PDB 8KGF
0 chains7 ECOD domains
3D Structure(domains colored, ligands/nucleic acids shown)
Loading viewer...
Domains by Chain
Chain Aview chain
7 domainse8kgfA01(A:-27-3,A:72-73,A:120,A:132-135,A:207-209,A:281-287,A:323-325,A:333-335,A:613-627,A:637-644,A:647-652,A:665,A:687,A:767-768,A:801-807,A:810-820,A:825-839)e8kgfA02(A:4-49,A:517-576,A:578-583,A:710-766,A:769-800,A:808-809,A:821-824,A:840-874)e8kgfA03(A:50-71,A:74-119,A:121-131,A:136-206,A:210-280,A:288-307)e8kgfA04(A:308-322,A:326-332,A:336-516)e8kgfA05(A:577,A:584-612,A:628-636,A:645-646,A:653-664,A:666-686,A:688-709)e8kgfA06(A:875-995,A:997-1061,A:1116-1122,A:1129-1143,A:1154-1155,A:1249-1289)e8kgfA07(A:996,A:1062-1115,A:1123-1128,A:1144-1153,A:1156-1248)
All Domains (7)
| # | Chain | Domain ID | Range | Family | Classification |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | A | e8kgfA01 | A:-27-3,A:72-73,A:120,A:132-135,A:207-209,A:281-287,A:323-325,A:333-335,A:613-627,A:637-644,A:647-652,A:665,A:687,A:767-768,A:801-807,A:810-820,A:825-839 | zf-C2H2 | 386 → 386.1 → 386.1.1 |
| 2 | A | e8kgfA02 | A:4-49,A:517-576,A:578-583,A:710-766,A:769-800,A:808-809,A:821-824,A:840-874 | 2.21.1.0 | 2 → 2.21 → 2.21.1 |
| 3 | A | e8kgfA03 | A:50-71,A:74-119,A:121-131,A:136-206,A:210-280,A:288-307 | REC1 | 1070 → 1070.1 → 1070.1.1 |
| 4 | A | e8kgfA04 | A:308-322,A:326-332,A:336-516 | cas_Cpf1_2nd | 1071 → 1071.1 → 1071.1.1 |
| 5 | A | e8kgfA05 | A:577,A:584-612,A:628-636,A:645-646,A:653-664,A:666-686,A:688-709 | Cpf1_PI-like | 1069 → 1069.1 → 1069.1.1 |
| 6 | A | e8kgfA06 | A:875-995,A:997-1061,A:1116-1122,A:1129-1143,A:1154-1155,A:1249-1289 | RuvC_1 | 2484 → 2484.1 → 2484.1.1 |
| 7 | A | e8kgfA07 | A:996,A:1062-1115,A:1123-1128,A:1144-1153,A:1156-1248 | NUC | 1068 → 1068.1 → 1068.1.1 |
Visualization Legend
ECOD domains (colored by index)Unclassified protein regionsNucleic acids (RNA/DNA)Ligands/cofactors