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PDB 8CO6

ELECTRON MICROSCOPY0 chains59 ECOD domains
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3D Structure(domains colored, ligands/nucleic acids shown)

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Domains by Chain

All Domains (59)

#ChainDomain IDRangeFamilyClassification
1Ae8co6A1A:49-224VP4_haemagglut10 → 10.1 → 10.1.1
2Ae8co6A2A:250-483Rota_VP4_MID5091 → 5091.1 → 5091.1.1
3Ae8co6A3A:2-48,A:480-776VP4_helical3329 → 3329.1 → 3329.1.1
4Be8co6B1B:250-483Rota_VP4_MID5091 → 5091.1 → 5091.1.1
5Be8co6B2B:49-224VP4_haemagglut10 → 10.1 → 10.1.1
6Be8co6B3B:1-48,B:480-776VP4_helical3329 → 3329.1 → 3329.1.1
7Ce8co6C1C:250-483Rota_VP4_MID5091 → 5091.1 → 5091.1.1
8Ce8co6C2C:64-224VP4_haemagglut10 → 10.1 → 10.1.1
9Ce8co6C3C:1-27,C:225-249,C:480-776VP4_helical3329 → 3329.1 → 3329.1.1
10de8co6d1d:1-148,d:333-397Rota_Capsid_VP6617 → 617.1 → 617.1.1
11de8co6d2d:149-332Rota_Capsid_VP610 → 10.5 → 10.5.1
12De8co6D1D:57-161,D:254-326VP72007 → 2007.16 → 2007.16.1
13De8co6D2D:160-253VP710 → 10.23 → 10.23.1
14ee8co6e1e:1-148,e:333-397Rota_Capsid_VP6617 → 617.1 → 617.1.1
15ee8co6e2e:149-332Rota_Capsid_VP610 → 10.5 → 10.5.1
16Ee8co6E1E:161-254VP710 → 10.23 → 10.23.1
17Ee8co6E2E:58-162,E:255-314VP72007 → 2007.16 → 2007.16.1
18fe8co6f1f:1-148,f:333-397Rota_Capsid_VP6617 → 617.1 → 617.1.1
19fe8co6f2f:149-332Rota_Capsid_VP610 → 10.5 → 10.5.1
20Fe8co6F1F:51-161,F:254-326VP72007 → 2007.16 → 2007.16.1
21Fe8co6F2F:160-253VP710 → 10.23 → 10.23.1
22ge8co6g1g:1-148,g:333-397Rota_Capsid_VP6617 → 617.1 → 617.1.1
23ge8co6g2g:149-332Rota_Capsid_VP610 → 10.5 → 10.5.1
24Ge8co6G1G:160-253VP710 → 10.23 → 10.23.1
25Ge8co6G2G:51-161,G:254-326VP72007 → 2007.16 → 2007.16.1
26he8co6h1h:149-332Rota_Capsid_VP610 → 10.5 → 10.5.1
27he8co6h2h:1-148,h:333-397Rota_Capsid_VP6617 → 617.1 → 617.1.1
28He8co6H1H:161-254VP710 → 10.23 → 10.23.1
29He8co6H2H:58-162,H:255-314VP72007 → 2007.16 → 2007.16.1
30ie8co6i1i:1-148,i:333-397Rota_Capsid_VP6617 → 617.1 → 617.1.1
31ie8co6i2i:149-332Rota_Capsid_VP610 → 10.5 → 10.5.1
32Ie8co6I1I:51-161,I:254-326VP72007 → 2007.16 → 2007.16.1
33Ie8co6I2I:160-253VP710 → 10.23 → 10.23.1
34je8co6j1j:1-148,j:333-397Rota_Capsid_VP6617 → 617.1 → 617.1.1
35je8co6j2j:149-332Rota_Capsid_VP610 → 10.5 → 10.5.1
36Je8co6J1J:160-253VP710 → 10.23 → 10.23.1
37Je8co6J2J:51-161,J:254-326VP72007 → 2007.16 → 2007.16.1
38ke8co6k1k:149-332Rota_Capsid_VP610 → 10.5 → 10.5.1
39ke8co6k2k:1-148,k:333-397Rota_Capsid_VP6617 → 617.1 → 617.1.1
40Ke8co6K1K:58-161,K:254-326VP72007 → 2007.16 → 2007.16.1
41Ke8co6K2K:160-253VP710 → 10.23 → 10.23.1
42le8co6l1l:1-148,l:333-397Rota_Capsid_VP6617 → 617.1 → 617.1.1
43le8co6l2l:149-332Rota_Capsid_VP610 → 10.5 → 10.5.1
44Le8co6L1L:160-253VP710 → 10.23 → 10.23.1
45Le8co6L2L:51-161,L:254-326VP72007 → 2007.16 → 2007.16.1
46me8co6m1m:1-148,m:333-397Rota_Capsid_VP6617 → 617.1 → 617.1.1
47me8co6m2m:149-332Rota_Capsid_VP610 → 10.5 → 10.5.1
48Me8co6M1M:160-253VP710 → 10.23 → 10.23.1
49Me8co6M2M:51-161,M:254-326VP72007 → 2007.16 → 2007.16.1
50ne8co6n1n:1-148,n:333-397Rota_Capsid_VP6617 → 617.1 → 617.1.1
51ne8co6n2n:149-332Rota_Capsid_VP610 → 10.5 → 10.5.1
52Ne8co6N1N:51-161,N:254-326VP72007 → 2007.16 → 2007.16.1
53Ne8co6N2N:160-253VP710 → 10.23 → 10.23.1
54oe8co6o1o:1-148,o:333-397Rota_Capsid_VP6617 → 617.1 → 617.1.1
55oe8co6o2o:149-332Rota_Capsid_VP610 → 10.5 → 10.5.1
56Oe8co6O1O:51-161,O:254-326VP72007 → 2007.16 → 2007.16.1
57Oe8co6O2O:160-253VP710 → 10.23 → 10.23.1
58qe8co6q1q:103-880Rota_VP24064 → 4064.1 → 4064.1.1
59re8co6r1r:77-880Rota_VP24064 → 4064.1 → 4064.1.1

Visualization Legend

ECOD domains (colored by index)Unclassified protein regionsNucleic acids (RNA/DNA)Ligands/cofactors