HHsearch alignment of GI: 254780140 and MMDB domain: 2ch7_A_52-256
>2ch7_A (A:52-256) Methyl-accepting chemotaxis protein; receptor, four-helix bundle, signal transduction, methyl-accepting receptor; 2.5A {Thermotoga maritima}
Probab=95.22 E-value=0.19 Score=27.48 Aligned_cols=202 Identities=6% Similarity=0.153 Sum_probs=0.0
Q ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHH
Q ss_conf 11100000012344320001244333333344555544444431012577898889889999987755323332--2233
Q gi|254780140|r 220 ITDLITSLDKMIKAIDLQKVNQILENIQVSSNNFVKSSDQVINTVHDVRETTQTFQEVGQKIDHLLSDFSSKMK--SKET 297 (452)
Q Consensus 220 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~l~~~~~~~~~~~~--~~~~ 297 (452)
+..+...+..+...+ ..+......+......+......+......+......+......+...+..+..... ...+
T Consensus 2 v~~~~~~~~el~~~~--~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~l~~~~~~i~~~~ 79 (205)
T 2ch7_A 2 VQETTAGSEEISSAT--KNIADSAQQAASFADQSTQLAKEAGDALKKVIEVTRMISNSAKDVERVVESFQKGAEEITSFV 79 (205)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_conf 999999999999999--988888888877788999998877888999988888999998864122378888776899999
Q ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHH
Q ss_conf 33210145677777765543322211122344431006888865798999999999999876401223679999999999
Q gi|254780140|r 298 SAFLENIADSTSNMRSSISAIREITDQRQKIISTINTIENITSNLNDSSQKFAELMSKINNISALKENNSLFKDAQRAMH 377 (452)
Q Consensus 298 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~i~~~~~~~~~l~~~~~~v~~~~~~id~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 377 (452)
.............+................+......+..+...+.....++......+.... .............+.
T Consensus 80 ~~i~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ev~~la~~~~~~~~ei~~~~~~i~~~~--~~~~~~~~~~~~~~~ 157 (205)
T 2ch7_A 80 ETINAIAEQTNLLALNAAIEAARAGEAGRGFAVVADEIRKLAEESQQASENVRRVVNEIRSIA--EDAGKVSSEITARVE 157 (205)
T ss_dssp HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTCTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HTTHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHH
T ss_conf 999863100005666567888740134430100012321010111237999988776565678--889999876245443
Q ss_pred HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Q ss_conf 9999999999999999999998646428999999999999999999999
Q gi|254780140|r 378 TFRDTSEKINRYIPSIGNNLQNFSQSGLNDIQNLVRKLQETVNHFDDCL 426 (452)
Q Consensus 378 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~l~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~l~~~~ 426 (452)
.+....+.+...+..+...+....... .++....+++...+..+...+
T Consensus 158 ~~~~~~~~~~~~~~~i~~~~~~~~~~~-~~i~~~~ee~~~~~~ei~~~i 205 (205)
T 2ch7_A 158 EGTKLADEADEKLNSIVGAVERINEML-QNIAAAIEEQTAAVDEITTAM 205 (205)
T ss_dssp HHHHTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_pred HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
T ss_conf 200121100110888999999999989-999999999999999999999