1. c.17.1 Caspase-like mature protein may be composed of two chains folded in a single domain !
Caspase-like 3 layers, a/b/a; core: mixed beta-sheet of 6 strands, order 213456, strand 6 is antiparallel to the rest
1cvr d1cvra2 A:162-178,204-210,283-300
3deh d3dehc1 C:66-82,155-165,213-227
3deh d3dehd1 D:64-82,155-164,213-227
3dei d3deic1 C:66-82,155-165,213-227
3dek d3dekc1 C:66-82,155-165,213-227
3dek d3deka1 A:66-82,155-165,213-227
3dej d3deja1 A:66-82,155-165,213-227
3dei d3deia1 A:66-82,155-165,213-227
3dej d3dejc1 C:66-82,155-165,213-227
3deh d3deha1 A:66-82,155-165,213-227
3dek d3dekd1 D:66-82,155-165,213-227
3dej d3dejb1 B:66-82,155-165,213-227
1nms d1nmsb_ B:64-82,155-165,213-227
3deh d3dehb1 B:64-82,155-165,213-227
1nms d1nmsa_ A:64-82,155-165,213-227
1qx3 d1qx3a_ A:66-82,155-165,213-227
1nmq d1nmqa_ A:64-82,155-165,213-227
3dek d3dekb1 B:64-82,155-165,213-227
1cvr d1cvra2 A:162-178,237-245,283-300
3dej d3dejd1 D:64-82,155-165,213-227
1nmq d1nmqb_ B:64-82,155-165,213-227
1kmc d1kmca_ A:179-197,277-287,347-361
1cp3 d1cp3a_ A:64-82,155-165,213-227
3dei d3deib1 B:64-82,155-165,213-227
1kmc d1kmcb_ B:179-197,277-287,347-361
1i4o d1i4ob_ B:87-105,178-188,239-253
1cp3 d1cp3b_ B:64-82,155-165,213-227
1m72 d1m72b_ B:79-97,170-180,230-244
1m72 d1m72a_ A:79-97,170-180,230-244
1f1j d1f1jb_ B:387-405,478-488,539-553
1m72 d1m72c_ C:79-97,170-180,230-244
1gqf d1gqfb_ B:180-197,277-285,347-361
1i4o d1i4oa_ A:87-105,178-188,239-253
1f1j d1f1ja_ A:87-105,178-188,239-253
1k88 d1k88b_ B:87-105,178-187,239-253
1shl d1shlb_ B:87-105,178-187,239-253
1shj d1shjb_ B:87-105,178-187,239-253
1gqf d1gqfa_ A:179-197,277-286,347-361
1shl d1shla_ A:87-105,178-186,239-253
1k86 d1k86b_ B:87-105,178-187,239-253
3dei d3deid1 D:64-82,155-162,213-227
1k86 d1k86a_ A:87-105,178-186,239-253
1shj d1shja_ A:87-105,178-186,239-253
1k88 d1k88a_ A:87-105,178-186,239-253
3dek d3dekd1 D:66-82,112-123,213-227
3dek d3deka1 A:66-82,112-123,213-227
1nw9 d1nw9b_ B:180-198,278-288,361-375
3dei d3deia1 A:66-82,112-123,213-227
2fun d2funb1 B:2262-2278,2351-2360,2419-2436
3dej d3dejb1 B:66-82,112-120,213-227
2fun d2fund1 D:3262-3278,3351-3362,3419-3436
1qx3 d1qx3a_ A:66-82,112-120,213-227
1i4e d1i4eb_ B:2262-2278,2351-2362,2419-2436
3deh d3dehc1 C:66-82,112-120,213-227
3dek d3dekc1 C:66-82,112-120,213-227
3dei d3deic1 C:66-82,112-120,213-227
1cvr d1cvra2 A:24-35,108-115,117-135
3dej d3dejc1 C:66-82,112-120,213-227
3dej d3deja1 A:66-82,112-120,213-227
1jxq d1jxqa_ A:179-197,276-287,347-361
1jxq d1jxqd_ D:179-197,276-286,347-361
1jxq d1jxqc_ C:179-197,276-287,347-361
3deh d3deha1 A:66-82,112-120,213-227
1jxq d1jxqb_ B:179-197,276-286,347-361
1i4e d1i4eb_ B:2262-2278,2308-2316,2419-2436
2fun d2funb1 B:2262-2278,2308-2316,2419-2436
2fun d2fund1 D:3262-3278,3308-3316,3419-3436
1cp3 d1cp3a_ A:64-82,112-120,213-227
1nmq d1nmqb_ B:64-82,112-120,213-227
1nmq d1nmqa_ A:64-82,112-120,213-227
3deh d3dehb1 B:64-82,112-120,213-227
1cp3 d1cp3b_ B:64-82,112-120,213-227
1i4o d1i4oa_ A:87-105,135-146,239-253
3dek d3dekb1 B:64-82,112-120,213-227
1nms d1nmsb_ B:64-82,112-120,213-227
1nms d1nmsa_ A:64-82,112-120,213-227
3dej d3dejd1 D:64-82,112-120,213-227
3dei d3deib1 B:64-82,112-123,213-227
1i4o d1i4ob_ B:87-105,135-146,239-253
3deh d3dehd1 D:64-82,112-123,213-227
1k88 d1k88b_ B:87-105,135-143,239-253
1m72 d1m72a_ A:79-97,127-135,230-244
1m72 d1m72b_ B:79-97,127-135,230-244
1m72 d1m72c_ C:79-97,127-135,230-244
1gqf d1gqfb_ B:180-197,228-236,347-361
1shj d1shjb_ B:87-105,135-143,239-253
1shl d1shlb_ B:87-105,135-143,239-253
1f1j d1f1jb_ B:387-405,435-443,539-553
1gqf d1gqfa_ A:179-197,228-236,347-361
1kmc d1kmca_ A:179-197,228-236,347-361
1f1j d1f1ja_ A:87-105,135-143,239-253
1k86 d1k86b_ B:87-105,135-143,239-253
1kmc d1kmcb_ B:179-197,228-236,347-361
1shl d1shla_ A:87-105,135-143,239-253
1shj d1shja_ A:87-105,135-143,239-253
1k86 d1k86a_ A:87-105,135-143,239-253
1k88 d1k88a_ A:87-105,135-143,239-253
2. c.116.1 alpha/beta knot known or predicted SAM-dependent methytransferases including the SPOUT 'sequence' superfamily ! all known members have dimeric structures !
alpha/beta knot core: 3 layers: a/b/a, parallel beta-sheet of 5 strands, order 21435; contains a deep trefoil knot
1oy5 d1oy5a_ A:14-25,35-42,141-157
1oy5 d1oy5b_ B:314-325,335-342,441-457
1oy5 d1oy5c_ C:614-625,635-642,741-758
1uaj d1uaja_ A:9-19,30-37,140-156
1ual d1uala_ A:9-19,30-37,140-157
1uak d1uaka_ A:9-19,30-37,140-157
1uam d1uama_ A:9-19,30-37,140-157
1p9p d1p9pa_ A:9-19,31-37,140-157
1o6d d1o6da_ A:12-27,30-38,125-146
1nxz d1nxzb2 B:91-103,188-197,224-241
1vh0 d1vh0c_ C:13-32,31-39,133-154
1to0 d1to0e_ E:13-32,31-39,133-153
1vh0 d1vh0b_ B:13-32,31-39,133-154
1oy5 d1oy5b_ B:314-325,408-416,441-457
1oy5 d1oy5a_ A:14-25,108-116,141-157
1to0 d1to0d_ D:13-31,31-39,133-154
1vh0 d1vh0a_ A:13-32,31-39,133-154
1uaj d1uaja_ A:9-19,106-112,140-156
1to0 d1to0f_ F:13-32,31-39,133-154
1v6z d1v6za2 A:80-96,175-181,210-227
1vh0 d1vh0d_ D:13-32,31-39,133-154
1to0 d1to0a_ A:13-32,31-39,133-154
1vh0 d1vh0f_ F:13-31,31-39,133-154
1to0 d1to0g_ G:13-32,31-39,133-154
1to0 d1to0c_ C:13-32,31-39,133-154
1to0 d1to0b_ B:13-32,31-39,133-154
1vh0 d1vh0e_ E:13-31,31-39,133-154
1v6z d1v6zb2 B:83-96,175-181,210-227
1oy5 d1oy5c_ C:624-634,635-642,741-758
2cx8 d2cx8a2 A:83-96,175-181,210-227
1gz0 d1gz0a1 A:105-120,190-197,226-243
1gz0 d1gz0e1 E:105-120,190-197,226-243
1oy5 d1oy5c_ C:614-625,708-716,741-758
2z0y d2z0ya2 A:83-96,175-181,210-227
1p9p d1p9pa_ A:9-19,106-112,140-157
1v2x d1v2xa_ A:32-47,116-123,152-172
1gz0 d1gz0c1 C:105-120,190-197,226-243
3bbd d3bbda1 A:54-68,157-162,191-205
1gz0 d1gz0d1 D:105-120,189-197,226-243
1to0 d1to0h_ H:13-32,31-39,133-154
1uak d1uaka_ A:9-19,106-112,140-157
3bbh d3bbha1 A:54-68,157-162,191-205
1nxz d1nxza2 A:91-103,188-195,224-241
3bbd d3bbdb1 B:54-68,157-162,191-205
1gz0 d1gz0g1 G:105-120,190-197,226-243
1ns5 d1ns5b_ B:13-28,31-39,128-149
3bbe d3bbea1 A:54-68,157-162,191-205
1gz0 d1gz0b1 B:105-120,189-197,226-243
3bbh d3bbhb1 B:54-68,157-162,191-205
1gz0 d1gz0h1 H:105-120,189-197,226-243
3bbe d3bbeb1 B:54-68,157-162,191-205
1j85 d1j85a_ A:11-26,94-101,132-149
2z0y d2z0ya2 A:83-96,98-104,210-227
1vhy d1vhyb2 B:91-103,188-195,224-241
1vhy d1vhyb2 B:91-103,105-111,224-241
1gz0 d1gz0f1 F:105-120,189-197,226-243
2o3a d2o3aa1 A:15-30,31-37,128-142
1mxi d1mxia_ A:11-26,94-101,132-149
1oy5 d1oy5a_ A:24-34,35-42,141-157
2o3a d2o3ab1 B:15-30,31-37,128-142
1ns5 d1ns5a_ A:13-28,31-39,128-149
1oy5 d1oy5b_ B:324-334,335-342,441-457
1vhy d1vhya2 A:91-103,188-195,224-241
2o3a d2o3ab1 B:15-30,97-104,128-142
2o3a d2o3aa1 A:15-30,97-104,128-142
1ipa d1ipaa1 A:126-141,143-148,245-263
2qmm d2qmma1 A:120-133,235-243,271-288
1j85 d1j85a_ A:11-26,27-36,132-149
1mxi d1mxia_ A:11-26,27-36,132-149
3bbd d3bbdb1 B:54-68,75-83,191-205
2qmm d2qmmb1 B:120-133,235-243,271-288
3bbh d3bbha1 A:54-68,75-83,191-205
3bbd d3bbda1 A:54-68,75-83,191-205
1vhk d1vhkc2 C:91-104,106-112,233-253
3bbh d3bbhb1 B:54-68,75-83,191-205
3bbe d3bbeb1 B:54-68,75-83,191-205
1uaj d1uaja_ A:19-29,30-37,140-156
3bbe d3bbea1 A:54-68,75-83,191-205
1ipa d1ipaa1 A:126-141,208-216,245-263
1vhk d1vhkb2 B:91-104,106-112,233-253
1vhk d1vhkd2 D:91-104,106-112,233-253
2qwv d2qwva1 A:31-44,151-158,186-204
1vhk d1vhka2 A:91-104,106-112,233-253
2qwv d2qwvb1 B:31-44,151-158,186-204
2v3j d2v3ja1 A:88-102,200-208,233-250
1p9p d1p9pa_ A:19-29,31-37,140-157
2v3k d2v3ka1 A:88-102,109-117,233-250
2v3j d2v3ja1 A:88-102,109-117,233-250
1k3r d1k3rb2 B:20-39,41-47,245-262
2qmm d2qmma1 A:120-133,141-152,271-288
2qmm d2qmmb1 B:120-133,141-152,271-288
2qwv d2qwva1 A:31-44,52-61,186-204
2qwv d2qwvb1 B:31-44,52-61,186-204
3. c.57.1 Molybdenum cofactor biosynthesis proteins
Molybdenum cofactor biosynthesis proteins 3 layers: a/b/a; mixed beta-sheet of 5 strands; order: 21354, strand 5 is antiparallel to the rest; permutation of the Phosphorylase/hydrolase-like fold
2f7w d2f7wb1 B:22-37,68-74,135-150
1y5e d1y5ea1 A:30-44,74-80,143-159
2f7w d2f7wa1 A:22-37,68-74,135-150
1y5e d1y5eb1 B:30-44,74-80,143-159
1y5e d1y5ec1 C:30-44,74-80,143-159
2g2c d2g2ca1 A:21-33,68-74,139-154
1o8n d1o8nb_ B:24-42,73-79,140-155
2f7y d2f7yc1 C:22-36,68-74,135-150
1o8o d1o8ob_ B:24-42,73-79,140-155
1jlj d1jlja_ A:33-45,80-86,147-159
1jlj d1jljc_ C:33-45,80-86,147-159
1eav d1eave_ E:24-42,73-79,140-155
1uuy d1uuya_ A:24-38,73-79,140-155
2nqs d2nqsa3 A:203-217,245-252,300-311
1uux d1uuxa_ A:24-38,73-79,140-155
2nqr d2nqra3 A:203-217,245-252,300-311
1o8q d1o8qc_ C:24-42,73-79,140-155
1o8q d1o8qe_ E:24-42,73-79,140-155
1o8q d1o8qf_ F:24-42,73-79,140-155
2nqu d2nqua3 A:203-217,245-252,300-311
1o8q d1o8qd_ D:24-42,73-79,140-155
1o8q d1o8qh_ H:24-42,73-79,140-155
1o8q d1o8qa_ A:24-42,73-79,140-155
1o8q d1o8qb_ B:24-42,73-79,140-155
1o8q d1o8qg_ G:24-42,73-79,140-155
2f7y d2f7yb1 B:22-36,68-74,135-150
2nro d2nroa3 A:203-217,245-252,300-311
2nqq d2nqqa3 A:203-217,245-252,300-311
2nrp d2nrpb3 B:203-217,245-252,300-312
1jlj d1jljb_ B:33-46,80-86,147-159
1ihc d1ihca_ A:33-45,80-86,147-159
1mkz d1mkzb_ B:27-41,71-77,139-151
2f7w d2f7wc1 C:22-36,68-74,135-147
2nqs d2nqsb3 B:203-217,245-252,300-311
2nqn d2nqna3 A:203-217,245-252,300-311
2nqn d2nqnb3 B:203-217,245-252,300-311
2nrs d2nrsa3 A:203-217,245-252,300-311
1fc5 d1fc5b3 B:203-217,245-252,300-311
1eav d1eavb_ B:24-42,73-79,140-155
1r2k d1r2kb_ B:26-40,70-76,138-150
2nqk d2nqka3 A:203-217,245-252,300-311
1g8r d1g8rb3 B:203-217,245-252,300-311
2nqu d2nqub3 B:203-217,245-252,300-311
1g8r d1g8ra3 A:203-217,245-252,300-311
2nrs d2nrsb3 B:203-217,245-252,300-311
1eav d1eavg_ G:24-42,73-79,140-155
2nqq d2nqqc3 C:203-217,245-252,300-311
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2nqq d2nqqb3 B:203-217,245-252,300-311
2nqv d2nqva3 A:203-217,245-252,300-311
1fc5 d1fc5a3 A:203-217,245-252,300-311
2nrp d2nrpa3 A:203-217,245-252,300-311
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1o8o d1o8oa_ A:24-38,73-79,140-155
2nqv d2nqvb3 B:203-217,245-252,300-311
2f7y d2f7ya1 A:22-36,68-74,135-150
2nqm d2nqma3 A:203-217,245-252,300-311
1mkz d1mkza_ A:27-41,71-77,139-151
2nro d2nrob3 B:203-217,245-252,300-311
1o8n d1o8nc_ C:24-38,73-79,140-152
2nqq d2nqqd3 D:203-217,245-252,300-311
1o8o d1o8oc_ C:24-38,73-79,140-155
2fts d2ftsa3 A:524-538,566-573,627-639
1g8l d1g8lb3 B:203-217,245-252,300-311
1uz5 d1uz5a3 A:206-220,248-255,303-315
1eav d1eavh_ H:24-42,73-79,140-152
1eav d1eavf_ F:24-42,73-79,140-152
1xi8 d1xi8a3 A:210-224,252-258,299-311
1eav d1eavc_ C:24-42,73-79,140-152
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1eav d1eava_ A:24-42,73-79,140-152
2fu3 d2fu3b3 B:524-538,566-572,627-639
1xi8 d1xi8b3 B:210-224,252-258,299-311
1di6 d1di6a_ A:22-37,68-74,135-145
2fu3 d2fu3a3 A:524-538,566-572,627-639
1wu2 d1wu2b3 B:210-224,252-258,299-311
1di7 d1di7a_ A:22-37,68-74,135-145
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2f7w d2f7wa1 A:22-37,126-134,135-150
2f7y d2f7yb1 B:22-36,126-134,135-150
2f7y d2f7ya1 A:22-36,126-134,135-150
1uz5 d1uz5a3 A:206-220,294-302,303-315
1xi8 d1xi8a3 A:210-224,292-297,299-311
1xi8 d1xi8b3 B:210-224,292-297,299-311
1wu2 d1wu2a3 A:210-224,292-297,299-311
1y5e d1y5ea1 A:30-44,134-141,143-159
1y5e d1y5eb1 B:30-44,134-141,143-159
1xi8 d1xi8a3 A:210-224,252-258,310-320
1wu2 d1wu2b3 B:210-224,292-297,299-311
1xi8 d1xi8b3 B:210-224,252-258,310-320
2f7w d2f7wb1 B:22-37,126-133,135-150
2fts d2ftsa3 A:524-538,616-626,627-639
1wu2 d1wu2a3 A:210-224,251-257,310-320
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2fu3 d2fu3a3 A:524-538,566-572,638-648
1r2k d1r2kb_ B:26-40,129-136,138-150
1t3e d1t3ea3 A:524-538,566-572,638-648
1t3e d1t3eb3 B:524-538,566-572,638-648
1r2k d1r2ka_ A:26-40,129-136,138-150
1mkz d1mkzb_ B:27-41,130-137,139-151
2f7y d2f7yc1 C:22-36,126-133,135-150
1mkz d1mkza_ A:27-41,130-137,139-151
1g8l d1g8la3 A:203-217,245-252,310-321
2nrs d2nrsa3 A:203-217,291-298,300-311
2nrp d2nrpa3 A:203-217,245-252,310-321
2nqq d2nqqc3 C:203-217,245-252,310-321
2nqq d2nqqb3 B:203-217,245-252,310-321
2nro d2nrob3 B:203-217,245-252,310-321
2nrs d2nrsb3 B:203-217,245-252,310-321
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2nqk d2nqka3 A:203-217,245-252,310-321
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1g8l d1g8lb3 B:203-217,291-298,300-311
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2nqs d2nqsb3 B:203-217,245-252,310-321
2f7w d2f7wc1 C:22-36,126-133,135-147
2nqm d2nqmb3 B:203-217,291-298,300-311
1g8r d1g8rb3 B:203-217,245-252,310-321
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2nqq d2nqqa3 A:203-217,245-252,310-321
1g8r d1g8ra3 A:203-217,245-252,310-321
2nqq d2nqqd3 D:203-217,245-252,310-321
2nro d2nroa3 A:203-217,291-298,300-311
2nqn d2nqnb3 B:203-217,245-252,310-321
2nrs d2nrsa3 A:203-217,245-252,310-321
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2nqv d2nqvb3 B:203-217,291-298,300-311
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1g8r d1g8ra3 A:203-217,291-298,300-311
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2nqq d2nqqc3 C:203-217,291-298,300-311
2nqv d2nqvb3 B:203-217,245-252,310-321
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1uuy d1uuya_ A:24-38,131-138,140-155
1uux d1uuxa_ A:24-38,131-138,140-155
2nqn d2nqna3 A:203-217,291-298,300-311
2nqs d2nqsa3 A:203-217,245-252,310-321
1g8r d1g8rb3 B:203-217,291-298,300-311
2nqv d2nqva3 A:203-217,245-252,310-321
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2nrs d2nrsb3 B:203-217,291-298,300-311
2nqq d2nqqd3 D:203-217,291-298,300-311
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2nqm d2nqma3 A:203-217,291-298,300-311
2nqu d2nqub3 B:203-217,291-298,300-311
2nqu d2nqua3 A:203-217,291-298,300-311
2nqs d2nqsb3 B:203-217,291-298,300-311
2nqq d2nqqb3 B:203-217,291-298,300-311
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2nqk d2nqkb3 B:203-217,291-298,300-311
2nqq d2nqqa3 A:203-217,291-298,300-311
1eav d1eavc_ C:24-42,131-138,140-152
2nqr d2nqra3 A:203-217,291-298,300-311
2nrp d2nrpb3 B:203-217,245-252,311-321
1fc5 d1fc5a3 A:203-217,291-298,300-311
1wu2 d1wu2b3 B:210-224,224-233,310-320
1fc5 d1fc5b3 B:203-217,291-298,300-311
1wu2 d1wu2a3 A:210-224,224-234,310-320
1eav d1eavd_ D:24-42,73-79,151-162
1eav d1eavc_ C:24-42,73-79,151-162
1eav d1eavh_ H:24-42,73-79,151-162
1uz5 d1uz5a3 A:206-220,248-255,314-324
2fu3 d2fu3b3 B:524-538,616-625,627-639
2fu3 d2fu3a3 A:524-538,616-625,627-639
1t3e d1t3ea3 A:524-538,616-625,627-639
2nqs d2nqsa3 A:203-217,291-297,300-311
1t3e d1t3eb3 B:524-538,616-625,627-639
2fts d2ftsa3 A:524-538,566-573,638-648
2f7w d2f7wc1 C:22-36,68-74,146-158
1o8n d1o8nc_ C:24-38,73-79,151-164
1xi8 d1xi8a3 A:210-224,225-233,310-320
1xi8 d1xi8b3 B:210-224,225-234,310-320
1uz5 d1uz5a3 A:206-220,221-230,314-324
2fu3 d2fu3a3 A:524-538,539-548,638-648
4. c.36.1 Thiamin diphosphate-binding fold (THDP-binding) there are two different functional modules of this fold: pyridine-binding (Pyr) and pyrophosphate-binding (PP) modules ! two Pyr and two PP modules assemble together in a conserved heterotetrameric core that binds two THDP coenzyme molecules !
Thiamin diphosphate-binding fold (THDP-binding) 3 layers: a/b/a; parallel beta-sheet of 6 strands, order 213465
1itz d1itzc2 C:367-384,467-475,508-523
1itz d1itzb2 B:367-384,467-474,508-523
1gpu d1gpub2 B:357-374,462-470,503-518
1trk d1trka2 A:357-374,462-470,503-518
1itz d1itza2 A:367-384,467-474,508-523
1tka d1tkaa2 A:357-374,462-470,503-518
1r9j d1r9jb1 B:351-368,451-460,493-508
1ngs d1ngsa2 A:357-374,461-470,503-518
1r9j d1r9ja1 A:351-368,451-460,493-508
1gpu d1gpua2 A:357-374,461-469,503-518
1ngs d1ngsb2 B:357-374,461-470,503-518
1tka d1tkab2 B:357-374,461-470,503-518
2r5n d2r5nb1 B:356-373,454-461,495-509
1tkc d1tkcb2 B:357-374,461-470,503-518
1yhy d1yhya3 A:463-476,557-565,617-632
1z8n d1z8na3 A:463-476,557-565,617-632
1yhz d1yhza3 A:463-476,557-565,617-632
1ybh d1ybha3 A:463-476,557-565,617-632
1ay0 d1ay0b2 B:357-374,461-469,503-518
1yi0 d1yi0a3 A:463-476,557-565,617-632
1yi1 d1yi1a3 A:463-476,557-565,617-632
2r8o d2r8oa1 A:356-373,453-461,495-509
1tkc d1tkca2 A:357-374,461-470,503-517
1tkb d1tkba2 A:357-374,461-470,503-517
1tkb d1tkbb2 B:357-374,461-469,503-518
2c3p d2c3pb1 B:9-22,106-114,145-164
2c42 d2c42b1 B:9-22,106-114,145-164
1upb d1upbd3 D:383-400,456-462,535-550
2pda d2pdab1 B:9-22,106-114,145-164
2pda d2pdaa1 A:9-22,106-114,145-164
2uza d2uzab1 B:9-22,106-114,145-164
2c3y d2c3yb1 B:9-22,106-114,145-164
2c3m d2c3mb1 B:9-22,106-114,145-164
2c3y d2c3ya1 A:9-22,106-114,145-164
2bp7 d2bp7f1 F:7-24,114-121,152-167
1ovm d1ovmd2 D:6-19,93-102,144-160
2c42 d2c42a1 A:9-22,106-114,145-164
1trk d1trkb2 B:357-374,461-470,503-517
1pyd d1pyda2 A:5-18,93-101,141-160
1upb d1upbc3 C:383-400,456-462,535-550
2bp7 d2bp7d1 D:7-24,114-121,152-167
1upa d1upac3 C:383-400,456-462,535-550
1kek d1kekb1 B:9-22,106-114,145-164
1ovm d1ovmc2 C:6-19,93-102,144-160
1ovm d1ovmb2 B:6-19,93-102,144-160
2c3u d2c3ua1 A:9-22,106-114,145-164
2g25 d2g25b1 B:493-509,620-628,662-679
1ovm d1ovma2 A:6-19,93-102,144-160
2bp7 d2bp7b1 B:7-24,114-121,152-167
1ay0 d1ay0a2 A:357-374,461-470,503-517
1upc d1upcd3 D:383-400,456-462,535-550
1b0p d1b0pb1 B:9-22,106-114,145-164
2iht d2ihtc3 C:383-400,456-462,535-550
1qs0 d1qs0b1 B:7-24,114-121,152-167
2c3m d2c3ma1 A:9-22,106-114,145-164
2iht d2ihtb3 B:383-400,456-462,535-550
1upc d1upcc3 C:383-400,456-462,535-550
2c3p d2c3pa1 A:9-22,106-114,145-164
1b0p d1b0pa1 A:9-22,106-114,145-164
2bp7 d2bp7h1 H:7-24,114-121,152-167
2c3o d2c3ob1 B:9-22,106-114,145-164
1kek d1keka1 A:9-22,106-114,145-164
2c3u d2c3ub1 B:9-22,106-114,145-164
2ihv d2ihvd3 D:383-400,456-462,535-550
2iht d2ihta3 A:383-400,456-462,535-550
1upc d1upca3 A:383-400,456-462,535-550
1qgd d1qgda1 A:356-373,454-461,495-510
2uza d2uzaa1 A:9-22,106-114,145-164
2ihv d2ihvb3 B:383-400,456-462,535-550
1qgd d1qgdb1 B:356-373,454-461,495-510
1umc d1umcb1 B:5-22,112-119,150-165
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1upa d1upac2 C:56-72,74-81,439-453
1ozh d1ozhb2 B:56-72,99-108,140-157
1pow d1powa2 A:58-74,102-112,142-161
1upb d1upba2 A:56-72,74-81,439-453
2iht d2ihtb2 B:56-72,74-81,439-453
2iht d2ihtc2 C:56-72,74-81,439-453
1upc d1upce2 E:56-72,74-81,439-453
1ozh d1ozha2 A:56-72,99-108,140-157
1ozg d1ozga2 A:56-72,99-108,140-157
1itz d1itza1 A:128-151,160-167,422-438
2iht d2ihta2 A:56-72,74-81,439-453
1l8a d1l8ab1 B:106-125,252-260,365-379
1ozf d1ozfa2 A:56-72,99-108,140-157
2iea d2ieab2 B:106-125,252-260,365-379
1upa d1upaa2 A:56-72,74-81,439-453
1upc d1upcf2 F:56-72,74-81,439-453
1upc d1upcb2 B:56-72,74-81,439-453
2iht d2ihtd2 D:56-72,74-81,439-453
2ez4 d2ez4b2 B:58-74,76-83,421-437
1ozh d1ozhc2 C:56-72,99-108,140-157
2ez9 d2ez9b2 B:58-74,76-83,421-437
2ezu d2ezub2 B:58-74,76-83,421-437
1tkb d1tkba2 A:503-517,519-527,590-598
1tkc d1tkca2 A:503-517,519-527,590-598
1x7y d1x7ya_ A:92-104,107-111,257-276
2qta d2qtab2 B:106-125,252-260,365-379
1r9j d1r9jb2 B:115-138,147-154,408-423
1qgd d1qgdb2 B:115-138,147-154,410-425
1x7w d1x7wa_ A:92-104,107-111,257-276
1x7x d1x7xa_ A:92-104,107-111,257-276
1jsc d1jscb2 B:138-154,156-163,526-540
1upc d1upca2 A:56-72,74-81,439-453
1qgd d1qgda2 A:115-138,147-154,410-425
2ihv d2ihvb2 B:56-72,74-81,439-453
1olu d1olua_ A:92-104,107-111,257-276
2ezt d2eztb2 B:58-74,76-83,421-437
2ez8 d2ez8a2 A:58-74,76-83,421-437
1pox d1poxb2 B:58-74,76-83,421-437
2ez8 d2ez8b2 B:58-74,76-83,421-437
2bfc d2bfca1 A:92-104,107-111,257-276
1t9d d1t9dc2 C:138-154,156-163,526-540
1r9j d1r9ja2 A:115-138,147-154,408-423
1t9a d1t9ab2 B:138-154,156-163,526-540
2ez9 d2ez9a2 A:58-74,76-83,421-437
2bfb d2bfba1 A:92-104,107-111,257-276
2ezu d2ezua2 A:58-74,76-83,421-437
2ihv d2ihvd2 D:56-72,74-81,439-453
2ihv d2ihva2 A:56-72,74-81,439-453
2ez4 d2ez4a2 A:58-74,76-83,421-437
1yi1 d1yi1a2 A:143-159,161-168,514-528
1jsc d1jsca2 A:138-154,156-163,526-540
2ji6 d2ji6a2 A:55-71,98-108,141-158
2jib d2jibb2 B:55-71,98-108,141-158
1trk d1trka2 A:503-518,520-527,590-598
2ji6 d2ji6b2 B:55-71,98-108,141-158
2ji6 d2ji6a2 A:55-71,73-80,430-443
1pow d1powa2 A:58-74,76-83,421-437
1ay0 d1ay0a2 A:503-517,519-527,590-598
2ji6 d2ji6b2 B:55-71,73-80,430-443
1gpu d1gpub2 B:503-518,520-527,590-598
2ji8 d2ji8a2 A:55-71,98-108,141-158
2jib d2jiba2 A:55-71,73-80,430-443
2ji9 d2ji9a2 A:55-71,98-108,141-158
2ji7 d2ji7a2 A:55-71,73-80,430-443
1pox d1poxa2 A:58-74,76-83,421-437
2c31 d2c31b2 B:55-71,73-80,430-443
2ji8 d2ji8a2 A:55-71,73-80,430-443
2ji7 d2ji7a2 A:55-71,98-108,141-158
2ji8 d2ji8b2 B:55-71,98-108,141-158
2jib d2jibb2 B:55-71,73-80,430-443
2c31 d2c31a2 A:55-71,73-80,430-443
2jib d2jiba2 A:55-71,98-108,141-158
2ji9 d2ji9b2 B:55-71,98-108,141-158
2ji7 d2ji7b2 B:55-71,73-80,430-443
2ji9 d2ji9a2 A:55-71,73-80,430-443
2ozl d2ozlc1 C:137-156,188-196,229-247
2ji8 d2ji8b2 B:55-71,73-80,430-443
2ji7 d2ji7b2 B:55-71,98-108,141-158
2ji9 d2ji9b2 B:55-71,73-80,430-443
2c31 d2c31b2 B:55-71,98-108,141-158
1ni4 d1ni4a_ A:65-80,83-89,229-247
2ozl d2ozla1 A:137-156,188-196,229-247
1r9j d1r9ja1 A:493-508,509-517,579-587
1r9j d1r9jb1 B:493-508,509-517,579-587
2dji d2djia2 A:29-41,98-106,137-156
2c31 d2c31a2 A:55-71,98-108,141-158
1v5g d1v5ga2 A:53-68,72-78,418-432
1w85 d1w85g_ G:143-162,194-202,237-255
1pow d1powb2 B:58-74,76-83,423-437
2dji d2djia2 A:53-68,72-78,418-432
1v5e d1v5ea2 A:53-68,72-78,418-432
1w88 d1w88g_ G:143-162,194-202,237-255
2ezt d2ezta2 A:58-74,76-83,423-437
1tka d1tkaa2 A:503-518,520-527,590-598
1v5f d1v5fa2 A:53-68,72-78,418-432
2bfd d2bfda1 A:89-104,107-112,257-276
1w85 d1w85e_ E:143-162,194-202,237-255
1qs0 d1qs0a_ A:109-124,127-131,278-296
2bff d2bffa1 A:89-104,107-112,257-276
1w85 d1w85c_ C:143-162,194-202,237-255
2bp7 d2bp7g1 G:109-124,127-131,278-296
2bp7 d2bp7e1 E:109-124,127-131,278-296
2bev d2beva1 A:89-104,107-112,257-276
1v5f d1v5fa2 A:32-39,98-106,137-156
2bew d2bewa1 A:89-104,107-112,257-276
1olx d1olxa_ A:89-104,107-112,257-276
1wci d1wcia1 A:89-104,107-112,257-276
1qgd d1qgda1 A:495-510,512-519,585-593
1dtw d1dtwa_ A:89-104,107-112,257-276
1w85 d1w85a_ A:143-162,194-202,237-255
2bp7 d2bp7a1 A:109-124,127-131,278-296
2beu d2beua1 A:89-104,107-112,257-276
1ozf d1ozfb3 B:395-405,411-415,421-437
1ozg d1ozgb3 B:395-405,411-415,421-437
2bp7 d2bp7c1 C:109-124,127-131,278-296
1w88 d1w88a_ A:143-162,194-202,237-255
1w88 d1w88c_ C:143-162,194-202,237-255
1ozh d1ozha3 A:395-405,411-415,421-437
1r9j d1r9jb2 B:26-45,210-216,221-236
1r9j d1r9ja2 A:26-45,210-216,221-236
1r9j d1r9jb2 B:26-45,147-154,221-236
1ozf d1ozfa3 A:395-405,411-415,421-437
1ozh d1ozhc3 C:395-405,411-415,421-437
1w88 d1w88e_ E:143-162,194-202,237-255
1ozh d1ozhb3 B:395-405,411-415,421-437
1r9j d1r9ja2 A:26-45,147-154,221-236
1ozg d1ozga3 A:395-405,411-415,421-437
1ozh d1ozhd3 D:395-405,411-415,421-437
1v1m d1v1ma_ A:89-104,107-111,257-276
1v16 d1v16a_ A:89-104,107-111,257-276
1v11 d1v11a_ A:89-104,107-111,257-276
1um9 d1um9c_ C:34-62,65-69,107-117
1v1r d1v1ra_ A:89-104,107-111,257-276
1ols d1olsa_ A:89-104,107-111,257-276
1x7z d1x7za_ A:89-104,107-111,257-276
1um9 d1um9c_ C:145-164,196-205,239-257
1itz d1itzb2 B:508-523,525-532,598-606
1pyd d1pyda2 A:50-66,67-74,417-434
1ols d1olsa_ A:165-182,212-222,257-276
1itz d1itzc2 C:508-523,525-532,598-606
1olu d1olua_ A:165-182,212-222,257-276
2bfb d2bfba1 A:165-182,212-222,257-276
2bfc d2bfca1 A:165-182,212-222,257-276
2beu d2beua1 A:165-182,213-223,257-276
2bfe d2bfea1 A:165-182,212-222,257-276
1x7x d1x7xa_ A:165-182,212-222,257-276
1u5b d1u5ba_ A:165-182,213-223,257-276
1v1m d1v1ma_ A:165-182,212-222,257-276
2qta d2qtaa2 A:106-125,222-230,365-379
2bev d2beva1 A:165-182,213-223,257-276
1wci d1wcia1 A:165-182,213-223,257-276
2bew d2bewa1 A:165-182,213-223,257-276
2g28 d2g28b2 B:106-125,222-230,365-379
2qta d2qtaa2 A:106-125,287-293,365-379
1l8a d1l8ab1 B:106-125,222-230,365-379
2iea d2ieab2 B:106-125,222-230,365-379
2g28 d2g28b2 B:106-125,287-293,365-379
2qta d2qtab2 B:106-125,222-230,365-379
2qta d2qtab2 B:106-125,287-293,365-379
1l8a d1l8ab1 B:106-125,287-293,365-379
2iea d2ieab2 B:106-125,287-293,365-379
1umd d1umda_ A:147-164,196-204,239-257
1umb d1umba_ A:147-164,196-204,239-257
1umd d1umdc_ C:147-164,196-204,239-257
1umc d1umcc_ C:147-164,196-204,239-257
1umb d1umbc_ C:147-164,196-204,239-257
1umc d1umca_ A:147-164,196-204,239-257
1um9 d1um9a_ A:147-164,196-205,239-257
5. d.228.1 Replication modulator SeqA, C-terminal DNA-binding domain
Replication modulator SeqA, C-terminal DNA-binding domain consists of seven alpha-helices and three-stranded beta-sheet
1lrr d1lrrd_ D:86-103,145-150,152-168
1iu3 d1iu3f_ F:21-38,80-85,87-103
1iu3 d1iu3c_ C:21-38,80-85,87-103
1lrr d1lrra_ A:86-103,145-150,152-168
1j3e d1j3ea_ A:21-38,80-85,87-103
6. e.52.1 NAD kinase/diacylglycerol kinase-like
NAD kinase/diacylglycerol kinase-like 2 domains: d1 [alpha/beta; related to the PFK N-terminal domain (scop_sf 53784)]; d2 [all-beta; atypical beta-sandwich made of 4 structural repeats of beta(3) unit]
1u0r d1u0ra_ A:18-33,77-83,120-131
1u0r d1u0rd_ D:18-33,76-83,120-131
1u0r d1u0rc_ C:16-33,76-83,120-131
1u0r d1u0rb_ B:19-32,77-83,120-131
1u0t d1u0ta_ A:19-33,78-83,120-131
1u0t d1u0tb_ B:19-33,78-83,120-131
1u0r d1u0rc_ C:16-33,101-107,120-131
1u0r d1u0ra_ A:18-33,101-107,120-131
1z0s d1z0sa1 A:9-24,41-47,83-95
1u0r d1u0rd_ D:18-33,101-107,120-131
1z0u d1z0ua1 A:10-24,41-47,83-95
1z0z d1z0zc1 C:10-24,41-47,83-95
1z0s d1z0sb1 B:10-24,41-47,83-95
2qv7 d2qv7a1 A:21-33,60-66,107-118
2qvl d2qvla1 A:21-33,60-66,107-118
1z0u d1z0ub1 B:12-24,41-47,83-95
1z0z d1z0za1 A:12-24,41-47,83-95
1z0s d1z0sd1 D:10-24,41-47,83-95
1z0s d1z0sc1 C:12-24,41-47,83-95
1suw d1suwa_ A:12-24,41-47,83-95
1suw d1suwc_ C:10-24,41-47,83-95
1z0s d1z0sb1 B:10-24,63-69,83-95
1z0s d1z0sd1 D:10-24,63-69,83-95
1z0z d1z0zc1 C:10-24,63-69,83-95
1z0u d1z0ua1 A:10-24,63-69,83-95
1z0z d1z0zd1 D:12-24,41-47,83-95
1suw d1suwb_ B:12-24,41-47,83-95
1suw d1suwd_ D:12-24,41-47,83-95
1z0s d1z0sa1 A:9-24,63-69,83-95
1z0u d1z0ub1 B:12-24,63-69,83-95
1z0z d1z0zb1 B:12-24,41-47,83-95
1u0t d1u0ta_ A:19-33,101-107,120-131
1z0z d1z0za1 A:12-24,63-69,83-95
1u0t d1u0tb_ B:19-33,101-107,120-131
1u0r d1u0rb_ B:19-32,100-107,120-131
1z0s d1z0sc1 C:12-24,63-69,83-95
1suw d1suwb_ B:12-24,63-69,83-95
1z0z d1z0zd1 D:12-24,63-69,83-95
1suw d1suwc_ C:10-24,63-69,83-95
1suw d1suwa_ A:12-24,63-69,83-95
1suw d1suwd_ D:12-24,63-69,83-95
1z0z d1z0zb1 B:12-24,63-69,83-95
2bon d2bonb1 B:18-32,34-40,108-119
2p1r d2p1ra1 A:18-32,59-65,108-119
2p1r d2p1rb1 B:18-32,59-65,108-119
2qvl d2qvla1 A:21-33,85-91,107-118
2qv7 d2qv7a1 A:21-33,85-91,107-118
1u0r d1u0rd_ D:18-33,34-38,120-131
1u0r d1u0rc_ C:16-33,34-39,120-131
7. d.92.2 beta-N-acetylhexosaminidase-like domain contains similar fold but lacks its catalytic centre !
Zincin-like contains mixed beta sheet with connection over free side of the sheet
1jak d1jaka2 A:48-67,79-85,109-125
1hp4 d1hp4a2 A:48-67,79-85,109-125
1m01 d1m01a2 A:48-67,79-85,109-125
2cbj d2cbjb3 B:75-90,102-109,148-164
1m04 d1m04a2 A:48-63,79-85,109-125
1m03 d1m03a2 A:48-63,79-85,109-125
1hp5 d1hp5a2 A:48-63,79-85,109-125
2cbi d2cbia3 A:75-90,102-109,148-164
2j62 d2j62b3 B:75-90,102-109,148-164
1k9f d1k9fa2 A:32-51,64-72,110-128
2cbi d2cbib3 B:75-90,102-109,148-164
2cbj d2cbja3 A:75-90,102-109,148-164
1mqp d1mqpa2 A:32-51,64-71,110-128
2j62 d2j62a3 A:75-90,102-109,148-164
1k9d d1k9da2 A:32-51,64-72,110-128
1mqr d1mqra2 A:32-51,64-71,110-128
1mqq d1mqqa2 A:32-51,65-72,110-128
1k9e d1k9ea2 A:32-51,64-71,110-128
1l8n d1l8na2 A:32-51,64-72,110-128
1o7a d1o7ad2 D:91-107,125-132,164-180
1o7a d1o7af2 F:91-107,125-132,164-180
1o7a d1o7ac2 C:91-107,125-132,164-180
1gqj d1gqjb2 B:39-58,70-77,120-138
1o7a d1o7aa2 A:91-107,125-132,164-180
1gqk d1gqkb2 B:39-58,70-77,120-138
1h41 d1h41b2 B:39-58,70-77,120-138
1gqi d1gqib2 B:39-58,70-77,120-138
1h41 d1h41a2 A:39-58,70-77,120-138
1gqj d1gqja2 A:39-58,70-77,120-138
1gql d1gqlb2 B:39-58,70-77,120-138
1gqk d1gqka2 A:39-58,70-77,120-138
1gqi d1gqia2 A:39-58,70-77,120-138
1gql d1gqla2 A:39-58,70-77,120-138
2j47 d2j47a3 A:34-46,55-62,96-112
2j4g d2j4gb3 B:34-46,54-62,96-112
1o7a d1o7ab2 B:91-107,125-132,164-180
1np0 d1np0b2 B:91-107,125-132,164-180
1nou d1noua2 A:91-107,125-132,164-180
1np0 d1np0a2 A:91-107,125-132,164-180
2j4g d2j4ga3 A:34-46,54-62,96-112
1now d1nowa2 A:91-107,125-132,164-180
2gk1 d2gk1f2 F:91-107,125-132,164-180
2gk1 d2gk1h2 H:91-107,125-132,164-180
2vvn d2vvna3 A:34-46,54-62,96-112
2vvn d2vvnb3 B:34-46,54-62,96-112
2jiw d2jiwa3 A:34-46,54-62,96-112
2jiw d2jiwb3 B:34-46,54-62,96-112
2cho d2choa3 A:34-45,54-62,96-112
2chn d2chna3 A:34-45,54-62,96-112
2cho d2chob3 B:34-45,54-62,96-112
2chn d2chnb3 B:34-45,54-62,96-112
2vvs d2vvsa3 A:34-45,54-62,96-112
2gjx d2gjxc2 C:91-107,122-133,164-180
1o7a d1o7ae2 E:91-107,125-133,164-180
1hp5 d1hp5a2 A:48-63,101-108,109-125
2gk1 d2gk1b2 B:91-107,125-133,164-180
1jak d1jaka2 A:48-67,101-108,109-125
1m01 d1m01a2 A:48-67,101-108,109-125
1m03 d1m03a2 A:48-63,101-108,109-125
1hp4 d1hp4a2 A:48-67,101-108,109-125
1m04 d1m04a2 A:48-63,101-108,109-125
1nou d1noub2 B:91-107,125-133,164-180
1mqq d1mqqa2 A:32-51,102-109,110-128
2j62 d2j62b3 B:75-90,140-147,148-164
2j4g d2j4gb3 B:34-46,88-96,96-112
2j4g d2j4ga3 A:34-46,88-96,96-112
1now d1nowb2 B:91-107,125-133,164-180
2gk1 d2gk1a2 A:58-74,92-100,131-147
2j47 d2j47a3 A:34-46,88-96,96-112
2gjx d2gjxb2 B:91-107,125-133,164-180
2gjx d2gjxe2 E:58-74,92-100,131-147
2gjx d2gjxg2 G:91-107,125-133,164-180
2vvn d2vvna3 A:34-46,88-96,96-112
2jiw d2jiwa3 A:34-46,88-96,96-112
2gk1 d2gk1d2 D:91-107,125-133,164-180
2jiw d2jiwb3 B:34-46,88-96,96-112
2vvn d2vvnb3 B:34-46,88-96,96-112
2vvs d2vvsa3 A:34-45,88-96,96-112
2cho d2choa3 A:34-45,88-96,96-112
1k9d d1k9da2 A:32-51,101-109,110-128
2gk1 d2gk1e2 E:58-74,92-100,131-147
1l8n d1l8na2 A:32-51,101-109,110-128
2cho d2chob3 B:34-45,88-96,96-112
2chn d2chna3 A:34-45,88-96,96-112
2chn d2chnb3 B:34-45,88-96,96-112
2gk1 d2gk1g2 G:58-74,92-100,131-147
2gjx d2gjxd2 D:58-74,92-100,131-147
2cbj d2cbja3 A:75-90,140-148,148-164
2cbi d2cbia3 A:75-90,140-148,148-164
2cbi d2cbib3 B:75-90,140-148,148-164
2j62 d2j62a3 A:75-90,140-148,148-164
2cbj d2cbjb3 B:75-90,140-148,148-164
2gjx d2gjxf2 F:91-107,125-133,164-180
2gk1 d2gk1c2 C:58-74,92-100,132-147
2gjx d2gjxa2 A:58-74,92-100,132-147
2gjx d2gjxh2 H:58-74,92-100,132-147
1h41 d1h41a2 A:39-58,110-118,120-138
1gqj d1gqja2 A:39-58,110-118,120-138
1gql d1gqla2 A:39-58,110-118,120-138
1gqi d1gqia2 A:39-58,110-118,120-138
1gql d1gqlb2 B:39-58,110-118,120-138
1h41 d1h41b2 B:39-58,110-118,120-138
1gqk d1gqka2 A:39-58,110-118,120-138
1gqi d1gqib2 B:39-58,110-118,120-138
1gqj d1gqjb2 B:39-58,110-118,120-138
1gqk d1gqkb2 B:39-58,110-118,120-138
8. d.3.1 Cysteine proteinases the constitute families differ by insertion into and circular permutation of the common catalytic core made of one alpha-helix and 3-strands of beta-sheet !
Cysteine proteinases consists of one alpha-helix and 4 strands of antiparallel beta-sheet and contains the catalytic triad Cys-His-Asn
2hl8 d2hl8a1 A:450-466,502-511,579-594
2bkq d2bkqb1 B:28-45,84-92,162-181
1euv d1euva_ A:450-466,502-511,579-594
2hl9 d2hl9a1 A:450-466,502-511,579-594
2hkp d2hkpa1 A:450-466,502-511,579-594
2bkq d2bkqc1 C:28-45,84-92,162-181
1nln d1nlna_ A:4-16,37-46,121-137
2bkq d2bkqd1 D:28-45,50-54,162-181
2bkr d2bkra1 A:28-45,84-93,162-181
1xt9 d1xt9a_ A:28-45,84-93,162-181
2bkq d2bkqa1 A:28-45,50-54,162-181
2bkq d2bkqc1 C:28-45,50-54,162-181
2bkq d2bkqa1 A:28-45,84-93,162-181
2bkq d2bkqb1 B:28-45,50-54,162-181
2hl9 d2hl9a1 A:450-466,467-471,579-594
2hl8 d2hl8a1 A:450-466,467-471,579-594
1avp d1avpa_ A:5-16,37-46,119-137
2hkp d2hkpa1 A:450-466,467-471,579-594
2bkr d2bkra1 A:28-45,50-54,162-181
1xt9 d1xt9a_ A:28-45,50-54,162-181
2bkq d2bkqd1 D:28-45,84-93,162-181
1euv d1euva_ A:450-466,467-471,579-594
1th0 d1th0a_ A:412-431,434-438,547-562
2io1 d2io1a1 A:412-431,434-438,547-562
1tgz d1tgza_ A:412-431,434-438,547-562
1th0 d1th0b_ B:412-431,434-438,547-562
2io3 d2io3a1 A:412-431,434-438,547-562
2ckh d2ckha1 A:467-485,522-531,601-616
2io2 d2io2a1 A:412-431,467-476,547-562
2io2 d2io2a1 A:412-431,434-438,547-562
2io3 d2io3a1 A:412-431,467-476,547-562
2ckh d2ckha1 A:467-485,489-493,601-616
1tgz d1tgza_ A:412-431,467-476,547-562
2io1 d2io1a1 A:412-431,467-476,547-562
1avp d1avpa_ A:5-16,20-27,119-137
1th0 d1th0a_ A:412-431,467-476,547-562
1th0 d1th0b_ B:412-431,467-476,547-562
2g4d d2g4da1 A:467-485,522-531,599-617
2g4d d2g4dc1 C:467-485,522-531,599-617
2io0 d2io0a1 A:412-431,467-476,544-562
2iy1 d2iy1a1 A:467-485,522-531,599-617
2etl d2etla1 A:9-21,25-31,89-103
2iy1 d2iy1c1 C:467-485,522-531,599-617
2iy0 d2iy0a1 A:467-485,522-531,599-617
1kv3 d1kv3e4 E:186-200,234-239,256-268
1kv3 d1kv3d4 D:186-200,234-239,256-268
1kv3 d1kv3b4 B:186-200,234-239,256-268
1kv3 d1kv3f4 F:186-200,234-239,256-268
1kv3 d1kv3a4 A:186-200,234-239,256-268
1nln d1nlna_ A:4-16,20-27,121-137
1cmx d1cmxc_ C:414-426,430-436,489-503
2q3z d2q3za4 A:186-200,234-239,256-268
2io1 d2io1e1 E:412-431,467-476,544-562
1xd3 d1xd3c_ C:12-24,28-34,93-108
1cmx d1cmxa_ A:14-26,30-36,89-103
2io0 d2io0a1 A:412-431,434-438,544-562
2io1 d2io1c1 C:412-431,467-476,544-562
1uch d1ucha_ A:12-24,28-34,94-108
2etl d2etlb1 B:9-21,26-31,89-103
1g0d d1g0da4 A:183-195,229-234,251-263
2io1 d2io1e1 E:412-431,434-438,544-562
1xd3 d1xd3c_ C:12-24,48-58,93-108
2io1 d2io1c1 C:412-431,434-438,544-562
1xd3 d1xd3a_ A:12-24,48-58,93-108
2iy1 d2iy1c1 C:467-485,489-493,599-617
2g4d d2g4dc1 C:467-485,489-493,599-617
2g4d d2g4da1 A:467-485,489-493,599-617
2iy1 d2iy1a1 A:467-485,489-493,599-617
2iy0 d2iy0a1 A:467-485,489-493,599-617
1xd3 d1xd3a_ A:12-24,29-34,93-108
1cmx d1cmxc_ C:414-426,452-460,489-503
1uch d1ucha_ A:12-24,48-58,94-108
1cmx d1cmxa_ A:14-26,52-61,89-103
2etl d2etla1 A:9-21,45-55,89-103
2etl d2etlb1 B:9-21,45-55,89-103
1xkg d1xkga1 A:53-62,217-225,226-233
1kfx d1kfxl3 L:117-126,137-146,199-209
9. c.108.1 HAD-like usually contains an insertion (sub)domain after strand 1 !
HAD-like 3 layers: a/b/a; parallel beta-sheet of 6 strands, order 321456
2o2x d2o2xa1 A:57-71,155-161,197-212
2o2x d2o2xa1 A:57-71,175-181,197-212
1zd5 d1zd5a1 A:102-116,179-185,205-218
1zd3 d1zd3a1 A:102-116,179-185,205-218
1s8o d1s8oa1 A:102-116,180-185,205-218
1zd4 d1zd4a1 A:102-116,179-185,205-218
1zd2 d1zd2p1 P:102-116,179-185,205-218
1vj5 d1vj5a1 A:102-116,179-185,205-218
2obb d2obba1 A:25-37,89-93,102-113
1cr6 d1cr6a1 A:102-116,180-185,207-219
1cqz d1cqza1 A:102-116,180-185,207-219
1ek2 d1ek2a1 A:102-116,180-185,207-219
1cqz d1cqzb1 B:102-116,180-185,207-216
1j97 d1j97b_ B:580-592,661-667,702-710
1l7n d1l7na_ A:80-92,161-167,202-210
1cr6 d1cr6b1 B:102-116,180-185,206-219
1wr8 d1wr8b_ B:22-36,38-44,212-229
2q4r d2q4ra1 A:25-40,39-46,233-246
2gmw d2gmwb1 B:52-66,150-156,195-207
2fue d2fuea1 A:32-47,46-53,242-256
2fuc d2fuca1 A:32-47,46-53,242-256
1wr8 d1wr8a_ A:22-36,37-44,212-229
2amy d2amya1 A:25-40,39-46,233-246
1ek2 d1ek2b1 B:102-116,180-185,206-216
1rlo d1rlod_ D:22-37,38-45,253-265
1rlo d1rloc_ C:22-37,38-45,253-265
1rlm d1rlma_ A:22-37,38-45,253-265
1rlo d1rlob_ B:22-37,38-45,253-265
1rlt d1rltd_ D:22-37,38-45,253-265
1rlm d1rlmc_ C:22-37,38-45,253-265
1y8a d1y8aa1 A:85-97,96-103,246-261
1rlt d1rltc_ C:22-37,38-45,253-265
1rlo d1rloa_ A:22-37,38-45,253-265
1u02 d1u02a_ A:25-40,39-46,211-230
1rlt d1rltb_ B:22-37,38-45,253-265
1rlm d1rlmd_ D:22-37,38-45,253-265
1rlm d1rlmb_ B:22-37,38-45,253-265
1rlt d1rlta_ A:22-37,38-45,253-265
1kyt d1kytb_ B:21-35,36-43,210-222
1l6r d1l6rb_ B:21-35,36-43,210-222
1rkq d1rkqa_ A:23-37,38-45,259-271
1rkq d1rkqb_ B:23-37,38-45,259-271
1l6r d1l6ra_ A:21-35,36-43,210-222
1kyt d1kyta_ A:21-35,36-43,210-222
1ta0 d1ta0a_ A:134-146,201-206,232-247
1t9z d1t9za_ A:134-146,201-206,232-247
1rku d1rkub_ B:70-84,84-90,187-200
1rkv d1rkvb_ B:70-84,84-90,187-200
2b8e d2b8ea1 A:551-565,566-573,654-663
1j8d d1j8dc_ C:37-51,52-59,146-160
2b30 d2b30d1 D:47-61,62-69,287-300
2b30 d2b30c1 C:47-61,62-69,287-300
2b30 d2b30a1 A:47-61,62-69,287-300
2b30 d2b30b1 B:47-61,62-69,287-300
1j8d d1j8da_ A:37-51,52-59,146-160
2b8e d2b8eb1 B:551-565,566-573,654-664
1k1e d1k1ed_ D:37-51,52-59,146-160
1j8d d1j8db_ B:37-51,52-59,146-160
1aq6 d1aq6b_ B:95-106,108-115,233-244
1j8d d1j8dd_ D:37-51,52-59,146-160
1k1e d1k1ek_ K:37-51,52-59,146-160
1k1e d1k1ei_ I:37-51,52-59,146-160
1k1e d1k1eg_ G:37-51,52-59,146-160
1k1e d1k1ee_ E:37-51,52-59,146-160
1k1e d1k1ea_ A:37-51,52-59,146-160
1k1e d1k1ej_ J:37-51,52-59,146-160
1k1e d1k1ec_ C:37-51,52-59,146-160
1k1e d1k1ef_ F:37-51,52-59,146-160
1k1e d1k1eh_ H:37-51,52-59,146-160
1k1e d1k1el_ L:37-51,52-59,146-160
1k1e d1k1eb_ B:37-51,52-59,146-160
1x42 d1x42a1 A:102-117,116-122,218-230
1z4m d1z4ma1 A:108-121,123-131,217-226
1z4p d1z4px1 X:108-121,123-131,217-226
1z4k d1z4ka1 A:108-121,123-131,217-226
1z4j d1z4ja1 A:108-121,123-131,217-226
1z4l d1z4la1 A:108-121,123-131,217-226
2jaw d2jawa1 A:108-121,123-131,217-226
1mh9 d1mh9a_ A:108-121,123-131,217-226
2jau d2jaua1 A:108-121,123-131,217-226
1z4i d1z4ia1 A:108-121,123-131,217-226
1z4q d1z4qa1 A:108-121,123-131,217-226
1q92 d1q92a_ A:108-121,123-131,217-226
1q91 d1q91a_ A:110-121,123-131,217-226
2fdr d2fdra1 A:89-99,206-211,211-224
2b8e d2b8ec1 C:551-565,566-573,654-669
1qq6 d1qq6a_ A:95-106,108-115,233-245
1qq7 d1qq7a_ A:95-106,108-115,233-245
1aq6 d1aq6a_ A:95-106,108-115,236-244
1su4 d1su4a2 A:606-618,619-626,739-782
1kju d1kjua2 A:606-618,619-626,739-782
1iwo d1iwob2 B:604-618,619-626,739-782
1iwo d1iwoa2 A:604-618,619-626,739-782
1t5s d1t5sa2 A:604-618,619-626,739-782
1vfp d1vfpa2 A:604-618,619-626,739-782
1vfp d1vfpb2 B:604-618,619-626,739-782
1t5t d1t5ta2 A:604-618,619-626,739-782
2zbd d2zbda2 A:604-618,619-626,739-782
1xp5 d1xp5a2 A:604-618,619-626,739-782
2zbe d2zbeb2 B:604-618,619-626,739-782
2zbf d2zbfa2 A:604-618,619-626,739-782
1wpg d1wpga2 A:604-618,619-626,739-782
1wpg d1wpgd2 D:604-618,619-626,739-782
2zbe d2zbea2 A:604-618,619-626,739-782
1wpg d1wpgb2 B:604-618,619-626,739-782
1wpg d1wpgc2 C:604-618,619-626,739-782
2zbg d2zbga2 A:604-618,619-626,739-782
3b9r d3b9ra2 A:604-618,619-626,739-782
3b9b d3b9ba2 A:604-618,619-626,739-782
10. c.80.1 SIS domain
SIS domain 3 layers: a/b/a; parallel beta-sheet of 5 strands, order 21345
1c7r d1c7ra_ A:80-95,106-112,208-218
1c7q d1c7qa_ A:80-95,106-112,208-218
2pgi d2pgia_ A:80-95,106-112,208-218
1b0z d1b0za_ A:80-95,106-112,208-218
1gzv d1gzva_ A:156-171,178-184,280-288
1jlh d1jlha_ A:156-171,178-184,280-288
1iri d1iric_ C:157-172,179-185,281-289
1dqr d1dqra_ A:156-171,178-184,280-288
1koj d1koja_ A:156-171,178-184,280-288
1u0f d1u0fa_ A:156-171,178-184,280-288
1gzd d1gzda_ A:156-171,178-184,280-288
1u0f d1u0fb_ B:156-171,178-184,280-288
1q50 d1q50a_ A:204-219,226-232,333-341
1jlh d1jlhc_ C:156-171,178-184,280-288
1u0g d1u0ga_ A:156-171,178-184,280-288
1iat d1iata_ A:156-171,178-184,280-288
1jiq d1jiqc_ C:157-172,179-185,281-289
1hm5 d1hm5a_ A:156-171,178-184,280-288
1u0e d1u0eb_ B:156-171,178-184,280-288
1iri d1irib_ B:157-172,179-185,281-289
1dqr d1dqrb_ B:156-171,178-184,280-288
1jlh d1jlhd_ D:156-171,178-184,280-288
1u0e d1u0ea_ A:156-171,178-184,280-288
1koj d1kojb_ B:156-171,178-184,280-288
1jiq d1jiqb_ B:157-172,179-185,281-289
1n8t d1n8tb_ B:156-171,178-184,280-288
1xtb d1xtbb1 B:1156-1171,1178-1184,1280-1288
1jlh d1jlhb_ B:156-171,178-184,280-288
1hox d1hoxb_ B:156-171,178-184,280-288
1n8t d1n8ta_ A:156-171,178-184,280-288
1g98 d1g98b_ B:156-171,178-184,280-288
1hm5 d1hm5b_ B:156-171,178-184,280-288
1jiq d1jiqd_ D:157-172,179-185,281-289
1jiq d1jiqa_ A:157-172,179-185,281-289
1u0g d1u0gb_ B:156-171,178-184,280-288
1g98 d1g98a_ A:156-171,178-184,280-288
1xtb d1xtba1 A:156-171,178-184,280-288
1iri d1irid_ D:157-172,179-185,281-289
1hox d1hoxa_ A:156-171,178-184,280-288
1iri d1iria_ A:157-172,179-185,281-289
1t10 d1t10a_ A:204-219,226-232,333-341
1nuh d1nuha_ A:156-171,178-184,280-288
1tzb d1tzbb_ B:45-63,81-88,137-154
1tzb d1tzba_ A:45-63,81-88,137-154
1jxa d1jxaa1 A:300-319,340-349,401-424
1mor d1mora_ A:300-319,340-349,401-424
2j6h d2j6hb1 B:300-319,340-349,401-424
1jxa d1jxab1 B:300-319,340-349,401-424
1c7r d1c7ra_ A:80-95,131-139,208-218
1jxa d1jxac1 C:300-319,340-349,401-424
3bjz d3bjzc1 C:51-68,111-121,169-194
1moq d1moqa_ A:300-319,340-349,401-424
2vf5 d2vf5x1 X:300-319,340-349,401-424
1x9h d1x9ha_ A:45-63,81-91,137-154
1tzc d1tzcb_ B:45-63,81-91,137-154
1x9i d1x9ib_ B:45-63,81-91,137-154
1x9h d1x9hb_ B:45-63,81-91,137-154
2bpl d2bplb1 B:300-319,340-349,401-424
2j6h d2j6ha1 A:300-319,340-349,401-424
1mos d1mosa_ A:300-319,340-349,401-424
2vf4 d2vf4x1 X:300-319,340-349,401-424
1tzc d1tzca_ A:45-63,81-91,137-154
1x9i d1x9ia_ A:45-63,81-91,137-154
3bjz d3bjzd1 D:50-68,111-121,169-194
1tk9 d1tk9c_ C:49-67,111-120,165-188
1m3s d1m3sa_ A:43-62,78-87,148-171
1tk9 d1tk9a_ A:49-67,111-120,165-188
1b0z d1b0za_ A:80-95,131-139,208-218
2pgi d2pgia_ A:80-95,131-139,208-218
1c7q d1c7qa_ A:80-95,131-139,208-218
1x92 d1x92a_ A:50-68,111-121,169-194
1vim d1vimb_ B:41-60,77-85,146-169
1m3s d1m3sb_ B:43-62,78-87,148-171
1tk9 d1tk9b_ B:49-67,111-120,165-188
1mor d1mora_ A:472-491,514-520,568-592
3bjz d3bjza1 A:50-68,111-120,169-194
2vf5 d2vf5x1 X:472-491,514-520,568-592
1tk9 d1tk9d_ D:49-67,111-120,165-188
2vf4 d2vf4x1 X:472-491,514-520,568-592
1x92 d1x92b_ B:50-68,111-121,169-194
1vim d1vimd_ D:41-60,77-86,146-169
1vim d1vima_ A:41-60,77-86,146-169
1vim d1vimc_ C:41-60,77-86,146-169
3bjz d3bjzb1 B:50-68,111-121,169-194
1moq d1moqa_ A:472-491,514-520,568-592
1jeo d1jeoa_ A:47-66,83-92,143-166
1mos d1mosa_ A:472-491,514-520,568-592
1j5x d1j5xa_ A:48-67,89-98,148-168
1jxa d1jxac1 C:472-491,514-521,571-592
1tzb d1tzba_ A:45-63,66-72,137-154
1x9i d1x9ib_ B:45-63,66-72,137-154
1x9h d1x9ha_ A:45-63,66-72,137-154
1x9i d1x9ia_ A:45-63,66-72,137-154
1tzc d1tzca_ A:45-63,66-72,137-154
1tzc d1tzcb_ B:45-63,66-72,137-154
1tzb d1tzbb_ B:45-63,66-72,137-154
1x9h d1x9hb_ B:45-63,66-72,137-154
1wiw d1wiwb_ B:44-55,61-70,107-123
1x9i d1x9ib_ B:45-63,107-115,137-154
1nri d1nria_ A:76-95,137-146,198-223
1viv d1viva_ A:43-62,78-87,146-171
2bpl d2bpla1 A:300-311,340-349,401-424
1jxa d1jxab1 B:472-491,514-521,571-592
1x94 d1x94b_ B:52-74,111-121,167-191
2j6h d2j6hb1 B:472-491,514-521,568-592
1j5x d1j5xa_ A:208-227,249-256,292-315
1viv d1vivb_ B:43-62,78-87,146-171
2bpl d2bplc1 C:300-311,340-349,401-424
2bpl d2bplb1 B:472-491,514-521,568-592
2j6h d2j6ha1 A:472-491,514-521,568-592
2bpl d2bpla1 A:472-491,514-521,568-592
1tk9 d1tk9c_ C:49-67,138-146,165-188
1nri d1nria_ A:76-95,100-106,198-223
1tk9 d1tk9d_ D:49-67,138-146,165-188
1x94 d1x94a_ A:52-74,111-121,167-191
1jxa d1jxab1 B:472-491,492-498,571-592
2bpl d2bplc1 C:472-491,514-521,568-592
1tk9 d1tk9b_ B:49-67,138-146,165-188
1wiw d1wiwa_ A:44-55,63-71,107-123
1tk9 d1tk9a_ A:49-67,138-146,165-188
1tzc d1tzcb_ B:45-63,108-115,137-154
1jxa d1jxaa1 A:472-491,514-521,568-592
1jxa d1jxac1 C:472-491,492-498,571-592
1tzb d1tzbb_ B:45-63,108-114,137-154
1tzb d1tzba_ A:45-63,108-114,137-154
2vf5 d2vf5x1 X:472-491,492-498,568-592
1x9i d1x9ia_ A:45-63,108-115,137-154
1x92 d1x92b_ B:50-68,138-147,169-194
1x9h d1x9hb_ B:45-63,108-115,137-154
1x9h d1x9ha_ A:45-63,108-115,137-154
1tzc d1tzca_ A:45-63,108-115,137-154
3bjz d3bjza1 A:50-68,138-146,169-194
1moq d1moqa_ A:472-491,492-498,568-592
1jxa d1jxac1 C:300-319,321-326,401-424
1mor d1mora_ A:472-491,492-498,568-592
2vf4 d2vf4x1 X:472-491,492-499,568-592
1x92 d1x92a_ A:50-68,138-147,169-194
1mos d1mosa_ A:472-491,492-499,568-592
2bpl d2bplb1 B:472-491,492-498,568-592
2j6h d2j6ha1 A:300-319,321-326,401-424
2j6h d2j6hb1 B:472-491,492-499,568-592
3bjz d3bjzd1 D:50-68,138-147,169-194
3bjz d3bjzb1 B:50-68,138-147,169-194
1jxa d1jxaa1 A:472-491,492-499,568-592
2j6h d2j6ha1 A:472-491,492-498,568-592
2bpl d2bpla1 A:472-491,492-498,568-592
2bpl d2bplc1 C:472-491,492-498,568-592
3bjz d3bjza1 A:50-68,77-81,169-194
1j5x d1j5xa_ A:208-227,229-234,292-315
2vf4 d2vf4x1 X:300-319,320-326,401-424
3bjz d3bjzc1 C:51-68,77-81,169-194
2vf4 d2vf4x1 X:300-319,368-376,401-424
1mor d1mora_ A:300-319,368-376,401-424
3bjz d3bjzd1 D:50-68,77-81,169-194
1j5x d1j5xa_ A:48-67,115-124,148-168
3bjz d3bjzb1 B:50-68,77-81,169-194
1moq d1moqa_ A:300-319,367-376,401-424
1hm5 d1hm5b_ B:344-361,376-382,482-505
1xtb d1xtba1 A:344-361,376-382,482-505
1jlh d1jlhd_ D:344-361,376-382,482-505
2j6h d2j6hb1 B:300-319,367-376,401-424
1jlh d1jlhc_ C:344-361,376-382,482-505
1jxa d1jxab1 B:300-319,368-376,401-424
1jlh d1jlhb_ B:344-361,376-382,482-505
1u0g d1u0gb_ B:344-361,376-382,482-505
2vf5 d2vf5x1 X:300-319,367-376,401-424
3bjz d3bjzc1 C:51-68,138-147,169-194
2bpl d2bplb1 B:300-319,368-376,401-424
1vim d1vima_ A:41-60,104-112,146-169
2bpl d2bplc1 C:300-311,368-376,401-424
2j6h d2j6ha1 A:300-319,367-376,401-424
1mos d1mosa_ A:300-319,367-376,401-424
1vim d1vimd_ D:41-60,104-112,146-169
2bpl d2bpla1 A:300-311,367-376,401-424
1jxa d1jxac1 C:300-319,367-376,401-424
1vim d1vimc_ C:41-60,104-112,146-169
1iri d1irid_ D:345-362,377-384,483-506
1hm5 d1hm5a_ A:344-361,376-383,482-505
1n8t d1n8ta_ A:344-361,376-383,482-505
1jxa d1jxaa1 A:300-319,367-376,401-424
1koj d1kojb_ B:344-361,376-383,482-505
1n8t d1n8tb_ B:344-361,376-383,482-505
1gzd d1gzda_ A:344-361,376-383,482-505
1xtb d1xtbb1 B:1344-1361,1376-1383,1482-1505
1jiq d1jiqd_ D:345-362,377-384,483-506
1jiq d1jiqa_ A:345-362,377-384,483-506
1hox d1hoxa_ A:344-361,376-383,482-505
1hox d1hoxb_ B:344-361,376-383,482-505
1jiq d1jiqc_ C:345-362,377-384,483-506
1jiq d1jiqb_ B:345-362,377-384,483-506
1jlh d1jlha_ A:344-361,376-383,482-505
1u0e d1u0eb_ B:344-361,376-383,482-505
1g98 d1g98a_ A:344-361,376-383,482-505
1g98 d1g98b_ B:344-361,376-383,482-505
1nuh d1nuha_ A:344-361,376-383,482-505
1gzv d1gzva_ A:344-361,376-383,482-505
1iri d1iric_ C:345-362,377-384,483-506
1iat d1iata_ A:344-361,376-383,482-505
1u0e d1u0ea_ A:344-361,376-383,482-505
1u0g d1u0ga_ A:344-361,376-383,482-505
1iri d1irib_ B:345-362,377-384,483-506
1u0f d1u0fb_ B:344-361,376-383,482-505
1koj d1koja_ A:344-361,376-383,482-505
1u0f d1u0fa_ A:344-361,376-383,482-505
1wiw d1wiwb_ B:172-188,215-222,250-274
1iri d1iria_ A:345-362,377-384,483-506
1m3s d1m3sa_ A:43-62,105-113,148-171
1m3s d1m3sb_ B:43-62,105-113,148-171
1wiw d1wiwa_ A:172-188,215-222,250-274
1x9h d1x9ha_ A:190-206,228-234,262-285
1x9i d1x9ib_ B:190-206,228-234,262-285
1x9h d1x9hb_ B:190-206,228-234,262-285
1tzb d1tzba_ A:190-206,228-234,262-285
1tzc d1tzcb_ B:190-206,228-234,262-285
1tzc d1tzca_ A:190-206,228-234,262-285
2vf5 d2vf5x1 X:472-491,492-498,498-505
1moq d1moqa_ A:472-491,492-498,498-505
1tzb d1tzbb_ B:190-206,228-234,262-285
1jxa d1jxaa1 A:472-491,541-549,568-592
2j6h d2j6ha1 A:472-491,492-498,498-505
1vim d1vimb_ B:41-60,104-111,146-169
1mor d1mora_ A:472-491,492-498,498-505
1mos d1mosa_ A:472-491,492-499,498-505
2bpl d2bplc1 C:472-491,492-498,498-505
1wiw d1wiwb_ B:44-55,87-96,107-123
1j5x d1j5xa_ A:208-227,229-234,234-241
1dqr d1dqra_ A:344-361,376-383,482-505
2bpl d2bpla1 A:472-491,492-498,498-505
1j5x d1j5xa_ A:208-227,276-283,292-315
1wiw d1wiwa_ A:44-55,87-96,107-123
1dqr d1dqrb_ B:344-361,376-383,482-505
2bpl d2bplb1 B:472-491,492-498,498-505
1jeo d1jeoa_ A:47-66,111-118,143-166
1mos d1mosa_ A:472-491,542-549,568-592
1moq d1moqa_ A:472-491,542-549,568-592
1viv d1vivb_ B:43-62,105-113,146-171
1x9i d1x9ia_ A:190-206,254-259,262-285
1tzb d1tzba_ A:190-206,254-259,262-285
1jxa d1jxac1 C:472-491,492-498,498-505
1x9h d1x9ha_ A:190-206,254-259,262-285
1jxa d1jxab1 B:300-319,321-326,326-334
1nuh d1nuha_ A:156-171,202-210,270-278
1iri d1iric_ C:157-172,203-211,271-279
1jxa d1jxab1 B:472-491,492-498,498-505
1u0g d1u0ga_ A:156-171,202-210,270-278
1tzc d1tzca_ A:190-206,254-259,262-285
1tzb d1tzbb_ B:190-206,254-259,262-285
1x9i d1x9ib_ B:190-206,254-259,262-285
1x9h d1x9hb_ B:190-206,254-259,262-285
1tzc d1tzcb_ B:190-206,254-259,262-285
1u0e d1u0ea_ A:156-171,202-210,270-278
1x94 d1x94b_ B:52-74,138-147,167-191
1u0f d1u0fa_ A:156-171,202-210,270-278
1iri d1irib_ B:157-172,203-211,271-279
1iri d1irid_ D:157-172,203-211,271-279
1n8t d1n8ta_ A:156-171,202-210,270-278
1iri d1iria_ A:157-172,203-211,271-279
1u0g d1u0gb_ B:156-171,202-210,270-278
1g98 d1g98b_ B:156-171,202-210,270-278
1iat d1iata_ A:156-171,202-210,270-278
2vf4 d2vf4x1 X:472-491,542-549,568-592
1hox d1hoxb_ B:156-171,202-210,270-278
1hox d1hoxa_ A:156-171,202-210,270-278
1dqr d1dqrb_ B:156-171,202-210,270-278
1koj d1kojb_ B:156-171,202-210,270-278
1dqr d1dqra_ A:156-171,202-210,270-278
1xtb d1xtba1 A:156-171,202-210,270-278
1n8t d1n8tb_ B:156-171,202-210,270-278
1g98 d1g98a_ A:156-171,202-210,270-278
1jiq d1jiqc_ C:157-172,203-211,271-279
1viv d1viva_ A:43-62,105-113,146-171
1xtb d1xtbb1 B:1156-1171,1202-1210,1270-1278
1hm5 d1hm5b_ B:156-171,202-210,270-278
1koj d1koja_ A:156-171,202-210,270-278
1jiq d1jiqa_ A:157-172,203-211,271-279
1x94 d1x94a_ A:52-74,138-147,167-191
1u0e d1u0eb_ B:156-171,202-210,270-278
1gzd d1gzda_ A:156-171,202-210,270-278
1jiq d1jiqd_ D:157-172,203-211,271-279
1jiq d1jiqb_ B:157-172,203-211,271-279
1jxa d1jxaa1 A:300-319,321-326,326-333
1nri d1nria_ A:76-95,164-172,198-223
1gzv d1gzva_ A:156-171,202-210,270-278
1t10 d1t10a_ A:204-219,250-259,323-331
1c7r d1c7ra_ A:269-289,318-328,384-407
2j6h d2j6hb1 B:300-319,321-326,326-333
1b0z d1b0za_ A:269-289,318-328,384-407
2pgi d2pgia_ A:269-289,318-328,384-407
1c7q d1c7qa_ A:269-289,318-328,384-407
2j6h d2j6ha1 A:300-319,321-326,326-333
1q50 d1q50a_ A:204-219,250-258,323-331
2bpl d2bplb1 B:300-319,321-326,326-333
1moq d1moqa_ A:300-319,321-326,326-333
1mos d1mosa_ A:300-319,321-326,326-333
1jxa d1jxac1 C:300-319,321-326,326-333
1mor d1mora_ A:300-319,321-326,326-333
2vf5 d2vf5x1 X:300-319,321-326,326-333
2vf4 d2vf4x1 X:300-319,320-326,326-333
1jlh d1jlhb_ B:156-171,242-246,280-288
1n8t d1n8tb_ B:156-171,242-247,280-288
1jlh d1jlha_ A:156-171,242-246,280-288
1jlh d1jlhd_ D:156-171,242-246,280-288
1n8t d1n8ta_ A:156-171,242-247,280-288
1hm5 d1hm5b_ B:156-171,242-247,280-288
1nuh d1nuha_ A:344-361,401-410,482-505
1dqr d1dqrb_ B:344-361,402-410,482-505
1dqr d1dqra_ A:344-361,402-410,482-505
1q50 d1q50a_ A:397-414,454-463,533-556
1u0f d1u0fb_ B:156-171,242-246,280-288
1t10 d1t10a_ A:397-414,454-463,533-556
1jlh d1jlhb_ B:344-361,401-410,482-505
1iri d1irid_ D:345-362,402-411,483-506
1jlh d1jlha_ A:344-361,401-410,482-505
1g98 d1g98a_ A:344-361,401-410,482-505
1xtb d1xtba1 A:344-361,401-410,482-505
1jiq d1jiqa_ A:345-362,402-411,483-506
1iat d1iata_ A:344-361,401-410,482-505
1xtb d1xtbb1 B:1344-1361,1401-1410,1482-1505
1jlh d1jlhd_ D:344-361,402-410,482-505
1jlh d1jlhc_ C:344-361,402-410,482-505
1iri d1irib_ B:345-362,402-411,483-506
1koj d1koja_ A:344-361,401-410,482-505
1hm5 d1hm5b_ B:344-361,401-410,482-505
1gzd d1gzda_ A:344-361,402-410,482-505
1n8t d1n8tb_ B:344-361,402-410,482-505
1jiq d1jiqd_ D:345-362,402-411,483-506
1iri d1iric_ C:345-362,402-411,483-506
1jiq d1jiqc_ C:345-362,402-411,483-506
1iri d1iria_ A:345-362,403-411,483-506
1n8t d1n8ta_ A:344-361,401-410,482-505
1g98 d1g98b_ B:344-361,401-410,482-505
1jiq d1jiqb_ B:345-362,402-411,483-506
1hox d1hoxb_ B:344-361,401-410,482-505
1u0g d1u0ga_ A:344-361,401-410,482-505
1hm5 d1hm5a_ A:344-361,402-410,482-505
1hox d1hoxa_ A:344-361,401-410,482-505
1koj d1kojb_ B:344-361,401-410,482-505
1gzv d1gzva_ A:344-361,402-410,482-505
1u0g d1u0gb_ B:344-361,401-410,482-505
1u0e d1u0ea_ A:344-361,401-410,482-505
1u0e d1u0eb_ B:344-361,401-410,482-505
1u0f d1u0fa_ A:344-361,401-410,482-505
1u0f d1u0fb_ B:344-361,401-410,482-505
1nuh d1nuha_ A:156-171,241-247,270-278
1iri d1iric_ C:157-172,243-248,271-279
1iri d1irib_ B:157-172,242-248,271-279
1iri d1irid_ D:157-172,243-248,271-279
1u0g d1u0ga_ A:156-171,241-247,270-278
1hox d1hoxa_ A:156-171,241-247,270-278
1hox d1hoxb_ B:156-171,241-247,270-278
1iri d1iria_ A:157-172,242-248,271-279
1dqr d1dqra_ A:156-171,241-247,270-278
1iat d1iata_ A:156-171,241-247,270-278
1g98 d1g98b_ B:156-171,241-247,270-278
1koj d1kojb_ B:156-171,241-247,270-278
1u0f d1u0fa_ A:156-171,241-247,270-278
1u0e d1u0ea_ A:156-171,241-247,270-278
1u0g d1u0gb_ B:156-171,241-247,270-278
1koj d1koja_ A:156-171,241-247,270-278
1g98 d1g98a_ A:156-171,241-247,270-278
1dqr d1dqrb_ B:156-171,241-247,270-278
1xtb d1xtba1 A:156-171,241-247,270-278
1xtb d1xtbb1 B:1156-1171,1242-1247,1270-1278
1gzd d1gzda_ A:156-171,242-247,270-278
1n8t d1n8ta_ A:156-171,242-247,270-278
1jiq d1jiqc_ C:157-172,242-248,271-279
1n8t d1n8tb_ B:156-171,242-247,270-278
1jiq d1jiqa_ A:157-172,243-248,271-279
1hm5 d1hm5b_ B:156-171,242-247,270-278
1u0e d1u0eb_ B:156-171,241-247,270-278
1jiq d1jiqb_ B:157-172,243-248,271-279
1jiq d1jiqd_ D:157-172,243-248,271-279
11. c.2.1 NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
NAD(P)-binding Rossmann-fold domains core: 3 layers, a/b/a; parallel beta-sheet of 6 strands, order 321456 ! The nucleotide-binding modes of this and the next two folds/superfamilies are similar
1yl7 d1yl7e1 E:10-24,47-53,213-228
1yl7 d1yl7a1 A:10-24,47-53,213-228
1yl7 d1yl7d1 D:10-24,47-53,213-228
1c3v d1c3va1 A:510-524,547-553,713-728
1c3v d1c3vb1 B:1010-1024,1047-1053,1213-1228
1yl7 d1yl7g1 G:10-24,47-53,213-228
1yl7 d1yl7b1 B:10-24,47-53,213-228
1p9l d1p9lb1 B:10-24,47-53,213-228
1p9l d1p9la1 A:10-24,47-53,213-228
1yl7 d1yl7c1 C:10-24,47-53,213-228
1yl5 d1yl5b1 B:10-24,47-53,213-228
1yl7 d1yl7f1 F:10-24,47-53,213-228
1yl7 d1yl7h1 H:10-24,47-52,213-228
1yl5 d1yl5a1 A:10-24,47-53,215-228
1yl6 d1yl6b1 B:10-24,47-52,213-228
1yl6 d1yl6a1 A:10-24,47-52,213-228
2q49 d2q49b1 B:26-39,84-89,326-345
2g17 d2g17a1 A:11-25,74-79,307-326
2q49 d2q49a1 A:26-40,84-89,326-345
1h5q d1h5qc_ C:21-35,91-97,229-243
1cyd d1cydc_ C:17-31,78-83,211-225
1h5q d1h5qj_ J:21-35,91-97,229-243
1cyd d1cydb_ B:17-31,78-83,211-225
1cyd d1cydd_ D:17-31,78-83,211-225
1cyd d1cyda_ A:17-31,78-83,211-225
1h5q d1h5qi_ I:21-35,91-97,229-243
1xyg d1xygd1 D:26-39,84-89,326-345
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1ofg d1ofgf1 F:40-54,123-128,323-339
1ofg d1ofga1 A:40-54,123-128,323-339
1li4 d1li4a1 A:222-236,292-299,344-351
1gr0 d1gr0a1 A:24-38,61-69,309-332
1h6c d1h6cb1 B:92-106,175-180,375-391
1d4f d1d4fb1 B:221-235,291-298,343-350
1rye d1ryec1 C:40-54,123-128,323-339
1ky5 d1ky5a1 A:221-235,291-298,343-350
1rm0 d1rm0b1 B:75-91,141-148,437-460
1tlt d1tltb1 B:14-28,30-38,267-282
1u1i d1u1ib1 B:410-426,451-458,731-754
1u1i d1u1ia1 A:10-26,51-58,331-354
1p1f d1p1fb1 B:75-91,141-148,437-460
1zh8 d1zh8a1 A:20-30,32-40,277-293
1zh8 d1zh8b1 B:20-30,32-40,277-293
12. c.67.1 PLP-dependent transferases
PLP-dependent transferase-like main domain: 3 layers: a/b/a, mixed beta-sheet of 7 strands, order 3245671; strand 7 is antiparallel to the rest
1yiy d1yiyb1 B:25-38,39-43,368-382
1yiz d1yizb1 B:25-38,39-43,368-382
2r5c d2r5cb1 B:25-38,39-43,368-382
1yiz d1yiza1 A:25-38,39-43,368-382
2r5e d2r5ea1 A:25-38,39-43,368-382
1yiy d1yiya1 A:25-38,39-43,368-382
2r5c d2r5ca1 A:25-38,39-43,368-382
2r5e d2r5eb1 B:25-38,39-43,368-382
1u08 d1u08b_ B:18-31,32-36,333-346
1w7m d1w7ma_ A:16-29,30-34,361-375
1u08 d1u08a_ A:18-31,32-36,333-346
1w7l d1w7la_ A:16-29,30-34,361-375
1w7n d1w7na_ A:16-29,30-34,361-375
1v2e d1v2ea_ A:13-26,27-31,318-327
1j32 d1j32a_ A:13-29,32-36,334-347
1gd9 d1gd9b_ B:513-526,528-532,831-844
1gd9 d1gd9a_ A:13-26,28-32,331-344
1gc4 d1gc4b_ B:514-530,533-537,833-845
1gc4 d1gc4a_ A:14-30,33-37,333-345
1v2f d1v2fa_ A:13-26,27-31,318-327
1gc4 d1gc4d_ D:1514-1530,1533-1537,1833-1845
1gc4 d1gc4c_ C:1014-1030,1033-1037,1333-1345
2g6w d2g6wa1 A:83-98,100-106,269-285
1bs0 d1bs0a_ A:83-98,100-106,269-285
1b9h d1b9ha_ A:37-52,54-60,238-252
1b9i d1b9ia_ A:37-52,54-60,238-252
1v2d d1v2da_ A:14-26,27-31,318-327
1gde d1gdea_ A:13-25,28-32,331-344
1dje d1djea_ A:83-98,100-106,269-285
1v2f d1v2fb_ B:13-26,27-31,318-327
1mdz d1mdza_ A:37-53,55-61,245-259
1mdx d1mdxa_ A:37-53,55-61,245-259
1mdo d1mdoa_ A:37-53,55-61,245-259
1ax4 d1ax4a_ A:75-90,92-98,305-321
1ax4 d1ax4b_ B:75-90,92-98,305-321
1cs1 d1cs1c_ C:51-66,67-74,234-248
1ax4 d1ax4c_ C:75-90,92-98,305-321
1ax4 d1ax4d_ D:75-90,92-98,305-321
1xi9 d1xi9c_ C:13-29,32-36,340-353
1tpl d1tplb_ B:74-89,91-97,295-311
1cs1 d1cs1b_ B:51-66,67-74,234-248
1aib d1aibb_ B:15-28,32-36,366-378
2fn6 d2fn6b1 B:31-46,48-54,232-246
1aib d1aiba_ A:15-28,32-36,366-378
1aia d1aiaa_ A:15-28,32-36,366-378
2fn6 d2fn6a1 A:31-46,48-55,232-246
2ctz d2ctzb1 B:57-72,73-80,273-287
2fnu d2fnub1 B:31-46,48-54,232-246
1ukj d1ukjb_ B:564-579,582-587,748-762
1aic d1aica_ A:15-28,32-36,366-378
2fni d2fnia1 A:31-46,48-55,232-246
2fni d2fnib1 B:31-46,48-55,232-246
1i41 d1i41d_ D:113-128,131-136,296-310
1i41 d1i41j_ J:113-128,131-136,296-310
1i43 d1i43b_ B:113-128,131-136,296-310
1gc2 d1gc2a_ A:64-79,82-87,248-262
1i41 d1i41g_ G:113-128,131-136,296-310
1gc2 d1gc2b_ B:64-79,82-87,248-262
2fnu d2fnua1 A:31-46,48-54,232-246
1i41 d1i41a_ A:113-128,131-136,296-310
1i41 d1i41i_ I:113-128,131-136,296-310
1i41 d1i41e_ E:113-128,131-136,296-310
1i43 d1i43i_ I:113-128,131-136,296-310
1i43 d1i43j_ J:113-128,131-136,296-310
2ctz d2ctza1 A:57-72,73-80,273-287
1i41 d1i41f_ F:113-128,131-136,296-310
1cs1 d1cs1a_ A:51-66,68-74,234-248
1i41 d1i41c_ C:113-128,131-136,296-310
2tpl d2tpla_ A:74-89,91-98,295-311
2aeu d2aeua1 A:270-286,287-296,356-373
1i41 d1i41b_ B:113-128,131-136,296-310
1i41 d1i41k_ K:113-128,131-136,296-310
1i41 d1i41g_ G:309-332,420-428,430-445
1qgn d1qgnb_ B:309-332,420-428,430-445
1cl1 d1cl1b_ B:61-76,78-84,245-259
1mgv d1mgva_ A:85-100,104-111,313-330
1i43 d1i43i_ I:309-332,420-428,430-445
1i43 d1i43e_ E:113-128,131-136,296-310
1i41 d1i41l_ L:113-128,131-136,296-310
3tat d3tatc_ C:15-28,32-36,366-378
3tat d3tatf_ F:15-28,32-36,366-378
3tat d3tate_ E:15-28,32-36,366-378
3tat d3tatd_ D:15-28,32-36,366-378
3tat d3tata_ A:15-28,32-36,366-378
3tat d3tatb_ B:15-28,32-36,366-378
1gc2 d1gc2c_ C:64-79,82-87,248-262
1cl1 d1cl1a_ A:61-76,78-84,245-259
1i43 d1i43l_ L:309-332,420-428,430-445
1i43 d1i43f_ F:113-128,131-136,296-310
1i43 d1i43c_ C:113-128,131-136,296-310
1i41 d1i41h_ H:113-128,131-136,296-310
1qgn d1qgng_ G:309-332,420-428,430-445
1gc0 d1gc0d_ D:64-79,82-87,248-262
1i41 d1i41k_ K:309-332,420-428,430-445
1gc2 d1gc2d_ D:64-79,82-87,248-262
1i41 d1i41c_ C:309-332,420-428,430-445
1n8p d1n8pb_ B:54-69,71-77,239-253
1cs1 d1cs1d_ D:51-66,68-74,234-248
1cl2 d1cl2b_ B:61-76,78-84,245-259
1i41 d1i41f_ F:309-332,420-428,430-445
1dty d1dtya_ A:85-100,104-111,313-330
1cl2 d1cl2a_ A:61-76,78-84,245-259
1gc0 d1gc0a_ A:64-79,82-87,248-262
1i48 d1i48a_ A:113-128,131-136,296-310
1asn d1asnb_ B:15-28,32-36,366-377
1gc0 d1gc0b_ B:64-79,82-87,248-262
1s07 d1s07a_ A:85-100,104-111,313-330
1gc0 d1gc0c_ C:64-79,82-87,248-262
1i43 d1i43c_ C:309-332,420-428,430-445
1szs d1szsc1 C:83-98,103-109,301-319
2gqn d2gqnb1 B:61-76,78-84,245-259
1wkh d1wkhb1 B:86-101,105-112,287-305
1dty d1dtyb_ B:85-100,104-111,313-330
1i41 d1i41i_ I:309-332,420-428,430-445
2aev d2aeva1 A:270-286,287-296,356-373
2gqn d2gqna1 A:61-76,78-84,245-259
1i41 d1i41d_ D:309-332,420-428,430-445
2fq6 d2fq6a1 A:61-76,78-84,245-259
1i43 d1i43d_ D:309-332,420-428,430-445
1e5e d1e5ea_ A:61-76,79-84,246-260
1e5f d1e5fa_ A:61-76,79-84,246-260
1ukj d1ukjc_ C:1064-1079,1082-1087,1248-1262
1i41 d1i41a_ A:309-332,420-428,430-445
1i48 d1i48g_ G:113-128,131-136,296-310
1asl d1aslb_ B:15-28,32-36,366-378
1sff d1sffa_ A:83-98,103-109,301-319
1ukj d1ukjd_ D:1564-1579,1582-1587,1748-1762
1sff d1sffc_ C:83-98,103-109,301-319
1n8p d1n8pd_ D:54-69,71-77,239-253
1n8p d1n8pc_ C:54-69,71-77,239-253
1i41 d1i41l_ L:309-332,420-428,430-445
1e5e d1e5eb_ B:61-76,79-84,246-260
1i48 d1i48h_ H:113-128,131-136,296-310
1i43 d1i43j_ J:309-332,420-428,430-445
1szu d1szuc1 C:83-98,103-109,301-319
1i43 d1i43f_ F:309-332,420-428,430-445
1i43 d1i43k_ K:309-332,420-428,430-445
1qz9 d1qz9a_ A:68-85,90-95,284-302
1ibj d1ibja_ A:132-147,149-155,314-328
1szu d1szua1 A:83-98,103-109,301-319
1szs d1szsa1 A:83-98,103-109,301-319
1s09 d1s09a_ A:85-100,104-111,313-330
1mly d1mlya_ A:85-100,104-111,313-330
1i43 d1i43b_ B:309-332,420-428,430-445
1e5f d1e5fb_ B:61-76,79-84,246-260
1sff d1sffb_ B:83-98,103-109,301-319
1n8p d1n8pa_ A:54-69,71-78,239-253
1i48 d1i48i_ I:309-332,420-428,430-445
1wkg d1wkga1 A:86-101,105-112,287-305
1pg8 d1pg8a_ A:64-79,82-87,248-262
2fq6 d2fq6b1 B:61-76,78-84,245-259
2o7c d2o7cb1 B:564-579,582-587,748-762
1i41 d1i41b_ B:309-332,420-428,430-445
1szu d1szub1 B:83-98,103-109,301-319
1szs d1szsb1 B:83-98,103-109,301-319
1i41 d1i41h_ H:309-332,420-428,430-445
1i48 d1i48k_ K:309-332,420-428,430-445
1s08 d1s08a_ A:85-100,104-111,313-330
1i48 d1i48g_ G:309-332,420-428,430-445
1qj5 d1qj5a_ A:85-100,104-111,313-330
1szk d1szkd1 D:83-98,103-109,301-319
1mlz d1mlza_ A:85-100,104-111,313-330
1ukj d1ukja_ A:64-79,82-87,248-262
1wkh d1wkha1 A:86-101,105-112,287-305
1szk d1szkb1 B:83-98,103-109,301-319
1i48 d1i48b_ B:309-332,420-428,430-445
1szk d1szka1 A:83-98,103-109,301-319
1ibj d1ibjc_ C:132-147,149-155,314-328
1dj9 d1dj9a_ A:83-98,100-106,269-286
2o7c d2o7cc1 C:1064-1079,1082-1087,1248-1262
1i48 d1i48c_ C:309-332,420-428,430-445
1s0a d1s0aa_ A:85-100,104-111,313-330
1qgn d1qgna_ A:113-128,130-136,296-310
1szk d1szkc1 C:83-98,103-109,301-319
2dgm d2dgmc1 C:90-109,119-125,320-335
1s06 d1s06a_ A:85-100,104-111,313-330
1qgn d1qgnc_ C:309-332,420-428,430-445
1vef d1vefa1 A:86-101,105-112,287-305
1i41 d1i41j_ J:309-332,420-428,430-445
1aic d1aicb_ B:15-28,32-36,366-377
1pmo d1pmoc_ C:90-109,119-125,320-335
1qgn d1qgnd_ D:113-128,130-136,296-310
1sf2 d1sf2d_ D:83-98,103-109,301-319
1xey d1xeya_ A:90-109,119-124,320-335
1sff d1sffd_ D:83-98,103-109,301-319
1dge d1dgea_ A:84-99,103-110,307-325
1pmo d1pmod_ D:90-109,119-125,320-335
1pmo d1pmoa_ A:90-109,119-125,320-335
1szs d1szsd1 D:83-98,103-109,301-319
1pmo d1pmob_ B:90-109,119-125,320-335
1pmo d1pmof_ F:90-109,119-125,320-335
1aia d1aiab_ B:15-28,32-36,366-377
1sf2 d1sf2b_ B:83-98,103-109,301-319
2dgm d2dgme1 E:90-109,119-125,320-335
1sf2 d1sf2a_ A:83-98,103-109,301-319
2o7c d2o7cd1 D:1564-1579,1582-1587,1748-1762
1wkg d1wkgb1 B:86-101,105-112,287-305
1qgn d1qgne_ E:113-128,130-136,296-310
2dgm d2dgmd1 D:90-109,119-125,320-335
1qj5 d1qj5b_ B:85-100,104-111,313-330
2o7c d2o7ca1 A:64-79,82-87,248-262
1sf2 d1sf2c_ C:83-98,103-109,301-319
2dgm d2dgmf1 F:90-109,119-125,320-335
1s09 d1s09b_ B:85-100,104-111,313-330
1qgn d1qgnb_ B:113-128,130-136,296-310
1vef d1vefb1 B:1086-1101,1105-1112,1287-1305
1qgn d1qgnh_ H:113-128,130-136,296-310
1i48 d1i48a_ A:309-332,420-428,430-445
1qgn d1qgnc_ C:113-128,130-136,296-310
1qgn d1qgnf_ F:113-128,130-136,296-310
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1aia d1aiab_ B:312-345,385-389,393-409
2dgm d2dgmd1 D:335-361,418-425,430-452
1xey d1xeyb_ B:335-361,418-425,430-452
1elu d1elua_ A:53-76,215-221,278-296
2dgl d2dglb1 B:335-361,418-425,430-452
1bqa d1bqab_ B:312-345,385-389,393-409
1bqa d1bqaa_ A:312-345,385-389,393-409
1rvu d1rvua_ A:86-105,249-256,305-321
3bcb d3bcba1 A:330-360,432-438,443-467
1elq d1elqa_ A:53-76,215-221,278-296
2fq6 d2fq6b1 B:61-76,202-209,245-259
1rvu d1rvub_ B:86-105,249-256,305-321
1rvy d1rvyb_ B:86-105,249-256,305-321
1i43 d1i43l_ L:113-128,253-260,296-310
1rvy d1rvya_ A:86-105,249-256,305-321
1ix7 d1ix7a_ A:312-345,385-389,393-409
1asn d1asnb_ B:312-345,385-389,393-409
1i43 d1i43e_ E:113-128,253-260,296-310
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1i43 d1i43k_ K:113-128,253-260,296-310
1iax d1iaxa_ A:324-354,409-415,419-438
1i43 d1i43f_ F:113-128,253-260,296-310
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1c9c d1c9ca_ A:312-345,385-389,393-409
1ls3 d1ls3b_ B:68-87,221-228,265-281
1cl1 d1cl1a_ A:61-76,202-209,245-259
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1cj0 d1cj0a_ A:68-87,221-228,265-282
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2dgm d2dgme1 E:335-361,418-425,430-452
1ecx d1ecxa_ A:36-58,195-201,240-258
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1ls3 d1ls3a_ A:68-87,221-228,265-281
1bqd d1bqda_ A:312-345,385-389,393-409
1pmo d1pmoc_ C:335-361,418-425,430-452
1ibj d1ibjc_ C:132-147,270-277,314-328
1ecx d1ecxb_ B:36-58,195-201,240-258
1ls3 d1ls3c_ C:68-87,221-228,265-281
1i43 d1i43h_ H:113-128,253-260,296-310
1i43 d1i43c_ C:113-128,253-260,296-310
1i41 d1i41e_ E:113-128,253-260,296-310
1pmm d1pmmf_ F:335-361,418-425,430-452
1pmo d1pmoa_ A:335-361,418-425,430-452
1i41 d1i41h_ H:113-128,253-260,296-310
1i41 d1i41a_ A:113-128,253-260,296-310
1qgn d1qgnf_ F:113-128,253-260,296-310
2ay9 d2ay9a_ A:76-89,248-256,299-313
1qgn d1qgnb_ B:113-128,253-260,296-310
1i41 d1i41c_ C:113-128,253-260,296-310
1qgn d1qgnd_ D:113-128,253-260,296-310
1cl1 d1cl1b_ B:61-76,202-209,245-259
1i41 d1i41d_ D:113-128,253-260,296-310
1qgn d1qgng_ G:113-128,253-260,296-310
1pmo d1pmof_ F:335-361,418-425,430-452
1qgn d1qgne_ E:113-128,253-260,296-310
1elu d1elub_ B:53-76,215-221,278-296
1ibj d1ibja_ A:132-147,270-277,314-328
1bj4 d1bj4a_ A:86-105,249-256,305-321
1i41 d1i41b_ B:113-128,253-260,296-310
1i41 d1i41f_ F:113-128,253-260,296-310
1i41 d1i41g_ G:113-128,253-260,296-310
1qgn d1qgnh_ H:113-128,253-260,296-310
1i41 d1i41l_ L:113-128,253-260,296-310
1pmo d1pmoe_ E:335-361,418-425,430-452
1qgn d1qgna_ A:113-128,253-260,296-310
1js6 d1js6b_ B:147-172,266-273,318-327
1pmo d1pmod_ D:335-361,418-425,430-452
1i41 d1i41i_ I:113-128,253-260,296-310
1rv4 d1rv4a_ A:86-105,249-256,305-321
1qgn d1qgnc_ C:113-128,253-260,296-310
1rv4 d1rv4b_ B:86-105,249-256,305-321
1pmo d1pmob_ B:335-361,418-425,430-452
1i41 d1i41k_ K:113-128,253-260,296-310
1n31 d1n31b_ B:53-76,215-221,278-296
1i48 d1i48h_ H:113-128,253-260,296-310
1i48 d1i48c_ C:113-128,253-260,296-310
1i41 d1i41j_ J:113-128,253-260,296-310
1i48 d1i48g_ G:113-128,253-260,296-310
1i48 d1i48l_ L:113-128,253-260,296-310
1n31 d1n31a_ A:53-76,215-221,278-296
1i48 d1i48e_ E:113-128,253-260,296-310
1iay d1iaya_ A:324-354,409-415,419-438
1i48 d1i48j_ J:113-128,253-260,296-310
1i48 d1i48d_ D:113-128,253-260,296-310
1elq d1elqb_ B:53-76,215-221,278-296
1i48 d1i48i_ I:113-128,253-260,296-310
2fni d2fnib1 B:31-46,173-179,232-246
1i48 d1i48a_ A:113-128,253-260,296-310
1i48 d1i48f_ F:113-128,253-260,296-310
1n2t d1n2ta_ A:53-76,215-221,278-296
1rv3 d1rv3a_ A:86-105,249-256,305-321
2fni d2fnia1 A:31-46,173-179,232-246
1rv3 d1rv3b_ B:86-105,249-256,305-321
1i48 d1i48k_ K:113-128,253-260,296-310
1n2t d1n2tb_ B:53-76,215-221,278-296
1kmj d1kmja_ A:102-111,195-202,239-246
1i48 d1i48b_ B:113-128,253-260,296-310
2fn6 d2fn6a1 A:31-46,173-179,232-246
1jf9 d1jf9a_ A:102-111,195-202,239-246
1kmk d1kmka_ A:102-111,195-202,239-246
1iax d1iaxb_ B:324-354,409-415,419-438
1pmm d1pmme_ E:335-361,418-425,430-452
3bc8 d3bc8a1 A:330-360,432-438,443-467
1o69 d1o69b_ B:31-46,174-181,231-268
1i29 d1i29a_ A:102-111,195-202,239-246
1aat d1aata_ A:312-345,385-390,393-412
1aat d1aatb_ B:312-345,385-390,393-412
1c4k d1c4ka2 A:413-439,537-543,548-569
1cj0 d1cj0b_ B:67-87,221-228,265-282
1ord d1orda2 A:173-187,345-353,398-414
1ord d1orda2 A:414-439,537-543,548-569
1ord d1ordb2 B:414-439,537-543,548-569
1ord d1ordb2 B:173-187,345-353,398-414
1kl2 d1kl2a_ A:63-83,218-225,259-276
1o69 d1o69b_ B:231-268,358-362,369-385
1o62 d1o62b_ B:231-268,358-362,369-385
2cst d2cstb_ B:312-345,385-389,393-412
1kkj d1kkja_ A:63-83,218-225,259-276
1eji d1ejid_ D:85-105,249-256,305-321
1eji d1ejia_ A:85-105,249-256,305-321
1eji d1ejic_ C:85-105,249-256,305-321
1eji d1ejib_ B:85-105,249-256,305-321
1kkp d1kkpa_ A:63-83,218-225,259-276
1kl2 d1kl2b_ B:63-83,218-225,259-276
1o62 d1o62a_ A:231-268,358-362,369-385
1yjs d1yjsa1 A:63-83,218-225,259-276
2cst d2csta_ A:312-345,385-389,393-412
1yjy d1yjya1 A:63-83,218-225,259-276
1yjz d1yjza1 A:63-83,218-225,259-276
1kl1 d1kl1a_ A:63-83,218-225,259-276
1o61 d1o61b_ B:231-268,358-362,369-385
1xi9 d1xi9c_ C:72-88,228-235,276-289
1o69 d1o69a_ A:231-268,358-362,369-385
2bwp d2bwpd1 D:297-322,369-376,382-398
1xi9 d1xi9d_ D:72-88,228-235,276-289
1xi9 d1xi9b_ B:72-88,228-235,276-289
2bwp d2bwpa1 A:297-322,369-376,382-398
1xi9 d1xi9a_ A:72-88,228-235,276-289
1yaa d1yaaa_ A:312-345,385-389,393-412
1o61 d1o61a_ A:231-268,358-362,369-385
1dfo d1dfod_ D:67-87,221-228,265-281
1dfo d1dfoc_ C:67-87,221-228,265-281
1dfo d1dfoa_ A:67-87,221-228,265-281
1dfo d1dfob_ B:67-87,221-228,265-281
2bwn d2bwnd1 D:297-322,369-376,382-397
2bwp d2bwpe1 E:297-322,369-376,382-398
1eqb d1eqbc_ C:67-87,221-228,265-281
1eqb d1eqba_ A:67-87,221-228,265-281
1eqb d1eqbd_ D:67-87,221-228,265-281
1eqb d1eqbb_ B:67-87,221-228,265-281
1ajs d1ajsb_ B:312-345,385-389,393-412
2bwo d2bwob1 B:297-322,369-376,382-399
2bwn d2bwna1 A:297-322,369-376,382-397
2bwo d2bwoe1 E:297-322,369-376,382-399
2bwn d2bwne1 E:297-322,369-376,382-399
1x0m d1x0ma1 A:316-344,347-351,407-428
2bwo d2bwoa1 A:297-322,369-376,382-398
2bwo d2bwod1 D:297-322,369-376,382-397
1ajr d1ajra_ A:312-345,385-389,393-412
1yaa d1yaab_ B:312-345,385-389,393-412
1ajs d1ajsa_ A:312-345,385-389,393-412
1yaa d1yaac_ C:312-345,385-389,393-412
1ajr d1ajrb_ B:312-345,385-389,393-412
1x0m d1x0ma1 A:316-344,397-403,407-428
1vp4 d1vp4a_ A:296-324,378-384,388-411
1vp4 d1vp4b_ B:296-324,378-384,388-411
1yaa d1yaad_ D:312-345,385-389,393-412
1wst d1wsta1 A:302-330,333-337,393-415
1eji d1ejid_ D:321-346,399-405,414-440
1wst d1wsta1 A:302-330,383-389,393-415
1ls3 d1ls3c_ C:281-306,360-366,374A-396A
1ls3 d1ls3a_ A:281-306,360-366,374A-396A
1rvy d1rvya_ A:321-346,399-405,414-440
1rvu d1rvua_ A:321-346,399-405,414-440
1bj4 d1bj4a_ A:321-346,399-405,414-440
1rv4 d1rv4a_ A:321-346,399-405,414-440
1rvy d1rvyb_ B:321-346,399-405,414-440
1rvu d1rvub_ B:321-346,399-405,414-440
1cj0 d1cj0a_ A:281-306,360-366,3741-3961
1eji d1ejic_ C:321-346,399-405,414-439
1cj0 d1cj0b_ B:281-306,360-366,3741-3961
1rv3 d1rv3a_ A:321-346,399-405,414-440
1ls3 d1ls3b_ B:281-306,360-366,374A-396A
1ls3 d1ls3d_ D:281-306,360-366,374A-396A
1rv4 d1rv4b_ B:321-346,399-405,414-440
1eji d1ejia_ A:321-346,399-405,414-440
1rv3 d1rv3b_ B:321-346,399-405,414-440
1eji d1ejib_ B:321-346,399-405,414-440
13. d.14.1 Ribosomal protein S5 domain 2-like
Ribosomal protein S5 domain 2-like core: beta(3)-alpha-beta-alpha; 2 layers: alpha/beta; left-handed crossover
2f1d d2f1df2 F:139-155,155-164,167-188
2f1d d2f1dc2 C:139-155,155-164,167-188
2ae8 d2ae8d2 D:128-144,144-155,156-177
2ae8 d2ae8c2 C:128-144,144-155,156-177
2ae8 d2ae8e2 E:128-144,144-155,156-177
2ae8 d2ae8a2 A:128-144,144-155,156-177
2ae8 d2ae8f2 F:128-144,144-155,156-177
2ae8 d2ae8b2 B:128-144,144-155,156-177
2ow8 d2ow8f1 F:103-114,117-124,127-143
1rhy d1rhya2 A:137-153,153-163,165-186
1rhy d1rhyb1 B:40-55,56-63,73-90
2f1d d2f1dj2 J:139-155,155-164,167-189
2f1d d2f1da2 A:139-155,155-164,167-189
2f1d d2f1db2 B:139-155,155-164,167-189
2f1d d2f1de2 E:139-155,155-164,167-189
2hgi d2hgih1 H:103-114,117-124,127-142
2f1d d2f1do2 O:139-155,155-164,167-189
2f1d d2f1dn2 N:139-155,155-164,167-189
2f1d d2f1dh2 H:139-155,155-164,167-189
2f1d d2f1di2 I:139-155,155-164,167-189
2f1d d2f1dg2 G:139-155,155-164,167-189
2hgr d2hgrh1 H:103-114,117-124,127-142
2f1d d2f1dk2 K:139-155,155-164,167-189
2hgp d2hgph1 H:103-114,117-124,127-143
1rhy d1rhya1 A:40-55,56-64,73-90
2f1d d2f1dl2 L:139-155,155-164,167-189
1rhy d1rhyb2 B:137-153,154-163,165-186
2f1d d2f1dd2 D:139-155,155-165,167-189
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1oyr d1oyrc1 C:84-102,108-122,124-148
1oyr d1oyra1 A:84-102,108-122,124-148
1oyr d1oyre1 E:84-102,108-122,124-148
1oyr d1oyrf1 F:84-102,108-122,124-148
1oyr d1oyrb1 B:84-102,108-122,124-148
1s4e d1s4ei1 I:68-84,89-97,105-123
2f1d d2f1dk2 K:71-92,155-164,167-189
2f1d d2f1de1 E:42-57,58-67,167-189
1kij d1kijb1 B:278-301,317-327,342-365
2f1d d2f1dn1 N:42-57,58-67,167-189
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1s4e d1s4eh1 H:68-84,89-97,105-123
2f1d d2f1dd1 D:42-57,58-67,167-189
1z5c d1z5ca2 A:386-395,406-418,433-469
1mx0 d1mx0a2 A:386-396,406-418,433-467
1s4e d1s4ec1 C:68-84,89-98,105-123
1udn d1udna1 A:84-103,109-122,124-148
2f1d d2f1do1 O:42-57,58-67,167-189
1kij d1kija1 A:278-301,317-327,342-365
2f1d d2f1dj1 J:42-57,58-67,167-189
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1uds d1udsa1 A:84-103,109-122,124-148
2f1d d2f1dl1 L:42-57,58-67,167-189
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2f1d d2f1df1 F:42-57,57-67,167-188
1pvg d1pvgb1 B:313-334,349-356,384-395
1z5a d1z5aa2 A:386-396,406-418,433-469
1ei1 d1ei1b1 B:678-701,718-727,742-765
2f1d d2f1di1 I:42-57,57-67,167-189
1z5b d1z5ba2 A:386-396,406-418,433-469
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1qzr d1qzrb1 B:313-334,349-356,384-395
1udq d1udqa1 A:84-103,109-122,124-148
1mx0 d1mx0c2 C:386-396,406-418,433-469
1pvg d1pvga1 A:313-334,349-356,384-395
1qzr d1qzra1 A:313-334,349-356,384-395
2f1d d2f1dp1 P:42-57,57-67,167-189
2jt2 d2jt2a2 A:72-83,146-155,221-239
1mx0 d1mx0f2 F:318-331,333-346,433-463
1fi4 d1fi4a1 A:72-94,103-111,119-137
1s16 d1s16b1 B:2276-2299,2315-2325,2339-2362
1s16 d1s16a1 A:1276-1299,1315-1325,1339-1362
2hkj d2hkja2 A:318-331,333-346,433-469
1z59 d1z59a2 A:318-331,333-346,433-469
14. c.23.16 Class I glutamine amidotransferase-like conserved positions of the oxyanion hole and catalytic nucleophile; different constituent families contain different additional structures !
Flavodoxin-like 3 layers, a/b/a; parallel beta-sheet of 5 strand, order 21345
1oi4 d1oi4a1 A:35-50,88-94,176-192
1oi4 d1oi4b1 B:235-250,288-294,376-392
1g2i d1g2ia_ A:12-27,95-100,150-166
1g2i d1g2ic_ C:412-427,495-500,550-566
1g2i d1g2ib_ B:212-227,295-300,350-366
1oy1 d1oy1d_ D:21-36,90-96,200-219
1vhq d1vhqb_ B:21-36,90-96,200-219
3bwe d3bwec1 C:415-430,468-474,557-574
1oi4 d1oi4a1 A:35-50,120-125,176-192
1oi4 d1oi4b1 B:235-250,320-325,376-392
3bwe d3bwef1 F:1015-1030,1068-1074,1157-1174
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3bwe d3bweb1 B:215-230,300-306,357-374
2ab0 d2ab0b1 B:14-29,100-107,157-174
1vhq d1vhqa_ A:21-36,90-96,200-220
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1j42 d1j42a_ A:15-30,100-106,157-174
1p5f d1p5fa_ A:15-30,100-107,157-174
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1pdv d1pdva_ A:15-30,100-106,157-174
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1pe0 d1pe0b_ B:215-230,300-306,357-374
1ucf d1ucfa_ A:15-30,100-106,157-174
2or3 d2or3b1 B:15-30,100-106,157-174
2or3 d2or3a1 A:15-30,100-106,157-174
1t36 d1t36f2 F:202-213,234-240,361-380
2r1u d2r1ua1 A:15-30,100-106,157-174
1ucf d1ucfb_ B:15-30,100-106,157-174
1soa d1soaa_ A:15-30,100-106,157-174
1q2u d1q2ua_ A:15-30,100-106,157-174
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1oy1 d1oy1c_ C:21-36,90-96,200-220
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1pe0 d1pe0a_ A:15-30,100-106,157-174
1pdw d1pdwa_ A:15-30,100-106,157-174
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3bwe d3bwef1 F:1015-1030,1100-1106,1157-1174
1rw7 d1rw7a_ A:27-42,100-105,220-235
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1u9c d1u9ca_ A:24-39,88-94,202-221
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1g2i d1g2ib_ B:212-227,263-271,350-366
1g2i d1g2ia_ A:12-27,63-71,150-166
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1pv2 d1pv2a_ A:74-89,179-186,262-280
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2a9v d2a9vd1 D:15-25,26-33,175-198
1s1m d1s1mb1 B:305-320,374-379,526-545
2abw d2abwb1 B:14-26,29-36,203-221
2a9v d2a9vc1 C:15-25,26-33,175-197
2abw d2abwa1 A:14-26,29-36,203-221
1zrs d1zrsa2 A:28-43,78-85,152-167
2aum d2auma2 A:28-43,78-85,152-167
2aun d2auna2 A:28-43,78-85,152-167
15. c.69.1 alpha/beta-Hydrolases many members have left-handed crossover connection between strand 8 and additional strand 9 !
alpha/beta-Hydrolases core: 3 layers, a/b/a; mixed beta-sheet of 8 strands, order 12435678, strand 2 is antiparallel to the rest
1qoz d1qozb_ B:22-34,82-90,194-206
1qoz d1qoza_ A:22-34,82-90,194-207
2axe d2axea_ A:22-33,82-90,194-207
1bs9 d1bs9a_ A:22-34,82-90,189-207
2i3d d2i3da1 A:43-57,101-108,192-213
1g66 d1g66a_ A:22-34,82-90,189-207
2i3d d2i3db1 B:43-57,101-108,192-213
2i3d d2i3db1 B:43-57,123-131,192-213
2i3d d2i3da1 A:43-57,123-131,192-213
2fuk d2fuka1 A:55-69,135-141,197-216
1tcc d1tcca_ A:48-60,98-105,230-243
1tcc d1tccb_ B:48-60,98-105,230-243
1tcb d1tcba_ A:48-60,98-105,230-243
1lbs d1lbsd_ D:48-60,98-105,230-243
1lbs d1lbsc_ C:48-60,98-105,230-243
1lbs d1lbsb_ B:48-60,98-105,230-243
1lbs d1lbsa_ A:48-60,98-105,230-243
1lbs d1lbsf_ F:48-60,98-105,230-243
1lbs d1lbse_ E:48-60,98-105,230-243
1tcb d1tcbb_ B:48-60,98-105,230-243
1tca d1tcaa_ A:48-60,98-105,230-243
1r1d d1r1da_ A:27-42,87-93,227-245
1lbt d1lbtb_ B:48-60,98-105,230-243
1lbt d1lbta_ A:48-60,98-105,230-243
1mt3 d1mt3a_ A:45-55,98-105,277-293
1tqh d1tqha_ A:28-43,88-94,228-246
1mtz d1mtza_ A:45-55,98-105,277-293
1mu0 d1mu0a_ A:45-55,98-105,277-293
1din d1dina_ A:41-55,116-123,213-232
1iuo d1iuoa_ A:44-55,96-103,258-274
1bs9 d1bs9a_ A:22-34,126-132,189-207
1lns d1lnsa3 A:271-281,341-345,508-523
1g66 d1g66a_ A:22-34,126-132,189-207
1iun d1iunb_ B:44-55,96-103,258-274
2gzr d2gzra1 A:188-202,206-212,286-304
2jbw d2jbwa1 A:154-165,210-217,335-353
1iun d1iuna_ A:44-55,96-103,258-273
1ggv d1ggva_ A:41-55,116-123,213-232
2gzs d2gzsa1 A:188-202,206-212,286-304
1iup d1iupa_ A:44-55,96-103,258-273
1r1d d1r1db_ B:27-42,86-93,227-245
2axe d2axea_ A:22-33,125-132,194-207
1uk8 d1uk8a_ A:44-55,96-103,258-273
1uka d1ukaa_ A:44-55,96-103,258-273
2yxp d2yxpx1 X:63-74,116-124,294-310
1ukb d1ukba_ A:44-55,96-103,258-273
1qtr d1qtra_ A:52-60,106-113,300-317
1uk6 d1uk6a_ A:44-55,96-103,258-273
1uk7 d1uk7a_ A:44-55,96-103,258-273
2edc d2edca_ A:63-74,116-124,294-310
1be0 d1be0a_ A:63-74,116-124,294-310
1cij d1cija_ A:63-74,116-124,294-310
1uk9 d1uk9a_ A:44-55,96-103,258-273
1bez d1beza_ A:63-74,116-124,294-310
2b9v d2b9vk2 K:132-142,198-205,388-408
2b9v d2b9vh2 H:132-142,198-205,388-408
1agy d1agya_ A:48-64,112-120,197-212
2b9v d2b9va2 A:132-142,198-205,388-408
1wm1 d1wm1a_ A:52-60,106-113,300-316
1cuj d1cuja_ A:48-64,112-120,197-211
2b9v d2b9vf2 F:132-142,198-205,388-408
2b9v d2b9vj2 J:132-142,198-205,388-408
1edd d1edda_ A:63-74,117-124,294-310
2b9v d2b9vm2 M:132-142,198-205,388-408
2b9v d2b9vn2 N:132-142,198-205,388-408
1nx9 d1nx9d2 D:132-142,198-205,388-408
2had d2hada_ A:63-74,117-124,294-310
1xze d1xzea_ A:48-64,112-120,197-211
1cui d1cuia_ A:48-64,112-120,197-211
1cex d1cexa_ A:48-64,112-120,197-212
2dhe d2dhea_ A:63-74,117-124,294-310
2b9v d2b9vi2 I:132-142,198-205,388-408
2b4k d2b4kd2 D:132-142,198-205,388-408
1qoz d1qoza_ A:22-34,126-132,194-207
2cut d2cuta_ A:48-64,112-120,197-212
1ryy d1ryya2 A:132-142,198-205,388-408
1x2b d1x2ba1 A:52-60,106-113,300-316
2b9v d2b9vo2 O:132-142,198-205,388-408
2b9v d2b9ve2 E:132-142,198-205,388-408
1bee d1beea_ A:63-74,117-124,294-310
2b9v d2b9vc2 C:132-142,198-205,388-408
2b9v d2b9vg2 G:132-142,198-205,388-408
1cus d1cusa_ A:48-64,112-120,197-212
2b9v d2b9vl2 L:132-142,198-205,388-408
2hu5 d2hu5a2 A:379-389,435-445,560-581
2b9v d2b9vb2 B:132-142,198-205,388-408
2b9v d2b9vd2 D:132-142,198-205,388-408
1xzj d1xzja_ A:48-64,112-120,197-212
2dhd d2dhda_ A:63-74,117-124,294-310
1y7h d1y7he_ E:20-31,31-36,244-259
1nx9 d1nx9b2 B:132-142,198-205,388-408
1nx9 d1nx9a2 A:132-142,198-205,388-408
2b9v d2b9vp2 P:132-142,198-205,388-408
1xzg d1xzga_ A:48-64,112-120,197-212
1xzh d1xzha_ A:48-64,112-120,197-212
1xzl d1xzla_ A:48-64,112-120,197-212
1hde d1hdea_ A:63-74,117-124,294-310
1xza d1xzaa_ A:48-64,112-120,197-212
1cue d1cuea_ A:48-64,112-120,197-211
1xzd d1xzda_ A:48-64,112-120,197-211
1xzf d1xzfa_ A:48-64,112-120,197-212
1hde d1hdeb_ B:63-74,117-124,294-310
1edb d1edba_ A:63-74,117-124,294-310
1ede d1edea_ A:63-74,117-124,294-310
1cua d1cuaa_ A:48-64,112-120,197-212
1xzi d1xzia_ A:48-64,112-120,197-212
1dwo d1dwob_ B:19-30,30-36,242-258
1cuf d1cufa_ A:48-64,112-120,197-212
2hu7 d2hu7a2 A:379-389,435-445,560-581
1xzc d1xzca_ A:48-64,112-120,197-212
2eda d2edaa_ A:63-74,117-124,294-310
1ffc d1ffca_ A:48-64,112-120,197-212
1ffe d1ffea_ A:48-64,112-120,197-212
1qoz d1qozb_ B:22-34,125-132,194-206
1xzm d1xzma_ A:48-64,112-120,197-212
1cuy d1cuya_ A:48-64,112-120,197-212
1y7i d1y7ib_ B:20-31,31-37,244-264
1y7h d1y7hb_ B:20-31,31-37,244-260
1x2e d1x2ea1 A:52-60,106-113,300-316
1xzb d1xzba_ A:48-64,112-120,197-212
2b4k d2b4ka2 A:132-142,198-205,388-408
1ffa d1ffaa_ A:48-64,112-120,197-212
1b6g d1b6ga_ A:63-74,117-124,294-310
1cug d1cuga_ A:48-64,112-120,197-212
1mj5 d1mj5a_ A:45-53,102-108,278-295
2pky d2pkyx1 X:63-74,117-124,294-309
1ffd d1ffda_ A:48-64,112-120,197-212
1cux d1cuxa_ A:48-64,112-120,197-212
1qj4 d1qj4a_ A:19-30,30-36,241-257
1cuv d1cuva_ A:48-64,112-120,197-212
2yas d2yasa_ A:19-30,30-36,241-257
1jji d1jjic_ C:98-110,153-160,294-311
3c70 d3c70a1 A:19-30,30-36,241-257
3c6x d3c6xa1 A:19-30,30-36,241-257
1e89 d1e89b_ B:19-30,30-36,242-258
1e8d d1e8db_ B:19-30,30-36,242-258
2qr5 d2qr5b2 B:379-389,435-445,560-581
3c6z d3c6za1 A:19-30,30-36,241-257
1k63 d1k63a_ A:45-53,102-108,278-295
1k6e d1k6ea_ A:45-53,102-108,278-295
1g5f d1g5fa_ A:45-53,102-108,278-295
2g4l d2g4la1 A:19-30,30-36,241-257
3c6y d3c6ya1 A:19-30,30-36,241-257
1yb7 d1yb7a1 A:19-30,30-36,241-257
1dwq d1dwqb_ B:19-30,30-36,242-258
1eb9 d1eb9b_ B:19-30,30-36,242-258
2ri6 d2ri6a1 A:52-63,105-112,271-286
1a88 d1a88b_ B:37-48,90-96,261-275
1cv2 d1cv2a_ A:45-53,101-108,278-295
3yas d3yasa_ A:19-30,30-36,241-257
1g4h d1g4ha_ A:45-53,101-108,278-295
2rht d2rhta1 A:52-63,105-112,271-286
1k5p d1k5pa_ A:45-53,102-108,278-295
1g42 d1g42a_ A:45-53,101-108,278-295
4yas d4yasa_ A:19-30,30-36,241-257
7yas d7yasa_ A:19-30,30-36,241-257
1d07 d1d07a_ A:45-53,101-108,278-295
1ve6 d1ve6a2 A:379-389,435-445,560-581
1a8s d1a8sa_ A:35-46,86-94,259-273
1ju3 d1ju3a2 A:58-66,110-117,306-324
1ek2 d1ek2a2 A:272-283,326-333,529-544
1cuu d1cuua_ A:48-64,112-120,197-212
1iz7 d1iz7a_ A:45-53,101-108,278-295
5yas d5yasa_ A:19-30,30-36,241-257
1ek2 d1ek2b2 B:272-283,326-333,529-544
1eb8 d1eb8b_ B:19-30,30-36,242-258
1sck d1scka_ A:19-30,30-36,241-257
1va4 d1va4b_ B:31-46,88-94,257-271
1bu8 d1bu8a2 A:79-97,145-152,264-277
2qr5 d2qr5a2 A:379-389,435-445,560-581
1dwp d1dwpb_ B:19-30,30-36,242-258
1uxo d1uxoa_ A:17-31,64-71,174-187
1xkl d1xkla_ A:20-31,31-36,244-260
2qzp d2qzpa2 A:379-389,437-445,560-581
1ju4 d1ju4a2 A:58-66,110-117,306-324
1y7h d1y7hg_ G:20-31,31-36,244-258
1a8u d1a8ub_ B:39-50,92-98,263-277
2puh d2puha1 A:52-63,105-112,271-286
1ve6 d1ve6b2 B:379-389,435-445,560-581
1bro d1brob_ B:39-50,92-98,263-277
2dhc d2dhca_ A:63-74,117-124,294-310
1y7h d1y7hh_ H:20-31,31-36,244-260
1l7q d1l7qa2 A:58-66,110-117,306-324
1jji d1jjia_ A:98-110,153-160,294-311
1l7r d1l7ra2 A:58-66,110-117,306-324
2rhw d2rhwa1 A:52-63,105-112,271-286
2hu5 d2hu5b2 B:379-389,435-445,560-582
1a7u d1a7ua_ A:39-50,92-98,263-277
1va4 d1va4e_ E:31-46,88-94,257-271
1xkl d1xkld_ D:20-31,31-36,244-260
1scq d1scqa_ A:19-30,30-36,241-257
1ve7 d1ve7b2 B:379-389,437-445,560-581
1y7h d1y7hf_ F:20-31,31-36,244-260
3c87 d3c87b2 B:280-295,299-305,376-396
1k8q d1k8qa_ A:82-91,147-153,361-377
1k8q d1k8qb_ B:82-91,147-153,361-377
1ve7 d1ve7a2 A:379-389,437-445,560-581
1dwq d1dwqb_ B:19-30,73-80,242-258
1cub d1cuba_ A:48-64,112-120,197-212
3c8d d3c8dc2 C:280-295,299-305,376-396
1iz8 d1iz8a_ A:45-53,100-108,278-295
1a7u d1a7ub_ B:39-50,92-98,263-277
3c87 d3c87a2 A:280-295,299-305,376-396
1dwq d1dwqa_ A:19-30,73-80,242-258
1brt d1brta_ A:39-50,92-98,263-277
1i6w d1i6wb_ B:17-30,70-77,162-175
2hu8 d2hu8a2 A:379-389,435-445,560-582
1a88 d1a88a_ A:37-48,88-96,261-275
1tht d1thta_ A:51-62,107-114,246-267
1eb9 d1eb9a_ A:19-30,73-80,242-258
1vlq d1vlqj_ J:102-109,181-188,306-323
1oxm d1oxma_ A:48-64,112-120,197-212
2bfn d2bfna1 A:45-53,100-108,278-295
1y7h d1y7hc_ C:20-31,31-36,244-258
1tht d1thtb_ B:51-62,107-114,246-267
1vlq d1vlqd_ D:102-109,181-188,306-323
2hu7 d2hu7b2 B:379-389,437-445,560-581
1vlq d1vlqi_ I:102-109,181-188,306-323
1vlq d1vlql_ L:102-109,181-188,306-323
1e89 d1e89a_ A:19-30,73-80,242-258
1vlq d1vlqe_ E:102-109,181-188,306-323
1vlq d1vlqc_ C:102-109,181-188,306-323
1vlq d1vlqb_ B:102-109,181-188,306-323
1vlq d1vlqf_ F:102-109,181-188,306-323
1vlq d1vlqh_ H:102-109,181-188,306-323
1t2n d1t2na_ A:15-30,70-77,162-175
1vlq d1vlqk_ K:102-109,181-188,306-323
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2i78 d2i78c2 C:562-572,573-580,744-764
2oqv d2oqvb2 B:562-572,573-580,744-764
1xfd d1xfdc2 C:644-654,655-662,828-849
2ajl d2ajli2 I:562-572,573-580,744-764
1xfd d1xfdd2 D:644-654,655-662,828-849
1xfd d1xfda2 A:644-654,655-662,828-849
3c43 d3c43b2 B:562-572,573-580,744-764
1xfd d1xfdb2 B:644-654,655-662,828-849
1mna d1mnab_ B:81-94,141-148,267-276
2qtb d2qtba2 A:562-572,573-580,744-764
2i03 d2i03d2 D:562-572,573-580,744-764
1mo2 d1mo2b_ B:81-93,162-172,265-280
2i03 d2i03b2 B:562-572,573-580,744-764
1tk3 d1tk3a2 A:562-572,573-579,744-764
2iiv d2iivb2 B:562-572,573-580,744-764
1orw d1orwd2 D:562-572,573-579,744-764
3ccc d3ccca2 A:562-572,573-580,744-764
2hha d2hhaa2 A:562-572,573-580,744-764
2buc d2bucd2 D:562-572,573-579,744-764
2qky d2qkyc2 C:562-572,573-580,744-764
2g63 d2g63c2 C:562-572,573-580,744-764
1mo2 d1mo2a_ A:81-93,95-102,265-280
2g63 d2g63d2 D:562-572,573-580,744-764
2ajc d2ajca2 A:562-572,573-579,744-764
1orv d1orva2 A:562-572,573-579,744-764
2onc d2onca2 A:562-572,573-580,744-764
2bub d2buba2 A:562-572,573-579,744-764
1r9m d1r9mb2 B:562-572,573-580,744-764
2ajc d2ajcd2 D:562-572,573-579,744-764
1tk3 d1tk3b2 B:562-572,573-580,744-764
2onc d2oncd2 D:562-572,573-580,744-764
2qt9 d2qt9a2 A:562-572,573-580,744-764
2ole d2oleb2 B:562-572,573-580,744-764
2qtb d2qtbb2 B:562-572,573-580,744-764
2hha d2hhab2 B:562-572,573-580,744-764
1r9m d1r9mc2 C:562-572,573-580,744-764
1wcy d1wcya2 A:562-572,573-580,744-764
2qt9 d2qt9b2 B:562-572,573-580,744-764
2i78 d2i78a2 A:562-572,573-580,744-764
2p8s d2p8sb2 B:562-572,573-580,744-764
2oqv d2oqva2 A:562-572,573-580,744-764
2qoe d2qoeb2 B:562-572,573-580,744-764
2g5t d2g5ta2 A:562-572,573-580,744-764
3c43 d3c43a2 A:562-572,573-580,744-764
1r9n d1r9nc2 C:562-572,573-580,744-764
2p8s d2p8sa2 A:562-572,573-580,744-764
2g63 d2g63b2 B:562-572,573-580,744-764
1j2e d1j2eb2 B:562-572,573-580,744-764
2g63 d2g63a2 A:562-572,573-580,744-764
1r9n d1r9nb2 B:562-572,573-580,744-764
1r9n d1r9nd2 D:562-572,573-580,744-764
2h7y d2h7yb1 B:81-94,141-148,267-276
2i03 d2i03c2 C:562-572,573-580,744-764
2iit d2iita2 A:562-572,573-580,744-764
1tkr d1tkrb2 B:562-572,573-579,744-764
2oph d2opha2 A:562-572,573-580,744-764
2iiv d2iiva2 A:562-572,573-580,744-764
1r9n d1r9na2 A:562-572,573-580,744-764
2aj8 d2aj8a2 A:562-572,573-579,744-764
2qoe d2qoea2 A:562-572,573-580,744-764
2aj8 d2aj8c2 C:562-572,573-579,744-764
1nu6 d1nu6b2 B:562-572,573-580,744-764
1nu6 d1nu6a2 A:562-572,573-580,744-764
2aj8 d2aj8b2 B:562-572,573-579,744-764
1j2e d1j2ea2 A:562-572,573-580,744-764
1kez d1kezc_ C:81-93,135-142,266-281
2i78 d2i78b2 B:562-572,573-580,744-764
1nu8 d1nu8a2 A:562-572,573-580,744-764
2h7x d2h7xb1 B:81-94,141-148,267-276
2rgu d2rgua2 A:562-572,573-580,744-764
1pfq d1pfqb2 B:562-572,573-579,744-764
2oph d2ophb2 B:562-572,573-580,744-764
1u8e d1u8ea2 A:562-572,573-580,744-764
3c45 d3c45b2 B:562-572,573-580,744-764
1wcy d1wcyb2 B:562-572,573-580,744-764
1w1i d1w1ia2 A:562-572,573-580,744-764
3d4l d3d4lb2 B:562-572,573-580,744-764
1x70 d1x70a2 A:562-572,573-580,744-764
3c45 d3c45a2 A:562-572,573-580,744-764
1x70 d1x70b2 B:562-572,573-580,744-764
1w1i d1w1id2 D:562-572,573-580,744-764
1w1i d1w1ib2 B:562-572,573-580,744-764
3d4l d3d4la2 A:562-572,573-580,744-764
2rip d2ripa2 A:562-572,573-580,744-764
1w1i d1w1ic2 C:562-572,573-580,744-764
2rgu d2rgub2 B:562-572,573-580,744-764
3bjm d3bjmb2 B:562-572,573-580,744-764
2ajb d2ajbc2 C:562-572,573-580,744-764
2bgr d2bgra2 A:562-572,573-580,744-764
2qjr d2qjrb2 B:562-572,573-580,744-764
2bgr d2bgrb2 B:562-572,573-580,744-764
2i03 d2i03a2 A:562-572,573-580,744-764
2ogz d2ogza2 A:562-572,573-580,744-764
2qjr d2qjra2 A:562-572,573-580,744-764
1mna d1mnaa_ A:81-94,141-148,267-276
1lpn d1lpna_ A:134-146,149-156,461-478
3bjm d3bjma2 A:562-572,573-580,744-764
1mna d1mnaa_ A:81-94,96-103,275-289
1mn6 d1mn6a_ A:81-94,96-103,275-289
1kez d1kezc_ C:81-93,97-102,266-281
2hfj d2hfja1 A:81-94,140-148,267-276
2hfj d2hfja1 A:81-94,140-148,275-292
2h7y d2h7ya1 A:81-94,140-148,267-276
2h7x d2h7xa1 A:81-94,140-148,267-276
2h7x d2h7xa1 A:81-94,140-148,275-292
1jmk d1jmkc_ C:30-42,73-79,212-229
1mna d1mnab_ B:81-94,96-103,275-291
2h7y d2h7ya1 A:81-94,140-148,275-292
1tht d1thtb_ B:51-62,62-73,246-267
2h7x d2h7xb1 B:81-94,96-103,275-291
2hfj d2hfjb1 B:81-94,96-103,275-291
2h7y d2h7yb1 B:81-94,96-103,275-291
1kez d1kezb_ B:81-93,135-141,266-281
1cuh d1cuha_ A:49-64,141-148,185-197
1cud d1cudc_ C:49-64,141-148,185-197
1xzk d1xzka_ A:49-64,141-148,185-198
1ffb d1ffba_ A:49-64,141-148,185-198
1cuz d1cuza_ A:49-64,141-148,185-198
1cuc d1cuca_ A:49-64,141-148,185-198
1qo9 d1qo9a_ A:238-250,258-264,479-489
2h7x d2h7xa1 A:81-94,96-103,275-292
2hfj d2hfja1 A:81-94,96-103,275-292
1xzk d1xzkb_ B:49-64,141-148,185-198
2h7y d2h7ya1 A:81-94,96-103,275-292
2axe d2axea_ A:22-33,125-132,183-195
1oxm d1oxmb_ B:49-64,141-148,185-198
1cud d1cuda_ A:49-64,141-148,185-198
1qon d1qona_ A:238-250,258-264,479-489
1cud d1cudb_ B:49-64,141-148,185-198
1cuw d1cuwb_ B:49-64,141-148,185-198
1cuw d1cuwa_ A:49-64,141-148,185-198
2cut d2cuta_ A:48-64,141-148,185-198
1cuy d1cuya_ A:48-64,141-148,185-198
1xzi d1xzia_ A:48-64,141-148,185-198
1agy d1agya_ A:48-64,141-148,185-198
1xze d1xzea_ A:48-64,141-148,185-198
1oxm d1oxma_ A:48-64,141-148,185-198
1cuj d1cuja_ A:48-64,141-148,185-198
1xzb d1xzba_ A:48-64,141-148,185-198
1cus d1cusa_ A:48-64,141-148,185-198
1xza d1xzaa_ A:48-64,141-148,185-198
1xzg d1xzga_ A:48-64,141-148,185-198
1ffa d1ffaa_ A:48-64,141-148,185-198
1cuv d1cuva_ A:48-64,141-148,185-198
1xzc d1xzca_ A:48-64,141-148,185-198
1cux d1cuxa_ A:48-64,141-148,185-198
1cex d1cexa_ A:48-64,141-148,185-198
1cui d1cuia_ A:48-64,141-148,185-198
1xzh d1xzha_ A:48-64,141-148,185-198
1ffd d1ffda_ A:48-64,141-148,185-198
1xzm d1xzma_ A:48-64,141-148,185-198
1ffc d1ffca_ A:48-64,141-148,185-198
1ffe d1ffea_ A:48-64,141-148,185-198
1xzj d1xzja_ A:48-64,141-148,185-198
1xzl d1xzla_ A:48-64,141-148,185-198
1cuf d1cufa_ A:48-64,141-148,185-198
1xzf d1xzfa_ A:48-64,141-148,185-198
1xzd d1xzda_ A:48-64,141-148,185-198
1cua d1cuaa_ A:48-64,141-148,185-198
1cug d1cuga_ A:48-64,141-148,185-198
1cuu d1cuua_ A:48-64,141-148,185-198
1cue d1cuea_ A:48-64,141-148,185-198
1cub d1cuba_ A:48-64,141-148,185-198
2axe d2axea_ A:22-33,82-90,183-195
1cuc d1cuca_ A:49-64,112-120,185-198
1ffb d1ffba_ A:49-64,112-120,185-198
2cut d2cuta_ A:48-64,112-120,185-198
1cuh d1cuha_ A:49-64,112-120,185-197
1cuz d1cuza_ A:49-64,112-120,185-198
1xzi d1xzia_ A:48-64,112-120,185-198
1agy d1agya_ A:48-64,112-120,185-198
1xzk d1xzka_ A:49-64,112-120,185-198
1cuy d1cuya_ A:48-64,112-120,185-198
1cud d1cudc_ C:49-64,112-120,185-197
1ffa d1ffaa_ A:48-64,112-120,185-198
1xzj d1xzja_ A:48-64,112-120,185-198
1xze d1xzea_ A:48-64,112-120,185-198
1cua d1cuaa_ A:48-64,112-120,185-198
1ffd d1ffda_ A:48-64,112-120,185-198
1xzg d1xzga_ A:48-64,112-120,185-198
1cex d1cexa_ A:48-64,112-120,185-198
1xzc d1xzca_ A:48-64,112-120,185-198
1oxm d1oxma_ A:48-64,112-120,185-198
1ffc d1ffca_ A:48-64,112-120,185-198
1xza d1xzaa_ A:48-64,112-120,185-198
1cux d1cuxa_ A:48-64,112-120,185-198
1cus d1cusa_ A:48-64,112-120,185-198
1cui d1cuia_ A:48-64,112-120,185-198
1xzh d1xzha_ A:48-64,112-120,185-198
1xzb d1xzba_ A:48-64,112-120,185-198
1xzf d1xzfa_ A:48-64,112-120,185-198
1cug d1cuga_ A:48-64,112-120,185-198
1ffe d1ffea_ A:48-64,112-120,185-198
1cuf d1cufa_ A:48-64,112-120,185-198
1cud d1cuda_ A:49-64,112-120,185-198
1cuu d1cuua_ A:48-64,112-120,185-198
1xzl d1xzla_ A:48-64,112-120,185-198
1xzm d1xzma_ A:48-64,112-120,185-198
1xzd d1xzda_ A:48-64,112-120,185-198
1cub d1cuba_ A:48-64,112-120,185-198
1cuj d1cuja_ A:48-64,112-120,185-198
1xzk d1xzkb_ B:49-64,112-120,185-198
1cud d1cudb_ B:49-64,112-120,185-198
1cuv d1cuva_ A:48-64,112-120,185-198
1cue d1cuea_ A:48-64,112-120,185-198
1oxm d1oxmb_ B:49-64,112-120,185-198
1cuw d1cuwa_ A:49-64,112-120,185-198
1cuw d1cuwb_ B:49-64,112-120,185-198
16. d.277.1 Bacillus phage protein
Bacillus phage protein alpa-beta(3)-alpha-beta(3)-alpha; 3 layers: b/a/b, 3-helical bundle flanked by two 3-stranded meander beta-sheets
1r7l d1r7la_ A:40-52,53-60,83-96
1r7l d1r7lb_ B:40-52,53-60,83-97
17. c.65.1 Formyltransferase
Formyltransferase 3 layers: a/b/a; mixed beta-sheet of 7 strands, order 3214567; strand 6 is antiparallel to the rest
1s3i d1s3ia2 A:9-23,79-86,167-186
2bw0 d2bw0a2 A:9-23,79-84,167-186
2cfi d2cfia2 A:9-23,79-84,167-186
2cfi d2cfia2 A:9-23,98-108,167-186
2bw0 d2bw0a2 A:9-23,98-108,167-186
1s3i d1s3ia2 A:9-23,98-108,167-186
1rc0 d1rc0b1 B:11-23,81-87,161-187
1rbz d1rbza1 A:11-23,81-87,161-187
1men d1menb_ B:11-23,81-87,161-187
1rbm d1rbmb1 B:11-23,81-87,161-187
1fmt d1fmtb2 B:12-26,83-89,174-189
2bln d2blna2 A:8-23,99-107,157-177
2fmt d2fmta2 A:12-26,102-112,171-189
1rbz d1rbzb1 B:11-23,81-87,175-187
1fmt d1fmta2 A:12-26,83-89,163-189
1rc1 d1rc1a1 A:11-23,81-86,161-187
1rby d1rbyd1 D:11-24,81-86,161-187
1rby d1rbyc1 C:11-24,81-86,161-187
2fmt d2fmta2 A:12-26,83-88,171-189
1zlx d1zlxa1 A:11-24,81-86,161-187
1rbm d1rbma1 A:11-24,81-86,161-187
1zly d1zlya1 A:11-24,81-86,161-187
1njs d1njsb_ B:11-23,81-86,161-187
1rbq d1rbqc1 C:11-23,81-86,161-187
1fmt d1fmtb2 B:12-26,102-112,174-189
1rbq d1rbqd1 D:11-24,81-86,161-187
1rc1 d1rc1b1 B:11-24,81-86,161-187
1mej d1mejb_ B:11-23,81-86,161-187
1fmt d1fmta2 A:12-26,102-112,163-189
1mej d1meja_ A:11-23,81-86,161-187
1meo d1meoa_ A:13-23,81-86,161-187
1rc0 d1rc0a1 A:11-23,81-86,161-187
1rby d1rbya1 A:11-24,81-87,161-187
1njs d1njsa_ A:11-24,81-87,161-187
1rbq d1rbqb1 B:11-24,81-87,161-187
1rbq d1rbqa1 A:11-24,81-87,161-187
1rby d1rbyb1 B:11-24,81-87,161-187
1men d1mena_ A:11-24,81-87,161-187
1mej d1mejc_ C:11-23,81-86,161-187
1grc d1grca_ A:11-24,81-86,161-187
1men d1menc_ C:11-24,81-87,161-187
2fmt d2fmtb2 B:12-26,102-112,174-189
1yrw d1yrwa2 A:9-23,99-107,157-174
1grc d1grcb_ B:11-24,81-86,161-187
2bln d2blnb2 B:8-23,98-107,157-177
1z7e d1z7ec3 C:8-23,98-107,157-177
1gar d1gara_ A:11-24,81-86,161-187
1z7e d1z7ee3 E:8-23,98-107,157-177
1yrw d1yrwa2 A:9-23,77-83,173-183
1z7e d1z7ed3 D:8-23,98-107,157-177
1z7e d1z7ea3 A:8-23,98-107,157-177
1cde d1cdeb_ B:11-24,81-86,161-187
1cde d1cded_ D:11-24,81-86,161-187
1cde d1cdea_ A:11-24,81-86,161-187
1cde d1cdec_ C:11-24,81-86,161-187
1z7e d1z7eb3 B:8-23,98-107,157-177
1gar d1garb_ B:11-24,81-86,161-187
2bln d2blna2 A:8-23,77-83,157-177
1cdd d1cddb_ B:11-24,81-87,161-187
1jkx d1jkxa_ A:11-24,81-87,161-187
1jkx d1jkxb_ B:11-24,81-87,161-187
3gar d3gara_ A:11-24,81-86,161-187
1c2t d1c2ta_ A:11-24,81-87,161-187
1c3e d1c3ea_ A:11-24,81-87,161-187
1jkx d1jkxc_ C:11-24,81-87,161-187
1c2t d1c2tb_ B:11-24,81-87,161-187
1c3e d1c3eb_ B:11-24,81-87,161-187
2bln d2blnb2 B:8-23,77-83,157-177
2fmt d2fmtb2 B:12-26,83-88,174-189
1jkx d1jkxd_ D:11-24,81-87,161-187
1cdd d1cdda_ A:11-24,81-87,161-187
1z7e d1z7ea3 A:8-23,77-83,157-177
1z7e d1z7ed3 D:8-23,77-83,157-177
1z7e d1z7ee3 E:8-23,77-83,157-177
2gar d2gara_ A:11-24,81-87,161-187
1z7e d1z7eb3 B:8-23,77-83,157-177
1z7e d1z7ec3 C:8-23,77-83,157-177
1z7e d1z7ef3 F:8-23,77-83,174-183
1z7e d1z7ef3 F:8-23,98-107,157-175
1men d1menb_ B:11-23,27-37,161-187
1z7e d1z7ef3 F:8-23,77-83,157-175
1rc0 d1rc0b1 B:11-23,28-37,161-187
1rbz d1rbza1 A:11-23,28-37,161-187
1men d1menc_ C:11-24,27-37,161-187
1mej d1mejc_ C:11-23,27-37,161-187
1mej d1mejb_ B:11-23,27-36,161-187
1rbq d1rbqc1 C:11-23,28-37,161-187
1men d1mena_ A:11-24,27-37,161-187
1rc1 d1rc1a1 A:11-23,28-37,161-187
1rbm d1rbmb1 B:11-23,28-37,161-187
1njs d1njsb_ B:11-23,28-37,161-187
1mej d1meja_ A:11-23,27-37,161-187
1yrw d1yrwa2 A:9-23,77-83,157-174
1rc0 d1rc0a1 A:11-23,28-37,161-187
1jkx d1jkxc_ C:11-24,28-36,161-187
1jkx d1jkxa_ A:11-24,28-36,161-187
1cde d1cded_ D:11-24,28-36,161-187
1cde d1cdeb_ B:11-24,28-36,161-187
1cde d1cdec_ C:11-24,28-36,161-187
1cde d1cdea_ A:11-24,28-36,161-187
1jkx d1jkxd_ D:11-24,28-36,161-187
1rc1 d1rc1a1 A:11-23,103-110,161-187
1jkx d1jkxb_ B:11-24,28-36,161-187
1c2t d1c2ta_ A:11-24,28-36,161-187
1c3e d1c3ea_ A:11-24,28-36,161-187
1meo d1meoa_ A:13-23,28-36,161-187
1c3e d1c3eb_ B:11-24,28-36,161-187
1c2t d1c2tb_ B:11-24,28-36,161-187
3gar d3gara_ A:11-24,28-36,161-187
1grc d1grcb_ B:11-24,28-36,161-187
1gar d1gara_ A:11-24,28-36,161-187
1gar d1garb_ B:11-24,28-36,161-187
1rbz d1rbzb1 B:11-23,103-110,175-187
1men d1menb_ B:11-23,103-110,161-187
2gar d2gara_ A:11-24,28-36,161-187
1rc0 d1rc0b1 B:11-23,103-110,161-187
1zlx d1zlxa1 A:11-24,28-36,161-187
1zgh d1zgha2 A:9-24,27-33,140-149
1rbz d1rbza1 A:11-23,103-110,161-187
1mej d1mejb_ B:11-23,103-110,161-187
1grc d1grca_ A:11-24,28-36,161-187
1rbz d1rbzb1 B:11-23,28-37,175-187
1zly d1zlya1 A:11-24,28-36,161-187
1mej d1meja_ A:11-23,103-110,161-187
1rbm d1rbma1 A:11-24,28-37,161-187
1rbq d1rbqb1 B:11-24,28-37,161-187
1rc0 d1rc0a1 A:11-23,103-110,161-187
1rbm d1rbmb1 B:11-23,103-110,161-187
1zgh d1zgha2 A:9-24,49-54,125-141
1rbq d1rbqa1 A:11-24,28-37,161-187
1njs d1njsb_ B:11-23,103-110,161-187
1rby d1rbyb1 B:11-24,28-37,161-187
1rbq d1rbqc1 C:11-23,103-110,161-187
1rc1 d1rc1b1 B:11-24,28-36,161-187
1njs d1njsa_ A:11-24,28-37,161-187
1rby d1rbya1 A:11-24,28-37,161-187
1rby d1rbyc1 C:11-24,28-37,161-187
1rby d1rbyd1 D:11-24,28-37,161-187
1mej d1mejc_ C:11-23,103-110,161-187
1rbq d1rbqd1 D:11-24,28-37,161-187
1rby d1rbyc1 C:11-24,103-110,161-187
1rbq d1rbqb1 B:11-24,103-110,161-187
1rbm d1rbma1 A:11-24,103-110,161-187
1njs d1njsa_ A:11-24,103-110,161-187
1rby d1rbyd1 D:11-24,103-110,161-187
1rbq d1rbqa1 A:11-24,103-110,161-187
1rby d1rbya1 A:11-24,103-110,161-187
1rby d1rbyb1 B:11-24,103-110,161-187
1zly d1zlya1 A:11-24,103-110,161-187
1rbq d1rbqd1 D:11-24,103-110,161-187
1men d1mena_ A:11-24,103-110,161-187
1rc1 d1rc1b1 B:11-24,103-110,161-187
1zlx d1zlxa1 A:11-24,103-110,161-187
1men d1menc_ C:11-24,103-110,161-187
2fmt d2fmtb2 B:12-26,102-112,163-175
1fmt d1fmtb2 B:12-26,102-112,163-175
1rbz d1rbzb1 B:11-23,81-87,161-176
1rbz d1rbzb1 B:11-23,103-110,161-176
18. c.48.1 TK C-terminal domain-like
TK C-terminal domain-like 3 layers: a/b/a; mixed beta-sheet of 5 strands, order 13245, strand 1 is antiparallel to the rest
1itz d1itzc3 C:571-588,620-626,664-675
1itz d1itzb3 B:571-588,620-626,664-675
1itz d1itza3 A:571-588,620-626,664-675
2ozl d2ozld2 D:212-230,258-264,315-328
1ni4 d1ni4d2 D:212-230,258-264,315-328
2ozl d2ozlb2 B:212-230,258-264,315-328
1ni4 d1ni4b2 B:212-230,258-264,315-328
1qgd d1qgdb3 B:558-575,607-614,651-663
2r8p d2r8pa3 A:558-575,607-614,651-663
1qgd d1qgda3 A:558-575,607-612,651-663
2r8o d2r8oa3 A:558-575,607-612,651-663
1umc d1umcd2 D:213-228,256-262,310-324
1umd d1umdb2 B:213-228,256-262,310-324
1umb d1umbb2 B:213-228,256-262,310-324
1um9 d1um9d2 D:213-228,256-262,310-324
1umc d1umcb2 B:213-228,256-262,310-324
1umb d1umbd2 D:213-228,256-262,310-324
1umd d1umdd2 D:213-228,256-262,310-324
1um9 d1um9b2 B:213-228,256-262,310-324
1v1r d1v1rb2 B:227-246,274-280,328-342
1w88 d1w88f2 F:209-227,255-260,310-324
1w85 d1w85f2 F:209-227,255-260,310-324
1olx d1olxb2 B:227-246,274-280,328-342
1ols d1olsb2 B:227-246,274-280,328-342
2beu d2beub2 B:227-246,274-280,328-342
1x7x d1x7xb2 B:227-246,274-280,328-342
1olu d1olub2 B:227-246,274-280,328-342
1v1m d1v1mb2 B:227-246,274-280,328-342
2r5n d2r5nb3 B:558-575,607-613,651-664
1u5b d1u5bb2 B:227-246,274-280,328-342
1x80 d1x80b2 B:227-246,274-280,328-342
1w88 d1w88h2 H:209-227,255-260,310-324
1x7y d1x7yb2 B:227-246,274-280,328-342
1w88 d1w88b2 B:209-227,255-261,310-324
2bev d2bevb2 B:227-246,274-280,328-342
1wci d1wcib2 B:227-246,274-280,328-342
1v11 d1v11b2 B:227-246,274-280,328-342
1x7w d1x7wb2 B:227-246,274-280,328-342
2bfd d2bfdb2 B:227-246,274-280,328-342
2bff d2bffb2 B:227-246,274-280,328-342
2bfc d2bfcb2 B:227-246,274-280,328-342
1v16 d1v16b2 B:227-246,274-280,328-342
1x7z d1x7zb2 B:227-246,274-280,328-342
2bew d2bewb2 B:227-246,274-280,328-342
1w85 d1w85b2 B:209-227,255-261,310-324
1w85 d1w85d2 D:209-227,255-261,310-324
1w85 d1w85h2 H:209-227,255-261,310-324
1w88 d1w88d2 D:209-227,255-261,310-324
1dtw d1dtwb2 B:227-246,274-280,328-342
1r9j d1r9jb3 B:552-571,600-608,641-657
1um9 d1um9b2 B:213-228,230-236,310-324
1umd d1umdb2 B:213-228,230-236,310-324
1umb d1umbb2 B:213-228,230-236,310-324
1umc d1umcb2 B:213-228,230-236,310-324
2r8p d2r8pa3 A:558-575,627-632,651-663
1um9 d1um9d2 D:213-228,230-236,310-324
1itz d1itzb3 B:571-588,640-645,664-675
1ni4 d1ni4d2 D:212-230,232-238,315-328
1ni4 d1ni4b2 B:212-230,232-238,315-328
1umc d1umcd2 D:213-228,230-236,310-324
1umb d1umbd2 D:213-228,230-236,310-324
1itz d1itza3 A:571-588,640-645,664-675
2ozl d2ozlb2 B:212-230,232-238,315-328
1qgd d1qgdb3 B:558-575,627-632,651-663
2r8p d2r8pb3 B:558-575,607-613,651-667
1umc d1umcd2 D:213-228,289-294,310-324
1umd d1umdd2 D:213-228,230-236,310-324
1um9 d1um9d2 D:213-228,289-294,310-324
2r5n d2r5na3 A:558-575,607-613,651-667
1umb d1umbd2 D:213-228,289-294,310-324
1umd d1umdd2 D:213-228,289-294,310-324
2c3u d2c3ua3 A:276-294,322-329,371-386
2uza d2uzaa3 A:276-294,322-329,371-386
1itz d1itzc3 C:571-588,640-644,664-675
2ozl d2ozld2 D:212-230,232-238,315-328
1umd d1umdb2 B:213-228,289-294,310-324
2r8o d2r8oa3 A:558-575,627-631,651-663
1umb d1umbb2 B:213-228,289-294,310-324
2c3u d2c3ub3 B:276-294,322-329,371-386
1um9 d1um9b2 B:213-228,289-294,310-324
1qgd d1qgda3 A:558-575,627-631,651-663
1umc d1umcb2 B:213-228,289-294,310-324
1r9j d1r9ja3 A:553-571,600-608,641-657
2r5n d2r5nb3 B:558-575,627-632,651-664
1x80 d1x80b2 B:227-246,248-254,328-342
2beu d2beub2 B:227-246,248-254,328-342
1w88 d1w88b2 B:209-227,288-293,310-324
2qtc d2qtca3 A:732-750,796-802,844-860
1w88 d1w88d2 D:209-227,288-293,310-324
1dtw d1dtwb2 B:227-246,307-312,328-342
1u5b d1u5bb2 B:227-246,307-312,328-342
2g28 d2g28a3 A:732-750,796-802,844-860
1w85 d1w85d2 D:209-227,288-293,310-324
2bev d2bevb2 B:227-246,307-312,328-342
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1tkc d1tkca3 A:562-580,611-619,652-668
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1qgd d1qgdb3 B:558-575,607-614,640-649
19. c.129.1 MCP/YpsA-like
MCP/YpsA-like 3 layers: a/b/a, parallel beta-sheet of 7 strands, order 4321567
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1rcu d1rcub_ B:21-36,98-104,159-170
1rcu d1rcuc_ C:21-36,98-104,159-170
1rcu d1rcua_ A:21-36,98-104,159-170
1wek d1wekc_ C:52-69,133-139,202-212
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1weh d1weha_ A:16-33,99-105,160-171
1ydh d1ydhb_ B:23-41,136-142,176-187
2a33 d2a33b1 B:27-45,140-146,180-190
1wek d1wekf_ F:52-69,133-139,202-213
1weh d1wehb_ B:16-33,99-105,160-171
2q4o d2q4ob1 B:27-45,140-146,180-190
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2a33 d2a33a1 A:27-45,111-117,180-190
1wek d1weka_ A:52-69,132-139,202-212
2q4o d2q4ob1 B:27-45,111-117,180-190
1ydh d1ydha_ A:23-41,136-142,176-187
2q4d d2q4da1 A:23-41,137-142,176-187
2q4o d2q4oa1 A:27-45,111-117,180-190
1wek d1wekb_ B:52-69,132-139,202-212
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1t35 d1t35b_ B:15-33,128-135,168-177
1rcu d1rcud_ D:21-36,122-127,159-170
1rcu d1rcub_ B:21-36,122-127,159-170
1rcu d1rcua_ A:21-36,122-127,159-170
1rcu d1rcuc_ C:21-36,122-127,159-170
1wek d1wekd_ D:52-69,132-139,202-213
1wek d1weke_ E:52-69,133-139,202-215
1ydh d1ydhb_ B:23-41,107-112,176-187
1ydh d1ydha_ A:23-41,107-112,176-187
1t35 d1t35f_ F:15-33,99-104,168-177
1t35 d1t35b_ B:15-33,99-104,168-177
2q4d d2q4da1 A:23-41,108-112,176-187
1t35 d1t35d_ D:15-33,99-105,168-179
1t35 d1t35c_ C:15-33,128-134,168-178
2q4d d2q4db1 B:23-41,136-142,176-188
1t35 d1t35a_ A:15-33,99-105,168-179
1t35 d1t35a_ A:15-33,128-135,168-179
1t35 d1t35e_ E:15-33,99-105,168-181
1t35 d1t35c_ C:15-33,99-104,168-178
1t35 d1t35e_ E:15-33,128-135,168-181
2q4d d2q4db1 B:23-41,107-112,176-188
1t35 d1t35h_ H:15-33,128-135,168-179
1weh d1weha_ A:16-33,34-39,160-171
1weh d1wehb_ B:16-33,34-39,160-171
1wek d1wekc_ C:52-69,197-201,202-212
2q4o d2q4oa1 A:27-45,175-179,180-190
1wek d1wekf_ F:52-69,197-201,202-213
1wek d1weka_ A:52-69,70-75,202-212
1t35 d1t35h_ H:15-33,99-104,168-179
1wek d1wekb_ B:52-69,70-75,202-212
1wek d1wekd_ D:52-69,70-75,202-213
1wek d1wekf_ F:52-69,70-75,202-213
1wek d1weke_ E:52-69,70-75,202-215
1wek d1wekc_ C:52-69,70-75,202-212
1t35 d1t35a_ A:15-33,163-167,168-179
1t35 d1t35e_ E:15-33,163-167,168-181
20. c.24.1 Methylglyoxal synthase-like contains a common phosphate-binding site !
Methylglyoxal synthase-like 3 layers, a/b/a; parallel beta-sheet of 5 strands, order 32145
1m9n d1m9nb1 B:17-29,96-103,148-163
1m9n d1m9na1 A:17-29,96-103,148-162
1pkx d1pkxc1 C:16-28,95-102,147-161
1pkx d1pkxa1 A:16-28,95-102,147-162
1g8m d1g8ma1 A:17-29,96-103,148-162
1pl0 d1pl0b1 B:16-28,95-102,147-161
1oz0 d1oz0b1 B:17-29,96-103,148-162
1p4r d1p4ra1 A:16-28,95-102,147-161
1pl0 d1pl0a1 A:16-28,95-102,147-161
1b93 d1b93a_ A:19-34,84-90,119-129
1s8a d1s8ad_ D:19-34,84-90,119-129
1s8a d1s8af_ F:19-34,84-90,119-129
1pl0 d1pl0c1 C:16-28,97-102,147-161
1ik4 d1ik4d_ D:19-34,84-90,119-129
1egh d1eghd_ D:19-34,84-90,119-129
1s89 d1s89d_ D:19-34,84-90,119-129
1egh d1eghf_ F:19-34,84-90,119-129
1ik4 d1ik4a_ A:19-34,84-90,119-129
1ik4 d1ik4f_ F:19-34,84-90,119-129
1ik4 d1ik4b_ B:19-34,84-90,119-129
1egh d1egha_ A:19-34,84-90,119-129
1s8a d1s8aa_ A:19-34,84-90,119-129
1b93 d1b93c_ C:19-34,84-90,119-129
1egh d1eghc_ C:19-34,84-90,119-129
1ik4 d1ik4e_ E:19-34,84-90,119-129
1egh d1eghb_ B:19-34,84-90,119-129
1egh d1eghe_ E:19-34,84-90,119-129
1ik4 d1ik4c_ C:19-34,84-90,119-129
1b93 d1b93b_ B:19-34,84-90,119-129
1pl0 d1pl0d1 D:16-28,97-102,147-161
1s89 d1s89a_ A:19-34,84-90,119-129
1s89 d1s89f_ F:19-34,84-90,119-129
1s89 d1s89c_ C:19-34,84-90,119-129
1s8a d1s8ac_ C:19-34,84-90,119-129
1t36 d1t36c2 C:953-968,1011-1017,1043-1057
1thz d1thza1 A:17-29,143-147,148-163
1thz d1thzb1 B:17-29,143-147,148-163
1zcz d1zcza1 A:10-25,81-86,116-126
1s89 d1s89b_ B:19-34,84-90,119-129
1g8m d1g8mb1 B:17-29,143-147,148-163
1oz0 d1oz0a1 A:17-29,96-104,148-162
1t36 d1t36e2 E:953-968,1011-1017,1043-1057
1m9n d1m9nb1 B:17-29,143-147,148-163
1vmd d1vmda_ A:23-38,88-94,123-133
1pkx d1pkxd1 D:16-28,142-146,147-162
1vmd d1vmdb_ B:23-38,88-94,123-133
1pkx d1pkxb1 B:16-28,142-146,147-161
1p4r d1p4rb1 B:16-28,142-146,147-162
1kee d1keeg2 G:953-968,1011-1017,1043-1057
1t36 d1t36g2 G:953-968,1011-1017,1043-1057
1kee d1keec2 C:953-968,1011-1017,1043-1057
1m9n d1m9na1 A:17-29,143-147,148-162
1g8m d1g8ma1 A:17-29,143-147,148-162
1ce8 d1ce8g2 G:953-968,1011-1017,1043-1057
1p4r d1p4ra1 A:16-28,142-146,147-161
1kee d1keee2 E:953-968,1011-1017,1043-1057
1ce8 d1ce8e2 E:953-968,1011-1017,1043-1057
1pl0 d1pl0b1 B:16-28,142-146,147-161
1t36 d1t36a2 A:953-968,1011-1017,1043-1057
1c3o d1c3oe2 E:953-968,1011-1017,1043-1057
1c30 d1c30e2 E:953-968,1011-1017,1043-1057
1ce8 d1ce8a2 A:953-968,1011-1017,1043-1057
1pkx d1pkxa1 A:16-28,142-146,147-162
1ce8 d1ce8c2 C:953-968,1011-1017,1043-1057
1m6v d1m6vg2 G:953-968,1011-1017,1043-1057
1c3o d1c3og2 G:953-968,1011-1017,1043-1057
1a9x d1a9xe2 E:4953-4968,5011-5017,5043-5057
1jdb d1jdbk2 K:952-967,1010-1016,1042-1056
1kee d1keea2 A:953-968,1011-1017,1043-1057
1cs0 d1cs0e2 E:953-968,1011-1017,1043-1057
1pl0 d1pl0d1 D:16-28,142-146,147-161
1jdb d1jdbb2 B:952-967,1010-1016,1042-1056
1c30 d1c30c2 C:953-968,1011-1017,1043-1057
1a9x d1a9xg2 G:6953-6968,7011-7017,7043-7057
1bxr d1bxrg2 G:953-968,1011-1017,1043-1057
1oz0 d1oz0b1 B:17-29,143-147,148-162
1c3o d1c3oa2 A:953-968,1011-1017,1043-1057
1c30 d1c30a2 A:953-968,1011-1017,1043-1057
1m6v d1m6ve2 E:953-968,1011-1017,1043-1057
1a9x d1a9xc2 C:2953-2968,3011-3017,3043-3057
1pkx d1pkxc1 C:16-28,142-146,147-161
1jdb d1jdbe2 E:952-967,1010-1016,1042-1056
1m6v d1m6vc2 C:953-968,1011-1017,1043-1057
1pl0 d1pl0a1 A:16-28,142-146,147-161
1pl0 d1pl0c1 C:16-28,142-146,147-161
1c3o d1c3oc2 C:953-968,1011-1017,1043-1057
1bxr d1bxrc2 C:953-968,1011-1017,1043-1057
1jdb d1jdbh2 H:952-967,1010-1016,1042-1056
1cs0 d1cs0g2 G:953-968,1011-1017,1043-1057
1cs0 d1cs0c2 C:953-968,1011-1017,1043-1057
1bxr d1bxre2 E:953-968,1011-1017,1043-1057
1m6v d1m6va2 A:953-968,1011-1017,1043-1057
1bxr d1bxra2 A:953-968,1011-1017,1043-1056
1a9x d1a9xa2 A:953-968,1011-1017,1043-1057
1c30 d1c30g2 G:953-968,1011-1017,1043-1057
1cs0 d1cs0a2 A:953-968,1011-1017,1043-1057
1g8m d1g8mb1 B:17-29,96-104,148-163
1thz d1thza1 A:17-29,96-104,148-163
1p4r d1p4rb1 B:16-28,95-103,147-162
1wo8 d1wo8a1 A:9-24,74-80,109-124
1bxr d1bxre2 E:953-968,968-974,1043-1057
1wo8 d1wo8c1 C:9-24,74-80,109-123
1wo8 d1wo8e1 E:9-24,74-80,109-123
1wo8 d1wo8d1 D:9-24,74-80,109-123
1pkx d1pkxd1 D:16-28,95-103,147-162
1wo8 d1wo8b1 B:9-24,74-80,109-123
1thz d1thzb1 B:17-29,96-104,148-163
1c30 d1c30a2 A:953-968,968-974,1043-1057
1s8a d1s8ae_ E:19-34,84-90,119-130
1s8a d1s8ab_ B:19-34,84-90,119-130
1s89 d1s89e_ E:19-34,84-90,119-130
1pkx d1pkxb1 B:16-28,97-103,147-161
1c30 d1c30e2 E:953-968,1038-1043,1043-1057
1s8a d1s8af_ F:19-34,114-119,119-129
1b93 d1b93a_ A:19-34,114-119,119-129
1wo8 d1wo8f1 F:9-24,72-80,109-123
1s8a d1s8ad_ D:19-34,114-119,119-129
1s89 d1s89f_ F:19-34,114-119,119-129
1ik4 d1ik4d_ D:19-34,114-119,119-129
1ik4 d1ik4a_ A:19-34,114-119,119-129
1s89 d1s89a_ A:19-34,114-119,119-129
1egh d1eghd_ D:19-34,114-119,119-129
1s8a d1s8ac_ C:19-34,114-119,119-129
1ik4 d1ik4b_ B:19-34,114-119,119-129
1ik4 d1ik4c_ C:19-34,114-119,119-129
1ik4 d1ik4f_ F:19-34,114-119,119-129
1egh d1eghf_ F:19-34,114-119,119-129
1egh d1egha_ A:19-34,114-119,119-129
1ik4 d1ik4e_ E:19-34,114-119,119-129
1b93 d1b93b_ B:19-34,114-119,119-129
1egh d1eghc_ C:19-34,114-119,119-129
1s89 d1s89c_ C:19-34,114-119,119-129
1b93 d1b93c_ C:19-34,114-119,119-129
1s8a d1s8aa_ A:19-34,114-119,119-129
1egh d1eghb_ B:19-34,114-119,119-129
1egh d1eghe_ E:19-34,114-119,119-129
1s89 d1s89d_ D:19-34,114-119,119-129
1s89 d1s89b_ B:19-34,114-119,119-129
1s8a d1s8ab_ B:19-34,114-119,119-130
1s8a d1s8ae_ E:19-34,114-119,119-130
1s89 d1s89e_ E:19-34,114-119,119-130
1wo8 d1wo8c1 C:9-24,105-109,109-123
1wo8 d1wo8a1 A:9-24,105-109,109-124
1wo8 d1wo8e1 E:9-24,105-109,109-123
1wo8 d1wo8d1 D:9-24,105-109,109-123
1wo8 d1wo8b1 B:9-24,105-109,109-123
1wo8 d1wo8f1 F:9-24,105-109,109-123
21. c.3.1 FAD/NAD(P)-binding domain
FAD/NAD(P)-binding domain core: 3 layers, b/b/a; central parallel beta-sheet of 5 strands, order 32145; top antiparallel beta-sheet of 3 strands, meander
2ign d2ignc1 C:55-69,314-319,593-613
1tzl d1tzld1 D:55-69,314-319,593-613
2f6c d2f6ca1 A:55-69,314-319,593-613
2f5v d2f5va1 A:55-69,314-319,593-613
1tzl d1tzlc1 C:55-69,314-319,593-613
1tzl d1tzlh1 H:55-69,314-319,593-613
2igo d2igoc1 C:55-69,314-319,593-613
2igo d2igoh1 H:55-69,314-319,593-613
1tzl d1tzle1 E:55-69,314-319,593-613
1tzl d1tzlb1 B:55-69,314-319,593-613
2ign d2ignf1 F:55-69,314-319,593-614
1ebd d1ebda1 A:18-32,141-146,321-338
2ign d2igne1 E:55-69,314-319,593-614
2ign d2igna1 A:55-69,314-319,593-614
2ign d2igng1 G:55-69,314-319,593-614
2ign d2ignd1 D:55-69,314-319,593-614
2ign d2ignb1 B:55-69,314-319,593-614
2igo d2igof1 F:55-69,314-319,593-614
1ojt d1ojta1 A:131-145,266-271,447-464
2ign d2ignh1 H:55-69,314-319,593-614
2igo d2igoa1 A:55-69,314-319,593-614
1bhy d1bhya1 A:131-145,266-271,447-464
2igo d2igoe1 E:55-69,314-319,593-614
2igo d2igod1 D:55-69,314-319,593-614
1tzl d1tzla1 A:55-69,314-319,593-614
1tzl d1tzlg1 G:55-69,314-319,593-614
2igo d2igob1 B:55-69,314-319,593-614
2igo d2igog1 G:55-69,314-319,593-614
1ebd d1ebdb1 B:18-32,141-146,321-338
1tzl d1tzlf1 F:55-69,314-319,593-614
1jeh d1jehb1 B:14-28,147-152,332-350
1lpf d1lpfb1 B:12-26,144-149,325-342
1e7p d1e7pa2 A:14-28,210-215,413-431
1e7p d1e7pj2 J:14-28,210-215,413-431
1e7p d1e7pd2 D:14-28,210-215,413-431
1e7p d1e7pg2 G:14-28,210-215,413-431
1dxl d1dxlb1 B:15-29,141-146,324-341
1lpf d1lpfa1 A:12-26,144-149,325-342
1fea d1feab1 B:12-27,153-158,333-351
1xdi d1xdia1 A:11-26,146-151,324-341
1v59 d1v59b1 B:14-28,147-152,332-350
1xdi d1xdib1 B:11-26,146-151,324-341
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1f6m d1f6me1 E:14-28,31-36,294-320
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3cph d3cphh1 H:93-103,109-113,238-254
1d4c d1d4cb2 B:214-226,228-234,251-268
1d5t d1d5ta1 A:85-95,101-105,230-246
1ukv d1ukvg1 G:93-103,109-113,238-254
2bcg d2bcgg1 G:93-103,109-113,238-254
3cph d3cphg1 G:93-103,109-113,238-254
1lv0 d1lv0a1 A:85-95,101-105,230-246
3cpj d3cpjg1 G:93-103,109-113,238-254
2i0z d2i0za1 A:79-91,93-98,108-124
1tdo d1tdoa1 A:95-106,108-112,239-252
1tdn d1tdna1 A:95-106,108-112,239-252
1reo d1reoa1 A:95-106,108-112,239-252
1tdk d1tdka1 A:95-106,108-112,239-252
2iid d2iida1 A:95-106,108-112,239-252
2iid d2iidb1 B:95-106,108-112,239-252
2iid d2iidc1 C:95-106,108-112,239-252
1f8r d1f8ra1 A:95-106,108-112,239-252
1f8r d1f8rb1 B:95-106,108-112,239-252
1f8s d1f8sd1 D:95-106,108-112,239-252
1f8s d1f8sf1 F:95-106,108-112,239-252
1f8r d1f8rd1 D:95-106,108-112,239-252
1f8s d1f8sg1 G:95-106,108-112,239-252
1f8s d1f8sh1 H:95-106,108-112,239-252
1f8r d1f8rc1 C:95-106,108-112,239-252
1f8s d1f8sb1 B:95-106,108-112,239-252
1f8s d1f8se1 E:95-106,108-112,239-252
1gnd d1gnda1 A:85-95,101-105,230-246
1f8s d1f8sc1 C:95-106,108-112,239-252
1f8s d1f8sa1 A:95-106,108-112,239-252
2iid d2iidd1 D:95-106,108-112,239-252
1ltx d1ltxr1 R:237-247,253-257,376-392
1vg9 d1vg9a1 A:237-247,253-257,376-392
1vg9 d1vg9e1 E:237-247,253-257,376-392
2gqf d2gqfa1 A:79-91,93-98,107-123
1b5q d1b5qa1 A:179-186,402-406,411-420
1h84 d1h84a1 A:179-186,402-406,411-420
1b37 d1b37a1 A:179-186,402-406,411-420
1h83 d1h83a1 A:179-186,402-406,411-420
1h86 d1h86a1 A:179-186,402-406,411-420
1h82 d1h82c1 C:179-186,402-406,411-420
1h81 d1h81b1 B:179-186,402-406,411-420
1h84 d1h84b1 B:179-186,402-406,411-420
1b5q d1b5qb1 B:179-186,402-406,411-420
1h83 d1h83b1 B:179-186,402-406,411-420
1h86 d1h86b1 B:179-186,402-406,411-420
1b37 d1b37b1 B:179-186,402-406,411-420
22. d.178.1 Aromatic aminoacid monoxygenases, catalytic and oligomerization domains
Aromatic aminoacid monoxygenases, catalytic and oligomerization domains unusual fold
1kw0 d1kw0a_ A:226-239,261-266,282-297
2pah d2pahb_ B:226-239,261-266,282-297
2pah d2paha_ A:226-239,261-266,282-297
1mmt d1mmta_ A:226-239,261-266,282-297
1tg2 d1tg2a_ A:226-239,261-266,282-297
1mmk d1mmka_ A:226-239,261-266,282-297
2toh d2toha_ A:272-285,307-312,328-343
1j8u d1j8ua_ A:226-239,261-266,282-297
1toh d1toha_ A:272-285,307-312,328-343
1tdw d1tdwa_ A:226-239,261-266,282-297
1phz d1phza2 A:226-239,261-266,282-297
1lrm d1lrma_ A:226-239,261-266,282-297
4pah d4paha_ A:226-239,261-266,282-297
1j8t d1j8ta_ A:226-239,261-266,282-297
1dmw d1dmwa_ A:226-239,261-266,282-297
3pah d3paha_ A:226-239,261-266,282-297
5pah d5paha_ A:226-239,261-266,282-297
2phm d2phma2 A:226-239,261-266,282-297
6pah d6paha_ A:226-239,261-266,282-297
1pah d1paha_ A:226-239,261-266,282-297
1mlw d1mlwa_ A:213-226,248-253,269-284
1ltu d1ltua_ A:79-92,114-119,135-150
1pah d1paha_ A:226-239,240-245,282-297
1tg2 d1tg2a_ A:226-239,240-245,282-297
3pah d3paha_ A:226-239,240-245,282-297
1dmw d1dmwa_ A:226-239,240-245,282-297
6pah d6paha_ A:226-239,240-245,282-297
4pah d4paha_ A:226-239,240-245,282-297
2phm d2phma2 A:226-239,240-245,282-297
1phz d1phza2 A:226-239,240-245,282-297
1tdw d1tdwa_ A:226-239,240-245,282-297
5pah d5paha_ A:226-239,240-245,282-297
1j8t d1j8ta_ A:226-239,240-245,282-297
1j8u d1j8ua_ A:226-239,240-245,282-297
1lrm d1lrma_ A:226-239,240-245,282-297
2toh d2toha_ A:272-285,286-291,328-343
2pah d2pahb_ B:226-239,240-245,282-297
2pah d2paha_ A:226-239,240-245,282-297
1toh d1toha_ A:272-285,286-291,328-343
1kw0 d1kw0a_ A:226-239,240-245,282-297
1mmk d1mmka_ A:226-239,240-245,282-297
1mmt d1mmta_ A:226-239,240-245,282-297
1mlw d1mlwa_ A:213-226,227-232,269-284
1ltz d1ltza_ A:79-86,114-119,135-150
1ltv d1ltva_ A:79-86,114-119,135-150
1ltu d1ltua_ A:79-92,93-99,135-150
1ltz d1ltza_ A:79-86,93-99,135-150
1ltv d1ltva_ A:79-86,93-99,135-150
1ltz d1ltza_ A:37-59,192-198,204-214
1mmt d1mmta_ A:180-202,338-344,350-359
1mmk d1mmka_ A:180-202,338-344,350-359
1kw0 d1kw0a_ A:180-202,338-344,350-360
23. c.31.1 DHS-like NAD/FAD-binding domain binds cofactor molecules in the opposite direction than classical Rossmann fold !
DHS-like NAD/FAD-binding domain 3 layers: a/b/a; parallel beta-sheet of 6 strands, order 321456; Rossmann-like
1u2d d1u2dc1 C:61-77,123-129,190-203
2oo5 d2oo5c1 C:61-77,123-129,190-203
2fsv d2fsvc1 C:61-77,123-129,190-203
1u2g d1u2gc1 C:61-77,123-129,190-203
1ptj d1ptjc_ C:61-77,123-129,190-203
1nm5 d1nm5c_ C:61-77,123-129,190-203
1pnq d1pnqa_ A:322-338,384-390,451-464
1xlt d1xltf1 F:322-338,384-390,451-464
1pno d1pnoa_ A:322-338,384-390,451-464
1xlt d1xlti1 I:322-338,384-390,451-464
1pnq d1pnqb_ B:322-338,384-390,451-464
1pno d1pnob_ B:322-338,384-390,451-464
1u28 d1u28c1 C:61-77,123-129,190-203
1pt9 d1pt9a_ A:60-76,122-128,189-204
1u31 d1u31a1 A:60-76,122-128,189-204
1jsc d1jscb1 B:313-328,369-374,426-439
1u31 d1u31b1 B:60-76,122-128,189-204
1s5p d1s5pa_ A:107-121,208-214,257-274
1xlt d1xltc1 C:322-338,384-390,451-464
1pt9 d1pt9b_ B:60-76,122-128,189-204
2frd d2frdc1 C:61-77,123-129,190-203
1hzz d1hzzc_ C:62-77,123-129,190-203
1djl d1djla_ A:896-912,958-964,1025-1040
1djl d1djlb_ B:896-912,958-964,1025-1040
1ici d1icib_ B:77-90,179-185,228-245
2oor d2oorc1 C:61-77,123-129,190-202
1ici d1icia_ A:77-90,179-185,228-245
2fr8 d2fr8c1 C:61-77,123-129,190-203
1ovm d1ovmc1 C:224-237,278-284,323-339
1s7g d1s7ge_ E:79-92,185-191,234-250
1ovm d1ovmd1 D:224-237,278-284,323-339
1yc2 d1yc2e1 E:79-92,185-191,234-250
1yc2 d1yc2c1 C:79-92,185-191,234-252
1s7g d1s7gc_ C:79-92,185-191,234-252
1upc d1upcd1 D:231-244,289-295,338-353
1upc d1upcb1 B:231-244,289-295,338-353
1ma3 d1ma3a_ A:79-92,185-191,234-251
1ovm d1ovma1 A:224-237,278-284,323-339
1ovm d1ovmb1 B:224-237,278-284,323-339
1e3t d1e3ta_ A:60-77,123-129,190-202
1upb d1upbd1 D:231-244,289-295,338-353
1upc d1upca1 A:231-244,289-295,338-353
1upc d1upcc1 C:231-244,289-295,338-353
1d4o d1d4oa_ A:37-53,99-105,166-181
1yc2 d1yc2b1 B:79-92,185-191,234-252
2iht d2ihtb1 B:231-244,289-295,338-353
1upb d1upbb1 B:231-244,289-295,338-353
1upa d1upab1 B:231-244,289-295,338-353
2iht d2ihtd1 D:231-244,289-295,338-353
1t9d d1t9da1 A:313-328,368-374,426-439
2ihv d2ihvb1 B:231-244,289-295,338-353
1n0h d1n0ha1 A:313-328,368-374,426-439
1t9d d1t9dd1 D:313-328,368-374,426-439
1t9a d1t9aa1 A:313-328,368-374,426-439
1yc2 d1yc2d1 D:79-92,185-191,234-252
1yc2 d1yc2a1 A:79-92,185-191,234-252
1t9c d1t9ca1 A:313-328,368-374,426-439
1t9b d1t9bb1 B:313-328,368-374,426-439
1m2n d1m2na_ A:77-90,179-185,228-246
1n0h d1n0hb1 B:313-328,368-374,426-439
1s7g d1s7gb_ B:79-92,185-191,234-252
1s7g d1s7ga_ A:79-92,185-191,234-252
1t9d d1t9db1 B:313-328,368-374,426-439
1t9a d1t9ab1 B:313-328,368-374,426-439
1s7g d1s7gd_ D:79-92,185-191,234-252
2ez4 d2ez4a1 A:226-238,278-284,325-338
1t9b d1t9ba1 A:313-328,368-374,426-439
1qpb d1qpba1 A:225-239,280-286,325-344
2a1t d2a1tr2 R:227-242,273-279,318-333
1qpb d1qpba1 A:225-239,305-311,325-344
1m2k d1m2ka_ A:77-90,179-185,228-247
1t9c d1t9cb1 B:313-328,368-374,426-439
1m2n d1m2nb_ B:77-90,179-185,228-246
1m2h d1m2ha_ A:77-90,179-185,228-247
1m2g d1m2ga_ A:77-90,179-185,228-247
1qpb d1qpbb1 B:227-239,280-286,325-344
2a1u d2a1ua2 A:227-242,273-279,318-333
1m2j d1m2ja_ A:77-90,179-185,228-247
1efp d1efpa2 A:205-220,251-257,296-308
1efp d1efpc2 C:205-220,251-257,296-308
1efv d1efva2 A:227-242,273-279,318-331
1upb d1upbc1 C:231-244,289-295,338-351
1upa d1upac1 C:231-244,289-295,338-351
1qpb d1qpbb1 B:227-239,305-311,325-344
1upc d1upce1 E:231-244,289-295,338-351
2iht d2ihtc1 C:231-244,289-295,338-351
1upc d1upcf1 F:231-244,289-295,338-351
1upa d1upad1 D:231-244,289-295,338-351
2iht d2ihta1 A:231-244,289-295,338-351
1upa d1upaa1 A:231-244,289-295,338-351
2ihv d2ihvd1 D:231-244,289-295,338-351
1upb d1upba1 A:231-244,289-295,338-351
1pvd d1pvdb1 B:226-239,305-311,325-337
3clt d3cltd2 D:214-229,261-267,306-319
3clr d3clrd2 D:214-229,261-267,306-319
1j8f d1j8fa_ A:146-159,255-261,323-336
1z8n d1z8na1 A:313-325,365-371,414-430
3clu d3clud2 D:214-229,261-267,306-319
1pyd d1pydb1 B:226-239,305-311,325-337
2ihu d2ihua1 A:231-244,289-295,338-351
1yhz d1yhza1 A:313-325,365-371,414-430
1yi0 d1yi0a1 A:313-325,365-371,414-430
1yhy d1yhya1 A:313-325,365-371,414-430
1ybh d1ybha1 A:313-325,365-371,414-430
1yi1 d1yi1a1 A:313-325,365-371,414-430
1j8f d1j8fc_ C:146-159,255-261,323-336
2ihv d2ihva1 A:231-244,289-295,338-351
2fsv d2fsvc1 C:61-77,158-165,190-203
1j8f d1j8fb_ B:146-159,255-261,323-336
1t9d d1t9dc1 C:313-328,368-374,426-438
1u2g d1u2gc1 C:61-77,158-165,190-203
1ozg d1ozga1 A:223-235,276-282,323-336
3cls d3clsd2 D:214-229,261-267,306-318
2ezt d2ezta1 A:226-238,278-284,325-337
1ozf d1ozfa1 A:223-235,276-282,323-336
2ji7 d2ji7a1 A:229-241,274-280,325-338
1pow d1powa1 A:226-238,278-284,325-337
1o97 d1o97d2 D:214-229,261-267,306-318
2fr8 d2fr8c1 C:61-77,158-165,190-203
1u28 d1u28c1 C:61-77,158-165,190-203
2ez9 d2ez9a1 A:226-238,278-284,325-337
2ji6 d2ji6a1 A:229-241,274-280,325-338
1pvd d1pvda1 A:225-239,280-286,325-337
2dji d2djia1 A:221-233,273-279,320-332
2jib d2jiba1 A:229-241,274-280,325-338
1pox d1poxa1 A:226-238,278-284,325-337
2ez8 d2ez8a1 A:226-238,278-284,325-337
1ozf d1ozfb1 B:223-235,276-282,323-336
1v5f d1v5fa1 A:221-233,273-279,320-332
1v5e d1v5ea1 A:221-233,273-279,320-332
1pvd d1pvda1 A:225-239,304-311,325-337
1v5g d1v5ga1 A:221-233,273-279,320-332
2ji9 d2ji9b1 B:229-241,274-280,325-338
2ezu d2ezua1 A:226-238,278-284,325-337
2ji9 d2ji9a1 A:229-241,274-280,325-338
2jib d2jibb1 B:229-241,274-280,325-338
2ji7 d2ji7b1 B:229-241,274-280,325-338
2ji8 d2ji8b1 B:229-241,274-280,325-338
2oor d2oorc1 C:61-77,158-165,190-202
2ezt d2eztb1 B:226-238,278-284,325-337
2ji6 d2ji6b1 B:229-241,274-280,325-338
2ez9 d2ez9b1 B:226-238,278-284,325-337
1ozh d1ozhc1 C:223-235,276-282,323-336
1pox d1poxb1 B:226-238,278-284,325-337
1pow d1powb1 B:226-238,278-284,325-337
2ji8 d2ji8a1 A:229-241,274-280,325-338
2ez8 d2ez8b1 B:226-238,278-284,325-337
1o96 d1o96b2 B:214-229,261-267,306-318
2ez4 d2ez4b1 B:226-238,278-284,325-337
1pyd d1pyda1 A:225-239,280-286,325-337
2c31 d2c31b1 B:229-241,274-280,325-338
1o96 d1o96f2 F:214-229,261-267,306-318
2ezu d2ezub1 B:226-238,278-284,325-337
1o96 d1o96d2 D:214-229,261-267,306-318
2c31 d2c31a1 A:229-241,274-280,325-338
1q14 d1q14a_ A:94-107,217-223,269-282
1o96 d1o96z2 Z:214-229,261-267,306-318
1pyd d1pyda1 A:225-239,304-311,325-337
1ytl d1ytld1 D:47-61,110-116,159-174
1ozh d1ozha1 A:220-235,276-282,323-336
2nyr d2nyra1 A:115-132,243-249,292-302
2nyr d2nyrb1 B:115-132,243-249,292-302
1ytl d1ytlc1 C:47-61,110-116,159-174
2b4y d2b4yb1 B:115-132,243-249,292-302
1ytl d1ytla1 A:47-61,110-116,159-174
1zpd d1zpda1 A:224-237,303-309,323-335
1pyd d1pydb1 B:226-239,280-286,325-337
2h2d d2h2da1 A:77-90,182-188,231-244
1ytl d1ytlb1 B:47-61,110-116,159-174
1q1a d1q1aa_ A:94-107,217-223,269-282
2h2f d2h2fa1 A:77-90,182-188,231-244
1zpd d1zpdf1 F:224-237,303-309,323-335
1zpd d1zpdb1 B:224-237,303-309,323-335
2v3w d2v3wa1 A:215-228,268-274,317-329
1jsc d1jsca1 A:313-328,368-374,426-435
2b4y d2b4ya1 A:115-132,243-249,292-302
2h4f d2h4fa1 A:77-90,182-188,231-244
2v3w d2v3wb1 B:215-228,268-274,317-329
1q6z d1q6za1 A:215-228,268-274,317-329
2h4j d2h4ja1 A:77-90,182-188,231-244
2b4y d2b4yd1 D:115-132,243-249,292-302
2v3w d2v3wd1 D:215-228,268-274,317-329
2b4y d2b4yc1 C:115-132,243-249,292-302
1mcz d1mczj1 J:215-228,268-274,317-329
1mcz d1mczg1 G:215-228,268-274,317-329
1mcz d1mcza1 A:215-228,268-274,317-329
1mcz d1mczm1 M:215-228,268-274,317-329
1mcz d1mczk1 K:215-228,268-274,317-329
1mcz d1mczi1 I:215-228,268-274,317-329
1mcz d1mczb1 B:215-228,268-274,317-329
1mcz d1mczn1 N:215-228,268-274,317-329
1mcz d1mczp1 P:215-228,268-274,317-329
1mcz d1mczo1 O:215-228,268-274,317-329
1zpd d1zpde1 E:224-237,303-309,323-335
3d4b d3d4ba1 A:77-90,182-188,231-244
1mcz d1mcze1 E:215-228,268-274,317-329
1mcz d1mczh1 H:215-228,268-274,317-329
1mcz d1mczd1 D:215-228,268-274,317-329
1mcz d1mczl1 L:215-228,268-274,317-329
1yc5 d1yc5a1 A:77-90,182-188,231-244
2fn3 d2fn3a1 A:215-228,268-274,317-329
2fwn d2fwna1 A:215-228,268-274,317-329
1mcz d1mczf1 F:215-228,268-274,317-329
1pvd d1pvdb1 B:226-239,280-286,325-337
1mcz d1mczc1 C:215-228,268-274,317-329
3d81 d3d81a1 A:77-90,182-188,231-244
2v3w d2v3wc1 C:215-228,268-274,317-329
2h2h d2h2ha1 A:77-90,182-188,231-244
1po7 d1po7a1 A:215-228,268-274,317-329
1pi3 d1pi3a1 A:215-228,268-274,317-329
1yno d1ynoa1 A:215-228,268-274,317-329
1ozg d1ozgb1 B:220-235,276-282,323-336
2h2g d2h2ga1 A:77-90,182-188,231-244
1ozh d1ozhd1 D:220-235,276-282,323-336
1bfd d1bfda1 A:215-228,268-274,317-329
1ozg d1ozga1 A:223-235,298-305,323-336
1ozf d1ozfa1 A:223-235,298-305,323-336
2h2i d2h2ia1 A:77-90,182-188,231-243
1zpd d1zpda1 A:224-237,278-284,323-335
1zpd d1zpdb1 B:224-237,278-284,323-335
1zpd d1zpdf1 F:224-237,278-284,323-335
1zpd d1zpde1 E:224-237,278-284,323-335
1ozh d1ozhb1 B:220-235,276-282,323-335
1q17 d1q17b_ B:94-107,216-223,269-282
1q17 d1q17a_ A:94-107,216-223,269-282
1q17 d1q17c_ C:94-107,216-223,269-282
1szd d1szda_ A:94-107,215-223,269-282
1szc d1szca_ A:94-107,215-223,269-282
1rlz d1rlza_ A:110-123,274-282,342-359
1dhs d1dhsa_ A:110-123,274-282,342-359
1rqd d1rqda_ A:110-123,274-282,342-354
1roz d1roza_ A:110-123,274-282,342-354
1rqd d1rqdb_ B:110-123,274-282,342-354
1roz d1rozb_ B:110-123,274-282,342-355
24. d.315.1 TRCF domain-like
TRCF domain-like beta-alpha(3)-beta(2)-alpha-beta(2)-alpha; 2 layers: alpha/beta; mixed beta sheet, order 12354, strands 1 and 2 are parallel; some topological similarity to the DCoH-like fold (scop_cf 55247)
2eyq d2eyqb6 B:1054-1074,1074-1082,1127-1146
2eyq d2eyqa6 A:1054-1074,1074-1082,1127-1146
2eyq d2eyqb6 B:522-529,1002-1007,1054-1074
25. c.81.1 Formate dehydrogenase/DMSO reductase, domains 1-3 molybdopterine enzyme !
Formate dehydrogenase/DMSO reductase, domains 1-3 contains of two similar intertwined domains related by pseudo dyad; duplication ! core: 3 layers: a/b/a; parallel beta-sheet of 5 strands, order 32451
2fug d2fugc2 C:350-365,564-570,636-649
2fug d2fugl2 L:350-365,564-570,636-649
2fug d2fugu2 U:350-365,565-570,636-649
2fug d2fug32 3:350-365,565-570,636-649
2jim d2jima2 A:113-129,410-416,493-506
2v3v d2v3va2 A:113-129,410-416,493-506
2v45 d2v45a2 A:113-129,410-416,493-506
2jiq d2jiqa2 A:113-129,410-416,493-506
2jio d2jioa2 A:113-129,410-416,493-506
2nap d2napa2 A:113-129,410-416,493-506
2jip d2jipa2 A:113-129,410-416,493-506
2jir d2jira2 A:113-129,410-416,493-506
1tmo d1tmoa2 A:126-139,462-469,519-532
2iv2 d2iv2x2 X:113-129,396-402,477-490
1fdo d1fdoa2 A:113-129,396-402,477-490
1ogy d1ogya2 A:125-141,448-454,531-544
1ogy d1ogym2 M:125-141,448-454,531-544
1ogy d1ogyk2 K:125-141,448-454,531-544
1ogy d1ogyo2 O:125-141,448-454,531-544
1dms d1dmsa2 A:124-137,453-460,510-523
1ogy d1ogye2 E:125-141,448-454,531-544
1ogy d1ogyc2 C:125-141,448-454,531-544
1fdi d1fdia2 A:113-129,396-402,477-490
1ogy d1ogyg2 G:125-141,448-454,531-544
1h5n d1h5na2 A:124-137,453-460,510-523
1ogy d1ogyi2 I:125-141,448-454,531-544
1dmr d1dmra2 A:124-137,453-460,510-523
1h5n d1h5nc2 C:124-137,453-460,510-523
1aa6 d1aa6a2 A:113-129,396-402,477-490
4dmr d4dmra2 A:124-137,453-460,510-523
1e5v d1e5va2 A:124-137,453-460,510-523
3dmr d3dmra2 A:124-137,453-460,510-523
1eu1 d1eu1a2 A:124-137,453-460,510-523
1ogy d1ogyc2 C:153-165,339-345,353-369
1ogy d1ogym2 M:153-165,339-345,353-369
1ogy d1ogyg2 G:153-165,339-345,353-369
1ogy d1ogya2 A:153-165,339-345,353-369
1ogy d1ogyk2 K:153-165,339-345,353-369
1ogy d1ogyo2 O:153-165,339-345,353-369
1ogy d1ogye2 E:153-165,339-345,353-369
1ogy d1ogyi2 I:153-165,339-345,353-369
1e60 d1e60c2 C:124-137,453-459,510-523
1e60 d1e60a2 A:124-137,453-459,510-523
1e18 d1e18a2 A:124-137,453-459,510-523
1e5v d1e5vc2 C:124-137,453-459,510-523
1e61 d1e61c2 C:124-137,453-459,510-523
2jim d2jima2 A:141-153,301-307,315-331
2jiq d2jiqa2 A:141-153,301-307,315-331
2v45 d2v45a2 A:141-153,301-307,315-331
2jio d2jioa2 A:141-153,301-307,315-331
1h0h d1h0hk2 K:132-147,510-516,604-624
2v3v d2v3va2 A:141-153,301-307,315-331
1e61 d1e61a2 A:124-137,453-459,510-523
1h0h d1h0ha2 A:132-147,510-516,604-624
1q16 d1q16a2 A:195-210,707-712,821-838
1y5l d1y5la2 A:195-210,707-712,821-838
2nap d2napa2 A:141-153,301-307,315-331
1y5i d1y5ia2 A:195-210,707-712,821-838
2dmr d2dmra2 A:124-137,453-459,510-523
2jir d2jira2 A:141-153,301-307,315-331
1y4z d1y4za2 A:195-210,707-712,821-838
1siw d1siwa2 A:195-210,707-712,821-838
1r27 d1r27c2 C:195-210,707-712,821-838
2jip d2jipa2 A:141-153,301-307,315-331
1y5n d1y5na2 A:195-210,707-712,821-838
1r27 d1r27a2 A:195-210,707-712,821-838
1h5n d1h5nc2 C:124-137,426-431,510-523
1kqg d1kqga2 A:170-185,550-556,648-668
1e5v d1e5vc2 C:124-137,426-431,510-523
1kqf d1kqfa2 A:170-185,550-556,648-668
1e60 d1e60c2 C:124-137,426-431,510-523
1h5n d1h5na2 A:124-137,426-431,510-523
1eu1 d1eu1a2 A:124-137,426-431,510-523
1e60 d1e60a2 A:124-137,426-431,510-523
1y5l d1y5la2 A:195-210,766-773,821-838
2dmr d2dmra2 A:124-137,426-431,510-523
1y4z d1y4za2 A:195-210,766-773,821-838
1q16 d1q16a2 A:195-210,766-773,821-838
1y5i d1y5ia2 A:195-210,766-773,821-838
1h0h d1h0ha2 A:158-171,364-370,375-394
1y5n d1y5na2 A:195-210,766-773,821-838
1siw d1siwa2 A:195-210,766-773,821-838
1vle d1vleu2 U:152-165,520-527,588-601
1vle d1vlew2 W:152-165,520-527,588-601
1vle d1vles2 S:152-165,520-527,588-601
1h0h d1h0hk2 K:158-171,364-370,375-394
1vlf d1vlfo2 O:152-165,520-527,588-601
1ti4 d1ti4g2 G:152-165,520-527,588-601
1ti4 d1ti4k2 K:152-165,520-527,588-601
1vle d1vleo2 O:152-165,520-527,588-601
1ti4 d1ti4a2 A:152-165,520-527,588-601
1r27 d1r27c2 C:195-210,766-773,821-838
1ti4 d1ti4i2 I:152-165,520-527,588-601
1vlf d1vlfu2 U:152-165,520-527,588-601
1vlf d1vlfw2 W:152-165,520-527,588-601
1r27 d1r27a2 A:195-210,766-773,821-838
1ti4 d1ti4c2 C:152-165,520-527,588-601
1vld d1vlds2 S:152-165,520-527,588-601
1vle d1vleq2 Q:152-165,520-527,588-601
1ti6 d1ti6g2 G:152-165,520-527,588-601
1ti6 d1ti6k2 K:152-165,520-527,588-601
1ti6 d1ti6c2 C:152-165,520-527,588-601
1vlf d1vlfs2 S:152-165,520-527,588-601
1vlf d1vlfq2 Q:152-165,520-527,588-601
1ti4 d1ti4e2 E:152-165,520-527,588-601
1ti2 d1ti2i2 I:152-165,520-527,588-601
1ti2 d1ti2g2 G:152-165,520-527,588-601
1ti6 d1ti6e2 E:152-165,520-527,588-601
1vle d1vlem2 M:152-165,520-527,588-601
1ti6 d1ti6a2 A:152-165,520-527,588-601
1vlf d1vlfm2 M:152-165,520-527,588-601
1ti6 d1ti6i2 I:152-165,520-527,588-601
1ti2 d1ti2k2 K:152-165,520-527,588-601
1vld d1vldq2 Q:152-165,520-527,588-601
1g8j d1g8ja2 A:204-211,378-384,392-408
1g8j d1g8ja2 A:135-155,450-456,491-506
1g8j d1g8jc2 C:204-211,378-384,392-408
1g8k d1g8kc2 C:204-211,378-384,392-408
1g8j d1g8jc2 C:135-155,450-456,491-506
1g8k d1g8kg2 G:204-211,378-384,392-408
1g8k d1g8ka2 A:204-211,378-384,392-408
1g8k d1g8ke2 E:204-211,378-384,392-408
1aa6 d1aa6a2 A:142-153,290-296,302-320
1g8k d1g8kc2 C:135-155,450-456,491-506
1g8k d1g8kg2 G:135-155,450-456,491-506
1g8k d1g8ka2 A:172-188,450-456,562-582
1g8k d1g8ka2 A:135-155,450-456,491-506
1g8k d1g8kg2 G:172-188,450-456,562-582
1g8k d1g8kc2 C:172-188,450-456,562-582
1g8k d1g8ke2 E:135-155,450-456,491-506
1g8k d1g8ke2 E:172-188,450-456,562-582
1g8j d1g8ja2 A:172-188,450-456,562-582
1g8j d1g8jc2 C:172-188,450-456,562-582
1ti2 d1ti2e2 E:152-160,520-527,588-601
1vld d1vlds2 S:152-165,491-497,588-601
1vle d1vlew2 W:152-165,491-497,588-601
1vle d1vles2 S:152-165,491-497,588-601
1vle d1vleu2 U:152-165,491-497,588-601
1ti4 d1ti4k2 K:152-165,491-497,588-601
1ti4 d1ti4g2 G:152-165,491-497,588-601
1vlf d1vlfs2 S:152-165,491-497,588-601
1vld d1vldo2 O:152-165,491-497,588-601
1vlf d1vlfo2 O:152-165,491-497,588-601
1vlf d1vlfw2 W:152-165,491-497,588-601
1vlf d1vlfu2 U:152-165,491-497,588-601
1ti4 d1ti4a2 A:152-165,491-497,588-601
1vlf d1vlfm2 M:152-165,491-497,588-601
1ti6 d1ti6k2 K:152-165,491-497,588-601
1vle d1vleo2 O:152-165,491-497,588-601
1vle d1vleq2 Q:152-165,491-497,588-601
1ti4 d1ti4e2 E:152-165,491-497,588-601
1vlf d1vlfq2 Q:152-165,491-497,588-601
1ti2 d1ti2i2 I:152-165,491-497,588-601
1vld d1vldo2 O:152-165,520-526,588-601
1ti4 d1ti4i2 I:152-165,491-497,588-601
1ti6 d1ti6c2 C:152-165,491-497,588-601
1ti6 d1ti6e2 E:152-165,491-497,588-601
1vld d1vldq2 Q:152-165,491-497,588-601
1vld d1vldu2 U:152-165,491-497,588-601
1ti2 d1ti2c2 C:152-165,520-526,588-601
1vld d1vldu2 U:152-165,520-526,588-601
1ti2 d1ti2a2 A:152-165,520-526,588-601
1vld d1vldw2 W:152-165,520-526,588-601
1vld d1vldm2 M:152-165,520-526,588-601
2dmr d2dmra2 A:148-156,315-321,329-345
26. c.33.1 Isochorismatase-like hydrolases
Isochorismatase-like hydrolases 3 layers: a/b/a; parallel beta-sheet of 6 strands, order 321456
1j2r d1j2rb_ B:40-59,133-139,191-199
1j2r d1j2rc_ C:40-59,133-139,191-199
1j2r d1j2ra_ A:40-59,133-141,191-199
1j2r d1j2rd_ D:40-59,133-139,191-199
1x9g d1x9ga_ A:30-49,125-131,160-170
1x9g d1x9ga_ A:30-49,100-108,160-170
1xn4 d1xn4a_ A:30-49,125-131,160-170
1nba d1nbaa_ A:67-86,165-173,223-234
1nba d1nbac_ C:67-86,165-173,223-234
1nba d1nbad_ D:67-86,165-173,223-234
1nba d1nbab_ B:67-86,165-173,223-234
1xn4 d1xn4a_ A:30-49,100-108,160-170
1nba d1nbac_ C:67-86,190-196,223-234
1j2r d1j2rd_ D:40-59,158-164,191-199
1j2r d1j2rb_ B:40-59,158-164,191-199
1nba d1nbab_ B:67-86,190-196,223-234
1j2r d1j2rc_ C:40-59,158-164,191-199
1nba d1nbaa_ A:67-86,190-196,223-234
1nba d1nbad_ D:67-86,190-196,223-234
1yac d1yacb_ B:32-51,131-137,164-174
1yac d1yaca_ A:32-51,131-137,164-174
1j2r d1j2ra_ A:40-59,158-164,191-199
1yac d1yacb_ B:32-51,106-114,164-174
1yac d1yaca_ A:32-51,106-114,164-174
1yac d1yacb_ B:32-51,160-164,164-174
1yac d1yaca_ A:32-51,160-164,164-174
27. c.37.1 P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases division into families based on beta-sheet topologies !
P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases 3 layers: a/b/a, parallel or mixed beta-sheets of variable sizes
1fmj d1fmjb_ B:75-89,178-184,254-267
2d06 d2d06a1 A:50-64,123-129,199-212
1fmj d1fmja_ A:75-89,178-184,254-267
1fml d1fmla_ A:75-89,178-184,254-267
1fml d1fmlb_ B:75-89,178-184,254-267
2ak3 d2ak3b1 B:17-30,107-114,198-214
1ls6 d1ls6a_ A:50-64,123-129,199-212
1kdr d1kdrb_ B:17-30,142-149,208-223
2ak3 d2ak3a1 A:17-29,107-114,198-214
3bfx d3bfxa1 A:51-65,124-130,200-213
2a3r d2a3ra1 A:50-64,123-129,199-212
2d06 d2d06b1 B:50-64,123-129,199-212
2a3r d2a3rb1 B:50-64,123-129,199-212
1cjm d1cjma_ A:50-63,123-129,199-212
1hy3 d1hy3a_ A:49-63,122-128,198-211
1hy3 d1hy3b_ B:49-63,122-128,198-211
2anc d2anca1 A:16-29,96-103,171-189
2anc d2ancd1 D:16-29,97-103,171-189
1g3m d1g3mb_ B:49-63,122-128,198-211
1g3m d1g3ma_ A:49-63,122-128,198-211
3adk d3adka_ A:20-33,113-120,178-193
1bo6 d1bo6b_ B:50-64,123-129,199-212
1fmj d1fmjb_ B:75-89,242-247,254-267
1bo6 d1bo6a_ A:50-64,123-129,199-212
1fmj d1fmja_ A:75-89,242-247,254-267
1aqy d1aqya_ A:50-64,124-129,199-212
1lw7 d1lw7a2 A:236-251,299-305,385-404
2f3t d2f3ta1 A:16-29,96-103,171-189
2f3t d2f3tf1 F:16-29,96-103,171-189
2f3t d2f3te1 E:16-29,96-103,171-189
1e2d d1e2da_ A:18-34,90-97,183-203
2f3t d2f3tc1 C:16-29,96-103,171-189
2f3t d2f3tb1 B:16-29,96-103,171-189
1fml d1fmlb_ B:75-89,242-247,254-267
1g4a d1g4ae_ E:350-363,362-369,403-414
2f3t d2f3td1 D:16-29,96-103,171-189
1fml d1fmla_ A:75-89,242-247,254-267
1s3g d1s3ga1 A:12-25,108-115,200-214
2anc d2ance1 E:16-28,96-103,171-189
1hy3 d1hy3b_ B:49-63,186-191,198-211
2anc d2ancb1 B:16-28,96-103,171-189
1vkj d1vkjc_ C:70-82,145-150,227-240
1hy3 d1hy3a_ A:49-63,186-191,198-211
1vkj d1vkjb_ B:70-82,144-150,227-240
1g3m d1g3ma_ A:49-63,186-191,198-211
1q1q d1q1qa_ A:57-71,125-131,201-214
1uf9 d1uf9a_ A:20-32,126-133,178-194
2anc d2ancf1 F:16-28,96-103,171-189
1bo6 d1bo6b_ B:50-64,187-192,199-212
1uf9 d1uf9b_ B:20-32,126-133,178-194
1dek d1deka_ A:12-26,190-197,226-241
2anc d2ancc1 C:16-28,96-103,171-189
1aqu d1aqub_ B:50-64,123-129,199-212
1s96 d1s96a_ A:16-28,97-103,171-189
1bo6 d1bo6a_ A:50-64,187-192,199-212
1ls6 d1ls6a_ A:50-64,187-192,199-212
1ufq d1ufqb_ B:32-45,55-61,214-230
1vkj d1vkja_ A:70-82,145-150,227-240
1t8u d1t8ua_ A:164-176,236-242,318-331
1aqy d1aqyb_ B:50-64,123-129,199-212
2an9 d2an9a1 A:16-29,96-103,171-189
1g4b d1g4bl_ L:350-363,363-369,403-414
1g3m d1g3mb_ B:49-63,186-191,198-211
1g4b d1g4bf_ F:350-363,363-369,403-414
1q22 d1q22a_ A:72-86,140-146,216-229
1uf9 d1uf9c_ C:20-32,126-133,178-194
1e9e d1e9ea_ A:18-34,90-97,183-202
2anb d2anba1 A:16-29,96-103,171-189
1aqu d1aqua_ A:50-64,123-129,199-212
2d06 d2d06a1 A:50-64,187-192,199-212
2a3r d2a3ra1 A:50-64,187-192,199-212
2a3r d2a3rb1 B:50-64,187-192,199-212
1e9d d1e9da_ A:18-34,90-97,183-202
1s96 d1s96b_ B:16-28,97-103,171-189
1ht2 d1ht2h_ H:350-363,363-369,403-414
1e9b d1e9ba_ A:18-34,90-97,183-202
1tex d1texa_ A:16-29,136-142,217-230
1hqy d1hqyf_ F:350-363,362-369,403-414
2f3r d2f3ra1 A:16-29,96-103,171-189
1e9c d1e9ca_ A:18-34,90-97,183-202
2an9 d2an9b1 B:16-29,96-103,171-189
1nn3 d1nn3a_ A:18-34,90-97,183-202
1nmy d1nmya_ A:18-34,90-97,183-202
1ht2 d1ht2f_ F:350-363,362-369,403-414
1nn1 d1nn1a_ A:18-34,90-97,183-202
1vkj d1vkjb_ B:70-82,215-220,227-240
1t8t d1t8ta_ A:164-176,236-243,318-331
1e99 d1e99a_ A:18-34,90-97,183-202
2d06 d2d06b1 B:50-64,187-192,199-212
1t8u d1t8ub_ B:164-176,236-242,318-331
1del d1dela_ A:13-26,190-197,226-241
1del d1delb_ B:13-25,190-197,226-241
1nmx d1nmxa_ A:18-34,90-97,183-202
1ufq d1ufqa_ A:32-45,55-61,214-230
1t8t d1t8tb_ B:164-176,236-242,318-331
1zin d1zina1 A:12-25,108-115,200-217
1dek d1dekb_ B:13-25,190-198,226-241
1ufq d1ufqd_ D:32-45,55-61,214-230
1zip d1zipa1 A:12-25,108-115,200-217
1vkj d1vkjc_ C:70-82,215-220,227-240
1t8u d1t8ua_ A:164-176,306-311,318-331
1zio d1zioa1 A:12-25,108-115,200-217
1do0 d1do0d_ D:350-363,363-369,403-414
1do0 d1do0f_ F:350-363,363-369,403-414
2f3r d2f3rb1 B:16-29,96-103,171-189
1ofi d1ofic_ C:351-364,363-370,404-415
1t8t d1t8ta_ A:164-176,306-312,318-331
1aqy d1aqyb_ B:50-64,187-192,199-212
1uky d1ukya_ A:28-41,122-130,188-204
1ufq d1ufqc_ C:32-45,55-61,214-230
1t8t d1t8tb_ B:164-176,306-311,318-331
1ake d1akeb1 B:12-25,104-111,201-214
1g41 d1g41a_ A:351-364,364-370,404-415
1t8u d1t8ub_ B:164-176,306-311,318-331
1ofh d1ofhc_ C:351-364,364-370,404-415
2ocp d2ocpe1 E:50-63,187-194,259-277
2ocp d2ocpg1 G:50-63,187-194,259-277
2ocp d2ocpd1 D:50-63,187-194,259-277
2ocp d2ocpb1 B:50-63,187-194,259-277
1aqy d1aqya_ A:50-64,187-192,199-212
2ocp d2ocpa1 A:50-63,187-194,259-277
2ocp d2ocph1 H:50-63,187-194,259-277
2ocp d2ocpc1 C:50-63,187-194,259-277
2ocp d2ocpf1 F:50-63,187-194,259-277
1g3i d1g3if_ F:351-364,364-370,404-415
1kyi d1kyie_ E:351-364,364-370,404-415
1q20 d1q20a_ A:72-86,139-146,216-229
1aqu d1aqub_ B:50-64,187-192,199-212
1do0 d1do0a_ A:350-363,363-369,403-414
1vkj d1vkja_ A:70-82,215-220,227-240
1kyi d1kyif_ F:351-364,364-370,404-415
1g3i d1g3ib_ B:351-364,364-370,404-415
1ofh d1ofhb_ B:351-364,364-370,404-415
1g3i d1g3ie_ E:351-364,364-370,404-415
1kyi d1kyic_ C:351-364,364-370,404-415
1q1z d1q1za_ A:72-86,139-146,216-229
1kyi d1kyib_ B:351-364,364-370,404-415
1xrj d1xrja1 A:32-45,55-61,214-230
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1upt d1upta_ A:29-40,119-127,164-180
1m1y d1m1yg_ G:14-30,145-152,234-250
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1yr8 d1yr8a1 A:12-28,96-103,228-244
1mr3 d1mr3f_ F:29-38,119-127,164-177
1nrj d1nrjb_ B:50-61,145-155,233-244
2j59 d2j59c1 C:29-40,119-127,164-180
2f7s d2f7sa1 A:21-31,93-101,168-189
1u81 d1u81a_ A:29-38,120-125,163-181
2eqb d2eqba1 A:32-42,94-101,166-187
1t3l d1t3la2 A:240-259,384-388,391-412
2j59 d2j59a1 A:29-40,119-127,164-180
1vyv d1vyva2 A:231-250,375-379,382-402
1wb1 d1wb1c4 C:17-26,84-92,161-176
2gao d2gaoa1 A:37-45,128-135,184-198
1yr8 d1yr8a1 A:12-28,158-166,228-244
2j59 d2j59e1 E:29-40,119-127,164-180
1rrf d1rrfa_ A:29-38,119-127,164-178
1vyv d1vyvb2 B:231-250,375-379,382-402
1m2o d1m2ob_ B:35-46,125-133,177-190
1rrg d1rrga_ A:29-38,119-127,164-181
1hur d1hura_ A:29-38,119-127,164-181
2b6h d2b6ha1 A:29-38,119-127,164-180
2b6h d2b6ha1 A:29-38,86-94,164-180
1vyt d1vyta2 A:190-209,334-338,341-361
1t0h d1t0hb_ B:239-258,384-388,391-412
1zj6 d1zj6a1 A:28-38,118-126,163-178
1f6b d1f6bb_ B:37-47,127-135,184-198
1vyu d1vyub2 B:190-209,334-338,341-361
1j2j d1j2ja_ A:29-40,119-127,164-180
1hur d1hurb_ B:29-38,86-94,164-181
2fmx d2fmxb1 B:37-47,127-135,184-197
1t0j d1t0jb_ B:239-258,384-388,391-412
1f6b d1f6ba_ A:37-47,127-135,184-198
2al7 d2al7a1 A:31-40,123-130,168-181
1aa9 d1aa9a_ A:15-26,110-117,149-171
2oxr d2oxra1 A:12-28,96-103,229-243
1jx2 d1jx2b_ B:3-18,61-70,275-295
1vyu d1vyua2 A:190-209,334-338,341-362
2fmx d2fmxa1 A:37-47,127-135,184-198
1zj6 d1zj6a1 A:28-38,85-93,163-178
1vyt d1vytb2 B:190-209,334-338,341-362
1hur d1hurb_ B:29-38,119-127,164-181
1zm3 d1zm3c2 C:159-168,216-221,271-291
2g0t d2g0ta1 A:26-36,108-113,195-202
1r8q d1r8qa_ A:29-39,86-94,164-180
1yzg d1yzga1 A:6-16,16-24,163-173
1r8q d1r8qa_ A:29-39,119-127,164-180
2g0t d2g0tb1 B:26-36,108-113,195-202
1re0 d1re0a_ A:29-39,86-94,164-179
2f7s d2f7sa1 A:21-31,126-134,168-189
2qm7 d2qm7b1 B:67-83,149-155,247-266
1g4b d1g4bk_ K:350-363,364-369,390-404
1g4b d1g4be_ E:350-363,364-369,390-404
1mky d1mkya1 A:13-23,83-91,152-168
1do0 d1do0f_ F:350-363,363-369,390-404
1re0 d1re0a_ A:29-39,119-127,164-179
1e94 d1e94f_ F:350-363,364-369,390-404
1do2 d1do2a_ A:350-363,363-369,390-404
1z06 d1z06a1 A:45-56,141-149,178-186
1do2 d1do2c_ C:350-363,363-369,390-404
1mky d1mkya1 A:13-23,112-119,152-168
1ht1 d1ht1f_ F:350-363,364-369,390-404
1yr6 d1yr6a1 A:12-28,96-103,229-244
2eqb d2eqba1 A:32-42,126-134,166-187
1ht1 d1ht1i_ I:350-363,364-369,390-404
1yrb d1yrba1 A:12-28,96-103,229-245
1g4b d1g4bf_ F:350-363,363-369,390-404
1g4b d1g4bl_ L:350-363,363-369,390-404
1g4b d1g4bk_ K:336-348,364-369,390-404
1g4b d1g4be_ E:336-348,364-369,390-404
1ofi d1ofia_ A:351-364,365-370,391-405
2eqb d2eqba1 A:32-42,66-77,166-187
1fuk d1fuka_ A:268-283,285-289,316-324
1do0 d1do0a_ A:350-363,363-369,390-404
1do0 d1do0d_ D:350-363,363-369,390-404
1yr9 d1yr9a1 A:12-28,96-103,229-244
1yra d1yraa1 A:12-28,96-103,229-246
1z3i d1z3ix1 X:390-398,400-409,590-603
1g3i d1g3ia_ A:351-364,364-370,391-405
1ofh d1ofhb_ B:351-364,364-370,391-405
1yrb d1yrbb1 B:12-28,96-103,229-246
1ht2 d1ht2h_ H:350-363,363-369,390-404
1yra d1yrab1 B:12-28,96-103,229-247
1g3i d1g3ib_ B:351-364,364-370,391-405
1g3i d1g3if_ F:351-364,364-370,391-405
1g3i d1g3id_ D:351-364,364-370,391-405
1g3i d1g3ic_ C:351-364,364-370,391-405
1ofi d1ofib_ B:351-364,364-370,391-405
1ofh d1ofhc_ C:351-364,364-370,391-405
1kyi d1kyia_ A:351-364,364-370,391-405
1kyi d1kyid_ D:351-364,364-370,391-405
1kyi d1kyib_ B:351-364,364-370,391-405
1kyi d1kyic_ C:351-364,364-370,391-405
1g41 d1g41a_ A:351-364,364-370,391-405
1g3i d1g3ie_ E:351-364,364-370,391-405
1kyi d1kyif_ F:351-364,364-370,391-405
1im2 d1im2a_ A:351-364,364-370,391-405
1kyi d1kyie_ E:351-364,364-370,391-405
1s5g d1s5ga2 A:471-504,584-590,683-695
1kk7 d1kk7a2 A:471-504,584-590,683-695
1s5g d1s5ga2 A:712-721,752-757,764-824
1sr6 d1sr6a2 A:712-721,752-757,764-824
28. d.68.2 EPT/RTPC-like
IF3-like beta-alpha-beta-alpha-beta(2); 2 layers; mixed sheet 1243, strand 4 is antiparallel to the rest
1rf4 d1rf4d_ D:232-246,247-258,416-427
1rf4 d1rf4a_ A:232-247,248-258,416-427
1rf4 d1rf4b_ B:232-247,247-258,416-427
1rf6 d1rf6a_ A:232-247,247-258,416-427
1rf6 d1rf6d_ D:232-246,247-258,416-427
1rf4 d1rf4c_ C:232-247,247-258,416-427
1q3g d1q3ga_ A:21-36,35-43,188-202
1q3g d1q3gw_ W:21-36,35-43,188-202
1uae d1uaea_ A:21-36,35-43,188-202
1q3g d1q3gi_ I:21-36,35-43,188-202
1ryw d1rywb_ B:21-36,35-43,188-202
1ryw d1rywh_ H:21-36,35-43,188-202
1q3g d1q3gg_ G:21-36,35-43,188-202
1q3g d1q3gl_ L:21-36,35-43,188-202
1q3g d1q3gd_ D:21-36,35-43,188-202
1q3g d1q3gc_ C:21-36,35-43,188-202
1q3g d1q3gh_ H:21-36,35-43,188-202
1ybg d1ybgc1 C:21-36,35-43,188-202
1ryw d1rywg_ G:21-36,35-43,188-202
1q3g d1q3gk_ K:21-36,35-43,188-202
1q3g d1q3ge_ E:21-36,35-43,188-202
1ryw d1rywa_ A:21-36,35-43,188-202
1ryw d1rywe_ E:21-36,35-43,188-202
1q3g d1q3gx_ X:21-36,35-43,188-202
1q3g d1q3gb_ B:21-36,35-43,188-202
1q3g d1q3gz_ Z:21-36,35-43,188-202
1ybg d1ybga1 A:21-36,35-43,188-202
1ryw d1rywc_ C:21-36,35-43,188-202
1q3g d1q3gj_ J:21-36,35-43,188-202
1q3g d1q3gy_ Y:21-36,35-43,188-202
1ryw d1rywf_ F:21-36,35-43,188-202
1q3g d1q3gf_ F:21-36,35-43,188-202
1ryw d1rywd_ D:21-36,35-43,188-202
1ejc d1ejca_ A:21-36,35-43,188-202
1ejd d1ejda_ A:21-36,35-43,188-202
1rf5 d1rf5a_ A:232-247,247-254,416-427
1naw d1nawa_ A:21-36,35-43,188-202
1dlg d1dlga_ A:21-36,35-43,188-202
1ybg d1ybgd1 D:21-36,35-43,188-202
1ejd d1ejdb_ B:21-36,35-43,188-202
1ybg d1ybgb1 B:21-36,35-43,188-202
1dlg d1dlgb_ B:21-36,35-43,188-202
1naw d1nawb_ B:21-36,35-43,188-202
1eyn d1eyna_ A:21-35,35-43,188-202
1rf6 d1rf6b_ B:232-247,247-258,416-427
1a2n d1a2na_ A:21-35,35-43,188-202
1rf6 d1rf6d_ D:122-133,133-138,166-180
1rf6 d1rf6a_ A:122-133,133-138,166-180
1rf6 d1rf6c_ C:232-247,247-258,416-427
1rf5 d1rf5d_ D:121-133,133-138,166-181
1x8t d1x8ta1 A:242-257,256-264,415-425
1x8r d1x8ra1 A:242-257,256-264,415-425
1qmi d1qmid2 D:15-31,33-38,307-322
1q36 d1q36a_ A:242-257,256-264,415-425
1qmi d1qmic2 C:15-31,33-38,307-322
1p89 d1p89a_ A:125-137,137-143,169-184
1rf5 d1rf5c_ C:121-133,133-138,166-180
1qmh d1qmha2 A:16-31,33-38,307-322
1qmh d1qmhb2 B:16-31,33-38,307-322
1eps d1epsa_ A:242-257,257-264,415-424
1rf5 d1rf5b_ B:232-247,247-258,414-427
1qmi d1qmia2 A:16-31,33-38,307-322
1g6t d1g6ta_ A:242-257,256-264,415-424
1qmi d1qmib2 B:16-31,33-38,307-322
2aa9 d2aa9a1 A:242-257,256-264,415-424
1mi4 d1mi4a_ A:242-257,256-264,415-424
2aay d2aaya1 A:242-257,256-264,415-424
1g6s d1g6sa_ A:242-257,256-264,415-424
2pq9 d2pq9a1 A:242-257,256-264,415-424
1rf5 d1rf5c_ C:232-247,247-258,414-427
1ejc d1ejca_ A:231-246,247-253,401-410
1ybg d1ybgc1 C:231-246,247-253,401-410
1ybg d1ybga1 A:231-246,247-253,401-410
1naw d1nawb_ B:231-246,247-253,401-410
1ybg d1ybgd1 D:231-246,247-253,401-410
1q3g d1q3gh_ H:231-246,247-253,401-410
1q3g d1q3ga_ A:231-246,247-253,401-410
1q3g d1q3gd_ D:231-246,247-253,401-410
1q3g d1q3gw_ W:231-246,247-253,401-410
1ybg d1ybgb1 B:231-246,247-253,401-410
1q3g d1q3gg_ G:231-246,247-253,401-410
1q3g d1q3gb_ B:231-246,247-253,401-410
1q3g d1q3gx_ X:231-246,247-253,401-410
1q3g d1q3gy_ Y:231-246,247-253,401-410
1q3g d1q3gc_ C:231-246,247-253,401-410
1q3g d1q3gf_ F:231-246,247-253,401-410
1q3g d1q3gi_ I:231-246,247-253,401-410
1q3g d1q3gj_ J:231-246,247-253,401-410
1q3g d1q3gz_ Z:231-246,247-253,401-410
1q3g d1q3gl_ L:231-246,247-253,401-410
1q3g d1q3ge_ E:231-246,247-253,401-410
1q3g d1q3gk_ K:231-246,247-253,401-410
1ryw d1rywd_ D:231-246,247-253,401-410
1ryw d1rywe_ E:231-246,247-253,401-410
1a2n d1a2na_ A:231-246,247-253,401-410
1ryw d1rywf_ F:231-246,247-253,401-410
1ryw d1rywa_ A:231-246,247-253,401-410
1ryw d1rywh_ H:231-246,247-253,401-410
1uae d1uaea_ A:231-246,247-253,401-410
1ejd d1ejdb_ B:231-246,246-253,401-410
1naw d1nawa_ A:231-246,246-253,401-410
1dlg d1dlga_ A:231-246,246-253,401-410
1dlg d1dlgb_ B:231-246,246-253,401-410
1ejd d1ejda_ A:231-246,246-253,401-410
1eyn d1eyna_ A:231-246,246-253,401-410
1ryw d1rywg_ G:231-246,246-253,401-410
1ryw d1rywb_ B:231-246,246-253,401-410
1ryw d1rywc_ C:231-246,246-253,401-410
1rf5 d1rf5d_ D:232-247,247-254,414-427
1p89 d1p89a_ A:25-35,35-43,197-212
1p88 d1p88a_ A:25-36,38-43,197-212
1g6t d1g6ta_ A:95-109,108-112,169-183
2pq9 d2pq9a1 A:95-109,108-112,169-183
29. c.23.15 Ribosomal protein S2 fold elaborated with additional structures !
Flavodoxin-like 3 layers, a/b/a; parallel beta-sheet of 5 strand, order 21345
2uua d2uuab1 B:74-89,160-166,207-227
2uuc d2uucb1 B:74-89,160-166,207-227
2uu9 d2uu9b1 B:74-89,160-166,207-227
2vqe d2vqeb1 B:74-89,160-166,207-227
2j02 d2j02b1 B:77-89,161-166,207-227
2j00 d2j00b1 B:77-89,161-166,207-227
2om7 d2om7n1 N:77-89,161-166,207-227
2uub d2uubb1 B:74-89,160-166,207-227
2qow d2qowb1 B:72-87,87-92,205-225
1hr0 d1hr0b_ B:74-89,160-166,207-227
1x18 d1x18e1 E:74-89,160-166,207-227
1j5e d1j5eb_ B:74-89,160-166,207-227
2uxc d2uxcb1 B:77-89,160-166,207-227
1xmq d1xmqb_ B:74-89,160-166,207-227
2qp0 d2qp0b1 B:75-88,87-93,205-224
1hnx d1hnxb_ B:74-89,160-166,207-227
1hnz d1hnzb_ B:74-89,160-166,207-227
1n33 d1n33b_ B:74-89,160-166,207-227
2hgr d2hgre1 E:77-89,160-166,207-227
1hnw d1hnwb_ B:74-89,160-166,207-227
1n32 d1n32b_ B:77-89,160-166,207-227
1fjg d1fjgb_ B:74-89,160-166,207-227
2hgp d2hgpe1 E:77-89,160-166,207-227
1n34 d1n34b_ B:74-89,160-166,207-227
1n36 d1n36b_ B:74-89,160-166,207-227
3d5a d3d5ab1 B:74-89,160-166,207-227
2gy9 d2gy9b1 B:75-87,158-164,205-225
3d5c d3d5cb1 B:74-89,160-166,207-227
2gyb d2gybb1 B:75-87,158-164,205-225
1yl4 d1yl4e1 E:77-89,161-166,207-227
1i96 d1i96b_ B:77-89,160-166,207-225
1i94 d1i94b_ B:77-89,160-166,207-225
2hgi d2hgie1 E:77-89,160-166,207-227
2uxb d2uxbb1 B:77-89,160-166,207-227
2vhp d2vhpb1 B:75-87,158-164,205-225
2uxd d2uxdb1 B:77-89,160-166,207-227
1i97 d1i97b_ B:74-89,160-166,207-225
2qoy d2qoyb1 B:72-86,158-164,205-225
2f4v d2f4vb1 B:77-89,160-166,207-227
2qow d2qowb1 B:72-87,158-164,205-225
2qp0 d2qp0b1 B:75-88,158-164,205-224
2vho d2vhob1 B:75-87,159-164,205-225
3df3 d3df3b1 B:78-88,87-93,205-225
2b9m d2b9mb1 B:77-89,160-166,207-227
2b64 d2b64b1 B:77-89,160-166,207-227
2b9o d2b9ob1 B:77-89,160-166,207-227
3df1 d3df1b1 B:78-88,87-93,205-225
2aw7 d2aw7b1 B:72-87,158-163,205-225
2qbf d2qbfb1 B:72-87,158-163,205-225
2qbd d2qbdb1 B:72-87,158-163,205-225
3df3 d3df3b1 B:78-88,158-164,205-225
3df1 d3df1b1 B:78-88,158-164,205-225
1vs7 d1vs7b1 B:72-87,158-163,205-225
2v46 d2v46b1 B:77-89,160-166,207-227
2v48 d2v48b1 B:77-89,160-166,207-227
2qbd d2qbdb1 B:72-87,88-93,205-225
2qbf d2qbfb1 B:72-87,88-93,205-225
2qbh d2qbhb1 B:75-87,88-93,205-225
2qbj d2qbjb1 B:75-87,88-93,205-225
2hhh d2hhhb1 B:74-89,160-165,207-227
2i2u d2i2ub1 B:77-84,158-163,205-219
1xmo d1xmob_ B:77-89,160-165,207-227
2vqf d2vqfb1 B:74-89,160-165,207-227
2qbb d2qbbb1 B:75-87,88-93,205-225
2qb9 d2qb9b1 B:75-87,88-93,205-225
2aw7 d2aw7b1 B:72-87,88-93,205-225
2z4k d2z4kb1 B:75-88,88-93,205-225
2z4m d2z4mb1 B:75-88,88-93,205-225
2qbh d2qbhb1 B:75-87,158-163,205-225
2qbj d2qbjb1 B:75-87,158-163,205-225
1vs7 d1vs7b1 B:72-87,88-93,205-225
1xnq d1xnqb_ B:77-89,160-165,207-227
2qal d2qalb1 B:75-88,88-93,205-225
2qan d2qanb1 B:75-88,88-93,205-225
2qb9 d2qb9b1 B:75-87,158-163,205-225
1xnr d1xnrb_ B:77-89,160-165,207-227
2qbb d2qbbb1 B:75-87,158-163,205-225
2qoy d2qoyb1 B:72-86,88-93,205-225
1i95 d1i95b_ B:77-89,160-165,207-225
3d5a d3d5ab1 B:74-89,183-189,207-227
3d5c d3d5cb1 B:74-89,183-189,207-227
1hnx d1hnxb_ B:74-89,90-95,207-227
1hr0 d1hr0b_ B:74-89,90-95,207-227
2avy d2avyb1 B:72-87,158-164,205-225
2i2p d2i2pb1 B:75-87,88-93,205-225
1n33 d1n33b_ B:74-89,90-94,207-227
2hhh d2hhhb1 B:74-89,183-189,207-227
2vho d2vhob1 B:75-87,88-93,205-225
2ow8 d2ow8c1 C:77-89,160-166,207-227
2z4m d2z4mb1 B:75-88,158-163,205-225
2z4k d2z4kb1 B:75-88,158-163,205-225
2i2p d2i2pb1 B:75-87,158-163,205-225
2qan d2qanb1 B:75-88,158-163,205-225
1vi5 d1vi5d_ D:76-91,116-121,163-183
2qal d2qalb1 B:75-88,158-163,205-225
1vi6 d1vi6b_ B:76-91,116-121,163-183
1vi6 d1vi6a_ A:76-91,116-121,163-183
2avy d2avyb1 B:72-87,89-93,205-225
1vi6 d1vi6c_ C:76-91,116-121,163-183
1vs5 d1vs5b1 B:72-87,89-93,205-225
1vi6 d1vi6d_ D:76-91,116-121,163-183
1vi5 d1vi5b_ B:76-91,116-121,163-183
1vs5 d1vs5b1 B:72-87,158-163,205-225
1vi5 d1vi5a_ A:76-91,116-121,163-183
1vi5 d1vi5c_ C:76-91,116-121,163-183
1vi6 d1vi6c_ C:76-91,138-145,163-183
1vi5 d1vi5a_ A:76-91,138-145,163-183
2i2u d2i2ub1 B:77-84,180-185,205-219
2qou d2qoub1 B:72-81,158-163,205-225
30. c.47.1 Thioredoxin-like
Thioredoxin fold core: 3 layers, a/b/a; mixed beta-sheet of 4 strands, order 4312; strand 3 is antiparallel to the rest
1nhy d1nhya2 A:11-25,27-32,62-75
1psq d1psqa_ A:55-73,74-82,152-163
1bx9 d1bx9a2 A:10-24,60-65,65-78
1syr d1syrk_ K:38-56,58-64,99-111
1xw9 d1xw9b_ B:32-50,52-59,94-106
1syr d1syrd_ D:38-56,58-65,99-111
1gnw d1gnwa2 A:11-25,61-66,66-79
1h75 d1h75a_ A:11-25,58-63,65-73
1syr d1syrb_ B:38-56,58-64,99-111
1xw9 d1xw9d_ D:32-50,52-59,94-106
1axd d1axdb2 B:11-25,27-32,66-80
1bye d1byec2 C:11-25,27-32,66-80
1syr d1syra_ A:38-56,58-65,99-111
1xw9 d1xw9a_ A:32-50,52-60,94-106
2hxk d2hxkc1 C:32-50,52-58,93-105
1xwb d1xwba_ A:38-50,52-59,94-106
1xwc d1xwca_ A:32-50,52-59,94-106
1syr d1syre_ E:38-56,58-65,99-111
1r5a d1r5aa2 A:11-25,61-66,66-79
1bye d1byed2 D:11-25,27-32,66-80
1xwa d1xwab_ B:32-50,52-59,94-106
1xwa d1xwac_ C:38-50,52-59,94-106
1bye d1byea2 A:11-25,61-66,66-80
1xw9 d1xw9c_ C:38-50,52-60,94-106
2ifq d2ifqc1 C:32-50,52-59,93-105
1xwb d1xwbd_ D:38-50,52-59,94-106
1z3e d1z3ea1 A:10-24,99-104,106-115
1xwb d1xwbc_ C:38-50,52-59,94-106
1xwb d1xwbb_ B:38-50,52-60,94-106
1xwa d1xwad_ D:38-50,52-60,94-106
1grx d1grxa_ A:11-29,66-71,71-85
1xwa d1xwaa_ A:38-50,52-59,94-106
1bye d1byeb2 B:11-25,27-32,66-80
1axd d1axda2 A:11-25,61-66,66-80
1m2a d1m2aa_ A:26-42,47-54,81-93
1jlw d1jlwb2 B:9-23,60-65,65-79
1e6b d1e6ba2 A:17-31,67-72,72-85
1syr d1syri_ I:44-56,58-64,99-111
1ep8 d1ep8b_ B:36-54,57-63,98-112
1syr d1syrg_ G:44-56,58-64,99-111
1m2a d1m2ab_ B:26-42,47-54,81-93
1syr d1syrj_ J:44-56,58-64,99-111
1gsb d1gsbd2 D:11-24,66-71,71-84
1gsb d1gsbb2 B:11-24,66-71,71-84
1gsc d1gscb2 B:11-24,66-71,71-84
1gsc d1gscd2 D:11-24,66-71,71-84
1hyu d1hyua4 A:129-147,178-184,187-197
1cqg d1cqga_ A:32-50,52-57,93-105
1nhy d1nhya2 A:11-25,57-62,62-75
1syr d1syrc_ C:44-56,58-64,99-111
1wpi d1wpia1 A:24-38,43-48,121-130
1gwc d1gwca2 A:15-29,63-68,68-81
1v2a d1v2ab2 B:9-23,58-63,63-76
2b5e d2b5ea1 A:412-427,429-436,472-484
1bye d1byec2 C:11-25,61-66,66-80
1syr d1syrf_ F:44-56,58-64,99-111
1f37 d1f37a_ A:26-42,47-54,78-93
1m2b d1m2bb_ B:26-42,47-54,81-93
1syr d1syrh_ H:38-56,59-64,99-111
1syr d1syrl_ L:44-56,58-65,99-111
6gsv d6gsvb2 B:10-24,66-71,71-84
1v2a d1v2aa2 A:9-23,58-63,63-76
1su9 d1su9b_ B:73-91,94-103,160-172
2h1d d2h1da1 A:74-92,95-104,161-173
1eem d1eema2 A:32-46,80-85,85-98
1mtc d1mtcb2 B:10-24,66-71,71-84
1k0a d1k0ab2 B:122-136,175-180,180-197
1k0c d1k0cd2 D:122-136,175-180,180-197
1v2a d1v2ad2 D:9-23,58-63,63-76
1axd d1axda2 A:11-25,27-33,66-80
2f9s d2f9sa1 A:74-92,95-104,161-173
1jzr d1jzrc2 C:122-136,175-180,180-197
1k0d d1k0dc2 C:122-136,175-180,180-197
6gst d6gsta2 A:10-24,66-71,71-84
1st9 d1st9a_ A:73-91,94-103,160-172
1bye d1byeb2 B:11-25,61-66,66-80
2h1d d2h1db1 B:74-92,95-104,161-173
1k0d d1k0da2 A:122-136,175-180,180-197
1g7o d1g7oa2 A:9-23,56-61,61-74
2hsh d2hsha1 A:32-50,52-59,93-105
1fhe d1fhea2 A:11-24,61-66,66-79
5fwg d5fwgb2 B:10-24,66-71,71-84
1hnc d1hncb2 B:11-24,66-71,71-84
1g6y d1g6ya2 A:122-136,175-180,180-197
2ab6 d2ab6a2 A:10-24,66-71,71-84
1k0b d1k0bc2 C:122-136,175-180,180-197
3gtu d3gtua2 A:10-24,66-71,71-84
1k0d d1k0db2 B:122-136,175-180,180-197
1k0a d1k0aa2 A:122-136,175-180,180-197
1gum d1gume2 E:14-27,62-67,67-80
1gum d1gumd2 D:14-27,62-67,67-80
1gum d1gumf2 F:14-27,62-67,67-80
1gum d1guma2 A:14-27,62-67,67-80
1gum d1gumb2 B:14-27,62-67,67-80
1gum d1gumg2 G:14-27,62-67,67-80
1gum d1gumc2 C:14-27,62-67,67-80
1gum d1gumh2 H:14-27,62-67,67-80
1su9 d1su9a_ A:73-91,94-103,160-172
1k0c d1k0ca2 A:122-136,175-180,180-197
1b48 d1b48b2 B:14-27,62-67,67-80
1v2a d1v2ac2 C:9-23,58-63,63-76
1m2d d1m2db_ B:26-42,47-54,81-93
2ab6 d2ab6c2 C:10-24,66-71,71-84
1k0d d1k0dd2 D:122-136,175-180,180-197
1tof d1tofa_ A:36-54,56-64,98-112
1bye d1byea2 A:11-25,27-33,66-80
2fno d2fnoa2 A:16-30,67-72,73-86
1erw d1erwa_ A:32-50,52-58,93-105
1gul d1gula2 A:13-27,62-67,67-80
1gul d1gulf2 F:13-27,62-67,67-80
1gul d1gulh2 H:13-27,62-67,67-80
1gul d1gulb2 B:13-27,62-67,67-80
1gul d1gulc2 C:13-27,62-67,67-80
1gul d1guld2 D:13-27,62-67,67-80
1gul d1gulg2 G:13-27,62-67,67-80
1gul d1gule2 E:13-27,62-67,67-80
3gtu d3gtuc2 C:10-24,66-71,71-84
3gtu d3gtud2 D:14-28,70-75,75-88
4gtu d4gtuh2 H:10-24,66-71,71-84
1n2a d1n2ab2 B:9-22,60-65,65-78
2iiy d2iiya1 A:32-50,52-59,93-105
1gsu d1gsua2 A:10-24,66-71,71-84
1ykc d1ykcb2 B:10-24,66-71,71-84
1k0c d1k0cb2 B:122-136,175-180,180-197
1c72 d1c72a2 A:10-24,66-71,71-84
1eru d1erua_ A:32-50,52-58,93-105
1jzw d1jzwa_ A:12-26,101-106,108-116
4gtu d4gtuf2 F:10-24,66-71,71-84
1gnw d1gnwb2 B:11-25,61-65,66-79
1ml6 d1ml6a2 A:13-26,61-66,66-79
2f9s d2f9sb1 B:74-92,95-104,161-173
4gtu d4gtud2 D:10-24,66-71,71-84
1j08 d1j08b2 B:99-117,135-142,146-167
2a4h d2a4ha1 A:87-97,104-109,136-149
1k0c d1k0cc2 C:122-136,175-180,180-197
1j9b d1j9ba_ A:12-26,101-106,108-116
1c72 d1c72c2 C:10-24,66-71,71-84
1i9d d1i9da_ A:12-26,101-106,108-116
1gtu d1gtub2 B:10-24,66-71,71-84
1ert d1erta_ A:32-50,52-58,93-105
1yj6 d1yj6b2 B:10-24,66-71,71-84
1fw1 d1fw1a2 A:14-28,66-70,71-84
2hxk d2hxka1 A:32-50,52-59,93-105
1lu4 d1lu4a_ A:1036-1054,1056-1063,1123-1134
1yj6 d1yj6a2 A:10-24,66-71,71-84
1xwk d1xwka2 A:10-24,66-71,71-84
1zyp d1zypa2 A:129-147,178-184,187-196
1st9 d1st9b_ B:73-91,94-103,160-172
1bye d1byed2 D:11-25,61-65,66-80
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1usb d1usbb2 B:13-27,62-67,67-80
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1x9s d1x9sb_ B:32-50,53-59,95-107
1mek d1meka_ A:42-57,60-67,104-117
1zyq d1zyqb1 B:32-50,53-59,95-107
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1zyp d1zypa1 A:30-48,49-56,83-99
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1kng d1knga_ A:98-109,111-119,177-193
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2e2g d2e2gj1 J:47-61,68-77,150-168
2e2g d2e2ga1 A:47-61,68-77,150-168
2nvl d2nvli1 I:47-61,68-77,150-168
2nvl d2nvlb1 B:47-61,68-77,150-168
2nvl d2nvlj1 J:47-61,68-77,150-168
2nvl d2nvlc1 C:47-61,68-77,150-168
2nvl d2nvlg1 G:47-61,68-77,150-168
2nvl d2nvle1 E:47-61,68-77,150-168
31. c.23.5 Flavoproteins
Flavodoxin-like 3 layers, a/b/a; parallel beta-sheet of 5 strand, order 21345
1ahn d1ahna_ A:13-27,81-89,149-169
1tll d1tlla2 A:764-782,800-808,922-943
1ag9 d1ag9a_ A:13-27,81-89,149-169
1tll d1tllb2 B:2764-2781,2800-2808,2922-2943
1obv d1obva_ A:1013-1027,1081-1089,1148-1168
1ykg d1ykga1 A:72-90,109-117,188-208
1rli d1rlic_ C:14-25,113-122,164-175
1obv d1obva_ A:1013-1027,1140-1144,1148-1168
1dx9 d1dx9c_ C:13-27,81-89,148-168
1dx9 d1dx9b_ B:13-27,81-89,148-168
1dx9 d1dx9d_ D:13-27,81-89,148-168
1dx9 d1dx9b_ B:13-27,48-56,148-168
1dx9 d1dx9c_ C:13-27,140-144,148-168
1aku d1akua_ A:12-30,86-94,133-148
1ykg d1ykga1 A:72-90,145-154,188-208
1dx9 d1dx9b_ B:13-27,140-144,148-168
1dx9 d1dx9d_ D:13-27,140-144,148-168
1dx9 d1dx9d_ D:13-27,48-56,148-168
1fue d1fuea_ A:12-27,136-140,144-160
1tll d1tllb2 B:2764-2781,2877-2886,2922-2943
1dx9 d1dx9c_ C:13-27,48-56,148-168
2gsw d2gswa1 A:14-28,66-73,149-170
2gsw d2gswd1 D:14-28,66-73,149-170
2gsw d2gswc1 C:14-28,66-73,149-170
2gsw d2gswb1 B:14-28,66-73,149-170
1rli d1rlia_ A:14-25,113-122,164-176
1tll d1tlla2 A:764-782,877-886,922-943
1x77 d1x77a_ A:20-33,74-81,164-180
1akw d1akwa_ A:13-30,85-94,133-148
5fx2 d5fx2a_ A:13-30,86-95,133-148
1tik d1tika_ A:18-36,135-144,182-204
1rli d1rlid_ D:14-25,113-122,164-176
1rli d1rlib_ B:14-25,113-122,164-176
1j9e d1j9ea_ A:12-30,86-95,133-148
1akv d1akva_ A:12-30,86-95,133-148
1rli d1rlic_ C:14-25,145-155,164-175
2oys d2oysb1 B:15-33,117-127,158-179
1c7e d1c7ea_ A:13-30,85-95,133-148
1sqs d1sqsa_ A:15-33,117-126,158-179
1sqs d1sqsb_ B:15-33,117-126,160-179
2fx2 d2fx2a_ A:12-30,86-95,133-148
2oys d2oysa1 A:15-33,117-127,158-179
1ag9 d1ag9b_ B:12-27,81-89,149-169
1c7e d1c7eb_ B:12-30,85-95,133-148
1xyv d1xyva_ A:13-30,85-95,133-148
1nni d1nni1_ 1:14-28,65-73,149-171
4fx2 d4fx2a_ A:13-30,85-95,133-148
2z9b d2z9ba1 A:15-33,132-141,179-200
2d5i d2d5ia1 A:15-33,132-141,179-200
2z9d d2z9da1 A:15-33,132-141,179-200
1xt6 d1xt6a_ A:13-30,85-95,133-148
2fz5 d2fz5a1 A:10-28,48-56,124-137
1akw d1akwa_ A:13-30,123-127,133-148
1bu5 d1bu5a_ A:12-30,51-58,133-148
3fx2 d3fx2a_ A:13-30,85-95,133-148
1x77 d1x77b_ B:20-33,74-81,164-180
1rtt d1rtta_ A:20-33,74-80,164-180
1i1o d1i1oa_ A:13-30,85-95,133-148
2fcr d2fcra_ A:11-25,85-93,155-172
1yob d1yoba1 A:11-25,148-152,156-172
1bu5 d1bu5b_ B:12-30,51-58,133-148
1yob d1yobb1 B:11-25,148-152,156-172
1rli d1rlia_ A:14-25,145-156,164-176
2z9d d2z9db1 B:15-33,132-141,179-200
1rli d1rlib_ B:14-25,145-155,164-176
2z9c d2z9ca1 A:15-33,132-141,179-200
1akt d1akta_ A:12-30,85-95,133-148
3nll d3nlla_ A:10-27,48-55,121-138
1bu5 d1bu5b_ B:12-30,85-95,133-148
1amo d1amoa2 A:89-106,131-139,211-232
1amo d1amob2 B:89-106,131-139,211-232
1v4b d1v4ba1 A:15-33,132-141,179-200
2z98 d2z98a1 A:15-33,132-141,179-200
2oys d2oysa1 A:15-33,81-89,158-179
1c7f d1c7fb_ B:12-30,85-95,133-148
1j8q d1j8qa_ A:12-30,85-95,133-148
1bu5 d1bu5a_ A:12-30,85-95,133-148
1aku d1akua_ A:12-30,123-127,133-148
5nul d5nula_ A:9-27,48-55,121-138
1rlj d1rlja_ A:11-21,37-44,104-123
1c7f d1c7fa_ A:12-30,85-95,133-148
4nll d4nlla_ A:10-27,48-55,121-138
5ull d5ulla_ A:9-27,48-55,121-138
2fax d2faxa_ A:9-27,48-55,121-138
1fln d1flna_ A:9-27,48-55,121-138
1c7e d1c7eb_ B:12-30,123-128,133-148
2flv d2flva_ A:9-27,48-55,121-138
1bu5 d1bu5a_ A:12-30,123-128,133-148
1x77 d1x77a_ A:20-33,108-118,164-180
2fdx d2fdxa_ A:9-27,48-55,121-138
2fox d2foxa_ A:9-27,48-55,121-138
1j9z d1j9za2 A:89-106,131-139,211-232
1akr d1akra_ A:12-30,85-95,133-148
1d04 d1d04a_ A:11-26,140-144,148-168
1f4p d1f4pa_ A:12-30,85-95,133-148
1fla d1flaa_ A:9-27,48-55,121-138
1czn d1czna_ A:11-26,140-144,148-168
1xyy d1xyya_ A:12-30,85-95,133-148
1wsw d1wswa_ A:12-30,85-95,133-148
1rli d1rlid_ D:14-25,145-155,164-176
6nul d6nula_ A:9-27,48-55,121-138
1j9g d1j9ga_ A:12-30,85-95,133-148
1c7f d1c7fb_ B:12-30,123-128,133-148
1ofv d1ofva_ A:11-26,140-144,148-168
1c7f d1c7fa_ A:12-30,123-128,133-148
1fld d1flda_ A:9-27,48-55,121-138
1j9g d1j9ga_ A:12-30,123-128,133-148
1f4p d1f4pa_ A:12-30,123-128,133-148
2fvx d2fvxa_ A:9-27,48-55,121-138
1j9e d1j9ea_ A:12-30,123-128,133-148
1t5b d1t5bb_ B:16-34,133-142,180-201
1akq d1akqa_ A:12-30,85-95,133-148
1akv d1akva_ A:12-30,123-128,133-148
1ahn d1ahna_ A:13-27,48-58,149-169
1akt d1akta_ A:12-30,123-128,133-148
1j9z d1j9za2 A:89-106,166-175,211-232
1yob d1yoba1 A:11-25,48-56,156-172
1azl d1azla_ A:12-30,85-95,133-148
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1t5b d1t5ba_ A:16-34,133-142,180-201
1ja1 d1ja1a2 A:88-106,166-175,211-232
1czo d1czoa_ A:11-26,140-144,148-168
1rtt d1rtta_ A:20-33,108-118,164-180
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1xyy d1xyya_ A:12-30,123-128,133-148
1akr d1akra_ A:12-30,123-128,133-148
1wsb d1wsba_ A:12-30,85-95,133-148
1vme d1vmea1 A:264-282,340-348,382-398
2fx2 d2fx2a_ A:12-30,123-128,133-148
1wsb d1wsba_ A:12-30,123-128,133-148
1yob d1yobb1 B:11-25,48-56,156-172
1czu d1czua_ A:11-26,140-144,148-168
1czr d1czra_ A:11-26,140-144,148-168
1czk d1czka_ A:11-26,140-144,148-168
1czl d1czla_ A:11-26,140-144,148-168
1c7e d1c7ea_ A:13-30,123-128,133-148
1d03 d1d03a_ A:11-26,140-144,148-168
1fx1 d1fx1a_ A:12-30,85-95,133-148
1azl d1azla_ A:12-30,123-128,133-148
1ag9 d1ag9a_ A:13-27,48-58,149-169
1ja0 d1ja0a2 A:88-106,166-175,211-232
1amo d1amoa2 A:89-106,166-175,211-232
1amo d1amob2 B:89-106,166-175,211-232
1obv d1obva_ A:1013-1027,1048-1058,1148-1168
1x77 d1x77b_ B:20-33,107-118,164-180
2fcr d2fcra_ A:11-25,47-55,155-172
1czh d1czha_ A:11-26,140-144,148-168
1sqs d1sqsb_ B:15-33,146-156,160-179
1xt6 d1xt6a_ A:13-30,123-128,133-148
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1rli d1rlic_ C:14-25,70-78,164-175
5fx2 d5fx2a_ A:13-30,123-128,133-148
4fx2 d4fx2a_ A:13-30,123-128,133-148
2oys d2oysb1 B:15-33,146-157,158-179
1xyv d1xyva_ A:13-30,123-128,133-148
1bvy d1bvyf_ F:490-508,563-571,608-629
3fx2 d3fx2a_ A:13-30,123-128,133-148
1sqs d1sqsa_ A:15-33,146-156,158-179
2oys d2oysa1 A:15-33,146-157,158-179
1ja1 d1ja1b2 B:88-106,166-175,211-232
2fz5 d2fz5a1 A:10-28,30-36,124-137
4nll d4nlla_ A:10-27,114-119,121-138
1bvy d1bvyf_ F:490-508,527-534,608-629
2gsw d2gswa1 A:14-28,133-138,149-170
1qhe d1qhea_ A:12-27,140-144,148-168
2gsw d2gswb1 B:14-28,133-138,149-170
2gsw d2gswc1 C:14-28,133-138,149-170
2gsw d2gswd1 D:14-28,133-138,149-170
3nll d3nlla_ A:10-27,114-119,121-138
5nll d5nlla_ A:9-27,48-55,124-138
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2fax d2faxa_ A:9-27,114-119,121-138
2fdx d2fdxa_ A:9-27,114-119,121-138
1ftg d1ftga_ A:12-27,48-56,148-168
1fx1 d1fx1a_ A:12-30,123-128,133-148
5ull d5ulla_ A:9-27,114-119,121-138
6nul d6nula_ A:9-27,114-119,121-138
2flv d2flva_ A:9-27,114-119,121-138
1ftg d1ftga_ A:12-27,140-144,148-168
4nul d4nula_ A:9-27,48-55,124-138
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1zx1 d1zx1b1 B:16-33,140-149,196-214
1qhe d1qhea_ A:12-27,48-56,148-168
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2qx9 d2qx9b1 B:16-33,140-149,196-217
2fox d2foxa_ A:9-27,114-119,121-138
1j9z d1j9zb2 B:88-106,166-175,211-232
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2fz5 d2fz5a1 A:10-28,80-90,124-137
1ja1 d1ja1a2 A:88-106,131-138,211-232
1ja0 d1ja0a2 A:88-106,131-139,211-232
2qx9 d2qx9b1 B:16-33,95-103,196-217
1vme d1vmea1 A:264-282,309-316,382-398
2qx9 d2qx9b1 B:16-33,181-191,196-217
1rli d1rlid_ D:14-25,70-78,164-176
1zx1 d1zx1a1 A:16-33,140-149,196-214
1b1c d1b1ca_ A:28-46,106-115,151-172
1yob d1yobb1 B:11-25,89-97,156-172
1ja1 d1ja1b2 B:88-106,131-139,211-232
1obo d1obob_ B:2012-2027,2048-2056,2148-2168
2gsw d2gswa1 A:14-28,97-106,149-170
1flv d1flva_ A:12-27,140-144,148-168
2qr2 d2qr2a_ A:16-33,140-149,196-214
1kbo d1kboa_ A:16-33,140-149,196-214
1nni d1nni1_ 1:14-28,133-138,149-171
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1kbo d1kbod_ D:16-33,140-149,196-214
1dx9 d1dx9a_ A:12-27,140-144,148-168
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1dx9 d1dx9a_ A:12-27,48-56,148-168
1yob d1yoba1 A:11-25,89-97,156-172
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1d04 d1d04a_ A:11-26,81-89,148-168
1qr2 d1qr2b_ B:16-33,140-149,196-214
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1zwl d1zwla1 A:14-32,33-40,175-197
1yrh d1yrhh1 H:15-33,112-123,177-203
1ydg d1ydgc_ C:15-33,112-123,177-203
1zwl d1zwla1 A:14-32,105-117,175-197
1yrh d1yrhd1 D:15-33,78-88,177-203
1yrh d1yrhf1 F:15-33,112-123,177-203
2a5l d2a5la1 A:14-32,105-116,175-198
2ark d2arkd1 D:12-30,84-95,144-168
1yrh d1yrhb1 B:15-33,112-123,177-203
1yrh d1yrhb1 B:15-33,78-88,177-203
1yrh d1yrhg1 G:15-33,78-88,177-203
1yrh d1yrhg1 G:15-33,112-123,177-203
1yrh d1yrhd1 D:15-33,112-123,177-203
1yrh d1yrhc1 C:15-33,34-41,177-203
1ydg d1ydge_ E:15-33,33-41,177-203
1ydg d1ydgf_ F:15-33,34-41,177-203
1ydg d1ydga_ A:15-33,34-41,177-203
1ydg d1ydgg_ G:15-33,34-41,177-203
1ydg d1ydgd_ D:15-33,34-41,177-203
1e5d d1e5da1 A:263-281,282-289,378-402
1ydg d1ydgb_ B:15-33,34-41,177-203
1yrh d1yrhh1 H:15-33,34-41,177-203
1ydg d1ydgh_ H:15-33,34-41,177-203
1e5d d1e5db1 B:263-281,282-289,378-402
1yrh d1yrha1 A:15-33,34-41,177-203
1ydg d1ydgc_ C:15-33,34-41,177-203
1yrh d1yrhb1 B:15-33,34-41,177-203
1t0i d1t0ia_ A:14-30,115-125,163-174
1yrh d1yrhd1 D:15-33,34-41,177-203
1yrh d1yrhg1 G:15-33,34-41,177-203
1yrh d1yrhf1 F:15-33,34-41,177-203
1t0i d1t0ia_ A:14-30,144-154,163-174
32. d.122.1 ATPase domain of HSP90 chaperone/DNA topoisomerase II/histidine kinase
ATPase domain of HSP90 chaperone/DNA topoisomerase II/histidine kinase 8-stranded mixed beta-sheet; 2 layers: alpha/beta
1bxd d1bxda_ A:300-314,318-324,333-353
2c2a d2c2aa2 A:328-341,349-356,366-385
1id0 d1id0a_ A:339-356,360-366,375-394
1ysr d1ysrb1 B:305-322,324-329,339-359
2ch4 d2ch4a2 A:358-377,379-386,399-416
1ys3 d1ys3b1 B:305-322,324-329,339-359
1ysr d1ysra1 A:305-322,324-329,339-359
1ys3 d1ys3a1 A:305-322,324-329,339-359
1ys3 d1ys3c1 C:305-322,324-329,339-359
1ysr d1ysrc1 C:305-322,324-329,339-359
1b3q d1b3qa3 A:357-377,379-386,399-416
1b3q d1b3qb3 B:357-377,379-386,399-416
1i5a d1i5ab_ B:357-377,379-386,399-416
1i58 d1i58a_ A:357-377,379-386,399-416
1i5d d1i5da_ A:357-377,379-386,399-416
1i5c d1i5ca_ A:357-377,379-386,399-416
1i5c d1i5cb_ B:357-377,379-386,399-416
1i5b d1i5ba_ A:357-377,379-386,399-416
1i5b d1i5bb_ B:357-377,379-386,399-416
1i59 d1i59a_ A:357-377,379-386,399-416
1i5a d1i5aa_ A:357-377,379-386,399-416
1i59 d1i59b_ B:357-377,379-386,395-416
1i58 d1i58b_ B:357-377,379-386,395-416
1r62 d1r62a_ A:198-214,217-225,234-254
2ch4 d2ch4b2 B:364-377,379-386,399-416
1gkx d1gkxa2 A:196-217,221-227,235-259
1gkz d1gkza2 A:196-217,221-227,235-259
1gjv d1gjva2 A:196-217,221-227,235-259
2pnr d2pnrb2 B:192-213,216-225,237-261
2pnr d2pnrf2 F:192-213,216-225,237-261
2pnr d2pnre2 E:192-213,216-225,237-261
2pnr d2pnra2 A:192-213,216-225,237-261
1jm6 d1jm6b2 B:1188-1209,1212-1221,1233-1257
1jm6 d1jm6a2 A:1188-1209,1212-1221,1233-1257
1y8o d1y8oa2 A:192-213,217-225,237-263
1y8n d1y8na2 A:192-213,217-225,237-263
2q8i d2q8ia2 A:192-213,217-225,237-263
33. e.8.1 DNA/RNA polymerases "palm" domain has a ferredoxin-like fold, related to that of an adenylyl cyclase domain !
DNA/RNA polymerases divided into morphological domains including "palm", "thumb" and "fingers"; the catalytic "palm" domain is conserved to all members
1s0v d1s0vd_ D:689-708,724-730,840-853
1h38 d1h38d_ D:689-708,724-730,840-853
2pi5 d2pi5a1 A:689-708,724-730,840-853
1aro d1arop_ P:689-708,724-730,840-853
1msw d1mswd_ D:689-709,724-730,840-855
1s0v d1s0va_ A:689-708,724-730,840-854
1h38 d1h38a_ A:689-708,724-730,840-854
1qln d1qlna_ A:689-709,724-730,840-854
1h38 d1h38b_ B:689-708,724-730,840-854
1cez d1ceza_ A:689-709,724-730,840-854
1h38 d1h38c_ C:689-708,724-730,840-854
1s0v d1s0vb_ B:689-708,724-730,840-854
1s0v d1s0vc_ C:689-708,724-730,840-854
4rnp d4rnpb_ B:689-708,724-730,840-854
4rnp d4rnpc_ C:689-708,724-730,840-854
4rnp d4rnpa_ A:689-708,724-730,840-854
1s77 d1s77d_ D:689-709,724-730,840-854
1s76 d1s76d_ D:689-709,724-730,840-854
2pi4 d2pi4a1 A:689-709,724-730,840-850
1s48 d1s48a_ A:538-554,580-585,586-596
1s49 d1s49a_ A:538-554,580-585,586-596
1s4f d1s4fa_ A:538-554,580-585,586-596
2alz d2alza2 A:202-214,216-221,222-234
2dpj d2dpja2 A:202-214,216-221,222-234
2fll d2flla2 A:202-214,216-221,222-234
2dpi d2dpia2 A:202-214,216-221,222-234
2fln d2flna2 A:202-214,216-221,222-234
1t3n d1t3nb2 B:622-634,636-641,642-654
1t3n d1t3na2 A:202-214,216-221,222-234
1s4f d1s4fb_ B:538-554,580-585,586-596
2flp d2flpa2 A:202-214,216-221,222-234
1zet d1zeta2 A:202-214,216-221,222-234
1s4f d1s4fc_ C:538-554,580-585,586-596
1s4f d1s4fd_ D:538-554,580-585,586-596
2v9w d2v9wa2 A:147-159,161-166,167-179
1s0v d1s0vb_ B:313-326,417-422,777-803
2r8k d2r8kb2 B:267-279,281-286,287-298
4rnp d4rnpb_ B:313-326,417-422,777-803
4rnp d4rnpa_ A:313-326,417-422,777-803
4rnp d4rnpc_ C:313-326,417-422,777-803
1s77 d1s77d_ D:313-326,417-422,777-803
1cez d1ceza_ A:313-326,417-422,777-803
2pi4 d2pi4a1 A:313-326,417-422,777-803
1msw d1mswd_ D:313-326,417-422,777-803
2r8k d2r8ka2 A:267-279,281-286,287-298
2r8j d2r8ja2 A:267-279,281-286,287-298
1qln d1qlna_ A:313-326,417-422,777-803
1s76 d1s76d_ D:313-326,417-422,777-803
1jih d1jiha2 A:267-279,281-286,287-298
1jih d1jihb2 B:267-279,281-286,287-298
1h38 d1h38c_ C:313-326,417-422,777-803
1s0v d1s0vc_ C:313-326,417-422,777-803
1h38 d1h38b_ B:313-326,417-422,777-803
1h38 d1h38d_ D:313-326,417-422,777-803
1h38 d1h38a_ A:313-326,417-422,777-803
1s0v d1s0va_ A:313-326,417-422,777-803
2c22 d2c22a2 A:147-159,161-166,167-178
1s97 d1s97c2 C:147-159,161-166,167-178
2au0 d2au0b2 B:1147-1159,1161-1166,1167-1178
1s97 d1s97a2 A:147-159,161-166,167-178
2j6s d2j6sa2 A:147-159,161-166,167-178
2c2d d2c2da2 A:147-159,161-166,167-178
2jeg d2jega2 A:147-159,161-166,167-178
2au0 d2au0a2 A:147-159,161-166,167-178
1rys d1rysb2 B:147-159,161-166,167-178
2va2 d2va2b2 B:147-159,161-166,167-178
1ryr d1ryra2 A:147-159,161-166,167-178
2c28 d2c28a2 A:147-159,161-166,167-178
1n48 d1n48a2 A:147-159,161-166,167-178
2asd d2asdb2 B:1147-1159,1161-1166,1167-1178
1rys d1rysa2 A:147-159,161-166,167-178
1jx4 d1jx4a2 A:147-159,161-166,167-178
2asj d2asjb2 B:1147-1159,1161-1166,1167-1178
2bqr d2bqra2 A:147-159,161-166,167-178
2r8i d2r8ia2 A:147-159,161-166,167-178
2asl d2aslb2 B:1147-1159,1161-1166,1167-1178
1s0o d1s0oa2 A:147-159,161-166,167-178
2jef d2jefa2 A:147-159,161-166,167-178
2asd d2asda2 A:147-159,161-166,167-178
1s10 d1s10a2 A:147-159,161-166,167-178
2r8j d2r8jb2 B:267-279,281-286,287-297
2atl d2atlb2 B:1147-1159,1161-1166,1167-1178
2bqu d2bqua2 A:147-159,161-166,167-178
2v9w d2v9wb2 B:147-159,161-166,167-178
2ago d2agoa2 A:147-159,161-166,167-178
2rdj d2rdja2 A:147-159,161-166,167-178
2ibk d2ibka2 A:147-159,161-166,167-178
1s97 d1s97b2 B:147-159,161-166,167-178
2j6u d2j6ua2 A:150-162,164-169,170-181
2c2r d2c2ra2 A:147-159,161-166,167-178
2agq d2agqa2 A:147-159,161-166,167-178
1s0m d1s0ma2 A:147-159,161-166,167-178
1s0o d1s0ob2 B:147-159,161-166,167-178
2uvu d2uvua2 A:147-159,161-166,167-178
2va3 d2va3a2 A:147-159,161-166,167-178
1kln d1klna2 A:519-534,820-825,845-871
2asj d2asja2 A:147-159,161-166,167-178
1n56 d1n56a2 A:147-159,161-166,167-178
2va2 d2va2a2 A:147-159,161-166,167-178
2br0 d2br0a2 A:147-159,161-166,167-178
1n56 d1n56b2 B:147-159,161-166,167-178
1s0m d1s0mb2 B:147-159,161-166,167-178
2jei d2jeia2 A:147-159,161-166,167-178
2agp d2agpb2 B:147-159,161-166,167-178
2asl d2asla2 A:147-159,161-166,167-178
1kfd d1kfda2 A:519-534,820-825,845-871
2agp d2agpa2 A:147-159,161-166,167-178
1ksp d1kspa2 A:519-534,820-825,845-871
1kfs d1kfsa2 A:519-534,820-825,845-871
2kfz d2kfza2 A:519-534,820-825,845-871
2kfn d2kfna2 A:519-534,820-825,845-871
1qsl d1qsla2 A:519-534,820-825,845-871
1cez d1ceza_ A:453-469,812-818,817-840
2kzm d2kzma2 A:519-534,820-825,845-871
1d9d d1d9da2 A:519-534,820-825,845-871
1d8y d1d8ya2 A:519-534,820-825,845-871
2kzz d2kzza2 A:519-534,820-825,845-871
1t94 d1t94b2 B:316-328,330-335,338-349
1t94 d1t94a2 A:316-328,330-335,338-349
1k1q d1k1qa2 A:148-160,162-167,168-179
1k1s d1k1sa2 A:148-160,162-167,168-179
1k1q d1k1qb2 B:148-160,162-167,168-179
1s77 d1s77d_ D:453-469,812-817,817-840
1msw d1mswd_ D:453-469,812-817,817-840
1h38 d1h38b_ B:453-469,812-817,817-840
1s0v d1s0vb_ B:453-469,812-817,817-840
1qln d1qlna_ A:453-469,812-817,817-840
1s76 d1s76d_ D:453-469,812-817,817-840
2pi4 d2pi4a1 A:453-469,812-817,817-840
1h38 d1h38a_ A:453-469,812-817,817-840
1sl0 d1sl0a2 A:211-231,418-423,605-637
1h38 d1h38c_ C:453-469,812-817,817-840
1h38 d1h38d_ D:453-469,812-817,817-840
3bq2 d3bq2a2 A:148-160,162-167,171-179
1sl0 d1sl0c2 C:211-231,418-423,605-637
2pi5 d2pi5a1 A:453-469,812-817,817-840
1s0v d1s0va_ A:453-469,812-817,817-840
1sl1 d1sl1a2 A:211-231,418-423,605-637
1t8e d1t8ea2 A:211-231,418-423,605-637
1tkd d1tkda2 A:211-231,418-423,605-637
1sl2 d1sl2a2 A:211-231,418-423,605-637
1x9w d1x9wa2 A:211-231,418-423,605-637
1s0v d1s0vc_ C:453-469,812-817,817-840
1skr d1skra2 A:211-231,418-423,605-637
1tk8 d1tk8a2 A:211-231,418-423,605-637
1aro d1arop_ P:452-469,812-817,817-840
1tk0 d1tk0a2 A:211-231,418-423,605-637
1x9m d1x9ma2 A:211-231,418-423,605-637
4rnp d4rnpb_ B:453-470,812-817,817-840
4rnp d4rnpc_ C:453-470,812-817,817-840
4rnp d4rnpa_ A:453-470,812-817,817-840
1tk5 d1tk5a2 A:211-231,418-423,605-637
1skw d1skwa2 A:211-231,418-423,605-637
4ktq d4ktqa2 A:486-499,504-508,515-523
1t7p d1t7pa2 A:211-231,418-423,605-637
1sks d1sksa2 A:211-231,418-423,605-637
1zyq d1zyqa2 A:211-231,418-423,605-637
1x9s d1x9sa2 A:211-231,418-423,605-637
2oyq d2oyqb2 B:414-424,454-458,658-675
1dpi d1dpia2 A:519-534,820-825,838-871
2p5g d2p5gb2 B:414-424,454-458,658-675
2dy4 d2dy4a2 A:414-424,454-458,658-675
1waf d1wafb2 B:414-424,454-458,658-675
2p5g d2p5ga2 A:414-424,454-458,658-675
1q9y d1q9ya2 A:417-427,457-461,661-678
1s0v d1s0vd_ D:453-469,812-818,820-840
1ih7 d1ih7a2 A:414-424,454-458,658-675
1q9x d1q9xb2 B:414-424,454-458,658-675
2p5o d2p5ob2 B:414-424,454-458,658-675
3cq8 d3cq8a2 A:414-424,454-458,658-675
1waf d1wafa2 A:414-424,454-458,657-675
2p5o d2p5od2 D:414-424,454-458,657-675
2oyq d2oyqa2 A:414-424,454-458,658-675
2ozs d2ozsa2 A:414-424,454-458,658-675
2dy4 d2dy4d2 D:414-424,454-458,657-675
1waj d1waja2 A:414-424,454-458,657-675
1q9x d1q9xd2 D:414-424,454-458,658-675
2oyq d2oyqc2 C:414-424,454-458,657-675
2p5o d2p5oc2 C:414-424,454-458,657-675
2atq d2atqa2 A:414-424,454-458,658-675
2p5o d2p5oa2 A:414-424,454-458,658-675
2p5g d2p5gc2 C:414-424,454-458,658-675
1q9x d1q9xc2 C:414-424,454-458,658-675
2ozm d2ozma2 A:414-424,454-458,658-675
2dy4 d2dy4b2 B:414-424,454-458,657-675
1s6q d1s6qa2 A:110-119,185-192,194-213
1clq d1clqa2 A:414-424,454-458,658-675
1ig9 d1ig9a2 A:414-424,454-458,658-675
1q9x d1q9xa2 A:414-424,454-458,658-675
1tvr d1tvrb_ B:110-118,185-192,194-214
2dy4 d2dy4c2 C:414-424,454-458,657-675
2p5g d2p5gd2 D:414-424,454-458,658-675
1krp d1krpa2 A:519-534,820-825,832-871
2vg6 d2vg6b1 B:1110-1119,1185-1192,1194-1213
1suq d1suqa2 A:110-119,185-192,194-213
2vg5 d2vg5b1 B:1110-1119,1185-1192,1194-1213
1rtd d1rtdd_ D:110-119,185-192,194-213
3drs d3drsb1 B:110-119,185-192,194-213
3c6t d3c6tb1 B:110-119,185-192,194-213
1rtd d1rtdb_ B:110-119,185-192,194-213
3drr d3drrb1 B:110-119,185-192,194-213
1bqn d1bqnb_ B:110-119,185-192,194-214
1s9g d1s9gb_ B:110-119,185-192,194-213
3c6u d3c6ub1 B:110-119,185-192,194-213
1bqm d1bqmb_ B:110-119,185-192,194-213
1eet d1eetb_ B:1110-1119,1185-1192,1194-1213
3drp d3drpb1 B:110-119,185-192,194-213
1n5y d1n5yb_ B:111-119,185-191,194-213
3dok d3dokb1 B:110-119,185-192,194-213
1klm d1klmb_ B:110-119,185-192,194-213
1fkp d1fkpb_ B:110-119,185-192,194-213
1jlq d1jlqb_ B:110-119,185-192,194-213
1rt6 d1rt6b1 B:110-119,185-192,194-213
1s9e d1s9eb_ B:110-119,185-192,194-213
1s1x d1s1xb1 B:110-119,185-192,194-213
1rt7 d1rt7b1 B:110-119,185-192,194-213
1rt1 d1rt1b1 B:110-119,185-192,194-213
2oyq d2oyqd2 D:414-424,454-458,643-675
1uwb d1uwbb_ B:110-119,185-192,194-214
1jxe d1jxea2 A:423-448,725-730,737-776
1tau d1taua4 A:423-448,562-566,737-776
1qsy d1qsya2 A:423-448,562-566,737-776
1q8i d1q8ia2 A:422-432,449-454,558-585
34. c.154.1 CdCA1 repeat-like
CdCA1 repeat-like contains two parallel beta-strands of four strands each; the sheets contact each other with edges at a right angle
3boh d3boha1 A:15-27,161-169,196-212
3boh d3bohb1 B:15-27,161-169,196-212
3boj d3boja1 A:15-27,161-169,196-212
3boe d3boea1 A:225-237,371-379,406-422
3boc d3boca1 A:225-237,371-379,406-422
3bob d3boba1 A:225-237,371-379,406-422
3boh d3boha1 A:15-27,28-34,196-212
3boh d3bohb1 B:15-27,28-34,196-212
3boj d3boja1 A:15-27,28-34,196-212
3boe d3boea1 A:225-237,238-244,406-422
3bob d3boba1 A:225-237,238-244,406-422
3boc d3boca1 A:225-237,238-244,406-422
35. c.72.1 Ribokinase-like has extra strand located between strands 2 and 3 !
Ribokinase-like core: 3 layers: a/b/a; mixed beta-sheet of 8 strands, order 21345678, strand 7 is antiparallel to the rest ! potential superfamily: members of this fold have similar functions but different ATP-binding sites
1jxi d1jxia_ A:18-31,74-79,210-226
1jxi d1jxib_ B:18-31,74-79,210-226
1lhr d1lhra_ A:18-32,78-83,232-249
1rfv d1rfvb_ B:18-32,78-83,232-249
1rfv d1rfva_ A:18-32,78-83,232-249
1lhp d1lhpa_ A:18-32,78-83,232-249
1lhp d1lhpb_ B:18-32,78-83,232-249
1lhr d1lhrb_ B:18-32,78-83,232-249
1ygj d1ygja1 A:18-32,78-83,232-249
1yhj d1yhja1 A:18-32,78-83,232-249
1ygk d1ygka1 A:18-32,78-83,232-249
1rfu d1rfub_ B:18-32,78-83,230-249
1rfu d1rfuh_ H:18-32,78-84,230-249
1rfu d1rfue_ E:18-32,78-83,230-249
1rfu d1rfuc_ C:18-32,78-83,230-249
1rfu d1rfud_ D:18-32,78-84,230-249
1rfu d1rfug_ G:19-32,78-84,230-249
1rfu d1rfua_ A:18-32,78-83,230-249
1rfu d1rfuf_ F:18-32,78-83,230-249
1ub0 d1ub0a_ A:16-29,72-77,207-223
1gc5 d1gc5a_ A:120-134,235-240,448-467
1vm7 d1vm7b_ B:40-54,130-136,243-259
2f02 d2f02b1 B:37-50,129-135,252-268
2awd d2awdb1 B:37-50,129-134,252-268
1rft d1rfta_ A:18-32,78-83,230-249
2f02 d2f02a1 A:37-50,129-135,252-268
2awd d2awda1 A:37-50,129-135,252-268
1vm7 d1vm7a_ A:40-54,130-136,243-259
1l2l d1l2la_ A:115-129,230-234,441-457
1v1b d1v1ba_ A:34-47,127-133,248-264
1jxh d1jxhb_ B:18-31,74-79,210-223
1lij d1lija_ A:69-83,160-169,315-331
1jxh d1jxha_ A:18-31,74-79,210-223
1tz3 d1tz3a_ A:31-44,122-128,249-266
2ajr d2ajra1 A:40-53,136-142,258-275
2abq d2abqb1 B:37-50,126-133,246-262
2abq d2abqa1 A:37-50,125-133,246-262
1tz3 d1tz3b_ B:31-44,122-128,249-266
1v1a d1v1aa_ A:34-47,127-133,248-264
1u2x d1u2xb_ B:118-131,238-244,452-472
2ajr d2ajrb1 B:40-53,136-142,258-275
1gqt d1gqta_ A:42-55,136-142,252-268
1rkd d1rkda_ A:42-55,136-142,252-268
1gqt d1gqtb_ B:42-55,136-142,252-268
1rka d1rkaa_ A:42-55,136-142,252-268
1dgm d1dgma_ A:69-83,162-168,315-331
1u2x d1u2xa_ A:118-131,238-244,452-472
1gqt d1gqtc_ C:42-55,136-142,252-268
1gqt d1gqtd_ D:42-55,136-142,252-268
2afb d2afbb1 B:33-46,127-135,277-293
1vi9 d1vi9d_ D:16-30,77-83,221-237
1tz6 d1tz6a_ A:31-44,121-129,249-266
1v1a d1v1ab_ B:34-47,127-133,246-264
1rk2 d1rk2c_ C:42-55,136-142,252-268
1tz6 d1tz6b_ B:31-44,121-129,249-266
1rk2 d1rk2a_ A:42-55,136-142,252-268
1vi9 d1vi9b_ B:16-30,77-83,221-237
1td2 d1td2b_ B:16-30,77-83,221-237
1vi9 d1vi9c_ C:16-30,77-83,221-237
1rk2 d1rk2b_ B:42-55,136-142,252-268
1vi9 d1vi9b_ B:16-30,31-37,221-237
2ab8 d2ab8a1 A:69-83,162-168,315-331
2ax3 d2ax3a1 A:244-259,310-318,426-444
1rks d1rksa_ A:42-55,136-142,252-268
1rk2 d1rk2d_ D:42-55,136-142,252-268
1vk4 d1vk4a_ A:25-38,109-114,231-248
1vi9 d1vi9a_ A:16-30,77-83,221-237
2fv7 d2fv7a1 A:53-66,147-153,266-283
1ua4 d1ua4a_ A:112-126,227-233,435-455
2fv7 d2fv7b1 B:53-66,147-153,266-283
1v1b d1v1bb_ B:34-47,127-133,246-264
1v1b d1v1bc_ C:34-47,127-133,246-264
1tyy d1tyya_ A:31-44,121-129,249-266
1v1b d1v1bd_ D:34-47,127-133,246-264
1td2 d1td2a_ A:16-30,77-83,221-237
1tyy d1tyyb_ B:31-44,121-129,249-266
1wye d1wyee1 E:34-47,130-135,251-269
2dcn d2dcnd1 D:34-47,130-135,251-269
1v19 d1v19b_ B:34-47,127-133,246-264
2dcn d2dcnk1 K:34-47,130-135,251-269
2abs d2absa1 A:69-83,162-168,315-331
1wye d1wyec1 C:34-47,130-135,251-269
2dcn d2dcna1 A:34-47,130-135,251-269
2dcn d2dcnj1 J:34-47,130-135,251-269
2dcn d2dcni1 I:34-47,130-135,251-269
2dcn d2dcnl1 L:34-47,130-135,251-269
1v1s d1v1se_ E:34-47,127-133,246-264
1v1s d1v1sd_ D:34-47,127-133,246-264
1v1s d1v1sc_ C:34-47,127-133,246-264
1v1s d1v1sf_ F:34-47,127-133,246-264
1v1s d1v1sa_ A:34-47,127-133,246-264
2dcn d2dcnc1 C:34-47,130-135,251-269
2dcn d2dcne1 E:34-47,130-135,251-269
1lio d1lioa_ A:69-83,162-168,312-331
1v1s d1v1sb_ B:34-47,127-133,246-264
2dcn d2dcng1 G:34-47,130-135,251-269
2dcn d2dcnb1 B:34-47,130-135,251-269
2dcn d2dcnh1 H:34-47,130-135,251-269
2afb d2afba1 A:33-46,128-135,277-293
2i6a d2i6aa1 A:64-78,163-169,294-313
2dcn d2dcnf1 F:34-47,130-135,251-269
1wye d1wyea1 A:34-47,130-135,251-269
2i6a d2i6ad1 D:64-78,163-169,294-313
1vm7 d1vm7b_ B:40-54,152-158,243-259
1lhr d1lhra_ A:18-32,33-39,232-249
1v19 d1v19a_ A:34-47,127-133,245-264
1ekk d1ekkb_ B:28-40,40-45,195-212
1wye d1wyef1 F:34-47,130-135,251-269
2a9y d2a9ya1 A:69-83,162-168,313-331
2a9z d2a9za1 A:69-83,162-168,313-331
1vm7 d1vm7a_ A:40-54,152-158,243-259
1v1b d1v1ba_ A:34-47,158-164,248-264
2fv7 d2fv7a1 A:53-66,172-178,266-283
2ax3 d2ax3a1 A:244-259,261-269,426-444
1lik d1lika_ A:69-83,162-169,315-331
1kyh d1kyha_ A:39-54,97-104,211-230
2f02 d2f02b1 B:37-50,158-164,252-268
1gqt d1gqta_ A:42-55,161-167,252-268
1rkd d1rkda_ A:42-55,161-167,252-268
1ub0 d1ub0a_ A:16-29,30-37,207-223
1rka d1rkaa_ A:42-55,161-167,252-268
2f02 d2f02a1 A:37-50,158-164,252-268
1rk2 d1rk2c_ C:42-55,161-167,252-268
2fv7 d2fv7b1 B:53-66,172-178,266-283
1rk2 d1rk2a_ A:42-55,161-167,252-268
1wye d1wyed1 D:34-47,130-135,250-269
1v1a d1v1aa_ A:34-47,158-164,248-264
1wye d1wyeb1 B:34-47,130-135,250-269
1yhj d1yhja1 A:18-32,34-39,232-249
1rk2 d1rk2b_ B:42-55,161-167,252-268
1rfu d1rfug_ G:19-32,33-41,230-249
1rk2 d1rk2d_ D:42-55,161-167,252-268
1gqt d1gqtd_ D:42-55,161-167,252-268
1gqt d1gqtc_ C:42-55,161-167,252-268
1gqt d1gqtb_ B:42-55,161-167,252-268
1rks d1rksa_ A:42-55,161-167,252-268
1lii d1liia_ A:69-83,162-169,315-331
1rfu d1rfuh_ H:18-32,33-41,230-249
2dcn d2dcng1 G:34-47,158-163,251-269
2awd d2awda1 A:37-50,158-164,252-268
1rfu d1rfud_ D:18-32,33-41,230-249
1rfu d1rfuc_ C:18-32,33-41,230-249
1rfu d1rfub_ B:18-32,33-41,230-249
1rfu d1rfuf_ F:18-32,33-41,230-249
1kyh d1kyha_ A:39-54,56-62,211-230
1rfu d1rfue_ E:18-32,33-41,230-249
2dcn d2dcni1 I:34-47,158-163,251-269
2dcn d2dcnk1 K:34-47,158-163,251-269
2dcn d2dcna1 A:34-47,158-163,251-269
1wye d1wyee1 E:34-47,158-163,251-269
2dcn d2dcnj1 J:34-47,158-163,251-269
1v1a d1v1ab_ B:34-47,158-164,246-264
2dcn d2dcnd1 D:34-47,158-163,251-269
2dcn d2dcnh1 H:34-47,158-163,251-269
1rfu d1rfua_ A:18-32,33-41,230-249
1wye d1wyec1 C:34-47,158-163,251-269
2dcn d2dcnc1 C:34-47,158-163,251-269
2dcn d2dcnl1 L:34-47,158-163,251-269
2dcn d2dcnb1 B:34-47,158-163,251-269
1v1s d1v1sd_ D:34-47,158-164,246-264
1v1s d1v1sa_ A:34-47,158-164,246-264
2dcn d2dcne1 E:34-47,158-163,251-269
1v1s d1v1sf_ F:34-47,158-164,246-264
1c3q d1c3qc1 C:25-40,40-45,195-211
2afb d2afbb1 B:33-46,159-166,277-293
1v1s d1v1se_ E:34-47,158-164,246-264
2i6a d2i6ac1 C:64-78,163-170,294-313
1v1s d1v1sb_ B:34-47,158-164,246-264
1v1s d1v1sc_ C:34-47,158-164,246-264
1v19 d1v19b_ B:34-47,158-164,246-264
1dgm d1dgma_ A:69-83,191-197,315-331
1jxi d1jxia_ A:18-31,32-39,210-226
1esq d1esqc1 C:25-40,40-45,195-211
2dcn d2dcnf1 F:34-47,158-163,251-269
1jxi d1jxib_ B:18-31,32-39,210-226
1wye d1wyea1 A:34-47,158-163,251-269
1c3q d1c3qa1 A:25-40,40-45,195-211
2afb d2afba1 A:33-46,159-166,277-293
2i6a d2i6ab1 B:64-78,163-170,294-313
1v1b d1v1bd_ D:34-47,158-164,246-264
1rft d1rfta_ A:18-32,33-41,230-249
1v1b d1v1bb_ B:34-47,158-164,246-264
1vk4 d1vk4a_ A:25-38,134-140,231-248
1esj d1esjb1 B:25-40,40-45,195-211
1v1b d1v1bc_ C:34-47,158-164,246-264
1esq d1esqb1 B:25-40,40-45,195-212
1ekk d1ekka_ A:25-40,40-45,195-212
1esj d1esjc1 C:25-40,40-45,195-211
1esj d1esjb1 B:25-40,60-66,195-211
1vi9 d1vi9c_ C:16-30,107-114,221-237
1bx4 d1bx4a_ A:64-78,163-170,294-313
1ekk d1ekkb_ B:28-40,60-67,195-212
1wye d1wyef1 F:34-47,158-163,251-269
1c3q d1c3qb1 B:25-40,40-45,195-212
1u2x d1u2xb_ B:118-131,277-283,452-472
2ax3 d2ax3a1 A:244-259,337-343,426-444
1u2x d1u2xa_ A:118-131,277-283,452-472
2aa0 d2aa0a1 A:69-83,162-169,313-331
1jxh d1jxhb_ B:18-31,32-39,210-223
1vi9 d1vi9a_ A:16-30,31-39,221-237
1vi9 d1vi9d_ D:16-30,31-39,221-237
1ekq d1ekqb_ B:25-40,40-45,195-212
1esj d1esja1 A:25-40,40-45,195-211
1jxh d1jxha_ A:18-31,32-40,210-223
2abs d2absa1 A:69-83,191-197,315-331
1td2 d1td2a_ A:16-30,31-39,221-237
1vi9 d1vi9c_ C:16-30,31-39,221-237
1td2 d1td2b_ B:16-30,31-39,221-237
1ekq d1ekqa_ A:25-40,40-45,195-212
1esq d1esqa1 A:25-40,40-45,195-212
1lii d1liia_ A:69-83,191-198,315-331
1v19 d1v19a_ A:34-47,158-164,245-264
1wye d1wyed1 D:34-47,158-163,250-269
1lij d1lija_ A:69-83,191-198,315-331
1lik d1lika_ A:69-83,191-198,315-331
1c3q d1c3qc1 C:25-40,60-67,195-211
1esj d1esjc1 C:25-40,60-67,195-211
1wye d1wyeb1 B:34-47,158-163,250-269
2ab8 d2ab8a1 A:69-83,191-198,315-331
1kyh d1kyha_ A:39-54,123-129,211-230
1c3q d1c3qa1 A:25-40,60-67,195-211
1c3q d1c3qb1 B:25-40,60-67,195-212
1l2l d1l2la_ A:115-129,264-270,441-457
1lio d1lioa_ A:69-83,191-197,312-331
2abq d2abqa1 A:37-50,155-162,246-262
1esj d1esja1 A:25-40,60-67,195-211
1esq d1esqb1 B:25-40,60-67,195-212
2abq d2abqb1 B:37-50,155-162,246-262
1ekq d1ekqb_ B:25-40,60-67,195-212
1esq d1esqc1 C:25-40,60-67,195-211
2awd d2awdb1 B:37-50,158-163,252-268
2ajr d2ajra1 A:40-53,165-172,258-275
1tz3 d1tz3a_ A:31-44,152-159,249-266
1ekq d1ekqa_ A:25-40,60-67,195-212
1ygj d1ygja1 A:18-32,33-41,232-249
1vk4 d1vk4a_ A:25-38,40-46,231-248
1ua4 d1ua4a_ A:112-126,261-267,435-455
1tz6 d1tz6a_ A:31-44,152-159,249-266
1gc5 d1gc5a_ A:120-134,274-280,448-467
1tz3 d1tz3b_ B:31-44,152-159,249-266
1lhp d1lhpa_ A:18-32,33-41,232-249
1ygk d1ygka1 A:18-32,33-41,232-249
1ekk d1ekka_ A:25-40,60-67,195-212
1lhr d1lhrb_ B:18-32,33-41,232-249
2ajr d2ajrb1 B:40-53,165-172,258-275
1rfv d1rfva_ A:18-32,33-41,232-249
1lhp d1lhpb_ B:18-32,33-41,232-249
1tz6 d1tz6b_ B:31-44,152-159,249-266
2a9y d2a9ya1 A:69-83,191-198,313-331
1tyy d1tyya_ A:31-44,152-159,249-266
1rfv d1rfvb_ B:18-32,33-41,232-249
2aa0 d2aa0a1 A:69-83,191-198,313-331
1esq d1esqa1 A:25-40,60-67,195-212
2a9z d2a9za1 A:69-83,191-198,313-331
1tyy d1tyyb_ B:31-44,152-159,249-266
2i6a d2i6ac1 C:64-78,191-198,294-313
1bx4 d1bx4a_ A:64-78,191-198,294-313
2i6a d2i6aa1 A:64-78,191-198,294-313
2i6a d2i6ad1 D:64-78,191-198,294-313
2i6a d2i6ab1 B:64-78,191-198,294-313
2dcn d2dcnd1 D:34-47,48-57,251-269
2dcn d2dcnj1 J:34-47,48-57,251-269
1wye d1wyed1 D:34-47,48-58,250-269
1wye d1wyeb1 B:34-47,48-58,250-269
1wye d1wyec1 C:34-47,48-58,251-269
2dcn d2dcnc1 C:34-47,48-58,251-269
2dcn d2dcni1 I:34-47,48-58,251-269
1wye d1wyee1 E:34-47,48-58,251-269
2dcn d2dcna1 A:34-47,48-58,251-269
2dcn d2dcng1 G:34-47,48-58,251-269
2dcn d2dcnf1 F:34-47,48-58,251-269
2dcn d2dcnh1 H:34-47,48-58,251-269
2dcn d2dcnl1 L:34-47,48-58,251-269
2dcn d2dcne1 E:34-47,48-58,251-269
2dcn d2dcnk1 K:34-47,48-58,251-269
2dcn d2dcnb1 B:34-47,48-58,251-269
1wye d1wyea1 A:34-47,48-58,251-269
2afb d2afba1 A:33-46,47-56,277-293
1wye d1wyef1 F:34-47,48-58,251-269
2afb d2afbb1 B:33-46,47-56,277-293
1rkd d1rkda_ A:42-55,57-66,252-268
1rks d1rksa_ A:42-55,57-66,252-268
1rk2 d1rk2c_ C:42-55,57-66,252-268
1rk2 d1rk2b_ B:42-55,57-66,252-268
1gqt d1gqtb_ B:42-55,57-66,252-268
1rk2 d1rk2d_ D:42-55,57-66,252-268
1rk2 d1rk2a_ A:42-55,57-66,252-268
1gqt d1gqtc_ C:42-55,57-66,252-268
1gqt d1gqta_ A:42-55,57-66,252-268
1vm7 d1vm7a_ A:40-54,56-65,243-259
1vm7 d1vm7b_ B:40-54,56-65,243-259
36. c.107.1 DHH phosphoesterases constituent families have similar domain organization with variable interdomain linker and spatial arrangement of the domains !
DHH phosphoesterases consists of two non-similar domains ! Domain 1 has parallel sheet of 6 strands, order 321456 ! Domain 2 has mixed sheet of 5 strands, order 12345; strands 1 & 4 are antiparallel to the rest
1ir6 d1ir6a_ A:82-100,130-136,186-203
1ir6 d1ir6a_ A:82-100,153-160,186-203
1i74 d1i74b_ B:12-30,69-75,118-131
1wpm d1wpmb_ B:13-31,69-75,118-131
1wpp d1wppb_ B:13-32,71-77,120-133
2haw d2hawb1 B:13-31,69-75,118-131
1wpp d1wppa_ A:13-32,71-77,120-133
1i74 d1i74a_ A:12-30,69-75,118-131
1k20 d1k20a_ A:13-32,71-77,120-133
1wpm d1wpma_ A:13-31,69-75,118-131
2haw d2hawa1 A:13-31,69-75,118-131
1wpn d1wpnb_ B:13-31,69-75,118-131
1wpn d1wpna_ A:13-31,69-75,118-131
1k20 d1k20b_ B:13-32,71-77,120-133
1k23 d1k23d_ D:13-31,69-75,118-131
1k23 d1k23b_ B:13-31,69-75,118-131
1k23 d1k23c_ C:13-31,69-75,118-131
1k23 d1k23a_ A:13-31,69-75,118-131
1i74 d1i74b_ B:12-30,89-97,118-131
1k20 d1k20a_ A:13-32,91-99,120-133
1wpp d1wppa_ A:13-32,91-99,120-133
1wpp d1wppb_ B:13-32,91-99,120-133
1k20 d1k20b_ B:13-32,91-99,120-133
1wpn d1wpna_ A:13-31,89-97,118-131
1i74 d1i74a_ A:12-30,89-97,118-131
2haw d2hawa1 A:13-31,89-97,118-131
2haw d2hawb1 B:13-31,89-97,118-131
1wpm d1wpma_ A:13-31,89-97,118-131
1wpn d1wpnb_ B:13-31,89-97,118-131
1wpm d1wpmb_ B:13-31,89-97,118-131
1k23 d1k23b_ B:13-31,89-97,118-131
1k23 d1k23a_ A:13-31,89-97,118-131
1k23 d1k23c_ C:13-31,89-97,118-131
1k23 d1k23d_ D:13-31,89-97,118-131
37. i.1.1 Ribosome and ribosomal fragments
Ribosome and ribosomal fragments
3bbn d3bbnb1 B:77-92,164-169,210-230
1jgp d1jgpe_ E:74-89,160-166,207-227
1jgo d1jgoe_ E:74-89,160-166,207-227
1jgq d1jgqe_ E:74-89,160-166,207-227
1gix d1gixe_ E:74-89,160-166,207-227
1s1h d1s1hb_ B:78-93,118-124,165-185
1ml5 d1ml5e_ E:74-89,160-166,207-227
1pns d1pnsb_ B:74-89,160-166,207-227
1pnx d1pnxb_ B:74-89,160-166,207-227
1p87 d1p87b_ B:72-87,158-164,205-225
1ml5 d1ml5h_ H:103-114,117-125,127-142
1gix d1gixh_ H:103-114,117-125,127-142
1jgp d1jgph_ H:103-114,117-125,127-142
1jgq d1jgqh_ H:103-114,117-125,127-142
1jgo d1jgoh_ H:103-114,117-125,127-142
1pns d1pnse_ E:103-114,117-125,127-142
1pnx d1pnxe_ E:103-114,117-125,127-142
1ibl d1ible_ E:103-114,117-125,127-142
2uxd d2uxde1 E:103-114,117-124,127-142
2vqf d2vqfe1 E:103-114,117-125,127-142
2uxb d2uxbe1 E:103-114,117-125,127-142
2vqe d2vqee1 E:103-114,117-125,127-142
1ibm d1ibme_ E:103-114,117-125,127-142
1p87 d1p87e_ E:107-118,121-129,131-146
1p6g d1p6ge_ E:107-118,121-129,131-146
1ibl d1iblb_ B:77-89,160-166,207-227
2v46 d2v46e1 E:103-114,117-124,127-142
1ibk d1ibke_ E:103-114,117-124,127-142
2v48 d2v48e1 E:103-114,117-124,127-142
3d5a d3d5ae1 E:103-114,117-124,127-142
3d5c d3d5ce1 E:103-114,117-124,127-142
1ibk d1ibkb_ B:77-89,160-166,207-227
1ibm d1ibmb_ B:77-89,160-166,207-227
2zkq d2zkqe1 E:115-126,129-137,140-156
1vov d1vovb_ B:74-89,159-165,207-227
1voz d1vozb_ B:74-89,159-165,207-227
1vos d1vosb_ B:74-89,159-165,207-227
1vox d1voxb_ B:74-89,159-165,207-227
1voq d1voqb_ B:74-89,159-165,207-227
1qd7 d1qd7d_ D:108-119,122-129,132-147
1eg0 d1eg0b_ B:105-116,119-126,129-144
1dv4 d1dv4e_ E:128-139,142-149,152-167
1voq d1voqe_ E:103-111,117-124,127-142
1vox d1voxe_ E:103-111,117-124,127-142
1vos d1vose_ E:103-111,117-124,127-142
1voz d1voze_ E:103-111,117-124,127-142
1vov d1vove_ E:103-111,117-124,127-142
1s1h d1s1he_ E:180-191,194-202,207-221
1ibl d1iblb_ B:77-89,90-95,207-227
1s1h d1s1hb_ B:78-93,94-99,165-185
1ibm d1ibmb_ B:77-89,90-95,207-227
1w2b d1w2bo_ O:2-15,20-24,27-35
1pn6 d1pn6a_ A:24-39,76-83,267-280
1fka d1fkae_ E:103-114,117-124,127-142
1ibk d1ibki_ I:40-54,57-68,69-90
1s1i d1s1ia_ A:70-81,108-114,143-154
1s1h d1s1hi_ I:46-55,61-71,72-93
1s1h d1s1ht_ T:31-44,123-131,329-342
1p87 d1p87i_ I:41-55,59-69,70-91
1p6g d1p6gi_ I:41-55,59-69,70-91
1ibm d1ibmi_ I:40-54,58-68,69-90
1pns d1pnsi_ I:40-54,58-68,69-90
1pnx d1pnxi_ I:40-54,58-68,69-90
1s1i d1s1ip_ P:3-15,20-24,27-35
1gix d1gixl_ L:40-54,58-68,69-90
1jgo d1jgol_ L:40-54,58-68,69-90
1jgp d1jgpl_ L:40-54,58-68,69-90
1jgq d1jgql_ L:40-54,58-68,69-90
1ml5 d1ml5l_ L:40-54,58-68,69-90
2zkq d2zkqi1 I:48-59,65-75,76-97
1s1h d1s1ht_ T:31-44,208-215,329-342
2qnh d2qnhf1 F:106-114,118-125,127-143
1pn6 d1pn6a_ A:24-39,102-110,267-280
1pny d1pny5_ 5:69-80,108-113,143-154
1pnu d1pnu5_ 5:69-80,108-113,143-154
1s1h d1s1ht_ T:31-44,151-159,329-342
1pn6 d1pn6a_ A:24-39,131-138,267-280
1eg0 d1eg0n_ N:71-82,103-108,140-150
487d d487dh_ H:79-90,111-116,148-159
1s1h d1s1ht_ T:31-44,96-104,329-342
1ml5 d1ml5c_ C:79-90,111-116,148-156
1giy d1giyc_ C:79-90,111-116,148-156
3cc7 d3cc7t1 T:28-36,38-42,105-115
1s1h d1s1ht_ T:655-674,683-694,701-721
1ml5 d1ml5c_ C:79-90,92-96,148-156
1giy d1giyc_ C:79-90,92-96,148-156
1pn6 d1pn6a_ A:535-552,562-573,578-598
1jqm d1jqmb_ B:535-553,562-573,578-598
487d d487dh_ H:79-90,92-96,148-159
1eg0 d1eg0n_ N:71-82,84-88,140-150
1fka d1fkak_ K:104-124,203-207,213-221
1nwy d1nwyc_ C:96-116,115-120,176-184
1eg0 d1eg0n_ N:71-82,84-88,88-98
1ml5 d1ml5z_ Z:137-160,323-329,344-351
1mi6 d1mi6a_ A:137-160,323-329,344-351
1vos d1vosa_ A:12-27,35-44,68-89
1voq d1voqa_ A:12-27,35-44,68-89
1voz d1voza_ A:12-27,35-44,68-89
1vov d1vova_ A:12-27,35-44,68-89
1vox d1voxa_ A:12-27,35-44,68-89
1ml5 d1ml5f_ F:103-120,193-197,219-230
1giy d1giyf_ F:103-120,193-197,219-230
38. c.83.1 Aconitase iron-sulfur domain
Aconitase iron-sulfur domain consists of three similar domains with 3 layers (a/b/a) each; duplication ! core: parallel beta-sheet of 5 strands, order 32145
1b0k d1b0ka2 A:362-380,385-390,465-476
1c97 d1c97a2 A:362-380,385-390,465-476
8acn d8acna2 A:362-380,385-390,465-476
1c96 d1c96a2 A:362-380,385-390,465-476
7acn d7acna2 A:362-380,385-390,465-476
1l5j d1l5ja3 A:713-728,733-738,807-818
1fgh d1fgha2 A:362-380,385-390,465-476
1b0j d1b0ja2 A:362-380,385-390,465-476
1ami d1amia2 A:362-380,385-390,465-476
6acn d6acna2 A:362-380,385-390,465-476
5acn d5acna2 A:362-380,385-390,465-476
1l5j d1l5jb3 B:713-728,733-738,807-818
1aco d1acoa2 A:362-380,385-390,465-476
1nis d1nisa2 A:362-380,385-390,465-476
1nit d1nita2 A:362-380,385-390,465-476
1b0m d1b0ma2 A:362-380,385-390,465-476
1amj d1amja2 A:362-380,385-390,465-476
2b3y d2b3yb2 B:442-460,467-473,553-564
2b3y d2b3ya2 A:442-460,467-473,553-564
2b3x d2b3xa2 A:442-460,467-472,553-564
1l5j d1l5jb3 B:414-429,436-442,511-522
1l5j d1l5ja3 A:414-429,436-442,511-522
5acn d5acna2 A:72-87,94-99,182-192
1amj d1amja2 A:72-87,94-99,182-192
1b0m d1b0ma2 A:72-87,94-99,182-192
1c97 d1c97a2 A:72-87,94-99,182-192
1c96 d1c96a2 A:72-87,94-99,182-192
1nis d1nisa2 A:72-87,94-99,182-192
1nit d1nita2 A:72-87,94-99,182-192
1aco d1acoa2 A:72-87,94-99,182-192
7acn d7acna2 A:72-87,94-99,182-192
6acn d6acna2 A:72-87,94-99,182-192
8acn d8acna2 A:72-87,94-99,182-192
1ami d1amia2 A:72-87,94-99,182-192
1fgh d1fgha2 A:72-87,94-99,182-192
1b0k d1b0ka2 A:72-87,94-99,182-192
1b0j d1b0ja2 A:72-87,94-99,182-192
2b3x d2b3xa2 A:86-108,119-124,222-232
2b3y d2b3ya2 A:86-108,119-124,222-232
2b3y d2b3yb2 B:86-108,119-124,222-232
5acn d5acna2 A:182-192,194-199,665-676
1amj d1amja2 A:182-192,194-199,665-676
6acn d6acna2 A:182-192,194-199,665-676
1c97 d1c97a2 A:182-192,194-199,665-676
1nis d1nisa2 A:182-192,194-199,665-676
1b0k d1b0ka2 A:182-192,194-199,665-676
1ami d1amia2 A:182-192,194-199,665-676
1nit d1nita2 A:182-192,194-199,665-676
1b0m d1b0ma2 A:182-192,194-199,665-676
1fgh d1fgha2 A:182-192,194-199,665-676
1aco d1acoa2 A:182-192,194-199,665-676
1c96 d1c96a2 A:182-192,194-199,665-676
2b3x d2b3xa2 A:222-232,234-239,801-812
2b3y d2b3ya2 A:222-232,234-239,801-812
39. c.121.1 Ribose/Galactose isomerase RpiB/AlsB
Ribose/Galactose isomerase RpiB/AlsB 3 layers: a/b/a, core: parallel beta-sheet of 5 strands, order 21354; topological similarity to a part of the arginase/deacetylase fold
2vvo d2vvoc1 C:11-29,63-70,116-130
2vvo d2vvoa1 A:11-29,63-70,116-130
2bet d2bete_ E:11-29,63-70,116-130
2vvq d2vvqe1 E:11-29,63-70,116-130
2vvo d2vvoe1 E:11-29,63-70,116-130
2bet d2beta_ A:11-29,63-70,116-130
2bet d2betb_ B:11-29,63-70,116-130
2vvp d2vvpc1 C:11-29,63-70,116-130
1usl d1uslb_ B:11-29,63-70,116-130
2vvo d2vvob1 B:11-29,63-70,116-130
2vvp d2vvpa1 A:11-29,63-70,116-130
2vvo d2vvod1 D:11-29,63-70,116-130
2vvq d2vvqa1 A:11-29,63-70,116-130
2bes d2besb_ B:11-29,63-70,116-130
2bes d2besd_ D:11-29,63-70,116-130
2vvp d2vvpd1 D:11-29,63-70,116-130
1usl d1usld_ D:11-29,63-70,116-130
1usl d1usle_ E:11-29,63-70,116-130
1usl d1uslc_ C:11-29,63-70,116-130
2vvp d2vvpe1 E:11-29,63-70,116-130
2vvq d2vvqd1 D:11-29,63-70,116-130
2bet d2betd_ D:11-29,63-70,116-130
2vvp d2vvpb1 B:11-29,63-70,116-130
2vvq d2vvqb1 B:11-29,63-70,116-130
1usl d1usla_ A:11-29,63-70,116-130
1nn4 d1nn4c_ C:15-27,60-67,113-127
2vvq d2vvqd1 D:11-29,106-112,116-130
2bet d2betb_ B:11-29,106-112,116-130
2vvq d2vvqa1 A:11-29,106-112,116-130
1nn4 d1nn4b_ B:15-27,60-67,113-127
1nn4 d1nn4a_ A:15-27,60-67,113-127
1nn4 d1nn4d_ D:15-27,60-67,113-127
2vvq d2vvqb1 B:11-29,106-112,116-130
2bes d2besd_ D:11-29,106-112,116-130
2bes d2besb_ B:11-29,106-112,116-130
2vvq d2vvqe1 E:11-29,106-112,116-130
2bet d2betd_ D:11-29,106-112,116-130
2bet d2bete_ E:11-29,106-112,116-130
2bet d2beta_ A:11-29,106-112,116-130
2vvp d2vvpb1 B:11-29,106-112,116-130
1usl d1uslb_ B:11-29,106-112,116-130
2vvp d2vvpd1 D:11-29,106-112,116-130
2vvp d2vvpe1 E:11-29,106-112,116-130
2vvp d2vvpa1 A:11-29,106-112,116-130
1o1x d1o1xa_ A:8-26,102-108,112-126
2vvp d2vvpc1 C:11-29,106-112,116-130
2vvo d2vvoe1 E:11-29,106-112,116-130
2vvo d2vvoa1 A:11-29,106-112,116-130
2vvo d2vvob1 B:11-29,106-112,116-130
1usl d1usld_ D:11-29,106-112,116-130
1usl d1uslc_ C:11-29,106-112,116-130
2vvo d2vvoc1 C:11-29,106-112,116-130
2vvo d2vvod1 D:11-29,106-112,116-130
1usl d1usle_ E:11-29,106-112,116-130
1o1x d1o1xa_ A:8-26,59-66,112-126
1usl d1usla_ A:11-29,106-112,116-130
2bet d2betc_ C:11-29,63-70,116-131
2bes d2besc_ C:11-29,63-70,116-131
2bes d2bese_ E:11-29,63-70,116-131
2vvq d2vvqc1 C:11-29,63-70,116-131
2bes d2besa_ A:11-29,63-70,116-131
2bes d2besc_ C:11-29,106-112,116-131
2vvq d2vvqc1 C:11-29,106-112,116-131
2bes d2bese_ E:11-29,106-112,116-131
1nn4 d1nn4a_ A:15-27,103-109,113-127
1nn4 d1nn4c_ C:15-27,103-109,113-127
1nn4 d1nn4d_ D:15-27,103-109,113-127
2bes d2besa_ A:11-29,106-112,116-131
2bet d2betc_ C:11-29,106-112,116-131
1nn4 d1nn4b_ B:15-27,103-109,113-127
2bes d2besd_ D:11-29,29-35,116-130
2bet d2betd_ D:11-29,29-35,116-130
1usl d1usld_ D:11-29,29-35,116-130
2bes d2besb_ B:11-29,29-35,116-130
2vvp d2vvpd1 D:11-29,29-35,116-130
2vvp d2vvpb1 B:11-29,29-35,116-130
2vvq d2vvqd1 D:11-29,29-35,116-130
2vvo d2vvoc1 C:11-29,30-35,116-130
2vvo d2vvoe1 E:11-29,30-35,116-130
2vvo d2vvoa1 A:11-29,30-35,116-130
2vvo d2vvob1 B:11-29,30-35,116-130
2bet d2bete_ E:11-29,30-35,116-130
2vvo d2vvod1 D:11-29,30-35,116-130
1usl d1usle_ E:11-29,30-35,116-130
2vvq d2vvqe1 E:11-29,30-35,116-130
2vvp d2vvpc1 C:11-29,30-35,116-130
2vvp d2vvpe1 E:11-29,30-35,116-130
1usl d1uslb_ B:11-29,30-35,116-130
2bet d2betb_ B:11-29,30-35,116-130
2vvq d2vvqb1 B:11-29,30-35,116-130
1usl d1uslc_ C:11-29,30-35,116-130
2vvp d2vvpa1 A:11-29,30-35,116-130
2vvq d2vvqa1 A:11-29,30-35,116-130
1usl d1usla_ A:11-29,30-35,116-130
2bes d2bese_ E:11-29,30-35,116-131
2vvq d2vvqc1 C:11-29,30-35,116-131
40. c.51.1 Class II aaRS ABD-related
Anticodon-binding domain-like 3 layers: a/b/a; mixed beta-sheet of five strands, order 21345; strand 4 is antiparallel to the rest
1wu7 d1wu7b1 B:344-359,384-390,413-424
1wu7 d1wu7a1 A:344-359,384-390,413-425
1ggm d1ggma1 A:410-428,453-459,491-504
1htt d1httd1 D:339-356,382-388,411-424
1htt d1httb1 B:339-356,382-388,411-424
1b76 d1b76b1 B:410-428,453-459,491-504
1htt d1httc1 C:339-356,382-388,411-424
1kmn d1kmna1 A:339-356,382-388,411-424
1kmm d1kmmb1 B:339-356,382-388,411-424
1b76 d1b76a1 A:410-428,453-459,491-504
1htt d1htta1 A:339-356,382-388,411-424
1kmm d1kmmd1 D:339-356,382-388,411-424
1kmm d1kmmc1 C:339-356,382-388,411-424
1kmn d1kmnb1 B:339-356,382-388,411-424
1kmn d1kmnd1 D:339-356,382-388,411-424
1kmm d1kmma1 A:339-356,382-388,411-424
1ati d1atib1 B:410-428,453-459,491-504
2el9 d2el9a1 A:339-356,382-388,411-424
2el9 d2el9b1 B:339-356,382-388,411-424
1kmn d1kmnc1 C:339-356,382-388,411-424
1ati d1atia1 A:410-428,453-459,491-504
2el9 d2el9c1 C:339-356,382-388,411-424
1nyr d1nyra1 A:558-573,598-604,627-642
2el9 d2el9d1 D:339-356,382-388,411-424
1nyr d1nyrb1 B:558-573,598-604,627-642
1ggm d1ggmb1 B:410-428,453-459,491-505
1nyq d1nyqa1 A:554-573,598-604,627-642
1nyq d1nyqb1 B:554-573,598-604,627-642
1wu7 d1wu7b1 B:344-359,360-365,413-424
1b76 d1b76b1 B:410-428,431-435,491-504
1wu7 d1wu7a1 A:344-359,360-365,413-425
1b76 d1b76a1 A:410-428,431-435,491-504
1kog d1kogg1 G:548-566,591-597,620-635
1kog d1kogc1 C:548-566,591-597,620-635
1fyf d1fyfb1 B:548-566,591-597,620-635
1kog d1kogf1 F:548-566,591-597,620-635
1kog d1kogd1 D:548-566,591-597,620-635
1kog d1koge1 E:548-566,591-597,620-635
1kog d1kogb1 B:548-566,591-597,620-635
1fyf d1fyfa1 A:548-566,591-597,620-635
1kog d1kogh1 H:548-566,591-597,620-635
1kog d1koga1 A:548-566,591-597,620-635
1evk d1evkb1 B:548-566,591-597,620-635
1evl d1evlb1 B:548-566,591-597,620-635
1evl d1evld1 D:548-566,591-597,620-635
1h4v d1h4vb1 B:337-352,379-385,408-421
1evl d1evlc1 C:548-566,591-597,620-635
1evk d1evka1 A:548-566,591-597,620-635
1evl d1evla1 A:548-566,591-597,620-635
1qf6 d1qf6a1 A:548-566,591-597,620-635
1adj d1adja1 A:337-352,379-385,408-421
1ady d1adya1 A:337-352,379-385,408-421
1ady d1adyd1 D:337-352,379-385,408-421
1ady d1adyb1 B:337-352,379-385,408-421
1adj d1adjd1 D:337-352,379-385,408-421
1adj d1adjb1 B:337-352,379-385,408-421
1adj d1adjc1 C:337-352,379-385,408-421
1ady d1adyc1 C:337-352,379-385,408-421
1v95 d1v95a_ A:17-35,62-67,93-114
1g5h d1g5hd1 D:365-384,412-418,441-459
1g5i d1g5id1 D:365-384,412-418,441-459
2g4c d2g4ca1 A:391-410,438-444,467-485
2g4c d2g4cb1 B:391-410,438-444,467-485
1kog d1kogc1 C:548-566,568-573,620-635
1kog d1kogf1 F:548-566,568-573,620-635
1kog d1kogg1 G:548-566,568-573,620-635
1kog d1koga1 A:548-566,568-573,620-635
1kog d1koge1 E:548-566,568-573,620-635
1kog d1kogh1 H:548-566,568-573,620-635
1kog d1kogd1 D:548-566,568-573,620-635
1kog d1kogb1 B:548-566,568-573,620-635
1g5h d1g5hb1 B:365-384,412-418,441-460
1g5i d1g5ib1 B:365-384,412-418,441-460
2g4c d2g4cd1 D:391-410,438-445,467-485
2g4c d2g4cc1 C:391-410,438-445,467-485
1h4v d1h4vb1 B:337-352,356-360,408-421
1adj d1adjd1 D:337-352,356-360,408-421
1adj d1adja1 A:337-352,356-360,408-421
1adj d1adjb1 B:337-352,356-360,408-421
1adj d1adjc1 C:337-352,356-360,408-421
1ady d1adyd1 D:337-352,356-360,408-421
1ady d1adya1 A:337-352,356-360,408-421
1ady d1adyb1 B:337-352,356-360,408-421
1ady d1adyc1 C:337-352,356-360,408-421
1g5h d1g5hd1 D:365-384,386-391,441-459
1g5i d1g5id1 D:365-384,386-391,441-459
1g5i d1g5ia1 A:365-384,412-418,441-464
2g4c d2g4cb1 B:391-410,412-417,467-485
2g4c d2g4ca1 A:391-410,412-417,467-485
1g5h d1g5ha1 A:365-384,412-418,441-466
1g5i d1g5ic1 C:365-384,412-418,441-466
1g5h d1g5hb1 B:365-384,386-391,441-460
1g5h d1g5hc1 C:365-384,412-418,441-466
1g5i d1g5ib1 B:365-384,386-391,441-460
1g5i d1g5ia1 A:365-384,386-391,441-464
1g5h d1g5ha1 A:365-384,386-391,441-466
1g5i d1g5ic1 C:365-384,386-391,441-466
1g5h d1g5hc1 C:365-384,386-391,441-466
1h4t d1h4td1 D:297-319,345-351,376-404
1h4t d1h4tb1 B:297-319,345-351,376-404
1h4t d1h4ta1 A:297-319,345-351,376-404
1hc7 d1hc7d1 D:297-319,345-351,376-405
1hc7 d1hc7b1 B:297-319,345-351,376-405
1hc7 d1hc7c1 C:297-319,345-351,376-405
1hc7 d1hc7a1 A:297-319,345-351,376-405
1h4t d1h4td1 D:297-319,321-325,376-404
1h4t d1h4ta1 A:297-319,321-325,376-404
1h4t d1h4tb1 B:297-319,321-325,376-404
1nj1 d1nj1a1 A:307-326,351-357,383-412
1nj6 d1nj6a1 A:307-326,351-357,383-412
1nj5 d1nj5a1 A:307-326,351-357,383-412
1h4q d1h4qa1 A:297-319,321-325,376-405
1h4q d1h4qa1 A:297-319,345-352,376-405
1h4s d1h4sa1 A:297-319,345-352,376-405
1h4s d1h4sa1 A:297-319,321-325,376-405
1hc7 d1hc7b1 B:297-319,321-325,376-405
1hc7 d1hc7d1 D:297-319,321-325,376-405
1hc7 d1hc7a1 A:297-319,321-325,376-405
1hc7 d1hc7c1 C:297-319,321-325,376-405
1nj2 d1nj2a1 A:307-326,351-357,383-412
41. d.199.1 DNA-binding C-terminal domain of the transcription factor MotA
MotA C-terminal domain-like alpha-beta(4)-alpha-beta(2)-alpha; 2 layers: alpha/beta
1kaf d1kafd_ D:108-125,148-156,197-211
1kaf d1kafe_ E:109-125,148-156,197-211
1kaf d1kafb_ B:107-125,148-156,197-211
1kaf d1kaff_ F:108-125,148-156,197-211
1kaf d1kafc_ C:107-125,148-156,197-211
1kaf d1kafa_ A:107-125,148-156,197-211
42. c.92.2 "Helical backbone" metal receptor contains a long alpha helical insertion in the interdomain linker !
Chelatase-like duplication: tandem repeat of two domains; 3 layers (a/b/a); parallel beta-sheet of 4 strands, order 2134
1toa d1toab_ B:40-52,84-89,137-157
1toa d1toaa_ A:40-52,84-89,137-157
1k0f d1k0fa_ A:40-52,84-90,137-157
1pq4 d1pq4a_ A:55-67,99-105,183-203
1pq4 d1pq4b_ B:55-67,99-105,183-203
1psz d1psza_ A:39-51,83-88,143-163
1n4a d1n4ab_ B:5008-5019,5081-5086,5089-5104
1xvl d1xvla1 A:61-73,105-110,158-178
1xvl d1xvlb1 B:61-73,105-110,158-178
1l5h d1l5ha_ A:62-76,177-185,190-209
1n4a d1n4aa_ A:8-19,81-86,89-104
2phz d2phza1 A:43-54,98-104,126-142
1qgu d1qgub_ B:68-81,143-150,190-208
1qh1 d1qh1b_ B:68-81,143-150,190-208
2etv d2etvb1 B:44-56,110-115,146-161
1n4d d1n4db_ B:1152-1162,1188-1194,1226-1243
2etv d2etva1 A:44-56,110-115,146-161
1n4a d1n4ab_ B:5008-5019,5058-5064,5089-5104
1n2z d1n2zb_ B:30-41,80-85,111-127
1n2z d1n2za_ A:30-41,80-85,111-127
1qh8 d1qh8b_ B:68-80,143-150,190-208
1n4d d1n4da_ A:8-19,58-63,89-104
1n4a d1n4aa_ A:8-19,58-64,89-104
1h1l d1h1lb_ B:68-80,143-150,190-208
1l5h d1l5ha_ A:62-76,146-154,190-209
1n2c d1n2cb_ B:70-83,145-152,192-210
1n2c d1n2cd_ D:70-83,145-152,192-210
1n2c d1n2cd_ D:233-248,288-294,321-337
2afk d2afka1 A:62-76,177-184,190-211
1n4d d1n4db_ B:1008-1019,1058-1063,1089-1105
2afk d2afkc1 C:62-76,177-184,190-211
1n2c d1n2cb_ B:233-248,288-294,321-337
1g21 d1g21a_ A:233-246,269-274,301-317
1mio d1mioc_ C:53-67,168-176,181-201
1m34 d1m34a_ A:62-76,177-184,190-211
1n2z d1n2za_ A:174-184,210-216,248-265
1g21 d1g21c_ C:233-246,269-274,301-317
1mio d1mioa_ A:53-67,168-176,181-198
1n2c d1n2cd_ D:70-83,180-185,192-210
1n2c d1n2cb_ B:70-83,180-185,192-210
2min d2mind_ D:233-248,288-294,321-337
2qi9 d2qi9f1 F:30-41,80-85,111-126
1g20 d1g20d_ D:233-248,288-294,321-337
1m34 d1m34i_ I:62-76,177-184,190-211
2chu d2chua1 A:57-68,130-136,141-158
1m1y d1m1yi_ I:62-76,177-185,190-211
1efd d1efdn_ N:42-53,118-123,129-146
2min d2minb_ B:233-248,288-294,321-337
1k7s d1k7sn_ N:42-53,118-123,129-146
1esz d1esza_ A:42-53,118-123,129-146
2afk d2afkd1 D:233-248,288-294,321-337
1g20 d1g20a_ A:62-76,177-184,190-211
1g20 d1g20b_ B:233-248,288-294,321-337
1n2c d1n2ca_ A:233-246,269-274,301-317
1n2c d1n2cc_ C:233-246,269-274,301-317
1g20 d1g20c_ C:62-76,177-184,190-211
1m34 d1m34c_ C:62-76,177-184,190-211
1m1y d1m1yc_ C:62-76,177-185,190-211
1m1y d1m1yk_ K:62-76,177-185,190-211
1m34 d1m34k_ K:62-76,177-184,190-211
1m1y d1m1yb_ B:233-248,288-294,321-337
1m1y d1m1ya_ A:62-76,177-185,190-211
2afk d2afkb1 B:233-248,288-294,321-337
2afh d2afhd1 D:233-248,288-294,321-337
1g20 d1g20a_ A:233-246,269-274,301-317
3min d3mind_ D:233-248,288-294,321-337
2min d2mina_ A:233-246,269-274,301-317
2afi d2afii1 I:233-246,269-274,301-317
3min d3minb_ B:233-248,288-294,321-337
2afi d2afic1 C:233-246,269-274,301-317
2min d2minc_ C:233-246,269-274,301-317
2afi d2afia1 A:233-246,269-274,301-317
1m34 d1m34a_ A:233-246,269-274,301-317
1m1y d1m1yl_ L:233-248,288-294,321-337
1m1y d1m1yd_ D:233-248,288-294,321-337
1fp4 d1fp4b_ B:233-248,288-294,321-337
1fp4 d1fp4d_ D:233-248,288-294,321-337
1m1n d1m1ne_ E:62-76,177-185,190-211
2afi d2afik1 K:233-246,269-274,301-317
2afh d2afhb1 B:233-248,288-294,321-337
1m1y d1m1yj_ J:233-248,288-294,321-337
1m34 d1m34b_ B:233-248,288-294,321-337
1m1n d1m1ng_ G:62-76,177-185,190-211
1n4d d1n4da_ A:152-162,188-193,226-243
2qi9 d2qi9f1 F:174-184,210-216,248-265
1m1y d1m1yk_ K:233-246,269-274,301-317
1m34 d1m34k_ K:233-246,269-274,301-317
1m1n d1m1na_ A:233-246,269-274,301-317
2afh d2afha1 A:233-246,269-274,301-317
1fp4 d1fp4a_ A:62-76,177-185,190-211
1fp4 d1fp4c_ C:62-76,177-185,190-211
1qh8 d1qh8d_ D:68-81,143-150,190-210
1m1n d1m1nc_ C:62-76,177-185,190-211
1m1n d1m1nf_ F:233-248,288-294,321-337
2afh d2afhc1 C:62-76,177-185,190-211
1fp4 d1fp4a_ A:233-246,269-274,301-317
1l5h d1l5hb_ B:233-248,288-294,321-337
2afh d2afhc1 C:233-246,269-274,301-317
1fp4 d1fp4c_ C:233-246,269-274,301-317
1m1y d1m1yc_ C:233-246,269-274,301-317
1qh1 d1qh1d_ D:68-81,143-150,190-210
1n2z d1n2zb_ B:174-184,210-216,248-266
3min d3mina_ A:62-76,177-185,190-211
1m1n d1m1na_ A:62-76,177-185,190-211
1m1n d1m1ng_ G:233-246,269-274,301-317
1m1y d1m1ya_ A:233-246,269-274,301-317
1g21 d1g21d_ D:70-83,145-152,192-213
1h1l d1h1la_ A:61-75,176-184,189-210
3min d3mina_ A:233-246,269-274,301-317
1k2v d1k2vn_ N:42-53,118-123,129-146
1g21 d1g21b_ B:70-83,145-152,192-213
1m34 d1m34c_ C:233-246,269-274,301-317
1g21 d1g21c_ C:62-76,177-184,190-211
1m1y d1m1yi_ I:233-246,269-274,301-317
2afh d2afha1 A:62-76,177-185,190-211
2afk d2afka1 A:233-246,269-274,301-317
1l5h d1l5ha_ A:233-246,269-274,301-317
1qh8 d1qh8a_ A:231-244,267-272,299-315
2min d2minc_ C:62-76,177-185,190-211
2phz d2phza1 A:43-54,119-124,126-142
1m1n d1m1nb_ B:233-248,288-294,321-337
2afk d2afkc1 C:233-246,269-274,301-317
1m1n d1m1nd_ D:233-248,288-294,321-337
1m34 d1m34j_ J:233-248,288-294,321-337
1m1n d1m1nc_ C:233-246,269-274,301-317
1m1n d1m1nh_ H:233-248,288-294,321-337
2afi d2afii1 I:62-76,177-185,190-211
1m34 d1m34l_ L:233-248,288-294,321-337
2afi d2afic1 C:62-76,177-185,190-211
1n2c d1n2ca_ A:62-76,177-184,190-211
1n2c d1n2cc_ C:62-76,177-184,190-211
2afi d2afik1 K:62-76,177-185,190-211
2afi d2afia1 A:62-76,177-185,190-211
2min d2mina_ A:62-76,177-185,190-211
1m34 d1m34i_ I:233-246,269-274,301-317
1qh1 d1qh1a_ A:231-244,267-272,299-315
2chu d2chua1 A:57-68,111-117,141-158
1m1n d1m1ne_ E:233-246,269-274,301-317
1m34 d1m34d_ D:233-248,288-294,321-337
1h1l d1h1lc_ C:61-75,176-184,189-210
1g20 d1g20c_ C:233-246,269-274,301-317
1qgu d1qgua_ A:231-244,267-272,299-315
2afi d2afib1 B:233-248,289-294,321-337
1qgu d1qgua_ A:61-75,176-184,189-210
1qh1 d1qh1a_ A:61-75,176-184,189-210
1g21 d1g21a_ A:62-76,177-184,190-211
1qgu d1qguc_ C:61-75,176-184,189-210
1qh8 d1qh8a_ A:61-75,176-184,189-210
2afi d2afij1 J:233-248,289-294,321-337
1h1l d1h1lc_ C:231-244,267-272,299-315
1h1l d1h1ld_ D:68-81,143-150,190-210
2afi d2afid1 D:233-248,289-294,321-337
1qh8 d1qh8c_ C:61-75,176-184,189-210
1qh1 d1qh1c_ C:61-75,176-184,189-210
2afi d2afil1 L:233-248,289-294,321-337
3min d3minc_ C:233-246,269-274,301-317
1qh8 d1qh8c_ C:231-244,267-272,299-315
1h1l d1h1la_ A:231-244,267-272,299-315
1n4a d1n4aa_ A:152-162,188-193,226-244
1qgu d1qguc_ C:231-244,267-272,299-315
1qh1 d1qh1c_ C:231-244,267-272,299-315
1efd d1efdn_ N:42-53,98-104,129-146
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1n4a d1n4ab_ B:5152-5162,5188-5193,5226-5244
1qh1 d1qh1b_ B:68-81,177-183,190-208
1g20 d1g20d_ D:70-83,145-152,192-213
1k7s d1k7sn_ N:42-53,98-104,129-146
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1m1n d1m1nf_ F:70-83,145-152,192-213
1m1n d1m1nh_ H:70-83,145-152,192-213
1k2v d1k2vn_ N:42-53,98-104,129-146
1m1n d1m1nd_ D:70-83,145-152,192-213
1m1y d1m1yl_ L:70-82,145-152,192-213
1mio d1miob_ B:23-35,98-105,145-162
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1m1y d1m1yd_ D:70-81,145-152,192-213
2afi d2afia1 A:62-76,146-154,190-211
1m1y d1m1yj_ J:70-81,145-152,192-213
1m1y d1m1yi_ I:62-76,146-154,190-211
1m1y d1m1yc_ C:62-76,146-154,190-211
2afk d2afkb1 B:70-83,145-152,192-213
2afk d2afkd1 D:70-83,145-152,192-213
1m1y d1m1yb_ B:70-81,145-152,192-213
1m1y d1m1ya_ A:62-76,146-154,190-211
1qh8 d1qh8d_ D:68-81,177-183,190-210
1fp4 d1fp4b_ B:70-83,145-152,192-213
1m1y d1m1yk_ K:62-76,146-154,190-211
1qh1 d1qh1d_ D:68-81,177-183,190-210
1l5h d1l5hb_ B:70-83,145-152,192-213
1fp4 d1fp4c_ C:62-76,146-154,190-211
2min d2minc_ C:62-76,146-154,190-211
1fp4 d1fp4a_ A:62-76,146-154,190-211
1m1n d1m1ne_ E:62-76,146-154,190-211
1m1n d1m1nb_ B:70-82,145-152,192-213
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1m1n d1m1ng_ G:62-76,146-154,190-211
3min d3mina_ A:62-76,146-154,190-211
1h1l d1h1ld_ D:68-81,177-183,190-210
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1m1n d1m1nc_ C:62-76,146-154,190-211
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2afh d2afhb1 B:70-82,145-152,192-213
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1m1n d1m1na_ A:62-76,146-154,190-211
3min d3mind_ D:70-82,145-152,192-213
2afi d2afib1 B:70-83,145-152,192-213
2min d2minb_ B:70-82,145-152,192-213
2afh d2afhc1 C:62-76,146-154,190-211
2min d2mina_ A:62-76,146-154,190-211
1mio d1mioa_ A:220-233,256-261,288-304
1fp4 d1fp4d_ D:70-82,145-152,192-213
2afh d2afha1 A:62-76,146-154,190-211
2afi d2afid1 D:70-83,145-152,192-213
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1m34 d1m34b_ B:70-82,145-152,192-213
1h1l d1h1lb_ B:229-244,284-290,317-333
1mio d1mioc_ C:53-67,137-145,181-201
1m1n d1m1nh_ H:70-83,180-185,192-213
1m1n d1m1nf_ F:70-83,180-185,192-213
2afi d2afij1 J:70-83,145-152,192-213
1toa d1toab_ B:40-52,108-113,137-157
1g20 d1g20d_ D:70-83,180-185,192-213
1toa d1toaa_ A:40-52,108-113,137-157
1m1n d1m1nd_ D:70-83,180-185,192-213
1mio d1miod_ D:23-35,37-44,145-162
1m34 d1m34j_ J:70-83,180-185,192-213
1l5h d1l5hb_ B:70-83,180-185,192-213
1qh1 d1qh1b_ B:68-81,82-89,190-208
2qi9 d2qi9f1 F:30-41,103-107,111-126
3min d3minb_ B:70-83,180-185,192-213
2afk d2afkc1 C:62-76,146-153,190-211
2afk d2afkb1 B:70-83,180-185,192-213
1qgu d1qgub_ B:68-81,82-89,190-208
1n4d d1n4db_ B:1008-1019,1081-1085,1089-1105
2afk d2afka1 A:62-76,146-153,190-211
1g20 d1g20a_ A:62-76,146-153,190-211
1m1y d1m1yl_ L:70-82,180-185,192-213
2afk d2afkd1 D:70-83,180-185,192-213
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1g20 d1g20c_ C:62-76,146-153,190-211
1g21 d1g21b_ B:233-248,250-254,321-337
1m34 d1m34k_ K:62-76,146-153,190-211
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1n2c d1n2cd_ D:233-248,250-254,321-337
1g20 d1g20d_ D:233-248,250-254,321-337
1g20 d1g20b_ B:233-248,250-254,321-337
1n2c d1n2cb_ B:233-248,250-254,321-337
1mio d1mioc_ C:220-233,256-261,288-304
1m34 d1m34a_ A:62-76,146-153,190-211
1mio d1miob_ B:23-35,37-44,145-162
1n2c d1n2cd_ D:70-83,84-91,192-210
1n2c d1n2cb_ B:70-83,84-91,192-210
1h1l d1h1lc_ C:61-75,145-153,189-210
1fp4 d1fp4b_ B:70-83,180-185,192-213
1k0f d1k0fa_ A:40-52,108-115,137-157
1m1n d1m1nb_ B:70-82,180-185,192-213
1h1l d1h1la_ A:61-75,145-153,189-210
1g20 d1g20b_ B:70-82,180-185,192-213
1m34 d1m34d_ D:70-82,180-185,192-213
1m34 d1m34i_ I:62-76,146-153,190-211
1m34 d1m34c_ C:62-76,146-153,190-211
2min d2mind_ D:233-248,250-254,321-337
1qh8 d1qh8a_ A:61-75,145-153,189-210
1n4d d1n4da_ A:8-19,81-85,89-104
1mio d1mioa_ A:53-67,137-145,181-198
1qh8 d1qh8b_ B:68-80,82-89,190-208
2min d2minb_ B:70-82,180-185,192-213
1m34 d1m34b_ B:70-82,180-185,192-213
1qgu d1qgua_ A:61-75,145-153,189-210
1m34 d1m34l_ L:70-82,180-185,192-213
1qh8 d1qh8c_ C:61-75,145-153,189-210
2afh d2afhd1 D:70-82,180-185,192-213
2afh d2afhb1 B:70-82,180-185,192-213
1qgu d1qguc_ C:61-75,145-153,189-210
1qh1 d1qh1a_ A:61-75,145-153,189-210
1n2z d1n2za_ A:30-41,103-107,111-127
2afi d2afib1 B:70-83,180-185,192-213
1n2z d1n2zb_ B:30-41,103-107,111-127
1n2c d1n2ca_ A:62-76,146-153,190-211
1n2c d1n2cc_ C:62-76,146-153,190-211
1g21 d1g21d_ D:233-248,250-254,321-337
1qh1 d1qh1c_ C:61-75,145-153,189-210
2min d2minb_ B:233-248,250-254,321-337
3min d3mind_ D:70-82,180-185,192-213
1h1l d1h1lb_ B:68-80,82-89,190-208
2afi d2afid1 D:70-83,180-185,192-213
2chu d2chub1 B:204-214,242-249,294-310
1fp4 d1fp4d_ D:70-82,180-185,192-213
2afi d2afil1 L:70-83,180-185,192-213
1fp4 d1fp4d_ D:233-248,250-254,321-337
1fp4 d1fp4b_ B:233-248,250-254,321-337
1m34 d1m34j_ J:233-248,250-254,321-337
3min d3minb_ B:233-248,250-254,321-337
2afi d2afij1 J:70-83,180-185,192-213
1m34 d1m34d_ D:233-248,250-254,321-337
1m34 d1m34b_ B:233-248,250-254,321-337
2afh d2afhb1 B:233-248,250-254,321-337
2phz d2phza1 A:191-202,229-235,280-296
2afh d2afhd1 D:233-248,250-254,321-337
2afi d2afib1 B:233-248,250-254,321-337
3min d3mind_ D:233-248,250-254,321-337
2afi d2afij1 J:233-248,250-254,321-337
2afk d2afkd1 D:233-248,250-254,321-337
2afi d2afil1 L:233-248,250-254,321-337
2afi d2afid1 D:233-248,250-254,321-337
1m34 d1m34l_ L:233-248,250-254,321-337
2chu d2chua1 A:206-214,242-249,294-310
1m1n d1m1nf_ F:233-248,250-254,321-337
2afk d2afkb1 B:233-248,250-254,321-337
1g21 d1g21c_ C:62-76,146-153,190-211
1qh8 d1qh8b_ B:68-80,177-183,190-208
1m1n d1m1nd_ D:233-248,250-254,321-337
1m1n d1m1nh_ H:233-248,250-254,321-337
1m1n d1m1nb_ B:233-248,250-254,321-337
3min d3minc_ C:62-76,146-154,190-213
1h1l d1h1lb_ B:68-80,177-183,190-208
1qh8 d1qh8d_ D:229-244,246-250,317-333
1h1l d1h1ld_ D:229-244,246-250,317-333
1m1y d1m1yb_ B:233-248,250-254,321-337
1m1y d1m1yl_ L:233-248,250-254,321-337
1g21 d1g21b_ B:70-83,180-184,192-213
1m1y d1m1yj_ J:233-248,250-254,321-337
1g21 d1g21a_ A:62-76,146-153,190-211
1m1y d1m1yd_ D:233-248,250-254,321-337
1qgu d1qgud_ D:229-244,246-250,317-333
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1h1l d1h1lb_ B:229-244,246-250,317-333
1mio d1miod_ D:180-195,197-201,269-285
1g21 d1g21d_ D:70-83,180-184,192-213
1qh8 d1qh8b_ B:229-244,246-250,317-333
1m1y d1m1yd_ D:70-81,180-185,192-213
1qgu d1qgub_ B:229-244,246-250,317-333
1qh1 d1qh1b_ B:229-244,246-250,317-333
1qgu d1qgud_ D:68-80,177-183,190-210
1l5h d1l5hb_ B:233-248,250-254,321-337
1m1y d1m1yj_ J:70-81,180-185,192-213
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1l5h d1l5ha_ A:364-371,419-424,452-469
1mio d1miob_ B:180-195,197-201,267-285
1g21 d1g21b_ B:233-248,288-293,321-337
1g21 d1g21d_ D:233-248,288-293,321-337
2afi d2afia1 A:355-371,419-423,452-469
2afi d2afii1 I:355-371,419-423,452-469
2afi d2afic1 C:355-371,419-423,452-469
2afi d2afik1 K:355-371,419-423,452-469
1psz d1psza_ A:39-51,114-118,143-163
1mio d1miob_ B:23-35,132-140,145-162
1pq4 d1pq4a_ A:55-67,123-129,183-203
1mio d1miob_ B:180-195,235-242,267-285
1qh8 d1qh8d_ D:229-244,284-289,317-333
1mio d1miod_ D:23-35,132-140,145-162
3min d3mind_ D:192-213,223-229,277-287
1qgu d1qgud_ D:229-244,284-289,317-333
1pq4 d1pq4b_ B:55-67,123-129,183-203
2chu d2chub1 B:57-68,130-135,141-158
1qh1 d1qh1b_ B:229-244,284-289,317-333
1qh1 d1qh1d_ D:229-244,284-289,317-333
1g21 d1g21d_ D:70-83,84-91,192-213
1g20 d1g20b_ B:192-213,223-229,277-287
1xvl d1xvla1 A:61-73,129-133,158-178
1h1l d1h1ld_ D:68-81,82-89,190-210
1qh8 d1qh8d_ D:68-81,82-89,190-210
1h1l d1h1ld_ D:229-244,284-289,317-333
1qh1 d1qh1d_ D:68-81,82-89,190-210
1g20 d1g20d_ D:192-213,223-229,277-287
2afk d2afkd1 D:192-213,223-229,277-287
2afi d2afij1 J:192-213,223-229,277-287
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2afk d2afkb1 B:192-213,223-229,277-287
1qgu d1qgud_ D:68-80,82-89,190-210
1m1n d1m1nd_ D:192-213,223-229,277-287
1m1n d1m1nb_ B:192-213,223-229,277-287
1g20 d1g20d_ D:70-83,84-91,192-213
1m1n d1m1nf_ F:192-213,223-229,277-287
1m1n d1m1nh_ H:192-213,223-229,277-287
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2afi d2afid1 D:192-213,223-229,277-287
1m1n d1m1nf_ F:70-83,84-91,192-213
1m34 d1m34d_ D:192-213,223-229,277-287
1m34 d1m34j_ J:70-83,84-91,192-213
1g20 d1g20b_ B:70-82,84-91,192-213
1m1n d1m1nh_ H:70-83,84-91,192-213
1l5h d1l5hb_ B:70-83,84-91,192-213
3min d3minb_ B:70-83,84-91,192-213
1n2z d1n2za_ A:174-184,184-188,248-265
2min d2mind_ D:70-83,84-91,192-213
1m1n d1m1nd_ D:70-83,84-91,192-213
1fp4 d1fp4b_ B:70-83,84-91,192-213
2min d2minb_ B:70-82,84-91,192-213
1xvl d1xvlb1 B:61-73,129-133,158-178
1m1n d1m1nb_ B:70-82,84-91,192-213
1m34 d1m34d_ D:70-82,84-91,192-213
1m34 d1m34l_ L:70-82,84-91,192-213
1m1y d1m1yl_ L:70-82,84-91,192-213
1n2z d1n2zb_ B:174-184,184-188,248-266
2afh d2afhd1 D:70-82,84-91,192-213
2afh d2afhb1 B:70-82,84-91,192-213
2afk d2afkd1 D:70-83,84-91,192-213
2afk d2afkb1 B:70-83,84-91,192-213
1n4d d1n4da_ A:152-162,162-166,226-243
1g20 d1g20a_ A:356-371,419-423,452-469
1fp4 d1fp4d_ D:70-82,84-91,192-213
3min d3mind_ D:70-82,84-91,192-213
1m34 d1m34b_ B:70-82,84-91,192-213
1n4a d1n4ab_ B:5152-5162,5162-5166,5226-5244
1mio d1mioc_ C:344-359,459-463,492-509
1g21 d1g21b_ B:192-213,223-228,277-287
1qh8 d1qh8b_ B:229-244,285-289,317-333
1qh8 d1qh8a_ A:354-369,417-421,450-467
1g21 d1g21c_ C:356-371,419-423,452-469
1qh8 d1qh8c_ C:354-369,417-421,450-467
1m1y d1m1yj_ J:70-81,84-91,192-213
1n2c d1n2cc_ C:356-371,419-423,452-469
1n2c d1n2ca_ A:356-371,419-423,452-469
1m1y d1m1yd_ D:70-81,84-91,192-213
1qh1 d1qh1a_ A:354-369,417-421,450-467
1m1y d1m1yb_ B:70-81,84-91,192-213
1mio d1mioa_ A:344-359,459-463,492-509
2afi d2afib1 B:70-83,84-91,192-213
2etv d2etvb1 B:211-219,245-252,291-308
1g21 d1g21b_ B:70-83,84-92,192-213
2etv d2etva1 A:211-219,245-252,291-308
2afi d2afil1 L:70-83,84-91,192-213
2afi d2afid1 D:70-83,84-91,192-213
1qh1 d1qh1c_ C:354-369,417-421,450-467
1g20 d1g20c_ C:356-371,419-423,452-469
1qgu d1qgub_ B:229-244,285-289,317-333
2afi d2afij1 J:70-83,84-91,192-213
1qgu d1qgua_ A:354-369,417-421,450-467
1h1l d1h1lc_ C:354-369,417-421,450-467
1qgu d1qguc_ C:354-369,417-421,450-467
1m1n d1m1ng_ G:356-371,419-423,452-469
1h1l d1h1la_ A:354-369,417-421,450-467
1m34 d1m34i_ I:356-371,419-423,452-469
1m1n d1m1na_ A:356-371,419-423,452-469
1g21 d1g21a_ A:356-371,419-423,452-469
1m34 d1m34k_ K:356-371,419-423,452-469
2afh d2afha1 A:356-371,419-423,452-469
1fp4 d1fp4c_ C:356-371,419-423,452-469
1m1n d1m1ne_ E:356-371,419-423,452-469
2afh d2afhc1 C:356-371,419-423,452-469
3min d3mina_ A:356-371,419-423,452-469
1fp4 d1fp4a_ A:356-371,419-423,452-469
3min d3minc_ C:356-371,419-423,452-469
1m34 d1m34a_ A:356-371,419-423,452-469
1m1n d1m1nc_ C:356-371,419-423,452-469
2min d2mina_ A:356-371,419-423,452-469
1mio d1miob_ B:320-335,387-392,426-449
1m34 d1m34c_ C:356-371,419-423,452-469
1mio d1miod_ D:320-335,387-392,426-449
2min d2minc_ C:356-371,419-423,452-469
2afk d2afka1 A:356-371,419-423,452-469
2afk d2afkc1 C:356-371,419-423,452-469
2etv d2etvb1 B:211-219,280-284,291-308
1g21 d1g21d_ D:192-213,223-228,277-288
2etv d2etva1 A:211-219,280-284,291-308
1m1y d1m1yd_ D:372-387,440-444,486-511
1m1y d1m1yl_ L:372-387,440-444,486-511
1m1y d1m1yj_ J:372-387,440-444,486-511
1m1y d1m1yb_ B:372-387,440-444,486-511
2min d2mind_ D:372-387,440-445,486-511
2min d2minb_ B:372-387,440-445,486-511
1g20 d1g20d_ D:372-387,440-445,486-511
2afh d2afhb1 B:372-387,440-445,486-511
3min d3minb_ B:372-387,440-445,486-511
1fp4 d1fp4b_ B:372-387,440-445,486-511
2afh d2afhd1 D:372-387,440-445,486-511
1fp4 d1fp4d_ D:372-387,440-445,486-511
3min d3mind_ D:372-387,440-445,486-511
1m1n d1m1nd_ D:372-387,440-445,486-511
1m34 d1m34l_ L:372-387,440-444,486-511
1m1n d1m1nb_ B:372-387,440-445,486-511
1g20 d1g20b_ B:372-387,440-445,486-511
1m1n d1m1nh_ H:372-387,440-445,486-511
1g20 d1g20d_ D:372-387,464-470,486-511
2afi d2afij1 J:372-387,440-444,486-511
2afi d2afil1 L:372-387,440-444,486-511
1m34 d1m34b_ B:372-387,440-444,486-511
2afi d2afib1 B:372-387,440-444,486-511
2afi d2afid1 D:372-387,440-444,486-511
2afk d2afkb1 B:372-387,440-445,486-511
2afk d2afkd1 D:372-387,440-445,486-511
1m1n d1m1nf_ F:372-387,440-444,486-511
1l5h d1l5hb_ B:372-387,440-444,486-511
1g21 d1g21b_ B:372-387,440-444,486-511
1g21 d1g21d_ D:372-387,440-444,486-511
2afk d2afkb1 B:372-387,465-470,486-511
2afk d2afkd1 D:372-387,465-470,486-511
1g20 d1g20b_ B:372-387,464-470,486-511
1qh8 d1qh8d_ D:368-383,460-466,482-507
1h1l d1h1lb_ B:368-383,436-441,482-507
1qh8 d1qh8d_ D:368-383,436-441,482-507
1h1l d1h1lb_ B:368-383,461-466,482-507
1n2c d1n2cd_ D:372-387,440-444,486-512
1n2c d1n2cb_ B:372-387,440-444,486-512
1qh1 d1qh1b_ B:368-383,461-466,482-507
1qh1 d1qh1b_ B:368-383,436-441,482-507
1m34 d1m34j_ J:372-387,440-444,486-512
1qh8 d1qh8b_ B:368-383,436-440,482-507
2qi9 d2qi9f1 F:128-154,155-161,248-265
1h1l d1h1ld_ D:368-383,436-440,482-507
1xvl d1xvlb1 B:221-231,232-238,306-323
1qgu d1qgud_ D:368-383,436-440,482-507
1qh1 d1qh1d_ D:368-383,436-440,482-507
1m34 d1m34d_ D:372-387,440-444,486-512
1qgu d1qgub_ B:368-383,436-440,482-507
1k0f d1k0fa_ A:202-210,211-217,290-307
1k0f d1k0fa_ A:159-189,193-199,290-307
1xvl d1xvlb1 B:180-210,214-220,306-323
1toa d1toab_ B:159-189,193-199,290-307
1toa d1toaa_ A:159-189,193-199,290-307
1toa d1toab_ B:202-210,211-217,290-307
1toa d1toaa_ A:202-210,211-217,290-307
1psz d1psza_ A:162-195,200-205,291-309
1xvl d1xvla1 A:180-210,214-220,306-325
1n2c d1n2cd_ D:341-365,363-371,486-512
1n2c d1n2cb_ B:341-365,363-371,486-512
1mio d1miob_ B:289-311,311-319,426-449
1m1y d1m1yd_ D:341-363,363-371,486-511
1m1y d1m1yj_ J:341-363,363-371,486-511
1g20 d1g20d_ D:341-363,363-371,486-511
1m1y d1m1yb_ B:341-363,363-371,486-511
1g20 d1g20b_ B:341-363,363-371,486-511
2min d2minb_ B:341-363,363-371,486-511
3min d3minb_ B:341-363,363-371,486-511
2min d2mind_ D:341-363,363-371,486-511
3min d3mind_ D:341-363,363-371,486-511
1g21 d1g21b_ B:341-363,363-371,486-511
1fp4 d1fp4d_ D:341-363,363-371,486-511
1fp4 d1fp4b_ B:341-363,363-371,486-511
2afi d2afid1 D:341-363,363-371,486-511
2afi d2afib1 B:341-363,363-371,486-511
2afi d2afil1 L:341-363,363-371,486-511
2afi d2afij1 J:341-363,363-371,486-511
1m1n d1m1nb_ B:341-363,363-371,486-511
1g21 d1g21d_ D:341-363,363-371,486-511
2afh d2afhb1 B:341-363,363-371,486-511
2afh d2afhd1 D:341-363,363-371,486-511
1m1n d1m1nh_ H:341-363,363-371,486-511
1m1n d1m1nf_ F:341-363,363-371,486-511
1m1n d1m1nd_ D:341-363,363-371,486-511
1m34 d1m34b_ B:341-363,363-371,486-511
1l5h d1l5hb_ B:341-363,363-371,486-511
2afk d2afkd1 D:341-363,363-371,486-511
2afk d2afkb1 B:341-363,363-371,486-511
1m34 d1m34l_ L:341-363,363-371,486-511
1m34 d1m34j_ J:341-363,363-371,486-512
1m34 d1m34d_ D:341-363,363-371,486-512
1k0f d1k0fa_ A:159-189,211-217,290-307
1toa d1toab_ B:159-189,211-217,290-307
1toa d1toaa_ A:159-189,211-217,290-307
43. c.23.1 CheY-like
Flavodoxin-like 3 layers, a/b/a; parallel beta-sheet of 5 strand, order 21345
2ayx d2ayxa2 A:715-730,745-751,788-800
2ayy d2ayya1 A:715-730,745-751,787-800
1i3c d1i3ca_ A:17-31,63-69,123-142
1i3c d1i3cb_ B:17-31,63-69,123-142
2ayx d2ayxa2 A:715-730,760-766,788-800
1jlk d1jlkb_ B:17-31,63-69,123-143
1nat d1nata_ A:12-27,49-55,107-120
2ayx d2ayxa2 A:715-730,730-736,788-800
2ftk d2ftkg1 G:1612-1627,1649-1654,1707-1719
1srr d1srrc_ C:12-27,49-55,107-120
1pey d1peya_ A:12-27,49-55,107-120
1mb0 d1mb0a_ A:11-26,48-54,108-121
1srr d1srra_ A:12-27,49-55,107-120
1y7p d1y7pb1 B:93-115,143-151,191-205
1y7p d1y7pa1 A:93-115,143-151,191-205
1pux d1puxa_ A:13-27,49-54,107-120
1f51 d1f51e_ E:1212-1227,1249-1255,1307-1320
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2v0n d2v0na1 A:11-26,48-54,108-124
1dbw d1dbwa_ A:12-27,48-55,107-123
2pl9 d2pl9a1 A:14-29,82-88,112-128
1ymv d1ymva_ A:14-29,52-58,112-128
1u8t d1u8td_ D:14-29,82-88,112-128
1ehc d1ehca_ A:14-29,52-58,112-128
1fqw d1fqwb_ B:14-29,52-58,112-128
1a0o d1a0oc_ C:14-29,82-88,112-128
2b4a d2b4aa1 A:12-27,28-35,105-117
2che d2chea_ A:14-29,82-88,112-128
2fmk d2fmka1 A:14-29,52-58,112-128
1ffw d1ffwa_ A:14-29,82-88,112-128
1a0o d1a0og_ G:14-29,82-88,112-128
2chf d2chfa_ A:14-29,82-88,112-128
1f4v d1f4va_ A:14-29,82-88,112-129
1ab5 d1ab5a_ A:14-29,52-58,112-128
2flk d2flka1 A:14-29,82-88,112-128
1udr d1udrc_ C:14-29,82-88,112-128
2flw d2flwa1 A:14-29,82-88,112-128
1ffs d1ffsa_ A:14-29,82-88,112-128
2iyn d2iyna1 A:11-26,78-84,108-121
1y7p d1y7pc1 C:93-115,186-190,191-205
1hey d1heya_ A:20-29,52-58,112-128
2fmh d2fmha1 A:14-29,82-88,112-128
2fmi d2fmia1 A:14-29,82-88,112-128
1y7p d1y7pb1 B:93-115,186-190,191-205
3chy d3chya_ A:14-29,82-88,112-128
1djm d1djma_ A:14-29,51-57,112-128
1y7p d1y7pa1 A:93-115,186-190,191-205
1udr d1udrb_ B:14-29,82-88,112-128
2chy d2chya_ A:14-29,81-87,112-128
1kmi d1kmiy_ Y:14-29,52-58,112-128
1ffg d1ffgc_ C:14-29,82-88,112-128
1f4v d1f4vb_ B:14-29,52-58,112-128
2fmf d2fmfa1 A:14-29,82-88,112-128
1ab6 d1ab6a_ A:14-29,52-58,112-128
1e6k d1e6ka_ A:14-29,52-58,112-128
2pl9 d2pl9a1 A:14-29,52-58,112-128
1zdm d1zdmb1 B:14-29,52-57,112-128
1ab5 d1ab5b_ B:14-29,82-88,112-128
1chn d1chna_ A:14-29,52-58,112-128
1cye d1cyea_ A:14-29,81-88,112-128
2a9o d2a9oa1 A:10-25,74-80,104-118
1a2o d1a2ob1 B:12-27,78-84,114-133
1a2o d1a2oa1 A:12-27,78-84,115-133
1vlz d1vlza_ A:14-29,82-88,112-128
1a0o d1a0oe_ E:14-29,82-88,112-128
1ab5 d1ab5a_ A:14-29,82-88,112-128
1xhe d1xhea1 A:12-27,76-82,106-122
2pl1 d2pl1a1 A:9-24,73-80,104-121
1tmy d1tmya_ A:11-26,99-104,107-119
1ehc d1ehca_ A:14-29,82-88,112-128
1zdm d1zdma1 A:14-29,52-57,112-128
1cye d1cyea_ A:14-29,52-58,112-128
1a2o d1a2ob1 B:12-27,27-36,114-133
1a0o d1a0oa_ A:14-29,82-88,112-128
4tmy d4tmya_ A:11-26,99-104,107-119
2fsp d2fspa_ A:12-27,28-34,107-120
1f4v d1f4va_ A:14-29,52-58,112-129
1e6k d1e6ka_ A:14-29,82-88,112-128
1b00 d1b00b_ B:11-26,78-84,108-123
1ymv d1ymva_ A:14-29,82-88,112-128
1ymu d1ymub_ B:14-29,52-58,112-129
1ab6 d1ab6a_ A:14-29,81-88,112-128
1zh4 d1zh4b1 B:10-25,73-80,104-120
1m2e d1m2ea_ A:13-25,78-83,110-129
1r8j d1r8ja2 A:13-25,78-85,110-129
1p6q d1p6qa_ A:15-30,82-87,113-127
1dc7 d1dc7a_ A:12-27,49-54,107-124
1nxw d1nxwa_ A:10-25,74-80,104-119
1chn d1chna_ A:14-29,82-88,112-128
2iyn d2iynb1 B:11-26,78-84,108-124
1j56 d1j56a_ A:11-27,28-33,107-124
1f51 d1f51h_ H:1412-1427,1428-1434,1507-1519
1krw d1krwa_ A:11-27,28-34,107-124
1b00 d1b00a_ A:11-26,77-84,108-123
1fsp d1fspa_ A:12-27,28-34,107-120
1djm d1djma_ A:14-29,104-109,112-128
1d5w d1d5wa_ A:12-27,77-83,107-123
1ab6 d1ab6b_ B:14-29,52-58,112-129
1zh4 d1zh4a1 A:10-25,74-80,104-121
1eay d1eayb_ B:14-29,104-109,112-128
1dbw d1dbwa_ A:12-27,77-83,107-123
1zh2 d1zh2a1 A:10-25,74-80,104-121
1w25 d1w25a2 A:162-178,197-203,257-283
1cey d1ceya_ A:14-29,81-88,112-128
1xhe d1xheb1 B:12-27,76-82,106-123
1r8j d1r8ja2 A:13-25,52-59,110-129
1p6u d1p6ua_ A:15-30,106-110,113-128
2v0n d2v0na2 A:162-178,197-203,257-285
1cey d1ceya_ A:14-29,52-58,112-128
1cye d1cyea_ A:14-29,104-109,112-128
2v0n d2v0nb1 B:11-26,78-84,108-124
2pmc d2pmcd1 D:14-29,104-109,112-128
1w25 d1w25b2 B:162-177,197-203,257-283
1udr d1udra_ A:14-29,104-109,112-128
2v0n d2v0na1 A:11-26,78-84,108-124
1u8t d1u8tc_ C:14-29,104-109,112-128
1c4w d1c4wa_ A:14-29,104-109,112-128
1qmp d1qmpb_ B:11-26,27-36,109-122
1ab5 d1ab5b_ B:14-29,104-109,112-128
5chy d5chya_ A:14-29,104-109,112-128
1udr d1udrd_ D:14-29,104-109,112-128
1ffg d1ffga_ A:14-29,104-109,112-128
1u8t d1u8td_ D:14-29,104-109,112-128
1p6q d1p6qa_ A:15-30,106-110,113-127
2che d2chea_ A:14-29,104-109,112-128
1e6l d1e6la_ A:14-29,104-109,112-128
1d4z d1d4za_ A:14-29,104-109,112-128
1jbe d1jbea_ A:14-29,104-109,112-128
2chf d2chfa_ A:14-29,104-109,112-128
1e6m d1e6ma_ A:14-29,104-109,112-128
1ntr d1ntra_ A:12-27,28-34,107-123
3chy d3chya_ A:14-29,104-109,112-128
2ayx d2ayxa1 A:833-848,870-877,928-948
1m2f d1m2fa_ A:13-26,52-58,113-129
1m2f d1m2fa_ A:13-26,78-83,113-129
1qmp d1qmpc_ C:11-26,27-36,109-123
1ny5 d1ny5a1 A:9-24,46-52,104-136
1qmp d1qmpa_ A:11-26,27-36,109-123
1ab6 d1ab6b_ B:14-29,104-109,112-129
1ny5 d1ny5b1 B:9-24,46-52,104-136
1m2f d1m2fa_ A:13-26,102-107,113-129
2v0n d2v0na2 A:162-178,227-233,257-285
2ayx d2ayxa1 A:833-848,897-904,928-948
1dc7 d1dc7a_ A:12-27,28-34,107-124
1l5y d1l5ya_ A:13-28,50-56,108-137
1w25 d1w25a2 A:162-178,227-233,257-283
2ayz d2ayza1 A:833-848,870-877,928-949
1ys7 d1ys7a2 A:16-31,32-39,111-128
1w25 d1w25b2 B:162-177,227-233,257-283
1ys6 d1ys6a2 A:16-31,32-39,111-128
2v0n d2v0nb2 B:162-177,197-203,257-290
1ny5 d1ny5b1 B:9-24,73-80,104-136
1l5y d1l5ya_ A:13-28,78-84,108-137
1ny5 d1ny5a1 A:9-24,73-80,104-136
1w25 d1w25b1 B:11-26,48-54,108-136
1ny5 d1ny5b1 B:9-24,96-101,104-136
1ny5 d1ny5a1 A:9-24,96-101,104-136
1s8n d1s8na_ A:22-37,60-66,117-143
1qkk d1qkka_ A:13-28,50-56,108-143
1w25 d1w25a1 A:11-26,48-54,108-137
1l5y d1l5yb_ B:213-228,250-256,308-344
1sd5 d1sd5a_ A:22-37,60-66,117-143
2v0n d2v0nb2 B:162-177,227-233,257-290
1s8n d1s8na_ A:22-37,86-93,117-143
1qkk d1qkka_ A:13-28,78-84,108-143
1sd5 d1sd5a_ A:22-37,86-93,117-143
1l5z d1l5za_ A:13-28,50-56,108-147
1zy2 d1zy2a1 A:9-24,46-51,104-139
1l5y d1l5ya_ A:13-28,29-35,108-137
1l5y d1l5yb_ B:213-228,278-284,308-344
1zn2 d1zn2a2 A:13-28,49-56,108-144
1yio d1yioa2 A:13-28,49-56,108-144
1l5z d1l5za_ A:13-28,78-84,108-147
1qkk d1qkka_ A:13-28,29-35,108-143
1l5y d1l5yb_ B:213-228,229-235,308-344
1l5z d1l5za_ A:13-28,29-35,108-147
1qo0 d1qo0d_ D:22-36,54-59,111-161
1qo0 d1qo0d_ D:22-36,80-87,111-161
1yio d1yioa2 A:13-28,29-35,108-144
1qo0 d1qo0e_ E:22-36,54-59,111-161
1qo0 d1qo0d_ D:22-36,103-108,111-161
1qo0 d1qo0e_ E:22-36,80-87,111-161
1qo0 d1qo0e_ E:22-36,103-108,111-161
44. c.41.1 Subtilisin-like
Subtilisin-like 3 layers: a/b/a, parallel beta-sheet of 7 strands, order 2314567; left-handed crossover connection between strands 2 & 3
2sbt d2sbta_ A:63-73,120-127,219-239
1p8j d1p8jb2 B:193-204,219-226,366-386
1p8j d1p8jd2 D:193-204,219-226,366-386
1p8j d1p8ja2 A:193-204,219-226,366-386
1p8j d1p8jf2 F:193-204,219-226,366-386
1p8j d1p8jg2 G:193-204,219-226,366-386
1p8j d1p8jh2 H:193-204,219-226,366-386
1p8j d1p8jc2 C:193-204,219-226,366-386
1p8j d1p8je2 E:193-204,219-226,366-386
1p8j d1p8jb2 B:193-204,248-253,366-386
1p8j d1p8jf2 F:193-204,248-253,366-386
1p8j d1p8jd2 D:193-204,248-253,366-386
1p8j d1p8jg2 G:193-204,248-253,366-386
1p8j d1p8jc2 C:193-204,248-253,366-386
1p8j d1p8ja2 A:193-204,248-253,366-386
1p8j d1p8jh2 H:193-204,248-253,366-386
1p8j d1p8je2 E:193-204,248-253,366-386
1r64 d1r64b2 B:211-223,238-245,383-403
2id4 d2id4a2 A:211-223,238-245,383-403
2id4 d2id4b2 B:211-223,238-245,383-403
1ot5 d1ot5b2 B:211-223,238-245,383-403
1spb d1spbs_ S:62-86,120-125,219-239
1gns d1gnsa_ A:62-86,120-125,219-239
1suc d1suca_ A:62-86,120-125,219-239
1sua d1suaa_ A:62-86,120-125,219-239
1gnv d1gnva_ A:62-86,120-125,219-239
2id4 d2id4b2 B:211-223,267-272,383-403
2id4 d2id4a2 A:211-223,267-272,383-403
1ot5 d1ot5b2 B:211-223,267-272,383-403
1sue d1suea_ A:62-86,120-125,219-239
1r64 d1r64b2 B:211-223,267-272,383-403
1dui d1duia_ A:62-86,120-125,219-239
1gns d1gnsa_ A:62-86,88-95,219-239
1suc d1suca_ A:62-86,88-95,219-239
1spb d1spbs_ S:62-86,88-95,219-239
1sue d1suea_ A:62-86,88-95,219-239
1gtl d1gtl2_ 2:74-91,123-128,276-296
1gtl d1gtl1_ 1:74-91,123-128,276-296
1t1g d1t1ga_ A:74-91,123-128,276-296
1c9j d1c9ja_ A:62-74,120-125,219-239
2sbt d2sbta_ A:63-73,147-153,219-239
1mpt d1mpta_ A:62-74,120-125,219-239
1t1i d1t1ia_ A:74-91,123-129,276-296
1dui d1duia_ A:62-86,88-95,219-239
1gt9 d1gt92_ 2:74-91,123-128,276-296
1gtj d1gtj2_ 2:74-91,123-128,276-296
1sua d1suaa_ A:62-86,88-95,219-239
1st3 d1st3a_ A:60-72,118-123,213-233
1gt9 d1gt91_ 1:74-91,123-128,276-296
1sup d1supa_ A:62-74,120-125,219-239
1t1e d1t1ea1 A:263-280,312-317,465-485
1gnv d1gnva_ A:62-86,88-95,219-239
1gtj d1gtj1_ 1:74-91,123-128,276-296
1bh6 d1bh6a_ A:62-74,120-125,219-239
2st1 d2st1a_ A:62-74,120-125,219-239
1sio d1sioa_ A:74-91,123-128,276-296
1tk2 d1tk2a_ A:62-74,120-125,219-239
1wsd d1wsda_ A:62-74,120-125,219-239
1gtg d1gtg1_ 1:74-91,123-128,276-296
1r6v d1r6va_ A:206-218,270-275,388-407
1jea d1jeaa_ A:62-74,120-125,219-239
1gci d1gcia_ A:62-74,120-125,219-239
1sio d1siob_ B:74-91,123-128,276-296
1af4 d1af4a_ A:62-74,120-125,219-239
1dbi d1dbia_ A:70-82,129-134,224-243
1a2q d1a2qa_ A:62-74,120-125,219-239
1ndq d1ndqa_ A:62-74,120-125,219-239
1svn d1svna_ A:62-74,120-125,219-239
1sud d1suda_ A:62-74,120-125,219-239
1yjc d1yjca_ A:62-74,120-125,219-239
1ndu d1ndua_ A:62-74,120-125,219-239
1v5i d1v5ia1 A:62-74,120-125,219-239
1s02 d1s02a_ A:62-74,120-125,219-239
1thm d1thma_ A:69-81,128-133,223-242
1aqn d1aqna_ A:62-74,120-125,219-239
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1sbi d1sbia_ A:62-74,120-125,219-239
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1yjb d1yjba_ A:62-74,120-125,219-239
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1sbh d1sbha_ A:62-74,120-125,219-239
1scn d1scne_ E:62-74,120-125,219-239
1scd d1scda_ A:62-74,120-125,219-239
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2v8b d2v8ba1 A:67-79,125-132,222-241
1kdz d1kdza_ A:38-53,58-64,74-93
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1pj8 d1pj8a_ A:67-79,124-132,222-241
1p7w d1p7wa_ A:67-79,124-132,222-241
1p7v d1p7va_ A:67-79,124-132,222-241
3prk d3prke_ E:67-79,124-132,222-241
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1ah2 d1ah2a_ A:60-72,118-123,213-233
2pwa d2pwaa1 A:67-79,124-132,222-241
1ht3 d1ht3a_ A:67-79,124-132,222-241
1ic6 d1ic6a_ A:67-79,124-132,222-241
2hd4 d2hd4a1 A:67-79,124-132,222-241
3bx1 d3bx1b1 B:62-74,120-125,220-239
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1ga6 d1ga6a_ A:38-53,58-64,74-93
2duj d2duja1 A:67-79,124-132,222-241
2id8 d2id8a1 A:67-79,124-132,222-241
2hpz d2hpza1 A:67-79,124-132,222-241
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1gtl d1gtl2_ 2:74-91,93-100,276-296
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2ixt d2ixta1 A:69-81,133-139,248-268
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3bx1 d3bx1a1 A:62-74,120-125,220-239
2ixt d2ixtb1 B:69-81,133-139,248-268
1cse d1csee_ E:62-74,120-125,220-239
3sic d3sice_ E:62-74,120-125,220-239
1gtl d1gtl1_ 1:74-91,93-100,276-296
1yu6 d1yu6b1 B:62-74,120-125,220-239
2sic d2sice_ E:62-74,120-125,220-239
1sbn d1sbne_ E:62-74,120-125,220-239
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1y34 d1y34e1 E:62-74,120-125,220-239
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1y48 d1y48e1 E:62-74,120-125,220-239
1y3c d1y3ce1 E:62-74,120-125,220-239
1y3d d1y3de1 E:62-74,120-125,220-239
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1tm4 d1tm4e_ E:62-74,120-125,220-239
2sni d2snie_ E:62-74,120-125,220-239
1gtj d1gtj2_ 2:74-91,93-100,276-296
5sic d5sice_ E:62-74,120-125,220-239
1q5p d1q5pa_ A:60-72,118-123,215-233
1tm3 d1tm3e_ E:62-74,120-125,220-239
1yu6 d1yu6a1 A:62-74,120-125,220-239
1t1e d1t1ea1 A:263-280,282-289,465-485
1c9m d1c9ma_ A:62-74,120-125,221-239
1y4a d1y4ae1 E:62-74,120-125,220-239
1v6c d1v6cb_ B:63-75,124-129,367-387
1gtj d1gtj1_ 1:74-91,93-100,276-296
1sio d1sioa_ A:74-91,93-100,276-296
1gt9 d1gt92_ 2:74-91,93-100,276-296
1gt9 d1gt91_ 1:74-91,93-100,276-296
1y4d d1y4de1 E:62-74,120-125,220-239
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2dp4 d2dp4e1 E:67-79,125-132,223-241
1v6c d1v6ca_ A:63-75,124-129,367-387
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1sbt d1sbta_ A:62-74,120-125,219-239
1p8j d1p8ja2 A:193-204,287-293,366-386
1p8j d1p8jh2 H:193-204,287-293,366-386
1t1i d1t1ia_ A:74-91,93-100,276-296
1spb d1spbs_ S:62-86,147-153,219-239
1sio d1siob_ B:74-91,93-100,276-296
1gtg d1gtg1_ 1:74-91,93-100,276-296
1sel d1sela_ A:62-74,120-125,221-239
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1sel d1selb_ B:62-74,120-125,221-239
1gns d1gnsa_ A:62-86,147-153,219-239
1ke1 d1ke1a_ A:74-93,128-133,285-305
1ga1 d1ga1a_ A:74-93,128-133,285-305
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1dui d1duia_ A:62-86,147-153,219-239
1ke2 d1ke2a_ A:74-93,128-133,285-305
1ga4 d1ga4a_ A:74-93,128-133,285-305
1sio d1sioc_ C:74-91,93-100,276-296
1av7 d1av7a_ A:62-74,120-125,221-239
1ga6 d1ga6a_ A:74-93,128-133,285-305
1sue d1suea_ A:62-86,147-153,219-239
1siu d1siua_ A:74-91,93-100,276-296
1ot5 d1ot5a2 A:208-223,267-272,383-403
1r64 d1r64a2 A:208-223,267-272,383-403
1st2 d1st2a_ A:62-74,88-95,222-239
1gt9 d1gt92_ 2:74-91,156-162,276-296
1sn7 d1sn7a_ A:74-91,156-162,276-296
1wmd d1wmda2 A:66-78,124-129,253-277
1wme d1wmea2 A:66-78,124-129,253-277
1gt9 d1gt92_ 2:38-50,55-61,74-91
1t1i d1t1ia_ A:38-50,55-61,74-91
1gtg d1gtg1_ 1:38-50,55-61,74-91
1gt9 d1gt91_ 1:38-50,55-61,74-91
1sio d1sioa_ A:38-50,55-61,74-91
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1sio d1siob_ B:38-50,55-61,74-91
1t1g d1t1ga_ A:38-50,55-61,74-91
1t1e d1t1ea1 A:227-239,244-250,263-280
1sio d1sioc_ C:38-50,55-61,74-91
1gtj d1gtj2_ 2:38-50,55-61,74-91
1gtl d1gtl1_ 1:38-50,55-61,74-91
1gtj d1gtj1_ 1:38-50,55-61,74-91
1siu d1siua_ A:38-50,55-61,74-91
1bh6 d1bh6a_ A:62-74,147-153,219-239
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1sup d1supa_ A:62-74,147-153,219-239
1gtl d1gtl2_ 2:38-50,55-61,74-91
1bfk d1bfka_ A:62-74,147-153,219-239
1v5i d1v5ia1 A:62-74,147-153,219-239
1be8 d1be8a_ A:62-74,147-153,219-239
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1af4 d1af4a_ A:62-74,147-153,219-239
1dbi d1dbia_ A:70-82,156-162,224-243
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1st2 d1st2a_ A:62-74,148-153,222-239
1oyv d1oyvb_ B:62-74,147-153,220-239
1kdy d1kdya_ A:74-93,162-168,285-305
1ga1 d1ga1a_ A:74-93,162-168,285-305
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1nlu d1nlua_ A:74-93,162-168,285-305
1to2 d1to2e_ E:62-74,147-153,220-239
1y48 d1y48e1 E:62-74,147-153,220-239
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1y3f d1y3fe1 E:62-74,147-153,220-239
1y3c d1y3ce1 E:62-74,147-153,220-239
2sec d2sece_ E:62-74,147-153,220-239
1y34 d1y34e1 E:62-74,147-153,220-239
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1y1k d1y1ke1 E:62-74,147-153,220-239
1y3b d1y3be1 E:62-74,147-153,220-239
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1r0r d1r0re_ E:62-74,147-153,220-239
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1y4a d1y4ae1 E:62-74,147-153,220-239
1ga4 d1ga4a_ A:74-93,162-168,285-305
1tm5 d1tm5e_ E:62-74,147-153,220-239
1oyv d1oyva_ A:62-74,147-153,220-239
1ga6 d1ga6a_ A:74-93,162-168,285-305
1yu6 d1yu6b1 B:62-74,147-153,220-239
1cse d1csee_ E:62-74,197-201,220-239
1yu6 d1yu6a1 A:62-74,147-153,220-239
1sbn d1sbne_ E:62-74,147-153,220-239
1ke1 d1ke1a_ A:74-93,97-105,285-305
1nlu d1nlua_ A:74-93,97-105,285-305
1kdz d1kdza_ A:74-93,97-105,285-305
1ga4 d1ga4a_ A:74-93,97-105,285-305
1ga1 d1ga1a_ A:74-93,97-105,285-305
1kdy d1kdya_ A:74-93,97-105,285-305
1kdv d1kdva_ A:74-93,97-105,285-305
1ga6 d1ga6a_ A:74-93,97-105,285-305
1ke2 d1ke2a_ A:74-93,97-105,285-305
1ke1 d1ke1a_ A:38-53,58-65,74-93
1wmf d1wmfa2 A:66-78,90-99,256-277
45. d.106.1 SCP-like
SCP-like alpha-beta(3)-(crossover)-beta-(alpha)-beta; 3 layers: a/b/a; antiparallel beta-sheet of 5 strands; order: 32145
2nsf d2nsfa2 A:162-181,185-192,211-221
2nsg d2nsga2 A:162-181,185-192,211-221
2cfu d2cfua1 A:539-551,581-588,629-640
1c44 d1c44a_ A:7-24,32-41,76-86
2cfz d2cfza1 A:539-551,581-588,629-640
2cg3 d2cg3a1 A:539-551,581-588,629-641
2cg2 d2cg2a1 A:539-551,581-588,629-641
1qnd d1qnda_ A:7-24,32-41,76-86
2c0l d2c0lb1 B:27-44,52-61,96-106
2i00 d2i00a1 A:301-309,317-323,358-368
2i00 d2i00d1 D:301-309,317-323,358-368
1pz4 d1pz4a_ A:3-19,27-37,67-77
2i00 d2i00f1 F:301-309,317-323,358-368
2i00 d2i00c1 C:301-309,317-323,358-368
2i00 d2i00b1 B:301-309,317-324,358-368
2i00 d2i00e1 E:301-309,317-324,358-368
1ikt d1ikta_ A:6-23,31-41,75-85
2hv2 d2hv2f1 F:287-295,302-310,349-359
2hv2 d2hv2b1 B:287-295,302-310,349-359
2hv2 d2hv2e1 E:287-295,302-310,349-359
2ozg d2ozga1 A:291-300,306-315,347-357
2hv2 d2hv2a1 A:287-295,302-310,349-359
2hv2 d2hv2c1 C:287-295,302-310,349-359
2hv2 d2hv2d1 D:287-295,302-310,349-359
2cg2 d2cg2a1 A:539-551,560-569,601-611
2cg3 d2cg3a1 A:539-551,560-569,601-611
2cfz d2cfza1 A:539-551,560-569,601-611
2cfu d2cfua1 A:539-551,560-569,601-611
46. c.106.1 SurE-like some topological similarity to the N-terminal domain of Glutaminase/Asparaginase family !
SurE-like 3 layers: a/b/a; mixed beta-sheet of 9 strands, order 342156798; strands 3, 8 and 9 are antiparallel to the rest; left-handed crossover connection between strands 6 and 7
1j9j d1j9jb_ B:13-27,88-97,135-150
1j9j d1j9ja_ A:13-27,88-97,135-150
1j9l d1j9lb_ B:13-27,88-97,135-150
1j9l d1j9la_ A:13-27,88-97,135-150
1j9k d1j9kb_ B:13-27,88-97,135-150
1ilv d1ilva_ A:13-27,88-97,135-150
1j9k d1j9ka_ A:13-27,88-97,135-150
1l5x d1l5xb_ B:13-27,86-95,138-160
1l5x d1l5xa_ A:13-27,86-95,138-160
1j9j d1j9ja_ A:13-27,122-129,135-150
1j9l d1j9la_ A:13-27,122-129,135-150
1l5x d1l5xb_ B:13-27,121-129,138-160
1l5x d1l5xa_ A:13-27,121-129,138-160
1j9j d1j9jb_ B:13-27,122-130,135-150
1j9l d1j9lb_ B:13-27,122-130,135-150
1j9k d1j9kb_ B:13-27,122-130,135-150
1ilv d1ilva_ A:13-27,122-130,135-150
1j9k d1j9ka_ A:13-27,122-130,135-150
1ilv d1ilvb_ B:13-27,88-93,135-151
1ilv d1ilvb_ B:13-27,122-130,135-151
47. c.82.1 ALDH-like binds NAD differently from other NAD(P)-dependent oxidoreductases !
ALDH-like consists of two similar domains with 3 layers (a/b/a) each; duplication ! core: parallel beta-sheet of 5 strands, order 32145
1uxr d1uxra_ A:169-185,237-243,474-483
1uxt d1uxta_ A:169-185,237-243,474-483
1uxv d1uxva_ A:169-185,237-243,474-483
1uxq d1uxqa_ A:169-185,237-243,474-483
1uxp d1uxpa_ A:169-185,237-243,474-484
1uxu d1uxua_ A:169-185,237-243,474-484
1ky8 d1ky8a_ A:169-185,237-243,474-484
1uxn d1uxna_ A:169-185,237-243,474-484
2eiw d2eiwb1 B:185-201,254-260,499-508
1a4z d1a4za_ A:170-186,239-246,477-486
1ag8 d1ag8d_ D:170-186,239-246,477-486
1bi9 d1bi9d_ D:170-186,239-245,478-487
1bi9 d1bi9a_ A:170-186,239-245,478-487
1qi6 d1qi6b_ B:155-171,224-230,456-466
1qi6 d1qi6d_ D:155-171,224-230,456-466
1qi6 d1qi6a_ A:155-171,224-230,456-466
1qi6 d1qi6c_ C:155-171,224-230,456-466
1bi9 d1bi9c_ C:170-186,239-245,478-487
1euh d1euhc_ C:155-171,224-230,456-466
2euh d2euha_ A:155-171,224-231,456-466
2euh d2euhd_ D:155-171,224-231,456-466
2euh d2euhc_ C:155-171,224-231,456-466
1qi1 d1qi1a_ A:155-171,224-230,456-466
2euh d2euhb_ B:155-171,224-231,456-466
1qi1 d1qi1c_ C:155-171,224-230,456-466
1qi1 d1qi1b_ B:155-171,224-230,456-466
1qi1 d1qi1d_ D:155-171,224-230,456-466
1bpw d1bpwd_ D:167-183,235-242,479-488
1bpw d1bpwc_ C:167-183,235-242,479-488
1bpw d1bpwb_ B:167-183,235-242,479-488
1bpw d1bpwa_ A:167-183,235-242,479-488
1euh d1euhb_ B:155-171,224-230,456-466
1euh d1euha_ A:155-171,224-230,456-466
1euh d1euhd_ D:155-171,224-230,456-466
1wnb d1wnbc_ C:150-166,218-224,457-466
1eyy d1eyyb_ B:156-166,223-229,466-474
1eyy d1eyyd_ D:156-166,223-229,466-474
1ez0 d1ez0c_ C:156-166,223-229,466-474
1eyy d1eyyc_ C:156-166,223-229,466-474
1ez0 d1ez0d_ D:156-166,223-229,466-474
1eyy d1eyya_ A:156-166,223-229,466-474
1ez0 d1ez0b_ B:156-166,223-229,466-474
1ez0 d1ez0a_ A:156-166,223-229,466-474
1wnb d1wnbd_ D:150-166,218-224,457-466
1a4s d1a4sd_ D:167-183,235-242,479-488
1a4s d1a4sb_ B:167-183,235-242,479-488
1a4s d1a4sa_ A:167-183,235-242,479-488
1a4s d1a4sc_ C:167-183,235-242,479-488
1bi9 d1bi9b_ B:170-186,239-246,478-487
1ad3 d1ad3b_ B:115-131,181-187,413-423
2eiw d2eiwb1 B:185-201,283-289,499-508
1ad3 d1ad3a_ A:115-131,181-187,412-423
1uxt d1uxta_ A:169-185,258-264,474-483
1uxr d1uxra_ A:169-185,258-264,474-483
1uxv d1uxva_ A:169-185,258-264,474-483
1wnb d1wnba_ A:150-166,218-224,457-465
1uxq d1uxqa_ A:169-185,258-264,474-483
1bxs d1bxsa_ A:170-186,239-246,478-487
1bxs d1bxsc_ C:170-186,239-246,478-487
1bxs d1bxsb_ B:170-186,239-246,478-487
1bxs d1bxsd_ D:170-186,239-246,478-487
1uxp d1uxpa_ A:169-185,258-264,474-484
1o9j d1o9jd_ D:170-186,239-246,478-487
1o9j d1o9jb_ B:170-186,239-246,478-487
1euh d1euhc_ C:155-171,246-251,456-466
1ky8 d1ky8a_ A:169-185,258-264,474-484
1wnb d1wnbb_ B:150-166,218-224,457-465
1uxu d1uxua_ A:169-185,258-264,474-484
1o9j d1o9ja_ A:170-186,239-246,478-487
1qi6 d1qi6b_ B:155-171,246-251,456-466
1uxn d1uxna_ A:169-185,258-264,474-484
1wnd d1wndd_ D:150-166,218-225,457-466
1qi6 d1qi6d_ D:155-171,246-251,456-466
1qi6 d1qi6a_ A:155-171,246-251,456-466
1qi6 d1qi6c_ C:155-171,246-251,456-466
1euh d1euhb_ B:155-171,246-251,456-466
1wnb d1wnba_ A:150-166,241-247,457-465
1o9j d1o9jc_ C:170-186,239-246,478-487
1euh d1euhd_ D:155-171,246-251,456-466
1wnd d1wnda_ A:150-166,218-225,457-466
1wnd d1wndc_ C:150-166,218-225,457-466
1wnb d1wnbb_ B:150-166,241-247,457-465
1wnd d1wndb_ B:150-166,218-225,457-466
1qi1 d1qi1a_ A:155-171,246-251,456-466
1euh d1euha_ A:155-171,246-251,456-466
1qi1 d1qi1d_ D:155-171,246-251,456-466
1qi1 d1qi1b_ B:155-171,246-251,456-466
1qi1 d1qi1c_ C:155-171,246-251,456-466
1wnd d1wndd_ D:150-166,241-248,457-466
1wnd d1wndc_ C:150-166,241-248,457-466
1wnd d1wnda_ A:150-166,241-248,457-466
1wnd d1wndb_ B:150-166,241-248,457-466
1kae d1kaea_ A:248-263,326-332,355-364
1a4s d1a4sa_ A:167-183,258-265,479-488
1a4s d1a4sb_ B:167-183,258-265,479-488
1a4s d1a4sd_ D:167-183,258-265,479-488
1a4s d1a4sc_ C:167-183,258-265,479-488
1ad3 d1ad3b_ B:115-131,204-211,413-423
1bpw d1bpwb_ B:167-183,258-265,479-488
1bpw d1bpwc_ C:167-183,258-265,479-488
1bpw d1bpwd_ D:167-183,258-265,479-488
1bpw d1bpwa_ A:167-183,258-265,479-488
2euh d2euhc_ C:155-171,246-252,456-466
2euh d2euhd_ D:155-171,246-252,456-466
2euh d2euha_ A:155-171,246-252,456-466
2euh d2euhb_ B:155-171,246-252,456-466
1wnb d1wnbc_ C:150-166,241-247,457-466
1k75 d1k75a_ A:248-263,326-332,355-364
1kah d1kaha_ A:248-264,326-332,355-364
1wnb d1wnbd_ D:150-166,241-247,457-466
1kae d1kaeb_ B:248-264,326-332,355-364
1bxs d1bxsc_ C:170-186,263-270,478-487
1bxs d1bxsa_ A:170-186,263-270,478-487
1bxs d1bxsb_ B:170-186,263-270,478-487
1bxs d1bxsd_ D:170-186,263-270,478-487
1kar d1kara_ A:248-264,326-332,355-364
1k75 d1k75b_ B:248-264,326-332,355-364
1kar d1karb_ B:248-264,326-332,355-364
1kah d1kahb_ B:248-264,326-332,355-364
1o9j d1o9jd_ D:170-186,263-270,478-487
1o9j d1o9jb_ B:170-186,263-270,478-487
1o9j d1o9ja_ A:170-186,263-270,478-487
1bi9 d1bi9b_ B:170-186,187-194,478-487
1bi9 d1bi9c_ C:170-186,186-194,478-487
1o9j d1o9jc_ C:170-186,263-270,478-487
1bi9 d1bi9a_ A:170-186,186-194,478-487
1bi9 d1bi9d_ D:170-186,186-194,478-487
1bpw d1bpwb_ B:167-183,183-191,479-488
1bpw d1bpwc_ C:167-183,183-191,479-488
1bpw d1bpwa_ A:167-183,183-191,479-488
1bpw d1bpwd_ D:167-183,183-191,479-488
1a4s d1a4sa_ A:167-183,183-191,479-488
1a4s d1a4sb_ B:167-183,183-191,479-488
1a4s d1a4sc_ C:167-183,183-191,479-488
1a4s d1a4sd_ D:167-183,183-191,479-488
1bxs d1bxsa_ A:170-186,186-194,478-487
1bxs d1bxsb_ B:170-186,186-194,478-487
2eiw d2eiwb1 B:185-201,202-209,499-508
1bxs d1bxsc_ C:170-186,187-194,478-487
1bxs d1bxsd_ D:170-186,187-194,478-487
1o9j d1o9jb_ B:170-186,187-194,478-487
1o9j d1o9jd_ D:170-186,186-194,478-487
1eyy d1eyyc_ C:156-166,248-254,466-474
1eyy d1eyyb_ B:156-166,248-254,466-474
1eyy d1eyyd_ D:156-166,248-254,466-474
1eyy d1eyya_ A:156-166,248-254,466-474
1o9j d1o9ja_ A:170-186,186-194,478-487
1o9j d1o9jc_ C:170-186,186-194,478-487
1wnd d1wndd_ D:150-166,166-174,457-466
1wnd d1wndc_ C:150-166,167-174,457-466
1wnd d1wnda_ A:150-166,167-174,457-466
1ez0 d1ez0c_ C:156-166,248-254,466-474
1ez0 d1ez0d_ D:156-166,248-254,466-474
1ez0 d1ez0b_ B:156-166,248-254,466-474
1ez0 d1ez0a_ A:156-166,248-254,466-474
1wnd d1wndb_ B:150-166,166-174,457-466
1wnb d1wnbc_ C:150-166,167-174,457-466
1wnb d1wnbd_ D:150-166,167-174,457-466
2eiw d2eiwb1 B:127-153,494-498,499-508
1ky8 d1ky8a_ A:125-135,148-157,474-484
1uxq d1uxqa_ A:125-134,148-158,474-483
1uxt d1uxta_ A:125-134,148-158,474-483
1uxr d1uxra_ A:125-134,148-158,474-483
1uxp d1uxpa_ A:125-134,148-157,474-484
1uxu d1uxua_ A:125-134,148-157,474-484
2eiw d2eiwb1 B:127-153,164-173,499-508
1bxs d1bxsd_ D:113-140,149-158,478-487
1bxs d1bxsc_ C:113-140,149-158,478-487
1o9j d1o9jb_ B:113-140,149-158,478-487
48. i.12.1 Proteins of incorrect, partial and unknown sequence
Proteins of incorrect, partial and unknown sequence
1ivi d1ivie_ E:514-528,647-652,832-850
1ivi d1ivid_ D:514-528,647-652,832-850
1grh d1grha_ A:29-43,150-155,338-356
3ldh d3ldha_ A:29-44,92-98,250-264
1ivi d1ivic_ C:14-28,147-152,332-350
1ivi d1ivia_ A:14-28,147-152,332-350
1ivi d1ivib_ B:14-28,147-152,332-350
3ldh d3ldha_ A:29-44,133-139,250-264
1ivi d1ivie_ E:514-528,530-536,832-850
1ivi d1ivid_ D:514-528,530-536,832-850
1ivi d1ivia_ A:14-28,30-36,332-350
1ivi d1ivic_ C:14-28,30-36,332-350
1ivi d1ivib_ B:14-28,30-36,332-350
1ivi d1ivie_ E:514-528,819-823,832-850
1ivi d1ivid_ D:514-528,819-823,832-850
1grh d1grha_ A:29-43,325-329,338-356
1grh d1grha_ A:29-43,45-51,338-356
1ivi d1ivia_ A:14-28,319-323,332-350
1ivi d1ivic_ C:14-28,319-323,332-350
1ivi d1ivib_ B:14-28,319-323,332-350
4cat d4cata_ A:521-538,608-613,635-649
4cat d4catb_ B:521-538,608-613,635-649
4cat d4cata_ A:521-538,563-568,635-649
4cat d4catb_ B:521-538,563-568,635-649
2pgk d2pgka_ A:215-229,327-332,385-395
4cat d4cata_ A:521-538,538-545,635-649
4cat d4catb_ B:521-538,538-545,635-649
2yhx d2yhxa_ A:188-202,205-211,431-451
49. c.124.1 NagB/RpiA/CoA transferase-like
NagB/RpiA/CoA transferase-like core: 3 layers: a/b/a; parallel or mixed beta-sheet of 6 strands, order 321456
3efb d3efbd1 D:10-24,251-256,256-265
3efb d3efbd1 D:10-24,26-31,256-265
3efb d3efbb1 B:11-24,26-31,256-265
3efb d3efbb1 B:11-24,251-256,256-265
3efb d3efba1 A:12-24,251-256,256-265
3efb d3efbc1 C:12-24,251-256,256-264
2gnp d2gnpa1 A:56-73,75-80,304-317
3efb d3efba1 A:12-24,26-31,256-265
3efb d3efbc1 C:12-24,26-31,256-264
2r5f d2r5fa1 A:62-74,76-81,309-316
2gnp d2gnpa1 A:56-73,299-304,304-317
2r5f d2r5fa1 A:62-74,303-308,309-316
2o0m d2o0ma1 A:95-106,108-113,333-341
3bxh d3bxhb1 B:93-106,108-116,330-338
3bxe d3bxeb1 B:93-106,108-116,330-338
3bxg d3bxgb1 B:93-106,108-116,330-338
2okg d2okgb1 B:93-106,108-116,330-338
3bxe d3bxea1 A:93-106,108-116,330-338
3bxh d3bxha1 A:95-106,108-116,330-338
3bxg d3bxga1 A:95-106,108-116,330-338
3bxf d3bxfb1 B:94-106,108-116,330-338
2okg d2okga1 A:93-106,108-116,330-338
3bxf d3bxfa1 A:93-106,108-116,330-338
2o0m d2o0ma1 A:95-106,325-332,333-341
3efb d3efbd1 D:37-57,251-256,256-265
3efb d3efbb1 B:37-57,251-256,256-265
3efb d3efbc1 C:37-57,251-256,256-264
3efb d3efba1 A:37-57,251-256,256-265
2okg d2okga1 A:93-106,108-116,310-321
1ne7 d1ne7c_ C:8-28,234-240,248-269
1ne7 d1ne7e_ E:8-28,234-240,248-269
1ne7 d1ne7b_ B:8-28,234-240,248-269
1ne7 d1ne7d_ D:8-28,234-240,248-269
1ne7 d1ne7a_ A:8-28,234-240,248-269
1ne7 d1ne7f_ F:8-28,234-240,248-269
50. c.66.1 S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases
S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases core: 3 layers, a/b/a; mixed beta-sheet of 7 strands, order 3214576; strand 7 is antiparallel to the rest
2f8l d2f8la1 A:99-115,303-309,313-329
2py6 d2py6a1 A:61-69,112-118,141-150
1av6 d1av6a_ A:36-57,193-197,257-271
1fjx d1fjxa_ A:22-32,73-78,307-325
3mht d3mhta_ A:22-32,73-78,307-325
1dct d1dcta_ A:11-21,63-68,309-324
1svu d1svub_ B:22-32,73-78,307-325
1mht d1mhta_ A:22-32,73-78,307-325
2c7r d2c7ra1 A:22-32,73-78,307-325
2hr1 d2hr1a1 A:22-32,73-78,307-325
1skm d1skma_ A:22-32,73-78,307-325
2c7q d2c7qa1 A:22-32,73-78,307-325
2c7o d2c7oa1 A:22-32,73-78,307-325
2c7p d2c7pa1 A:22-32,73-78,307-325
1m0e d1m0ea_ A:22-32,73-78,307-325
1dct d1dctb_ B:11-21,63-68,309-324
1hmy d1hmya_ A:22-32,73-78,307-325
4mht d4mhta_ A:22-32,73-78,307-325
2hmy d2hmyb_ B:22-32,73-78,307-325
1svu d1svua_ A:22-32,73-79,307-325
5mht d5mhta_ A:22-32,73-78,307-325
9mht d9mhta_ A:22-32,73-78,307-325
6mht d6mhta_ A:22-32,73-78,307-325
1g55 d1g55a_ A:14-24,71-76,378-391
7mht d7mhta_ A:22-32,73-78,307-325
8mht d8mhta_ A:22-32,73-78,307-325
1eqa d1eqaa_ A:36-57,193-197,257-270
2okc d2okcb1 B:155-167,327-337,381-395
10mh d10mha_ A:22-32,73-78,307-325
4dcg d4dcga_ A:36-57,193-197,257-270
1jte d1jtea_ A:36-57,193-197,257-270
1v39 d1v39a_ A:36-57,193-197,257-270
1jsz d1jsza_ A:36-57,193-197,257-270
1vp3 d1vp3a_ A:36-57,193-197,257-270
1bky d1bkya_ A:36-57,193-197,257-270
2vp3 d2vp3a_ A:36-57,193-197,257-270
1vp9 d1vp9a_ A:36-57,193-197,257-270
1b42 d1b42a_ A:36-57,193-197,257-270
2f8l d2f8la1 A:99-115,264-274,313-329
3mag d3maga_ A:36-57,193-197,257-270
1jtf d1jtfa_ A:36-57,193-197,257-270
1p39 d1p39a_ A:36-57,193-197,257-270
1eam d1eama_ A:36-57,193-197,257-270
1vpt d1vpta_ A:36-57,193-197,257-270
3mct d3mcta_ A:36-57,193-197,257-270
2gaf d2gafa1 A:36-57,193-197,257-270
2ga9 d2ga9a1 A:36-57,193-197,257-270
1dct d1dcta_ A:11-21,104-112,309-324
1g55 d1g55a_ A:14-24,114-121,378-391
1fjx d1fjxa_ A:22-32,114-122,307-325
1zkd d1zkdb1 B:58-77,234-243,299-308
1zkd d1zkda1 A:58-77,234-243,299-308
1dct d1dctb_ B:11-21,104-112,309-324
1skm d1skma_ A:22-32,114-122,307-325
4mht d4mhta_ A:22-32,114-122,307-325
3mht d3mhta_ A:22-32,114-122,307-325
2c7r d2c7ra1 A:22-32,114-122,307-325
1m0e d1m0ea_ A:22-32,114-122,307-325
2hr1 d2hr1a1 A:22-32,114-122,307-325
2c7p d2c7pa1 A:22-32,114-122,307-325
1mht d1mhta_ A:22-32,114-122,307-325
2c7o d2c7oa1 A:22-32,114-122,307-325
1svu d1svua_ A:22-32,114-122,307-325
2c7q d2c7qa1 A:22-32,114-122,307-325
5mht d5mhta_ A:22-32,114-122,307-325
1svu d1svub_ B:22-32,114-122,307-325
1hmy d1hmya_ A:22-32,114-122,307-325
6mht d6mhta_ A:22-32,114-122,307-325
2hmy d2hmyb_ B:22-32,114-122,307-325
9mht d9mhta_ A:22-32,114-122,307-325
10mh d10mha_ A:22-32,114-122,307-325
8mht d8mhta_ A:22-32,114-122,307-325
7mht d7mhta_ A:22-32,114-122,307-325
2okc d2okca1 A:155-167,327-336,381-395
2ar0 d2ar0a1 A:154-166,333-342,396-408
2ar0 d2ar0b1 B:154-166,333-342,396-408
2gti d2gtia1 A:1-13,23-28,50-61
2gth d2gtha1 A:1-13,23-28,50-61
2rhb d2rhbd1 D:1-13,23-28,50-61
2rhb d2rhbe1 E:1-13,23-28,50-61
1rjg d1rjga_ A:71-97,279-285,285-295
2rhb d2rhbf1 F:1-13,23-28,50-61
2rhb d2rhbc1 C:1-13,23-28,50-61
2rhb d2rhbb1 B:1-13,23-28,50-61
2h85 d2h85a1 A:1-13,23-28,50-61
2ytz d2ytzb1 B:29-47,212-224,301-315
2rhb d2rhba1 A:1-13,23-28,50-61
2ytz d2ytza1 A:29-47,212-224,301-315
2ejt d2ejta1 A:29-47,212-224,301-315
2eju d2ejua1 A:29-47,212-224,301-315
2dul d2dula1 A:29-47,212-224,301-315
2p7h d2p7hd1 D:22-40,190-199,218-233
2p7h d2p7hb1 B:22-40,190-199,218-233
2p7i d2p7ia1 A:22-40,190-199,218-233
2avn d2avnb1 B:22-41,192-202,214-229
2avn d2avna1 A:22-41,192-202,214-229
2p7h d2p7ha1 A:22-40,189-199,218-233
2p7h d2p7hc1 C:22-40,189-199,218-233
2p7i d2p7ib1 B:22-40,189-199,218-233
1r6a d1r6aa_ A:8-20,216-222,227-245
2p1d d2p1da1 A:8-20,216-222,227-245
2p40 d2p40a1 A:8-20,216-222,227-245
51. c.111.1 Activating enzymes of the ubiquitin-like proteins transfer adenylyl group to the C-terminal carboxyl group of the ubiquitin and MoaD/ThiS-related proteins ! the ATP nucleotide-binding site is similar to that of the NAD-binding Rossmann-folds !
Activating enzymes of the ubiquitin-like proteins 3 layers: a/b/a; mixed beta-sheet of 8 strands, order 32145678; strands 6 and 8 are antiparallel to the rest
3dbl d3dblb1 B:57-71,139-144,292-313
3dbl d3dblh1 H:57-71,139-144,292-313
1r4n d1r4nf_ F:56-71,139-144,292-313
1r4n d1r4nh_ H:56-71,139-144,292-313
1r4n d1r4nd_ D:56-71,139-144,292-313
1r4n d1r4nb_ B:56-71,139-144,292-313
2nvu d2nvub1 B:2056-2071,2139-2144,2292-2313
1r4m d1r4mb_ B:57-71,139-144,292-313
1r4m d1r4mf_ F:57-71,139-144,292-313
1r4m d1r4mh_ H:57-71,139-144,292-313
1r4m d1r4md_ D:57-71,139-144,292-313
1tt5 d1tt5b_ B:57-71,139-144,292-313
3dbl d3dblf1 F:56-71,139-144,292-313
3dbl d3dbld1 D:57-71,139-144,292-313
1tt5 d1tt5d_ D:57-71,139-144,292-313
1yov d1yovb1 B:56-71,139-144,292-313
1yov d1yovd1 D:57-71,139-144,292-313
1jw9 d1jw9b_ B:40-54,123-128,193-214
1jwb d1jwbb_ B:40-54,123-128,193-214
1jwa d1jwab_ B:39-54,123-128,193-214
3dbl d3dbla1 A:39-53,124-130,490-511
3dbr d3dbrc1 C:39-53,124-130,490-511
1tt5 d1tt5c_ C:39-53,124-130,490-511
1yov d1yova1 A:39-53,124-130,490-511
1r4n d1r4na_ A:39-53,124-130,490-511
1tt5 d1tt5a_ A:39-53,124-130,490-511
1r4n d1r4ng_ G:39-53,124-130,490-511
1r4n d1r4ne_ E:39-53,124-130,490-511
1r4n d1r4nc_ C:39-53,124-130,490-511
3dbh d3dbhc1 C:39-53,124-130,490-511
3dbh d3dbhg1 G:39-53,124-130,490-511
3dbl d3dblg1 G:39-53,124-130,490-511
1r4m d1r4mg_ G:39-53,124-130,490-511
3dbr d3dbra1 A:39-53,124-130,490-511
1r4m d1r4mc_ C:39-53,124-130,490-511
1r4m d1r4me_ E:39-53,124-130,490-511
1r4m d1r4ma_ A:39-53,124-130,490-511
3dbr d3dbre1 E:39-53,124-130,490-511
3dbl d3dble1 E:39-53,124-130,490-511
3dbr d3dbrg1 G:39-53,124-130,490-511
1yov d1yovc1 C:39-53,124-130,490-511
3dbl d3dblc1 C:39-53,124-130,490-511
2nvu d2nvua1 A:39-53,124-130,490-511
3dbh d3dbhe1 E:39-53,124-130,490-511
3dbh d3dbha1 A:39-53,124-130,490-511
1r4n d1r4nf_ F:56-71,175-184,292-313
1r4n d1r4nh_ H:56-71,175-184,292-313
1r4n d1r4nb_ B:56-71,175-184,292-313
1r4n d1r4nd_ D:56-71,175-184,292-313
3dbl d3dblh1 H:57-71,175-184,292-313
3dbl d3dblb1 B:57-71,175-184,292-313
1tt5 d1tt5b_ B:57-71,175-184,292-313
1tt5 d1tt5d_ D:57-71,175-184,292-313
3dbl d3dbld1 D:57-71,175-184,292-313
2nvu d2nvub1 B:2056-2071,2175-2184,2292-2313
3dbl d3dblf1 F:56-71,176-184,292-313
1yov d1yovb1 B:56-71,175-184,292-313
1r4m d1r4mb_ B:57-71,176-184,292-313
1r4m d1r4mf_ F:57-71,176-184,292-313
1r4m d1r4md_ D:57-71,176-184,292-313
1r4m d1r4mh_ H:57-71,176-184,292-313
1yov d1yovd1 D:57-71,176-184,292-313
1yov d1yovc1 C:39-53,149-157,490-511
1tt5 d1tt5c_ C:39-53,149-157,490-511
1tt5 d1tt5a_ A:39-53,149-157,490-511
1yov d1yova1 A:39-53,149-157,490-511
3dbl d3dbla1 A:39-53,149-157,490-511
3dbr d3dbrg1 G:39-53,149-157,490-511
1jwb d1jwbb_ B:40-54,148-156,193-214
1r4m d1r4mg_ G:39-53,149-157,490-511
1r4m d1r4mc_ C:39-53,149-157,490-511
1r4n d1r4na_ A:39-53,149-157,490-511
1r4m d1r4ma_ A:39-53,149-157,490-511
1r4n d1r4nc_ C:39-53,149-157,490-511
3dbh d3dbhc1 C:39-53,149-157,490-511
1r4m d1r4me_ E:39-53,149-157,490-511
3dbh d3dbhg1 G:39-53,149-157,490-511
1r4n d1r4ng_ G:39-53,149-157,490-511
3dbl d3dblg1 G:39-53,149-157,490-511
1r4n d1r4ne_ E:39-53,149-157,490-511
1jw9 d1jw9b_ B:40-54,148-156,193-214
1jwa d1jwab_ B:39-54,148-156,193-214
3dbh d3dbha1 A:39-53,149-157,490-511
3dbr d3dbre1 E:39-53,149-157,490-511
2nvu d2nvua1 A:39-53,149-157,490-511
3dbl d3dble1 E:39-53,149-157,490-511
3dbr d3dbra1 A:39-53,149-157,490-511
3dbh d3dbhe1 E:39-53,149-157,490-511
3dbl d3dblc1 C:39-53,149-157,490-511
3dbr d3dbrc1 C:39-53,149-157,490-511
52. d.92.1 Metalloproteases ("zincins"), catalytic domain
Zincin-like contains mixed beta sheet with connection over free side of the sheet
1pwv d1pwvb2 B:551-575,582-587,591-610
1g9c d1g9ca3 A:101-115,156-162,222-240
1pww d1pwwb2 B:551-575,582-587,591-610
1yqy d1yqya1 A:551-575,582-587,591-610
2etf d2etfa1 A:101-115,156-162,222-240
1t3c d1t3cb_ B:96-110,180-186,204-222
2etf d2etfb1 B:101-115,156-162,222-240
1t3a d1t3ab_ B:96-110,180-186,204-222
1pwq d1pwqa2 A:551-575,582-587,591-610
1t3a d1t3aa_ A:96-110,180-186,204-222
3d3x d3d3xa1 A:96-110,180-186,204-222
1pwp d1pwpb2 B:551-575,582-587,591-610
1f82 d1f82a_ A:101-115,156-162,222-240
1t3c d1t3ca_ A:96-110,180-186,204-222
3d3x d3d3xb1 B:96-110,180-186,204-222
1s0d d1s0da3 A:101-115,156-162,222-240
1f31 d1f31a3 A:101-115,189-195,222-240
1pwq d1pwqb2 B:551-575,582-587,591-610
2etf d2etfb1 B:101-115,189-195,222-240
2etf d2etfa1 A:101-115,189-195,222-240
2np0 d2np0a3 A:101-115,189-195,222-240
1g9c d1g9ca3 A:101-115,189-195,222-240
1umt d1umta_ A:109-129,141-147,194-208
1f82 d1f82a_ A:101-115,189-195,222-240
1epw d1epwa3 A:101-115,189-195,222-240
1s0b d1s0ba3 A:101-115,189-195,222-240
1g9d d1g9da3 A:101-115,189-195,222-240
1s0e d1s0ea3 A:101-115,189-195,222-240
1g9a d1g9aa3 A:101-115,189-195,222-240
1i1e d1i1ea3 A:101-115,189-195,222-240
1s0f d1s0fa3 A:101-115,189-195,222-240
1s0c d1s0ca3 A:101-115,189-195,222-240
1g9b d1g9ba3 A:101-115,189-195,222-240
1s0g d1s0ga3 A:101-115,189-195,222-240
2ima d2imab1 B:101-115,183-188,216-234
1s0d d1s0da3 A:101-115,189-195,222-240
2ilp d2ilpb1 B:101-115,183-188,216-234
2ilp d2ilpa1 A:101-115,183-188,216-234
1xtg d1xtga_ A:101-115,183-188,216-234
2imc d2imcb1 B:101-115,183-188,216-234
3boo d3booa1 A:101-115,183-188,216-234
2ima d2imaa1 A:101-115,183-188,216-234
1xtf d1xtfb_ B:529-543,611-616,644-662
3bok d3boka1 A:101-115,183-188,216-234
2imb d2imbb1 B:101-115,183-188,216-234
1xtf d1xtfa_ A:101-115,183-188,216-234
3bon d3bona1 A:101-115,183-188,216-234
2imc d2imca1 A:101-115,183-188,216-234
1pww d1pwwa1 A:67-78,126-132,140-164
3bta d3btaa3 A:100-114,182-187,215-233
2imb d2imba1 A:101-115,183-188,216-234
1jiz d1jiza_ A:112-126,126-131,152-164
1jiz d1jizb_ B:112-126,126-131,152-164
1umt d1umta_ A:109-129,175-181,194-208
1e1h d1e1h.2 C:100-114,182-187,215-233
1e1h d1e1h.1 A:100-114,182-187,215-233
1oz9 d1oz9a_ A:21-37,40-48,104-122
1k9x d1k9xc_ C:208-224,230-234,259-280
1oo9 d1oo9a_ A:109-129,141-147,194-208
1k9x d1k9xa_ A:208-224,230-234,259-280
1uea d1ueaa_ A:109-129,141-147,194-208
1j7n d1j7na1 A:67-78,126-132,140-164
1xm5 d1xm5b_ B:2020-2032,2039-2047,2103-2121
1k9x d1k9xd_ D:208-224,230-234,259-280
1u4g d1u4ga_ A:71-92,99-105,134-152
1eub d1euba_ A:130-150,162-169,215-230
1xm5 d1xm5c_ C:3020-3032,3039-3047,3103-3121
3ayk d3ayka_ A:26-46,58-64,111-125
1ums d1umsa_ A:109-129,175-182,194-208
4ayk d4ayka_ A:26-46,58-64,111-125
1bqq d1bqqm_ M:136-156,176-182,232-246
1buv d1buvm_ M:136-156,176-182,232-246
1xm5 d1xm5d_ D:4020-4033,4039-4047,4103-4121
1iab d1iaba_ A:23-42,53-60,86-99
1ums d1umsa_ A:109-129,141-148,194-208
1k9x d1k9xb_ B:208-224,230-234,259-280
1u4g d1u4ga_ A:71-92,118-123,134-152
1ka4 d1ka4a_ A:208-224,230-234,259-280
1iaa d1iaaa_ A:23-42,53-60,86-99
1iae d1iaea_ A:23-42,53-60,86-99
1iad d1iada_ A:23-42,53-60,86-99
2ayk d2ayka_ A:26-46,58-64,111-125
1qjj d1qjja_ A:23-42,53-60,86-99
1iac d1iaca_ A:23-42,53-60,86-99
1ka2 d1ka2a_ A:208-224,230-234,259-280
1ast d1asta_ A:23-42,53-60,86-99
1ayk d1ayka_ A:26-46,58-64,111-125
1pww d1pwwa2 A:551-575,582-587,591-611
2ow0 d2ow0a1 A:133-153,165-171,394-408
830c d830ca_ A:130-150,162-168,215-229
2ozr d2ozrc1 C:109-129,141-147,194-208
2ozr d2ozrf1 F:109-129,141-147,194-208
2ozr d2ozrg1 G:109-129,141-147,194-208
1l3f d1l3fe_ E:64-89,118-123,136-154
1hv5 d1hv5b_ B:126-146,158-164,212-226
1qji d1qjia_ A:23-42,53-60,86-99
1ztq d1ztqc1 C:105-125,137-143,190-204
2g4z d2g4za1 A:64-89,118-123,136-154
2srt d2srta_ A:109-129,141-147,194-208
1ezm d1ezma_ A:71-92,118-123,134-152
1c7k d1c7ka_ A:14-29,62-68,76-90
1jky d1jkya2 A:611-626,663-670,679-701
1zxv d1zxvb1 B:67-78,126-133,140-164
1tlp d1tlpe_ E:64-89,118-123,136-154
1lnd d1lnde_ E:64-89,118-123,136-154
7tln d7tlna_ A:64-89,118-123,136-154
1kuh d1kuha_ A:14-29,62-68,76-90
1zxv d1zxvb2 B:551-575,582-587,591-611
1os9 d1os9b_ B:126-146,192-199,211-225
1pwv d1pwva2 A:551-575,582-587,591-611
1kjo d1kjoa_ A:64-89,118-123,136-154
1kei d1keia_ A:64-89,118-123,136-154
1lnc d1lnce_ E:64-89,118-123,136-154
8tln d8tlne_ E:64-89,118-123,136-154
1kl6 d1kl6a_ A:64-89,118-123,136-154
4tln d4tlna_ A:64-89,118-123,136-154
1thl d1thla_ A:64-89,118-123,136-154
1kjp d1kjpa_ A:64-89,118-123,136-154
1zxv d1zxva2 A:551-575,582-587,591-611
1os9 d1os9a_ A:126-146,192-199,211-225
1j7n d1j7nb2 B:551-575,582-587,591-611
4tli d4tlia_ A:64-89,118-123,136-154
1gxw d1gxwa_ A:64-89,118-123,136-154
1kro d1kroa_ A:64-89,118-123,136-154
3tmn d3tmne_ E:64-89,118-123,136-154
1kr6 d1kr6a_ A:64-89,118-123,136-154
1os2 d1os2d_ D:126-146,192-199,211-225
1lnf d1lnfe_ E:64-89,118-123,136-154
1os2 d1os2a_ A:126-146,192-199,211-225
1ks7 d1ks7a_ A:64-89,118-123,136-154
1os2 d1os2b_ B:126-146,192-199,211-225
1kto d1ktoa_ A:64-89,118-123,136-154
1os2 d1os2e_ E:126-146,192-199,211-225
1fjv d1fjva_ A:64-89,118-123,136-154
1zxv d1zxva1 A:67-78,126-133,140-164
1zdp d1zdpe1 E:64-89,118-123,136-154
1lna d1lnae_ E:64-89,118-123,136-154
1z9g d1z9ge1 E:64-89,118-123,136-154
1j7n d1j7na2 A:551-575,582-587,591-611
1j7n d1j7nb1 B:67-78,126-133,140-164
1fj3 d1fj3a_ A:64-89,118-123,136-154
1kkk d1kkka_ A:64-89,118-123,136-154
3tli d3tlia_ A:64-89,118-123,136-154
1pwu d1pwua2 A:551-575,582-587,591-611
1lnb d1lnbe_ E:64-89,118-123,136-154
1fju d1fjua_ A:64-89,118-123,136-154
5tmn d5tmne_ E:64-89,118-123,136-154
1buv d1buvm_ M:136-156,210-216,232-246
1bqq d1bqqm_ M:136-156,210-216,232-246
1hyt d1hyta_ A:64-89,118-123,136-154
1fjw d1fjwa_ A:64-89,118-123,136-154
1jiz d1jiza_ A:27-47,93-100,112-126
1jiz d1jizb_ B:27-47,93-100,112-126
1pe7 d1pe7a_ A:64-89,118-123,136-154
4tmn d4tmne_ E:64-89,118-123,136-154
1pe8 d1pe8a_ A:64-89,118-123,136-154
1fjq d1fjqa_ A:64-89,118-123,136-154
1lne d1lnee_ E:64-89,118-123,136-154
5tln d5tlna_ A:64-89,118-123,136-154
6tmn d6tmne_ E:64-89,118-123,136-154
2a7g d2a7ge1 E:64-89,118-123,136-154
1npc d1npca_ A:65-90,119-124,137-155
2tli d2tlia_ A:64-89,118-123,136-154
1tli d1tlia_ A:64-89,118-123,136-154
2tlx d2tlxa_ A:64-89,118-123,136-154
1pe5 d1pe5a_ A:64-89,118-123,136-154
1fjt d1fjta_ A:64-89,118-123,136-154
1pwq d1pwqa1 A:67-78,126-133,140-164
1jk3 d1jk3a_ A:126-146,192-199,211-225
1ros d1rosa_ A:126-146,192-199,211-225
1pwp d1pwpa2 A:551-575,582-587,591-611
2oy2 d2oy2a1 A:105-125,171-178,190-204
1pwq d1pwqb1 B:67-78,126-133,140-164
1y93 d1y93a1 A:126-146,192-199,211-225
5tli d5tlia_ A:64-89,118-123,136-154
1tmn d1tmne_ E:64-89,118-123,136-154
1tlx d1tlxa_ A:64-89,118-123,136-154
2tmn d2tmne_ E:64-89,118-123,136-154
1y3g d1y3ge1 E:64-89,118-123,136-154
1fjo d1fjoa_ A:64-89,118-123,136-154
1os0 d1os0a_ A:64-89,118-123,136-154
1qf2 d1qf2a_ A:64-89,118-123,136-154
1jk3 d1jk3a_ A:126-146,158-165,211-225
6tli d6tlia_ A:64-89,118-123,136-154
1zp5 d1zp5a1 A:105-125,171-178,190-204
1qf0 d1qf0a_ A:64-89,118-123,136-154
7tli d7tlia_ A:64-89,118-123,136-154
1go8 d1go8p2 P:98-117,161-168,179-195
1ezm d1ezma_ A:71-92,99-105,134-152
1bzs d1bzsa_ A:105-125,171-178,190-204
8tli d8tlia_ A:64-89,118-123,136-154
1qf1 d1qf1a_ A:64-89,118-123,136-154
1smp d1smpa2 A:82-101,149-155,167-183
2oxz d2oxza1 A:126-146,192-199,211-225
1cgf d1cgfb_ B:126-146,158-165,211-225
1os9 d1os9d_ D:126-146,192-199,211-225
1cgf d1cgfb_ B:126-146,192-199,211-225
2hu6 d2hu6a1 A:126-146,192-199,211-225
1bm6 d1bm6a_ A:109-129,141-148,194-209
2oxu d2oxua1 A:126-146,192-199,211-225
1go7 d1go7p2 P:98-117,161-168,179-195
1af0 d1af0a2 A:82-101,149-156,167-183
1os2 d1os2d_ D:126-146,158-165,211-225
1k9x d1k9xa_ A:208-224,248-254,259-280
2oxw d2oxwa1 A:126-146,192-199,211-225
1k7g d1k7ga2 A:98-117,161-168,179-195
2oc2 d2oc2a1 A:311-327,364-370,374-395
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1os9 d1os9c_ C:126-146,192-199,211-225
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53. c.14.1 ClpP/crotonase
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1xnw d1xnwc2 C:297-307,369-380,498-516
2a7s d2a7sf2 F:313-323,384-395,516-532
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1pix d1pixb3 B:321-331,407-418,543-562
54. d.50.3 YcfA/nrd intein domain
dsRBD-like alpha-beta(3)-alpha; 2 layers: alpha/beta
1whz d1whza_ A:6-18,36-43,49-61
1dq3 d1dq3a2 A:343-355,371-378,386-402
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1dq3 d1dq3a2 A:343-355,356-362,386-402
2hjj d2hjja1 A:13-25,26-33,58-68
55. d.218.1 Nucleotidyltransferase
Nucleotidyltransferase core: alpha-beta-turn-beta-X-beta-(alpha); mixed beta-sheet, order of core strands: 123
1bpx d1bpxa4 A:275-290,290-295,315-324
3c2l d3c2la3 A:275-290,290-295,315-324
1bpz d1bpza4 A:275-290,290-295,315-324
9icp d9icpa4 A:275-290,290-295,315-324
3c2m d3c2ma3 A:275-290,290-295,315-324
7icf d7icfa4 A:275-290,290-295,315-324
1jn3 d1jn3a2 A:275-290,290-295,315-324
1zqv d1zqva2 A:275-290,290-295,315-324
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2fmq d2fmqa3 A:275-290,290-295,315-324
7icj d7icja4 A:275-290,290-295,315-324
7icp d7icpa4 A:275-290,290-295,315-324
1zjm d1zjma3 A:275-290,290-295,315-324
7icu d7icua4 A:275-290,290-295,315-324
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8icy d8icya4 A:275-290,290-295,315-324
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3c2k d3c2ka3 A:275-290,290-295,315-324
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7icg d7icga4 A:275-290,290-295,315-324
2bpf d2bpfa4 A:275-290,290-295,315-324
2bpc d2bpca2 A:275-290,290-295,315-324
9icr d9icra4 A:275-290,290-295,315-324
7icq d7icqa4 A:275-290,290-295,315-324
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2iso d2isoa3 A:275-290,290-295,315-324
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1nom d1noma2 A:275-290,290-295,315-324
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1zqx d1zqxa2 A:275-290,290-295,315-324
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9icv d9icva4 A:275-290,290-295,315-324
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7icm d7icma4 A:275-290,290-295,315-324
1huz d1huzb4 B:275-290,290-295,315-324
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1zqy d1zqya2 A:275-290,290-295,315-324
1zqn d1zqna4 A:275-290,290-295,315-324
8ict d8icta4 A:275-290,290-295,315-324
8icm d8icma4 A:275-290,290-295,315-324
9ich d9icha4 A:275-290,290-295,315-324
1bpy d1bpya4 A:275-290,290-295,315-324
1zqz d1zqza2 A:275-290,290-295,315-324
9icb d9icba4 A:275-290,290-295,315-324
8icx d8icxa4 A:275-290,290-295,315-324
9icm d9icma4 A:275-290,290-295,315-324
7ich d7icha4 A:275-290,290-295,315-324
8ice d8icea4 A:275-290,290-295,315-324
1zqp d1zqpa4 A:275-290,290-295,315-324
1mq3 d1mq3a3 A:275-290,290-295,315-324
1zqf d1zqfa4 A:275-290,290-295,315-324
8icc d8icca4 A:275-290,290-295,315-324
9ica d9icaa4 A:275-290,290-295,315-324
9ico d9icoa4 A:275-290,290-295,315-324
8icp d8icpa4 A:275-290,290-295,315-324
8icj d8icja4 A:275-290,290-295,315-324
1zqu d1zqua2 A:275-290,290-295,315-324
8icv d8icva4 A:275-290,290-295,315-324
9icx d9icxa4 A:275-290,290-295,315-324
7ics d7icsa4 A:275-290,290-295,315-324
2bpg d2bpgb4 B:275-290,290-295,315-324
9icf d9icfa4 A:275-290,290-295,315-324
9ice d9icea4 A:275-290,290-295,315-324
9icw d9icwa4 A:275-290,290-295,315-324
1zqe d1zqea4 A:275-290,290-295,315-324
1bpe d1bpea3 A:275-290,290-295,315-324
1zqo d1zqoa4 A:275-290,290-295,315-324
8icb d8icba4 A:275-290,290-295,315-324
8icu d8icua4 A:275-290,290-295,315-324
1tva d1tvaa3 A:275-290,290-295,315-324
1zql d1zqla4 A:275-290,290-295,315-324
1zqa d1zqaa4 A:275-290,290-295,315-324
1zqi d1zqia4 A:275-290,290-295,315-324
1zqs d1zqsa4 A:275-290,290-295,315-324
1huz d1huza4 A:275-290,290-295,315-324
8ica d8icaa4 A:275-290,290-295,315-324
9ici d9icia4 A:275-290,290-295,315-324
1huo d1huoa4 A:275-290,290-295,315-324
1zqm d1zqma4 A:275-290,290-295,315-324
8ics d8icsa4 A:275-290,290-295,315-324
1zqt d1zqta4 A:275-290,290-295,315-324
8icg d8icga4 A:275-290,290-295,315-324
1bpd d1bpda3 A:275-290,290-295,315-324
8icw d8icwa4 A:275-290,290-295,315-324
8icr d8icra4 A:275-290,290-295,315-324
1zqc d1zqca4 A:275-290,290-295,315-324
2bpg d2bpga4 A:275-290,290-295,315-324
8ich d8icha4 A:275-290,290-295,315-324
1zqk d1zqka4 A:275-290,290-295,315-324
1zqg d1zqga4 A:275-290,290-295,315-324
8icn d8icna4 A:275-290,290-295,315-324
1zqd d1zqda4 A:275-290,290-295,315-324
1zqh d1zqha4 A:275-290,290-295,315-324
1huo d1huob4 B:275-290,290-295,315-324
2pfn d2pfna3 A:509-524,524-529,555-564
8icf d8icfa4 A:275-290,290-295,315-324
2pfo d2pfoa3 A:509-524,524-529,555-564
2bcu d2bcua3 A:509-524,524-529,555-564
2pfp d2pfpa3 A:509-524,524-529,555-564
2bcs d2bcsa3 A:509-524,524-529,555-564
9icy d9icya4 A:275-290,290-295,315-324
1xsp d1xspa3 A:509-524,524-529,555-564
9icj d9icja4 A:275-290,290-295,315-324
1xsn d1xsna3 A:509-524,524-529,555-564
3c5f d3c5fa3 A:509-524,524-529,555-564
2bcq d2bcqa3 A:509-524,524-529,555-564
2bcr d2bcra3 A:509-524,524-529,555-564
3c5f d3c5fb3 B:509-524,524-529,555-564
1rzt d1rzta3 A:509-524,524-529,555-564
2bcv d2bcva3 A:509-524,524-529,555-564
1xsl d1xsli3 I:509-524,524-529,555-564
3c5g d3c5gb3 B:509-524,524-529,555-564
3c5g d3c5ga3 A:509-524,524-529,555-564
1rzt d1rzte3 E:509-524,524-529,555-564
1rzt d1rzti3 I:509-524,524-529,555-564
1xsl d1xslm3 M:509-524,524-529,555-564
1rzt d1rztm3 M:509-524,524-529,555-564
2gws d2gwse3 E:509-524,524-529,555-564
2gws d2gwsi3 I:509-524,524-529,555-564
1xsl d1xsla3 A:509-524,524-529,555-564
1xsl d1xsle3 E:509-524,524-529,555-564
2pfq d2pfqa3 A:509-524,524-529,555-564
2gws d2gwsm3 M:509-524,524-529,555-564
2gws d2gwsa3 A:509-524,524-529,555-564
1kdh d1kdha4 A:453-469,469-474,490-499
1jms d1jmsa4 A:453-469,469-474,490-499
1jqr d1jqra_ A:119-134,134-139,155-164
1kej d1keja4 A:453-469,469-474,490-499
1jaj d1jaja_ A:119-134,134-139,155-164
2b4v d2b4va2 A:167-175,213-222,223-236
2b4v d2b4va2 A:83-90,97-104,271-289
2bpg d2bpgb4 B:264-275,305-311,315-324
1tv9 d1tv9a3 A:261-274,305-311,315-324
1zqz d1zqza2 A:261-274,306-311,315-324
1zjn d1zjna3 A:264-274,305-311,315-324
2pxi d2pxia3 A:264-274,305-311,315-324
2iso d2isoa3 A:264-274,305-311,315-324
2fmq d2fmqa3 A:264-274,305-311,315-324
2isp d2ispa3 A:264-274,305-311,315-324
2van d2vana2 A:261-274,305-311,315-324
2fms d2fmsa3 A:264-274,305-311,315-324
3c2k d3c2ka3 A:264-274,305-311,315-324
1zjm d1zjma3 A:261-274,305-311,315-324
1nom d1noma2 A:261-274,306-311,315-324
2i9g d2i9ga3 A:261-274,305-311,315-324
1zqv d1zqva2 A:261-274,307-311,315-324
1rpl d1rpla2 A:261-274,306-311,315-324
1zqw d1zqwa2 A:261-274,307-311,315-324
1zqu d1zqua2 A:261-274,307-311,315-324
2bpg d2bpga4 A:264-274,305-311,315-324
1zqy d1zqya2 A:261-274,307-311,315-324
1mq3 d1mq3a3 A:275-290,305-311,315-324
1huz d1huza4 A:275-290,305-311,315-324
1xsp d1xspa3 A:495-508,546-551,555-564
2bcs d2bcsa3 A:495-508,546-551,555-564
2bcr d2bcra3 A:495-508,546-551,555-564
56. c.87.1 UDP-Glycosyltransferase/glycogen phosphorylase
UDP-Glycosyltransferase/glycogen phosphorylase consists of two non-similar domains with 3 layers (a/b/a) each ! domain 1: parallel beta-sheet of 7 strands, order 3214567 ! domain 2: parallel beta-sheet of 6 strands, order 321456
1rzu d1rzua_ A:305-320,367-372,426-444
1rzu d1rzub_ B:305-320,367-372,426-444
1rzv d1rzvb_ B:305-320,367-372,426-444
1rzv d1rzva_ A:305-320,367-372,426-444
1v4v d1v4vb_ B:210-229,295-300,320-335
1vgv d1vgvd_ D:9-27,88-94,360-373
1vgv d1vgvb_ B:219-237,303-308,328-343
1vgv d1vgvb_ B:16-27,112-117,360-373
1f0k d1f0kb_ B:18-34,98-104,341-356
1f6d d1f6dc_ C:219-237,303-308,328-343
1v4v d1v4va_ A:210-229,295-300,320-335
1o6c d1o6cb_ B:215-231,297-302,322-337
1psw d1pswa_ A:198-213,262-268,331-348
1v4v d1v4vb_ B:210-229,275-281,320-335
1f0k d1f0ka_ A:16-34,98-105,341-356
1o6c d1o6cb_ B:215-231,278-283,322-337
1f6d d1f6dd_ D:9-27,88-94,360-373
1vgv d1vgva_ A:219-237,303-308,328-343
2bfw d2bfwa1 A:264-279,330-335,379-393
1o6c d1o6ca_ A:216-231,278-283,322-337
1f6d d1f6db_ B:219-237,303-308,328-343
1vgv d1vgvd_ D:219-237,303-308,328-343
1vgv d1vgvc_ C:9-27,88-94,360-373
1f6d d1f6dc_ C:16-27,112-117,360-373
1rrv d1rrvb_ B:10-28,96-102,386-400
1f6d d1f6dd_ D:219-237,303-308,328-343
2nzw d2nzwa1 A:192-207,233-239,286-301
1vgv d1vgvc_ C:219-237,303-308,328-343
1pyg d1pygc_ C:575-594,661-666,772-794
1f6d d1f6db_ B:16-27,112-117,360-373
1em6 d1em6b_ B:575-594,661-666,772-794
1em6 d1em6a_ A:575-594,661-666,772-794
1exv d1exvb_ B:575-594,661-666,772-794
2asv d2asvb1 B:540-559,626-631,739-761
1exv d1exva_ A:575-594,661-666,772-794
1f6d d1f6da_ A:219-237,303-308,328-343
2asv d2asva1 A:540-559,626-631,739-761
1f6d d1f6dc_ C:219-237,284-289,328-343
2iw1 d2iw1a1 A:14-31,94-98,356-370
2ecp d2ecpb_ B:575-594,661-666,772-794
1l5s d1l5sa_ A:575-594,661-666,772-794
2f9f d2f9fa1 A:27-39,89-94,138-153
1vgv d1vgvb_ B:16-27,88-94,360-373
1fc0 d1fc0a_ A:575-594,661-666,772-794
2ecp d2ecpa_ A:575-594,661-666,772-794
1fc0 d1fc0b_ B:1575-1594,1661-1666,1772-1794
1l5w d1l5wa_ A:540-559,626-631,739-761
1vgv d1vgvd_ D:9-27,112-117,360-373
1psw d1pswa_ A:10-29,82-88,130-141
1f6d d1f6dc_ C:16-27,88-94,360-373
1l5r d1l5ra_ A:575-594,661-666,772-794
1l5v d1l5vb_ B:540-559,626-631,739-761
1l5w d1l5wb_ B:540-559,626-631,739-761
2iv7 d2iv7a1 A:14-31,94-98,356-370
1l5v d1l5va_ A:540-559,626-631,739-761
1l5r d1l5rb_ B:575-594,661-666,772-794
1l6i d1l6ia_ A:540-559,626-631,739-761
1uqu d1uqua_ A:21-34,124-130,438-453
2nzw d2nzwc1 C:192-206,233-239,286-301
1rrv d1rrvb_ B:249-267,324-329,356-369
1e4o d1e4ob_ B:540-559,626-631,739-761
1e4o d1e4oa_ A:540-559,626-631,739-761
2nzw d2nzwb1 B:192-206,233-239,286-301
1vgv d1vgva_ A:9-27,88-94,358-373
1rrv d1rrva_ A:249-267,324-329,356-369
3cej d3cejb1 B:575-594,661-666,776-794
1l6i d1l6ib_ B:540-559,626-631,739-761
1ahp d1ahpb_ B:540-559,626-631,739-761
1ahp d1ahpa_ A:540-559,626-631,739-761
2nzy d2nzyc1 C:192-207,233-239,286-301
2qll d2qlla1 A:575-594,661-666,772-794
2aw3 d2aw3a1 A:540-559,626-631,739-761
1vgv d1vgvc_ C:9-27,112-117,360-373
1qm5 d1qm5a_ A:540-559,626-631,739-761
1qm5 d1qm5b_ B:540-559,626-631,739-761
2av6 d2av6a1 A:540-559,626-631,739-761
1f6d d1f6dd_ D:9-27,112-117,360-373
1v4v d1v4va_ A:14-32,93-98,352-366
2av6 d2av6b1 B:540-559,626-631,739-761
2nzy d2nzya1 A:192-207,233-239,286-301
1uqu d1uqub_ B:21-34,124-130,438-454
2nzx d2nzxa1 A:192-207,233-239,286-301
2zb2 d2zb2b1 B:575-594,661-666,776-794
1uqt d1uqta_ A:21-34,124-130,438-454
1f6d d1f6db_ B:16-27,88-94,360-373
1v4v d1v4va_ A:14-32,116-122,352-366
2aw3 d2aw3b1 B:540-559,626-631,739-761
2azd d2azdb1 B:540-559,626-631,739-761
2nzy d2nzyb1 B:192-207,233-239,286-301
1v4v d1v4va_ A:210-229,275-281,320-335
1rrv d1rrva_ A:249-267,304-310,356-369
1pnv d1pnvb_ B:233-251,287-294,344-357
2nzx d2nzxc1 C:192-207,233-239,286-301
2nzx d2nzxb1 B:192-207,233-239,286-301
1fa9 d1fa9a_ A:575-593,661-666,772-794
1uqt d1uqtb_ B:21-34,124-130,438-454
1f6d d1f6da_ A:16-27,88-94,360-373
1rrv d1rrvb_ B:249-267,303-310,356-369
1vgv d1vgvc_ C:219-237,284-289,328-343
1f0k d1f0kb_ B:18-34,121-127,341-356
2ati d2atia1 A:575-594,661-666,776-794
2iei d2ieib1 B:575-594,661-666,772-794
1vgv d1vgvb_ B:219-237,284-289,328-343
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2vg8 d2vg8a1 A:16-35,132-139,454-476
1o6c d1o6ca_ A:12-30,31-41,352-368
2vch d2vcha1 A:16-35,132-139,454-476
2vce d2vcea1 A:16-35,132-139,454-476
1vgv d1vgvc_ C:9-27,29-38,360-373
1rrv d1rrva_ A:10-28,29-36,386-401
2bis d2bisa1 A:264-278,283-293,379-397
1ygp d1ygpb_ B:575-592G,600-609,772-795
1pnv d1pnvb_ B:10-28,29-36,374-391
1iir d1iira_ A:10-28,29-36,385-401
1pn3 d1pn3b_ B:10-28,29-36,374-391
2bis d2bisc1 C:264-279,283-292,379-397
3cej d3cejb1 B:575-594,600-609,776-794
1pnv d1pnva_ A:10-28,29-36,374-390
1pn3 d1pn3a_ A:10-28,29-36,374-391
57. c.72.2 MurD-like peptide ligases, catalytic domain has extra strand located between strands 1 and 2 !
Ribokinase-like core: 3 layers: a/b/a; mixed beta-sheet of 8 strands, order 21345678, strand 7 is antiparallel to the rest ! potential superfamily: members of this fold have similar functions but different ATP-binding sites
1j6u d1j6ua3 A:112-128,171-178,263-281
1gqq d1gqqb3 B:125-144,187-194,289-307
1p31 d1p31b3 B:128-144,187-194,289-307
1p31 d1p31a3 A:128-144,187-194,289-307
1p3d d1p3da3 A:128-144,187-194,289-307
1gqy d1gqyb3 B:128-144,187-194,289-307
1p3d d1p3db3 B:128-144,187-194,289-307
1gqy d1gqya3 A:128-144,187-194,289-307
1gg4 d1gg4b4 B:610-626,677-684,779-797
1o5z d1o5za2 A:47-66,158-165,257-275
1gqq d1gqqa3 A:128-144,187-194,289-307
1e0d d1e0da3 A:114-130,172-178,265-283
1gg4 d1gg4a4 A:110-126,176-184,279-297
1fgs d1fgsa2 A:46-65,158-165,258-280
1e8c d1e8ca3 A:118-134,199-206,304-322
2gca d2gcaa2 A:46-65,159-165,258-280
1uag d1uaga3 A:114-130,172-178,265-283
1e8c d1e8cb3 B:118-134,199-206,304-322
1e8c d1e8ca3 A:118-134,177-183,304-322
2uuo d2uuoa3 A:114-130,172-178,265-283
1e8c d1e8cb3 B:118-134,177-183,304-322
1p31 d1p31a3 A:128-144,168-174,289-307
3uag d3uaga3 A:114-130,172-179,265-283
2gc6 d2gc6a2 A:49-65,138-144,258-280
1p31 d1p31b3 B:128-144,168-174,289-307
1p3d d1p3da3 A:128-144,168-174,289-307
1p3d d1p3db3 B:128-144,168-174,289-307
2uag d2uaga3 A:114-130,172-179,265-283
1jbv d1jbva2 A:49-65,138-144,258-280
4uag d4uaga3 A:114-130,172-179,265-283
1gg4 d1gg4b4 B:610-626,653-659,779-797
1gqy d1gqya3 A:128-144,168-174,289-307
2jfg d2jfga3 A:114-130,172-179,265-283
2jff d2jffa3 A:114-130,172-179,265-283
1gqy d1gqyb3 B:128-144,168-174,289-307
2uup d2uupa3 A:114-130,172-179,265-283
1eeh d1eeha3 A:114-130,172-177,265-283
1jbw d1jbwa2 A:49-65,138-144,258-280
3uag d3uaga3 A:114-130,152-158,265-283
2gc5 d2gc5a2 A:46-65,159-166,258-280
2jfh d2jfha3 A:114-130,172-179,265-283
1gg4 d1gg4a4 A:110-126,153-159,279-297
2uag d2uaga3 A:114-130,152-158,265-283
2uup d2uupa3 A:114-130,152-158,265-283
1jbv d1jbva2 A:49-65,159-166,258-280
2gcb d2gcba2 A:46-65,158-166,258-280
2jff d2jffa3 A:114-130,152-158,265-283
4uag d4uaga3 A:114-130,152-158,265-283
2jfg d2jfga3 A:114-130,152-158,265-283
1fgs d1fgsa2 A:46-65,138-144,258-280
2gc5 d2gc5a2 A:46-65,138-144,258-280
2uuo d2uuoa3 A:114-130,152-158,265-283
2gc6 d2gc6a2 A:49-65,158-166,258-280
1uag d1uaga3 A:114-130,152-158,265-283
1jbw d1jbwa2 A:49-65,159-166,258-280
2gca d2gcaa2 A:46-65,138-144,258-280
1e0d d1e0da3 A:114-130,152-158,265-283
2jfh d2jfha3 A:114-130,152-158,265-283
1eeh d1eeha3 A:114-130,152-158,265-283
2gcb d2gcba2 A:46-65,138-144,258-280
1jbv d1jbva2 A:49-65,192-198,258-280
2gc6 d2gc6a2 A:49-65,192-198,258-280
1jbw d1jbwa2 A:49-65,192-198,258-280
1gqq d1gqqb3 B:125-144,224-230,289-307
2gc5 d2gc5a2 A:46-65,192-198,258-280
1o5z d1o5za2 A:47-66,192-199,257-275
2gcb d2gcba2 A:46-65,192-198,258-280
2gca d2gcaa2 A:46-65,192-198,258-280
1fgs d1fgsa2 A:46-65,192-198,258-280
58. b.45.1 FMN-binding split barrel related to the ferredoxin reductase-like FAD-binding domain !
Split barrel-like barrel; n=6, S=10; greek-key
2arz d2arzb1 B:155-172,190-197,219-233
2arz d2arza1 A:155-172,190-197,219-233
59. c.77.1 Isocitrate/Isopropylmalate dehydrogenase-like the constituent families form similar dimers !
Isocitrate/Isopropylmalate dehydrogenase-like consists of two intertwined (sub)domains related by pseudo dyad; duplication ! 3 layers: a/b/a; single mixed beta-sheet of 10 strands, order 213A945867 (A=10); strands from 5 to 9 are antiparallel to the rest
1ika d1ikaa_ A:34-58,96-102,352-368
1a05 d1a05b_ B:10-32,66-73,291-308
8icd d8icda_ A:34-58,96-103,352-368
1t0l d1t0lc_ C:16-34,68-74,328-348
1a05 d1a05a_ A:10-32,66-73,291-308
1sjs d1sjsa_ A:34-58,96-103,352-368
7icd d7icda_ A:34-58,96-103,352-368
1bl5 d1bl5a_ A:34-58,96-103,352-368
3icd d3icda_ A:34-58,96-103,352-368
1ai2 d1ai2a_ A:34-58,96-103,352-368
6icd d6icda_ A:34-58,96-103,352-368
4icd d4icda_ A:34-58,96-103,352-368
5icd d5icda_ A:34-58,96-103,352-368
1hqs d1hqsb_ B:27-51,87-94,358-374
1pb3 d1pb3a_ A:34-58,96-103,352-368
1ai3 d1ai3a_ A:34-58,96-103,352-368
1iso d1isoa_ A:34-58,96-103,352-368
1grp d1grpa_ A:34-58,96-103,352-368
1idc d1idca_ A:34-58,96-103,352-368
1gro d1groa_ A:34-58,96-103,352-368
1idd d1idda_ A:34-58,96-102,352-368
1p8f d1p8fa_ A:34-58,96-103,352-368
1cnz d1cnza_ A:13-35,69-76,297-314
1hj6 d1hj6a_ A:34-58,96-103,352-368
1cw1 d1cw1a_ A:34-58,96-103,352-368
9icd d9icda_ A:34-58,96-103,352-368
1cw4 d1cw4a_ A:34-58,96-103,352-368
1pb1 d1pb1a_ A:34-58,96-103,352-368
1idf d1idfa_ A:34-58,96-102,352-368
1ide d1idea_ A:34-58,96-103,352-368
1cm7 d1cm7b_ B:13-35,69-76,297-314
1cw7 d1cw7a_ A:34-58,96-102,352-368
1hqs d1hqsa_ A:27-51,87-94,358-374
1vlc d1vlca_ A:9-31,65-72,287-304
1gc8 d1gc8b_ B:9-31,65-72,286-303
1osi d1osia_ A:9-31,65-72,286-303
1osi d1osib_ B:9-31,65-72,286-303
1xac d1xaca_ A:9-31,65-72,286-303
1xaa d1xaaa_ A:9-31,65-72,286-303
1xab d1xaba_ A:9-31,65-72,286-303
1g2u d1g2ua_ A:9-31,65-72,286-303
2ayq d2ayqa_ A:11-33,67-74,292-309
1cnz d1cnzb_ B:13-35,69-76,297-314
1gc8 d1gc8a_ A:1009-1031,1065-1072,1286-1303
2ayq d2ayqb_ B:11-33,67-74,292-309
1osj d1osjb_ B:9-31,65-72,286-303
1j1w d1j1wc_ C:379-397,483-488,520-535
1j1w d1j1wb_ B:379-397,483-488,520-535
1dpz d1dpza_ A:9-31,65-72,286-303
1dpz d1dpzb_ B:9-31,65-72,286-303
1j1w d1j1wa_ A:379-397,483-488,520-535
1j1w d1j1wd_ D:379-397,483-488,520-535
1hex d1hexa_ A:9-31,65-72,286-303
1gc9 d1gc9a_ A:9-31,65-72,286-303
1osj d1osja_ A:9-31,65-72,286-303
1xad d1xada_ A:8-31,65-72,286-303
1v53 d1v53a1 A:11-33,67-74,292-309
1dr0 d1dr0b_ B:9-31,65-72,286-303
1itw d1itwa_ A:379-397,483-488,520-535
1idm d1idma_ A:8-31,65-72,284-301
1dr0 d1dr0a_ A:9-31,65-72,286-303
1wal d1wala_ A:8-31,65-72,286-303
1itw d1itwc_ C:379-397,483-488,520-535
1osi d1osic_ C:8-31,65-72,286-303
1itw d1itwb_ B:379-397,483-488,520-535
1ipd d1ipda_ A:8-31,65-72,286-303
1dr8 d1dr8b_ B:9-31,65-72,286-303
1wpw d1wpwa_ A:9-32,66-74,269-289
1osi d1osid_ D:8-31,65-72,286-303
1dr8 d1dr8a_ A:9-31,65-72,286-303
1itw d1itwd_ D:379-397,483-488,520-535
1v53 d1v53b1 B:10-30,67-74,292-309
2g4o d2g4oc1 C:9-28,61-68,283-299
1w0d d1w0db_ B:9-28,61-68,283-299
1wpw d1wpwa_ A:9-32,34-40,269-289
2g4o d2g4ob1 B:9-28,61-68,283-299
2g4o d2g4od1 D:9-28,61-68,283-299
1w0d d1w0dd_ D:9-28,61-68,283-299
1w0d d1w0da_ A:9-28,61-68,283-299
1w0d d1w0dc_ C:9-28,61-68,283-299
2g4o d2g4oa1 A:9-28,61-68,283-299
1t0l d1t0la_ A:54-68,68-74,328-348
1ai3 d1ai3a_ A:34-58,61-68,352-368
1p8f d1p8fa_ A:34-58,61-68,352-368
1cw7 d1cw7a_ A:34-58,61-68,352-368
1iso d1isoa_ A:34-58,61-68,352-368
1wpw d1wpwb_ B:20-32,34-40,269-289
1xco d1xcoc_ C:26-40,42-48,307-323
1xco d1xcod_ D:26-40,42-48,307-323
1ai2 d1ai2a_ A:34-58,61-68,352-368
1td9 d1td9e_ E:26-40,42-48,307-323
1td9 d1td9d_ D:26-40,42-48,307-323
1xco d1xcof_ F:26-40,42-48,307-323
1td9 d1td9f_ F:26-40,42-48,307-323
1td9 d1td9b_ B:26-40,42-48,307-323
1td9 d1td9c_ C:26-40,42-48,307-323
1vmi d1vmia_ A:24-38,40-46,308-323
1ika d1ikaa_ A:34-58,61-68,352-368
1ipd d1ipda_ A:8-31,266-272,286-303
1t0l d1t0lb_ B:16-31,68-74,328-348
1td9 d1td9a_ A:26-40,42-48,307-323
1cw4 d1cw4a_ A:34-58,61-68,352-368
1cw1 d1cw1a_ A:34-58,61-68,352-368
1xco d1xcob_ B:26-40,42-48,307-323
1pb3 d1pb3a_ A:34-58,61-68,352-368
1pb1 d1pb1a_ A:34-58,61-68,352-368
5icd d5icda_ A:34-58,61-68,352-368
1xco d1xcoa_ A:26-40,42-48,307-323
1t09 d1t09a_ A:16-31,68-74,328-348
1xco d1xcoe_ E:26-40,42-48,307-323
1u7n d1u7na_ A:12-29,92-97,301-319
1idc d1idca_ A:34-58,61-68,352-368
7icd d7icda_ A:34-58,61-68,352-368
1xad d1xada_ A:8-31,266-272,286-303
1idm d1idma_ A:8-31,264-270,284-301
1hj6 d1hj6a_ A:34-58,61-68,352-368
1t0l d1t0ld_ D:16-31,68-74,328-348
6icd d6icda_ A:34-58,61-68,352-368
1wal d1wala_ A:8-31,266-272,286-303
9icd d9icda_ A:34-58,61-68,352-368
1bl5 d1bl5a_ A:34-58,61-68,352-368
1vmi d1vmia_ A:24-38,117-123,308-323
4icd d4icda_ A:34-58,61-68,352-368
8icd d8icda_ A:34-58,61-68,352-368
1osi d1osic_ C:8-31,266-272,286-303
1ps7 d1ps7c_ C:16-28,113-121,310-329
1osi d1osid_ D:8-31,267-272,286-303
3icd d3icda_ A:34-58,61-68,352-368
1sjs d1sjsa_ A:34-58,61-68,352-368
1cnz d1cnza_ A:13-35,276-283,297-314
1u7n d1u7nb_ B:12-29,92-97,301-319
1gro d1groa_ A:34-58,61-68,352-368
1t0l d1t0la_ A:16-31,68-74,328-348
1qzt d1qztb_ B:3-16,17-22,313-332
1hqs d1hqsb_ B:27-51,54-61,358-374
1grp d1grpa_ A:34-58,61-68,352-368
1osi d1osia_ A:158-177,231-236,236-251
1t09 d1t09b_ B:16-31,68-74,328-348
1osi d1osib_ B:158-177,231-236,236-251
1cnz d1cnza_ A:13-35,37-43,297-314
1lwd d1lwda_ A:17-32,69-75,328-348
1v53 d1v53b1 B:10-30,272-278,292-309
1a05 d1a05a_ A:10-32,270-277,291-308
1r5j d1r5ja_ A:28-42,44-50,311-329
1dpz d1dpzb_ B:9-31,266-272,286-303
1dpz d1dpza_ A:9-31,266-272,286-303
1ide d1idea_ A:34-58,61-68,352-368
1a05 d1a05b_ B:10-32,34-40,291-308
1lwd d1lwdb_ B:17-32,69-75,328-348
1r5j d1r5ja_ A:28-42,121-126,311-329
1idf d1idfa_ A:34-58,61-68,352-368
1dr0 d1dr0a_ A:158-177,231-236,236-251
1a05 d1a05b_ B:10-32,270-277,291-308
1a05 d1a05a_ A:10-32,34-40,291-308
1r5j d1r5jb_ B:28-42,44-50,311-329
1idd d1idda_ A:34-58,61-68,352-368
1r5j d1r5jb_ B:28-42,121-126,311-329
1cnz d1cnzb_ B:13-35,276-283,297-314
1hex d1hexa_ A:158-177,231-236,236-251
1xco d1xcoc_ C:26-40,119-125,307-323
1osj d1osja_ A:9-31,266-272,286-303
1g2u d1g2ua_ A:158-177,231-236,236-251
1ipd d1ipda_ A:158-177,231-236,236-251
1ps6 d1ps6a_ A:16-28,113-121,310-329
1r8k d1r8ka_ A:16-29,113-121,310-329
1gc8 d1gc8a_ A:1009-1031,1266-1272,1286-1303
1cm7 d1cm7a_ A:13-35,69-78,297-314
1gc8 d1gc8b_ B:9-31,266-272,286-303
1cnz d1cnzb_ B:13-35,37-43,297-314
1xab d1xaba_ A:9-31,266-272,286-303
1xaa d1xaaa_ A:9-31,266-272,286-303
1xco d1xcoa_ A:26-40,119-125,307-323
1w0d d1w0da_ A:151-170,225-230,230-246
1itw d1itwb_ B:12-34,75-84,602-622
1gc9 d1gc9a_ A:9-31,266-272,286-303
1g2u d1g2ua_ A:9-31,266-272,286-303
1cm7 d1cm7b_ B:13-35,276-283,297-314
1hex d1hexa_ A:9-31,267-272,286-303
1td9 d1td9e_ E:26-40,119-125,307-323
1td9 d1td9d_ D:26-40,119-125,307-323
1osj d1osjb_ B:9-31,266-272,286-303
1dr0 d1dr0b_ B:9-31,266-272,286-303
1td9 d1td9a_ A:26-40,119-125,307-323
1osi d1osia_ A:9-31,266-272,286-303
1w0d d1w0db_ B:151-170,225-230,230-246
1cm7 d1cm7a_ A:13-35,36-43,297-314
1osi d1osib_ B:9-31,267-272,286-303
1hqs d1hqsa_ A:27-51,54-61,358-374
1xco d1xcoe_ E:26-40,119-126,307-323
1hqs d1hqsb_ B:193-212,301-306,306-322
1ptm d1ptmb_ B:16-28,113-121,310-329
1xco d1xcob_ B:26-40,119-126,307-323
1xac d1xaca_ A:9-31,266-272,286-303
1xco d1xcod_ D:26-40,119-126,307-323
1dr0 d1dr0a_ A:9-31,266-272,286-303
1td9 d1td9b_ B:26-40,119-125,307-323
1w0d d1w0dd_ D:151-170,225-230,230-246
1ptm d1ptma_ A:16-28,113-121,310-329
1itw d1itwd_ D:12-34,75-84,602-622
1wpw d1wpwb_ B:142-161,214-219,219-235
1itw d1itwa_ A:12-34,75-84,602-622
1td9 d1td9c_ C:26-40,119-126,307-323
1dr8 d1dr8a_ A:9-31,266-272,286-303
1dr8 d1dr8b_ B:9-31,266-272,286-303
1xco d1xcof_ F:26-40,119-126,307-323
2af4 d2af4d1 D:3-16,17-22,313-332
1wpw d1wpwb_ B:10-21,66-74,269-289
2ayq d2ayqa_ A:11-33,272-278,292-309
1qzt d1qztc_ C:3-16,17-22,313-332
1ps6 d1ps6b_ B:16-28,114-121,310-329
2g4o d2g4ob1 B:151-170,225-230,230-246
1ps7 d1ps7b_ B:16-28,114-121,310-329
1v53 d1v53b1 B:163-182,236-241,241-256
1r8k d1r8kb_ B:16-27,113-121,310-328
1qzt d1qzta_ A:3-16,17-22,313-332
2af3 d2af3c1 C:3-16,17-22,313-332
1sjs d1sjsa_ A:202-221,297-302,302-318
2ayq d2ayqb_ B:11-33,272-278,292-309
2af4 d2af4c1 C:2-16,17-22,313-333
1vi1 d1vi1a_ A:12-29,93-98,299-317
1vlc d1vlca_ A:9-31,32-39,287-304
1cw4 d1cw4a_ A:202-221,297-302,302-318
4icd d4icda_ A:202-221,297-302,302-318
3icd d3icda_ A:202-221,297-302,302-318
1v53 d1v53a1 A:11-33,272-278,292-309
1qzt d1qztd_ D:3-16,17-22,313-332
1vlc d1vlca_ A:160-179,233-238,238-253
1itw d1itwb_ B:12-34,35-43,602-622
1ika d1ikaa_ A:202-221,297-302,302-318
2af3 d2af3d1 D:26-40,42-48,313-332
2g4o d2g4oc1 C:9-28,263-269,283-299
1itw d1itwd_ D:12-34,35-43,602-622
7icd d7icda_ A:202-221,297-302,302-318
1w0d d1w0dd_ D:9-28,263-269,283-299
1ps7 d1ps7d_ D:16-28,113-121,311-329
2g4o d2g4od1 D:9-28,263-269,283-299
1w0d d1w0db_ B:9-28,263-269,283-299
1xaa d1xaaa_ A:158-178,231-236,236-251
1itw d1itwc_ C:12-34,35-43,602-622
1osj d1osja_ A:158-177,231-237,236-252
1w0d d1w0dc_ C:9-28,263-269,283-299
2g4o d2g4ob1 B:9-28,263-269,283-299
1vi1 d1vi1b_ B:12-29,93-98,299-317
1itw d1itwa_ A:12-34,35-43,602-622
2g4o d2g4oa1 A:9-28,263-269,283-299
1hj6 d1hj6a_ A:34-58,331-338,352-368
1u7n d1u7nb_ B:12-29,31-37,301-319
1w0d d1w0da_ A:9-28,263-269,283-299
1ps7 d1ps7a_ A:16-28,114-121,311-329
1u7n d1u7na_ A:12-29,31-38,301-319
1wpw d1wpwb_ B:20-32,66-74,269-289
1pb3 d1pb3a_ A:34-58,331-337,352-368
1sjs d1sjsa_ A:34-58,331-337,352-368
1qzt d1qzta_ A:26-40,42-48,313-332
1p8f d1p8fa_ A:34-58,331-337,352-368
1pb1 d1pb1a_ A:34-58,331-337,352-368
7icd d7icda_ A:34-58,331-337,352-368
1cw1 d1cw1a_ A:34-58,331-337,352-368
1ai3 d1ai3a_ A:34-58,331-337,352-368
1cw7 d1cw7a_ A:34-58,331-337,352-368
1idc d1idca_ A:34-58,331-337,352-368
1ai2 d1ai2a_ A:34-58,331-337,352-368
3icd d3icda_ A:34-58,331-337,352-368
1cw4 d1cw4a_ A:34-58,331-337,352-368
1qzt d1qztc_ C:26-40,42-48,313-332
1j1w d1j1wa_ A:22-34,35-42,602-622
9icd d9icda_ A:34-58,331-337,352-368
1j1w d1j1wd_ D:22-34,35-42,602-622
2af3 d2af3c1 C:26-40,42-48,313-332
1qzt d1qztd_ D:26-40,42-48,313-332
4icd d4icda_ A:34-58,331-337,352-368
1bl5 d1bl5a_ A:34-58,331-337,352-368
8icd d8icda_ A:34-58,331-337,352-368
1iso d1isoa_ A:34-58,331-337,352-368
1qzt d1qztb_ B:26-40,42-48,313-332
2af4 d2af4d1 D:26-40,42-48,313-332
1grp d1grpa_ A:34-58,331-337,352-368
6icd d6icda_ A:34-58,331-337,352-368
5icd d5icda_ A:34-58,331-337,352-368
1gro d1groa_ A:34-58,331-337,352-368
1cm7 d1cm7b_ B:168-187,241-247,246-262
1ide d1idea_ A:34-58,331-337,352-368
1idd d1idda_ A:34-58,331-337,352-368
1vi1 d1vi1a_ A:12-29,30-37,299-317
1w0d d1w0dc_ C:151-171,225-230,230-246
2af3 d2af3d1 D:26-40,118-124,313-332
1idf d1idfa_ A:34-58,331-337,352-368
2af3 d2af3d1 D:3-16,17-22,313-332
1j1w d1j1wb_ B:22-34,35-43,602-622
1j1w d1j1wc_ C:22-34,35-43,602-622
2af4 d2af4c1 C:26-40,42-48,313-333
1ps7 d1ps7b_ B:16-28,32-39,310-329
2af3 d2af3c1 C:26-40,118-123,313-332
1qzt d1qzta_ A:26-40,118-123,313-332
1cm7 d1cm7b_ B:13-35,35-43,297-314
1qzt d1qztc_ C:26-40,118-123,313-332
1qzt d1qztd_ D:26-40,118-123,313-332
1ps6 d1ps6a_ A:16-28,32-38,310-329
1ptm d1ptmb_ B:16-28,32-38,310-329
2af4 d2af4d1 D:26-40,118-125,313-332
1ps6 d1ps6b_ B:16-28,32-38,310-329
1xac d1xaca_ A:158-178,231-236,236-252
1ptm d1ptma_ A:16-28,32-38,310-329
1r8k d1r8ka_ A:16-29,32-39,310-329
1qzt d1qztb_ B:26-40,118-123,313-332
2af4 d2af4c1 C:26-40,118-125,313-333
1ps7 d1ps7c_ C:16-28,31-38,310-329
1vi1 d1vi1b_ B:12-29,30-38,299-317
1ps7 d1ps7c_ C:16-28,291-296,310-329
1ps7 d1ps7b_ B:16-28,291-296,310-329
1ps6 d1ps6a_ A:16-28,291-296,310-329
1ptm d1ptma_ A:16-28,291-296,310-329
1qzt d1qztb_ B:3-16,42-48,313-332
1ps7 d1ps7d_ D:16-28,31-39,311-329
1ps7 d1ps7a_ A:16-28,32-39,311-329
1ps7 d1ps7d_ D:16-28,291-296,311-329
1ps7 d1ps7a_ A:16-28,291-296,311-329
1wpw d1wpwb_ B:10-21,248-255,269-289
1itw d1itwa_ A:148-159,404-415,543-560
1itw d1itwd_ D:148-159,404-415,543-560
1itw d1itwc_ C:148-159,404-415,543-560
1itw d1itwb_ B:148-159,404-415,543-560
1j1w d1j1wa_ A:148-159,404-415,543-560
1j1w d1j1wc_ C:148-159,404-415,543-560
1j1w d1j1wd_ D:148-159,404-415,543-560
1j1w d1j1wb_ B:148-159,404-415,543-560
1j1w d1j1wd_ D:12-23,76-83,602-622
1j1w d1j1wc_ C:12-23,76-83,602-622
1j1w d1j1wa_ A:12-23,76-83,602-622
1j1w d1j1wb_ B:12-23,76-83,602-622
1u7n d1u7na_ A:148-168,220-224,225-253
1u7n d1u7nb_ B:148-168,220-224,225-253
1vi1 d1vi1b_ B:147-167,219-223,224-254
60. c.95.1 Thiolase-like
Thiolase-like consists of two similar domains related by pseudo dyad; duplication ! 3 layers: a/b/a; mixed beta-sheet of 5 strands, order 32451; strand 5 is antiparallel to the rest
1u0m d1u0mb2 B:136-156,265-271,304-320
2alm d2alma1 A:139-152,154-161,162-181
1u0m d1u0ma2 A:136-156,265-270,304-320
2byy d2byyb1 B:138-151,153-161,161-180
2byy d2byyd1 D:138-151,153-161,161-180
2byx d2byxb1 B:138-151,153-161,161-180
2byx d2byxd1 D:138-151,153-161,161-180
2byx d2byxa1 A:138-151,153-161,161-180
2byw d2bywb1 B:138-151,153-161,161-180
1e5m d1e5ma1 A:142-155,158-164,165-184
2bz3 d2bz3a1 A:138-151,153-161,161-180
2byz d2byzd1 D:138-151,153-161,161-180
2bz3 d2bz3c1 C:138-151,153-161,161-180
2byw d2bywc1 C:138-151,153-161,161-180
2byx d2byxc1 C:138-151,153-161,161-180
2byz d2byzc1 C:138-151,153-161,161-180
1fj8 d1fj8a1 A:138-151,153-161,161-180
1fj8 d1fj8c1 C:138-151,153-161,161-180
2bui d2buia1 A:138-151,153-161,161-180
1f91 d1f91c1 C:138-151,153-161,161-180
1f91 d1f91d1 D:138-151,153-161,161-180
1fj4 d1fj4c1 C:138-151,153-161,161-180
1f91 d1f91a1 A:138-151,153-161,161-180
1fj8 d1fj8d1 D:138-151,153-161,161-180
1f91 d1f91b1 B:138-151,153-161,161-180
1fj8 d1fj8b1 B:138-151,153-161,161-180
2buh d2buha1 A:138-151,153-161,161-180
2bz4 d2bz4a1 A:138-151,153-161,161-180
2byy d2byyc1 C:138-151,153-161,161-180
2bz4 d2bz4c1 C:138-151,153-161,161-180
2buh d2buhd1 D:138-151,153-161,161-180
2bui d2buic1 C:138-151,153-161,161-180
2aq7 d2aq7b1 B:138-151,153-161,161-180
2aq7 d2aq7d1 D:138-151,153-161,161-180
2aqb d2aqbb1 B:138-151,153-161,161-180
2cdh d2cdhd1 D:140-151,154-159,161-180
2cdh d2cdhc1 C:140-151,154-159,161-180
2vb9 d2vb9b1 B:138-151,153-161,161-180
2byz d2byzb1 B:140-151,153-161,161-180
2byw d2bywa1 A:140-151,153-161,161-180
2bz3 d2bz3b1 B:140-151,153-161,161-180
2bz3 d2bz3d1 D:140-151,153-161,161-180
2vb8 d2vb8d1 D:140-151,153-161,161-180
2vb8 d2vb8a1 A:140-151,153-161,161-180
1ek4 d1ek4c1 C:140-151,153-161,161-180
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1w0i d1w0ia1 A:76-88,90-94,241-252
2byw d2bywb2 B:161-180,253-265,273-286
2byw d2bywc2 C:161-180,253-265,273-286
2byw d2bywa2 A:161-180,253-265,273-286
1h4f d1h4fa2 A:161-180,253-265,273-286
2byx d2byxd2 D:161-180,253-265,273-286
2byx d2byxb2 B:161-180,253-265,273-286
2byz d2byzc2 C:161-180,253-265,273-286
2vb9 d2vb9d2 D:161-180,253-265,273-286
2vb9 d2vb9b2 B:161-180,253-265,273-286
2vb8 d2vb8b2 B:161-180,253-265,273-286
1fj4 d1fj4b2 B:161-180,253-265,273-286
1fj4 d1fj4c2 C:161-180,253-265,273-286
2aqb d2aqbb2 B:161-180,253-265,273-286
2bz3 d2bz3c2 C:161-180,253-265,273-286
1fj8 d1fj8c2 C:161-180,253-266,273-286
2byw d2bywd2 D:161-180,253-266,273-286
1fj8 d1fj8a2 A:161-180,253-266,273-286
2byy d2byyc2 C:161-180,253-266,273-286
2vb9 d2vb9a2 A:161-180,253-266,273-286
1h4f d1h4fc2 C:161-180,253-266,273-286
1fj8 d1fj8b2 B:161-180,253-266,273-286
2byz d2byza2 A:161-180,253-266,273-286
1h4f d1h4fb2 B:161-180,253-266,273-286
2bui d2buib2 B:161-180,253-266,273-286
2byx d2byxc2 C:161-180,253-266,273-286
2vb8 d2vb8a2 A:161-180,253-266,273-286
2byz d2byzd2 D:161-180,253-266,273-286
2bz4 d2bz4a2 A:161-180,253-266,273-286
2byz d2byzb2 B:161-180,253-266,273-286
2bui d2buic2 C:161-180,253-266,273-286
2byx d2byxa2 A:161-180,253-266,273-286
2vb9 d2vb9c2 C:161-180,253-266,273-286
2vba d2vbac2 C:161-180,253-266,273-286
2vba d2vbaa2 A:161-180,253-266,273-286
2vb7 d2vb7a2 A:161-180,253-266,273-286
2bz3 d2bz3a2 A:161-180,253-266,273-286
2buh d2buha2 A:161-180,253-266,273-286
2bz3 d2bz3b2 B:161-180,253-266,273-286
2vb8 d2vb8c2 C:161-180,253-266,273-286
2bz4 d2bz4b2 B:161-180,253-266,273-286
2buh d2buhb2 B:161-180,253-266,273-286
2buh d2buhd2 D:161-180,253-266,273-286
2vba d2vbab2 B:161-180,253-266,273-286
2vba d2vbad2 D:161-180,253-266,273-286
2vb8 d2vb8d2 D:161-180,253-266,273-286
2vb7 d2vb7d2 D:161-180,253-266,273-286
2bui d2buia2 A:161-180,253-266,273-286
2vb7 d2vb7b2 B:161-180,253-266,273-286
2aqb d2aqbc2 C:161-180,253-266,273-286
2bz3 d2bz3d2 D:161-180,253-266,273-286
2bui d2buid2 D:161-180,253-266,273-286
2aq7 d2aq7b2 B:161-180,253-266,273-286
2aq7 d2aq7d2 D:161-180,253-266,273-286
1h4f d1h4fd2 D:161-180,253-266,273-286
2bz4 d2bz4c2 C:161-180,253-266,273-286
2buh d2buhc2 C:161-180,253-266,273-286
2bz4 d2bz4d2 D:161-180,253-266,273-286
1g5x d1g5xd2 D:164-180,253-266,273-286
1fj4 d1fj4a2 A:164-180,253-266,273-286
1g5x d1g5xa2 A:164-180,253-266,273-286
2byy d2byya2 A:164-180,253-266,273-286
1g5x d1g5xb2 B:164-180,253-267,273-286
2aqb d2aqbd2 D:164-180,253-266,273-286
2aq7 d2aq7c2 C:164-180,253-266,273-286
1g5x d1g5xc2 C:164-180,253-267,273-286
2vb7 d2vb7c2 C:164-180,253-266,273-286
2aq7 d2aq7a2 A:164-180,253-266,273-286
2qo1 d2qo1a2 A:150-157,188-193,208-220
2qnx d2qnxa2 A:150-157,188-193,208-220
2qo0 d2qo0b2 B:150-157,188-193,208-220
2qo1 d2qo1b2 B:150-157,188-193,208-220
61. c.56.5 Zn-dependent exopeptidases core: mixed beta-sheet of 8 strands, order 12435867; strands 2, 6 & 7 are antiparallel to the rest !
Phosphorylase/hydrolase-like core: 3 layers, a/b/a ; mixed sheet of 5 strands: order 21354; strand 4 is antiparallel to the rest; contains crossover loops
2q43 d2q43a1 A:47-62,64-70,117-136
1gyt d1gyti2 I:199-215,217-224,294-311
1gyt d1gytb2 B:294-311,372-380,483-498
1gyt d1gytl2 L:294-311,372-380,483-498
1gyt d1gytb2 B:199-215,217-224,294-311
1gyt d1gytk2 K:294-311,372-380,483-498
1gyt d1gytg2 G:294-311,372-380,483-498
1gyt d1gyth2 H:294-311,372-380,483-498
1gyt d1gytf2 F:294-311,372-380,483-498
1uwy d1uwya2 A:69-87,100-107,283-295
1gyt d1gyte2 E:294-311,372-380,483-498
1gyt d1gytd2 D:294-311,372-380,483-498
1yw4 d1yw4a1 A:59-76,82-89,229-243
1gyt d1gyta2 A:294-311,372-380,483-498
1gyt d1gyte2 E:199-215,217-224,294-311
1gyt d1gyta2 A:199-215,217-224,294-311
1gyt d1gytf2 F:199-215,217-224,294-311
2gre d2grei2 I:187-205,235-241,327-345
1gyt d1gyti2 I:294-311,372-380,483-498
1gyt d1gytj2 J:294-311,372-380,483-498
1gyt d1gytc2 C:199-215,217-224,294-311
1gyt d1gyth2 H:199-215,217-224,294-311
1yw6 d1yw6b1 B:56-73,140-148,223-238
1bll d1blle2 E:179-196,197-204,272-291
1y7e d1y7ea2 A:34-50,89-96,253-269
1gyt d1gytg2 G:199-215,217-224,294-311
1gyt d1gytj2 J:199-215,217-224,294-311
1gyt d1gytl2 L:199-215,217-224,294-311
1gyt d1gytk2 K:199-215,217-224,294-311
2gre d2grei2 I:25-40,41-47,187-205
1gyt d1gytd2 D:199-215,217-224,294-311
1lam d1lama1 A:179-196,197-204,274-291
1obr d1obra_ A:72-90,103-110,301-315
2ewb d2ewba1 A:179-196,197-204,271-291
2gre d2grek2 K:24-39,41-47,186-205
1lcp d1lcpa2 A:179-196,197-204,274-291
1lap d1lapa1 A:179-196,197-204,274-291
1lcp d1lcpb2 B:179-196,197-204,274-291
2j9a d2j9aa1 A:179-196,197-204,274-291
2gre d2greg2 G:24-39,41-47,186-205
1bpn d1bpna1 A:179-196,197-204,274-291
2gre d2gren2 N:24-39,41-47,186-205
1lan d1lana2 A:179-196,197-204,274-291
1gyt d1gytc2 C:294-311,372-379,483-498
1xjo d1xjoa_ A:97-116,121-129,257-277
1yw6 d1yw6a1 A:56-73,140-149,222-238
1f2o d1f2oa_ A:97-116,121-129,257-277
2gre d2greb2 B:24-39,41-47,186-205
2gre d2grea2 A:24-39,41-47,186-205
2gre d2grem2 M:24-39,41-47,185-205
1bpn d1bpna1 A:274-291,350-359,471-484
1tf9 d1tf9a1 A:97-116,121-129,257-277
1lap d1lapa1 A:274-291,351-359,469-484
2gre d2grel2 L:185-205,235-242,327-345
1tkj d1tkja1 A:97-116,121-129,257-277
1tf8 d1tf8a1 A:97-116,121-129,257-277
1xjo d1xjoa_ A:97-116,153-159,257-277
1tkh d1tkha1 A:94-116,121-129,257-277
1tkj d1tkja1 A:97-116,153-160,257-277
1y7e d1y7ea2 A:253-269,329-339,441-458
1tf9 d1tf9a1 A:97-116,153-159,257-277
1bpm d1bpma1 A:179-196,197-204,271-291
1qq9 d1qq9a_ A:94-116,121-129,257-277
1qmu d1qmua2 A:98-108,108-115,291-304
2gre d2gree2 E:24-39,41-47,186-205
2gre d2grej2 J:24-39,41-47,185-205
1cp7 d1cp7a_ A:94-116,121-129,257-277
1yw6 d1yw6a1 A:56-73,78-86,222-238
2gre d2grec2 C:24-39,41-47,186-205
2afo d2afob1 B:159-175,190-200,340-360
2afx d2afxa1 A:159-175,190-200,340-360
2g9d d2g9da1 A:66-83,148-157,230-247
1zg7 d1zg7c1 C:14-30,31-42,72-90
2afx d2afxb1 B:159-175,190-200,340-360
2gre d2greh2 H:187-205,235-241,327-344
2afm d2afma1 A:159-175,190-200,340-360
2afz d2afza1 A:159-175,190-200,340-360
2bco d2bcob1 B:66-83,89-96,230-247
1xbu d1xbua1 A:94-116,121-129,257-277
1h8l d1h8la2 A:98-108,108-115,291-304
2afw d2afwa1 A:159-175,190-200,340-360
1tkf d1tkfa1 A:94-116,121-129,257-277
2zeh d2zeha1 A:159-175,190-200,340-360
2afm d2afmb1 B:159-175,190-200,340-360
2afu d2afub1 B:159-175,190-200,340-360
2afs d2afsa1 A:159-175,190-200,340-360
2afs d2afsb1 B:159-175,190-200,340-360
2afs d2afsa1 A:159-175,241-248,340-360
2bco d2bcoa1 A:66-83,148-157,230-247
2g9d d2g9da1 A:66-83,89-96,230-247
2afw d2afwb1 B:159-175,190-200,340-360
2afo d2afob1 B:159-175,241-248,340-360
2afz d2afzb1 B:159-175,190-200,340-360
2bco d2bcob1 B:66-83,148-158,230-247
1lam d1lama1 A:274-291,351-359,471-484
1xbu d1xbua1 A:94-116,153-160,257-277
2afu d2afua1 A:159-175,241-248,340-360
2afm d2afma1 A:159-175,241-248,340-360
2afw d2afwa1 A:159-175,241-248,340-360
1tkh d1tkha1 A:94-116,154-159,257-277
2zeh d2zeha1 A:159-175,241-248,340-360
2afu d2afub1 B:159-175,241-248,340-360
2afx d2afxa1 A:159-175,241-248,340-360
2afm d2afmb1 B:159-175,241-248,340-360
1vgy d1vgya1 A:101-121,158-165,357-376
2afz d2afza1 A:159-175,241-248,340-360
1vgy d1vgyb1 B:101-121,158-165,357-376
2afs d2afsb1 B:159-175,241-248,340-360
2gre d2grej2 J:185-205,235-241,327-344
2zeh d2zehb1 B:159-175,190-200,340-360
1lcp d1lcpb2 B:274-291,351-359,471-484
1tf8 d1tf8a1 A:97-116,154-159,257-277
1f2o d1f2oa_ A:97-116,154-159,257-277
2afz d2afzb1 B:159-175,241-248,340-360
1lcp d1lcpa2 A:274-291,351-359,471-484
2zeh d2zehb1 B:159-175,241-248,340-360
2afx d2afxb1 B:159-175,241-248,340-360
2gre d2gref2 F:184-205,235-242,327-345
2afw d2afwb1 B:159-175,241-248,340-360
2afo d2afoa1 A:159-175,241-248,340-360
2gre d2greo2 O:185-205,235-242,327-344
1qmu d1qmua2 A:77-95,108-115,291-304
1f2p d1f2pa_ A:94-116,121-129,257-277
2j9a d2j9aa1 A:274-291,350-359,471-485
2bco d2bcoa1 A:66-83,89-96,230-247
1lan d1lana2 A:274-291,351-359,471-484
1qq9 d1qq9a_ A:94-116,154-159,257-277
2gre d2grep2 P:186-205,235-241,327-344
1cp7 d1cp7a_ A:94-116,154-159,257-277
1h8l d1h8la2 A:77-95,108-115,291-304
2odf d2odfc1 C:59-74,148-156,233-255
1tkf d1tkfa1 A:94-116,154-159,257-277
2gre d2grem2 M:185-205,235-241,327-344
2afo d2afoa1 A:159-175,190-199,340-360
2gre d2gred2 D:185-205,235-241,327-344
1gyt d1gytd2 D:199-215,264-276,294-311
1ylo d1yloa2 A:164-184,187-197,315-334
1z2l d1z2lb1 B:93-114,186-194,391-412
1gyt d1gyti2 I:199-215,264-276,294-311
1xmb d1xmba1 A:68-83,105-114,138-157
1xjo d1xjoa_ A:97-116,214-221,257-277
2afu d2afua1 A:159-175,190-199,340-360
1gyt d1gyta2 A:199-215,264-276,294-311
1gyt d1gytj2 J:199-215,264-276,294-311
2pvv d2pvva3 A:384-409,413-423,570-590
1ylo d1ylof2 F:164-184,187-197,315-334
2jbj d2jbja3 A:384-409,413-423,570-590
2or4 d2or4a3 A:384-409,413-423,570-590
1ylo d1yloc2 C:164-184,187-197,315-334
1ylo d1yloe2 E:164-184,187-197,315-334
2q43 d2q43a1 A:47-62,84-93,117-136
1tf9 d1tf9a1 A:97-116,214-221,257-277
1ylo d1ylob2 B:164-184,187-197,315-334
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1jqg d1jqga1 A:72-90,264-271B,282-308
1tkj d1tkja1 A:31-49,78-86,97-116
1r3n d1r3nc1 C:124-144,218-229,428-455
1tkh d1tkha1 A:31-49,78-86,94-116
1cp7 d1cp7a_ A:31-49,78-86,94-116
1tkf d1tkfa1 A:31-49,78-86,94-116
1r3n d1r3ne1 E:124-144,218-229,428-455
8cpa d8cpaa_ A:72-90,265-272,282-307
1qq9 d1qq9a_ A:31-49,78-86,94-116
1tf8 d1tf8a1 A:31-49,78-86,97-116
1uwy d1uwya2 A:69-87,258-267,272-284
1xjo d1xjoa_ A:31-49,78-86,97-116
1cg2 d1cg2c1 C:59-78,102-114,141-160
1xov d1xova2 A:22-42,73-82,147-156
1vho d1vhoa2 A:21-34,58-66,168-189
1hdq d1hdqa_ A:72-90,265-272,282-307
2ewb d2ewba1 A:179-196,251-256,271-291
1h8l d1h8la2 A:77-95,266-275,280-292
1r43 d1r43b1 B:124-144,219-229,428-455
1r3n d1r3ng1 G:124-144,218-229,428-455
1aye d1ayea1 A:72-90,265-272,282-308
1xmb d1xmba1 A:138-157,378-387,404-428
1cx8 d1cx8b3 B:415-441,550-559,582-605
2nsu d2nsub3 B:415-441,550-559,582-605
1qmu d1qmua2 A:77-95,266-275,280-292
1cx8 d1cx8c3 C:415-441,550-559,582-605
1xfo d1xfob2 B:24-38,59-69,180-197
1cx8 d1cx8e3 E:415-441,550-559,582-605
1cx8 d1cx8h3 H:415-441,550-559,582-605
1cx8 d1cx8f3 F:415-441,550-559,582-605
1cx8 d1cx8g3 G:415-441,550-559,582-605
2nsu d2nsua3 A:415-441,550-559,582-605
1cx8 d1cx8a3 A:415-441,550-559,582-605
1cx8 d1cx8d3 D:415-441,550-559,582-605
2fvg d2fvga2 A:15-28,53-61,164-181
1jwq d1jwqa_ A:25-45,136-146,148-158
1xbu d1xbua1 A:31-49,50-60,94-116
1tkh d1tkha1 A:31-49,50-60,94-116
1tkf d1tkfa1 A:31-49,50-60,94-116
1cp7 d1cp7a_ A:31-49,50-60,94-116
1r3n d1r3nb1 B:124-144,407-415,428-455
1r3n d1r3nd1 D:124-144,407-415,428-455
1r3n d1r3na1 A:124-144,407-415,428-455
1r3n d1r3nf1 F:124-144,407-415,428-455
1r3n d1r3nh1 H:124-144,407-415,428-455
1r3n d1r3nc1 C:124-144,407-415,428-455
1r3n d1r3ne1 E:124-144,407-415,428-455
1tf9 d1tf9a1 A:31-49,50-60,97-116
1r43 d1r43b1 B:124-144,406-415,428-455
1tkj d1tkja1 A:31-49,50-60,97-116
1tf8 d1tf8a1 A:31-49,50-60,97-116
1r43 d1r43a1 A:124-144,406-415,428-455
1r3n d1r3ng1 G:124-144,407-415,428-455
1cg2 d1cg2d1 D:59-78,102-113,141-160
1de4 d1de4f3 F:159-177,179-194,415-441
1de4 d1de4c3 C:159-177,179-194,415-441
1de4 d1de4i3 I:159-177,179-194,415-441
1bpn d1bpna1 A:266-275,294-306,333-350
2jbk d2jbka3 A:86-104,106-121,384-409
2c6p d2c6pa3 A:86-104,106-121,384-409
3bi1 d3bi1a3 A:86-104,106-121,384-409
3bhx d3bhxa3 A:86-104,106-121,384-409
2pvv d2pvva3 A:86-104,106-121,384-409
2c6c d2c6ca3 A:86-104,106-121,384-409
2jbj d2jbja3 A:86-104,106-121,384-409
2c6g d2c6ga3 A:86-104,106-121,384-409
1z8l d1z8lc3 C:86-104,106-121,384-409
1z8l d1z8ld3 D:86-104,106-121,384-409
1z8l d1z8la3 A:86-104,106-121,384-409
1z8l d1z8lb3 B:86-104,106-121,384-409
2oot d2oota3 A:86-104,106-121,384-409
2or4 d2or4a3 A:86-104,106-121,384-409
3bi0 d3bi0a3 A:86-104,106-121,384-409
2cij d2cija3 A:86-104,106-121,384-409
2pvw d2pvwa3 A:86-104,106-121,384-409
62. i.26.1 Fatty acid synthase
Fatty acid synthase
2cf2 d2cf2n1 N:15-29,81-87,211-225
2cf2 d2cf2e1 E:15-29,81-87,211-225
2cf2 d2cf2n1 N:15-29,129-137,211-225
2cf2 d2cf2e1 E:15-29,129-137,211-225
2cf2 d2cf2e1 E:15-29,172-182,211-225
2cf2 d2cf2n1 N:15-29,172-182,211-225
63. c.4.1 Nucleotide-binding domain this superfamily shares the common nucleotide-binding site with and provides a link between the Rossmann-fold NAD(P)-binding and FAD/NAD(P)-binding domains !
Nucleotide-binding domain 3 layers: a/b/a; parallel beta-sheet of 5 strands, order 32145; Rossmann-like
1i8t d1i8ta1 A:10-24,225-230,348-367
1i8t d1i8tb1 B:10-24,225-230,348-367
1e1n d1e1na2 A:15-30,96-101,375-397
1cjc d1cjca2 A:15-30,96-101,375-397
2bi8 d2bi8a1 A:12-26,228-233,351-373
2bi7 d2bi7a1 A:12-26,228-233,351-373
1e1m d1e1ma2 A:15-30,96-101,375-397
1ddo d1ddof1 F:9-24,176-181,318-338
1e1k d1e1ka2 A:15-30,96-101,375-397
1ddo d1ddoc1 C:9-24,176-181,318-338
1e6e d1e6ea2 A:15-30,96-101,375-397
1ddo d1ddoa1 A:9-24,176-181,318-338
1ddo d1ddog1 G:9-24,176-181,318-338
1ddo d1ddod1 D:9-24,176-181,318-338
1ddo d1ddoe1 E:9-24,176-181,318-338
1ddo d1ddoh1 H:9-24,176-181,318-338
1e1l d1e1la2 A:15-30,96-101,375-397
1wam d1wama1 A:12-26,228-233,351-373
1ddo d1ddob1 B:9-24,176-181,318-338
1e6e d1e6ec2 C:15-30,96-101,375-397
1c0i d1c0ia1 A:1013-1027,1173-1178,1340-1361
1c0k d1c0ka1 A:1013-1027,1173-1178,1340-1361
1dao d1daoc1 C:9-24,176-181,318-338
1c0l d1c0la1 A:1013-1027,1173-1178,1340-1361
1ve9 d1ve9a1 A:9-24,176-181,318-338
1dao d1daod1 D:9-24,176-181,318-338
1c0p d1c0pa1 A:1013-1027,1173-1178,1340-1361
1dao d1daof1 F:9-24,176-181,318-338
1dao d1daob1 B:9-24,176-181,318-338
1dao d1daoa1 A:9-24,176-181,318-338
1evi d1evib1 B:9-24,176-181,318-338
1kif d1kifc1 C:9-24,176-181,318-338
1kif d1kiff1 F:9-24,176-181,318-338
1kif d1kifa1 A:9-24,176-181,318-338
1kif d1kifb1 B:9-24,176-181,318-338
1kif d1kife1 E:9-24,176-181,318-338
1dao d1daoe1 E:9-24,176-181,318-338
1kif d1kifg1 G:9-24,176-181,318-338
1kif d1kifh1 H:9-24,176-181,318-338
1kif d1kifd1 D:9-24,176-181,318-338
1evi d1evia1 A:9-24,176-181,318-338
1dao d1daoh1 H:9-24,176-181,318-338
1dao d1daog1 G:9-24,176-181,318-338
1an9 d1an9a1 A:9-27,176-181,314-338
1an9 d1an9b1 B:9-24,176-181,314-338
1ve9 d1ve9b1 B:9-24,176-181,314-338
1e1n d1e1na2 A:15-30,361-365,375-397
1e6e d1e6ea2 A:15-30,361-365,375-397
1h7x d1h7xc4 C:196-210,277-282,488-512
1gte d1gteb4 B:196-210,277-282,488-512
1h7x d1h7xb4 B:196-210,277-282,488-512
1gte d1gtec4 C:196-210,277-282,488-512
1gte d1gtea4 A:196-210,277-282,488-512
1cjc d1cjca2 A:15-30,361-365,375-397
1gte d1gted4 D:196-210,277-282,488-512
1gth d1gthb4 B:196-210,277-282,488-512
1e1m d1e1ma2 A:15-30,361-365,375-397
1e1k d1e1ka2 A:15-30,361-365,375-397
1h7x d1h7xa4 A:196-210,277-282,488-512
1gth d1gtha4 A:196-210,277-282,488-512
1h7w d1h7wc4 C:196-210,277-282,488-512
1h7w d1h7wd4 D:196-210,277-282,488-512
1h7w d1h7wa4 A:196-210,277-282,488-512
1gth d1gthc4 C:196-210,277-282,488-512
1h7x d1h7xd4 D:196-210,277-282,488-512
1gth d1gthd4 D:196-210,277-282,488-512
1h7w d1h7wb4 B:196-210,277-282,488-512
1gt8 d1gt8c4 C:196-210,277-282,488-512
1e6e d1e6ec2 C:15-30,361-365,375-397
1gt8 d1gt8b4 B:196-210,277-282,488-512
1gt8 d1gt8a4 A:196-210,277-282,488-512
1ps9 d1ps9a3 A:382-396,457-462,656-671
1gt8 d1gt8d4 D:196-210,277-282,488-512
1e1l d1e1la2 A:15-30,361-365,375-397
1o95 d1o95b3 B:398-412,481-486,680-695
1i8t d1i8tb1 B:10-24,334-338,348-367
1i8t d1i8ta1 A:10-24,334-338,348-367
1o95 d1o95a3 A:398-412,481-486,680-695
1lqu d1lqub2 B:12-30,98-103,367-393
1lqt d1lqtb2 B:12-30,98-103,367-393
1djq d1djqb3 B:398-412,481-486,680-695
1djq d1djqa3 A:398-412,481-486,680-695
1djn d1djna3 A:398-412,481-486,680-695
2tmd d2tmdb3 B:398-412,481-486,680-695
1lqt d1lqta2 A:12-30,98-103,367-393
1o94 d1o94b3 B:398-412,481-486,680-695
1lqu d1lqua2 A:12-30,98-103,367-393
1djn d1djnb3 B:398-412,481-486,680-695
2tmd d2tmda3 A:398-412,481-486,680-695
2bi8 d2bi8a1 A:12-26,337-341,351-373
1o94 d1o94a3 A:398-412,481-486,680-695
2bi7 d2bi7a1 A:12-26,337-341,351-373
1wam d1wama1 A:12-26,337-341,351-373
1h7x d1h7xc4 C:196-210,475-479,488-512
1h7x d1h7xb4 B:196-210,475-479,488-512
1gte d1gteb4 B:196-210,475-479,488-512
1gte d1gted4 D:196-210,475-479,488-512
1gte d1gtec4 C:196-210,475-479,488-512
1gte d1gtea4 A:196-210,475-479,488-512
1h7x d1h7xa4 A:196-210,475-479,488-512
1h7x d1h7xd4 D:196-210,475-479,488-512
1h7w d1h7wc4 C:196-210,475-479,488-512
1h7w d1h7wa4 A:196-210,475-479,488-512
1h7w d1h7wd4 D:196-210,475-479,488-512
1h7w d1h7wb4 B:196-210,475-479,488-512
1gth d1gthc4 C:196-210,475-479,488-512
1gth d1gthb4 B:196-210,475-479,488-512
1gth d1gtha4 A:196-210,475-479,488-512
1gth d1gthd4 D:196-210,475-479,488-512
1gt8 d1gt8d4 D:196-210,475-479,488-512
1gt8 d1gt8b4 B:196-210,475-479,488-512
1e6e d1e6ea2 A:15-30,31-39,375-397
1gt8 d1gt8c4 C:196-210,475-479,488-512
1gt8 d1gt8a4 A:196-210,475-479,488-512
1c0i d1c0ia1 A:1013-1027,1322-1332,1340-1361
1evi d1evib1 B:9-24,300-310,318-338
1ddo d1ddod1 D:9-24,300-310,318-338
1ddo d1ddog1 G:9-24,300-310,318-338
1ddo d1ddof1 F:9-24,300-310,318-338
1ddo d1ddoc1 C:9-24,300-310,318-338
1ddo d1ddoe1 E:9-24,300-310,318-338
1c0p d1c0pa1 A:1013-1027,1322-1332,1340-1361
1ddo d1ddoa1 A:9-24,300-310,318-338
1ddo d1ddoh1 H:9-24,300-310,318-338
1c0k d1c0ka1 A:1013-1027,1322-1332,1340-1361
1ddo d1ddob1 B:9-24,300-310,318-338
1an9 d1an9a1 A:9-27,300-310,314-338
1evi d1evia1 A:9-24,300-310,318-338
1e1n d1e1na2 A:15-30,31-39,375-397
1djq d1djqa3 A:398-412,666-672,680-695
1wam d1wama1 A:12-26,27-34,351-373
1kif d1kifc1 C:9-24,300-310,318-338
1kif d1kiff1 F:9-24,300-310,318-338
1kif d1kife1 E:9-24,300-310,318-338
1kif d1kifb1 B:9-24,300-310,318-338
1kif d1kifa1 A:9-24,300-310,318-338
1kif d1kifd1 D:9-24,300-310,318-338
1kif d1kifg1 G:9-24,300-310,318-338
1kif d1kifh1 H:9-24,300-310,318-338
1c0l d1c0la1 A:1013-1027,1322-1332,1340-1361
1cjc d1cjca2 A:15-30,31-39,375-397
1e1m d1e1ma2 A:15-30,31-39,375-397
1o95 d1o95b3 B:398-412,668-672,680-695
1e1k d1e1ka2 A:15-30,31-39,375-397
1ps9 d1ps9a3 A:382-396,642-646,656-671
1e1l d1e1la2 A:15-30,31-39,375-397
1ve9 d1ve9a1 A:9-24,300-310,318-338
1lqu d1lqub2 B:12-30,353-357,367-393
1lqt d1lqtb2 B:12-30,353-357,367-393
1lqt d1lqta2 A:12-30,353-357,367-393
1lqu d1lqua2 A:12-30,353-357,367-393
1dao d1daoe1 E:9-24,300-310,318-338
1dao d1daog1 G:9-24,300-310,318-338
1dao d1daob1 B:9-24,300-310,318-338
1dao d1daod1 D:9-24,300-310,318-338
1dao d1daoh1 H:9-24,300-310,318-338
1dao d1daoa1 A:9-24,300-310,318-338
1dao d1daoc1 C:9-24,300-310,318-338
1dao d1daof1 F:9-24,300-310,318-338
1o95 d1o95a3 A:398-412,668-672,680-695
1an9 d1an9b1 B:9-24,300-310,314-338
1e6e d1e6ec2 C:15-30,32-39,375-397
1c0l d1c0la1 A:1013-1027,1028-1035,1340-1361
1c0k d1c0ka1 A:1013-1027,1028-1035,1340-1361
1c0i d1c0ia1 A:1013-1027,1028-1035,1340-1361
1ve9 d1ve9b1 B:9-24,300-310,314-338
2tmd d2tmdb3 B:398-412,667-672,680-695
1djq d1djqb3 B:398-412,667-672,680-695
1djn d1djnb3 B:398-412,667-672,680-695
1djn d1djna3 A:398-412,667-672,680-695
1o94 d1o94b3 B:398-412,667-672,680-695
1o94 d1o94a3 A:398-412,667-672,680-695
2tmd d2tmda3 A:398-412,667-672,680-695
64. c.73.1 Carbamate kinase-like the sheet topology is similar to those of undecaprenyl diphosphate synthase and the N-terminal domain of phosphoglycerate kinase !
Carbamate kinase-like 3 layers: a/b/a; mixed (mainly parallel) beta-sheet of 8 strands, order 34215786; strand 8 is antiparallel to the rest
2ako d2akob1 B:20-38,156-162,231-242
2ako d2akoa1 A:20-39,156-162,231-242
2ako d2akod1 D:20-38,156-162,231-242
2ako d2akoc1 C:20-38,156-162,231-242
2ij9 d2ij9a1 A:15-33,130-136,201-211
2ij9 d2ij9b1 B:15-33,130-136,201-211
1oh9 d1oh9a_ A:16-35,174-181,239-249
2bnf d2bnfb1 B:30-48,159-165,222-232
1oha d1ohaa_ A:16-35,174-181,239-249
1ybd d1ybdc1 C:30-48,159-165,222-232
1ybd d1ybdb1 B:30-48,159-165,222-232
2brx d2brxa1 A:18-36,134-140,203-210
1ybd d1ybda1 A:30-48,159-165,222-232
2bri d2bria1 A:18-36,134-140,203-210
2bne d2bneb1 B:30-48,49-56,224-232
2ij9 d2ij9a1 A:15-33,33-42,201-211
2ij9 d2ij9b1 B:15-33,33-42,201-211
2bnd d2bndb1 B:30-48,49-56,224-232
2bmu d2bmua1 A:18-37,134-140,203-210
1ybd d1ybdb1 B:30-48,49-56,222-232
2bmu d2bmub1 B:18-37,134-140,203-210
2a1f d2a1fa1 A:27-45,46-55,219-230
2buf d2bufa1 A:41-59,60-67,279-288
2buf d2bufl1 L:41-59,60-66,279-288
1ybd d1ybdc1 C:30-48,49-57,222-232
2a1f d2a1fb1 B:27-45,46-55,219-230
2a1f d2a1ff1 F:27-45,46-56,219-230
2bri d2brib1 B:18-37,134-140,203-210
2brx d2brxb1 B:18-37,134-140,203-210
2buf d2bufh1 H:41-59,60-67,279-288
2buf d2bufb1 B:41-59,60-68,279-288
2buf d2bufd1 D:41-59,60-66,279-288
2v4y d2v4ya1 A:30-48,49-58,224-232
2v4y d2v4yc1 C:30-48,49-58,224-232
2v4y d2v4yb1 B:30-48,49-58,224-232
2v4y d2v4yf1 F:30-48,49-58,224-232
2v4y d2v4ye1 E:30-48,49-58,224-232
2v4y d2v4yd1 D:30-48,49-58,224-232
1ybd d1ybda1 A:30-48,49-58,222-232
2buf d2bufk1 K:41-59,60-66,279-288
2buf d2bufg1 G:41-59,60-67,279-288
2bty d2btya1 A:35-53,53-61,261-270
2buf d2bufi1 I:41-59,60-67,279-288
1z9d d1z9da1 A:28-46,47-56,223-231
1z9d d1z9dc1 C:28-46,47-56,223-231
2a1f d2a1fd1 D:27-45,46-56,219-229
2buf d2buff1 F:41-59,60-68,279-288
1z9d d1z9db1 B:28-46,47-56,223-231
2a1f d2a1fe1 E:27-45,46-55,219-229
2a1f d2a1fc1 C:27-45,46-55,219-229
2buf d2bufj1 J:41-59,61-67,279-288
1e19 d1e19a_ A:22-44,45-52,299-306
1e19 d1e19b_ B:22-44,45-52,299-306
2bmu d2bmub1 B:18-37,36-43,209-216
2brx d2brxb1 B:18-37,36-43,209-216
2bri d2brib1 B:18-37,36-43,209-216
2bri d2bria1 A:18-36,36-43,209-216
2brx d2brxa1 A:18-36,36-43,209-216
2bmu d2bmua1 A:18-37,36-43,209-216
2buf d2bufc1 C:41-59,61-68,279-288
65. d.250.1 Folate-binding domain some topological similarity to Formylmethanofuran:tetrahydromethanopterin formyltransferase !
Folate-binding domain duplication: consists of two beta(2)-alpha-beta(3)-alpha subdomains swapped with the first strands
1wos d1wosa2 A:4-14,42-49,199-218
1wor d1wora2 A:4-14,42-49,199-218
1wop d1wopa2 A:4-14,42-49,199-218
1woo d1wooa2 A:4-14,42-49,199-218
1v5v d1v5vb2 B:10-18,46-53,224-242
1pj7 d1pj7a4 A:433-443,499-506,662-678
1vlo d1vloa2 A:5-15,43-50,200-215
1pj6 d1pj6a4 A:433-443,499-506,662-678
1pj5 d1pj5a4 A:433-443,499-506,662-678
1v5v d1v5va2 A:10-18,46-53,224-242
1v5v d1v5va2 A:35-46,46-53,224-242
1wos d1wosa2 A:31-42,42-49,199-218
1wop d1wopa2 A:31-42,42-49,199-218
1wor d1wora2 A:31-42,42-49,199-218
1v5v d1v5vb2 B:35-46,46-53,224-242
66. c.5.1 MurCD N-terminal domain
MurCD N-terminal domain 3 layers: a/b/a; parallel beta-sheet of 5 strands, order 32145; incomplete Rossmann-like fold; binds UDP group
1j6u d1j6ua1 A:10-24,61-65,88-101
1gqq d1gqqb1 B:28-42,79-83,106-119
1gqy d1gqya1 A:28-42,79-83,106-118
2jfg d2jfga1 A:14-28,66-71,93-102
2uuo d2uuoa1 A:14-28,66-71,93-102
1eeh d1eeha1 A:14-28,66-71,93-102
2jfh d2jfha1 A:14-28,66-71,93-102
1uag d1uaga1 A:14-28,66-71,93-102
3uag d3uaga1 A:14-28,66-71,93-102
2uup d2uupa1 A:14-28,66-71,93-102
2jff d2jffa1 A:14-28,66-71,93-102
4uag d4uaga1 A:14-28,66-71,93-102
1e0d d1e0da1 A:14-28,66-71,93-102
2uag d2uaga1 A:14-28,66-71,93-102
1gqq d1gqqa1 A:28-42,79-83,106-119
1p31 d1p31a1 A:28-42,79-84,106-118
1gqy d1gqyb1 B:28-42,79-84,106-118
1p31 d1p31b1 B:28-42,79-84,106-118
1p3d d1p3da1 A:28-42,79-84,106-118
1p3d d1p3db1 B:28-42,79-84,106-118
67. c.1.1 Triosephosphate isomerase (TIM)
TIM beta/alpha-barrel contains parallel beta-sheet barrel, closed; n=8, S=8; strand order 12345678 ! the first seven superfamilies have similar phosphate-binding sites
1r2r d1r2rd_ D:17-32,37-43,237-246
2jk2 d2jk2b1 B:17-32,37-43,237-246
1r2t d1r2ta_ A:17-32,37-43,237-246
1r2t d1r2tb_ B:17-32,37-43,237-246
2jk2 d2jk2a1 A:17-32,37-43,237-246
1tim d1tima_ A:17-32,37-43,237-246
1mo0 d1mo0b_ B:16-31,36-42,236-245
1hg3 d1hg3b_ B:20-39,41-46,213-225
1hg3 d1hg3h_ H:20-39,41-46,213-225
1hg3 d1hg3f_ F:20-39,41-46,213-225
1hg3 d1hg3c_ C:20-39,41-46,213-225
1hg3 d1hg3a_ A:20-39,41-46,213-225
1hg3 d1hg3d_ D:20-39,41-46,213-225
1hg3 d1hg3g_ G:20-39,41-46,213-225
1hg3 d1hg3e_ E:20-39,41-46,213-225
1wyi d1wyib1 B:17-32,36-44,237-246
1lzo d1lzoc_ C:16-31,37-43,237-248
1r2r d1r2rc_ C:17-32,36-44,237-246
1o5x d1o5xb_ B:16-31,37-43,237-248
1wob d1wobb_ B:16-31,37-43,237-248
1wob d1wobd_ D:16-31,37-43,237-248
1o5x d1o5xa_ A:16-31,37-43,237-248
1lzo d1lzoa_ A:16-31,37-43,237-248
1vga d1vgaa_ A:16-31,37-43,237-248
1wob d1wobc_ C:16-31,37-43,237-248
1wob d1woba_ A:16-31,37-43,237-248
1vga d1vgad_ D:16-31,37-43,237-248
1lzo d1lzob_ B:16-31,37-43,237-248
1woa d1woac_ C:16-31,37-43,237-248
1woa d1woaa_ A:16-31,37-43,237-248
1lzo d1lzod_ D:16-31,37-43,237-248
1woa d1woab_ B:16-31,37-43,237-248
1ydv d1ydva_ A:16-31,37-43,237-248
1woa d1woad_ D:16-31,37-43,237-248
1vga d1vgab_ B:16-31,37-43,237-248
1mo0 d1mo0a_ A:16-31,36-42,236-247
1m7p d1m7pb_ B:16-31,37-43,237-248
1m7p d1m7pa_ A:16-31,37-43,237-248
1lyx d1lyxa_ A:16-31,37-43,237-248
1vga d1vgac_ C:16-31,37-43,237-248
1m7o d1m7ob_ B:16-31,37-43,237-248
1m7o d1m7oa_ A:16-31,37-43,237-248
1w0m d1w0mg_ G:16-36,38-44,210-223
1ydv d1ydvb_ B:16-31,37-43,237-248
1w0m d1w0mf_ F:16-36,38-44,210-224
1r2r d1r2ra_ A:17-32,37-43,237-248
1iig d1iigb_ B:317-332,337-343,539-550
1mss d1mssa_ A:17-32,37-44,239-250
1tsi d1tsib_ B:17-32,37-43,239-250
1sux d1suxa_ A:18-33,38-44,240-251
1r2r d1r2rb_ B:17-32,36-43,237-246
1sux d1suxb_ B:18-33,38-44,240-251
1ci1 d1ci1b_ B:18-33,38-44,240-251
6tim d6timb_ B:17-32,37-43,239-250
1trd d1trda_ A:17-32,37-43,239-250
2oma d2omaa1 A:18-33,38-44,240-251
1iih d1iihb_ B:317-332,337-343,539-550
1tcd d1tcdb_ B:18-33,38-44,240-251
1wyi d1wyia1 A:17-32,37-43,237-248
1n55 d1n55a_ A:17-32,37-43,239-250
1w0m d1w0md_ D:16-36,38-44,210-225
1w0m d1w0ma_ A:16-36,38-44,210-225
1w0m d1w0mc_ C:16-36,38-44,210-225
1w0m d1w0mh_ H:16-36,38-44,210-225
1r2s d1r2sc_ C:17-32,36-43,237-246
2oma d2omab1 B:18-33,38-44,240-251
1ttj d1ttja_ A:20-32,37-43,239-250
1qds d1qdsa_ A:17-32,37-43,239-250
1if2 d1if2a_ A:17-32,37-43,239-250
1w0m d1w0mb_ B:16-36,38-44,210-225
1tcd d1tcda_ A:18-33,38-44,240-251
1amk d1amka_ A:17-32,37-43,239-250
1ci1 d1ci1a_ A:18-33,38-44,240-251
2btm d2btmb_ B:14-29,35-41,238-250
1w0m d1w0me_ E:16-36,38-44,210-225
2btm d2btma_ A:14-29,35-41,238-250
1b9b d1b9ba_ A:16-32,37-43,240-253
1sq7 d1sq7a_ A:17-31,37-43,237-246
1btm d1btmb_ B:14-29,35-41,238-250
1b9b d1b9bb_ B:516-532,537-543,740-755
1sq7 d1sq7b_ B:17-31,37-43,237-246
1dkw d1dkwa_ A:20-31,37-43,239-250
1dkw d1dkwb_ B:20-31,37-43,239-250
1tpw d1tpwb_ B:17-31,37-43,237-246
1btm d1btma_ A:14-29,35-41,238-251
1tpu d1tpua_ A:17-31,37-43,237-246
1tti d1ttia_ A:20-31,37-43,239-250
1tpw d1tpwa_ A:17-31,37-43,237-246
1hti d1htia_ A:17-32,36-43,237-248
1tpc d1tpc2_ 2:17-31,37-43,237-246
1spq d1spqa_ A:17-31,37-43,237-246
1tph d1tph1_ 1:17-31,37-43,237-246
1tpu d1tpub_ B:17-31,37-43,237-246
1tpv d1tpva_ A:17-31,37-43,237-246
1tmh d1tmhd_ D:17-33,38-44,240-257
1tpc d1tpc1_ 1:17-31,37-43,237-246
1tpb d1tpb1_ 1:17-31,37-43,237-246
1hti d1htib_ B:17-31,37-44,237-246
1su5 d1su5b_ B:17-31,37-43,237-246
1sw7 d1sw7a_ A:17-31,37-43,237-246
1tph d1tph2_ 2:17-31,37-43,237-246
1tpb d1tpb2_ 2:17-31,37-43,237-246
1m6j d1m6ja_ A:17-33,40-46,246-261
7tim d7tima_ A:16-30,36-42,237-248
1tpv d1tpvb_ B:17-31,37-43,237-246
1ssd d1ssda_ A:17-31,37-43,237-246
1nf0 d1nf0b_ B:16-30,36-42,237-248
1sw0 d1sw0a_ A:17-31,37-43,237-246
1nf0 d1nf0a_ A:16-30,36-42,237-248
1tmh d1tmha_ A:17-33,38-44,240-257
1su5 d1su5a_ A:17-31,37-43,237-246
1tmh d1tmhc_ C:17-33,38-44,240-257
1sw0 d1sw0b_ B:17-31,37-43,237-246
1ssg d1ssgb_ B:17-31,37-43,237-246
1sw3 d1sw3a_ A:17-31,37-43,237-246
1r2s d1r2sa_ A:17-31,36-44,237-246
4tim d4timb_ B:17-31,37-43,239-249
3ypi d3ypia_ A:16-30,36-42,237-248
1spq d1spqb_ B:17-31,37-43,237-246
1sw3 d1sw3b_ B:17-31,37-43,237-246
2ypi d2ypia_ A:16-30,36-42,237-247
1aw1 d1aw1b_ B:15-31,36-42,240-255
1aw1 d1aw1h_ H:15-31,36-42,240-255
1aw1 d1aw1k_ K:15-31,36-42,240-255
1aw1 d1aw1e_ E:15-31,36-42,240-255
3ypi d3ypib_ B:16-30,36-42,237-248
1m6j d1m6jb_ B:17-33,40-46,246-261
1sw7 d1sw7b_ B:17-31,37-43,237-246
1ney d1neyb_ B:16-30,36-42,237-248
1ssg d1ssga_ A:17-31,37-43,237-246
1mss d1mssb_ B:17-31,37-44,239-250
1ney d1neya_ A:16-30,36-42,237-248
1ypi d1ypia_ A:16-30,36-42,237-248
1aw2 d1aw2h_ H:15-31,36-42,240-255
1aw2 d1aw2b_ B:15-31,36-42,240-255
1aw2 d1aw2e_ E:15-31,36-42,240-255
1aw2 d1aw2k_ K:15-31,36-42,240-255
1ssd d1ssdb_ B:17-31,37-43,237-246
1tmh d1tmhb_ B:17-33,38-44,240-257
2ypi d2ypib_ B:16-30,35-42,237-247
1iig d1iiga_ A:17-31,37-43,239-250
1aw2 d1aw2a_ A:15-31,36-42,240-256
1aw2 d1aw2d_ D:15-31,36-42,240-256
1aw2 d1aw2j_ J:15-31,36-42,240-256
1aw2 d1aw2g_ G:15-31,36-42,240-256
1tim d1timb_ B:17-32,36-43,237-248
1i45 d1i45b_ B:16-30,36-42,237-248
1i45 d1i45a_ A:16-30,36-42,237-248
8tim d8tima_ A:17-31,36-43,237-246
1aw1 d1aw1a_ A:15-31,36-42,240-256
1aw1 d1aw1d_ D:15-31,36-42,240-256
1aw1 d1aw1g_ G:15-31,36-42,240-256
1aw1 d1aw1j_ J:15-31,36-42,240-256
1m6j d1m6ja_ A:33-41,236-241,246-261
1tsi d1tsia_ A:17-31,37-43,239-250
7tim d7timb_ B:16-30,36-42,237-248
5tim d5timb_ B:17-31,37-43,239-250
1tpd d1tpdb_ B:17-31,37-43,239-250
1iih d1iiha_ A:17-31,37-43,239-250
2oma d2omaa1 A:18-33,60-64,240-251
1m6j d1m6jb_ B:33-41,236-241,246-261
1tre d1treb_ B:17-33,38-44,240-255
1r2s d1r2sd_ D:17-31,36-43,237-246
4tim d4tima_ A:17-31,37-43,239-250
1ag1 d1ag1o_ O:17-31,37-43,239-250
2v5l d2v5lb1 B:317-331,337-343,539-550
1r2s d1r2sb_ B:17-31,36-43,237-246
5tim d5tima_ A:17-31,37-43,239-250
1ypi d1ypib_ B:16-30,35-42,237-248
1tsi d1tsib_ B:17-32,59-63,239-250
6tim d6tima_ A:17-31,37-43,239-250
1tpd d1tpda_ A:17-31,37-43,239-250
3tim d3timb_ B:17-31,37-43,239-250
1sux d1suxa_ A:18-33,60-64,240-251
1tpf d1tpfa_ A:17-31,37-43,239-250
3tim d3tima_ A:17-31,37-43,239-250
1trd d1trdb_ B:17-31,37-43,239-250
1ci1 d1ci1b_ B:18-33,60-64,240-251
1kv5 d1kv5a_ A:17-31,36-43,239-250
1iig d1iigb_ B:317-332,359-363,539-550
1tri d1tria_ A:17-31,37-43,239-250
2oma d2omab1 B:18-33,60-64,240-251
1sux d1suxb_ B:18-33,60-64,240-251
1tpf d1tpfb_ B:17-31,37-43,239-250
1iih d1iihb_ B:317-332,359-363,539-550
1tcd d1tcdb_ B:18-33,60-64,240-251
1ml1 d1ml1e_ E:17-31,37-43,239-250
1ml1 d1ml1g_ G:17-31,37-43,239-250
1ml1 d1ml1i_ I:17-31,37-43,239-250
1ml1 d1ml1a_ A:17-31,37-43,239-250
1ml1 d1ml1k_ K:17-31,37-43,239-250
1ml1 d1ml1c_ C:17-31,37-43,239-250
1tcd d1tcda_ A:18-33,60-64,240-251
1kv5 d1kv5b_ B:17-31,37-43,239-250
6tim d6timb_ B:17-32,59-63,239-250
1tpe d1tpea_ A:17-31,37-43,239-250
1n55 d1n55a_ A:17-32,59-63,239-250
1amk d1amka_ A:17-32,59-63,239-250
1if2 d1if2a_ A:17-32,59-63,239-250
1ci1 d1ci1a_ A:18-33,60-64,240-251
1qds d1qdsa_ A:17-32,59-63,239-250
2v5l d2v5la1 A:17-31,36-43,239-250
1ag1 d1ag1t_ T:17-31,37-43,239-250
8tim d8timb_ B:17-31,37-43,237-248
1tre d1trea_ A:17-35,38-44,240-257
4tim d4timb_ B:17-31,59-63,239-249
1dkw d1dkwb_ B:20-31,229-238,239-250
1dkw d1dkwa_ A:20-31,229-238,239-250
1ttj d1ttja_ A:20-32,59-65,239-250
1kv5 d1kv5a_ A:17-31,59-63,239-250
4tim d4tima_ A:17-31,59-63,239-250
1iih d1iiha_ A:17-31,59-63,239-250
5tim d5timb_ B:17-31,59-63,239-250
5tim d5tima_ A:17-31,59-63,239-250
7tim d7timb_ B:16-30,58-62,237-248
1tpd d1tpda_ A:17-31,59-63,239-250
1tpd d1tpdb_ B:17-31,59-63,239-250
3tim d3timb_ B:17-31,59-63,239-250
1tpe d1tpea_ A:17-31,59-63,239-250
6tim d6tima_ A:17-31,59-63,239-250
1trd d1trdb_ B:17-31,59-63,239-250
2v5l d2v5la1 A:17-31,59-63,239-250
3tim d3tima_ A:17-31,59-63,239-250
1kv5 d1kv5b_ B:17-31,59-63,239-250
1ag1 d1ag1t_ T:17-31,59-63,239-250
2btm d2btma_ A:14-29,58-64,238-250
1btm d1btma_ A:14-29,58-64,238-251
1btm d1btmb_ B:14-29,58-64,238-250
68. c.89.1 Phosphofructokinase
Phosphofructokinase consists of two non-similar domains, 3 layers (a/b/a) each ! Domain 1 has mixed sheet of 7 strands, order 3214567; strands 3 & 7 are antiparallel to the rest ! Domain 2 has parallel sheet of 4 strands, order 2314
4pfk d4pfka_ A:13-31,94-102,257-278
1mto d1mtoe_ E:13-31,95-101,257-278
3pfk d3pfka_ A:13-31,95-102,257-278
2pfk d2pfkc_ C:13-31,95-102,257-278
1kzh d1kzhb_ B:86-103,168-174,436-457
2f48 d2f48a1 A:86-103,168-174,436-457
1mto d1mtof_ F:13-31,94-102,257-278
6pfk d6pfkc_ C:13-31,95-102,257-278
1mto d1mtoc_ C:13-31,95-102,257-278
6pfk d6pfka_ A:13-31,95-102,257-278
6pfk d6pfkd_ D:13-31,95-101,257-278
2pfk d2pfkd_ D:13-31,95-102,257-278
6pfk d6pfkb_ B:13-31,95-102,257-278
1mto d1mtob_ B:13-31,94-102,257-278
2pfk d2pfka_ A:13-31,95-102,257-278
1mto d1mtog_ G:13-31,94-102,257-278
2pfk d2pfkb_ B:13-31,95-102,257-278
1mto d1mtod_ D:13-31,95-102,257-278
2f48 d2f48b1 B:86-103,168-174,436-457
1mto d1mtoa_ A:13-31,94-102,257-278
1mto d1mtoh_ H:13-31,94-102,257-278
1mto d1mtoe_ E:13-31,118-123,257-278
1kzh d1kzhb_ B:86-103,196-202,436-457
4pfk d4pfka_ A:13-31,118-123,257-278
2f48 d2f48a1 A:86-103,196-202,436-457
2f48 d2f48b1 B:86-103,196-202,436-457
2pfk d2pfkc_ C:13-31,117-123,257-278
1kzh d1kzha_ A:86-103,168-175,436-457
1mto d1mtof_ F:13-31,118-125,257-278
3pfk d3pfka_ A:13-31,118-123,257-278
2pfk d2pfkd_ D:13-31,117-123,257-278
1mto d1mtoc_ C:13-31,118-123,257-278
2pfk d2pfka_ A:13-31,118-123,257-278
6pfk d6pfka_ A:13-31,118-123,257-278
2pfk d2pfkb_ B:13-31,118-123,257-278
6pfk d6pfkc_ C:13-31,118-123,257-278
1mto d1mtob_ B:13-31,118-123,257-278
1mto d1mtoa_ A:13-31,118-123,257-278
6pfk d6pfkb_ B:13-31,118-123,257-278
6pfk d6pfkd_ D:13-31,118-123,257-278
1mto d1mtog_ G:13-31,118-123,257-278
1kzh d1kzha_ A:86-103,196-204,436-457
1mto d1mtod_ D:13-31,118-123,257-278
1mto d1mtoh_ H:13-31,118-123,257-278
1mto d1mtoe_ E:13-31,32-38,257-278
1mto d1mtob_ B:13-31,32-38,257-278
1mto d1mtog_ G:13-31,32-38,257-278
1mto d1mtod_ D:13-31,32-38,257-278
4pfk d4pfka_ A:13-31,32-38,257-278
6pfk d6pfkc_ C:13-31,32-38,257-278
1mto d1mtoa_ A:13-31,32-38,257-278
6pfk d6pfka_ A:13-31,32-38,257-278
1mto d1mtoc_ C:13-31,32-38,257-278
1mto d1mtof_ F:13-31,32-38,257-278
1mto d1mtoh_ H:13-31,32-38,257-278
6pfk d6pfkd_ D:13-31,32-38,257-278
3pfk d3pfka_ A:13-31,32-38,257-278
6pfk d6pfkb_ B:13-31,32-38,257-278
2pfk d2pfka_ A:13-31,32-38,257-278
2pfk d2pfkc_ C:13-31,32-38,257-278
2pfk d2pfkd_ D:13-31,32-38,257-278
2pfk d2pfkb_ B:13-31,32-38,257-278
1mto d1mtoe_ E:197-212,214-222,307-319
1mto d1mtof_ F:197-212,214-222,307-319
69. d.123.1 Sporulation response regulatory protein Spo0B Histidine kinase-like fold lacking the kinase ATP-binding site !
Sporulation response regulatory protein Spo0B core: alpha-beta-alpha-beta(2)-(alpha)-beta(2)
1f51 d1f51a_ A:73-87,90-98,103-125
70. c.50.1 Macro domain-like
Macro domain-like 3 layers: a/b/a; mixed beta-sheet of 6 strands, order 165243, strand 3 is antiparallel to the rest
1ty8 d1ty8a_ A:25-37,46-52,201-219
1njr d1njra_ A:25-37,46-52,201-219
1txz d1txza_ A:25-37,46-52,201-219
1njr d1njra_ A:25-37,186-192,201-219
1ty8 d1ty8a_ A:25-37,186-191,201-219
1txz d1txza_ A:25-37,186-191,201-219
71. c.84.1 Phosphoglucomutase, first 3 domains
Phosphoglucomutase, first 3 domains consists of three similar domains with 3 layers (a/b/a) each; duplication ! core: mixed beta-sheet of 4 strands, order 2134, strand 4 is antiparallel to the rest
1k2y d1k2yx2 X:183-196,236-242,341-357
2fkf d2fkfa2 A:183-196,236-242,341-357
3c04 d3c04a2 A:183-196,236-242,341-357
2fkm d2fkmx2 X:183-196,236-242,341-357
2h5a d2h5ax2 X:183-196,236-242,341-357
3bkq d3bkqx2 X:183-196,236-242,341-357
1pcj d1pcjx2 X:183-196,236-242,341-357
1pcm d1pcmx2 X:183-196,236-242,341-357
2h4l d2h4lx2 X:183-196,236-242,341-357
1p5g d1p5gx2 X:183-196,236-242,341-357
1p5d d1p5dx2 X:183-196,236-242,341-357
1k35 d1k35a2 A:183-196,236-242,341-357
1kfi d1kfia2 A:241-255,302-308,406-423
1c47 d1c47a2 A:227-241,281-287,389-405
1c4g d1c4ga2 A:227-241,281-287,389-405
1kfi d1kfib2 B:241-255,302-308,406-423
1c47 d1c47b2 B:227-241,281-287,389-405
1kfq d1kfqa2 A:241-255,302-308,406-425
3pmg d3pmga2 A:227-241,281-287,389-405
1vkl d1vkla2 A:227-241,281-287,389-405
3pmg d3pmgb2 B:227-241,281-287,389-405
1kfq d1kfqa3 A:218-229,232-237,406-425
1jdy d1jdya2 A:227-241,281-287,389-405
1lxt d1lxta2 A:227-241,281-287,389-405
1kfq d1kfqb2 B:241-255,302-308,406-425
1jdy d1jdyb2 B:227-241,281-287,389-405
1vkl d1vklb2 B:227-241,281-287,389-405
1kfq d1kfqb3 B:218-229,232-237,406-425
1c4g d1c4gb2 B:226-241,281-287,389-405
1lxt d1lxtb2 B:227-241,281-287,389-405
1c47 d1c47a3 A:304-316,371-376,389-405
1c4g d1c4ga3 A:304-316,369-376,389-405
1kfi d1kfia3 A:324-336,388-393,406-423
1kfi d1kfib3 B:324-336,388-393,406-423
1pcj d1pcjx3 X:259-276,321-326,341-357
2fkm d2fkmx3 X:259-276,321-326,341-357
2h5a d2h5ax3 X:259-276,321-326,341-357
1p5d d1p5dx3 X:259-276,321-326,341-357
2fkf d2fkfa3 A:259-276,321-326,341-357
1lxt d1lxta3 A:304-316,371-376,389-405
2h4l d2h4lx3 X:259-276,321-326,341-357
3c04 d3c04a3 A:259-276,321-326,341-357
3pmg d3pmga3 A:304-316,371-376,389-405
1jdy d1jdya3 A:304-316,371-376,389-405
1p5g d1p5gx3 X:259-276,321-326,341-357
1pcm d1pcmx3 X:259-276,321-326,341-357
3pmg d3pmgb3 B:304-316,371-376,389-405
1vkl d1vkla3 A:304-316,371-376,389-405
1k35 d1k35a3 A:259-276,321-326,341-357
1k2y d1k2yx2 X:183-196,196-203,341-357
1c4g d1c4gb3 B:304-316,369-376,389-405
1vkl d1vklb3 B:304-316,371-376,389-405
3bkq d3bkqx3 X:259-276,321-326,341-357
1jdy d1jdyb3 B:304-316,371-376,389-405
1c47 d1c47b3 B:304-316,369-376,389-405
1lxt d1lxtb3 B:304-316,369-376,389-405
1k2y d1k2yx3 X:259-276,321-326,341-357
1k35 d1k35a2 A:183-196,196-203,341-357
2fkm d2fkmx2 X:183-196,196-203,341-357
2h5a d2h5ax2 X:183-196,196-203,341-357
1p5d d1p5dx2 X:183-196,196-203,341-357
2h4l d2h4lx2 X:183-196,196-203,341-357
1p5g d1p5gx2 X:183-196,196-203,341-357
1kfq d1kfqa3 A:324-336,388-393,406-425
1kfq d1kfqb3 B:324-336,388-393,406-425
1c4g d1c4gb2 B:203-213,281-287,389-405
2fkf d2fkfa2 A:183-196,196-206,341-357
72. c.141.1 Glycerate kinase I
Glycerate kinase I consists of two different alpha/beta domains; (1) of the Flavodoxin-like fold (scop_cf 52171); (2) similar to the Restriction endonuclease-like fold (scop_cf 52979), inserted into domain 1
1to6 d1to6b_ B:45-57,125-131,261-271
1to6 d1to6a_ A:45-57,125-131,261-271
1to6 d1to6b_ B:45-57,184-190,261-271
1to6 d1to6a_ A:45-57,184-190,261-271
1to6 d1to6b_ B:45-57,82-88,261-271
1to6 d1to6a_ A:45-57,82-88,261-271
1to6 d1to6b_ B:15-32,311-318,350-369
1to6 d1to6a_ A:15-32,310-318,350-369
1to6 d1to6b_ B:15-32,280-288,350-369
1to6 d1to6a_ A:15-32,280-288,350-369
1to6 d1to6b_ B:15-32,34-41,350-369
1to6 d1to6a_ A:140-148,149-154,216-233
1to6 d1to6b_ B:140-148,149-153,213-233
73. c.62.1 vWA-like
vWA-like core: 3 layers, a/b/a; mixed beta-sheet of 6 strands, order 321456; strand 3 is antiparallel to the rest
1tye d1tyeb2 B:127-147,242-251,336-351
1jey d1jeya2 A:58-78,161-171,238-252
1tye d1tyed2 D:127-147,242-251,336-351
1sht d1shtx_ X:55-75,140-148,204-216
1tye d1tyeb2 B:127-147,304-311,336-351
1tye d1tyed2 D:127-147,304-311,336-351
1jeq d1jeqa4 A:58-78,198-206,238-252
1rtk d1rtka2 A:257-279,397-405,432-445
1rs0 d1rs0a2 A:257-279,397-405,432-445
1rrk d1rrka2 A:257-279,397-405,432-445
1jey d1jeya2 A:58-78,198-206,238-252
1t6b d1t6by_ Y:55-74,171-178,201-210
1jeq d1jeqa4 A:58-78,162-171,238-252
2i91 d2i91a2 A:391-408,494-501,523-536
2i91 d2i91b2 B:391-408,494-501,523-536
1jey d1jeyb2 B:29-49,159-165,226-234
1jeq d1jeqb2 B:29-49,159-165,226-234
1yvp d1yvpa2 A:391-408,494-501,523-536
1lfa d1lfab_ B:143-162,254-262,291-306
3e2m d3e2mb1 B:143-162,254-262,291-306
1lfa d1lfaa_ A:143-162,254-262,291-306
3bqn d3bqnc1 C:143-162,254-262,291-306
1m2o d1m2oc3 C:133-152,281-290,377-389
2ica d2icaa1 A:143-162,254-262,291-306
1m2o d1m2oa3 A:133-152,281-290,377-389
1yvr d1yvra2 A:391-408,494-501,523-536
1yvp d1yvpb2 B:391-408,494-501,523-536
1tye d1tyef2 F:124-147,304-311,336-351
1pt6 d1pt6b_ B:157-173,245-253,323-334
1zop d1zopa_ A:143-162,254-262,291-306
1zoo d1zooa_ A:143-162,254-262,291-306
1tye d1tyef2 F:124-147,242-251,336-351
1xdd d1xddb_ B:143-162,254-262,291-306
1zop d1zopb_ B:143-162,254-262,291-306
1zoo d1zoob_ B:143-162,254-262,291-306
3bqm d3bqmc1 C:143-162,254-262,291-306
1rd4 d1rd4d_ D:143-162,254-262,291-306
3e2m d3e2ma1 A:143-162,254-262,291-306
1rd4 d1rd4b_ B:143-162,254-262,291-306
1t6b d1t6by_ Y:55-74,140-148,201-210
1rd4 d1rd4c_ C:143-162,254-262,291-306
3bqn d3bqnb1 B:143-162,254-262,291-306
1rd4 d1rd4a_ A:143-162,254-262,291-306
1sht d1shtx_ X:55-75,171-178,204-216
1rtk d1rtka2 A:257-279,355-364,432-445
2i91 d2i91a2 A:391-408,462-469,523-536
2i91 d2i91b2 B:391-408,462-469,523-536
2o7n d2o7na1 A:143-165,230-239,291-307
3bqm d3bqmb1 B:143-162,254-262,291-306
1rrk d1rrka2 A:257-279,355-364,432-445
1rs0 d1rs0a2 A:257-279,355-364,432-445
1xuo d1xuob1 B:143-162,254-262,291-302
1yvp d1yvpb2 B:391-408,462-469,523-536
1cqp d1cqpb_ B:143-162,254-262,291-306
1shu d1shux_ X:55-74,171-178,203-217
1xdg d1xdgb_ B:143-162,254-262,291-306
1yvp d1yvpa2 A:391-408,462-469,523-536
1cqp d1cqpa_ A:143-162,254-262,291-306
1ck4 d1ck4a_ A:161-177,249-257,327-336
1xdg d1xdga_ A:143-162,254-262,291-306
2o7n d2o7na1 A:143-165,254-262,291-307
1yvr d1yvra2 A:391-408,462-469,523-536
1xuo d1xuoa1 A:143-162,254-262,291-303
1m2v d1m2va3 A:133-151,341-349,377-389
1m2v d1m2vb3 B:320-333,439-447,533-551
1mhp d1mhpa_ A:161-177,249-257,327-336
1mhp d1mhpb_ B:161-177,249-257,327-336
1shu d1shux_ X:55-74,140-148,203-217
1dzi d1dzia_ A:158-173,275-282,317-326
1xdd d1xdda_ A:143-162,254-262,291-307
1ido d1idoa_ A:146-165,264-271,301-315
1m2v d1m2va3 A:133-151,281-289,377-389
1qc5 d1qc5a_ A:47-63,134-143,213-221
2qtv d2qtva3 A:133-151,281-290,377-389
1m2o d1m2oc3 C:133-152,340-349,377-389
1qc5 d1qc5b_ B:347-363,434-443,513-521
1yvp d1yvpa2 A:391-408,515-521,523-536
1n3y d1n3ya_ A:144-163,231-240,306-317
1yvr d1yvra2 A:391-408,515-521,523-536
1m1u d1m1ua_ A:146-165,264-271,301-315
2ok5 d2ok5a1 A:261-279,354-364,432-448
1rrk d1rrka2 A:257-279,426-430,432-445
1m2o d1m2oa3 A:133-152,340-349,377-389
1n9z d1n9za_ A:146-165,264-271,301-315
1aox d1aoxa_ A:158-174,245-254,324-335
1rtk d1rtka2 A:257-279,426-430,432-445
1yvp d1yvpb2 B:391-408,515-521,523-536
1bhq d1bhq1_ 1:146-165,234-242,308-321
1t6b d1t6by_ Y:55-74,195-199,201-210
1bho d1bho1_ 1:146-165,234-242,308-321
1rs0 d1rs0a2 A:257-279,426-430,432-445
1qc5 d1qc5a_ A:47-63,164-172,206-214
1qc5 d1qc5b_ B:347-363,464-472,506-514
2ica d2icaa1 A:143-162,230-239,291-306
1bhq d1bhq2_ 2:446-465,534-542,608-621
2i91 d2i91a2 A:391-408,515-521,523-536
2i91 d2i91b2 B:391-408,515-521,523-536
2ok5 d2ok5a1 A:261-279,397-406,432-448
1v7p d1v7pc_ C:158-174,245-254,324-335
1u0o d1u0oc1 C:526-545,614-623,686-698
1bho d1bho2_ 2:446-465,534-542,608-621
1atz d1atza_ A:940-958,1057-1065,1090-1102
1atz d1atzb_ B:940-958,1057-1065,1090-1102
1fe8 d1fe8a_ A:940-958,1057-1065,1090-1102
2adf d2adfa1 A:940-958,1057-1065,1090-1101
3bqn d3bqnc1 C:143-162,230-239,291-306
1lfa d1lfab_ B:143-162,230-239,291-306
1fe8 d1fe8c_ C:940-958,1057-1065,1090-1102
1ao3 d1ao3b_ B:18-36,135-143,168-180
2b2x d2b2xb1 B:161-175,250-257,327-336
1xdd d1xddb_ B:143-162,230-239,291-306
3e2m d3e2mb1 B:143-162,230-239,291-306
1qc5 d1qc5a_ A:47-63,134-143,206-214
1pd0 d1pd0a3 A:320-333,439-447,533-550
1qc5 d1qc5b_ B:347-363,434-443,506-514
1zop d1zopb_ B:143-162,230-239,291-306
1zoo d1zoob_ B:143-162,230-239,291-306
1lfa d1lfaa_ A:143-162,230-239,291-306
1cqp d1cqpa_ A:143-162,230-239,291-306
1oak d1oaka_ A:526-545,614-623,686-699
3bqm d3bqmc1 C:143-162,230-239,291-306
1cqp d1cqpb_ B:143-162,230-239,291-306
1idn d1idn1_ 1:146-165,234-242,308-321
1fe8 d1fe8b_ B:940-958,1057-1065,1090-1101
1zop d1zopa_ A:143-162,230-239,291-306
1zoo d1zooa_ A:143-162,230-239,291-306
1pcx d1pcxa3 A:320-333,439-447,533-550
1idn d1idn2_ 2:446-465,534-542,608-621
1tye d1tyed2 D:127-147,328-333,336-351
1pd1 d1pd1a3 A:320-333,439-447,533-550
1aox d1aoxb_ B:158-174,245-254,320-335
1tye d1tyeb2 B:127-147,328-333,336-351
1xdg d1xdga_ A:143-162,230-239,291-306
1aox d1aoxb_ B:158-174,275-283,320-335
1auq d1auqa_ A:526-545,614-623,686-699
1ao3 d1ao3a_ A:18-36,135-143,168-180
1ijb d1ijba_ A:526-545,614-623,686-699
3bqm d3bqmb1 B:143-162,230-239,291-306
3e2m d3e2ma1 A:143-162,230-239,291-306
3bqn d3bqnb1 B:143-162,230-239,291-306
1mq9 d1mq9a_ A:143-162,230-239,292-300
1m2v d1m2vb3 B:320-333,494-504,533-551
1xdg d1xdgb_ B:143-162,230-239,291-306
1rd4 d1rd4c_ C:143-162,230-239,291-306
1xuo d1xuoa1 A:143-162,230-239,291-303
1rd4 d1rd4d_ D:143-162,230-239,291-306
1rd4 d1rd4b_ B:143-162,230-239,291-306
1qcy d1qcya_ A:157-172,244-253,323-333
1rd4 d1rd4a_ A:143-162,230-239,291-306
1ijk d1ijka_ A:526-545,614-623,686-699
1dgq d1dgqa_ A:143-162,254-262,291-311
1xuo d1xuob1 B:143-162,230-239,291-302
1sht d1shtx_ X:55-75,195-199,204-216
1m10 d1m10a_ A:526-545,614-623,686-699
1fns d1fnsa_ A:526-545,614-623,686-699
1mf7 d1mf7a_ A:146-165,233-242,308-319
1xdd d1xdda_ A:143-162,230-239,291-307
1mqa d1mqaa_ A:143-162,230-238,292-300
2qtv d2qtva3 A:133-151,340-349,377-389
1n9z d1n9za_ A:146-165,233-242,301-315
1dzi d1dzia_ A:158-173,245-254,317-326
1jlm d1jlma_ A:146-165,233-242,308-318
1na5 d1na5a_ A:146-165,233-242,308-319
1tye d1tyef2 F:124-147,328-333,336-351
1pd0 d1pd0a3 A:320-333,494-503,533-550
1dgq d1dgqa_ A:143-162,230-239,291-311
1jey d1jeyb2 B:29-49,128-136,226-234
1pcx d1pcxa3 A:320-333,494-503,533-550
1shu d1shux_ X:55-74,195-199,203-217
1atz d1atza_ A:940-958,1029-1038,1090-1102
1fe8 d1fe8c_ C:940-958,1029-1038,1090-1102
1atz d1atzb_ B:940-958,1029-1038,1090-1102
1aox d1aoxb_ B:158-174,179-188,320-335
1v7p d1v7pc_ C:158-174,179-188,324-335
1fe8 d1fe8a_ A:940-958,1029-1038,1090-1102
1pd1 d1pd1a3 A:320-333,494-503,533-550
1aox d1aoxa_ A:158-174,179-188,324-335
1fe8 d1fe8b_ B:940-958,1029-1038,1090-1101
1sq0 d1sq0a_ A:526-545,614-623,686-699
1ao3 d1ao3b_ B:18-36,107-116,168-180
2adf d2adfa1 A:940-958,1029-1038,1090-1101
1atz d1atzb_ B:940-958,1029-1038,1101-1110
1ao3 d1ao3a_ A:18-36,107-116,168-180
1fe8 d1fe8a_ A:940-958,1029-1038,1101-1110
1uex d1uexc_ C:526-544,614-623,686-699
1zon d1zona_ A:143-162,230-239,298-308
1ido d1idoa_ A:146-165,233-242,301-315
1m1u d1m1ua_ A:146-165,233-242,301-315
1u0n d1u0na1 A:526-544,614-623,686-699
1mjn d1mjna_ A:143-162,230-239,297-306
1atz d1atzb_ B:940-958,964-973,1101-1110
74. c.56.2 Purine and uridine phosphorylases complex architecture; contains mixed beta-sheet of 8 strands, order 23415867, strands 3, 6 & 7 are antiparallel to the rest; and barrel, closed; n=5, S=8 !
Phosphorylase/hydrolase-like core: 3 layers, a/b/a ; mixed sheet of 5 strands: order 21354; strand 4 is antiparallel to the rest; contains crossover loops
1ybf d1ybfa_ A:34-46,63-69,230-250
1jdt d1jdtc_ C:22-34,54-62,219-236
1rxc d1rxch_ H:27-39,59-68,236-253
1t8s d1t8sd_ D:206-224,270-278,447-467
1t8s d1t8sf_ F:206-224,270-278,447-467
1lvu d1lvuf_ F:2032-2043,2109-2120,2266-2282
1jdv d1jdve_ E:22-34,54-62,218-236
1sq6 d1sq6a_ A:32-44,64-73,232-252
1lv8 d1lv8f_ F:2032-2043,2109-2120,2265-2282
1t8s d1t8sc_ C:206-224,270-278,447-467
1rt9 d1rt9a1 A:32-43,75-83,267-283
2q7o d2q7oe1 E:35-43,75-83,267-283
1jdv d1jdva_ A:22-34,54-62,218-236
1jdv d1jdvd_ D:22-34,54-62,218-236
1lvu d1lvue_ E:1032-1043,1109-1120,1265-1282
1t8s d1t8se_ E:206-224,270-278,447-467
1t8s d1t8sb_ B:206-224,270-278,446-467
1t8s d1t8sa_ A:206-224,270-278,447-467
1rr6 d1rr6a1 A:32-43,75-83,267-283
1jds d1jdse_ E:22-34,54-62,218-236
1jdv d1jdvb_ B:22-34,54-62,218-236
1jds d1jdsb_ B:22-34,54-62,218-236
1rxc d1rxca_ A:27-39,59-68,235-253
1jds d1jdsa_ A:22-34,54-62,218-236
1jds d1jdsd_ D:22-34,54-62,218-236
1jdz d1jdzc_ C:22-34,54-62,217-236
2qpl d2qpla1 A:33-42,109-117,262-282
1lv8 d1lv8a_ A:32-43,75-83,266-283
1odk d1odke_ E:22-34,55-63,215-235
1je0 d1je0c_ C:22-34,54-62,216-236
1jp7 d1jp7b_ B:22-34,54-62,217-236
1u1c d1u1cd1 D:27-39,59-67,234-253
1lv8 d1lv8d_ D:32-43,75-83,266-283
1lvu d1lvuc_ C:2032-2042,2109-2120,2264-2282
1q1g d1q1gc_ C:24-36,56-65,222-245
1vfn d1vfna_ A:33-42,109-120,265-282
1jdz d1jdzb_ B:22-34,54-62,217-236
1q1g d1q1gb_ B:24-36,56-65,222-245
1yry d1yrye1 E:32-43,75-83,265-283
1lv8 d1lv8c_ C:2032-2043,2075-2083,2264-2283
1ybf d1ybfc_ C:34-46,63-69,231-250
1jdz d1jdza_ A:22-34,54-62,217-236
1nw4 d1nw4f_ F:24-36,56-65,222-245
1je0 d1je0a_ A:22-34,54-62,217-236
1q1g d1q1gd_ D:24-36,56-65,222-245
1k3f d1k3fb_ B:1027-1039,1059-1066,1233-1253
1q1g d1q1ga_ A:24-36,56-65,222-245
1nw4 d1nw4e_ E:24-36,56-65,222-245
1jp7 d1jp7c_ C:22-34,54-62,216-236
1nw4 d1nw4d_ D:24-36,56-65,222-245
1nc3 d1nc3b_ B:9-20,40-48,210-230
1lv8 d1lv8e_ E:1032-1043,1075-1083,1266-1283
1jdt d1jdtb_ B:22-34,54-62,215-236
1je0 d1je0b_ B:22-34,54-62,217-236
1q1g d1q1ge_ E:24-36,56-65,222-245
1ulb d1ulba_ A:32-43,109-120,265-282
1nw4 d1nw4c_ C:24-36,56-65,222-245
1pr5 d1pr5c_ C:21-33,54-62,219-237
1nw4 d1nw4b_ B:24-36,56-65,222-245
1jdu d1jduc_ C:22-34,54-62,215-236
1q1g d1q1gf_ F:24-36,56-65,222-245
1pr4 d1pr4c_ C:21-33,54-62,217-237
1jdt d1jdta_ A:22-34,54-62,215-236
1nw4 d1nw4a_ A:24-36,56-65,222-245
1yry d1yrye1 E:32-43,109-120,265-283
1jds d1jdsc_ C:22-34,54-62,215-236
1v41 d1v41e_ E:32-43,75-83,263-283
1lv8 d1lv8a_ A:32-43,109-120,266-283
1jds d1jdsf_ F:22-34,54-62,215-236
1jp7 d1jp7a_ A:22-34,54-62,216-236
1je1 d1je1f_ F:22-34,54-62,215-236
1je1 d1je1c_ C:22-34,54-62,215-236
1lvu d1lvuf_ F:2032-2043,2075-2083,2266-2282
1a9o d1a9oa_ A:32-42,109-120,265-282
1lv8 d1lv8b_ B:1035-1043,1075-1083,1266-1282
1odj d1odjc_ C:22-34,55-63,213-235
1jdv d1jdvc_ C:22-34,54-62,215-236
1v41 d1v41e_ E:32-43,109-120,263-283
1jdv d1jdvf_ F:22-34,54-62,215-236
1lvu d1lvuf_ F:2032-2043,2233-2245,2266-2282
1vhw d1vhwf_ F:22-35,55-63,217-238
1rxc d1rxck_ K:27-39,59-68,239-253
1ybf d1ybfb_ B:34-46,63-69,231-252
1rt9 d1rt9a1 A:32-43,109-120,267-283
1odk d1odkb_ B:22-34,55-63,213-235
1k3f d1k3fb_ B:1027-1039,1087-1098,1233-1253
1lv8 d1lv8d_ D:32-43,109-120,266-283
1tgv d1tgvb1 B:27-39,59-68,234-253
1vhj d1vhje_ E:22-35,55-63,217-238
1odk d1odkc_ C:22-34,55-63,212-235
1lv8 d1lv8f_ F:2032-2043,2075-2083,2265-2282
1odi d1odia_ A:22-34,55-63,213-235
1jdu d1jdua_ A:22-34,54-62,215-236
1odl d1odla_ A:22-34,55-63,213-235
1jpv d1jpvc_ C:22-34,54-62,215-236
1odj d1odjd_ D:22-34,55-63,213-235
1lv8 d1lv8e_ E:1032-1043,1109-1120,1266-1283
1lx7 d1lx7b_ B:27-39,87-96,233-253
1odl d1odle_ E:22-34,55-63,213-235
1odl d1odlb_ B:22-34,55-63,213-235
1pr2 d1pr2c_ C:21-33,54-62,217-237
1lv8 d1lv8f_ F:2032-2043,2233-2243,2265-2282
1odk d1odkd_ D:22-34,55-63,213-235
1lv8 d1lv8c_ C:2032-2043,2109-2120,2264-2283
1jpv d1jpvb_ B:22-34,54-62,215-236
1odl d1odld_ D:22-34,55-63,213-235
1t8r d1t8re_ E:206-224,270-278,442-467
1odi d1odic_ C:22-34,55-63,213-235
1xe3 d1xe3e_ E:21-33,54-62,213-234
1odk d1odka_ A:22-34,55-63,213-235
1pr6 d1pr6c_ C:21-33,54-62,218-237
1pwy d1pwye_ E:32-42,109-120,265-283
1a9r d1a9ra_ A:32-42,109-120,267-282
1pr1 d1pr1a_ A:21-33,54-62,217-237
1t8r d1t8rd_ D:206-224,270-278,442-467
1odl d1odlc_ C:22-34,55-63,213-235
2ai2 d2ai2a1 A:32-42,109-120,267-282
1t8w d1t8wc_ C:206-224,270-278,442-467
1je1 d1je1b_ B:22-34,54-62,215-236
1jpv d1jpva_ A:22-34,54-62,215-236
1je1 d1je1e_ E:22-34,54-62,215-236
1odk d1odkf_ F:22-34,55-63,213-235
1t8w d1t8wa_ A:206-224,270-278,442-467
1t8r d1t8rb_ B:206-224,270-278,442-467
1odi d1odid_ D:22-34,55-63,213-235
1t8y d1t8ye_ E:206-224,270-278,442-467
1je1 d1je1a_ A:22-34,54-62,215-236
1t8y d1t8yc_ C:206-224,270-278,442-467
1t8r d1t8rf_ F:206-224,270-278,442-467
1odl d1odlf_ F:22-34,55-63,213-235
1t8r d1t8ra_ A:206-224,270-278,442-467
1t8y d1t8ya_ A:206-224,270-278,442-467
1t8w d1t8wd_ D:206-224,270-278,442-467
1nc1 d1nc1a_ A:9-20,69-80,210-232
1lx7 d1lx7b_ B:27-39,59-68,233-253
1lvu d1lvue_ E:1032-1043,1233-1244,1265-1282
1jdz d1jdza_ A:22-34,82-94,217-236
1t8y d1t8yb_ B:206-224,270-278,442-467
1t8w d1t8we_ E:206-224,270-278,442-467
1t8w d1t8wb_ B:206-224,270-278,442-467
1t8r d1t8rc_ C:206-224,270-278,442-467
1jds d1jdsa_ A:22-34,82-94,218-236
1je1 d1je1d_ D:22-34,54-62,215-236
1t8w d1t8wf_ F:206-224,270-278,442-467
1ryz d1ryzb_ B:27-39,59-67,230-253
1lvu d1lvue_ E:1032-1043,1075-1083,1265-1282
1nc3 d1nc3a_ A:9-20,69-80,210-232
1u1f d1u1fa1 A:27-39,59-68,233-253
1jds d1jdsd_ D:22-34,82-94,218-236
1jds d1jdse_ E:22-34,82-94,218-236
1a9q d1a9qa_ A:32-42,109-120,267-282
1odj d1odjb_ B:22-34,55-63,213-235
1t8y d1t8yd_ D:206-224,270-278,442-467
1odi d1odie_ E:22-34,55-63,213-235
1rxc d1rxch_ H:27-39,87-98,236-253
1jdv d1jdva_ A:22-34,82-94,218-236
1odi d1odib_ B:22-34,55-63,213-235
1jdv d1jdve_ E:22-34,82-94,218-236
1y6q d1y6qa1 A:9-20,69-80,210-232
1t8y d1t8yf_ F:206-224,270-278,442-467
1jdt d1jdtc_ C:22-34,82-94,219-236
2ai1 d2ai1a1 A:32-42,109-120,267-282
1tgv d1tgvb1 B:27-39,87-98,234-253
1jdz d1jdzb_ B:22-34,82-94,217-236
1jdz d1jdzc_ C:22-34,82-94,217-236
1pr1 d1pr1c_ C:21-33,54-62,218-237
1jds d1jdsb_ B:22-34,82-94,218-236
1y6r d1y6ra1 A:9-20,69-80,210-232
1vhj d1vhjc_ C:22-34,55-63,217-238
1odi d1odif_ F:22-34,55-63,213-235
1jdu d1jdub_ B:22-34,54-62,215-236
1vhj d1vhjd_ D:22-34,55-63,217-238
1jdv d1jdvd_ D:22-34,82-94,218-236
1xe3 d1xe3f_ F:21-33,83-94,217-233
1xe3 d1xe3d_ D:21-33,54-62,213-234
1jys d1jysa_ A:9-20,40-48,206-230
1t0u d1t0ua_ A:27-39,59-68,233-253
1vfn d1vfna_ A:33-42,233-243,265-282
1rxc d1rxcc_ C:27-39,59-68,234-253
1je0 d1je0a_ A:22-34,82-94,217-236
1rr6 d1rr6a1 A:32-43,109-120,267-283
1je0 d1je0b_ B:22-34,82-94,217-236
1odj d1odjf_ F:22-34,55-63,213-235
1jys d1jysb_ B:9-20,69-80,206-230
1k9s d1k9sb_ B:21-34,54-62,221-237
1pf7 d1pf7e_ E:32-42,109-120,265-283
1jdv d1jdvb_ B:22-34,82-94,218-236
1ryz d1ryzc_ C:27-39,59-67,230-253
1lvu d1lvua_ A:32-42,109-120,262-282
1v3q d1v3qe_ E:32-42,109-120,265-283
1rxc d1rxca_ A:27-39,87-98,235-253
1jp7 d1jp7b_ B:22-34,82-94,217-236
1lvu d1lvuc_ C:2032-2042,2233-2245,2264-2282
1ulb d1ulba_ A:32-43,233-242,265-282
1nc3 d1nc3b_ B:9-20,69-80,210-230
1v2h d1v2he_ E:32-42,109-120,263-283
1odk d1odke_ E:22-34,83-94,215-235
1odj d1odja_ A:22-34,55-63,213-235
1rsz d1rsza1 A:32-42,109-120,267-283
1jys d1jysa_ A:9-20,69-80,206-230
1u1f d1u1ff1 F:27-39,59-67,230-253
1u1g d1u1ge1 E:27-39,59-67,230-253
1rxc d1rxci_ I:27-39,59-68,230-253
1lv8 d1lv8b_ B:1035-1043,1109-1120,1266-1282
1jp7 d1jp7a_ A:22-34,82-94,216-236
2bsx d2bsxa1 A:24-35,56-65,221-245
1rxu d1rxuh_ H:27-39,59-68,230-253
1rxu d1rxum_ M:27-39,59-68,230-253
1rxu d1rxua_ A:27-39,59-68,230-253
1rxu d1rxur_ R:27-39,59-68,230-253
1rxu d1rxul_ L:27-39,59-68,230-253
1rxu d1rxuj_ J:27-39,59-68,230-253
1rxu d1rxug_ G:27-39,59-68,230-253
1rxu d1rxui_ I:27-39,59-68,230-253
1u1g d1u1gf1 F:27-39,59-67,230-253
1rxu d1rxuk_ K:27-39,59-68,230-253
1rxu d1rxub_ B:27-39,59-68,230-253
1rxu d1rxup_ P:27-39,59-68,230-253
1rxu d1rxuc_ C:27-39,59-68,230-253
1y6q d1y6qb1 B:9-20,69-80,210-232
1jp7 d1jp7c_ C:22-34,82-94,216-236
1lv8 d1lv8e_ E:1032-1043,1233-1243,1266-1283
1rxu d1rxuf_ F:27-39,59-68,230-253
1rxu d1rxue_ E:27-39,59-68,230-253
1nc1 d1nc1b_ B:9-20,69-80,210-232
1xe3 d1xe3f_ F:21-33,54-62,217-233
1rxu d1rxuo_ O:27-39,59-68,230-253
1rxu d1rxud_ D:27-39,59-68,230-253
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1rxu d1rxum_ M:27-39,87-98,230-253
1rxu d1rxuk_ K:27-39,87-98,230-253
1rxc d1rxcd_ D:27-39,87-98,230-253
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1u1d d1u1db1 B:27-39,87-98,230-253
1vhw d1vhwd_ D:22-35,55-63,214-238
1rxu d1rxuq_ Q:27-39,87-98,230-253
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1xe3 d1xe3e_ E:21-33,83-94,213-234
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1ov6 d1ov6c_ C:21-33,54-62,214-237
1rxu d1rxuc_ C:27-39,87-98,230-253
1a9t d1a9ta_ A:33-42,109-120,267-282
1u1d d1u1de1 E:27-39,87-98,230-253
1rxc d1rxcg_ G:27-39,87-98,231-253
1rxc d1rxcb_ B:27-39,87-98,230-253
1v2h d1v2he_ E:32-42,233-244,263-283
1rfg d1rfge_ E:32-42,233-245,265-283
1rxc d1rxcl_ L:27-39,87-98,230-253
1ryz d1ryze_ E:27-39,87-98,230-253
1u1e d1u1ea1 A:27-39,87-98,230-253
1odj d1odje_ E:22-34,83-94,213-235
1u1e d1u1eb1 B:27-39,87-98,230-253
1odj d1odjd_ D:22-34,83-94,213-235
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1ryz d1ryzc_ C:27-39,87-98,230-253
1lx7 d1lx7a_ A:27-39,87-98,230-253
1ryz d1ryze_ E:27-39,59-68,230-253
1nw4 d1nw4f_ F:24-36,84-95,222-245
1rxc d1rxcj_ J:27-39,87-98,230-253
1lvu d1lvud_ D:32-42,109-120,257-283
1rxc d1rxci_ I:27-39,87-98,230-253
1nw4 d1nw4c_ C:24-36,84-95,222-245
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1rxc d1rxce_ E:27-39,87-98,230-253
1v45 d1v45e_ E:32-42,233-245,264-283
1rxy d1rxyb_ B:27-39,59-68,230-253
1ou4 d1ou4b_ B:21-33,54-62,214-237
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1b8o d1b8oa_ A:33-42,109-120,267-282
1pk7 d1pk7c_ C:21-33,54-62,214-237
1a9p d1a9pa_ A:33-42,109-120,267-280
1ula d1ulaa_ A:32-42,109-120,260-283
1ecp d1ecpc_ C:21-33,54-62,213-237
1nw4 d1nw4d_ D:24-36,84-95,222-245
1ovg d1ovgc_ C:21-33,54-62,214-237
1u1c d1u1ce1 E:27-39,87-98,230-253
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1t8y d1t8ye_ E:206-224,298-309,442-467
1t8y d1t8yc_ C:206-224,298-309,442-467
1t8w d1t8wb_ B:206-224,298-309,442-467
1t8y d1t8yb_ B:206-224,298-309,442-467
1t8w d1t8wf_ F:206-224,298-309,442-467
1t8r d1t8re_ E:206-224,298-309,442-467
1t8r d1t8ra_ A:206-224,298-309,442-467
1t8y d1t8yf_ F:206-224,298-309,442-467
1t8y d1t8yd_ D:206-224,298-309,442-467
1t8r d1t8rd_ D:206-224,298-309,442-467
2ai1 d2ai1a1 A:32-42,233-244,256-268
1t8r d1t8rc_ C:206-224,298-309,442-467
1g2o d1g2oc_ C:36-46,221-233,242-254
1g2o d1g2ob_ B:36-46,221-233,242-254
1n3i d1n3ic_ C:36-46,221-233,242-254
1n3i d1n3ib_ B:36-46,221-233,242-254
1g2o d1g2oa_ A:36-46,221-233,242-254
1n3i d1n3ia_ A:36-46,221-233,242-254
75. c.23.17 Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH fold elaborated with additional structures !
Flavodoxin-like 3 layers, a/b/a; parallel beta-sheet of 5 strand, order 21345
1v9c d1v9ca_ A:73-81,128-135,189-207
1v9c d1v9cb_ B:73-81,127-135,189-207
1ou0 d1ou0b_ B:77-85,129-136,191-206
1ou0 d1ou0a_ A:77-85,129-136,191-206
1ou0 d1ou0d_ D:77-85,129-136,191-206
1ou0 d1ou0c_ C:77-85,129-136,191-206
1f2v d1f2va_ A:78-86,130-136,194-208
1i1h d1i1ha_ A:78-86,130-136,194-208
1v9c d1v9cb_ B:81-89,89-95,189-207
1f2v d1f2va_ A:78-86,94-98,194-208
1ou0 d1ou0a_ A:77-85,157-163,191-206
1ou0 d1ou0b_ B:77-85,92-97,191-206
1ou0 d1ou0d_ D:77-85,92-97,191-206
1ou0 d1ou0a_ A:77-85,92-97,191-206
1ou0 d1ou0b_ B:77-85,157-163,191-206
1ou0 d1ou0c_ C:77-85,92-97,191-206
1ou0 d1ou0c_ C:77-85,157-163,191-206
1ou0 d1ou0d_ D:77-85,157-163,191-206
1v9c d1v9cb_ B:73-81,154-160,189-207
1v9c d1v9ca_ A:73-81,154-160,189-207
1f2v d1f2va_ A:78-86,157-162,194-208
1i1h d1i1ha_ A:78-86,157-162,194-208
1v9c d1v9ca_ A:81-89,90-94,189-207
76. c.23.12 Formate/glycerate dehydrogenase catalytic domain-like
Flavodoxin-like 3 layers, a/b/a; parallel beta-sheet of 5 strand, order 21345
1k0u d1k0uf2 F:56-70,125-131,353-375
2h5l d2h5le2 E:56-70,125-131,353-375
2h5l d2h5lg2 G:56-70,125-131,353-375
2h5l d2h5lc2 C:56-70,125-131,353-375
2h5l d2h5lh2 H:56-70,125-131,353-375
2h5l d2h5ld2 D:56-70,125-131,353-375
1k0u d1k0uh2 H:56-70,125-131,353-375
2h5l d2h5lf2 F:56-70,125-131,353-375
2h5l d2h5la2 A:56-70,125-131,353-375
2h5l d2h5lb2 B:56-70,125-131,353-375
1k0u d1k0ua2 A:56-70,125-131,353-375
1sc6 d1sc6d2 D:20-31,55-60,296-319
1k0u d1k0ub2 B:56-70,125-131,353-375
1k0u d1k0ud2 D:56-70,125-131,353-375
1k0u d1k0ue2 E:56-70,125-131,353-375
1k0u d1k0uc2 C:56-70,125-131,353-375
1k0u d1k0ug2 G:56-70,125-131,353-375
1d4f d1d4fa2 A:56-70,125-131,353-375
1ky5 d1ky5a2 A:56-70,125-131,353-375
1ky5 d1ky5d2 D:3056-3070,3125-3131,3353-3375
1ky5 d1ky5b2 B:1056-1070,1125-1131,1353-1375
1a7a d1a7ab2 B:57-71,126-132,354-376
1ky5 d1ky5c2 C:2056-2070,2125-2131,2353-2375
1a7a d1a7aa2 A:57-71,126-132,354-376
1gdh d1gdhb2 B:12-24,47-53,292-313
1li4 d1li4a2 A:57-71,126-132,354-376
1d4f d1d4fc2 C:56-70,125-131,353-375
1sc6 d1sc6b2 B:20-31,55-60,297-319
1d4f d1d4fd2 D:56-70,125-131,353-375
1d4f d1d4fb2 B:56-70,125-131,353-375
1xwf d1xwfb2 B:56-70,125-131,353-375
1xwf d1xwfa2 A:56-70,125-131,353-375
2p9e d2p9eb2 B:20-31,55-60,297-319
1xwf d1xwfd2 D:56-70,125-131,353-375
1ky4 d1ky4a2 A:56-70,125-131,353-375
1xwf d1xwfc2 C:56-70,125-131,353-375
1ky4 d1ky4b2 B:1056-1070,1125-1131,1353-1375
1ky4 d1ky4c2 C:2056-2070,2125-2131,2353-2375
1b3r d1b3rb2 B:56-70,125-131,353-375
2p9e d2p9ed2 D:20-31,55-60,297-319
1ky4 d1ky4d2 D:3056-3070,3125-3131,3353-3375
1b3r d1b3ra2 A:56-70,125-131,353-375
1b3r d1b3rc2 C:56-70,125-131,353-375
1yba d1ybad2 D:20-31,55-60,297-319
1sc6 d1sc6c2 C:20-31,55-60,299-319
1b3r d1b3rd2 D:56-70,125-131,353-375
2p9c d2p9ca2 A:20-31,55-60,297-319
2dld d2dlda2 A:10-25,26-33,302-323
1psd d1psda2 A:20-31,55-60,297-319
2p9g d2p9gb2 B:20-31,55-60,297-319
2pa3 d2pa3a2 A:20-31,55-60,297-319
2p9c d2p9cb2 B:20-31,55-60,297-319
2p9g d2p9ga2 A:20-31,55-60,297-319
1psd d1psdb2 B:20-31,55-60,297-319
1sc6 d1sc6a2 A:20-31,55-60,296-319
1yba d1ybac2 C:20-31,55-60,297-319
1yba d1ybab2 B:20-31,55-60,297-319
2p9e d2p9ea2 A:20-31,55-60,297-319
1yba d1ybaa2 A:20-31,55-60,297-319
1dxy d1dxya2 A:9-24,25-31,300-322
1j49 d1j49a2 A:10-25,27-33,302-323
2dld d2dldb2 B:10-25,26-33,302-323
2p9e d2p9ec2 C:20-31,55-60,297-319
1j49 d1j49b2 B:10-25,27-33,302-323
1sc6 d1sc6d2 D:20-31,77-82,296-319
1dxy d1dxya2 A:9-24,46-51,300-322
2dld d2dlda2 A:10-25,48-53,302-323
2dld d2dldb2 B:10-25,48-53,302-323
1ygy d1ygyb2 B:14-22,46-51,285-306
1qp8 d1qp8a2 A:10-21,33-38,267-288
1j4a d1j4ac2 C:10-25,27-33,302-323
1sc6 d1sc6c2 C:20-31,77-82,299-319
1gdh d1gdhb2 B:12-24,70-77,292-313
1j4a d1j4ab2 B:10-25,27-33,302-323
1j4a d1j4aa2 A:10-25,27-33,302-323
1j4a d1j4ad2 D:10-25,27-33,302-323
1hl3 d1hl3a2 A:27-35,60-65,309-331
1v8b d1v8bd2 D:56-70,129-135,399-424
1v8b d1v8bb2 B:56-70,129-135,399-424
2p9c d2p9ca2 A:20-31,77-82,297-319
1v8b d1v8ba2 A:56-70,129-135,399-424
1gdh d1gdha2 A:12-23,47-52,292-313
1sc6 d1sc6b2 B:20-31,77-82,297-319
1v8b d1v8bc2 C:56-70,129-135,399-424
1mx3 d1mx3a2 A:38-46,71-76,320-342
1gdh d1gdha2 A:12-23,70-77,292-313
1hku d1hkua2 A:26-35,60-65,309-331
2p9e d2p9ed2 D:20-31,77-82,297-319
1j4a d1j4aa2 A:10-25,48-53,302-323
1j4a d1j4ad2 D:10-25,48-53,302-323
2p9g d2p9ga2 A:20-31,77-82,297-319
1j4a d1j4ab2 B:10-25,48-53,302-323
2p9e d2p9eb2 B:20-31,77-82,297-319
1yba d1ybab2 B:20-31,77-82,297-319
2p9c d2p9cb2 B:20-31,77-82,297-319
2h5l d2h5ld2 D:56-70,71-77,353-375
2h5l d2h5le2 E:56-70,71-77,353-375
2h5l d2h5lh2 H:56-70,71-77,353-375
2h5l d2h5lc2 C:56-70,71-77,353-375
2h5l d2h5lb2 B:56-70,71-77,353-375
2h5l d2h5la2 A:56-70,71-77,353-375
2h5l d2h5lg2 G:56-70,71-77,353-375
2h5l d2h5lf2 F:56-70,71-77,353-375
1xwf d1xwfd2 D:56-70,71-77,353-375
1xwf d1xwfb2 B:56-70,71-77,353-375
1xwf d1xwfc2 C:56-70,71-77,353-375
1k0u d1k0ug2 G:56-70,71-77,353-375
1k0u d1k0ue2 E:56-70,71-77,353-375
1xwf d1xwfa2 A:56-70,71-77,353-375
1li4 d1li4a2 A:57-71,72-78,354-376
1hku d1hkua2 A:26-35,37-44,309-331
1b3r d1b3ra2 A:56-70,71-77,353-375
1sc6 d1sc6a2 A:20-31,75-82,296-319
1ky4 d1ky4c2 C:2056-2070,2071-2077,2353-2375
1ky4 d1ky4a2 A:56-70,71-77,353-375
1ky4 d1ky4d2 D:3056-3070,3071-3077,3353-3375
1b3r d1b3rd2 D:56-70,71-77,353-375
1gdh d1gdha2 A:12-23,23-29,292-313
1say d1saya2 A:19-30,31-37,316-327
2pa3 d2pa3a2 A:20-31,75-82,297-319
1gdh d1gdhb2 B:12-24,23-29,292-313
1b3r d1b3rc2 C:56-70,71-77,353-375
1yba d1ybad2 D:20-31,75-82,297-319
1b3r d1b3rb2 B:56-70,71-77,353-375
1yba d1ybac2 C:20-31,75-82,297-319
1pjc d1pjca2 A:19-30,31-37,316-327
2p9g d2p9gb2 B:20-31,75-82,297-319
1yba d1ybaa2 A:20-31,75-82,297-319
1psd d1psda2 A:20-31,75-82,297-319
2p9e d2p9ea2 A:20-31,75-82,297-319
1psd d1psdb2 B:20-31,75-82,297-319
2p9e d2p9ec2 C:20-31,75-82,297-319
1pjb d1pjba2 A:19-30,31-37,316-327
1ky4 d1ky4b2 B:1056-1070,1071-1079,1353-1375
1hl3 d1hl3a2 A:27-35,38-44,309-331
1mx3 d1mx3a2 A:38-46,49-55,320-342
1hl3 d1hl3a2 A:27-35,82-87,309-331
1ygy d1ygyb2 B:14-22,68-73,285-306
1pjc d1pjca2 A:19-30,68-75,304-317
77. c.78.1 Aspartate/ornithine carbamoyltransferase
ATC-like consists of two similar domains related by pseudo dyad; duplication ! core: 3 layers, a/b/a, parallel beta-sheet of 4 strands, order 2134
2atc d2atca1 A:52-67,122-130,279-300
2at2 d2at2b1 B:47-62,116-122,272-291
1fb5 d1fb5a1 A:90-105,157-165,322-343
1ort d1orti1 I:56-71,123-131,312-333
1ort d1ortf1 F:56-71,123-131,312-333
1ort d1ortj1 J:56-71,123-131,312-333
1ort d1orth1 H:56-71,123-131,312-333
1ort d1ortc1 C:56-71,123-131,312-333
1ort d1ortl1 L:56-71,123-131,312-333
1ort d1ortk1 K:56-71,123-131,312-333
1ort d1ortg1 G:56-71,123-131,312-333
1ort d1orta1 A:56-71,123-131,312-333
1ort d1ortd1 D:56-71,123-131,312-333
1ort d1orte1 E:56-71,123-131,312-333
1ort d1ortb1 B:56-71,123-131,312-333
2otc d2otcc1 C:55-70,122-130,311-332
2otc d2otca1 A:55-70,122-130,311-332
2otc d2otcg1 G:55-70,122-130,311-332
2otc d2otci1 I:55-70,122-130,311-332
2otc d2otce1 E:55-70,122-130,311-332
2otc d2otcf1 F:55-70,122-130,311-332
2otc d2otcb1 B:55-70,122-130,311-332
2otc d2otch1 H:55-70,122-130,311-332
2otc d2otcd1 D:55-70,122-130,311-332
1ep9 d1ep9a1 A:90-105,157-165,322-343
1c9y d1c9ya1 A:90-105,157-165,322-343
1dxh d1dxha1 A:56-71,123-131,312-333
1oth d1otha1 A:90-105,157-165,322-343
1fvo d1fvob1 B:90-105,157-165,322-343
3at1 d3at1c1 C:52-67,122-130,284-306
1fvo d1fvoa1 A:90-105,157-165,322-343
1i5o d1i5oa1 A:52-67,122-130,284-306
2at2 d2at2a2 A:47-59,94-101,269-290
8at1 d8at1c1 C:52-67,122-130,284-306
7at1 d7at1c1 C:52-67,122-130,284-306
1duv d1duvg1 G:55-70,122-130,311-333
1f1b d1f1ba1 A:52-67,122-130,284-306
1duv d1duvh1 H:55-70,122-130,311-333
2fg7 d2fg7c1 C:47-62,136-144,294-317
2fg7 d2fg7d1 D:47-62,136-144,294-317
2fg7 d2fg7e1 E:47-62,136-144,294-317
2fg6 d2fg6d1 D:47-62,136-144,294-317
2fg7 d2fg7z1 Z:47-62,136-144,294-317
2a0f d2a0fc1 C:52-67,122-130,284-305
1duv d1duvi1 I:55-70,122-130,311-333
2fg6 d2fg6z1 Z:47-62,136-144,294-317
2fg6 d2fg6e1 E:47-62,136-144,294-317
2atc d2atca1 A:52-67,100-107,279-300
1fb5 d1fb5a1 A:90-105,136-143,322-343
2hse d2hsea1 A:52-67,122-130,283-306
3csu d3csua1 A:52-67,122-130,283-306
1xjw d1xjwa1 A:52-67,122-130,283-306
2fzg d2fzga1 A:52-67,122-130,283-306
1ml4 d1ml4a1 A:55-70,123-131,284-306
1za2 d1za2c1 C:52-67,122-130,283-306
2air d2airg1 G:52-67,122-130,283-306
1pvv d1pvva1 A:56-71,123-131,289-312
8atc d8atcc1 C:52-67,122-130,283-306
1za2 d1za2a1 A:52-67,122-130,283-306
2fzk d2fzkc1 C:52-67,122-130,283-306
2ipo d2ipoa1 A:52-67,122-130,283-306
1q95 d1q95a1 A:52-67,122-130,283-306
5at1 d5at1c1 C:52-67,122-130,283-306
2h3e d2h3ea1 A:52-67,122-130,283-306
1a1s d1a1sa1 A:56-71,123-131,289-312
2h3e d2h3ec1 C:52-67,122-130,283-306
1xjw d1xjwc1 C:52-67,122-130,283-306
2ipo d2ipoc1 C:52-67,122-130,283-306
1q95 d1q95c1 C:52-67,122-130,283-306
1q95 d1q95b1 B:52-67,122-130,283-306
1ezz d1ezzc1 C:52-67,122-130,283-306
6at1 d6at1c1 C:52-67,122-130,283-306
2air d2aira1 A:52-67,122-130,283-306
1q95 d1q95d1 D:52-67,122-130,283-306
3csu d3csuc1 C:52-67,122-130,283-306
7at1 d7at1a1 A:52-67,122-130,283-306
1nbe d1nbec1 C:52-67,122-130,283-306
9atc d9atca1 A:52-67,122-130,283-306
1q95 d1q95f1 F:52-67,122-130,283-306
1tth d1ttha2 A:52-67,122-130,283-306
2fzc d2fzca1 A:52-67,122-130,283-306
1r0c d1r0ca1 A:52-67,122-130,283-306
1acm d1acma1 A:52-67,122-130,283-306
1acm d1acmc1 C:52-67,122-130,283-306
2at1 d2at1c1 C:52-67,122-130,283-306
1za1 d1za1c1 C:52-67,122-130,283-306
1za1 d1za1a1 A:52-67,122-130,283-306
2at1 d2at1a1 A:52-67,122-130,283-306
8atc d8atca1 A:52-67,122-130,283-306
2fzc d2fzcc1 C:52-67,122-130,283-306
1r0c d1r0cg1 G:52-67,122-130,283-306
1sku d1skuc1 C:52-67,122-130,283-306
2qgf d2qgfa1 A:52-67,122-130,283-306
1ezz d1ezza1 A:52-67,123-130,283-305
1at1 d1at1a1 A:52-67,122-130,283-306
2fzg d2fzgc1 C:52-67,122-130,283-306
1rae d1raea1 A:52-67,122-130,283-306
4at1 d4at1c1 C:52-67,122-130,283-306
1vlv d1vlva1 A:57-72,125-132,292-313
1raf d1rafa1 A:52-67,122-130,283-306
1d09 d1d09a1 A:52-67,122-130,283-306
1at1 d1at1c1 C:52-67,122-130,283-306
1rab d1raba1 A:52-67,122-130,283-306
6at1 d6at1a1 A:52-67,122-130,283-306
1rac d1raca1 A:52-67,122-130,283-306
1rad d1rada1 A:52-67,122-130,283-306
1rah d1raha1 A:52-67,122-130,283-306
1rai d1raia1 A:52-67,122-130,283-306
1tu0 d1tu0a2 A:52-67,122-130,283-306
1akm d1akmc2 C:55-70,122-127,311-333
1ort d1ortb1 B:56-71,102-109,312-333
1ort d1ortj1 J:56-71,102-109,312-333
1ort d1ortl1 L:56-71,102-109,312-333
1ort d1ortf1 F:56-71,102-109,312-333
1ort d1ortg1 G:56-71,102-109,312-333
1ort d1orte1 E:56-71,102-109,312-333
1ort d1orth1 H:56-71,102-109,312-333
1ort d1ortc1 C:56-71,102-109,312-333
1ort d1orti1 I:56-71,102-109,312-333
1ort d1ortd1 D:56-71,102-109,312-333
1ort d1orta1 A:56-71,102-109,312-333
1ort d1ortk1 K:56-71,102-109,312-333
1raa d1raac1 C:52-67,122-130,283-306
1raa d1raaa1 A:52-67,122-130,283-306
1rag d1raga1 A:52-67,122-130,283-306
1rae d1raec1 C:52-67,122-130,283-306
1rad d1radc1 C:52-67,122-130,283-306
5at1 d5at1a1 A:52-67,122-130,283-306
1akm d1akmb2 B:55-70,122-127,311-333
1akm d1akma2 A:55-70,122-127,311-333
2hse d2hsec1 C:52-67,122-130,283-306
1rac d1racc1 C:52-67,122-130,283-306
1r0b d1r0bf1 F:52-67,122-130,283-306
1tug d1tuga1 A:52-67,122-130,283-306
1raf d1rafc1 C:52-67,122-130,283-306
1rab d1rabc1 C:52-67,122-130,283-306
1sku d1skua1 A:52-67,122-130,283-306
1rai d1raic1 C:52-67,122-130,283-306
1rah d1rahc1 C:52-67,122-130,283-306
1nbe d1nbea1 A:52-67,122-130,283-306
1rag d1ragc1 C:52-67,122-130,283-306
2fzk d2fzka1 A:52-67,122-130,283-306
4at1 d4at1a1 A:52-67,122-130,283-306
2qgf d2qgfc1 C:52-67,122-130,283-306
2at2 d2at2b1 B:47-62,96-100,272-291
1d09 d1d09c1 C:52-67,122-130,283-306
1ep9 d1ep9a1 A:90-105,136-143,322-343
1oth d1otha1 A:90-105,136-143,322-343
2a0f d2a0fa1 A:52-67,122-130,283-306
1c9y d1c9ya1 A:90-105,136-143,322-343
2qg9 d2qg9a1 A:52-67,122-130,283-306
1fvo d1fvoa1 A:90-105,136-143,322-343
1fvo d1fvob1 B:90-105,136-143,322-343
2be9 d2be9a1 A:49-64,117-125,284-299
1i5o d1i5oa1 A:52-67,100-107,284-306
3at1 d3at1c1 C:52-67,100-107,284-306
1pg5 d1pg5a1 A:49-64,117-125,284-299
1dxh d1dxha1 A:56-71,102-109,312-333
1tug d1tugc1 C:52-67,123-130,283-306
2otc d2otcc1 C:55-70,101-108,311-332
2otc d2otcg1 G:55-70,101-108,311-332
2otc d2otci1 I:55-70,101-108,311-332
2otc d2otca1 A:55-70,101-108,311-332
2otc d2otch1 H:55-70,101-108,311-332
2otc d2otce1 E:55-70,101-108,311-332
2otc d2otcd1 D:55-70,101-108,311-332
2otc d2otcf1 F:55-70,101-108,311-332
2otc d2otcb1 B:55-70,101-108,311-332
1duv d1duvg1 G:55-70,101-108,311-333
1vlv d1vlva1 A:57-72,103-110,292-313
3d7s d3d7sc1 C:52-67,122-130,283-306
8at1 d8at1c1 C:52-67,100-107,284-306
1duv d1duvh1 H:55-70,101-108,311-333
2a0f d2a0fc1 C:52-67,100-107,284-305
1duv d1duvi1 I:55-70,101-108,311-333
7at1 d7at1c1 C:52-67,100-107,284-306
1gq3 d1gq3b1 B:52-67,100-107,283-305
1f1b d1f1ba1 A:52-67,100-107,284-306
1ezz d1ezza1 A:52-67,100-107,283-305
1tug d1tugc1 C:52-67,100-107,283-306
2at2 d2at2a2 A:47-59,115-119,269-290
1ml4 d1ml4a1 A:55-70,102-109,284-306
1tug d1tuga1 A:52-67,100-107,283-306
1gq3 d1gq3a2 A:52-67,123-127,283-306
1fb5 d1fb5a1 A:90-105,106-112,322-343
1pg5 d1pg5a1 A:49-64,96-103,284-299
1c9y d1c9ya1 A:90-105,106-112,322-343
2be9 d2be9a1 A:49-64,96-103,284-299
1fvo d1fvoa1 A:90-105,106-113,322-343
1fvo d1fvob1 B:90-105,106-113,322-343
1ep9 d1ep9a1 A:90-105,106-113,322-343
2at2 d2at2c1 C:47-62,94-103,276-291
1oth d1otha1 A:90-105,106-113,322-343
2at2 d2at2c1 C:47-62,116-124,276-291
1tug d1tugc1 C:52-67,123-130,134-150
2qg9 d2qg9c1 C:52-67,123-130,134-150
2at2 d2at2c1 C:47-62,116-124,127-143
78. d.79.4 PurM N-terminal domain-like
Bacillus chorismate mutase-like core: beta-alpha-beta-alpha-beta(2); mixed beta-sheet: order: 1423, strand 4 is antiparallel to the rest
2hry d2hrya2 A:35-46,435-447,452-471
2hs4 d2hs4a2 A:35-46,435-447,452-471
2hs3 d2hs3a2 A:35-46,435-447,452-471
3d54 d3d54i2 I:35-46,435-447,452-471
1cli d1clid1 D:3021-3034,3100-3112,3115-3134
3d54 d3d54a2 A:35-46,435-447,452-471
3d54 d3d54e2 E:35-46,435-447,452-471
1vk3 d1vk3a2 A:35-46,435-447,452-471
2hru d2hrua2 A:35-46,435-447,452-471
1cli d1clib1 B:1021-1034,1100-1112,1115-1134
2hs0 d2hs0a2 A:35-45,435-447,452-471
1t3t d1t3ta5 A:236-249,733-743,746-769
1cli d1clia1 A:15-27,100-112,115-134
1cli d1clic1 C:2015-2027,2100-2112,2115-2134
1vqv d1vqva1 A:56-76,149-155,191-202
79. d.198.3 YjbR-like overall similar to the Type III secretory system chaperone subunits; different shape of the beta-sheet !
Secretion chaperone-like alpha-beta(3)-alpha-beta(2)-alpha; 2 layers: alpha/beta
2a1v d2a1va1 A:9-21,43-52,100-121
2a1v d2a1va1 A:9-21,22-27,100-121
2fki d2fkia1 A:2-14,36-43,88-108
80. c.119.1 DAK1/DegV-like domain folds and architecture show some similarity to the tubulin-like GTPases; the nucleotide-binding sites of the Dihydroxyacetone kinase and tubulin families are different !
DAK1/DegV-like 2 different domains; d1: [core: 3 layers, a/b/a; parallel sheet of 5 strands, order: 2134]; D2: [2 layers, a/b; mixed sheet of 6 strands, order 321645; strands 2 and 6 are antiparallel to the rest]
1un8 d1un8a4 A:8-24,28-33,61-69
1un8 d1un8b4 B:8-24,28-33,61-69
1uod d1uodb_ B:20-34,35-40,66-74
1uoe d1uoea_ A:20-34,35-40,66-74
1oi2 d1oi2b_ B:20-34,35-40,66-74
1oi3 d1oi3a_ A:20-34,35-40,66-74
1uod d1uoda_ A:20-34,35-40,66-74
1uoe d1uoeb_ B:20-34,35-40,66-74
1oi3 d1oi3b_ B:20-34,35-40,66-74
1oi2 d1oi2a_ A:20-34,35-40,66-74
1oi3 d1oi3a_ A:66-74,107-115,159-177
1oi3 d1oi3b_ B:66-74,107-115,159-177
1uoe d1uoea_ A:66-74,107-115,159-177
1uod d1uoda_ A:66-74,107-115,159-177
1uod d1uodb_ B:66-74,107-115,159-177
1oi2 d1oi2a_ A:66-74,107-115,159-177
1oi2 d1oi2b_ B:66-74,107-115,159-177
1un8 d1un8b4 B:61-69,103-110,151-169
1uoe d1uoeb_ B:66-74,107-115,159-177
1un8 d1un8a4 A:61-69,103-110,151-169
1un8 d1un8a4 A:61-69,75-79,151-169
1un8 d1un8b4 B:61-69,75-79,151-169
1pzx d1pzxa_ A:14-22,23-27,122-140
1pzx d1pzxb_ B:14-22,23-27,122-140
81. d.320.1 YojJ-like
YojJ-like alpha-beta-X-beta-alpha-beta(2)-alpha-beta(3); 3 layers: a/b/a; 7-stranded mixed beta-sheet, order 2431567; strands 1 and 3 are parallel to each other
2fb5 d2fb5a1 A:76-91,92-100,119-128
2fb5 d2fb5b1 B:76-91,92-100,119-128
2fb5 d2fb5c1 C:76-91,92-100,119-128
82. d.134.1 Nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S domain-like duplication: contains two domains of this fold !
Nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S domain-like beta-alpha-beta-alpha-beta(3)-alpha(2,3); mixed sheet: order 12345; left-handed crossover connection between strands 1 and 2
1zj9 d1zj9a4 A:184-196,206-214,262-281
1zj8 d1zj8a4 A:184-196,206-214,262-281
1zj9 d1zj9b4 B:184-196,206-214,262-281
1zj8 d1zj8b4 B:183-196,206-214,262-281
2akj d2akja3 A:453-470,476-481,535-552
1zj9 d1zj9a3 A:429-449,457-462,517-536
2akj d2akja4 A:196-210,223-230,281-300
1zj8 d1zj8b3 B:429-449,457-462,517-536
1zj8 d1zj8a3 A:429-449,457-462,517-536
2v4j d2v4je3 E:157-170,183-188,313-331
1zj9 d1zj9b3 B:429-446,457-463,517-536
2v4j d2v4jb3 B:157-170,183-188,313-331
2v4j d2v4jd3 D:189-202,212-221,355-373
2v4j d2v4ja3 A:189-202,212-221,355-373
3geo d3geoa4 A:447-466,490-496,523-542
4gep d4gepa4 A:450-466,490-496,523-542
5aop d5aopa4 A:450-466,490-496,523-542
8gep d8gepa4 A:450-466,490-496,523-542
2aop d2aopa4 A:450-466,490-496,523-542
6gep d6gepa4 A:450-466,490-496,523-542
5gep d5gepa4 A:450-466,490-496,523-542
4aop d4aopa4 A:450-466,490-496,523-542
3aop d3aopa4 A:450-466,490-496,523-542
7gep d7gepa4 A:450-466,490-496,523-542
2gep d2gepa4 A:450-466,490-496,523-542
1aop d1aopa4 A:450-466,490-496,523-542
1zj8 d1zj8a4 A:184-196,224-232,262-281
1zj9 d1zj9a4 A:184-196,224-232,262-281
1zj9 d1zj9b4 B:184-196,224-232,262-281
5gep d5gepa3 A:163-183,215-222,278-297
1zj8 d1zj8b4 B:183-196,224-232,262-281
8gep d8gepa3 A:163-182,215-222,278-297
1aop d1aopa3 A:163-182,215-222,278-297
7gep d7gepa3 A:163-182,214-222,278-297
2aop d2aopa3 A:163-182,215-222,278-297
6gep d6gepa3 A:163-182,215-222,278-297
5aop d5aopa3 A:163-182,215-222,278-297
4gep d4gepa3 A:163-182,215-222,278-297
3geo d3geoa3 A:163-182,215-222,278-297
4aop d4aopa3 A:163-182,215-222,278-297
2gep d2gepa3 A:163-182,214-222,278-297
3aop d3aopa3 A:163-182,215-222,278-297
2v4j d2v4jb3 B:157-170,200-208,313-331
2v4j d2v4je3 E:157-170,200-208,313-331
5gep d5gepa3 A:163-183,234-243,278-297
2akj d2akja4 A:196-210,243-252,281-300
7gep d7gepa3 A:163-182,234-243,278-297
2gep d2gepa3 A:163-182,234-243,278-297
2aop d2aopa3 A:163-182,234-243,278-297
5aop d5aopa3 A:163-182,234-243,278-297
6gep d6gepa3 A:163-182,234-243,278-297
8gep d8gepa3 A:163-182,234-243,278-297
4gep d4gepa3 A:163-182,234-243,278-297
4aop d4aopa3 A:163-182,234-243,278-297
3aop d3aopa3 A:163-182,234-243,278-297
1aop d1aopa3 A:163-182,234-243,278-297
3geo d3geoa3 A:163-182,234-243,278-297
2akj d2akja3 A:453-470,493-504,535-552
2v4j d2v4jd3 D:189-202,233-242,355-373
2v4j d2v4ja3 A:189-202,233-242,355-373
1zj9 d1zj9a3 A:429-449,474-485,517-536
83. c.44.1 Phosphotyrosine protein phosphatases I share the common active site structure with the family II !
Phosphotyrosine protein phosphatases I-like 3 layers: a/b/a; parallel beta-sheet of 4 strands, order 2134
1y1l d1y1lb_ B:9-24,71-77,103-124
1rxe d1rxea_ A:13-29,76-82,110-131
1y1l d1y1ld_ D:9-24,71-77,103-124
1rxi d1rxia_ A:12-29,76-82,110-131
2fxi d2fxia1 A:12-29,76-82,110-131
1y1l d1y1la_ A:9-24,71-77,104-124
1y1l d1y1lc_ C:9-24,71-77,104-124
1lk0 d1lk0a_ A:15-29,76-82,110-131
1jf8 d1jf8a_ A:13-29,76-82,110-131
1ljl d1ljla_ A:15-29,76-82,110-131
1jfv d1jfva_ A:15-29,76-82,110-131
1jl3 d1jl3c_ C:12-28,76-82,112-138
1jl3 d1jl3b_ B:15-29,76-82,112-138
1z2d d1z2da1 A:12-29,76-82,112-138
1lju d1ljua_ A:13-29,76-81,110-131
1jl3 d1jl3d_ D:12-28,76-83,112-138
1lk0 d1lk0b_ B:13-29,76-81,110-131
1p8a d1p8aa_ A:13-30,33-38,121-144
1jl3 d1jl3a_ A:15-29,76-82,112-138
1pnt d1pnta_ A:14-34,86-91,134-157
1z13 d1z13a1 A:14-34,86-91,134-157
1dg9 d1dg9a_ A:14-34,86-91,134-157
1z12 d1z12a1 A:14-34,86-91,134-157
1lju d1ljua_ A:13-29,31-39,110-131
2fxi d2fxia1 A:12-29,31-39,110-131
1jfv d1jfva_ A:15-29,97-102,110-131
1c0e d1c0eb_ B:214-234,286-291,334-357
1c0e d1c0ea_ A:14-34,86-91,134-157
1jfv d1jfva_ A:15-29,31-40,110-131
5pnt d5pnta_ A:14-34,86-91,134-156
1z2e d1z2ea1 A:15-29,76-84,112-138
1phr d1phra_ A:14-34,86-91,134-157
1lk0 d1lk0a_ A:15-29,31-40,110-131
1rxi d1rxia_ A:12-29,31-40,110-131
1jf8 d1jf8a_ A:13-29,31-40,110-131
1ljl d1ljla_ A:15-29,31-40,110-131
1lk0 d1lk0b_ B:13-29,31-40,110-131
1d1q d1d1qb_ B:15-35,88-93,137-160
1z2e d1z2ea1 A:15-29,97-105,112-138
1d1p d1d1pb_ B:15-35,88-93,137-160
1d1q d1d1qa_ A:15-35,88-93,137-160
1d2a d1d2aa_ A:15-35,88-93,137-160
1bvh d1bvha_ A:14-34,86-91,137-157
1d2a d1d2ab_ B:15-35,88-93,137-160
1jf8 d1jf8a_ A:13-29,96-102,110-131
2fxi d2fxia1 A:12-29,96-102,110-131
1lk0 d1lk0a_ A:15-29,96-102,110-131
1d1p d1d1pa_ A:15-35,88-93,137-160
1rxi d1rxia_ A:12-29,96-102,110-131
1p8a d1p8aa_ A:13-30,81-86,121-144
1bvh d1bvha_ A:14-34,38-45,137-157
1ljl d1ljla_ A:15-29,96-102,110-131
1rxe d1rxea_ A:13-29,96-102,110-131
1z2e d1z2ea1 A:15-29,31-39,112-138
1jl3 d1jl3c_ C:12-28,96-102,112-138
1jl3 d1jl3a_ A:15-29,96-102,112-138
1jl3 d1jl3d_ D:12-28,96-103,112-138
5pnt d5pnta_ A:14-34,38-47,134-156
84. c.79.1 Tryptophan synthase beta subunit-like PLP-dependent enzymes
Tryptophan synthase beta subunit-like PLP-dependent enzymes consists of two similar domains related by pseudo dyad; duplication ! core: 3 layers, a/b/a; parallel beta-sheet of 4 strands, order 3214
1tz2 d1tz2c_ C:21-29,31-40,291-309
1v8z d1v8zd1 D:56-64,66-73,343-361
1tzm d1tzmd_ D:21-29,31-40,291-309
1rqx d1rqxc_ C:21-29,31-40,291-309
1tzm d1tzmc_ C:21-29,31-40,291-309
1tzm d1tzma_ A:21-29,31-40,291-309
1tz2 d1tz2a_ A:21-29,31-40,291-309
1tzk d1tzkd_ D:21-29,31-40,291-309
1tyz d1tyzc_ C:21-29,31-40,291-309
1tzm d1tzmb_ B:21-29,31-40,291-309
1tzk d1tzkc_ C:21-29,31-40,291-309
1m54 d1m54e_ E:92-100,103-111,347-362
1tzj d1tzjd_ D:21-29,31-40,291-309
1tz2 d1tz2b_ B:21-29,31-40,291-309
1uin d1uinb_ B:59-76,78-83,133-149
1uim d1uima_ A:59-76,78-83,133-149
1tyz d1tyzb_ B:21-29,31-40,291-309
1tzj d1tzja_ A:21-29,31-40,291-309
1v8z d1v8zb1 B:56-64,66-74,343-361
1tzj d1tzjc_ C:21-29,31-40,291-309
1tz2 d1tz2d_ D:21-29,31-40,291-309
1tzk d1tzkb_ B:21-29,31-40,291-309
1rqx d1rqxa_ A:21-29,31-40,291-309
1v8z d1v8za1 A:56-64,66-73,343-361
1rqx d1rqxd_ D:21-29,31-40,291-309
1tyz d1tyza_ A:21-29,31-40,291-309
1tzj d1tzjb_ B:21-29,31-40,291-309
1tyz d1tyzd_ D:21-29,31-40,291-309
1rqx d1rqxb_ B:21-29,31-40,291-309
1wdw d1wdwj1 J:56-64,66-74,343-361
1tzk d1tzka_ A:21-29,31-40,291-309
1wdw d1wdwf1 F:56-64,66-73,343-361
1wdw d1wdwh1 H:56-64,66-73,343-361
1v8z d1v8zc1 C:56-64,66-73,343-361
1wdw d1wdwd1 D:56-64,66-74,343-361
1wdw d1wdwb1 B:56-64,66-74,343-361
1wdw d1wdwl1 L:56-64,66-74,343-361
1m54 d1m54d_ D:92-100,103-111,347-364
1m54 d1m54a_ A:92-100,103-111,347-362
1j0b d1j0bh_ H:27-35,36-43,279-297
1k8x d1k8xb_ B:112-127,128-135,165-181
1tdj d1tdja1 A:37-45,45-54,286-304
1j0b d1j0bl_ L:27-35,36-43,279-297
1m54 d1m54f_ F:92-100,103-111,347-362
1j0b d1j0bn_ N:27-35,36-44,279-297
1jbq d1jbqe_ E:92-100,103-111,347-362
1jbq d1jbqd_ D:92-100,103-111,347-362
1jbq d1jbqb_ B:92-100,103-111,347-362
1jbq d1jbqa_ A:92-100,103-111,347-362
1jbq d1jbqc_ C:92-100,103-111,347-362
1jbq d1jbqf_ F:92-100,103-111,347-362
1j0c d1j0cb_ B:21-29,31-40,292-310
1j0b d1j0bb_ B:27-35,36-44,279-297
1beu d1beub_ B:112-127,128-136,165-181
1m54 d1m54b_ B:92-100,103-111,347-362
2j9x d2j9xb1 B:112-127,128-135,165-181
1j0b d1j0bs_ S:27-35,36-43,279-297
1j0b d1j0bq_ Q:27-35,36-43,279-297
2cle d2cleb1 B:85-102,104-110,165-185
1j0c d1j0cd_ D:21-29,31-40,292-310
1j0b d1j0bp_ P:27-35,36-44,279-297
1j0b d1j0bt_ T:27-35,36-44,279-297
1d6s d1d6sb_ B:69-84,86-92,117-134
1j0b d1j0bw_ W:27-35,36-44,279-297
1j0b d1j0br_ R:27-35,36-43,279-297
1j0b d1j0bk_ K:27-35,36-43,279-297
1j0b d1j0bc_ C:27-35,36-43,279-297
1j0b d1j0bm_ M:27-35,36-44,279-297
1j0b d1j0bf_ F:27-35,36-44,279-297
1j0b d1j0bo_ O:27-35,36-44,279-297
1j0e d1j0ec_ C:21-29,31-40,292-310
1j0b d1j0bd_ D:27-35,36-44,279-297
1j0a d1j0ac_ C:27-35,36-44,279-297
1f2d d1f2dc_ C:21-29,31-40,292-310
1m54 d1m54c_ C:92-100,103-111,347-364
1j0d d1j0db_ B:21-29,31-40,292-310
1j0b d1j0bx_ X:27-35,36-44,279-297
1j0b d1j0bu_ U:27-35,36-44,279-297
1j0b d1j0be_ E:27-35,36-44,279-297
1j0e d1j0eb_ B:21-29,31-40,292-310
1j0b d1j0bi_ I:27-35,36-44,279-297
1j0d d1j0dc_ C:21-29,31-40,292-310
1j0a d1j0aa_ A:27-35,36-44,279-297
1j0b d1j0bv_ V:27-35,36-44,279-297
1j0c d1j0cc_ C:21-29,31-40,292-310
1j0b d1j0bg_ G:27-35,36-44,279-297
1j0e d1j0ed_ D:21-29,31-40,292-310
1j0b d1j0ba_ A:27-35,36-44,279-297
1j0d d1j0dd_ D:21-29,31-40,292-310
1f2d d1f2dd_ D:21-29,31-40,292-310
1wtc d1wtca1 A:32-40,40-48,281-295
1o58 d1o58a_ A:61-76,78-85,109-126
1j0b d1j0bj_ J:27-35,36-44,279-297
1f2d d1f2da_ A:21-29,31-40,292-310
1f2d d1f2db_ B:21-29,31-40,292-310
1j0d d1j0da_ A:21-29,31-40,292-310
1j0e d1j0ea_ A:21-29,31-40,292-310
1j0a d1j0ab_ B:27-35,36-44,279-297
1v7c d1v7ca_ A:85-100,101-109,133-149
1v7c d1v7cb_ B:85-100,101-109,133-149
1v7c d1v7cd_ D:85-100,101-109,133-149
1ve5 d1ve5c1 C:26-34,35-43,277-291
1v7c d1v7cc_ C:85-100,101-109,133-149
1v71 d1v71a1 A:32-40,41-48,281-295
1ve5 d1ve5b1 B:26-34,35-42,277-291
1ve5 d1ve5a1 A:26-34,35-43,277-291
1pwh d1pwhd_ D:65-80,82-90,112-128
1pwh d1pwhc_ C:65-80,82-90,112-128
1pwh d1pwha_ A:65-80,82-90,112-128
1pwh d1pwhb_ B:65-80,82-90,112-128
1ve5 d1ve5d1 D:26-34,35-42,277-291
1beu d1beub_ B:234-245,250-260,348-366
2rhg d2rhgb1 B:234-245,250-260,348-366
1j0c d1j0ca_ A:21-29,32-40,292-310
1pwe d1pweb_ B:16-24,26-33,267-280
1pwe d1pwed_ D:16-24,26-33,267-280
1pwe d1pwec_ C:16-24,26-33,267-280
1pwe d1pwee_ E:16-24,26-33,267-280
1pwe d1pwea_ A:16-24,26-33,267-280
1pwe d1pwef_ F:16-24,26-33,267-280
1pwh d1pwhd_ D:16-24,26-33,267-280
1pwh d1pwhc_ C:16-24,26-33,267-280
1pwh d1pwhb_ B:16-24,26-33,267-280
1pwh d1pwha_ A:16-24,26-33,267-280
1vb3 d1vb3a1 A:185-200,207-211,416-428
1p5j d1p5ja_ A:16-24,26-33,267-280
1pwe d1pwea_ A:169-184,189-196,267-280
1pwe d1pwec_ C:169-184,189-196,267-280
1pwe d1pwee_ E:169-184,189-196,267-280
1pwe d1pweb_ B:169-184,189-196,267-280
1pwe d1pwef_ F:169-184,189-196,267-280
1pwe d1pwed_ D:169-184,189-196,267-280
1e5x d1e5xb_ B:136-145,148-155,402-419
1e5x d1e5xa_ A:136-145,148-155,402-419
85. c.92.3 PrpR receptor domain-like recent PDB entry 2q5c belongs to this superfamily
Chelatase-like duplication: tandem repeat of two domains; 3 layers (a/b/a); parallel beta-sheet of 4 strands, order 2134
2pju d2pjub1 B:19-38,63-68,178-197
2pju d2pjua1 A:19-38,37-43,178-196
2pju d2pjub1 B:19-38,37-43,178-197
2pju d2pjuc1 C:19-34,63-68,178-198
2pju d2pjuc1 C:19-34,37-43,178-198
2pju d2pjud1 D:20-38,63-68,178-205
2pju d2pjud1 D:20-38,37-44,178-205
86. c.56.1 HybD-like the HybD fold coincides with the consensus core structure !
Phosphorylase/hydrolase-like core: 3 layers, a/b/a ; mixed sheet of 5 strands: order 21354; strand 4 is antiparallel to the rest; contains crossover loops
1cfz d1cfzc_ C:17-30,56-64,131-153
1cfz d1cfze_ E:17-30,56-64,131-153
1cfz d1cfzd_ D:17-30,56-64,131-153
1cfz d1cfzb_ B:17-30,56-64,131-153
1cfz d1cfza_ A:17-30,56-64,131-153
1cfz d1cfzf_ F:17-30,56-64,131-153
1c8b d1c8bb_ B:525-538,645-657,737-758
1c8b d1c8ba_ A:525-538,645-657,737-758
1c8b d1c8bb_ B:525-538,588-599,737-758
1c8b d1c8ba_ A:525-538,588-599,737-758
1cfz d1cfzb_ B:17-30,112-120,131-153
1cfz d1cfza_ A:17-30,112-120,131-153
1cfz d1cfzf_ F:17-30,112-120,131-153
1cfz d1cfzc_ C:17-30,112-121,131-153
1cfz d1cfzd_ D:17-30,112-121,131-153
1cfz d1cfze_ E:17-30,112-121,131-153
1c8b d1c8bb_ B:525-538,558-563,737-758
1c8b d1c8ba_ A:525-538,558-563,737-758
87. e.54.1 CbiD-like
CbiD-like 2 domains; (1) alpha+beta (res 1-192), a circularly permuted rS5 domain 2-like fold (scop_cf 54210); (2) alpha/beta with parallel beta-sheet of 4 strands, order 2134
1sr8 d1sr8a_ A:43-62,64-71,132-151
88. c.27.1 Nucleoside phosphorylase/phosphoribosyltransferase catalytic domain
Nucleoside phosphorylase/phosphoribosyltransferase catalytic domain 3 layers: a/b/a; parallel beta-sheet of 5 strands, order 32145; Rossmann-like
1brw d1brwa2 A:89-103,105-110,265-284
1brw d1brwb2 B:1089-1103,1105-1110,1265-1284
1tpt d1tpta2 A:93-106,107-113,269-288
2tpt d2tpta2 A:93-106,106-113,269-288
2elc d2elcc2 C:88-101,186-192,277-295
2elc d2elcd2 D:88-101,186-192,277-295
2elc d2elca2 A:88-101,186-192,277-295
1azy d1azya2 A:93-106,106-114,269-288
1azy d1azyb2 B:93-106,106-114,269-288
1v8g d1v8gb2 B:88-101,186-192,277-295
1otp d1otpa2 A:92-106,106-114,269-288
2elc d2elcc2 C:88-101,103-108,277-295
1zxy d1zxyb2 B:89-102,186-192,281-300
1gxb d1gxbb2 B:89-102,186-192,281-300
2elc d2elcd2 D:88-101,103-108,277-295
1zyk d1zykc2 C:89-102,186-192,281-300
2gvq d2gvqa2 A:89-102,186-192,281-300
2elc d2elcb2 B:88-101,186-192,277-295
1gxb d1gxba2 A:89-102,186-192,281-300
1zxy d1zxya2 A:89-102,186-192,281-300
1zyk d1zyka2 A:89-102,186-192,281-300
1v8g d1v8gb2 B:88-101,103-108,277-295
1gxb d1gxbc2 C:89-102,186-192,281-300
1zyk d1zykb2 B:89-102,186-192,281-300
1v8g d1v8ga2 A:88-101,186-192,277-295
2elc d2elca2 A:88-101,103-108,277-295
1o17 d1o17b2 B:89-102,186-192,281-300
2gvq d2gvqb2 B:89-102,186-192,281-300
1khd d1khdd2 D:101-114,200-206,295-314
2elc d2elcb2 B:88-101,103-108,277-295
1o17 d1o17d2 D:89-102,186-192,281-300
1khd d1khda2 A:101-114,200-206,295-314
1v8g d1v8ga2 A:88-101,103-108,277-295
2gvq d2gvqd2 D:89-102,186-192,281-300
1o17 d1o17a2 A:89-102,186-192,281-300
1gxb d1gxbd2 D:89-102,186-192,281-300
2gvq d2gvqc2 C:89-102,186-192,281-300
1zxy d1zxyc2 C:89-102,186-192,281-300
1khd d1khdb2 B:101-114,200-206,295-314
1o17 d1o17c2 C:89-102,186-192,281-300
1kgz d1kgza2 A:101-114,200-206,295-314
1zyk d1zykd2 D:89-102,186-192,281-300
1khd d1khdc2 C:101-114,200-206,295-314
1zxy d1zxyd2 D:89-102,186-192,281-300
1kgz d1kgzb2 B:101-114,200-206,295-314
1khd d1khdd2 D:101-114,116-122,295-314
1khd d1khda2 A:101-114,116-122,295-314
1khd d1khdb2 B:101-114,116-122,295-314
1khd d1khdc2 C:101-114,116-122,295-314
1tpt d1tpta2 A:93-106,197-206,269-288
1kgz d1kgzb2 B:101-114,116-122,295-314
2tpt d2tpta2 A:93-106,197-206,269-288
1kgz d1kgza2 A:101-114,116-122,295-314
1uou d1uoua2 A:124-137,138-144,299-318
1azy d1azya2 A:93-106,197-206,269-288
1azy d1azyb2 B:93-106,197-206,269-288
1brw d1brwa2 A:89-103,194-203,265-284
1otp d1otpa2 A:92-106,197-207,269-288
1brw d1brwb2 B:1089-1103,1194-1203,1265-1284
1uou d1uoua2 A:124-137,228-237,299-318
89. c.23.4 Succinyl-CoA synthetase domains
Flavodoxin-like 3 layers, a/b/a; parallel beta-sheet of 5 strand, order 21345
2scu d2scud2 D:153-168,201-209,275-286
2scu d2scua2 A:153-168,201-209,275-286
2nu9 d2nu9a2 A:153-168,201-209,275-286
2nu9 d2nu9h2 H:153-168,201-209,275-286
2nu9 d2nu9f2 F:153-168,201-209,275-286
2nu9 d2nu9d2 D:153-168,201-209,275-286
1cqi d1cqia2 A:153-168,201-209,275-286
1cqj d1cqjd2 D:153-168,201-209,275-286
1cqj d1cqja2 A:153-168,201-209,275-286
1cqi d1cqid2 D:153-168,201-209,275-286
2nua d2nuad2 D:153-168,201-209,275-287
2nua d2nuaa2 A:153-168,201-209,275-287
2nu6 d2nu6d2 D:153-168,201-209,275-287
2nu7 d2nu7d2 D:153-168,201-209,275-287
2nu7 d2nu7a2 A:153-168,201-209,275-287
2nu6 d2nu6a2 A:153-168,201-209,275-287
2nu8 d2nu8d2 D:153-168,201-209,275-287
2nu8 d2nu8a2 A:153-168,201-209,275-287
1jkj d1jkja2 A:153-168,201-209,275-287
1jkj d1jkjd2 D:153-168,201-209,275-287
1oi7 d1oi7a2 A:153-168,201-208,275-288
1jll d1jlld2 D:153-168,201-209,275-287
1jll d1jlla2 A:153-168,201-209,275-287
2scu d2scub1 B:265-280,312-320,373-385
1cqi d1cqib1 B:265-280,312-320,373-385
1cqi d1cqie1 E:265-280,312-320,373-385
2scu d2scud2 D:153-168,228-235,275-286
1cqj d1cqje1 E:265-280,312-320,373-385
1cqj d1cqjb1 B:265-280,312-320,373-385
2scu d2scue1 E:265-280,312-320,373-385
2scu d2scua2 A:153-168,228-235,275-286
2nu7 d2nu7e1 E:265-280,312-320,373-385
2nu9 d2nu9d2 D:153-168,228-235,275-286
2nu9 d2nu9h2 H:153-168,228-235,275-286
2nu9 d2nu9a2 A:153-168,228-235,275-286
1jkj d1jkje1 E:265-280,312-320,373-385
2nu9 d2nu9g1 G:265-280,312-320,373-385
2nu9 d2nu9f2 F:153-168,228-235,275-286
2nu9 d2nu9b1 B:265-280,312-320,373-385
2nu9 d2nu9i1 I:265-280,312-320,373-385
2nua d2nuae1 E:265-280,312-320,373-385
2nu9 d2nu9e1 E:265-280,312-320,373-385
2nu8 d2nu8e1 E:265-280,312-320,373-385
2nu6 d2nu6e1 E:265-280,312-320,373-385
1jll d1jlle1 E:265-280,312-320,373-385
2fpp d2fppb1 B:272-287,319-327,380-393
1scu d1scua2 A:153-168,201-209,275-288
1cqj d1cqja2 A:153-168,228-235,275-286
1cqj d1cqjd2 D:153-168,228-235,275-286
1cqi d1cqia2 A:153-168,228-235,275-286
1cqi d1cqid2 D:153-168,228-235,275-286
2nua d2nuab1 B:265-280,312-320,373-386
1jll d1jllb1 B:265-280,312-320,373-386
2nu7 d2nu7a2 A:153-168,228-235,275-287
2nu6 d2nu6a2 A:153-168,228-235,275-287
2nu7 d2nu7d2 D:153-168,228-235,275-287
2nu6 d2nu6d2 D:153-168,228-235,275-287
2nua d2nuaa2 A:153-168,228-235,275-287
2nua d2nuad2 D:153-168,228-235,275-287
1jkj d1jkjb1 B:265-280,312-320,373-386
1scu d1scud2 D:153-168,201-209,278-288
2nu7 d2nu7b1 B:265-280,312-320,373-386
2nu8 d2nu8a2 A:153-168,228-235,275-287
1jll d1jlld2 D:153-168,228-235,275-287
2nu8 d2nu8b1 B:265-280,312-320,373-386
2nu6 d2nu6b1 B:265-280,312-320,373-386
2nu8 d2nu8d2 D:153-168,228-235,275-287
1jkj d1jkja2 A:153-168,228-235,275-287
1jll d1jlla2 A:153-168,228-235,275-287
1jkj d1jkjd2 D:153-168,228-235,275-287
1oi7 d1oi7a2 A:153-168,227-234,275-288
2fpi d2fpib1 B:272-287,319-327,380-393
2fp4 d2fp4b1 B:272-287,319-328,380-393
1euc d1eucb1 B:272-287,319-326,380-393
2csu d2csub2 B:158-173,204-211,275-289
2fpg d2fpgb1 B:272-287,319-328,380-393
1scu d1scue1 E:265-280,312-319,373-388
2csu d2csua2 A:158-173,204-211,275-289
1scu d1scua2 A:153-168,228-235,275-288
2scu d2scub1 B:265-280,343-351,373-385
1eud d1eudb1 B:272-287,319-327,380-393
2nu7 d2nu7e1 E:265-280,343-351,373-385
2nu6 d2nu6e1 E:265-280,343-351,373-385
2csu d2csub3 B:302-317,370-377,433-452
2nu8 d2nu8e1 E:265-280,343-351,373-385
1jll d1jlle1 E:265-280,343-351,373-385
2csu d2csua3 A:302-317,370-377,433-452
1cqj d1cqjb1 B:265-280,343-351,373-385
1jkj d1jkje1 E:265-280,343-351,373-385
1cqj d1cqje1 E:265-280,343-351,373-385
1scu d1scub1 B:265-280,312-320,373-388
2nu9 d2nu9g1 G:265-280,343-351,373-385
2nu9 d2nu9i1 I:265-280,343-351,373-385
2nu9 d2nu9e1 E:265-280,343-351,373-385
2nu9 d2nu9b1 B:265-280,343-351,373-385
2nua d2nuae1 E:265-280,343-351,373-385
2fpp d2fppb1 B:272-287,350-358,380-393
1jll d1jllb1 B:265-280,343-351,373-386
2nu6 d2nu6b1 B:265-280,343-351,373-386
2csu d2csub3 B:302-317,405-411,433-452
1jkj d1jkjb1 B:265-280,343-351,373-386
2nu7 d2nu7b1 B:265-280,343-351,373-386
2nu8 d2nu8b1 B:265-280,343-351,373-386
2nua d2nuab1 B:265-280,343-351,373-386
2csu d2csua3 A:302-317,404-411,433-452
2fp4 d2fp4b1 B:272-287,350-359,380-393
2csu d2csua2 A:158-173,176-182,275-289
1euc d1euca2 A:162-177,210-218,288-304
1eud d1euda2 A:162-177,210-218,288-304
2fp4 d2fp4a2 A:162-177,210-218,288-304
2fpi d2fpia2 A:162-177,210-218,288-304
2fpp d2fppa2 A:162-177,210-218,288-304
2fpg d2fpgb1 B:272-287,350-359,380-393
2fpg d2fpga2 A:162-177,210-218,288-304
2fpp d2fppa2 A:162-177,240-248,288-304
2fp4 d2fp4a2 A:162-177,240-248,288-304
2fpi d2fpia2 A:162-177,240-248,288-304
2fpg d2fpga2 A:162-177,240-248,288-304
1euc d1euca2 A:162-177,241-248,288-304
1eud d1euda2 A:162-177,241-248,288-304
1scu d1scub1 B:265-280,344-351,373-388
90. c.23.2 Toll/Interleukin receptor TIR domain
Flavodoxin-like 3 layers, a/b/a; parallel beta-sheet of 5 strand, order 21345
1o77 d1o77d_ D:651-666,697-704,767-784
1o77 d1o77a_ A:651-666,697-704,767-784
1o77 d1o77e_ E:651-667,697-704,767-784
1o77 d1o77a_ A:651-666,732-737,767-784
1o77 d1o77d_ D:651-666,732-737,767-784
1o77 d1o77e_ E:651-667,732-737,767-784
1o77 d1o77c_ C:657-666,731-737,767-784
1o77 d1o77c_ C:657-666,697-704,767-784
1fyw d1fywa_ A:648-663,732-737,767-784
1fyx d1fyxa_ A:648-663,732-737,767-784
1o77 d1o77b_ B:657-666,697-704,767-784
1fyv d1fyva_ A:654-663,691-698,761-778
1o77 d1o77c_ C:657-666,671-675,767-784
91. c.23.13 Type II 3-dehydroquinate dehydratase
Flavodoxin-like 3 layers, a/b/a; parallel beta-sheet of 5 strand, order 21345
1gu0 d1gu0k_ K:32-48,73-80,134-150
1gu0 d1gu0a_ A:32-48,73-80,134-150
1gu0 d1gu0d_ D:32-48,74-80,134-150
1gtz d1gtzk_ K:32-48,73-80,134-150
1gu1 d1gu1f_ F:32-48,73-81,134-150
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1j2y d1j2ya_ A:26-42,45-53,129-158
92. c.58.1 Aminoacid dehydrogenase-like, N-terminal domain
Aminoacid dehydrogenase-like, N-terminal domain core: 3 layers: a/b/a; parallel beta-sheet of 4 strands; 2134
1p77 d1p77a2 A:14-28,55-61,237-255
1p74 d1p74b2 B:14-28,56-61,237-255
1p74 d1p74a2 A:14-28,56-61,237-255
1vi2 d1vi2b2 B:20-34,61-67,254-272
1nyt d1nytb2 B:14-28,56-61,236-254
1nyt d1nyta2 A:14-28,56-61,236-254
1nyt d1nytd2 D:14-28,56-61,236-254
1npd d1npda2 A:20-34,61-67,254-272
1nyt d1nytc2 C:14-28,56-61,236-254
1o9b d1o9bb2 B:20-34,61-67,254-272
1vi2 d1vi2a2 A:20-34,61-67,254-272
1nvt d1nvtb2 B:24-38,65-71,251-269
1npd d1npdb2 B:20-34,61-67,254-272
1o9b d1o9ba2 A:20-34,61-67,254-272
1nvt d1nvta2 A:24-38,65-71,251-269
1npy d1npyc2 C:17-32,57-63,234-252
1npy d1npya2 A:17-32,57-63,234-252
1npy d1npyd2 D:17-32,57-63,234-252
1npd d1npda2 A:20-34,36-43,254-272
1p77 d1p77a2 A:14-28,31-37,237-255
1npy d1npyb2 B:17-32,57-64,234-252
1vi2 d1vi2b2 B:20-34,36-43,254-272
1p74 d1p74b2 B:14-28,30-37,237-255
1nvt d1nvtb2 B:24-38,40-47,251-269
1npd d1npdb2 B:20-34,36-43,254-272
1nyt d1nytd2 D:14-28,32-37,236-254
1o9b d1o9bb2 B:20-34,36-43,254-272
1p74 d1p74a2 A:14-28,30-37,237-255
1nvt d1nvta2 A:24-38,40-47,251-269
1vi2 d1vi2a2 A:20-34,36-43,254-272
1nyt d1nytc2 C:14-28,32-37,236-254
1o9b d1o9ba2 A:20-34,36-43,254-272
1npy d1npyc2 C:17-32,34-41,234-252
1npy d1npya2 A:17-32,34-41,234-252
1npy d1npyb2 B:17-32,34-41,234-252
1npy d1npyd2 D:17-32,34-41,234-252
1dib d1dibb2 B:1046-1064,1095-1100,1273-1296
1gq2 d1gq2l2 L:172-192,250-255,466-482
1gq2 d1gq2i2 I:172-192,250-255,466-482
1gq2 d1gq2b2 B:172-192,250-255,466-482
1gq2 d1gq2p2 P:172-192,250-255,466-482
1gq2 d1gq2d2 D:172-192,250-255,466-482
1dib d1diba2 A:46-64,65-73,270-296
1gq2 d1gq2j2 J:172-192,250-255,466-482
1gq2 d1gq2m2 M:172-192,250-255,466-482
1gq2 d1gq2o2 O:172-192,250-255,466-482
1gz3 d1gz3b2 B:172-192,250-255,466-482
1gq2 d1gq2k2 K:172-192,250-255,466-482
1gq2 d1gq2e2 E:172-192,250-255,466-482
1gz3 d1gz3d2 D:172-192,250-255,466-482
1gq2 d1gq2c2 C:172-192,250-255,466-482
1a4i d1a4ia2 A:46-64,65-73,270-296
1gz3 d1gz3c2 C:172-192,250-255,466-482
1gz3 d1gz3a2 A:172-192,250-255,466-482
1gq2 d1gq2a2 A:172-192,250-255,466-482
1dia d1diaa2 A:46-64,65-73,270-296
1gq2 d1gq2n2 N:172-192,250-255,466-482
1gq2 d1gq2h2 H:172-192,250-255,466-482
1dig d1diga2 A:46-64,65-73,270-296
1pj2 d1pj2a2 A:172-192,250-255,466-482
1gq2 d1gq2f2 F:172-192,250-255,466-482
1gq2 d1gq2g2 G:172-192,250-255,466-482
1llq d1llqa2 A:188-208,266-271,478-494
1pj2 d1pj2d2 D:3172-3192,3250-3255,3466-3482
1llq d1llqb2 B:188-208,266-271,478-494
1dib d1dibb2 B:1046-1064,1065-1073,1273-1296
1vl6 d1vl6c2 C:76-96,124-129,313-329
1efl d1efla2 A:172-192,250-255,466-482
1vl6 d1vl6a2 A:76-96,124-129,313-329
1pj2 d1pj2c2 C:2172-2192,2250-2255,2466-2482
1gz4 d1gz4c2 C:172-192,250-255,466-482
1pj3 d1pj3d2 D:3172-3192,3250-3255,3466-3482
1o0s d1o0sb2 B:188-208,266-271,478-494
1gz4 d1gz4d2 D:172-192,250-255,466-482
1pj3 d1pj3c2 C:2172-2192,2250-2255,2466-2482
1pj2 d1pj2b2 B:1172-1192,1250-1255,1466-1482
1pj3 d1pj3b2 B:1172-1192,1250-1255,1466-1482
1vl6 d1vl6d2 D:76-96,124-129,313-329
1o0s d1o0sa2 A:188-208,266-271,478-494
1vl6 d1vl6b2 B:76-96,124-129,313-329
1gz4 d1gz4a2 A:172-192,250-255,466-482
1gz4 d1gz4b2 B:172-192,250-255,466-482
1do8 d1do8a2 A:172-192,250-255,466-482
1pj4 d1pj4c2 C:2172-2192,2250-2255,2466-2482
1pj4 d1pj4a2 A:172-192,250-255,466-482
1pj3 d1pj3a2 A:172-192,250-255,466-482
1pj4 d1pj4d2 D:3172-3192,3250-3255,3466-3482
1pj4 d1pj4b2 B:1172-1192,1250-1255,1466-1482
1efl d1eflc2 C:172-192,250-255,466-482
2hae d2haeb2 B:76-96,124-129,313-329
1efl d1eflb2 B:172-192,250-255,466-482
2hae d2haea2 A:76-96,124-129,313-329
1efl d1efld2 D:172-192,250-255,466-482
2hae d2haed2 D:76-96,124-129,313-329
2hae d2haec2 C:76-96,124-129,313-329
1qr6 d1qr6a2 A:172-192,250-255,466-482
1efk d1efkc2 C:172-192,250-255,466-482
1pjl d1pjlb2 B:1172-1192,1250-1255,1466-1482
1efk d1efkb2 B:172-192,250-255,466-482
1efk d1efkd2 D:172-192,250-255,466-482
1qr6 d1qr6b2 B:1172-1192,1250-1255,1466-1482
1efk d1efka2 A:172-192,250-255,466-482
1pjl d1pjlg2 G:6172-6192,6250-6255,6466-6482
1pjl d1pjlc2 C:2172-2192,2250-2255,2466-2482
1a4i d1a4ib2 B:46-64,65-73,270-296
1pjl d1pjle2 E:4172-4192,4250-4255,4466-4482
1dia d1diab2 B:1046-1064,1065-1073,1270-1296
1pjl d1pjlf2 F:5172-5192,5250-5255,5466-5482
1dig d1digb2 B:1046-1064,1065-1073,1270-1296
1pjl d1pjla2 A:172-192,250-255,466-482
1pjl d1pjld2 D:3172-3192,3250-3255,3466-3482
1c1d d1c1da2 A:1-8,10-20,48-71
1pjl d1pjlh2 H:7172-7192,7250-7255,7466-7482
1bw9 d1bw9a2 A:1-8,10-20,48-71
1bxg d1bxga2 A:1-8,10-20,48-71
1leh d1lehb2 B:2-11,12-22,50-73
1c1x d1c1xa2 A:1-8,10-20,48-71
1leh d1leha2 A:2-11,12-22,50-73
1vl6 d1vl6a2 A:76-96,97-104,313-329
1vl6 d1vl6c2 C:76-96,97-104,313-329
1vl6 d1vl6d2 D:76-96,97-104,313-329
1vl6 d1vl6b2 B:76-96,97-104,313-329
2hae d2haeb2 B:76-96,97-104,313-329
2hae d2haea2 A:76-96,97-104,313-329
2hae d2haed2 D:76-96,97-104,313-329
2hae d2haec2 C:76-96,97-104,313-329
1edz d1edza2 A:47-65,66-73,294-319
2tmg d2tmge2 E:78-97,138-146,336-358
2tmg d2tmgd2 D:78-97,138-146,336-358
2tmg d2tmgb2 B:78-97,138-146,336-358
2tmg d2tmgc2 C:78-97,138-146,336-358
2tmg d2tmga2 A:78-97,138-146,336-358
1hwy d1hwyc2 C:100-119,162-170,369-391
1hwy d1hwya2 A:100-119,162-170,369-391
1hwy d1hwyb2 B:100-119,162-170,369-391
1hwy d1hwye2 E:100-119,162-170,369-391
1hwy d1hwyf2 F:100-119,162-170,369-391
1hwy d1hwyd2 D:100-119,162-170,369-391
2hae d2haec2 C:76-96,149-154,313-329
2tmg d2tmgf2 F:78-97,138-145,336-358
1ee9 d1ee9a2 A:47-65,66-73,295-319
1bxg d1bxgb2 B:401-408,410-420,448-471
1hwz d1hwze2 E:100-119,162-170,369-391
1hwz d1hwzb2 B:100-119,162-170,369-391
1hwz d1hwza2 A:100-119,162-170,369-391
1hwz d1hwzf2 F:100-119,162-170,369-391
1hwz d1hwzc2 C:100-119,162-170,369-391
1hwz d1hwzd2 D:100-119,162-170,369-391
1bw9 d1bw9b2 B:401-408,410-420,448-471
1c1x d1c1xb2 B:1-8,10-20,48-71
1c1d d1c1db2 B:1-8,10-20,48-71
1k89 d1k89a2 A:99-118,159-167,368-390
1bgv d1bgva2 A:99-118,159-167,368-390
1bxg d1bxga2 A:48-71,73-84,288-302
1aup d1aupa2 A:99-118,122-131,368-383
1bw9 d1bw9b2 B:448-471,475-484,688-702
1hwz d1hwzf2 F:100-119,122-131,369-391
1hwz d1hwza2 A:100-119,122-131,369-391
1hwz d1hwzb2 B:100-119,122-131,369-391
1hwz d1hwze2 E:100-119,122-131,369-391
1hwz d1hwzc2 C:100-119,122-131,369-391
1hwz d1hwzd2 D:100-119,122-131,369-391
93. c.15.1 BRCT domain
BRCT domain 3 layers, a/b/a; core: parallel beta-sheet of 4 strands, order 2134
1kzy d1kzyc2 C:1880-1896,1918-1922,1943-1954
1kzy d1kzyd2 D:1880-1896,1918-1922,1943-1954
1kzy d1kzyd1 D:1772-1784,1800-1806,1828-1838
1gzh d1gzhb1 B:1772-1784,1800-1806,1828-1838
1kzy d1kzyc1 C:1772-1784,1800-1806,1828-1838
1gzh d1gzhd1 D:1772-1784,1800-1806,1828-1838
1gzh d1gzhb2 B:1880-1896,1918-1923,1943-1954
1gzh d1gzhd2 D:1880-1896,1918-1923,1943-1954
1n5o d1n5ox2 X:1776-1788,1804-1811,1835-1845
2ing d2ingx2 X:1776-1788,1805-1811,1835-1845
1wf6 d1wf6a_ A:53-67,79-84,106-116
3coj d3cojf2 F:1776-1788,1804-1811,1835-1845
1t15 d1t15a2 A:1776-1788,1805-1811,1835-1845
1t29 d1t29a2 A:1776-1788,1804-1811,1835-1845
1y98 d1y98a2 A:1776-1788,1804-1811,1835-1845
3coj d3cojb2 B:1776-1788,1804-1811,1835-1845
3coj d3coja2 A:1776-1788,1804-1811,1835-1845
1t2u d1t2ua2 A:1776-1788,1805-1811,1835-1845
3coj d3cojg2 G:1776-1788,1805-1811,1835-1845
1jnx d1jnxx2 X:1776-1788,1805-1811,1835-1845
1oqa d1oqaa_ A:20-35,51-57,82-92
3coj d3cojx2 X:1776-1788,1804-1811,1835-1845
1t2v d1t2vb2 B:1776-1788,1804-1811,1835-1845
1t2v d1t2ve2 E:1776-1788,1804-1811,1835-1845
1t2v d1t2vc2 C:1776-1788,1805-1811,1835-1845
1t2v d1t2va2 A:1776-1788,1804-1811,1835-1845
3coj d3cojc2 C:1776-1788,1804-1811,1835-1845
3coj d3coje2 E:1776-1788,1804-1811,1835-1845
1t2v d1t2vd2 D:1776-1788,1804-1811,1835-1845
1in1 d1in1a_ A:864-876,889-893,905-916
3coj d3cojd2 D:1776-1788,1804-1811,1835-1845
1imo d1imoa_ A:864-876,889-893,905-916
2ing d2ingx1 X:1658-1673,1685-1690,1715-1726
1cdz d1cdza_ A:18-33,45-50,72-82
1l0b d1l0ba2 A:1721-1733,1751-1755,1780-1790
1l7b d1l7ba_ A:22-34,35-39,70-83
94. c.146.1 YgbK-like
YgbK-like consists of two domains with partial topological similarity to the P-loop kinases but without the P-loop motif; the domain association results in the formation of a single mixed beta-sheet of 15 strands
1yzy d1yzya1 A:7-22,75-80,219-232
1yzy d1yzyb1 B:7-22,75-80,219-232
1yzy d1yzya1 A:7-22,41-47,219-232
1yzy d1yzyb1 B:7-22,41-47,219-232
1yzy d1yzya1 A:7-22,214-219,219-232
1yzy d1yzyb1 B:7-22,214-219,219-232
1yzy d1yzya1 A:7-22,24-30,219-232
1yzy d1yzyb1 B:7-22,24-30,219-232
1yzy d1yzya1 A:255-269,347-353,402-412
1yzy d1yzya1 A:255-269,302-309,402-412
95. c.44.2 PTS system IIB component-like
Phosphotyrosine protein phosphatases I-like 3 layers: a/b/a; parallel beta-sheet of 4 strands, order 2134
2r48 d2r48a1 A:12-31,57-64,88-99
2r4q d2r4qa1 A:184-200,225-234,257-268
1vkr d1vkra_ A:386-406,425-430,454-471
2r48 d2r48a1 A:12-31,32-41,88-99
2r4q d2r4qa1 A:184-200,202-210,257-268
1vkr d1vkra_ A:386-406,425-430,430-442
1vkr d1vkra_ A:386-406,444-449,454-471
1h9c d1h9ca_ A:16-31,33-41,88-106
1iib d1iiba_ A:12-31,33-40,88-105
1iib d1iibb_ B:12-31,33-40,88-105
96. c.34.1 Homo-oligomeric flavin-containing Cys decarboxylases, HFCD
Homo-oligomeric flavin-containing Cys decarboxylases, HFCD 3 layers: a/b/a; parallel beta-sheet of 6 strands, order 321456
1mvn d1mvna_ A:29-47,98-106,185-199
1qzu d1qzub_ B:27-41,96-103,184-191
1e20 d1e20a_ A:29-47,98-106,185-200
1sbz d1sbza_ A:12-27,116-122,157-174
1sbz d1sbzc_ C:12-27,116-122,157-174
1mvl d1mvla_ A:29-47,98-106,185-200
1sbz d1sbzb_ B:12-27,116-122,157-174
1sbz d1sbzd_ D:12-27,116-122,157-174
1sbz d1sbzb_ B:12-27,78-85,157-174
1sbz d1sbza_ A:12-27,78-87,157-174
1sbz d1sbzc_ C:12-27,78-87,157-174
1sbz d1sbzd_ D:12-27,78-87,157-174
1g5q d1g5ql_ L:17-29,75-81,164-174
1g5q d1g5qg_ G:17-29,75-81,164-174
1g5q d1g5qd_ D:17-29,75-81,164-174
1g5q d1g5qa_ A:17-29,75-82,164-174
1g63 d1g63h_ H:12-26,75-81,164-174
1g63 d1g63a_ A:12-26,75-81,164-174
1qzu d1qzud_ D:27-41,96-101,184-191
1qzu d1qzua_ A:27-41,96-101,184-193
1qzu d1qzuc_ C:27-41,96-101,184-193
1p3y d1p3y1_ 1:23-32,83-89,172-185
1g63 d1g63e_ E:12-26,75-81,164-174
1g63 d1g63d_ D:12-26,75-81,164-174
1g63 d1g63l_ L:12-26,75-81,164-174
1g63 d1g63g_ G:12-26,75-81,164-174
1g63 d1g63i_ I:12-26,75-81,164-174
1g63 d1g63f_ F:12-26,75-81,164-174
1g63 d1g63b_ B:12-26,75-81,164-174
1g63 d1g63c_ C:12-26,75-81,164-174
1g63 d1g63k_ K:12-26,75-81,164-174
1g63 d1g63j_ J:12-26,75-80,164-174
97. c.72.3 CoaB-like combination of the Rossmann-like and Ribokinase-like topologies; mixed beta-sheet of 8 strands, order 32145678, strand 7 is antiparallel to the rest !
Ribokinase-like core: 3 layers: a/b/a; mixed beta-sheet of 8 strands, order 21345678, strand 7 is antiparallel to the rest ! potential superfamily: members of this fold have similar functions but different ATP-binding sites
1p9o d1p9oa_ A:63-77,172-181,290-307
1p9o d1p9ob_ B:63-77,172-181,290-307
1p9o d1p9ob_ B:63-77,225-231,290-307
1u7w d1u7wb_ B:214-228,269-277,384-405
1u80 d1u80b_ B:214-228,269-277,384-405
1u7z d1u7zb_ B:214-228,269-277,384-405
1u7z d1u7zc_ C:214-228,269-277,384-405
1u80 d1u80a_ A:214-228,269-277,384-405
1u7z d1u7za_ A:214-228,269-277,384-405
1u80 d1u80c_ C:214-228,269-277,384-405
1u7w d1u7wa_ A:214-228,269-277,384-405
1u7u d1u7ua_ A:214-228,269-277,384-405
1u7w d1u7wc_ C:214-228,269-277,384-405
1p9o d1p9ob_ B:63-77,253-259,290-307
1u7u d1u7ua_ A:214-228,322-328,384-405
1u7w d1u7wb_ B:214-228,322-329,384-405
1u7w d1u7wc_ C:214-228,322-330,384-405
1u7z d1u7zb_ B:214-228,322-331,384-405
1u80 d1u80b_ B:214-228,322-331,384-405
1u7z d1u7za_ A:214-228,322-331,384-405
1u80 d1u80c_ C:214-228,322-331,384-405
1u7w d1u7wa_ A:214-228,322-331,384-405
98. c.23.8 N5-CAIR mutase (phosphoribosylaminoimidazole carboxylase, PurE)
Flavodoxin-like 3 layers, a/b/a; parallel beta-sheet of 5 strand, order 21345
1d7a d1d7ab_ B:19-34,64-71,121-142
1d7a d1d7ac_ C:19-34,64-71,121-142
1d7a d1d7ab_ B:19-34,86-93,121-142
1d7a d1d7ac_ C:19-34,86-93,121-142
1u11 d1u11b_ B:33-48,78-85,134-156
1u11 d1u11a_ A:33-48,78-85,134-156
2fw1 d2fw1a1 A:33-48,78-85,134-156
2fwj d2fwjb1 B:33-48,78-85,134-156
2fw1 d2fw1b1 B:33-48,78-85,134-156
2fw1 d2fw1b1 B:33-48,101-107,134-156
1u11 d1u11b_ B:33-48,101-107,134-156
2fwj d2fwja1 A:33-48,78-85,134-156
1xmp d1xmpf_ F:18-29,81-88,115-137
1u11 d1u11a_ A:33-48,101-107,134-156
1xmp d1xmph_ H:18-29,81-88,115-137
1xmp d1xmpd_ D:18-29,81-88,115-137
2fwj d2fwjb1 B:33-48,101-107,134-156
2fwj d2fwja1 A:33-48,101-107,134-156
2fw1 d2fw1a1 A:33-48,101-107,134-156
1d7a d1d7al_ L:19-34,64-71,120-142
1d7a d1d7an_ N:19-34,64-71,120-142
1d7a d1d7am_ M:19-34,64-71,120-142
1d7a d1d7ao_ O:19-34,64-71,120-142
1qcz d1qcza_ A:19-34,64-71,120-142
1xmp d1xmpb_ B:14-29,82-88,115-137
1d7a d1d7aa_ A:19-34,64-71,120-142
1xmp d1xmpg_ G:14-29,82-88,115-137
1d7a d1d7ad_ D:19-34,64-71,120-142
1xmp d1xmpa_ A:14-29,81-88,115-137
1d7a d1d7al_ L:19-34,86-93,120-142
1d7a d1d7ao_ O:19-34,86-93,120-142
1xmp d1xmpe_ E:14-29,81-88,115-137
1d7a d1d7an_ N:19-34,86-93,120-142
1d7a d1d7aa_ A:19-34,86-93,120-142
1d7a d1d7am_ M:19-34,86-93,120-142
1d7a d1d7ad_ D:19-34,86-93,120-142
1xmp d1xmpf_ F:18-29,59-66,115-137
1xmp d1xmpd_ D:18-29,59-66,115-137
1xmp d1xmph_ H:18-29,59-66,115-137
1qcz d1qcza_ A:19-34,86-93,120-142
1xmp d1xmpc_ C:18-29,59-66,115-137
2ate d2atea1 A:19-34,86-93,120-142
1o4v d1o4va_ A:13-28,81-87,117-134
2ate d2atea1 A:19-34,64-71,120-142
1u11 d1u11a_ A:33-48,50-56,134-156
1xmp d1xmpd_ D:18-29,31-37,115-137
2fwj d2fwja1 A:33-48,50-56,134-156
1xmp d1xmph_ H:18-29,31-37,115-137
2fw1 d2fw1a1 A:33-48,50-56,134-156
1u11 d1u11b_ B:33-48,50-56,134-156
2fw1 d2fw1b1 B:33-48,50-56,134-156
1xmp d1xmpb_ B:14-29,59-66,115-137
1xmp d1xmpc_ C:18-29,31-37,115-137
1xmp d1xmpf_ F:18-29,31-37,115-137
2fwj d2fwjb1 B:33-48,50-56,134-156
1xmp d1xmpg_ G:14-29,59-66,115-137
1xmp d1xmpa_ A:14-29,59-66,115-137
1xmp d1xmpe_ E:14-29,59-66,115-137
1xmp d1xmpc_ C:18-29,82-88,115-137
1xmp d1xmpg_ G:14-29,31-37,115-137
1xmp d1xmpb_ B:14-29,31-37,115-137
1xmp d1xmpa_ A:14-29,31-37,115-137
1xmp d1xmpe_ E:14-29,31-37,115-137
1o4v d1o4va_ A:13-28,58-65,117-134
1o4v d1o4va_ A:13-28,30-36,117-134
99. c.61.1 PRTase-like
PRTase-like core: 3 layers, a/b/a; mixed beta-sheet of 6 strands, order 321456; strand 3 is antiparallel to the rest
1ibs d1ibsa1 A:17-29,56-63,293-308
1dku d1dkua1 A:17-29,56-64,293-308
1dku d1dkub1 B:17-29,56-64,293-308
1ibs d1ibsb1 B:17-29,56-63,293-308
1dkr d1dkrb1 B:17-29,56-64,293-308
1u9z d1u9zb1 B:9-21,48-56,275-284
1u9z d1u9za1 A:9-21,48-56,275-284
1u9z d1u9zd1 D:9-21,48-56,275-284
1u9z d1u9zc1 C:9-21,48-56,275-284
1u9y d1u9yc1 C:9-21,48-56,275-284
1u9y d1u9ya1 A:9-21,48-56,275-284
1u9y d1u9yb1 B:9-21,48-56,275-284
1u9y d1u9yd1 D:9-21,48-56,275-284
1dkr d1dkra1 A:17-29,55-64,293-308
1jls d1jlsa_ A:21-34,35-39,199-210
1jlr d1jlrc_ C:21-34,35-39,199-210
1jls d1jlsd_ D:21-34,35-39,199-210
1bd4 d1bd4c_ C:21-34,35-39,199-210
1jlr d1jlrb_ B:21-34,35-39,199-210
1jlr d1jlrd_ D:21-34,35-39,199-210
1bd4 d1bd4a_ A:21-34,35-39,199-210
1bd3 d1bd3c_ C:21-34,35-39,199-210
1upf d1upfc_ C:21-34,35-39,199-210
1upf d1upfa_ A:21-34,35-39,199-210
1jls d1jlsb_ B:21-34,35-39,199-210
1upu d1upuc_ C:21-34,35-39,199-210
1bd4 d1bd4d_ D:21-34,35-39,199-210
1upu d1upua_ A:21-34,35-39,199-210
1bd3 d1bd3a_ A:21-34,35-39,199-210
1u9z d1u9za1 A:9-21,79-87,275-284
1u9z d1u9zd1 D:9-21,79-87,275-284
1u9z d1u9zb1 B:9-21,79-87,275-284
1u9z d1u9zc1 C:9-21,79-87,275-284
1jlr d1jlra_ A:21-34,35-39,199-210
1u9y d1u9yc1 C:9-21,79-87,275-284
1u9y d1u9ya1 A:9-21,79-87,275-284
1u9y d1u9yb1 B:9-21,79-87,275-284
1u9y d1u9yd1 D:9-21,79-87,275-284
1upf d1upfd_ D:21-34,35-39,199-210
1jls d1jlsc_ C:21-34,35-39,199-210
1bd4 d1bd4b_ B:21-34,35-39,199-210
1upu d1upud_ D:21-34,35-39,199-210
1bd3 d1bd3d_ D:21-34,35-39,199-210
1upf d1upfb_ B:21-34,35-39,199-210
1bd3 d1bd3b_ B:21-34,35-39,199-210
1upu d1upub_ B:21-34,35-39,199-210
1p4a d1p4aa2 A:111-129,246-250,268-275
1dku d1dkua1 A:17-29,88-97,293-308
1dku d1dkub1 B:17-29,88-97,293-308
1dkr d1dkrb1 B:17-29,88-97,293-308
1dkr d1dkra1 A:17-29,88-97,293-308
1ibs d1ibsa1 A:17-29,88-95,293-308
1ibs d1ibsb1 B:17-29,88-95,293-308
1o57 d1o57a2 A:111-127,246-250,268-276
2c4k d2c4kd1 D:16-31,56-64,327-342
2c4k d2c4kf1 F:16-31,56-64,327-342
2c4k d2c4kb1 B:16-31,56-64,327-342
2c4k d2c4ka1 A:16-31,56-64,327-342
2c4k d2c4kc1 C:16-31,56-64,327-342
2c4k d2c4ke1 E:16-31,56-64,327-342
1p4a d1p4aa2 A:111-129,223-233,268-275
2c4k d2c4ka1 A:16-31,90-97,327-342
2c4k d2c4kd1 D:16-31,90-97,327-342
2c4k d2c4kf1 F:16-31,90-97,327-342
2c4k d2c4kb1 B:16-31,90-97,327-342
2c4k d2c4kc1 C:16-31,90-97,327-342
2c4k d2c4ke1 E:16-31,90-97,327-342
1o57 d1o57a2 A:111-127,223-233,268-276
100. c.115.1 Hypothetical protein MTH777 (MT0777)
Hypothetical protein MTH777 (MT0777) 3 layers: a/b/a; parallel beta-sheet of 6 strands, order 321456
1kjn d1kjna_ A:18-36,104-113,141-156
1kjn d1kjnb_ B:18-36,104-113,141-156
1kjn d1kjna_ A:18-36,80-87,141-156
101. c.23.6 Cobalamin (vitamin B12)-binding domain
Flavodoxin-like 3 layers, a/b/a; parallel beta-sheet of 5 strand, order 21345
1id8 d1id8a_ A:22-31,56-62,122-136
1k7y d1k7ya2 A:759-774,829-835,859-872
1k98 d1k98a2 A:759-774,828-835,859-872
1bmt d1bmta2 A:759-774,828-835,859-872
3bul d3bula2 A:759-774,828-835,859-872
3req d3reqb2 B:524-539,591-597,622-635
2req d2reqb2 B:524-539,591-597,622-635
1i9c d1i9ca_ A:16-31,56-63,122-135
1bmt d1bmtb2 B:759-774,828-835,859-872
1cb7 d1cb7c_ C:16-31,56-63,122-135
1i9c d1i9cc_ C:16-31,56-63,122-135
1ccw d1ccwc_ C:16-31,56-63,122-135
5req d5reqb2 B:524-539,591-597,622-635
4req d4reqd2 D:524-539,591-597,622-635
3req d3reqb2 B:524-539,563-569,622-635
1ccw d1ccwa_ A:16-31,56-63,122-135
5req d5reqd2 D:524-539,591-597,622-635
1e1c d1e1cd2 D:524-539,591-597,622-635
1cb7 d1cb7a_ A:16-31,56-63,122-135
1req d1reqb2 B:524-539,591-597,622-635
1e1c d1e1cb2 B:524-539,591-597,622-635
7req d7reqb2 B:524-539,591-597,622-635
6req d6reqb2 B:524-539,591-597,622-635
6req d6reqd2 D:524-539,591-597,622-635
4req d4reqb2 B:524-539,591-597,622-635
7req d7reqd2 D:524-539,591-597,622-635
3req d3reqb2 B:524-539,614-618,622-635
2req d2reqb2 B:524-539,614-618,622-635
5req d5reqb2 B:524-539,614-618,622-635
4req d4reqd2 D:524-539,614-618,622-635
5req d5reqd2 D:524-539,614-618,622-635
1req d1reqd2 D:524-539,591-597,622-635
7req d7reqd2 D:524-539,614-618,622-635
1req d1reqb2 B:524-539,614-618,622-635
4req d4reqb2 B:524-539,614-618,622-635
7req d7reqb2 B:524-539,614-618,622-635
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1xrs d1xrsb1 B:105-118,157-166,244-261
102. c.32.1 Tubulin nucleotide-binding domain-like
Tubulin nucleotide-binding domain-like 3 layers: a/b/a; parallel beta-sheet of 6 strands, order 321456
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2q1y d2q1yb1 B:17-31,94-100,190-201
103. c.51.3 B12-dependent dehydatase associated subunit
Anticodon-binding domain-like 3 layers: a/b/a; mixed beta-sheet of five strands, order 21345; strand 4 is antiparallel to the rest
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1uc4 d1uc4e_ E:83-99,100-108,161-178
1egm d1egmb_ B:83-99,100-108,161-178
1mmf d1mmfe_ E:50-66,67-75,128-145
1iwb d1iwbe_ E:83-99,100-108,161-178
1uc4 d1uc4b_ B:83-99,100-108,161-178
1dio d1diob_ B:83-99,100-108,161-178
1eex d1eexe_ E:83-99,100-109,161-178
1egv d1egve_ E:83-99,100-109,161-178
1egm d1egme_ E:83-99,100-109,161-178
1iwp d1iwpb_ B:50-66,67-76,128-145
1iwp d1iwpe_ E:50-66,67-76,128-145
104. d.204.1 Ribosome binding protein Y (YfiA homologue)
Ribosome binding protein Y (YfiA homologue) beta-alpha-beta(3)-alpha; 2 layers; mixed sheet 1234, strand 3 is antiparallel to the rest
2ywq d2ywqa1 A:14-29,36-45,75-95
2ywq d2ywqb1 B:14-33,36-45,75-95
2ywq d2ywqd1 D:14-33,36-45,75-95
2ywq d2ywqc1 C:14-29,36-46,75-95
1n3g d1n3ga_ A:13-30,33-45,69-91
1imu d1imua_ A:13-31,34-45,69-91
1l4s d1l4sa_ A:12-27,35-44,68-89
105. c.109.1 PEP carboxykinase N-terminal domain
PEP carboxykinase N-terminal domain contains mixed beta-sheets; topology is partly similar to that of the catalytic C-terminal domain
1j3b d1j3ba2 A:122-134,151-158,191-211
1xkv d1xkva2 A:122-134,151-158,191-211
1ii2 d1ii2b2 B:114-126,140-147,180-200
1ii2 d1ii2a2 A:114-126,140-147,180-200
1j3b d1j3bb2 B:122-134,151-158,191-211
2pc9 d2pc9a2 A:122-134,151-158,191-211
1xkv d1xkvb2 B:122-134,151-158,191-211
2pc9 d2pc9b2 B:122-134,151-158,191-211
2pc9 d2pc9d2 D:122-134,151-158,191-211
2pc9 d2pc9c2 C:122-134,151-158,191-211
2olq d2olqa2 A:141-153,166-173,207-227
2py7 d2py7x2 X:141-153,166-173,207-227
2pxz d2pxzx2 X:141-153,166-173,207-227
1k3d d1k3da2 A:141-153,166-173,207-227
1oen d1oena2 A:141-153,166-173,207-227
2olr d2olra2 A:141-153,166-173,207-227
1os1 d1os1a2 A:141-153,166-173,207-227
1k3c d1k3ca2 A:141-153,166-173,207-227
1aq2 d1aq2a2 A:141-153,166-173,207-227
1ayl d1ayla2 A:141-153,166-173,207-227
106. d.162.1 LDH C-terminal domain-like
LDH C-terminal domain-like unusual fold, defines family
1mld d1mlda2 A:10-23,70-76,223-244
1ie3 d1ie3c2 C:10-24,71-76,223-244
1ie3 d1ie3a2 A:10-24,71-76,223-244
1ib6 d1ib6c2 C:10-24,71-76,223-244
1ie3 d1ie3b2 B:10-24,71-76,223-244
1ib6 d1ib6d2 D:10-24,71-76,223-244
1ie3 d1ie3d2 D:10-24,71-76,223-244
2pwz d2pwze2 E:10-24,71-76,223-244
5ldh d5ldha2 A:30-44,92-97,242-264
1t2e d1t2ea2 A:164-181,186-190,209D-216
1ceq d1ceqa2 A:164-181,186-190,209D-216
1t2d d1t2da2 A:150-167,172-176,198-206
1xiv d1xiva2 A:164-181,186-190,209D-216
1t24 d1t24a2 A:164-181,186-190,209D-216
2a94 d2a94a2 A:164-181,186-190,209D-216
1cet d1ceta2 A:164-181,186-190,209D-216
1ldg d1ldga2 A:164-181,186-190,209D-216
1u4o d1u4oa2 A:164-181,186-190,209D-216
1u5a d1u5aa2 A:164-181,186-190,209D-216
1u4s d1u4sa2 A:164-181,186-190,209D-216
107. c.52.1 Restriction endonuclease-like
Restriction endonuclease-like core: 3 layers, a/b/a; mixed beta-sheet of 5 strands, order 12345; strands 2 &, in some families, 5 are antiparallel to the rest
1vsr d1vsra_ A:25-36,109-115,126-141
1vsr d1vsra_ A:25-36,57-64,126-141
2a1i d2a1ia1 A:110-117,135-142,201-216
1odg d1odga_ A:23-36,109-116,126-141
2bhn d2bhna2 A:30-40,58-65,132-149
1qc9 d1qc9b_ B:34-51,102-115,247-267
1qc9 d1qc9a_ A:34-51,102-115,247-267
1qc9 d1qc9c_ C:34-51,102-115,247-267
1xmx d1xmxa_ A:248-268,300-309,368-381
2bgw d2bgwb2 B:30-40,58-65,132-148
2bhn d2bhnd2 D:30-40,58-65,132-149
1xmx d1xmxa_ A:248-268,334-342,368-381
1odg d1odga_ A:23-36,57-65,126-141
1cw0 d1cw0a_ A:22-36,109-115,126-141
1cl8 d1cl8a_ A:34-51,102-115,247-267
1ckq d1ckqa_ A:34-51,102-115,247-267
2jnw d2jnwa1 A:110-117,135-142,201-214
2bhn d2bhnc2 C:30-40,58-66,132-147
1qps d1qpsa_ A:34-51,102-115,247-271
1qrh d1qrha_ A:34-51,102-115,247-271
2bhn d2bhna2 A:30-40,41-46,132-149
1eri d1eria_ A:34-51,102-115,247-271
1qri d1qria_ A:34-51,102-115,247-271
1j23 d1j23a_ A:16-26,44-51,117-135
1j22 d1j22a_ A:16-26,44-51,117-135
1j24 d1j24a_ A:16-26,44-51,117-136
1na6 d1na6a2 A:268-282,318-326,388-398
2bgw d2bgwa2 A:30-40,58-65,132-149
1qri d1qria_ A:34-51,54-59,247-271
1j25 d1j25a_ A:16-26,44-51,117-136
2bhn d2bhnb2 B:30-40,41-46,132-149
2bgw d2bgwb2 B:30-40,41-47,132-148
2bhn d2bhnd2 D:30-40,41-47,132-149
2bgw d2bgwa2 A:30-40,41-47,132-149
2a1i d2a1ia1 A:110-117,165-173,201-216
1cw0 d1cw0a_ A:22-36,57-64,126-141
1cfr d1cfra_ A:58-86,88-94,271-283
1j23 d1j23a_ A:16-26,27-33,117-135
1fiu d1fiuc_ C:61-85,178-189,276-286
1fiu d1fiud_ D:61-85,178-189,276-286
1fiu d1fiua_ A:61-85,178-189,276-286
1j22 d1j22a_ A:16-26,27-33,117-135
1fiu d1fiub_ B:61-85,178-189,276-286
1knv d1knvb_ B:67-95,98-104,279-292
1j24 d1j24a_ A:16-26,27-33,117-136
1j25 d1j25a_ A:16-26,27-33,117-136
2jnw d2jnwa1 A:110-117,165-173,201-214
2jnw d2jnwa1 A:110-117,120-124,201-214
1knv d1knva_ A:67-95,98-104,279-293
1xmx d1xmxa_ A:248-268,269-276,368-381
2fok d2fokb4 B:420-437,542-547,547-561
1xmx d1xmxa_ A:248-268,358-363,368-381
1knv d1knva_ A:67-95,190-200,279-293
1na6 d1na6b2 B:268-282,343-350,388-401
2a1i d2a1ia1 A:110-117,120-124,201-216
1fok d1foka4 A:420-437,542-547,547-561
1knv d1knvb_ B:67-95,190-200,279-292
1na6 d1na6b2 B:268-282,319-326,388-401
1cfr d1cfra_ A:58-86,182-191,271-283
1knv d1knva_ A:67-95,234-242,279-293
1na6 d1na6a2 A:268-282,345-350,388-398
2fok d2fokb4 B:420-437,514-521,547-561
2fok d2foka4 A:420-437,514-521,547-561
1fok d1foka4 A:420-437,514-521,547-561
1cfr d1cfra_ A:58-86,227-234,271-283
1fiu d1fiud_ D:61-85,239-244,276-286
1ob8 d1ob8a_ A:6-21,80-92,116-129
1qc9 d1qc9c_ C:34-51,164-171,247-267
1qc9 d1qc9a_ A:34-51,164-171,247-267
1qc9 d1qc9b_ B:34-51,164-171,247-267
1fiu d1fiub_ B:61-85,239-244,276-286
1ckq d1ckqa_ A:34-51,164-171,247-267
1cl8 d1cl8a_ A:34-51,164-171,247-267
1qrh d1qrha_ A:34-51,164-171,247-271
1qps d1qpsa_ A:34-51,164-171,247-271
1qri d1qria_ A:34-51,164-171,247-271
1eri d1eria_ A:34-51,164-171,247-271
1ob8 d1ob8b_ B:6-21,80-92,116-131
1cfr d1cfra_ A:58-86,264-269,271-283
1wte d1wteb_ B:51-86,156-164,199-209
1wte d1wtea_ A:51-86,156-164,199-209
1wte d1wteb_ B:51-86,118-128,199-209
1wtd d1wtda_ A:51-86,118-127,199-209
1wte d1wtea_ A:51-86,118-128,199-209
1wtd d1wtdb_ B:51-86,118-129,199-209
1dc1 d1dc1b_ B:109-154,275-282,309-323
1dc1 d1dc1a_ A:109-154,275-282,309-323
1dc1 d1dc1b_ B:109-154,302-306,309-323
1dc1 d1dc1a_ A:109-154,302-306,309-323
1dc1 d1dc1a_ A:109-154,193-201,309-323
1dc1 d1dc1b_ B:109-154,193-201,309-323
108. c.1.6 PLP-binding barrel circular permutation of the canonical fold: begins with an alpha helix and ends with a beta-strand !
TIM beta/alpha-barrel contains parallel beta-sheet barrel, closed; n=8, S=8; strand order 12345678 ! the first seven superfamilies have similar phosphate-binding sites
2sfp d2sfpa2 A:14-29,32-39,203-211
1epv d1epvb2 B:14-29,32-39,203-211
1sft d1sftb2 B:14-29,32-39,203-211
1ftx d1ftxb2 B:14-29,32-39,203-211
1niu d1niub2 B:14-29,32-39,203-211
1l6g d1l6gb2 B:14-29,32-39,203-211
1l6g d1l6ga2 A:14-29,32-39,203-211
1l6f d1l6fb2 B:14-29,32-39,203-211
1sft d1sfta2 A:14-29,32-39,203-211
1epv d1epva2 A:14-29,32-39,203-211
1bd0 d1bd0b2 B:14-29,32-39,203-211
1ftx d1ftxa2 A:14-29,32-39,203-211
1l6f d1l6fa2 A:14-29,32-39,203-211
1bd0 d1bd0a2 A:14-29,32-39,203-211
1niu d1niua2 A:14-29,32-39,203-211
1vfh d1vfha2 A:14-29,31-38,208-216
2sfp d2sfpb2 B:14-29,32-39,203-211
1vft d1vfta2 A:14-29,31-37,208-216
1vfs d1vfsb2 B:1014-1029,1031-1037,1208-1216
1vfs d1vfsa2 A:14-29,31-38,208-216
1vft d1vftb2 B:1014-1029,1031-1037,1208-1216
1rcq d1rcqa2 A:10-25,26-33,192-200
1ct5 d1ct5a_ A:8-33,42-48,226-234
1b54 d1b54a_ A:8-33,42-48,226-234
1ct5 d1ct5a_ A:8-33,218-224,226-234
1b54 d1b54a_ A:8-33,218-224,226-234
1twi d1twib2 B:51-66,75-80,277-297
1twi d1twid2 D:51-66,75-80,277-297
1hkv d1hkvb2 B:47-62,66-71,271-291
109. c.132.1 Bacterial fluorinating enzyme, N-terminal domain
Bacterial fluorinating enzyme, N-terminal domain 3 layers: a/b/a; mixed beta-sheet of 6 strands; order: 213546, strand 5 is antiparallel to the rest; topological similarity to the MogA-like family fold
2c5h d2c5ha2 A:21-36,38-46,156-172
2cbx d2cbxc2 C:21-36,38-46,156-172
2v7x d2v7xb2 B:21-36,38-46,156-172
2v7w d2v7wc2 C:21-36,38-46,156-172
2v7x d2v7xc2 C:21-36,38-46,156-172
2c4u d2c4ud2 D:21-36,38-46,156-172
2c5b d2c5bc2 C:21-36,38-46,156-172
1rqr d1rqrc2 C:21-36,38-46,156-172
2v7w d2v7wb2 B:21-36,38-46,156-172
2c2w d2c2wc2 C:21-36,38-46,156-172
2cc2 d2cc2a2 A:21-36,38-46,156-172
2v7w d2v7wa2 A:21-36,38-46,156-172
2v7u d2v7ua2 A:21-36,38-46,156-172
2v7t d2v7ta2 A:21-36,38-46,156-172
2cc2 d2cc2c2 C:21-36,38-46,156-172
2cbx d2cbxa2 A:21-36,37-46,156-172
2c4u d2c4ue2 E:21-36,38-46,156-172
2c4u d2c4uf2 F:21-36,38-46,156-172
2v7x d2v7xa2 A:21-36,37-46,156-172
2v7v d2v7vb2 B:21-36,38-46,156-172
2v7u d2v7ub2 B:21-36,38-46,156-172
2v7t d2v7tc2 C:21-36,38-46,156-172
2c4u d2c4ua2 A:21-36,38-46,156-172
2c5h d2c5hc2 C:21-36,37-46,156-172
2c5h d2c5hb2 B:21-36,37-46,156-172
2v7t d2v7tb2 B:21-36,38-46,156-172
1rqp d1rqpc2 C:21-36,38-46,156-172
2c4u d2c4uc2 C:21-36,38-46,156-172
2c4u d2c4ub2 B:21-36,38-46,156-172
2c4t d2c4tb2 B:21-36,37-46,156-172
2cbx d2cbxb2 B:21-36,37-46,156-172
2c2w d2c2wa2 A:21-36,37-46,156-172
1rqr d1rqrb2 B:21-36,37-46,156-172
2c5b d2c5ba2 A:21-36,37-46,156-172
2v7v d2v7va2 A:21-36,37-46,156-172
2c4t d2c4tc2 C:21-36,37-46,156-172
2cc2 d2cc2b2 B:21-36,37-46,156-172
2v7v d2v7vc2 C:21-36,37-46,156-172
2c2w d2c2wb2 B:21-36,37-46,156-172
1rqp d1rqpa2 A:21-36,37-46,156-172
2c4t d2c4ta2 A:21-36,37-46,156-172
1rqp d1rqpb2 B:21-36,37-46,156-172
2v7u d2v7uc2 C:21-36,37-46,156-172
2c5b d2c5bb2 B:21-36,37-46,156-172
1rqr d1rqra2 A:21-36,37-46,156-172
2c5h d2c5hb2 B:21-36,69-76,156-172
2v7x d2v7xc2 C:21-36,69-76,156-172
2c5h d2c5hc2 C:21-36,69-76,156-172
2c4u d2c4ud2 D:21-36,69-76,156-172
2cbx d2cbxc2 C:21-36,69-76,156-172
2cbx d2cbxb2 B:21-36,69-76,156-172
2c5b d2c5bc2 C:21-36,69-76,156-172
2v7w d2v7wb2 B:21-36,69-76,156-172
2cbx d2cbxa2 A:21-36,69-76,156-172
2v7x d2v7xb2 B:21-36,69-76,156-172
2c4u d2c4uc2 C:21-36,69-76,156-172
2c5h d2c5ha2 A:21-36,69-76,156-172
2v7w d2v7wc2 C:21-36,69-76,156-172
2c2w d2c2wc2 C:21-36,69-76,156-172
2v7x d2v7xa2 A:21-36,69-76,156-172
2c5b d2c5ba2 A:21-36,69-76,156-172
2v7v d2v7vb2 B:21-36,69-76,156-172
2c2w d2c2wb2 B:21-36,69-76,156-172
2v7w d2v7wa2 A:21-36,69-76,156-172
2c2w d2c2wa2 A:21-36,69-76,156-172
2v7v d2v7va2 A:21-36,69-76,156-172
2c4u d2c4uf2 F:21-36,69-76,156-172
2v7v d2v7vc2 C:21-36,69-76,156-172
2cc2 d2cc2c2 C:21-36,69-76,156-172
2cc2 d2cc2a2 A:21-36,69-76,156-172
2c4t d2c4tb2 B:21-36,69-76,156-172
2c4u d2c4ua2 A:21-36,69-76,156-172
2cc2 d2cc2b2 B:21-36,69-76,156-172
1rqr d1rqrc2 C:21-36,69-76,156-172
2c4u d2c4ue2 E:21-36,69-76,156-172
2c5b d2c5bb2 B:21-36,69-76,156-172
2c4u d2c4ub2 B:21-36,69-76,156-172
2c4t d2c4tc2 C:21-36,69-76,156-172
1rqp d1rqpb2 B:21-36,69-76,156-172
1rqp d1rqpc2 C:21-36,69-76,156-172
2c4t d2c4ta2 A:21-36,69-76,156-172
1rqr d1rqrb2 B:21-36,69-76,156-172
2v7u d2v7ua2 A:21-36,69-76,156-172
2v7t d2v7ta2 A:21-36,69-76,156-172
2v7u d2v7ub2 B:21-36,69-76,156-172
2v7u d2v7uc2 C:21-36,69-76,156-172
2v7t d2v7tc2 C:21-36,69-76,156-172
1rqr d1rqra2 A:21-36,69-76,156-172
1rqp d1rqpa2 A:21-36,69-76,156-172
2v7t d2v7tb2 B:21-36,69-76,156-172
110. c.56.7 AF0625-like contains extra C-terminal alpha/beta domain: 3 layers, a/b/a; parallel beta-sheet of 4 strands, order 2134 !
Phosphorylase/hydrolase-like core: 3 layers, a/b/a ; mixed sheet of 5 strands: order 21354; strand 4 is antiparallel to the rest; contains crossover loops
1yqe d1yqea1 A:10-25,68-77,162-179
1yqe d1yqea1 A:196-206,237-242,267-276
2gfq d2gfqb1 B:10-25,71-81,164-182
2gfq d2gfqc1 C:10-25,72-81,164-182
2gfq d2gfqa1 A:10-25,72-81,164-182
1yqe d1yqea1 A:10-25,41-48,162-179
1yqe d1yqea1 A:196-206,207-216,267-276
1yqe d1yqea1 A:10-25,147-155,162-179
2gfq d2gfqc1 C:10-25,43-50,164-182
2gfq d2gfqb1 B:10-25,149-157,164-182
2gfq d2gfqc1 C:10-25,149-157,164-182
2gfq d2gfqa1 A:10-25,149-157,164-182
2gfq d2gfqb1 B:10-25,43-51,164-182
2gfq d2gfqa1 A:10-25,43-51,164-182
111. c.1.16 Bacterial luciferase-like consists of clearly related families of somewhat different folds !
TIM beta/alpha-barrel contains parallel beta-sheet barrel, closed; n=8, S=8; strand order 12345678 ! the first seven superfamilies have similar phosphate-binding sites
1m41 d1m41a_ A:27-42,44-48,332-345
1nqk d1nqka_ A:28-43,45-49,333-346
1luc d1lucb_ B:16-35,36-42,304-320
1m41 d1m41b_ B:1027-1042,1044-1049,1332-1345
1rhc d1rhca_ A:15-30,303-311,313-325
1fvp d1fvpb_ B:137-153,172-176,176-192
1bsl d1bslb_ B:16-35,36-42,304-324
1yw1 d1yw1a1 A:35-50,384-389,392-411
1f07 d1f07a_ A:212-221,274-278,278-293
1f07 d1f07c_ C:2212-2221,2274-2278,2278-2293
1bsl d1bsla_ A:16-35,36-42,304-323
1f07 d1f07b_ B:1212-1221,1274-1278,1278-1293
1tvl d1tvla_ A:35-50,384-389,392-411
1f07 d1f07d_ D:3212-3221,3274-3278,3278-3293
1luc d1lucb_ B:16-35,293-299,304-320
1brl d1brld_ D:16-35,293-299,304-319
1brl d1brlb_ B:16-35,293-299,304-319
1ezw d1ezwa_ A:15-30,320-325,331-343
1f07 d1f07c_ C:2012-2027,2295-2300,2306-2321
1f07 d1f07b_ B:1012-1027,1295-1300,1306-1321
1xkj d1xkjb_ B:16-35,36-42,304-324
1f07 d1f07a_ A:12-27,295-300,306-321
1f07 d1f07d_ D:3012-3027,3295-3300,3306-3321
1bsl d1bsla_ A:16-35,293-299,304-323
1bsl d1bslb_ B:16-35,293-299,304-324
1xkj d1xkjb_ B:16-35,293-299,304-324
1xkj d1xkja_ A:16-35,293-299,304-324
1fvp d1fvpa_ A:20-40,194-201,206-229
1fvp d1fvpb_ B:20-39,194-201,206-229
1nfp d1nfpa_ A:20-39,191-198,203-226
112. b.43.2 FucI/AraA C-terminal domain-like
Reductase/isomerase/elongation factor common domain barrel, closed; n=6, S=10; greek-key
2hxg d2hxgc1 C:434-446,472-477,481-498
2hxg d2hxgb1 B:434-446,472-477,481-498
2ajt d2ajtc1 C:434-446,471-477,481-498
2ajt d2ajtb1 B:434-446,471-477,481-498
2ajt d2ajta1 A:434-446,471-477,481-498
2hxg d2hxga1 A:434-446,471-477,481-498
113. d.135.1 The spindle assembly checkpoint protein mad2 N- and C-termini undergo large conformational rearrangement upon ligand binding !
The spindle assembly checkpoint protein mad2 core: alpha(2)-beta(2)-alpha-beta; mixed sheet: order 213
1duj d1duja_ A:18-38,97-108,123-145
1go4 d1go4b_ B:12-36,93-107,120-142
2v64 d2v64c1 C:12-36,93-107,120-142
2v64 d2v64f1 F:12-36,93-107,120-142
2v64 d2v64a1 A:12-36,93-107,120-142
1go4 d1go4c_ C:12-36,93-107,120-142
1go4 d1go4a_ A:12-36,93-107,120-142
1s2h d1s2ha_ A:10-36,93-107,119-143
1klq d1klqa_ A:13-38,97-109,122-145
1go4 d1go4d_ D:12-36,93-107,120-143
114. c.70.1 Nucleoside hydrolase
Nucleoside hydrolase core: 3 layers, a/b/a ; mixed beta-sheet of 8 strands, order 32145687; strand 7 is antiparallel to the rest
1ezr d1ezrb_ B:12-26,119-126,242-251
1ezr d1ezra_ A:12-26,119-126,242-251
1ezr d1ezrd_ D:12-26,119-126,242-251
1ezr d1ezrc_ C:12-26,119-126,242-251
1hp0 d1hp0b_ B:12-26,158-167,259-271
1kie d1kiea_ A:12-26,158-167,259-271
1mas d1masb_ B:12-26,147-155,240-252
1kic d1kicb_ B:12-26,158-167,259-271
2mas d2masa_ A:12-26,147-155,240-252
2mas d2masb_ B:12-26,147-155,240-252
2mas d2masd_ D:12-26,147-155,240-252
2mas d2masc_ C:12-26,147-155,240-252
1kic d1kicb_ B:12-26,29-37,259-271
1hoz d1hozb_ B:12-26,158-167,259-271
2ff1 d2ff1b1 B:12-26,158-167,259-271
1kic d1kica_ A:12-26,158-167,259-271
1kie d1kieb_ B:12-26,158-167,259-271
1mas d1masa_ A:12-26,147-155,240-252
1kie d1kieb_ B:12-26,29-37,259-271
1hoz d1hoza_ A:12-26,158-167,259-271
1r4f d1r4fb_ B:12-26,158-167,259-271
1hp0 d1hp0a_ A:12-26,158-167,259-271
2ff1 d2ff1a1 A:12-26,158-167,259-271
2ff2 d2ff2a1 A:12-26,158-167,259-271
1hp0 d1hp0a_ A:12-26,132-137,259-271
2ff2 d2ff2b1 B:12-26,28-37,259-271
1hp0 d1hp0b_ B:12-26,132-137,259-271
2ff1 d2ff1b1 B:12-26,132-137,259-271
1r4f d1r4fb_ B:12-26,132-137,259-271
1kic d1kicb_ B:12-26,132-137,259-271
1hp0 d1hp0b_ B:12-26,28-37,259-271
3b9x d3b9xc1 C:13-26,145-153,238-250
3b9x d3b9xd1 D:13-26,119-124,241-250
1r4f d1r4fa_ A:12-26,28-37,259-271
1hoz d1hoza_ A:12-26,132-137,259-271
1r4f d1r4fb_ B:12-26,28-37,259-271
1kic d1kica_ A:12-26,28-37,259-271
2ff2 d2ff2b1 B:12-26,159-167,259-271
1hoz d1hozb_ B:12-26,28-37,259-271
1hp0 d1hp0a_ A:12-26,28-37,259-271
2ff1 d2ff1a1 A:12-26,132-137,259-271
2ff1 d2ff1a1 A:12-26,28-37,259-271
1kic d1kica_ A:12-26,132-137,259-271
1q8f d1q8fb_ B:13-26,145-153,238-250
1kie d1kiea_ A:12-26,28-37,259-271
1r4f d1r4fa_ A:12-26,159-167,259-271
3b9x d3b9xa1 A:13-26,145-153,238-250
2ff2 d2ff2a1 A:12-26,132-137,259-271
1hoz d1hoza_ A:12-26,28-37,259-271
2ff2 d2ff2a1 A:12-26,28-37,259-271
1q8f d1q8fd_ D:13-26,145-153,238-250
2ff1 d2ff1b1 B:12-26,28-37,259-271
1hoz d1hozb_ B:12-26,132-137,259-271
1q8f d1q8fa_ A:13-26,145-153,238-250
1kie d1kieb_ B:12-26,132-137,259-271
1q8f d1q8fc_ C:13-26,145-153,238-250
1kie d1kiea_ A:12-26,132-137,259-271
1q8f d1q8fd_ D:13-26,29-38,238-250
3b9x d3b9xc1 C:13-26,29-38,238-250
1r4f d1r4fa_ A:12-26,131-137,259-271
3b9x d3b9xd1 D:13-26,29-38,241-250
1q8f d1q8fa_ A:13-26,29-38,238-250
1q8f d1q8fb_ B:13-26,29-38,238-250
3b9x d3b9xa1 A:13-26,29-38,238-250
1q8f d1q8fc_ C:13-26,29-38,238-250
3b9x d3b9xb1 B:13-26,29-38,241-250
1ezr d1ezrd_ D:12-26,28-37,242-251
1mas d1masa_ A:12-26,28-37,240-252
1ezr d1ezrb_ B:12-26,28-37,242-251
1ezr d1ezra_ A:12-26,28-37,242-251
1ezr d1ezrc_ C:12-26,28-37,242-251
2ff2 d2ff2b1 B:12-26,131-137,259-271
2mas d2masd_ D:12-26,28-37,240-252
2mas d2masa_ A:12-26,28-37,240-252
2mas d2masb_ B:12-26,28-37,240-252
2mas d2masc_ C:12-26,28-37,240-252
1mas d1masb_ B:12-26,119-126,240-252
1mas d1masb_ B:12-26,28-37,240-252
3b9x d3b9xc1 C:13-26,119-124,238-250
3b9x d3b9xa1 A:13-26,119-124,238-250
3b9x d3b9xb1 B:13-26,117-124,241-250
2mas d2masb_ B:12-26,118-126,240-252
2mas d2masa_ A:12-26,118-126,240-252
2mas d2masd_ D:12-26,118-126,240-252
1mas d1masa_ A:12-26,118-126,240-252
2mas d2masc_ C:12-26,118-126,240-252
1q8f d1q8fd_ D:13-26,117-124,238-250
1q8f d1q8fa_ A:13-26,117-124,238-250
1q8f d1q8fc_ C:13-26,117-124,238-250
1q8f d1q8fb_ B:13-26,117-124,238-250
115. c.16.1 Lumazine synthase
Lumazine synthase 3 layers, a/b/a; core: parallel beta-sheet of 4 strands, order 2134
1kz1 d1kz1c_ C:28-48,79-89,126-135
1c41 d1c41h_ H:26-45,112-122,159-168
1kz1 d1kz1a_ A:28-48,79-89,126-135
1c41 d1c41e_ E:26-45,112-122,159-168
1c41 d1c41a_ A:26-45,112-122,159-168
1c41 d1c41j_ J:26-45,112-122,159-168
1c41 d1c41d_ D:26-45,112-122,159-168
1c41 d1c41c_ C:26-45,112-122,159-168
1kz1 d1kz1d_ D:28-48,79-89,126-135
1kz1 d1kz1e_ E:28-48,79-89,126-135
1c41 d1c41i_ I:26-45,112-122,159-168
1kz1 d1kz1b_ B:28-48,79-89,126-135
1ejb d1ejbc_ C:27-46,82-92,129-138
1c41 d1c41g_ G:26-45,112-122,159-168
1c41 d1c41f_ F:26-45,112-122,159-168
1ejb d1ejbe_ E:27-46,82-92,129-138
1ejb d1ejba_ A:27-46,82-92,129-138
1ejb d1ejbb_ B:27-46,82-92,129-138
1c41 d1c41b_ B:26-45,112-122,159-168
1ejb d1ejbd_ D:27-46,82-92,129-138
1kz6 d1kz6c_ C:28-48,79-89,126-135
1kz6 d1kz6a_ A:28-48,79-89,126-135
1kyx d1kyxa_ A:28-48,79-89,126-135
1kz4 d1kz4a_ A:28-48,79-89,126-135
1kz9 d1kz9a_ A:28-48,79-89,126-135
1kz4 d1kz4c_ C:28-48,79-89,126-135
1kyx d1kyxd_ D:28-48,79-89,126-135
1kyx d1kyxc_ C:28-48,79-89,126-135
1kz6 d1kz6d_ D:28-48,79-89,126-135
1kyv d1kyvd_ D:28-48,79-89,126-135
1kz9 d1kz9c_ C:28-48,79-89,126-135
1kyv d1kyvc_ C:28-48,79-89,126-135
1kyx d1kyxe_ E:28-48,79-89,126-135
1kz4 d1kz4d_ D:28-48,79-89,126-135
1kyv d1kyva_ A:28-48,79-89,126-135
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1rvv d1rvvr_ R:23-42,73-83,134-154
1rvv d1rvvi_ I:23-42,73-83,134-154
1rvv d1rvvc_ C:23-42,73-83,134-154
1rvv d1rvvx_ X:23-42,73-83,134-154
1rvv d1rvvz_ Z:23-42,73-83,134-154
1rvv d1rvvm_ M:23-42,73-83,134-154
1rvv d1rvvl_ L:23-42,73-83,134-154
1rvv d1rvva_ A:23-42,73-83,134-154
1rvv d1rvvk_ K:23-42,73-83,134-154
1rvv d1rvvy_ Y:23-42,73-83,134-154
1c41 d1c41c_ C:26-45,149-158,175-197
1c41 d1c41a_ A:26-45,149-158,175-197
1c41 d1c41f_ F:26-45,149-158,175-197
1c41 d1c41i_ I:26-45,149-158,175-197
1c41 d1c41h_ H:26-45,149-158,175-197
1c41 d1c41e_ E:26-45,149-158,175-197
1c41 d1c41j_ J:26-45,149-158,175-197
1c41 d1c41d_ D:26-45,149-158,175-197
1c41 d1c41b_ B:26-45,149-158,175-197
1c41 d1c41g_ G:26-45,149-158,175-197
1zis d1zish1 H:23-42,73-83,134-154
1zis d1zisd1 D:23-42,73-83,134-154
1zis d1zisj1 J:23-42,73-83,134-154
1zis d1zisi1 I:23-42,73-83,134-154
1zis d1zisb1 B:23-42,73-83,134-154
1zis d1zise1 E:23-42,73-83,134-154
1zis d1zisg1 G:23-42,73-83,134-154
1zis d1zisc1 C:23-42,73-83,134-154
1zis d1zisf1 F:23-42,73-83,134-154
1zis d1zisa1 A:23-42,73-83,134-154
1c41 d1c41i_ I:26-45,112-122,175-197
1c41 d1c41h_ H:26-45,112-122,175-197
1c41 d1c41a_ A:26-45,112-122,175-197
1c41 d1c41f_ F:26-45,112-122,175-197
1c41 d1c41c_ C:26-45,112-122,175-197
1c41 d1c41j_ J:26-45,112-122,175-197
1c41 d1c41b_ B:26-45,112-122,175-197
1c41 d1c41d_ D:26-45,112-122,175-197
1c41 d1c41g_ G:26-45,112-122,175-197
1c41 d1c41e_ E:26-45,112-122,175-197
116. d.193.1 Hsp33 domain
Hsp33 domain 3 layers: beta/alpha/beta; buried helix
1vq0 d1vq0b1 B:33-54,58-68,135-149
1vq0 d1vq0a1 A:33-54,58-68,135-149
1vzy d1vzya1 A:35-57,60-69,138-152
1vzy d1vzyb1 B:35-57,60-69,138-152
1hw7 d1hw7a_ A:40-61,64-75,137-151
1i7f d1i7fa_ A:40-61,64-74,137-151
117. d.166.1 ADP-ribosylation
ADP-ribosylation unusual fold
1gs0 d1gs0a2 A:332-342,342-348,407-418
1gs0 d1gs0b2 B:332-342,342-348,407-418
1pax d1paxa2 A:788-798,798-804,865-876
3pax d3paxa2 A:788-798,798-804,865-876
2pax d2paxa2 A:788-798,798-804,865-876
1a26 d1a26a2 A:788-798,798-804,865-876
4pax d4paxa2 A:788-798,798-804,865-876
1wok d1wokd2 D:788-798,798-804,865-876
1uk1 d1uk1a2 A:788-798,798-804,868-876
1wok d1wokb2 B:788-798,798-804,868-876
1wok d1woka2 A:788-798,798-804,868-876
1wok d1wokc2 C:788-798,798-804,868-876
1uk0 d1uk0a2 A:127-137,137-143,207-215
2paw d2pawa2 A:788-798,798-804,868-876
1efy d1efya2 A:788-798,798-804,868-876
1uk0 d1uk0b2 B:127-137,137-143,207-215
2rd6 d2rd6a2 A:127-137,137-143,207-215
2rcw d2rcwa2 A:127-137,137-143,207-215
1uk1 d1uk1b2 B:788-798,798-804,868-876
1pto d1ptoa_ A:56-78,82-93,199-208
1pto d1ptog_ G:56-78,82-93,199-208
1bcp d1bcpa_ A:56-78,82-93,199-208
1bcp d1bcpg_ G:56-78,82-93,199-208
118. b.40.4 Nucleic acid-binding proteins
OB-fold barrel, closed or partly opened n=5, S=10 or S=8; greek-key
1quq d1quqc_ C:50-57,72-79,151-170
1quq d1quqa_ A:50-57,72-79,151-170
2pi2 d2pi2f1 F:13-21,23-30,95-110
1l1o d1l1oa_ A:13-21,21-30,95-110
2pi2 d2pi2h1 H:13-21,23-30,95-110
2pqa d2pqad1 D:13-21,23-30,95-110
2pqa d2pqac1 C:50-57,72-79,151-170
2z6k d2z6kc1 C:13-21,23-30,95-110
2pqa d2pqaa1 A:50-58,72-79,151-172
1quq d1quqb_ B:13-21,23-30,95-110
2pqa d2pqab1 B:13-21,23-30,95-110
2pi2 d2pi2g1 G:13-21,23-30,95-110
1l1o d1l1od_ D:13-21,22-30,95-110
2pi2 d2pi2e1 E:13-21,22-30,95-110
1quq d1quqd_ D:13-21,22-30,95-110
2pi2 d2pi2c1 C:50-57,72-79,151-173
2z6k d2z6kd1 D:13-21,22-30,95-110
2pi2 d2pi2b1 B:50-57,72-79,151-174
1l1o d1l1ob_ B:50-57,72-81,151-171
2pi2 d2pi2d1 D:50-57,72-79,151-174
2z6k d2z6kb1 B:50-57,72-79,151-175
2pi2 d2pi2a1 A:50-57,72-81,151-176
2id0 d2id0b4 B:383-409,410-416,501-517
2z6k d2z6ka1 A:50-57,72-81,151-175
2id0 d2id0c4 C:383-409,410-416,501-517
2ix1 d2ix1a4 A:383-409,410-416,501-517
2id0 d2id0d4 D:383-409,410-416,501-517
2ix0 d2ix0a4 A:383-409,410-416,501-517
2id0 d2id0a4 A:383-409,410-417,501-517
2vnu d2vnud4 D:721-747,748-756,848-863
2r7f d2r7fa2 A:260-285,289-294,344-359
2r7d d2r7da2 A:260-285,289-294,344-360
2r7d d2r7dc2 C:260-285,289-294,344-360
2pi2 d2pi2d1 D:50-57,62-67,151-174
2r7d d2r7db2 B:260-285,289-294,344-360
1l1o d1l1ob_ B:50-57,62-67,151-171
1l1o d1l1oe_ E:50-57,62-67,151-171
119. i.24.1 anthrax toxin protective antigen-receptor complex
anthrax toxin protective antigen-receptor complex
1tzn d1tzni_ I:1058-1074,1140-1148,1203-1217
1tzn d1tznm_ M:1058-1074,1140-1148,1203-1217
1tzn d1tznd_ D:1058-1074,1140-1148,1203-1217
1tzn d1tznj_ J:1058-1074,1140-1148,1203-1217
1tzn d1tznb_ B:1058-1074,1140-1148,1203-1217
1tzn d1tznk_ K:1058-1074,1140-1148,1203-1217
1tzn d1tzna_ A:1058-1074,1140-1148,1203-1217
1tzn d1tznl_ L:1058-1074,1140-1148,1203-1217
1tzn d1tzng_ G:1058-1074,1140-1148,1203-1217
1tzn d1tznf_ F:1058-1074,1140-1148,1203-1217
1tzn d1tznc_ C:1058-1074,1140-1148,1203-1217
1tzn d1tznh_ H:1058-1074,1140-1148,1203-1217
1tzn d1tzno_ O:1058-1074,1140-1148,1203-1217
1tzn d1tzne_ E:1058-1074,1140-1148,1203-1217
1tzn d1tznh_ H:1058-1074,1170-1178,1203-1217
1tzn d1tznd_ D:1058-1074,1170-1178,1203-1217
1tzn d1tzne_ E:1058-1074,1170-1178,1203-1217
1tzn d1tznj_ J:1058-1074,1170-1178,1203-1217
1tzn d1tznm_ M:1058-1074,1170-1178,1203-1217
1tzn d1tznk_ K:1058-1074,1170-1178,1203-1217
1tzn d1tznf_ F:1058-1074,1170-1178,1203-1217
1tzn d1tzna_ A:1058-1074,1170-1178,1203-1217
1tzn d1tzng_ G:1058-1074,1170-1178,1203-1217
1tzn d1tznb_ B:1058-1074,1170-1178,1203-1217
1tzn d1tznc_ C:1058-1074,1170-1178,1203-1217
1tzn d1tznl_ L:1058-1074,1170-1178,1203-1217
1tzn d1tzno_ O:1058-1074,1170-1178,1203-1217
1tzn d1tzni_ I:1058-1074,1170-1178,1203-1217
120. c.76.1 Alkaline phosphatase-like
Alkaline phosphatase-like core:3 layers: a/b/a; mixed beta-sheet of 8 strands, order 43516728, strand 7 is antiparallel to the rest
1hdh d1hdha_ A:96-105,200-208,406-419
1hdh d1hdhb_ B:96-105,200-208,406-419
1e3c d1e3cp_ P:106-115,218-226,332-345
1fsu d1fsua_ A:128-137,231-239,349-362
1p49 d1p49a_ A:117-126,279-287,399-412
1e33 d1e33p_ P:106-115,218-226,332-345
1e1z d1e1zp_ P:106-115,218-226,332-345
1auk d1auka_ A:106-115,218-226,332-345
1urb d1urbb_ B:131-140,316-324,434-447
1ei6 d1ei6c_ C:126-135,139-145,173-192
1n2k d1n2ka_ A:106-115,218-226,332-345
1n2l d1n2la_ A:106-115,218-226,332-345
1e2s d1e2sp_ P:106-115,218-226,332-345
1khk d1khka_ A:131-140,316-324,434-447
2anh d2anhb_ B:131-140,316-324,434-447
1ew9 d1ew9b_ B:131-140,316-324,434-447
1urb d1urba_ A:131-140,316-324,434-447
1ew8 d1ew8a_ A:131-140,316-324,434-447
1alk d1alkb_ B:131-140,316-324,434-447
1ajb d1ajbb_ B:131-140,316-324,434-447
1hqa d1hqab_ B:131-140,316-324,434-447
1ajb d1ajba_ A:131-140,316-324,434-447
1khl d1khlb_ B:131-140,316-324,434-447
1b8j d1b8ja_ A:131-140,316-324,434-447
1ura d1uraa_ A:131-140,316-324,434-447
1ura d1urab_ B:131-140,316-324,434-447
2anh d2anha_ A:131-140,316-324,434-447
1hjk d1hjkb_ B:131-140,316-324,434-447
1khk d1khkb_ B:131-140,316-324,434-447
1y6v d1y6vb1 B:131-140,316-324,434-447
1ajd d1ajda_ A:131-140,316-324,434-447
1aja d1ajab_ B:131-140,316-324,434-447
1alj d1alja_ A:131-140,316-324,434-447
1hqa d1hqaa_ A:131-140,316-324,434-447
1y6v d1y6va1 A:131-140,316-324,434-447
1khl d1khla_ A:131-140,316-324,434-447
1alj d1aljb_ B:131-140,316-324,434-447
1alh d1alhb_ B:131-140,316-324,434-447
1alh d1alha_ A:131-140,316-324,434-447
1ew8 d1ew8b_ B:131-140,316-324,434-447
1ani d1anib_ B:131-140,316-324,434-447
1b8j d1b8jb_ B:131-140,316-324,434-447
1ed9 d1ed9b_ B:631-640,816-824,934-947
1kh9 d1kh9a_ A:131-140,316-324,434-447
1kh5 d1kh5a_ A:131-140,316-324,434-447
1ajd d1ajdb_ B:131-140,316-324,434-447
1ani d1ania_ A:131-140,316-324,434-447
1ed8 d1ed8b_ B:631-640,816-824,934-947
1kh9 d1kh9b_ B:131-140,316-324,434-447
1kh5 d1kh5b_ B:631-640,816-824,934-947
1ew9 d1ew9a_ A:131-140,316-324,434-447
1ali d1alib_ B:131-140,316-324,434-447
1alk d1alka_ A:131-140,316-324,434-447
1ed9 d1ed9a_ A:131-140,316-324,434-447
1anj d1anjb_ B:131-140,316-324,434-447
1khj d1khjb_ B:131-140,316-324,434-447
1ajc d1ajca_ A:131-140,316-324,434-447
1ely d1elyb_ B:131-140,316-324,434-447
1ali d1alia_ A:131-140,316-324,434-447
1hjk d1hjka_ A:131-140,316-324,434-447
1khn d1khna_ A:131-140,316-324,434-447
1ajc d1ajcb_ B:131-140,316-324,434-447
1ed8 d1ed8a_ A:131-140,316-324,434-447
1khj d1khja_ A:131-140,316-324,434-447
1kh7 d1kh7a_ A:131-140,316-324,434-447
1anj d1anja_ A:131-140,316-324,434-447
1elz d1elza_ A:131-140,316-324,434-447
1ely d1elya_ A:131-140,316-324,434-447
1elz d1elzb_ B:131-140,316-324,434-447
1aja d1ajaa_ A:131-140,316-324,434-447
1kh7 d1kh7b_ B:131-140,316-324,434-447
1elx d1elxa_ A:131-140,316-324,434-447
1khn d1khnb_ B:131-140,316-324,434-447
1elx d1elxb_ B:131-140,316-324,434-447
1kh4 d1kh4a_ A:131-140,316-324,434-447
1kh4 d1kh4b_ B:131-140,316-324,434-447
1zef d1zefa1 A:131-140,305-313,454-467
1ew2 d1ew2a_ A:131-140,305-313,454-467
2glq d2glqa1 A:131-140,305-313,454-467
1zed d1zeda1 A:131-140,305-313,454-467
1zeb d1zeba1 A:131-140,305-313,454-467
1shn d1shna_ A:127-136,304-312,454-467
1shn d1shnb_ B:127-136,304-312,454-467
1k7h d1k7hb_ B:127-136,304-312,454-467
1p49 d1p49a_ A:76-85,334-345,399-412
1shq d1shqb_ B:127-136,304-312,454-467
1k7h d1k7ha_ A:127-136,304-312,454-467
1shq d1shqa_ A:127-136,304-312,454-467
1fsu d1fsua_ A:92-101,292-301,349-362
1o98 d1o98a2 A:61-72,436-445,483-496
1ejj d1ejja2 A:61-72,436-445,483-496
1o99 d1o99a2 A:61-72,436-445,483-496
1eqj d1eqja2 A:61-72,436-445,483-496
1zef d1zefa1 A:153-161,349-358,454-467
1zeb d1zeba1 A:153-161,349-358,454-467
1zed d1zeda1 A:153-161,349-358,454-467
1ew2 d1ew2a_ A:153-161,349-358,454-467
2glq d2glqa1 A:153-161,349-358,454-467
1eqj d1eqja2 A:316-325,393-400,483-496
1o99 d1o99a2 A:316-325,393-400,483-496
1ejj d1ejja2 A:316-325,393-400,483-496
1o98 d1o98a2 A:316-325,393-400,483-496
1hjk d1hjka_ A:153-161,162-166,190-199
1zed d1zeda1 A:91-102,349-358,454-467
1zef d1zefa1 A:91-102,349-358,454-467
1zeb d1zeba1 A:91-102,349-358,454-467
1shn d1shna_ A:85-96,348-357,454-467
1alk d1alka_ A:153-161,162-166,190-199
1anj d1anja_ A:153-161,162-166,190-199
1shn d1shnb_ B:85-96,348-357,454-467
2glq d2glqa1 A:91-102,349-358,454-467
1k7h d1k7hb_ B:85-96,348-357,454-467
1shq d1shqb_ B:85-96,348-357,454-467
1hdh d1hdhb_ B:50-61,309-318,406-419
1aja d1ajab_ B:153-161,162-166,190-199
1ew2 d1ew2a_ A:91-102,349-358,454-467
1hdh d1hdha_ A:50-61,309-318,406-419
1shq d1shqa_ A:85-96,348-357,454-467
1k7h d1k7ha_ A:85-96,348-357,454-467
1ani d1anib_ B:153-161,162-166,190-199
1alk d1alka_ A:101-112,361-370,434-447
1ed8 d1ed8b_ B:601-612,861-870,934-947
1ei6 d1ei6c_ C:108-117,194-202,397-406
1alh d1alha_ A:101-112,361-370,434-447
1alh d1alhb_ B:101-112,361-370,434-447
1aja d1ajab_ B:101-112,361-370,434-447
1ei6 d1ei6b_ B:108-117,194-202,397-406
1urb d1urbb_ B:101-112,361-370,434-447
1urb d1urba_ A:101-112,361-370,434-447
1ura d1uraa_ A:101-112,361-370,434-447
1khl d1khlb_ B:101-112,361-370,434-447
1ew8 d1ew8a_ A:101-112,361-370,434-447
1ed9 d1ed9b_ B:601-612,861-870,934-947
1ew9 d1ew9a_ A:101-112,361-370,434-447
1ed8 d1ed8a_ A:101-112,361-370,434-447
1ura d1urab_ B:101-112,361-370,434-447
1ei6 d1ei6a_ A:108-117,194-202,397-406
1elz d1elza_ A:101-112,361-370,434-447
1ew9 d1ew9b_ B:101-112,361-370,434-447
1ei6 d1ei6d_ D:108-117,194-202,397-406
1b8j d1b8ja_ A:101-112,361-370,434-447
1khk d1khkb_ B:101-112,361-370,434-447
1alk d1alkb_ B:101-112,361-370,434-447
1khj d1khjb_ B:101-112,361-370,434-447
1b8j d1b8jb_ B:101-112,361-370,434-447
1ajb d1ajba_ A:101-112,361-370,434-447
1elz d1elzb_ B:101-112,361-370,434-447
1ew8 d1ew8b_ B:101-112,361-370,434-447
1ani d1ania_ A:101-112,361-370,434-447
1ajc d1ajca_ A:101-112,361-370,434-447
1khn d1khnb_ B:101-112,361-370,434-447
1alj d1aljb_ B:101-112,361-370,434-447
1ani d1anib_ B:101-112,361-370,434-447
1ed9 d1ed9a_ A:101-112,361-370,434-447
1kh7 d1kh7b_ B:101-112,361-370,434-447
1khl d1khla_ A:101-112,361-370,434-447
1y6v d1y6va1 A:101-112,361-370,434-447
1hqa d1hqab_ B:101-112,361-370,434-447
1hqa d1hqaa_ A:101-112,361-370,434-447
1ali d1alia_ A:101-112,361-370,434-447
2anh d2anha_ A:101-112,361-370,434-447
1ajd d1ajda_ A:101-112,361-370,434-447
1ajc d1ajcb_ B:101-112,361-370,434-447
1ajd d1ajdb_ B:101-112,361-370,434-447
1hjk d1hjka_ A:101-112,361-370,434-447
1y6v d1y6vb1 B:101-112,361-370,434-447
1kh9 d1kh9b_ B:101-112,361-370,434-447
1kh5 d1kh5b_ B:601-612,861-870,934-947
1kh7 d1kh7a_ A:101-112,361-370,434-447
1elx d1elxb_ B:101-112,361-370,434-447
1elx d1elxa_ A:101-112,361-370,434-447
1anj d1anja_ A:101-112,361-370,434-447
2anh d2anhb_ B:101-112,361-370,434-447
1khn d1khna_ A:101-112,361-370,434-447
1ali d1alib_ B:101-112,361-370,434-447
1ajb d1ajbb_ B:101-112,361-370,434-447
1kh4 d1kh4b_ B:101-112,361-370,434-447
1hjk d1hjkb_ B:101-112,361-370,434-447
1anj d1anjb_ B:101-112,361-370,434-447
1khj d1khja_ A:101-112,361-370,434-447
1kh9 d1kh9a_ A:101-112,361-370,434-447
1kh5 d1kh5a_ A:101-112,361-370,434-447
1kh4 d1kh4a_ A:101-112,361-370,434-447
1ely d1elya_ A:101-112,361-370,434-447
1ely d1elyb_ B:101-112,361-370,434-447
1khk d1khka_ A:101-112,361-370,434-447
1shq d1shqa_ A:85-96,451-455,454-467
1shq d1shqb_ B:85-96,451-455,454-467
1k7h d1k7hb_ B:85-96,451-455,454-467
1k7h d1k7ha_ A:85-96,451-455,454-467
1shn d1shna_ A:85-96,451-455,454-467
1shn d1shnb_ B:85-96,451-455,454-467
1zed d1zeda1 A:91-102,451-455,454-467
1zeb d1zeba1 A:91-102,451-455,454-467
1alj d1alja_ A:101-112,361-369,434-447
1aja d1ajaa_ A:101-112,361-368,434-447
121. c.91.1 PEP carboxykinase-like
PEP carboxykinase-like contains a P-loop NTP-binding motif; mixed beta-sheet folds into a barrel-like structure with helices packed on one side
2pc9 d2pc9b1 B:237-244,340-348,440-454
2pc9 d2pc9c1 C:237-244,340-348,440-454
1xkv d1xkvb1 B:237-244,340-349,440-454
1j3b d1j3bb1 B:237-244,340-349,440-454
1j3b d1j3ba1 A:237-244,340-349,440-454
2pc9 d2pc9a1 A:237-244,340-349,440-454
2pc9 d2pc9d1 D:237-244,340-349,440-454
1os1 d1os1a1 A:253-260,355-363,451-465
1xkv d1xkva1 A:237-244,340-349,440-454
1oen d1oena1 A:253-260,355-365,451-465
1ii2 d1ii2b1 B:226-233,328-337,430-444
1ii2 d1ii2a1 A:226-233,328-337,430-444
1k3c d1k3ca1 A:253-260,355-364,451-465
2olr d2olra1 A:253-260,355-364,451-465
2py7 d2py7x1 X:253-260,355-364,451-465
2pxz d2pxzx1 X:253-260,355-364,451-465
1j3b d1j3bb1 B:237-244,419-427,440-454
2olq d2olqa1 A:253-260,355-364,451-465
1xkv d1xkvb1 B:237-244,419-427,440-454
1k3d d1k3da1 A:253-260,355-364,451-465
1aq2 d1aq2a1 A:253-260,355-364,451-465
1ayl d1ayla1 A:253-260,355-364,451-465
2pc9 d2pc9b1 B:237-244,419-427,440-454
1j3b d1j3ba1 A:237-244,419-427,440-454
1ii2 d1ii2b1 B:226-233,408-416,430-444
2pc9 d2pc9a1 A:237-244,419-427,440-454
1ii2 d1ii2a1 A:226-233,408-416,430-444
2pc9 d2pc9c1 C:237-244,419-427,440-454
2pc9 d2pc9d1 D:237-244,419-427,440-454
1xkv d1xkva1 A:237-244,419-427,440-454
1oen d1oena1 A:253-260,434-444,451-465
1os1 d1os1a1 A:253-260,434-442,451-465
1k3c d1k3ca1 A:253-260,434-442,451-465
2py7 d2py7x1 X:253-260,434-442,451-465
2olr d2olra1 A:253-260,434-442,451-465
2pxz d2pxzx1 X:253-260,434-442,451-465
2olq d2olqa1 A:253-260,434-442,451-465
1k3d d1k3da1 A:253-260,434-442,451-465
1ayl d1ayla1 A:253-260,434-442,451-465
1aq2 d1aq2a1 A:253-260,434-442,451-465
1knx d1knxd2 D:156-171,227-234,272-290
1knx d1knxa2 A:159-171,227-234,272-290
1ko7 d1ko7a2 A:156-168,225-232,268-286
1knx d1knxf2 F:156-171,227-234,272-290
1ko7 d1ko7b2 B:156-168,225-232,268-286
1kkm d1kkma_ A:160-172,229-237,272-290
1kkl d1kklb_ B:160-172,229-237,272-290
1knx d1knxc2 C:156-171,227-234,272-290
1knx d1knxe2 E:156-171,227-234,272-290
1kkm d1kkmc_ C:160-172,229-237,272-290
1kkm d1kkmb_ B:160-172,229-237,272-290
1jb1 d1jb1a_ A:160-172,229-236,272-290
1kkl d1kklc_ C:160-172,229-237,272-290
1knx d1knxb2 B:159-171,227-234,272-290
1kkl d1kkla_ A:160-172,229-237,272-290
1knx d1knxe2 E:156-171,257-267,272-290
1knx d1knxc2 C:156-171,257-267,272-290
1knx d1knxd2 D:156-171,257-267,272-290
1knx d1knxf2 F:156-171,257-267,272-290
122. i.2.1 Helicase
Helicase
2rec d2recd_ D:44-52,254-264,269-282
2rec d2recc_ C:44-52,254-264,269-282
2rec d2recf_ F:44-52,254-264,269-282
1n03 d1n03e_ E:44-52,254-264,269-282
1n03 d1n03c_ C:44-52,254-264,269-282
1n03 d1n03d_ D:44-52,254-264,269-282
1n03 d1n03a_ A:44-52,254-264,269-282
2rec d2reca_ A:44-52,254-264,269-282
1n03 d1n03f_ F:44-52,254-264,269-282
2rec d2recb_ B:44-52,254-264,269-282
1n03 d1n03g_ G:44-52,254-264,269-282
1n03 d1n03b_ B:44-52,254-264,269-282
2rec d2rece_ E:44-52,254-264,269-282
123. c.123.1 CoA-transferase family III (CaiB/BaiF)
CoA-transferase family III (CaiB/BaiF) consist of two different alpha/beta domains; N-terminal domain has a SurE-like topology with a left-handed beta-alpha-beta unit
1pt8 d1pt8a_ A:16-30,91-96,166-191
1q6y d1q6ya_ A:18-32,93-98,168-193
1pqy d1pqya_ A:18-32,93-98,168-193
1pt7 d1pt7b_ B:16-30,91-96,166-191
1pt8 d1pt8b_ B:16-30,91-96,166-191
1q7e d1q7ea_ A:18-32,93-98,168-193
1pt5 d1pt5b_ B:16-30,91-96,166-191
1pt7 d1pt7a_ A:16-30,91-96,166-191
1pt5 d1pt5a_ A:16-30,91-96,166-191
1t4c d1t4cb_ B:16-30,91-96,166-191
2vjl d2vjla1 A:16-30,91-96,166-191
2vjk d2vjkb1 B:16-30,91-96,166-191
2vjm d2vjma1 A:16-30,91-96,166-191
2vjk d2vjka1 A:16-30,91-96,166-191
2vjl d2vjlb1 B:16-30,91-96,166-191
1p5r d1p5ra_ A:16-30,91-96,166-191
1t3z d1t3zb_ B:16-30,91-96,166-191
1t4c d1t4ca_ A:16-30,91-96,166-191
1vgr d1vgrb_ B:16-30,91-96,166-191
1vgq d1vgqa_ A:16-30,91-96,166-191
1p5h d1p5hb_ B:16-30,91-96,166-191
1vgr d1vgra_ A:16-30,91-96,166-191
1p5r d1p5rb_ B:16-30,91-96,166-191
1vgq d1vgqb_ B:16-30,91-96,166-191
1t3z d1t3za_ A:16-30,91-96,166-191
1p5h d1p5ha_ A:16-30,91-96,166-191
1q6y d1q6ya_ A:18-32,120-127,168-193
1pt8 d1pt8a_ A:16-30,118-125,166-191
1xk6 d1xk6d1 D:23-32,90-96,166-191
1xa4 d1xa4a_ A:23-37,90-96,166-191
1pqy d1pqya_ A:18-32,120-127,168-193
1xk6 d1xk6a1 A:23-32,90-96,166-191
1xa3 d1xa3b_ B:23-32,90-96,166-191
1pt8 d1pt8b_ B:16-30,118-125,166-191
1pt5 d1pt5b_ B:16-30,118-125,166-191
1pt7 d1pt7a_ A:16-30,118-125,166-191
1pt7 d1pt7b_ B:16-30,118-125,166-191
1xk7 d1xk7b1 B:23-32,90-96,166-191
1pt5 d1pt5a_ A:16-30,118-125,166-191
1q7e d1q7ea_ A:18-32,120-127,168-193
2gci d2gcid1 D:16-30,78-83,151-179
1xk6 d1xk6d1 D:23-32,117-124,166-191
2gci d2gcic1 C:16-30,78-83,151-179
1x74 d1x74c1 C:16-30,78-83,151-179
1xvv d1xvva1 A:23-37,90-96,166-191
1xk6 d1xk6a1 A:23-32,117-124,166-191
1x74 d1x74b1 B:16-30,78-83,151-179
1x74 d1x74d1 D:16-30,78-83,151-179
1x74 d1x74a1 A:16-30,78-83,151-179
2gd6 d2gd6a1 A:16-30,78-83,151-179
2gce d2gcea1 A:16-30,78-83,151-179
2gd0 d2gd0b1 B:16-30,78-83,151-179
2gd2 d2gd2c1 C:16-30,78-83,151-179
2gce d2gceb1 B:16-30,78-83,151-179
1xa3 d1xa3a_ A:22-37,117-124,166-191
2gd2 d2gd2b1 B:16-30,78-83,151-179
2gd0 d2gd0d1 D:16-30,78-83,151-179
2gd6 d2gd6b1 B:16-30,78-83,151-179
2gd6 d2gd6d1 D:16-30,78-83,151-179
2gd0 d2gd0a1 A:16-30,78-83,151-179
2gce d2gced1 D:16-30,78-83,151-179
2gd2 d2gd2d1 D:16-30,78-83,151-179
1xvu d1xvua1 A:23-37,90-96,166-191
2gd0 d2gd0c1 C:16-30,78-83,151-179
1xk7 d1xk7b1 B:23-32,117-124,166-191
2gd2 d2gd2a1 A:16-30,78-83,151-179
2gce d2gcec1 C:16-30,78-83,151-179
1xk7 d1xk7c1 C:22-37,117-124,166-191
1xa3 d1xa3b_ B:23-32,117-124,166-191
1xk7 d1xk7a1 A:22-37,117-124,166-191
2gd6 d2gd6c1 C:16-30,78-83,151-179
1xk6 d1xk6c1 C:22-37,117-124,166-191
2gci d2gcib1 B:16-30,78-83,151-179
2gci d2gcia1 A:16-30,78-83,151-179
2vjm d2vjma1 A:16-30,118-125,166-191
1xk6 d1xk6b1 B:22-37,117-124,166-191
2vjk d2vjka1 A:16-30,118-125,166-191
1p5r d1p5ra_ A:16-30,118-125,166-191
1xvt d1xvta1 A:22-37,90-96,166-191
1xvt d1xvta1 A:22-37,117-124,166-191
2vjl d2vjla1 A:16-30,118-125,166-191
1vgr d1vgrb_ B:16-30,118-125,166-191
1vgq d1vgqa_ A:16-30,118-125,166-191
2vjk d2vjkb1 B:16-30,118-125,166-191
1t4c d1t4cb_ B:16-30,118-125,166-191
1vgq d1vgqb_ B:16-30,118-125,166-191
1t3z d1t3zb_ B:16-30,118-125,166-191
2vjl d2vjlb1 B:16-30,118-125,166-191
1xa3 d1xa3a_ A:22-37,90-96,166-191
1vgr d1vgra_ A:16-30,118-125,166-191
1p5r d1p5rb_ B:16-30,118-125,166-191
1xk7 d1xk7c1 C:22-37,90-96,166-191
1xk7 d1xk7a1 A:22-37,90-96,166-191
1p5h d1p5hb_ B:16-30,118-125,166-191
1t4c d1t4ca_ A:16-30,118-125,166-191
1t3z d1t3za_ A:16-30,118-125,166-191
1p5h d1p5ha_ A:16-30,118-125,166-191
1xa4 d1xa4b_ B:22-37,117-124,166-191
1xk6 d1xk6c1 C:22-37,90-96,166-191
1xk6 d1xk6b1 B:22-37,90-96,166-191
1xa4 d1xa4b_ B:22-37,90-96,166-191
1xa4 d1xa4a_ A:23-37,117-124,166-191
1xvv d1xvva1 A:23-37,117-124,166-191
1xvu d1xvua1 A:23-37,117-124,166-191
2gce d2gcea1 A:16-30,105-112,151-179
1x74 d1x74b1 B:16-30,105-112,151-179
2gd0 d2gd0b1 B:16-30,105-112,151-179
2gci d2gcid1 D:16-30,105-112,151-179
2gce d2gceb1 B:16-30,105-112,151-179
1x74 d1x74c1 C:16-30,105-112,151-179
2gci d2gcic1 C:16-30,105-112,151-179
2gd0 d2gd0d1 D:16-30,105-112,151-179
2gce d2gced1 D:16-30,105-112,151-179
2gd0 d2gd0c1 C:16-30,105-112,151-179
2gd6 d2gd6a1 A:16-30,105-112,151-179
1x74 d1x74a1 A:16-30,105-112,151-179
2gd0 d2gd0a1 A:16-30,105-112,151-179
1x74 d1x74d1 D:16-30,105-112,151-179
2gd6 d2gd6d1 D:16-30,105-112,151-179
2gce d2gcec1 C:16-30,105-112,151-179
2gd6 d2gd6b1 B:16-30,105-112,151-179
2gd2 d2gd2b1 B:16-30,105-112,151-179
2gd2 d2gd2c1 C:16-30,105-112,151-179
2gd2 d2gd2a1 A:16-30,105-112,151-179
2gd6 d2gd6c1 C:16-30,105-112,151-179
2gd2 d2gd2d1 D:16-30,105-112,151-179
2gci d2gcib1 B:16-30,105-112,151-179
2gci d2gcia1 A:16-30,105-112,151-179
124. e.26.1 Prismane protein-like
Prismane protein-like 3 domains: (1) spectrin repeat-like 3-helical bundle; (2 and 3) alpha/beta: Rossmann-fold topology
1ru3 d1ru3a_ A:168-183,252-259,300-313
2z8y d2z8yo1 O:165-180,249-256,297-310
1jqk d1jqkd_ D:459-473,556-562,618-637
1jqk d1jqke_ E:459-473,556-562,618-637
1jqk d1jqkb_ B:459-473,556-562,618-637
2z8y d2z8yp1 P:165-180,249-256,297-310
1jqk d1jqka_ A:459-473,556-562,618-637
1jqk d1jqkf_ F:459-473,556-562,618-637
1jqk d1jqkc_ C:459-473,556-562,618-637
1oao d1oaoc_ C:165-180,249-256,297-310
2z8y d2z8yn1 N:165-180,249-256,297-310
3b53 d3b53x1 X:454-468,551-557,613-633
1oao d1oaod_ D:165-180,249-256,297-310
2z8y d2z8ym1 M:165-180,249-256,297-310
3b51 d3b51x1 X:454-468,551-557,613-633
1su7 d1su7a_ A:454-468,551-557,613-633
3b52 d3b52x1 X:454-468,551-557,613-633
1su8 d1su8a_ A:454-468,551-557,613-633
1suf d1sufa_ A:454-468,551-557,613-633
1su6 d1su6a_ A:454-468,551-557,613-633
1mjg d1mjgo_ O:165-180,249-256,297-310
1mjg d1mjgn_ N:165-180,249-256,297-310
1mjg d1mjgp_ P:165-180,249-256,297-310
1mjg d1mjgm_ M:165-180,249-256,297-310
1jqk d1jqkf_ F:266-281,330-335,375-394
1jqk d1jqke_ E:266-281,330-335,375-394
1jqk d1jqkc_ C:266-281,330-335,375-394
1jqk d1jqkd_ D:266-281,330-335,375-394
1jqk d1jqka_ A:266-281,330-335,375-394
1jqk d1jqkb_ B:266-281,330-335,375-394
1su7 d1su7a_ A:262-277,325-330,370-390
1su7 d1su7a_ A:454-468,575-582,613-633
3b53 d3b53x1 X:454-468,575-582,613-633
3b51 d3b51x1 X:454-468,575-582,613-633
1su8 d1su8a_ A:454-468,575-582,613-633
3b52 d3b52x1 X:454-468,575-582,613-633
1su8 d1su8a_ A:262-277,325-330,370-390
3b52 d3b52x1 X:262-277,325-330,370-390
1su6 d1su6a_ A:262-277,325-330,370-390
1jqk d1jqkd_ D:266-281,290-298,375-394
1su6 d1su6a_ A:454-468,575-581,613-633
1jqk d1jqka_ A:266-281,290-298,375-394
1suf d1sufa_ A:262-277,325-330,370-390
1suf d1sufa_ A:454-468,575-582,613-633
1jqk d1jqke_ E:266-281,290-298,375-394
3b53 d3b53x1 X:262-277,325-330,370-390
3b51 d3b51x1 X:262-277,325-330,370-390
1jqk d1jqkb_ B:266-281,290-298,375-394
1oa1 d1oa1a_ A:410-423,485-492,541-552
1e2u d1e2ua_ A:410-423,485-492,541-552
1gnt d1gnta_ A:410-423,485-492,541-552
1e9v d1e9va_ A:410-423,485-492,541-552
1e1d d1e1da_ A:410-423,485-492,541-552
1w9m d1w9ma1 A:410-423,485-492,541-552
1jqk d1jqkd_ D:459-473,580-586,618-637
1jqk d1jqke_ E:459-473,580-586,618-637
1jqk d1jqkf_ F:459-473,580-586,618-637
1jqk d1jqkb_ B:459-473,580-586,618-637
1jqk d1jqkc_ C:459-473,580-586,618-637
1jqk d1jqka_ A:459-473,580-586,618-637
1jqk d1jqkf_ F:266-281,290-299,375-394
1jqk d1jqkc_ C:266-281,290-299,375-394
1su7 d1su7a_ A:262-277,285-294,370-390
1upx d1upxb_ B:403-416,478-485,534-543
1su8 d1su8a_ A:262-277,285-294,370-390
3b52 d3b52x1 X:262-277,285-294,370-390
1gnl d1gnlb_ B:403-416,478-485,534-543
1suf d1sufa_ A:262-277,285-294,370-390
1su6 d1su6a_ A:262-277,285-294,370-390
1gn9 d1gn9b_ B:403-416,478-485,534-543
1upx d1upxa_ A:403-416,478-485,534-543
3b53 d3b53x1 X:262-277,285-294,370-390
1oa0 d1oa0b_ B:403-416,478-485,534-543
1gn9 d1gn9a_ A:403-416,478-485,534-543
1gnl d1gnla_ A:403-416,478-485,534-543
3b51 d3b51x1 X:262-277,285-294,370-390
1oa0 d1oa0a_ A:403-416,478-485,534-543
1gn9 d1gn9b_ B:241-253,300-305,343-354
1upx d1upxb_ B:241-253,300-305,343-354
1gnl d1gnlb_ B:241-253,300-305,343-354
1oa0 d1oa0b_ B:241-253,300-305,343-354
1upx d1upxb_ B:241-253,257-262,343-354
1gn9 d1gn9b_ B:241-253,257-262,343-354
1gnl d1gnlb_ B:241-253,257-262,343-354
2z8y d2z8yb1 B:284-299,347-353,392-415
2z8y d2z8ya1 A:284-299,347-353,392-415
1oa0 d1oa0b_ B:241-253,257-262,343-354
1e2u d1e2ua_ A:245-257,304-309,350-362
1e9v d1e9va_ A:245-257,304-309,350-362
1oao d1oaob_ B:284-299,347-353,392-415
1oa1 d1oa1a_ A:245-257,304-309,350-362
1upx d1upxa_ A:241-253,300-305,343-355
1e2u d1e2ua_ A:245-257,261-266,350-362
1gnl d1gnla_ A:241-253,300-305,343-355
1gn9 d1gn9a_ A:241-253,300-305,343-355
1e9v d1e9va_ A:245-257,261-266,350-362
1oa0 d1oa0a_ A:241-253,300-305,343-355
2z8y d2z8yd1 D:284-299,347-353,392-415
1oa1 d1oa1a_ A:245-257,261-266,350-362
1mjg d1mjgc_ C:284-299,347-353,392-415
1mjg d1mjgd_ D:284-299,347-353,392-415
1upx d1upxa_ A:241-253,257-262,343-355
1mjg d1mjga_ A:284-299,347-353,392-415
1gnl d1gnla_ A:241-253,257-262,343-355
1mjg d1mjgb_ B:284-299,347-353,392-415
2z8y d2z8yc1 C:284-299,347-353,392-415
1gn9 d1gn9a_ A:241-253,257-262,343-355
1oa0 d1oa0a_ A:241-253,257-262,343-355
3b53 d3b53x1 X:454-468,468-475,613-633
1su7 d1su7a_ A:454-468,468-475,613-633
1oao d1oaoa_ A:284-299,347-353,392-415
1gn9 d1gn9b_ B:403-416,503-508,534-543
3b51 d3b51x1 X:454-468,468-475,613-633
3b52 d3b52x1 X:454-468,468-475,613-633
1gn9 d1gn9a_ A:403-416,503-508,534-543
1upx d1upxb_ B:403-416,503-508,534-543
1gnl d1gnlb_ B:403-416,503-508,534-543
1su8 d1su8a_ A:454-468,468-475,613-633
2z8y d2z8ya1 A:284-299,308-316,392-415
1suf d1sufa_ A:454-468,468-475,613-633
1su6 d1su6a_ A:454-468,468-475,613-633
1oao d1oaob_ B:284-299,307-316,392-415
1oa0 d1oa0b_ B:403-416,503-508,534-543
1jqk d1jqkf_ F:459-473,473-480,618-637
2z8y d2z8yb1 B:284-299,307-316,392-415
1jqk d1jqke_ E:459-473,473-480,618-637
1jqk d1jqka_ A:459-473,473-480,618-637
1jqk d1jqkb_ B:459-473,473-480,618-637
1upx d1upxa_ A:403-416,503-508,534-543
1jqk d1jqkc_ C:459-473,473-480,618-637
1jqk d1jqkd_ D:459-473,473-480,618-637
1gnl d1gnla_ A:403-416,503-508,534-543
1oa0 d1oa0a_ A:403-416,503-508,534-543
1e2u d1e2ua_ A:410-423,510-515,541-552
1w9m d1w9ma1 A:245-257,304-309,351-362
1w9m d1w9ma1 A:410-423,510-515,541-552
1oa1 d1oa1a_ A:410-423,510-515,541-552
1e9v d1e9va_ A:410-423,510-515,541-552
1gnt d1gnta_ A:410-423,510-515,541-552
2z8y d2z8yc1 C:284-299,307-316,392-415
1w9m d1w9ma1 A:245-257,261-266,351-362
1e1d d1e1da_ A:410-423,510-515,541-552
1gnt d1gnta_ A:245-257,304-309,351-361
1gnl d1gnla_ A:263-272,419-427,427-436
1e1d d1e1da_ A:245-257,304-309,351-361
1oao d1oaoa_ A:284-299,307-316,392-415
1gnt d1gnta_ A:245-257,261-266,351-361
1gn9 d1gn9a_ A:263-272,419-427,427-436
1e1d d1e1da_ A:245-257,261-266,351-361
1gn9 d1gn9b_ B:263-272,419-427,427-436
1e2u d1e2ua_ A:267-275,426-434,434-442
1oa1 d1oa1a_ A:267-275,426-434,434-442
1e9v d1e9va_ A:267-275,426-434,434-442
1w9m d1w9ma1 A:267-275,426-434,434-442
1oao d1oaoa_ A:476-492,575-581,637-667
2z8y d2z8yd1 D:284-299,309-316,392-415
2z8y d2z8ya1 A:476-492,575-581,637-667
1upx d1upxb_ B:263-271,419-427,427-435
1gnt d1gnta_ A:267-275,426-434,434-442
1mjg d1mjgc_ C:284-299,309-316,392-415
1mjg d1mjgd_ D:284-299,309-316,392-415
2z8y d2z8yc1 C:476-492,575-581,637-667
1upx d1upxa_ A:263-272,419-427,427-435
1oao d1oaob_ B:476-492,575-581,637-667
1mjg d1mjgb_ B:284-299,309-316,392-415
2z8y d2z8yd1 D:476-492,575-581,637-667
1mjg d1mjga_ A:284-299,309-316,392-415
1gnl d1gnlb_ B:263-271,419-427,427-435
1mjg d1mjga_ A:476-492,575-581,637-667
1oa0 d1oa0b_ B:263-271,419-427,427-435
1mjg d1mjgc_ C:476-492,575-581,637-667
1mjg d1mjgd_ D:476-492,575-581,637-667
1mjg d1mjgb_ B:476-492,575-581,637-667
1oa0 d1oa0a_ A:263-272,419-427,427-435
2z8y d2z8yb1 B:476-492,575-581,637-667
1upx d1upxa_ A:403-416,527-532,534-543
1mjg d1mjgd_ D:317-327,492-499,499-509
1mjg d1mjgb_ B:317-327,492-499,499-509
1mjg d1mjga_ A:317-327,492-499,499-509
1mjg d1mjgc_ C:317-327,492-499,499-509
1gnl d1gnla_ A:403-416,527-532,534-543
1jqk d1jqkb_ B:298-310,473-480,480-490
1jqk d1jqka_ A:298-310,473-480,480-490
1jqk d1jqkd_ D:298-310,473-480,480-490
1jqk d1jqke_ E:298-310,473-480,480-490
2z8y d2z8yb1 B:317-327,492-499,500-509
1jqk d1jqkc_ C:299-310,473-480,480-490
1jqk d1jqkf_ F:299-310,473-480,480-490
2z8y d2z8yc1 C:317-327,492-499,500-509
1oao d1oaob_ B:317-327,492-499,500-509
1oao d1oaoa_ A:317-327,492-499,500-509
2z8y d2z8ya1 A:317-327,492-499,500-509
2z8y d2z8yd1 D:317-327,492-499,500-509
1su7 d1su7a_ A:295-305,468-475,476-485
3b53 d3b53x1 X:295-305,468-475,476-485
3b51 d3b51x1 X:295-305,468-475,476-485
1su8 d1su8a_ A:295-305,468-475,476-485
3b52 d3b52x1 X:295-305,468-475,476-485
1su6 d1su6a_ A:295-305,468-475,476-485
1suf d1sufa_ A:295-305,468-475,476-485
1e1d d1e1da_ A:267-275,426-433,434-443
2z8y d2z8ya1 A:476-492,599-606,637-667
1oao d1oaoa_ A:476-492,599-606,637-667
2z8y d2z8yb1 B:476-492,599-606,637-667
2z8y d2z8yd1 D:476-492,599-606,637-667
1oao d1oaob_ B:476-492,599-606,637-667
1mjg d1mjga_ A:476-492,599-606,637-667
1mjg d1mjgc_ C:476-492,599-606,637-667
1mjg d1mjgd_ D:476-492,599-606,637-667
1mjg d1mjgb_ B:476-492,599-606,637-667
2z8y d2z8yc1 C:476-492,599-606,637-667
2z8y d2z8ya1 A:476-492,492-499,637-667
2z8y d2z8yd1 D:476-492,492-499,637-667
2z8y d2z8yb1 B:476-492,492-499,637-667
1oao d1oaoa_ A:476-492,492-499,637-667
1oao d1oaob_ B:476-492,492-499,637-667
1mjg d1mjgb_ B:476-492,492-499,637-667
1mjg d1mjga_ A:476-492,492-499,637-667
1mjg d1mjgd_ D:476-492,492-499,637-667
1mjg d1mjgc_ C:476-492,492-499,637-667
2z8y d2z8yc1 C:476-492,492-499,637-667
125. c.23.14 N-(deoxy)ribosyltransferase-like there are similar active site architectures as well as the catalytic mechanisms of functionally characterised members !
Flavodoxin-like 3 layers, a/b/a; parallel beta-sheet of 5 strand, order 21345
1s3f d1s3fc_ C:18-36,83-91,144-151
1s2g d1s2gc_ C:18-36,83-91,144-151
1s2i d1s2ic_ C:18-36,83-91,144-151
1s2g d1s2ga_ A:18-36,83-91,144-151
1s3f d1s3fa_ A:18-36,83-91,144-151
1s2i d1s2ia_ A:18-36,83-91,144-151
1s2d d1s2da_ A:18-36,83-91,144-151
1s2l d1s2la_ A:18-36,83-91,144-151
1s2d d1s2dc_ C:18-36,83-91,144-151
1s2d d1s2db_ B:18-36,83-91,144-151
1s2l d1s2lc_ C:18-36,83-91,144-151
1s2g d1s2gb_ B:18-36,83-91,144-151
1s3f d1s3fb_ B:18-36,83-91,144-151
1s2i d1s2ib_ B:18-36,83-91,144-151
1s2l d1s2lb_ B:18-36,83-91,144-151
1f8x d1f8xa_ A:14-32,80-86,135-142
1f8y d1f8ya_ A:14-32,80-86,135-142
1s2g d1s2ga_ A:18-36,111-118,144-151
1s3f d1s3fa_ A:18-36,111-118,144-151
1f8x d1f8xb_ B:214-232,280-286,335-342
1s2g d1s2gc_ C:18-36,111-118,144-151
1f8y d1f8ya_ A:14-32,108-114,135-142
1f8x d1f8xa_ A:14-32,108-114,135-142
1f8x d1f8xb_ B:214-232,308-314,335-342
1s2i d1s2ia_ A:18-36,111-118,144-151
1s2l d1s2la_ A:18-36,111-118,144-151
1s3f d1s3fc_ C:18-36,111-118,144-151
1t1j d1t1jb_ B:14-36,77-82,109-118
1s2i d1s2ic_ C:18-36,111-118,144-151
1t1j d1t1ja_ A:14-36,77-82,109-118
2a0k d2a0ka1 A:25-40,69-76,146-159
1s2d d1s2da_ A:18-36,111-118,144-151
2f64 d2f64a1 A:25-40,69-76,146-159
1f8y d1f8yb_ B:214-231,308-314,335-342
2a0k d2a0kb1 B:25-40,69-76,146-159
2f64 d2f64b1 B:25-40,69-76,146-159
1s2d d1s2dc_ C:18-36,111-118,144-151
1s2g d1s2gb_ B:18-36,111-118,144-151
2f67 d2f67b1 B:25-40,69-76,146-159
2f67 d2f67a1 A:25-40,69-76,146-159
2f2t d2f2ta1 A:25-40,69-76,146-159
2f2t d2f2tb1 B:25-40,69-76,146-159
1s2d d1s2db_ B:18-36,111-118,144-151
2f62 d2f62a1 A:25-40,69-76,146-159
2f62 d2f62b1 B:25-40,69-76,146-159
1s3f d1s3fb_ B:18-36,111-118,144-151
1s2l d1s2lc_ C:18-36,111-118,144-151
1s2l d1s2lb_ B:18-36,111-118,144-151
1s2i d1s2ib_ B:18-36,111-118,144-151
1f8y d1f8yb_ B:214-231,280-286,335-342
2ef1 d2ef1a1 A:128-140,234-245,280-291
2a0k d2a0ka1 A:25-40,41-45,146-159
2f62 d2f62a1 A:25-40,41-45,146-159
2f62 d2f62b1 B:25-40,41-45,146-159
2a0k d2a0kb1 B:25-40,41-45,146-159
2f67 d2f67a1 A:25-40,41-45,146-159
2f64 d2f64b1 B:25-40,41-45,146-159
2f64 d2f64a1 A:25-40,41-45,146-159
2f2t d2f2tb1 B:25-40,41-45,146-159
2f67 d2f67b1 B:25-40,41-45,146-159
2f2t d2f2ta1 A:25-40,41-45,146-159
2ef1 d2ef1b1 B:128-140,234-244,280-289
1f8y d1f8yb_ B:214-231,331-336,335-342
1f8y d1f8ya_ A:14-32,131-136,135-142
1f8x d1f8xa_ A:14-32,131-136,135-142
1f8x d1f8xb_ B:214-232,331-336,335-342
126. e.29.1 beta and beta-prime subunits of DNA dependent RNA-polymerase The catalytic site is formed by the association of two double-psi beta-barrel domains, one from each subunit !
beta and beta-prime subunits of DNA dependent RNA-polymerase Multidomain subunits of complex domain organization
2nvz d2nvzb1 B:1022-1039,1041-1045,1051-1063
2e2i d2e2ib1 B:1022-1039,1041-1045,1051-1063
1twa d1twab_ B:1022-1039,1041-1045,1051-1063
3cqz d3cqzb1 B:1022-1039,1041-1045,1051-1063
1i3q d1i3qb_ B:1022-1039,1041-1045,1051-1063
2nvy d2nvyb1 B:1022-1039,1041-1045,1051-1063
1twc d1twcb_ B:1022-1039,1041-1045,1051-1063
2b63 d2b63b1 B:1022-1039,1041-1045,1051-1063
2r92 d2r92b1 B:1022-1039,1041-1045,1051-1063
1twf d1twfb_ B:1022-1039,1041-1045,1051-1063
2e2h d2e2hb1 B:1022-1039,1041-1045,1051-1063
2ja7 d2ja7n1 N:1022-1039,1041-1045,1051-1063
2ja5 d2ja5b1 B:1022-1039,1041-1045,1051-1063
1k83 d1k83b_ B:1022-1039,1041-1045,1051-1063
1i6h d1i6hb_ B:1022-1039,1041-1045,1051-1063
2ja8 d2ja8b1 B:1022-1039,1041-1045,1051-1063
2ja7 d2ja7b1 B:1022-1039,1041-1045,1051-1063
2b8k d2b8kb1 B:1022-1039,1041-1045,1051-1063
3cqz d3cqzb1 B:57-67,90-100,408-430
1k83 d1k83b_ B:57-67,89-100,408-430
1k83 d1k83b_ B:57-67,164-172,408-430
2gho d2ghoc1 C:41-54,63-75,335-363
2o5j d2o5jc1 C:41-54,61-76,335-363
2ppb d2ppbm1 M:41-54,61-76,335-363
2a6h d2a6hm1 M:41-54,61-76,335-363
3cqz d3cqzb1 B:57-67,164-172,408-430
2ppb d2ppbc1 C:41-54,61-76,335-363
1iw7 d1iw7c_ C:41-54,61-76,335-363
2o5j d2o5jm1 M:41-54,61-76,335-363
2a68 d2a68m1 M:41-54,61-76,335-363
1i6v d1i6vc_ C:883-898,899-903,910-933
1smy d1smyc_ C:41-54,61-77,335-363
2o5i d2o5ic1 C:41-54,61-76,335-363
2a6h d2a6hc1 C:41-54,61-76,335-363
1zyr d1zyrm1 M:41-54,62-77,335-363
2a69 d2a69c1 C:41-54,61-76,335-363
2a68 d2a68c1 C:41-54,61-76,335-363
2be5 d2be5c1 C:41-54,61-76,335-363
2a6e d2a6ec1 C:41-54,61-76,335-363
2e2i d2e2ib1 B:57-69,88-99,408-436
3dxj d3dxjm1 M:41-54,63-76,335-362
2nvy d2nvyb1 B:57-67,89-100,408-436
2nvx d2nvxb1 B:57-68,89-100,408-436
2vum d2vumb1 B:57-68,90-99,408-435
1i6h d1i6hb_ B:56-65,168-172,408-436
2b63 d2b63b1 B:56-67,164-172,408-436
1iw7 d1iw7m_ M:41-54,60-77,335-363
1i3q d1i3qb_ B:57-68,89-100,408-436
1zyr d1zyrc1 C:41-54,63-76,335-362
1i50 d1i50b_ B:57-67,164-172,408-436
1twa d1twab_ B:57-67,89-100,408-436
1twa d1twab_ B:57-67,164-172,408-436
1twc d1twcb_ B:57-67,164-172,408-436
1twc d1twcb_ B:57-67,89-100,408-436
1twh d1twhb_ B:57-67,164-172,408-436
1twf d1twfb_ B:57-67,89-100,408-436
2nvx d2nvxb1 B:57-68,164-172,408-436
2yu9 d2yu9b1 B:57-67,89-100,408-436
1twg d1twgb_ B:57-67,164-172,408-436
2a69 d2a69c1 C:881-898,898-903,910-933
2vum d2vumb1 B:57-68,164-172,408-435
2a68 d2a68c1 C:881-898,898-903,910-933
2o5i d2o5ic1 C:881-898,898-903,910-933
2a6h d2a6hc1 C:881-898,898-903,910-933
2o5j d2o5jm1 M:881-898,898-903,910-933
2cw0 d2cw0c1 C:881-898,898-903,910-933
2be5 d2be5m1 M:881-898,898-903,910-933
2cw0 d2cw0m1 M:881-898,899-903,910-933
2nvx d2nvxa1 A:573-583,610-615,617-624
2be5 d2be5c1 C:881-898,898-903,910-933
2a6e d2a6ec1 C:881-898,898-904,910-933
2a69 d2a69m1 M:881-898,899-903,910-933
1iw7 d1iw7c_ C:881-898,898-903,910-933
2o5i d2o5im1 M:881-898,898-904,910-933
1ynn d1ynnc1 C:881-898,899-903,910-933
2a68 d2a68m1 M:881-898,899-903,910-933
2a6h d2a6hm1 M:881-898,898-904,910-933
2o5j d2o5jc1 C:881-898,898-904,910-933
2a6e d2a6em1 M:881-898,899-903,910-933
2ppb d2ppbm1 M:881-898,899-903,910-933
1iw7 d1iw7m_ M:881-898,899-903,910-933
1ynj d1ynjc1 C:881-898,899-903,910-933
2ppb d2ppbc1 C:881-898,899-903,910-933
1zyr d1zyrc1 C:881-898,899-903,910-933
1smy d1smyc_ C:881-898,898-903,910-933
1smy d1smym_ M:881-898,898-903,910-933
2gho d2ghoc1 C:881-898,899-903,910-933
3dxj d3dxjm1 M:881-898,899-903,910-933
1i3q d1i3qb_ B:57-68,164-171,408-436
2e2h d2e2hb1 B:57-69,164-171,408-436
3dxj d3dxjc1 C:881-898,898-903,910-933
2e2i d2e2ib1 B:57-69,164-172,408-436
2e2i d2e2ib1 B:750-757,803-807,1022-1039
2nvy d2nvyb1 B:750-757,803-807,1022-1039
2gho d2ghoc1 C:41-54,104-118,335-363
2nvy d2nvyb1 B:44-58,168-172,408-436
1i6h d1i6hb_ B:44-57,168-172,408-436
2nvz d2nvzb1 B:44-58,168-172,408-436
2e2j d2e2jb1 B:44-58,168-172,408-436
2yu9 d2yu9b1 B:44-58,168-172,408-436
1k83 d1k83b_ B:44-58,164-172,408-430
2gho d2ghoc1 C:270-282,330-335,487-494
3cqz d3cqzb1 B:44-58,164-172,408-430
2nvx d2nvxb1 B:44-58,164-172,408-436
1ynj d1ynjc1 C:19-31,105-120,335-363
2vum d2vumb1 B:44-58,164-172,408-435
2e2i d2e2ib1 B:44-58,164-172,408-436
2nvt d2nvtb1 B:44-58,164-172,408-436
1twa d1twab_ B:44-58,164-172,408-436
2nvq d2nvqb1 B:44-58,164-172,408-436
1twh d1twhb_ B:44-58,164-172,408-436
1twc d1twcb_ B:44-58,164-172,408-436
2ja5 d2ja5b1 B:44-58,164-172,408-437
2ja7 d2ja7b1 B:44-58,164-172,408-437
2ja7 d2ja7n1 N:44-58,164-172,408-437
1twg d1twgb_ B:44-58,164-172,408-436
2ja6 d2ja6b1 B:44-58,164-172,408-437
1i50 d1i50b_ B:44-58,164-172,408-436
2r92 d2r92b1 B:44-58,164-172,408-437
2b63 d2b63b1 B:44-57,164-172,408-436
127. d.133.1 Molybdenum cofactor-binding domain duplication: consists of 4 structural repeats arranged in 2 lobes ! contains one left-hand beta-alpha-beta unit per lobe !
Molybdenum cofactor-binding domain beta(2)-alpha-beta-alpha-beta; 2 layers: a/b; mixed sheet: order 1243: crossing loops
1sij d1sija4 A:391-404,409-414,427-441
1vlb d1vlba4 A:391-404,409-414,427-441
1dgj d1dgja4 A:392-405,411-416,429-443
1n5x d1n5xb5 B:768-781,786-792,801-820
1n5x d1n5xa5 A:768-781,786-792,801-820
1vdv d1vdvb5 B:768-781,786-792,803-820
1vdv d1vdva5 A:768-781,786-792,801-820
1sij d1sija4 A:656-670,678-682,698-720
1rm6 d1rm6a2 A:215-228,233-238,252-266
1vlb d1vlba4 A:656-673,678-682,698-720
1rm6 d1rm6d2 D:215-228,233-238,252-266
1sb3 d1sb3a2 A:215-228,233-238,252-266
1sb3 d1sb3d2 D:215-228,233-238,252-266
1jro d1jrof2 F:198-211,216-222,229-250
1fiq d1fiqc2 C:768-781,786-792,799-820
1jro d1jroh2 H:198-211,216-222,229-250
1jrp d1jrph2 H:198-211,216-222,229-250
1jro d1jrob2 B:198-211,216-222,229-250
1v97 d1v97a5 A:768-781,786-792,799-820
1n62 d1n62b2 B:241-254,259-264,278-292
1fo4 d1fo4b5 B:768-781,786-792,799-820
1v97 d1v97b5 B:768-781,786-792,799-820
1n60 d1n60b2 B:241-254,259-264,278-292
1fo4 d1fo4a5 A:768-781,786-792,799-820
1t3q d1t3qe2 E:225-238,243-248,262-276
1n62 d1n62e2 E:241-254,259-264,278-292
1t3q d1t3qb2 B:225-238,243-248,262-276
1jrp d1jrpf2 F:198-211,216-222,228-250
3b9j d3b9jc2 C:768-781,786-792,799-820
1jrp d1jrpd2 D:198-211,216-222,228-250
1n60 d1n60e2 E:241-254,259-264,278-292
1jro d1jrod2 D:198-211,216-222,228-250
1jrp d1jrpb2 B:198-211,216-222,228-250
1t3q d1t3qe2 E:509-523,528-533,547-577
1t3q d1t3qb2 B:509-523,528-533,547-577
1n62 d1n62e2 E:531-545,550-555,570-600
1n62 d1n62b2 B:531-545,550-555,570-600
1n60 d1n60e2 E:531-545,550-555,570-600
1n60 d1n60b2 B:531-545,550-555,570-600
1n63 d1n63e2 E:531-545,550-555,570-600
1zxi d1zxib2 B:531-545,550-555,570-600
1n63 d1n63b2 B:531-545,550-555,570-600
1n61 d1n61e2 E:531-545,550-555,570-600
1n61 d1n61b2 B:531-545,550-555,570-600
1n5w d1n5we2 E:531-545,550-555,570-600
1ffu d1ffue2 E:525-539,544-549,564-594
1n5w d1n5wb2 B:531-545,550-555,570-600
1ffv d1ffvb2 B:525-539,544-549,564-594
1ffv d1ffve2 E:525-539,544-549,564-594
1dgj d1dgja4 A:800-822,847-853,866-888
1ffv d1ffve2 E:685-707,736-741,754-776
1ffv d1ffvb2 B:685-707,736-741,754-776
1ffu d1ffue2 E:685-707,736-741,754-776
1ffu d1ffub2 B:685-707,736-741,754-776
1dgj d1dgja4 A:585-609,612-626,866-888
1n62 d1n62b2 B:691-713,742-747,760-785
1n62 d1n62e2 E:691-713,742-747,760-785
1n60 d1n60e2 E:691-713,742-747,760-785
1n60 d1n60b2 B:691-713,742-747,760-785
1n61 d1n61e2 E:691-713,742-747,760-785
1n63 d1n63b2 B:691-713,742-747,760-785
1n63 d1n63e2 E:691-713,742-747,760-785
1n61 d1n61b2 B:691-713,742-747,760-785
1jrp d1jrpd2 D:530-560,566-570,581-593
1jrp d1jrpf2 F:530-560,566-570,581-593
1jrp d1jrpf2 F:656-679,706-713,727-752
1jrp d1jrpb2 B:530-560,566-570,581-593
1jrp d1jrph2 H:530-560,566-570,581-593
1jro d1jrob2 B:530-560,566-570,581-593
1jro d1jrod2 D:530-560,566-570,581-593
1jrp d1jrph2 H:656-679,706-713,727-752
1jro d1jrof2 F:530-560,566-570,581-593
1jro d1jrob2 B:656-679,706-713,727-752
1jrp d1jrpb2 B:656-679,706-713,727-752
1jrp d1jrpd2 D:656-679,706-713,727-752
1zxi d1zxib2 B:691-713,742-747,761-785
1n5x d1n5xa5 A:1187-1209,1237-1244,1258-1286
1n5x d1n5xb5 B:1187-1209,1237-1244,1258-1286
1jro d1jroh2 H:530-560,566-570,581-593
1vdv d1vdvb5 B:1187-1209,1237-1244,1258-1286
1v97 d1v97b5 B:1187-1209,1237-1244,1258-1286
1n5w d1n5wb2 B:691-713,742-747,761-785
1jro d1jroh2 H:656-679,706-713,727-752
1fo4 d1fo4b5 B:1187-1209,1237-1244,1258-1286
1n5w d1n5we2 E:691-713,742-747,761-785
1jro d1jrod2 D:656-679,706-713,727-752
1v97 d1v97a5 A:1187-1209,1237-1244,1258-1287
1jro d1jrof2 F:656-679,706-713,727-752
1fo4 d1fo4a5 A:1187-1209,1237-1244,1258-1287
1fiq d1fiqc2 C:1187-1209,1237-1244,1258-1287
1t3q d1t3qe2 E:547-577,582-587,601-613
1t3q d1t3qb2 B:547-577,582-587,601-613
3b9j d3b9jc2 C:873-887,892-903,913-935
3b9j d3b9jc2 C:1187-1209,1237-1244,1259-1286
1rm6 d1rm6d2 D:655-677,703-712,723-745
1sb3 d1sb3a2 A:655-677,703-712,723-745
1sb3 d1sb3d2 D:655-677,703-712,723-745
1rm6 d1rm6a2 A:655-677,703-712,723-745
1jrp d1jrph2 H:303-317,322-334,344-365
1jrp d1jrpf2 F:303-317,322-334,344-365
1fo4 d1fo4a5 A:871-887,892-903,914-935
1jro d1jroh2 H:303-317,322-334,344-365
1rm6 d1rm6a2 A:523-553,558-563,577-590
1vdv d1vdva5 A:871-887,892-903,914-935
1vdv d1vdvb5 B:871-887,892-903,914-935
1fo4 d1fo4b5 B:871-887,892-903,914-935
1jrp d1jrpb2 B:303-317,322-334,343-365
1sb3 d1sb3a2 A:523-553,558-563,577-590
1vlb d1vlba4 A:494-506,514-525,534-556
1rm6 d1rm6d2 D:523-553,558-563,577-590
1sb3 d1sb3d2 D:523-553,558-563,577-590
1sij d1sija4 A:494-506,514-525,534-556
1jro d1jrob2 B:303-317,322-334,343-365
1jro d1jrof2 F:303-317,322-334,343-365
1jro d1jrod2 D:303-317,322-334,343-365
1jrp d1jrpd2 D:303-317,322-334,343-365
1fiq d1fiqc2 C:871-887,892-903,914-935
1t3q d1t3qb2 B:332-344,351-362,372-394
1v97 d1v97b5 B:871-887,892-903,913-935
1v97 d1v97a5 A:871-887,892-903,913-935
1sb3 d1sb3d2 D:319-336,338-350,359-381
1sb3 d1sb3a2 A:319-336,338-350,359-381
1n5x d1n5xa5 A:871-887,892-904,914-935
1n5x d1n5xb5 B:871-887,892-904,914-935
1t3q d1t3qe2 E:332-344,351-363,372-394
1rm6 d1rm6a2 A:317-336,338-350,359-381
1rm6 d1rm6d2 D:317-336,338-350,359-381
128. c.54.1 PTS system fructose IIA component-like active dimer is formed by strand 5 swapping !
PTS system fructose IIA component-like 3 layers: a/b/a; mixed beta-sheet of 5 strands, order 21345; strand 5 is antiparallel to the rest
3bed d3bedb1 B:10-26,60-66,93-103
3b48 d3b48a1 A:11-26,31-38,98-111
3b48 d3b48a1 A:11-26,62-69,98-111
3b48 d3b48b1 B:11-26,62-69,98-113
3b48 d3b48b1 B:11-26,31-38,98-113
3ct6 d3ct6b1 B:11-27,30-36,91-106
3b48 d3b48c1 C:11-26,30-38,98-114
3cr3 d3cr3d1 D:11-27,30-36,91-106
3ct6 d3ct6a1 A:11-27,30-36,91-106
3b48 d3b48f1 F:11-26,30-38,98-114
3cr3 d3cr3c1 C:11-27,30-36,91-106
3b48 d3b48e1 E:11-26,62-69,98-114
3b48 d3b48c1 C:11-26,62-69,98-114
3b48 d3b48e1 E:11-26,31-38,98-114
3b48 d3b48d1 D:11-26,31-38,98-114
3b48 d3b48d1 D:11-26,62-69,98-114
3bed d3beda1 A:11-26,60-66,93-103
3b48 d3b48f1 F:11-26,62-69,98-114
3ct6 d3ct6b1 B:11-27,59-66,91-106
3ct6 d3ct6a1 A:11-27,59-66,91-106
3cr3 d3cr3c1 C:11-27,59-66,91-106
3cr3 d3cr3d1 D:11-27,59-66,91-106
1vrc d1vrcb1 B:11-26,61-67,94-108
1vsq d1vsqa1 A:11-26,61-67,94-108
1vrc d1vrca1 A:11-26,61-67,94-108
1pdo d1pdoa_ A:11-26,61-67,94-108
1vsq d1vsqb1 B:11-26,61-67,94-108
2jzo d2jzoa1 A:11-26,61-67,94-108
2jzo d2jzob1 B:11-26,61-67,94-108
129. a.160.1 PAP/OAS1 substrate-binding domain this domain follows the catalytic nucleotidyltransferase domain !
PAP/OAS1 substrate-binding domain core: 5-helical bundle; up-and-down; right-handed twist
2pbe d2pbea1 A:174-203,204-208,212-220
130. d.296.1 YktB/PF0168-like
YktB/PF0168-like alpha-beta(4)-alpha-beta(2)-alpha-beta-alpha; 2 layers, a/b; antiparallel beta-sheet, order: 1234756; half-barrel shape; topological similarity to the MotA C-terminal domain-like fold (scop_cf 69651) and the Secretion chaperone-like fold (scop_cf 69634)
2a8e d2a8ea1 A:29-42,86-94,184-200
2a8e d2a8ea1 A:41-50,86-94,184-200
1yb3 d1yb3a1 A:2-29,65-72,146-165
131. e.3.1 beta-lactamase/transpeptidase-like
beta-lactamase/transpeptidase-like contains a cluster of helices and an alpha+beta sandwich
1u60 d1u60b_ B:243-255,256-262,289-304
1u60 d1u60c_ C:243-255,256-262,289-304
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2ffy d2ffyb1 B:63-81,221-226,226-240
1ceg d1cega_ A:61-79,238-243,243-257
1kvm d1kvmb_ B:63-81,221-226,226-240
1iel d1ielb_ B:63-81,221-226,226-240
1l0f d1l0fb_ B:63-81,221-226,226-240
1iki d1ikia_ A:61-79,238-243,243-257
2hds d2hdsb1 B:63-81,221-226,226-240
1my8 d1my8a_ A:63-81,221-226,226-240
1ll5 d1ll5b_ B:63-81,221-226,226-240
1iem d1iemb_ B:63-81,221-226,226-240
2hdq d2hdqb1 B:63-81,221-226,226-240
1ga9 d1ga9a_ A:63-81,221-226,226-240
1fcm d1fcmb_ B:60-78,218-223,223-237
2r9w d2r9wa1 A:63-81,221-226,226-240
2hdu d2hdub1 B:63-81,221-226,226-240
1mxo d1mxob_ B:63-81,221-226,226-240
1ll5 d1ll5a_ A:63-81,221-226,226-240
1ke3 d1ke3a_ A:63-81,221-226,226-240
2r9x d2r9xb1 B:63-81,221-226,226-240
1pi4 d1pi4a_ A:63-81,221-226,226-240
1llb d1llbb_ B:63-81,221-226,226-240
2hds d2hdsa1 A:63-81,221-226,226-240
2r9x d2r9xa1 A:63-81,221-226,226-240
1pi5 d1pi5a_ A:63-81,221-226,226-240
1kds d1kdsb_ B:63-81,221-226,226-240
2rcx d2rcxa1 A:63-81,221-226,226-240
2hdu d2hdua1 A:63-81,221-226,226-240
2ffy d2ffya1 A:63-81,221-226,226-240
2pu4 d2pu4a1 A:63-81,221-226,226-240
1fcn d1fcnb_ B:60-78,218-223,223-237
1fcm d1fcma_ A:59-78,219-223,223-237
1ke4 d1ke4a_ A:63-81,221-226,226-240
1kvm d1kvma_ A:63-81,221-226,226-240
1l0g d1l0ga_ A:63-81,221-226,226-240
1kdw d1kdwa_ A:63-81,221-226,226-240
1dy6 d1dy6b_ B:217-226,229-240,275-291
1llb d1llba_ A:63-81,221-226,226-240
1fsy d1fsya_ A:63-81,221-226,226-240
1bul d1bula_ A:217-226,255-268,275-290
2pu2 d2pu2a1 A:63-81,221-226,226-240
1ke0 d1ke0a_ A:63-81,221-226,226-240
1fsw d1fswa_ A:63-81,221-226,226-240
1mxo d1mxoa_ A:63-81,221-226,226-240
2r9w d2r9wb1 B:62-81,222-226,226-240
1iem d1iema_ A:63-81,221-226,226-240
1iel d1iela_ A:63-81,221-226,226-240
2hdr d2hdra1 A:63-81,221-226,226-240
2pu2 d2pu2b1 B:62-81,222-226,226-240
1l2s d1l2sa_ A:62-81,222-226,226-240
1l0f d1l0fa_ A:63-81,221-226,226-240
1l0d d1l0da_ A:63-81,221-226,226-240
1xgi d1xgia1 A:62-81,222-226,226-240
1my8 d1my8b_ B:62-81,222-226,226-240
1l0d d1l0db_ B:62-81,222-226,226-240
1l2s d1l2sb_ B:62-81,222-226,226-240
2i72 d2i72b1 B:62-81,222-226,226-240
1c3b d1c3ba_ A:62-81,222-226,226-240
1xgj d1xgja1 A:62-81,222-226,226-240
1ke4 d1ke4b_ B:62-81,222-226,226-240
1fr1 d1fr1b_ B:62-81,222-226,226-240
1bsg d1bsga_ A:217-226,255-268,275-291
1fcn d1fcna_ A:59-78,219-223,223-237
1xgi d1xgib1 B:62-81,222-226,226-240
1ll9 d1ll9a_ A:62-81,222-226,226-240
1ke3 d1ke3b_ B:62-81,222-226,226-240
1kds d1kdsa_ A:62-81,222-226,226-240
1dy6 d1dy6a_ A:217-226,229-240,275-291
1i5q d1i5qa_ A:62-81,222-226,226-240
1fsy d1fsyb_ B:62-81,222-226,226-240
1rgy d1rgya_ A:63-81,221-226,226-240
2hdr d2hdrb1 B:62-81,222-226,226-240
1ll9 d1ll9b_ B:62-81,222-226,226-240
1fco d1fcoa_ A:59-78,219-223,223-237
2pu4 d2pu4b1 B:63-81,221-226,226-240
1xgj d1xgjb1 B:62-81,222-226,226-240
2drw d2drwa1 A:59-77,243-248,248-262
1fsw d1fswb_ B:62-81,222-226,226-240
1o07 d1o07b_ B:62-81,222-226,226-240
2p9v d2p9va1 A:62-81,222-226,226-240
2drw d2drwb1 B:59-77,243-248,248-262
1ga9 d1ga9b_ B:63-81,221-226,226-240
2dns d2dnsd1 D:59-77,243-248,248-262
1bue d1buea_ A:217-225,255-268,275-290
1kvl d1kvlb_ B:62-81,222-226,226-240
1onh d1onha_ A:62-81,225-229,229-243
1o07 d1o07a_ A:62-81,222-226,226-240
1kvl d1kvla_ A:62-81,222-226,226-240
1kdw d1kdwb_ B:62-81,222-226,226-240
2drw d2drwe1 E:59-77,243-248,248-262
2efu d2efua1 A:59-77,243-248,248-262
1ke0 d1ke0b_ B:62-81,222-226,226-240
2efu d2efud1 D:59-77,243-248,248-262
2dns d2dnsb1 B:59-77,243-248,248-262
2drw d2drwd1 D:59-77,243-248,248-262
3bls d3blsa_ A:62-81,222-226,226-240
2efx d2efxc1 C:59-77,243-248,248-262
2hdq d2hdqa1 A:62-81,222-226,226-240
2efx d2efxb1 B:59-77,243-248,248-262
2efu d2efub1 B:59-77,243-248,248-262
2dns d2dnse1 E:59-77,243-248,248-262
1fr1 d1fr1a_ A:62-81,222-226,226-240
2efu d2efuc1 C:59-77,243-248,248-262
1q2q d1q2qa_ A:63-81,224-229,229-243
1fr6 d1fr6a_ A:62-81,222-226,226-240
2q9n d2q9na1 A:62-81,222-226,226-240
1bls d1blsb_ B:62-81,222-226,226-240
2drw d2drwf1 F:59-77,243-248,248-262
2efx d2efxd1 D:59-77,243-248,248-262
2efu d2efuf1 F:59-77,243-248,248-262
1xx2 d1xx2b_ B:1063-1081,1221-1226,1226-1240
2dns d2dnsc1 C:59-77,243-248,248-262
1gce d1gcea_ A:62-81,225-229,229-243
2efx d2efxe1 E:59-77,243-248,248-262
1xx2 d1xx2a_ A:62-81,222-226,226-240
2q9m d2q9ma1 A:63-81,221-226,226-240
2dns d2dnsf1 F:59-77,243-248,248-262
1ci9 d1ci9b_ B:76-92,275-280,280-294
1ei5 d1ei5a3 A:61-77,226-231,231-249
1e25 d1e25a_ A:217-225,256-269,271-297
2ex8 d2ex8a1 A:402-409,413-422,457-477
2ex2 d2ex2a1 A:402-409,413-422,457-477
1e25 d1e25a_ A:217-225,230-240B,271-297
132. c.56.3 Peptidyl-tRNA hydrolase-like
Phosphorylase/hydrolase-like core: 3 layers, a/b/a ; mixed sheet of 5 strands: order 21354; strand 4 is antiparallel to the rest; contains crossover loops
1ryn d1ryna_ A:20-37,130-138,155-180
1rym d1ryma_ A:19-36,129-137,154-179
1ryn d1ryna_ A:20-37,88-96,155-180
1rym d1ryma_ A:19-36,87-95,154-179
1ryb d1ryba_ A:19-36,127-137,154-179
1ryb d1ryba_ A:19-36,87-95,154-179
2pth d2ptha_ A:21-35,87-95,154-179
2pth d2ptha_ A:21-35,127-136,154-179
133. c.56.8 Cgl1923-like
Phosphorylase/hydrolase-like core: 3 layers, a/b/a ; mixed sheet of 5 strands: order 21354; strand 4 is antiparallel to the rest; contains crossover loops
2p90 d2p90a1 A:40-53,133-143,210-226
2p90 d2p90c1 C:40-53,131-143,210-226
2p90 d2p90b1 B:40-53,131-143,210-226
2p90 d2p90a1 A:40-53,193-202,210-226
2p90 d2p90c1 C:40-53,193-202,210-226
2p90 d2p90b1 B:40-53,193-202,210-226
134. c.52.4 TBP-interacting protein-like contains extra C-terminal alpha+beta domain of complex fold with an embeded C2H2 zinc-finger
Restriction endonuclease-like core: 3 layers, a/b/a; mixed beta-sheet of 5 strands, order 12345; strands 2 &, in some families, 5 are antiparallel to the rest
2czr d2czra1 A:6-20,63-69,85-101
2czr d2czra1 A:6-20,38-47,85-101
2czr d2czra1 A:6-20,80-85,85-101
135. a.94.1 Ribosomal protein L19 (L19e)
Ribosomal protein L19 (L19e) multihelical; consists of two different 3-helical domains connected by a long, partly helical linker
1yj9 d1yj9p1 P:2-15,20-24,27-35
1ffk d1ffkm_ M:2-15,20-24,27-35
3ccr d3ccrp1 P:2-15,20-24,27-35
1vql d1vqlp1 P:2-15,20-24,27-35
1vq7 d1vq7p1 P:2-15,20-24,27-35
3cma d3cmap1 P:2-15,20-24,27-35
1vq4 d1vq4p1 P:2-15,20-24,27-35
1vqm d1vqmp1 P:2-15,20-24,27-35
1yij d1yijp1 P:2-15,20-24,27-35
1yjn d1yjnp1 P:2-15,20-24,27-35
1vqp d1vqpp1 P:2-15,20-24,27-35
1vq8 d1vq8p1 P:2-15,20-24,27-35
3ccq d3ccqp1 P:2-15,20-24,27-35
3cc2 d3cc2p1 P:2-15,20-24,27-35
1s72 d1s72p_ P:2-15,20-24,27-35
1vqn d1vqnp1 P:2-15,20-24,27-35
1vqk d1vqkp1 P:2-15,20-24,27-35
1nji d1njiq_ Q:2-15,20-24,27-35
1vqo d1vqop1 P:2-15,20-24,27-35
1jj2 d1jj2o_ O:2-15,20-24,27-35
1yit d1yitp1 P:2-15,20-24,27-35
1yi2 d1yi2p1 P:2-15,20-24,27-35
1m90 d1m90q_ Q:2-15,20-24,27-35
3ccu d3ccup1 P:2-15,20-24,27-35
1yhq d1yhqp1 P:2-15,20-24,27-35
3ccm d3ccmp1 P:2-15,20-24,27-35
1q7y d1q7yq_ Q:2-15,20-24,27-35
3cce d3ccep1 P:2-15,20-24,27-35
3cd6 d3cd6p1 P:2-15,20-24,27-35
3cpw d3cpwo1 O:2-15,20-24,27-35
1vq5 d1vq5p1 P:2-15,20-24,27-35
2otl d2otlp1 P:2-15,20-24,27-35
3cc7 d3cc7p1 P:2-15,20-24,27-35
3ccv d3ccvp1 P:2-15,20-24,27-35
1qvf d1qvfo_ O:2-15,20-24,27-35
1kc8 d1kc8q_ Q:2-15,20-24,27-35
1kqs d1kqso_ O:2-15,20-24,27-35
3cc4 d3cc4p1 P:2-15,20-24,27-35
1k73 d1k73q_ Q:2-15,20-24,27-35
1qvg d1qvgo_ O:2-15,20-24,27-35
1kd1 d1kd1q_ Q:2-15,20-24,27-35
3cme d3cmep1 P:2-15,20-24,27-35
2qa4 d2qa4p1 P:2-15,20-24,27-35
1k9m d1k9mq_ Q:2-15,20-24,27-35
1n8r d1n8rq_ Q:2-15,20-24,27-35
1vq9 d1vq9p1 P:2-15,20-24,27-35
1q82 d1q82q_ Q:2-15,20-24,27-35
1vq6 d1vq6p1 P:2-15,20-24,27-35
2otj d2otjp1 P:2-15,20-24,27-35
1q86 d1q86q_ Q:2-15,20-24,27-35
1m1k d1m1kq_ Q:2-15,20-24,27-35
1k8a d1k8aq_ Q:2-15,20-24,27-35
3ccl d3cclp1 P:2-15,20-24,27-35
2qex d2qexp1 P:2-15,20-24,27-35
3ccs d3ccsp1 P:2-15,20-24,27-35
1yjw d1yjwp1 P:2-15,20-24,27-35
1q81 d1q81q_ Q:2-15,20-24,27-35
136. c.56.4 Pyrrolidone carboxyl peptidase (pyroglutamate aminopeptidase)
Phosphorylase/hydrolase-like core: 3 layers, a/b/a ; mixed sheet of 5 strands: order 21354; strand 4 is antiparallel to the rest; contains crossover loops
1ioi d1ioib_ B:17-27,62-71,188-208
1a2z d1a2zc_ C:18-28,63-72,190-212
1ioi d1ioic_ C:17-27,62-71,188-208
1ioi d1ioia_ A:17-27,62-71,188-208
1a2z d1a2zb_ B:18-28,63-72,190-212
1ioi d1ioid_ D:17-27,62-71,188-208
1a2z d1a2zd_ D:18-28,63-72,190-212
1a2z d1a2za_ A:18-28,63-72,190-212
1iof d1iofc_ C:17-27,62-71,188-208
1iof d1iofb_ B:17-27,62-71,188-208
1iof d1iofd_ D:17-27,62-71,188-208
1iof d1iofa_ A:17-27,62-71,188-208
1aug d1auga_ A:19-29,64-73,185-204
1aug d1augd_ D:649-659,694-703,815-834
1aug d1augb_ B:229-239,274-283,395-414
1aug d1augc_ C:439-449,484-493,605-624
1iu8 d1iu8b_ B:17-31,59-68,181-205
1iu8 d1iu8a_ A:17-31,59-68,181-206
1a2z d1a2zc_ C:18-28,161-170,190-212
1a2z d1a2zd_ D:18-28,161-170,190-212
1a2z d1a2zb_ B:18-28,161-170,190-212
1a2z d1a2za_ A:18-28,161-170,190-212
1ioi d1ioia_ A:17-27,160-169,188-208
1ioi d1ioic_ C:17-27,160-169,188-208
1ioi d1ioib_ B:17-27,160-169,188-208
1ioi d1ioid_ D:17-27,160-169,188-208
1iof d1iofd_ D:17-27,160-169,188-208
1iof d1iofa_ A:17-27,160-169,188-208
1iof d1iofc_ C:17-27,160-169,188-208
1iof d1iofb_ B:17-27,160-169,188-208
1aug d1auga_ A:19-29,162-171,185-204
1aug d1augd_ D:649-659,792-801,815-834
1aug d1augb_ B:229-239,372-381,395-414
1aug d1augc_ C:439-449,582-591,605-624
1iu8 d1iu8b_ B:17-31,156-166,181-205
1iu8 d1iu8a_ A:17-31,156-166,181-206
1iu8 d1iu8b_ B:17-31,32-39,181-205
1iu8 d1iu8a_ A:17-31,32-39,181-206
137. c.93.1 Periplasmic binding protein-like I Similar in architecture to the superfamily II but partly differs in topology !
Periplasmic binding protein-like I consists of two similar intertwined domain with 3 layers (a/b/a) each: duplication ! parallel beta-sheet of 6 strands, order 213456
1jhz d1jhzb_ B:71-89,117-123,293-312
3ckm d3ckma1 A:269-285,314-320,510-530
1dbq d1dbqa_ A:71-89,117-123,293-312
1zvv d1zvvg2 G:72-90,118-123,293-311
1jhz d1jhza_ A:71-89,117-123,293-311
1dbq d1dbqb_ B:71-89,117-123,293-312
1zvv d1zvvg2 G:72-90,140-146,293-311
2nzv d2nzvg1 G:72-90,140-146,293-311
2liv d2liva_ A:13-37,71-77,274-295
2nzu d2nzug1 G:72-90,140-146,293-311
1zvv d1zvva2 A:72-90,118-123,293-311
1zvv d1zvvb2 B:72-90,140-146,293-311
1zvv d1zvva2 A:72-90,140-146,293-311
1sxg d1sxgf_ F:72-90,140-146,293-311
1bdi d1bdia2 A:71-89,117-123,293-312
1pnr d1pnra2 A:71-89,117-123,293-312
1qp7 d1qp7a2 A:71-89,117-122,293-312
2nzv d2nzvg1 G:72-90,117-123,293-311
1zvv d1zvvb2 B:72-90,118-123,293-311
2hsg d2hsga2 A:72-90,141-146,293-311
1sxi d1sxim_ M:72-90,118-123,293-311
1sxi d1sxim_ M:72-90,140-146,293-311
2nzu d2nzug1 G:72-90,118-123,293-311
1byk d1byka_ A:74-92,120-126,283-301
1rzr d1rzrc2 C:72-90,118-123,293-311
1byk d1bykb_ B:74-92,120-126,283-301
1rzr d1rzrc2 C:72-90,140-146,293-311
1sxg d1sxgd_ D:72-90,140-146,293-311
1jh9 d1jh9a2 A:71-89,117-122,293-312
1rzr d1rzrd2 D:72-90,118-123,293-311
2pua d2puaa2 A:71-89,117-122,293-312
1rzr d1rzrg2 G:72-90,140-146,293-311
1qqa d1qqaa2 A:71-89,117-122,293-312
1rzr d1rzra2 A:72-90,140-146,293-311
1sxg d1sxgd_ D:72-90,118-123,293-311
1qp4 d1qp4a2 A:71-89,117-122,293-312
2qw1 d2qw1a1 A:14-32,85-91,257-275
3ckm d3ckma1 A:269-285,338-344,510-530
1qp0 d1qp0a2 A:71-89,117-122,293-312
1wet d1weta2 A:71-89,117-122,293-312
1qqb d1qqba2 A:71-89,117-122,293-312
1jye d1jyea_ A:73-91,119-128,292-310
2puc d2puca2 A:71-89,117-122,293-312
1bdh d1bdha2 A:71-89,117-122,293-312
1byk d1byka_ A:74-92,141-146,283-301
1byk d1bykb_ B:74-92,141-146,283-301
2pub d2puba2 A:71-89,116-122,293-312
1sxg d1sxgf_ F:72-90,117-123,293-311
1qpz d1qpza2 A:71-89,117-122,293-312
2pug d2puga2 A:71-89,117-122,293-312
1vpw d1vpwa2 A:71-89,117-122,293-312
2pud d2puda2 A:71-89,116-122,293-312
1qnl d1qnla_ A:20-42,77-81,283-304
1rzr d1rzrg2 G:72-90,118-123,293-311
2fw0 d2fw0a1 A:14-32,85-91,257-275
2qw1 d2qw1a1 A:14-32,61-67,257-275
1sxh d1sxha_ A:72-90,140-146,293-311
2puf d2pufa2 A:71-89,117-122,293-312
1rzr d1rzrd2 D:72-90,141-146,293-311
1pea d1peaa_ A:20-42,77-81,283-304
1jdp d1jdpb_ B:23-40,84-89,310-334
1sxh d1sxha_ A:72-90,118-124,293-311
2hsg d2hsga2 A:72-90,116-123,293-311
2fvy d2fvya1 A:14-32,85-91,257-275
1zhh d1zhha1 A:80-97,153-159,311-329
2gbp d2gbpa_ A:14-32,86-91,257-275
1jft d1jfta2 A:71-89,117-122,293-312
1rzr d1rzra2 A:72-90,118-123,293-311
1jdp d1jdpa_ A:23-40,84-89,310-334
1zay d1zaya2 A:71-89,117-122,293-312
2pue d2puea2 A:71-89,117-122,293-312
1gca d1gcaa_ A:14-32,85-91,257-275
2fw0 d2fw0a1 A:14-32,61-67,257-275
1sxi d1sxir_ R:72-90,141-146,293-311
1tm2 d1tm2a_ A:39-57,86-92,267-285
2fvy d2fvya1 A:14-32,61-67,257-275
1jdn d1jdna_ A:23-40,84-89,310-334
1glg d1glga_ A:14-32,61-67,257-275
1sxi d1sxig_ G:72-90,118-123,293-311
1gca d1gcaa_ A:14-32,61-67,257-275
1tm2 d1tm2a_ A:39-57,110-117,267-285
3ckm d3ckma1 A:269-285,289-296,510-530
1lbi d1lbib_ B:73-91,120-128,292-311
1glg d1glga_ A:14-32,86-91,257-275
2pe5 d2pe5c2 C:73-91,120-128,292-310
1lbg d1lbgb2 B:73-91,120-125,292-311
2gbp d2gbpa_ A:14-32,61-66,257-275
1qo0 d1qo0b_ B:20-42,77-81,283-304
1lbg d1lbgc2 C:73-91,120-125,292-311
9abp d9abpa_ A:14-32,83-89,255-274
1gcg d1gcga_ A:14-32,85-91,257-275
1abe d1abea_ A:14-32,83-89,255-274
1lbg d1lbgd2 D:73-91,120-125,292-311
2oen d2oeng1 G:72-90,118-123,293-311
1sxh d1sxhd_ D:72-90,140-146,293-311
1gcg d1gcga_ A:14-32,61-67,257-275
3gbp d3gbpa_ A:14-32,85-91,257-275
2hph d2hpha1 A:14-32,85-91,257-275
1lbg d1lbga2 A:73-91,120-125,292-311
1bap d1bapa_ A:14-32,83-89,255-274
6abp d6abpa_ A:14-32,83-89,255-274
1zhh d1zhha1 A:80-97,129-134,311-329
2pe5 d2pe5b2 B:73-91,120-128,292-310
1sxi d1sxii_ I:72-90,118-123,293-311
1tm2 d1tm2a_ A:39-57,58-64,267-285
8abp d8abpa_ A:14-32,83-89,255-274
2hph d2hpha1 A:14-32,61-67,257-275
1abf d1abfa_ A:14-32,83-89,255-274
7abp d7abpa_ A:14-32,83-89,255-274
3gbp d3gbpa_ A:14-32,61-67,257-275
1sxi d1sxig_ G:72-90,140-146,293-311
1efa d1efaa2 A:73-91,120-128,292-310
1efa d1efac2 C:73-91,120-128,292-310
1sxg d1sxgb_ B:72-90,140-146,293-311
1sxi d1sxia_ A:72-90,140-146,293-311
1usk d1uskc_ C:15-37,71-77,274-295
1sxi d1sxib_ B:72-90,140-146,293-311
1pea d1peaa_ A:20-42,100-109,283-304
1sxi d1sxil_ L:72-90,140-146,293-311
1sxi d1sxib_ B:72-90,118-123,293-311
5abp d5abpa_ A:14-32,83-89,255-274
1sxh d1sxhd_ D:72-90,117-123,293-311
9abp d9abpa_ A:14-32,33-40,255-274
1usk d1uskd_ D:15-37,71-77,274-295
9abp d9abpa_ A:14-32,58-64,255-274
1apb d1apba_ A:14-32,83-89,255-274
1jwl d1jwlc_ C:73-91,120-128,292-310
1sxg d1sxgb_ B:72-90,118-123,293-311
1tjy d1tjya_ A:39-57,58-64,267-285
1jwl d1jwla2 A:73-91,120-128,292-310
2oen d2oeng1 G:72-90,140-146,293-311
1qnl d1qnla_ A:20-42,100-109,283-304
1sxi d1sxit_ T:72-90,117-124,293-311
1jwl d1jwlb2 B:73-91,120-128,292-310
1efa d1efab2 B:73-91,120-128,292-310
1jfs d1jfsa2 A:71-89,118-122,293-312
6abp d6abpa_ A:14-32,59-64,255-274
1sxi d1sxit_ T:72-90,140-146,293-311
1tlf d1tlfc_ C:73-91,120-128,292-310
1abe d1abea_ A:14-32,58-64,255-274
7abp d7abpa_ A:14-32,33-40,255-274
8abp d8abpa_ A:14-32,58-64,255-274
6abp d6abpa_ A:14-32,33-40,255-274
8abp d8abpa_ A:14-32,33-40,255-274
1usk d1uskb_ B:15-37,71-77,274-295
1urp d1urpc_ C:13-31,84-89,236-254
7abp d7abpa_ A:14-32,58-64,255-274
1usi d1usia_ A:15-37,71-77,274-295
1bap d1bapa_ A:14-32,33-40,255-274
1abe d1abea_ A:14-32,33-40,255-274
1bap d1bapa_ A:14-32,58-64,255-274
1sxi d1sxil_ L:72-90,118-123,293-311
1sxg d1sxgp_ P:72-90,140-146,293-311
5abp d5abpa_ A:14-32,58-64,255-274
1abf d1abfa_ A:14-32,58-64,255-274
1urp d1urpd_ D:13-31,84-89,236-254
1qo0 d1qo0a_ A:20-42,77-81,283-304
1apb d1apba_ A:14-32,33-40,255-274
1apb d1apba_ A:14-32,58-64,255-274
1abf d1abfa_ A:14-32,33-40,255-274
1usk d1uska_ A:15-37,71-77,274-295
5abp d5abpa_ A:14-32,33-40,255-274
1tlf d1tlfb_ B:73-91,120-128,292-310
1ba2 d1ba2a_ A:13-31,59-65,236-254
1ba2 d1ba2a_ A:13-31,83-89,236-254
1sxi d1sxii_ I:72-90,140-146,293-311
1sxi d1sxik_ K:72-90,140-146,293-311
1qo0 d1qo0b_ B:20-42,100-109,283-304
1sxi d1sxir_ R:72-90,119-123,293-311
2lbp d2lbpa_ A:13-37,71-77,274-295
1tjy d1tjya_ A:39-57,110-117,267-285
1jye d1jyea_ A:73-91,144-149,292-310
1urp d1urpa_ A:13-31,84-89,236-254
1sxg d1sxgp_ P:72-90,118-124,293-311
1sxg d1sxgi_ I:72-90,140-146,293-311
1sxi d1sxik_ K:72-90,118-123,293-311
1tjy d1tjya_ A:39-57,86-92,267-285
1urp d1urpb_ B:13-31,84-89,236-254
1sxi d1sxiw_ W:72-90,140-146,293-311
1sxi d1sxin_ N:72-90,118-124,293-311
1usi d1usic_ C:15-37,71-77,274-295
2pe5 d2pe5a2 A:73-91,120-128,292-310
1sxi d1sxia_ A:72-90,117-123,293-311
1ba2 d1ba2b_ B:13-31,83-89,236-254
1sxi d1sxid_ D:72-90,140-146,293-311
1sxg d1sxgi_ I:72-90,118-123,293-311
1byk d1byka_ A:74-92,152-158,283-301
1gud d1guda_ A:13-31,33-38,248-267
1byk d1bykb_ B:74-92,152-158,283-301
1gud d1gudb_ B:13-31,32-38,248-267
2qw1 d2qw1a1 A:14-32,34-42,257-275
1lbi d1lbid_ D:73-91,120-128,292-310
1drk d1drka_ A:13-31,84-89,236-254
1gca d1gcaa_ A:14-32,34-42,257-275
1tlf d1tlfd_ D:73-91,120-128,292-310
1drj d1drja_ A:13-31,84-89,236-254
3gbp d3gbpa_ A:14-32,34-42,257-275
1sxi d1sxiw_ W:72-90,118-124,293-311
1sxi d1sxin_ N:72-90,140-146,293-311
1dbp d1dbpa_ A:13-31,84-89,236-254
2dri d2dria_ A:13-31,84-89,236-254
1ba2 d1ba2b_ B:13-31,59-65,236-254
1usg d1usga_ A:13-37,71-77,274-295
1lbh d1lbha_ A:73-91,120-128,292-310
1urp d1urpc_ C:13-31,60-65,236-254
1qo0 d1qo0a_ A:20-42,100-109,283-304
2p9h d2p9ha1 A:73-91,120-128,292-310
1urp d1urpd_ D:13-31,60-65,236-254
1sxi d1sxid_ D:72-90,118-124,293-311
1t34 d1t34a_ A:19-38,79-84,312-339
1drk d1drka_ A:13-31,59-64,236-254
1lbi d1lbic_ C:73-91,120-128,292-310
1dp4 d1dp4c_ C:19-38,79-84,312-339
2pe5 d2pe5c2 C:73-91,143-149,292-310
1zhh d1zhha1 A:80-97,173-178,311-329
1drj d1drja_ A:13-31,59-64,236-254
1dp4 d1dp4a_ A:19-38,79-84,312-339
1t34 d1t34b_ B:19-38,79-84,312-339
1urp d1urpa_ A:13-31,60-65,236-254
1jdp d1jdpb_ B:23-40,51-61,310-334
1dbp d1dbpa_ A:13-31,59-64,236-254
2p9h d2p9hb1 B:73-91,120-128,292-310
1tlf d1tlfa_ A:73-91,120-128,292-310
2dri d2dria_ A:13-31,59-64,236-254
1urp d1urpb_ B:13-31,60-65,236-254
1usk d1uskd_ D:15-37,42-50,274-295
2hj9 d2hj9a1 A:79-97,153-159,311-329
1lbi d1lbib_ B:73-91,143-149,292-311
2hsg d2hsga2 A:72-90,91-98,293-311
1usk d1uskb_ B:15-37,42-50,274-295
1jx6 d1jx6a_ A:79-97,153-159,311-329
1jyf d1jyfa_ A:73-91,120-128,292-310
1lbh d1lbhb_ B:73-91,120-128,292-310
1efa d1efac2 C:73-91,143-149,292-310
1efa d1efaa2 A:73-91,143-149,292-310
1ewk d1ewkb_ B:71-93,156-162,407-433
2liv d2liva_ A:13-37,94-100,274-295
2liv d2liva_ A:13-37,43-51,274-295
2lbp d2lbpa_ A:13-37,42-51,274-295
1usk d1uska_ A:15-37,42-50,274-295
1gub d1guba_ A:13-31,33-38,248-267
1usk d1uskc_ C:15-37,42-51,274-295
1efa d1efab2 B:73-91,143-149,292-310
1sxg d1sxga_ A:72-90,118-124,293-311
1jdn d1jdna_ A:23-40,52-61,310-334
1ewv d1ewvb_ B:71-93,156-161,407-433
1usi d1usia_ A:15-37,42-51,274-295
1lbi d1lbia_ A:73-91,120-128,292-310
2pe5 d2pe5b2 B:73-91,144-149,292-310
2hj9 d2hj9b1 B:79-97,153-159,311-329
2paf d2pafb1 B:73-91,120-128,292-310
1sxg d1sxga_ A:72-90,140-146,293-311
1ewt d1ewtb_ B:71-93,156-161,407-433
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1gud d1guda_ A:13-31,59-66,248-267
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2fw0 d2fw0a1 A:14-32,33-42,257-275
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1usk d1uskd_ D:15-37,94-100,274-295
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1gub d1guba_ A:13-31,85-91,248-267
1pnr d1pnra2 A:71-89,90-96,293-312
1tlf d1tlfd_ D:73-91,144-149,292-310
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1iss d1issb_ B:71-93,156-161,407-433
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1pea d1peaa_ A:20-42,49-54,283-304
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1qo0 d1qo0b_ B:20-42,49-54,283-304
1lbh d1lbha_ A:73-91,144-149,292-310
1jye d1jyea_ A:73-91,92-99,292-310
1jx6 d1jx6a_ A:79-97,129-134,311-329
1urp d1urpc_ C:13-31,32-40,236-254
1bdi d1bdia2 A:71-89,90-96,293-312
1iss d1issa_ A:71-93,156-161,407-433
1lbg d1lbgb2 B:73-91,92-99,292-311
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1urp d1urpd_ D:13-31,98-104,236-254
2p9h d2p9ha1 A:73-91,144-149,292-310
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1tlf d1tlfa_ A:73-91,144-149,292-310
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1qo0 d1qo0a_ A:20-42,49-55,283-304
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1urp d1urpa_ A:13-31,32-40,236-254
2p9h d2p9hb1 B:73-91,144-149,292-310
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1lbi d1lbia_ A:73-91,144-149,292-310
1urp d1urpb_ B:13-31,32-40,236-254
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1ba2 d1ba2b_ B:13-31,32-40,236-254
2nzu d2nzug1 G:72-90,155-159,293-311
1zvv d1zvvg2 G:72-90,91-99,293-311
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1rzr d1rzrd2 D:72-90,91-99,293-311
2pe5 d2pe5a2 A:73-91,92-99,292-310
1ewk d1ewka_ A:71-93,156-161,409-433
1drj d1drja_ A:13-31,32-40,236-254
1drk d1drka_ A:13-31,32-40,236-254
1lbh d1lbhc_ C:73-91,144-149,292-310
1iss d1issb_ B:71-93,100-108,407-433
2paf d2pafa1 A:73-91,144-149,292-310
1zvv d1zvva2 A:72-90,91-99,293-311
2nzv d2nzvg1 G:72-90,91-99,293-311
1tlf d1tlfb_ B:73-91,92-99,292-310
2dri d2dria_ A:13-31,32-40,236-254
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1t34 d1t34b_ B:19-38,44-54,312-339
1iss d1issa_ A:71-93,100-108,407-433
1lbi d1lbib_ B:73-91,92-99,292-311
1rzr d1rzra2 A:72-90,91-99,293-311
2oen d2oeng1 G:72-90,91-99,293-311
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1isr d1isra_ A:71-93,156-161,409-433
2nzu d2nzug1 G:72-90,91-99,293-311
1byk d1byka_ A:74-92,93-101,283-301
1lbh d1lbhb_ B:73-91,92-99,292-310
1byk d1bykb_ B:74-92,93-101,283-301
1jh9 d1jh9a2 A:71-89,90-98,293-312
1sxg d1sxgf_ F:72-90,91-99,293-311
1tlf d1tlfd_ D:73-91,92-99,292-310
1ewv d1ewva_ A:71-93,100-108,409-433
1lbh d1lbha_ A:73-91,92-99,292-310
1usg d1usga_ A:13-37,94-99,274-295
1ewt d1ewta_ A:71-93,100-108,409-433
2pe5 d2pe5c2 C:73-91,92-100,292-310
1rpj d1rpja_ A:13-31,33-40,248-267
1wet d1weta2 A:71-89,90-98,293-312
2p9h d2p9ha1 A:73-91,92-99,292-310
1qqa d1qqaa2 A:71-89,90-98,293-312
2puc d2puca2 A:71-89,90-98,293-312
2p9h d2p9hb1 B:73-91,92-99,292-310
2puf d2pufa2 A:71-89,90-98,293-312
2pub d2puba2 A:71-89,90-98,293-312
2pe5 d2pe5b2 B:73-91,92-100,292-310
1bdh d1bdha2 A:71-89,90-98,293-312
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1vpw d1vpwa2 A:71-89,90-98,293-312
1qqb d1qqba2 A:71-89,90-98,293-312
1lbh d1lbhc_ C:73-91,92-99,292-310
1tlf d1tlfa_ A:73-91,92-99,292-310
2pug d2puga2 A:71-89,90-98,293-312
1lbi d1lbid_ D:73-91,92-99,292-310
1jfs d1jfsa2 A:71-89,90-98,293-312
1ewk d1ewkb_ B:71-93,181-186,407-433
1qp0 d1qp0a2 A:71-89,90-98,293-312
1sxi d1sxim_ M:72-90,91-99,293-311
1qpz d1qpza2 A:71-89,90-98,293-312
1jyf d1jyfa_ A:73-91,92-99,292-310
1ewk d1ewka_ A:71-93,100-108,409-433
1jft d1jfta2 A:71-89,90-98,293-312
1zay d1zaya2 A:71-89,90-98,293-312
1efa d1efac2 C:73-91,92-100,292-310
1efa d1efaa2 A:73-91,92-100,292-310
1jwl d1jwlc_ C:73-91,92-100,292-310
2paf d2pafa1 A:73-91,92-99,292-310
1jwl d1jwla2 A:73-91,92-100,292-310
1lbh d1lbhd_ D:73-91,92-99,292-310
1jwl d1jwlb2 B:73-91,92-100,292-310
2paf d2pafb1 B:73-91,92-99,292-310
1efa d1efab2 B:73-91,92-100,292-310
1isr d1isra_ A:71-93,100-108,409-433
1sxi d1sxib_ B:72-90,91-99,293-311
1sxi d1sxil_ L:72-90,91-99,293-311
1sxg d1sxgb_ B:72-90,91-99,293-311
1sxh d1sxha_ A:72-90,91-99,293-311
1sxi d1sxit_ T:72-90,91-99,293-311
1sxh d1sxhd_ D:72-90,91-99,293-311
1sxi d1sxik_ K:72-90,91-99,293-311
1sxi d1sxig_ G:72-90,91-99,293-311
1lbi d1lbic_ C:73-91,92-100,292-310
1sxi d1sxii_ I:72-90,91-99,293-311
1sxi d1sxin_ N:72-90,91-99,293-311
1sxi d1sxia_ A:72-90,91-99,293-311
1lbi d1lbia_ A:73-91,92-100,292-310
1sxi d1sxid_ D:72-90,91-99,293-311
1sxg d1sxgp_ P:72-90,91-99,293-311
1sxg d1sxgi_ I:72-90,91-99,293-311
1sxi d1sxiw_ W:72-90,91-99,293-311
1sxg d1sxga_ A:72-90,91-99,293-311
138. d.185.1 LuxS/MPP-like metallohydrolase Share the same "active site motif" HxxEH located in the first core helix, but differ in one of the zinc-binding residues !
LuxS/MPP-like metallohydrolase core: beta-alpha-beta(2)-alpha(2); 2 layers: alpha/beta
1q2l d1q2la2 A:652-667,742-750,946-954
1q2l d1q2la2 A:652-667,918-928,946-954
2fge d2fgeb2 B:828-852,854-863,949-967
2fge d2fgea2 A:828-852,854-863,949-967
139. c.26.1 Nucleotidylyl transferase
Adenine nucleotide alpha hydrolase-like core: 3 layers, a/b/a ; parallel beta-sheet of 5 strands, order 32145
1u7d d1u7da1 A:239-249,251-257,283-300
1u0b d1u0bb2 B:117-132,133-138,231-247
1xnj d1xnja2 A:391-398,446-457,464-479
1xjq d1xjqa2 A:391-398,446-457,464-479
1x6v d1x6va2 A:391-398,446-457,464-479
1x6v d1x6vb2 B:391-398,446-457,464-479
1xjq d1xjqb2 B:391-398,446-457,464-479
1li7 d1li7a2 A:117-132,133-138,230-247
1xnj d1xnjb2 B:391-398,446-457,464-479
1li5 d1li5a2 A:117-132,133-138,230-247
1li7 d1li7b2 B:117-132,133-138,230-247
1li5 d1li5b2 B:117-132,133-138,230-247
1n78 d1n78b2 B:85-100,101-106,209-224
2dxi d2dxib2 B:85-100,101-106,209-224
2cv2 d2cv2b2 B:85-100,101-106,209-224
1g59 d1g59c2 C:85-100,101-106,209-224
2cv0 d2cv0b2 B:85-100,101-106,209-224
1n77 d1n77b2 B:85-100,101-106,209-224
1gln d1glna2 A:85-100,101-106,209-224
1n77 d1n77a2 A:85-100,101-106,209-224
2cv1 d2cv1b2 B:85-100,101-106,209-224
2cv0 d2cv0a2 A:85-100,101-106,209-224
2dxi d2dxia2 A:85-100,101-106,209-224
2cuz d2cuza2 A:85-100,101-106,209-224
2cv2 d2cv2a2 A:85-100,101-106,209-224
2cv1 d2cv1a2 A:85-100,101-106,209-224
1j09 d1j09a2 A:85-100,101-106,209-224
1n78 d1n78a2 A:85-100,101-106,209-224
1n75 d1n75a2 A:85-100,101-106,209-224
1g59 d1g59a2 A:85-100,101-106,209-224
1n3l d1n3la_ A:258-268,274-282,305-322
1q11 d1q11a_ A:258-268,274-282,305-322
2zlz d2zlza1 A:78-96,97-102,194-209
1nzj d1nzja_ A:78-96,97-102,194-209
1exd d1exda2 A:98-117,118-123,233-247
1gax d1gaxa3 A:146-164,398-403,491-508
1j1u d1j1ua_ A:239-249,251-260,283-306
2re8 d2re8a2 A:98-117,118-123,233-248
1euy d1euya2 A:98-117,118-123,233-247
1o0b d1o0ba2 A:98-117,118-123,233-247
1gax d1gaxb3 B:146-164,398-403,491-508
1gts d1gtsa2 A:98-117,118-123,233-247
1gsg d1gsgp2 P:98-117,118-123,233-247
1u7d d1u7db1 B:239-249,252-259,283-306
1qtq d1qtqa2 A:98-117,118-123,233-248
1qru d1qrua2 A:98-117,118-123,233-247
2rd2 d2rd2a2 A:98-117,118-123,233-248
1ivs d1ivsb4 B:146-164,398-403,491-508
1gtr d1gtra2 A:98-117,118-123,233-247
1zjw d1zjwa2 A:98-117,118-123,233-248
1o0c d1o0ca2 A:98-117,118-123,233-247
1irx d1irxa2 A:126-134,213-217,217-230
1qrt d1qrta2 A:98-117,118-123,233-247
1qrs d1qrsa2 A:98-117,118-123,233-247
1irx d1irxb2 B:35-56,268-274,298-310
2cv2 d2cv2a2 A:15-33,234-238,262-275
1nyl d1nyla2 A:102-117,118-123,233-248
1irx d1irxa2 A:35-56,268-274,298-310
1gln d1glna2 A:15-33,234-238,262-275
1g59 d1g59a2 A:15-33,228-234,262-275
1j09 d1j09a2 A:15-33,235-239,262-275
2dxi d2dxia2 A:15-33,228-234,262-275
1n77 d1n77a2 A:15-33,228-234,262-275
2cv1 d2cv1a2 A:15-33,228-234,262-275
2cv0 d2cv0a2 A:15-33,228-234,262-275
1n75 d1n75a2 A:15-33,235-239,262-275
1n78 d1n78a2 A:15-33,228-234,262-275
2cv2 d2cv2a2 A:15-33,228-234,262-275
1ivs d1ivsa4 A:146-164,398-406,491-508
1j09 d1j09a2 A:15-33,228-234,262-275
1pg2 d1pg2a2 A:21-42,318-329,351-363
1pfy d1pfya2 A:21-42,318-329,351-363
1pg0 d1pg0a2 A:21-42,323-329,351-363
1qqt d1qqta2 A:21-42,318-329,351-363
1p7p d1p7pa2 A:21-42,318-329,351-363
1pfw d1pfwa2 A:21-42,318-329,351-363
1pfv d1pfva2 A:21-42,318-329,351-363
1jzq d1jzqa3 A:151-169,443-449,557-571
1pfu d1pfua2 A:21-42,318-329,351-363
1f4l d1f4la2 A:21-42,318-329,351-363
1u0b d1u0bb2 B:37-58,252-263,285-297
1nzj d1nzja_ A:19-37,213-219,242-255
1li5 d1li5b2 B:37-58,252-263,285-297
1li7 d1li7b2 B:37-58,252-263,285-297
1li5 d1li5a2 A:37-58,252-263,285-297
1li7 d1li7a2 A:37-58,252-263,285-297
2zlz d2zlza1 A:19-37,219-224,242-255
2quk d2quka1 A:170-188,332-338,397-408
1ulh d1ulha_ A:123-141,285-291,350-361
1o5t d1o5ta_ A:170-188,332-338,397-408
2ake d2akea1 A:170-188,332-338,397-408
1h3f d1h3fb1 B:52-69,216-222,258-271
140. e.24.1 Ribosomal protein L1
Ribosomal protein L1 2 domains: (1) alpha+beta; (2) alpha/beta (interrupts domain 1)
1i2a d1i2aa_ A:65-76,103-109,138-149
1cjs d1cjsa_ A:65-76,103-109,138-149
2hgu d2hguc1 C:79-90,111-117,148-158
1dwu d1dwub_ B:65-76,103-109,138-149
1u63 d1u63a1 A:65-76,103-109,138-149
2hgj d2hgjc1 C:79-90,112-116,148-158
1dwu d1dwua_ A:65-76,103-109,138-149
1zho d1zhoc1 C:79-90,111-116,148-159
1zho d1zhog1 G:79-90,111-116,148-159
1mzp d1mzpa_ A:69-80,108-113,143-154
1zho d1zhoa1 A:79-90,111-116,148-159
2hw8 d2hw8a1 A:79-90,111-116,148-159
1zho d1zhoe1 E:79-90,111-116,148-159
1ad2 d1ad2a_ A:79-90,111-116,148-159
2hgq d2hgqc1 C:79-90,111-116,148-158
1yl3 d1yl3c1 C:79-90,111-116,148-159
1u63 d1u63c1 C:65-76,103-108,138-149
2hgu d2hguc1 C:79-90,92-96,148-158
2hgq d2hgqc1 C:79-90,92-96,148-158
1cjs d1cjsa_ A:65-76,130-134,138-149
1zho d1zhog1 G:79-90,92-96,148-159
1i2a d1i2aa_ A:65-76,130-134,138-149
1zho d1zhoc1 C:79-90,92-96,148-159
1u63 d1u63a1 A:65-76,130-134,138-149
2hw8 d2hw8a1 A:79-90,92-96,148-159
1ad2 d1ad2a_ A:79-90,92-96,148-159
1zho d1zhoa1 A:79-90,92-96,148-159
1yl3 d1yl3c1 C:79-90,92-96,96-106
1zho d1zhoc1 C:79-90,92-96,96-106
1i2a d1i2aa_ A:65-76,77-81,138-149
2hgu d2hguc1 C:79-90,92-96,95-106
1yl3 d1yl3c1 C:79-90,92-96,148-159
1zho d1zhog1 G:79-90,92-96,95-106
141. c.78.2 Aspartate/glutamate racemase
ATC-like consists of two similar domains related by pseudo dyad; duplication ! core: 3 layers, a/b/a, parallel beta-sheet of 4 strands, order 2134
1jfl d1jflb1 B:11-27,76-81,212-228
1jfl d1jflb1 B:11-27,36-42,212-228
1b74 d1b74a1 A:9-24,64-69,199-213
1b73 d1b73a1 A:9-24,64-69,199-213
1jfl d1jfla1 A:11-26,36-42,212-227
1jfl d1jfla1 A:11-26,76-80,212-227
1b73 d1b73a1 A:9-24,88-92,199-213
1b74 d1b74a1 A:9-24,88-92,199-213
142. d.270.1 2-isopropylmalate synthase LeuA, allosteric (dimerisation) domain
2-isopropylmalate synthase LeuA, allosteric (dimerisation) domain duplication: consists of two beta(3)-alpha repeats; 3 layers, beta/alpha/beta
1sr9 d1sr9b3 B:533-546,546-560,626-643
1sr9 d1sr9a3 A:533-546,547-560,626-643
143. d.153.1 N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases) N-terminal residue provides two catalytic groups, nucleophile and proton donor !
Ntn hydrolase-like 4 layers: alpha/beta/beta/alpha; has an unusual sheet-to-sheet packing
1jn9 d1jn9.1 A:105-118,120-124,124-135
1k2x d1k2x.2 C:105-117,120-124,124-135
1t3m d1t3m.2 C:104-117,119-123,123-134
1jn9 d1jn9.2 C:105-118,120-124,124-135
1t3m d1t3m.1 A:104-116,119-123,123-134
1k2x d1k2x.1 A:105-118,120-124,124-135
1apy d1apy.2 C:87-100,102-106,106-117
1apy d1apy.1 A:87-100,102-106,106-117
1ayy d1ayy.1 A:87-99,102-106,106-117
9gaa d9gaaa_ A:87-99,102-106,106-117
9gaa d9gaac_ C:387-399,402-406,406-417
1p4k d1p4kc_ C:387-399,402-406,406-417
1apz d1apz.2 C:87-100,102-106,106-117
1ayy d1ayy.2 C:87-99,102-106,106-117
2gac d2gac.1 A:87-99,102-106,106-117
2gac d2gac.2 C:87-99,102-106,106-117
9gac d9gaca_ A:87-99,102-106,106-117
1p4k d1p4ka_ A:87-99,102-106,106-117
2gaw d2gaw.1 A:87-99,102-106,106-117
9gaf d9gafa_ A:87-99,102-106,106-117
9gaf d9gafc_ C:387-399,402-406,406-417
2gaw d2gaw.2 C:87-99,102-106,106-117
9gac d9gacc_ C:387-399,402-406,406-417
1p4v d1p4vc_ C:387-399,402-406,406-417
1p4v d1p4va_ A:87-99,102-106,106-117
1apz d1apz.1 A:87-99,102-106,106-117
2e0w d2e0wa1 A:294-311,473-482,483-502
2e0w d2e0wb1 B:294-311,473-483,483-502
2i3o d2i3ob1 B:255-271,403-413,416-432
2i3o d2i3oa1 A:255-271,403-413,416-432
2i3o d2i3oc1 C:255-271,403-413,416-432
2i3o d2i3od1 D:255-271,403-413,416-432
2nlz d2nlzd1 D:271-287,430-440,440-459
2nlz d2nlzc1 C:271-287,430-440,440-459
2nlz d2nlza1 A:271-287,430-440,440-459
2nlz d2nlzb1 B:271-287,430-440,440-459
144. d.369.1 SMI1/KNR4-like
SMI1/KNR4-like alpha(4)-beta(4)-alpha; 3 layers: a/b/a; antiparallel beta-sheet, order 1234(meander)
2prv d2prvb1 B:0-14,16-20,128-146
2pag d2paga1 A:39-52,95-102,123-135
2prv d2prva1 A:40-50,95-102,128-145
2prv d2prvb1 B:40-51,95-102,128-146
2icg d2icga1 A:43-54,105-112,142-158
145. i.8.1 RNA polymerase
RNA polymerase
1nik d1nikb_ B:1022-1039,1041-1045,1051-1063
1pqv d1pqvb_ B:1022-1039,1041-1045,1051-1063
1nt9 d1nt9b_ B:1022-1039,1041-1045,1051-1063
1r9s d1r9sb_ B:1022-1039,1041-1045,1051-1063
1r5u d1r5ub_ B:1022-1039,1041-1045,1051-1063
1y1y d1y1yb_ B:1022-1039,1041-1045,1051-1063
1y1w d1y1wb_ B:1022-1039,1041-1045,1051-1063
1wcm d1wcmb_ B:1022-1039,1041-1045,1051-1063
1y77 d1y77b_ B:1022-1039,1041-1045,1051-1063
1y1y d1y1yb_ B:56-65,164-172,408-436
1y1v d1y1vb_ B:56-65,164-172,408-436
1pqv d1pqvb_ B:56-65,168-172,408-436
1r9s d1r9sb_ B:56-65,168-172,408-436
1r5u d1r5ub_ B:56-65,168-172,408-436
1nt9 d1nt9b_ B:56-65,168-172,408-436
1nik d1nikb_ B:56-65,168-172,408-436
1hqm d1hqmc_ C:883-898,899-903,910-933
1pqv d1pqve_ E:3-27,106-113,136-143
1nt9 d1nt9e_ E:3-27,106-112,136-143
1nik d1nike_ E:3-27,106-112,136-143
1r5u d1r5ue_ E:3-27,106-112,136-143
1r9s d1r9se_ E:3-27,106-112,136-143
1r9t d1r9te_ E:3-27,106-112,136-143
1y1v d1y1ve_ E:3-27,106-112,136-143
1y1y d1y1ye_ E:3-27,106-112,136-143
1wcm d1wcme_ E:3-27,106-112,136-143
1y77 d1y77e_ E:3-27,106-112,136-143
1sfo d1sfoe_ E:3-27,106-112,136-143
1y1w d1y1we_ E:3-27,106-112,136-143
1r9t d1r9tb_ B:44-58,168-172,408-436
1sfo d1sfob_ B:44-58,168-172,408-436
1r5u d1r5ub_ B:44-57,168-172,408-436
1nt9 d1nt9b_ B:44-57,168-172,408-436
1pqv d1pqvb_ B:44-57,168-172,408-436
1r9s d1r9sb_ B:44-57,168-172,408-436
1nik d1nikb_ B:44-57,168-172,408-436
1sfo d1sfoa_ A:524-536,569-574,638-661
1r9t d1r9ta_ A:524-536,569-574,638-661
1y1y d1y1yb_ B:44-57,164-172,408-436
1y1v d1y1vb_ B:44-57,164-172,408-436
1hqm d1hqmc_ C:17-31,105-120,335-363
146. c.88.1 Glutaminase/Asparaginase
Glutaminase/Asparaginase consists of two non-similar alpha/beta domains, 3 layers (a/b/a) each ! Domain 1 has mixed beta-sheet of 6 strands, order 213456, strand 6 is antiparallel to the rest; left-handed crossover connection between strands 4 and 5 ! Domain 2 has parallel beta-sheet of 4 strands, order 1234
1hfw d1hfwa_ A:43-51,50-57,129-144
1jja d1jjae_ E:39-46,46-53,123-139
1ihd d1ihda_ A:39-46,46-53,123-139
1ihd d1ihdc_ C:39-46,46-53,123-139
1jaz d1jaza_ A:39-47,46-53,123-139
2ocd d2ocdc1 C:30-38,47-54,126-143
2ocd d2ocdb1 B:30-38,83-90,126-143
2ocd d2ocdc1 C:30-38,83-90,126-143
2ocd d2ocda1 A:30-38,83-90,126-143
3pga d3pga2_ 2:38-49,92-98,134-149
2ocd d2ocdd1 D:30-38,83-90,126-143
147. c.55.3 Ribonuclease H-like consists of one domain of this fold !
Ribonuclease H-like motif 3 layers: a/b/a; mixed beta-sheet of 5 strands, order 32145; strand 2 is antiparallel to the rest
2f8s d2f8sa2 A:365-384,452-457,465-482
2f8t d2f8ta2 A:365-384,452-457,465-482
1yvu d1yvua2 A:367-384,452-457,465-482
1z25 d1z25a2 A:393-413,472-479,523-539
1yvu d1yvua2 A:367-384,418-425,465-482
2f8t d2f8ta2 A:365-384,418-425,465-482
2f8s d2f8sb2 B:362-384,418-424,465-482
2f8s d2f8sa2 A:365-384,418-425,465-482
1z26 d1z26a2 A:393-417,472-479,523-539
1u04 d1u04a2 A:393-413,472-479,523-539
1w9h d1w9ha1 A:57-77,109-116,149-165
2nub d2nuba2 A:366-384,452-457,465-482
2nub d2nuba2 A:366-384,418-425,465-482
2f8t d2f8tb2 B:364-384,452-457,465-482
2f8t d2f8tb2 B:364-384,418-425,465-482
2bgg d2bgga1 A:58-77,135-142,148-165
1mur d1mura_ A:70-90,136-149,345-371
1z25 d1z25a2 A:393-413,499-506,523-539
1muh d1muha_ A:70-90,136-149,345-371
1z26 d1z26a2 A:393-417,499-506,523-539
2bgg d2bggb1 B:58-77,109-115,148-165
1mm8 d1mm8a_ A:70-89,136-149,345-372
1w9h d1w9ha1 A:57-77,135-141,149-165
1u04 d1u04a2 A:393-413,499-506,523-539
1ytu d1ytua1 A:58-77,109-115,148-165
2bgg d2bggb1 B:58-77,135-140,148-165
2f8s d2f8sb2 B:362-384,452-457,465-482
2bgg d2bgga1 A:58-77,108-117,148-165
3ecp d3ecpa1 A:70-90,136-149,345-372
1mus d1musa_ A:70-90,136-149,345-372
1ytu d1ytub1 B:58-77,135-142,148-165
1ytu d1ytub1 B:58-77,109-117,148-165
1yvu d1yvua2 A:367-384,385-397,465-482
1q9y d1q9ya1 A:166-173,188-194,319-342
2nub d2nuba2 A:366-384,385-397,465-482
2f8s d2f8sa2 A:365-384,385-397,465-482
2bw3 d2bw3a2 A:143-163,202-215,590-609
2f8t d2f8ta2 A:365-384,385-397,465-482
2f8s d2f8sb2 B:362-384,385-396,465-482
2q3s d2q3sb1 B:30-46,47-58,181-206
2f8t d2f8tb2 B:364-384,385-397,465-482
2p5o d2p5oc1 C:163-170,185-193,316-339
2p5o d2p5ob1 B:163-170,185-193,316-339
148. c.23.11 Beta-D-glucan exohydrolase, C-terminal domain
Flavodoxin-like 3 layers, a/b/a; parallel beta-sheet of 5 strand, order 21345
1j8v d1j8va2 A:446-455,477-486,549-559
1ieq d1ieqa2 A:446-455,477-486,549-559
1iew d1iewa2 A:446-455,477-486,549-559
1x39 d1x39a2 A:446-455,477-486,549-559
1iev d1ieva2 A:446-455,477-486,549-559
1x38 d1x38a2 A:446-455,477-486,549-559
1ex1 d1ex1a2 A:446-455,477-486,549-559
1lq2 d1lq2a2 A:446-455,477-486,549-559
1iex d1iexa2 A:446-455,477-486,549-559
1iew d1iewa2 A:446-455,517-524,549-559
1x38 d1x38a2 A:446-455,517-524,549-559
1x39 d1x39a2 A:446-455,517-524,549-559
1lq2 d1lq2a2 A:446-455,517-525,549-559
1ex1 d1ex1a2 A:446-455,517-524,549-559
1ieq d1ieqa2 A:446-455,517-525,549-559
1iex d1iexa2 A:446-455,517-524,549-559
1j8v d1j8va2 A:446-455,517-525,549-559
1iev d1ieva2 A:446-455,517-525,549-559
149. c.127.1 F420-dependent methylenetetrahydromethanopterin dehydrogenase (MTD) the sheet topology is similar to those of the Periplasmic binding protein-like I domains !
F420-dependent methylenetetrahydromethanopterin dehydrogenase (MTD) 3 layers: a/b/a; parallel beta-sheet of 6 strands, order 213456
1u6i d1u6il1 L:14-26,93-100,152-171
1u6j d1u6jg1 G:14-26,93-100,152-171
1u6j d1u6ja1 A:14-26,93-100,152-171
1u6i d1u6ig1 G:14-26,93-100,152-171
1u6i d1u6ia1 A:14-26,93-100,152-171
1u6j d1u6jg1 G:14-26,66-72,152-171
1u6k d1u6ka1 A:14-26,93-100,152-171
1qv9 d1qv9a_ A:14-26,93-100,152-171
1u6j d1u6ja1 A:14-26,66-72,152-171
1qv9 d1qv9a_ A:14-26,66-72,152-171
1u6k d1u6ka1 A:14-26,66-72,152-171
1u6i d1u6ig1 G:14-26,66-72,152-171
1u6j d1u6jh1 H:14-26,93-100,152-171
1u6i d1u6ia1 A:14-26,66-72,152-171
1u6j d1u6jb1 B:14-26,93-100,152-171
1u6j d1u6jd1 D:14-26,93-100,152-171
1u6j d1u6jj1 J:14-26,93-100,152-171
1u6j d1u6jf1 F:14-26,93-100,152-171
1u6j d1u6jk1 K:14-26,93-100,152-171
1u6j d1u6je1 E:14-26,93-100,152-171
1u6k d1u6kc1 C:14-26,93-100,152-171
1qv9 d1qv9c_ C:14-26,93-100,152-171
1u6i d1u6ik1 K:14-26,93-100,152-171
1u6j d1u6jl1 L:14-26,93-100,152-171
1u6i d1u6ie1 E:14-26,93-100,152-171
1u6k d1u6kb1 B:14-26,93-100,152-171
1qv9 d1qv9b_ B:14-26,93-100,152-171
1u6i d1u6if1 F:14-26,93-100,152-171
1u6i d1u6ij1 J:14-26,93-100,152-171
1u6k d1u6kb1 B:14-26,66-72,152-171
1u6i d1u6id1 D:14-26,93-100,152-171
1qv9 d1qv9b_ B:14-26,66-72,152-171
1u6j d1u6jb1 B:14-26,66-72,152-171
1u6j d1u6jh1 H:14-26,66-72,152-171
1qv9 d1qv9c_ C:14-26,66-72,152-171
1u6k d1u6kc1 C:14-26,66-72,152-171
1u6j d1u6jc1 C:14-26,93-100,152-171
1u6j d1u6ji1 I:14-26,93-100,152-171
1u6i d1u6ic1 C:14-26,93-100,152-171
1u6i d1u6ii1 I:14-26,93-100,152-171
1u6i d1u6ik1 K:14-26,66-72,152-171
1u6i d1u6ie1 E:14-26,66-72,152-171
1u6j d1u6jk1 K:14-26,66-72,152-171
1u6j d1u6je1 E:14-26,66-72,152-171
1u6j d1u6jj1 J:14-26,66-72,152-171
1u6j d1u6jd1 D:14-26,66-72,152-171
1u6i d1u6ij1 J:14-26,66-72,152-171
1u6i d1u6id1 D:14-26,66-72,152-171
1u6i d1u6if1 F:14-26,66-72,152-171
1u6i d1u6ii1 I:14-26,66-72,152-171
1u6i d1u6ic1 C:14-26,66-72,152-171
1u6j d1u6ji1 I:14-26,66-72,152-171
1u6j d1u6jc1 C:14-26,66-72,152-171
1u6j d1u6jf1 F:14-26,66-72,152-171
1u6i d1u6ia1 A:14-26,114-120,152-171
1u6i d1u6ig1 G:14-26,114-120,152-171
1u6i d1u6if1 F:14-26,114-120,152-171
1u6j d1u6jg1 G:14-26,114-120,152-171
1u6j d1u6ja1 A:14-26,114-120,152-171
1u6i d1u6il1 L:14-26,114-120,152-171
1u6j d1u6jb1 B:14-26,114-120,152-171
1u6j d1u6jh1 H:14-26,114-120,152-171
1qv9 d1qv9a_ A:14-26,114-120,152-171
1u6k d1u6ka1 A:14-26,114-120,152-171
1u6i d1u6ii1 I:14-26,114-120,152-171
1u6i d1u6ic1 C:14-26,114-120,152-171
1u6j d1u6jk1 K:14-26,114-120,152-171
1u6j d1u6ji1 I:14-26,114-120,152-171
1u6j d1u6jc1 C:14-26,114-120,152-171
1u6j d1u6je1 E:14-26,114-120,152-171
1u6j d1u6jl1 L:14-26,114-120,152-171
1u6j d1u6jf1 F:14-26,114-120,152-171
1u6j d1u6jd1 D:14-26,114-120,152-171
1u6j d1u6jj1 J:14-26,114-120,152-171
1u6i d1u6ik1 K:14-26,114-120,152-171
1u6i d1u6ie1 E:14-26,114-120,152-171
1u6i d1u6il1 L:14-26,66-74,152-171
1qv9 d1qv9b_ B:14-26,114-120,152-171
1u6k d1u6kb1 B:14-26,114-120,152-171
1qv9 d1qv9c_ C:14-26,114-120,152-171
1u6k d1u6kc1 C:14-26,114-120,152-171
1u6i d1u6id1 D:14-26,114-120,152-171
1u6i d1u6ij1 J:14-26,114-120,152-171
1u6j d1u6jl1 L:14-26,66-73,152-171
1u6i d1u6ic1 C:152-171,179-184,184-192
1u6i d1u6ii1 I:152-171,179-184,184-192
1u6j d1u6jc1 C:152-171,179-184,184-192
1u6j d1u6ji1 I:152-171,179-184,184-192
1u6j d1u6jf1 F:152-171,180-184,184-192
1u6i d1u6il1 L:152-171,180-184,184-192
1u6j d1u6jl1 L:152-171,180-184,184-192
1u6i d1u6ij1 J:152-171,180-184,184-192
1u6i d1u6id1 D:152-171,180-184,184-192
1u6i d1u6if1 F:152-171,180-184,184-192
1u6j d1u6jd1 D:152-171,180-184,184-192
1u6j d1u6jj1 J:152-171,180-184,184-192
1qv9 d1qv9b_ B:152-171,180-184,184-192
1u6k d1u6kb1 B:152-171,180-184,184-192
1u6k d1u6kc1 C:152-171,180-184,184-192
1qv9 d1qv9c_ C:152-171,180-184,184-192
1u6j d1u6jl1 L:14-26,114-120,133-152
1u6j d1u6jd1 D:14-26,114-120,133-152
1u6j d1u6jj1 J:14-26,114-120,133-152
1u6i d1u6if1 F:14-26,114-120,133-152
1u6i d1u6ii1 I:14-26,114-120,133-152
1u6i d1u6ic1 C:14-26,114-120,133-152
1u6j d1u6jk1 K:14-26,114-120,133-152
1u6j d1u6je1 E:14-26,114-120,133-152
1u6i d1u6il1 L:14-26,114-120,133-152
1u6j d1u6jh1 H:14-26,114-120,133-152
1u6j d1u6jb1 B:14-26,114-120,133-152
1u6i d1u6ig1 G:14-26,114-120,133-152
1u6i d1u6ia1 A:14-26,114-120,133-152
1u6i d1u6ie1 E:14-26,114-120,133-152
1u6i d1u6ik1 K:14-26,114-120,133-152
1u6i d1u6id1 D:14-26,114-120,133-152
1u6i d1u6ij1 J:14-26,114-120,133-152
1u6j d1u6jf1 F:14-26,114-120,133-152
1u6j d1u6jg1 G:14-26,114-120,133-152
1u6j d1u6ja1 A:14-26,114-120,133-152
1u6k d1u6kb1 B:14-26,114-120,133-152
1qv9 d1qv9b_ B:14-26,114-120,133-152
1u6j d1u6ji1 I:14-26,114-120,133-152
1u6k d1u6ka1 A:14-26,114-120,133-152
1qv9 d1qv9a_ A:14-26,114-120,133-152
1u6j d1u6jc1 C:14-26,114-120,133-152
1qv9 d1qv9c_ C:14-26,114-120,133-152
1u6k d1u6kc1 C:14-26,114-120,133-152
150. d.208.1 MTH1598-like
MTH1598-like beta(2)-alpha-beta-alpha-beta(4); 3 layers: beta/alpha/beta; some similarity to the Hsp33 fold
1j5u d1j5ua_ A:25-42,48-56,59-77
151. i.10.1 Microtubule complexes
Microtubule complexes
1ia0 d1ia0b_ B:10-27,166-172,223-241
1ffx d1ffxb_ B:10-25,165-172,223-244
1ffx d1ffxd_ D:10-25,165-172,223-244
1ffx d1ffxa_ A:10-26,133-140,223-245
1ffx d1ffxc_ C:10-26,133-140,223-245
1ia0 d1ia0a_ A:10-25,133-141,223-245
1ia0 d1ia0b_ B:10-27,133-141,223-241
1ia0 d1ia0a_ A:10-25,165-172,223-245
1ffx d1ffxb_ B:10-25,132-141,223-244
1ffx d1ffxd_ D:10-25,132-141,223-244
1ia0 d1ia0b_ B:10-27,199-205,223-241
1ffx d1ffxc_ C:10-26,164-174,223-245
1ffx d1ffxa_ A:10-26,164-174,223-245
3du7 d3du7a1 A:10-29,133-141,223-240
2p4n d2p4na1 A:10-29,131-142,223-245
2p4n d2p4nb1 B:10-29,131-141,223-239
3du7 d3du7b1 B:10-29,165-174,223-240
2p4n d2p4na1 A:10-29,165-173,223-245
2p4n d2p4nb1 B:10-29,164-172,223-239
1ffx d1ffxc_ C:10-26,199-206,223-245
1ffx d1ffxa_ A:10-26,199-206,223-245
3du7 d3du7b1 B:10-29,199-207,223-240
3du7 d3du7a1 A:10-29,164-172,223-240
3du7 d3du7b1 B:10-29,131-142,223-240
152. c.94.1 Periplasmic binding protein-like II Similar in architecture to the superfamily I but partly differs in topology !
Periplasmic binding protein-like II consists of two similar intertwined domain with 3 layers (a/b/a) each: duplication ! mixed beta-sheet of 5 strands, order 21354; strand 5 is antiparallel to the rest
1ryo d1ryoa_ A:124-136,242-248,316-327
1ovt d1ovta1 A:121-136,243-249,321-333
1lfi d1lfia1 A:121-133,246-252,321-333
1dot d1dota2 A:460-476,585-590,658-670
1sqy d1sqya1 A:121-133,246-252,321-333
1b7z d1b7za2 A:463-479,588-593,662-674
1i6b d1i6ba1 A:12-30,33-38,263-279
1lcf d1lcfa1 A:121-133,246-252,321-333
1iej d1ieja_ A:121-136,243-249,321-332
1f9b d1f9ba1 A:121-133,246-252,321-333
1cb6 d1cb6a2 A:1465-1481,1590-1595,1664-1676
1lfg d1lfga1 A:121-133,246-252,321-333
1bka d1bkaa1 A:121-133,246-252,321-333
1sqy d1sqya2 A:465-481,590-595,664-676
1biy d1biya2 A:463-479,588-593,662-674
1b0l d1b0la2 A:465-481,590-595,664-676
1fck d1fcka2 A:465-481,590-595,664-676
1nnt d1nnta_ A:121-136,243-249,321-332
1lfg d1lfga2 A:465-481,590-595,664-676
2bjj d2bjjx2 X:466-482,591-596,665-677
1qjm d1qjma2 A:463-479,588-593,662-673
1n76 d1n76a2 A:465-481,590-595,664-676
1kwh d1kwha_ A:91-101,314-321,325-339
1j1n d1j1nb_ B:91-101,314-321,325-339
1y3n d1y3na1 A:91-101,314-321,325-339
1j1n d1j1na_ A:91-101,314-321,325-339
1qjm d1qjma2 A:351-366,368-375,376-387
2nwj d2nwja1 A:351-366,368-375,376-387
2nuv d2nuva1 A:351-366,368-375,376-387
2px1 d2px1a1 A:351-366,368-375,376-387
1biy d1biya2 A:351-366,368-375,376-387
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2i6e d2i6eg1 G:113-128,201-210,264-280
2i6e d2i6ec1 C:113-128,201-210,264-280
153. d.271.1 HSP90 C-terminal domain
HSP90 C-terminal domain alpha-beta(3)-alpha(3); 2 layers, a/b; mixed beta-sheet, order:132; crossing loops
1sf8 d1sf8c_ C:509-520,566-571,585-606
1sf8 d1sf8h_ H:509-520,566-571,585-606
1sf8 d1sf8g_ G:510-520,565-571,585-606
1sf8 d1sf8f_ F:510-520,566-571,585-606
1sf8 d1sf8b_ B:510-520,566-571,585-606
1sf8 d1sf8a_ A:510-520,566-571,585-606
1sf8 d1sf8e_ E:510-520,566-571,585-606
1sf8 d1sf8d_ D:510-520,566-571,585-606
1sf8 d1sf8f_ F:510-520,566-571,574-584
1sf8 d1sf8a_ A:510-520,566-571,574-584
1sf8 d1sf8g_ G:510-520,524-529,574-584
1sf8 d1sf8e_ E:510-520,566-571,574-584
1sf8 d1sf8e_ E:510-520,524-529,574-584
1sf8 d1sf8a_ A:510-520,525-529,574-584
1sf8 d1sf8d_ D:510-520,524-529,574-583
1sf8 d1sf8f_ F:510-520,525-529,574-584
1sf8 d1sf8b_ B:510-520,525-529,574-583
1sf8 d1sf8h_ H:509-520,524-529,574-583
1sf8 d1sf8h_ H:509-520,524-529,585-606
154. c.23.10 SGNH hydrolase
Flavodoxin-like 3 layers, a/b/a; parallel beta-sheet of 5 strand, order 21345
1wab d1waba_ A:57-66,95-101,197-216
1es9 d1es9a_ A:57-66,95-101,197-216
1vyh d1vyhj1 J:56-67,96-102,198-221
1vyh d1vyhr1 R:56-67,96-102,198-221
1vyh d1vyhf1 F:56-67,96-102,198-221
1vyh d1vyhb1 B:56-67,96-102,198-221
1vyh d1vyhn1 N:56-67,96-102,198-221
1vyh d1vyha1 A:56-67,96-102,198-221
1bwp d1bwpa_ A:57-66,95-101,197-216
1vyh d1vyhq1 Q:56-67,96-102,198-221
1vyh d1vyhi1 I:56-67,96-102,198-221
1vyh d1vyhm1 M:56-67,96-102,198-221
1vyh d1vyhe1 E:56-67,96-102,198-221
1bwq d1bwqa_ A:57-66,95-101,197-216
1bwr d1bwra_ A:57-66,95-101,197-216
1esd d1esda_ A:40-53,97-102,285-305
1yzf d1yzfa1 A:21-36,40-47,171-187
1vyh d1vyhj1 J:56-67,67-73,198-221
1vyh d1vyhe1 E:56-67,67-73,198-221
1vyh d1vyhn1 N:56-67,67-73,198-221
2o14 d2o14a2 A:186-195,230-237,344-363
2apj d2apjd1 D:93-106,150-159,240-260
1u8u d1u8ua1 A:22-32,35-43,159-175
1ese d1esea_ A:40-53,97-103,285-305
1zmb d1zmbd1 D:55-69,151-157,209-227
1zmb d1zmbf1 F:55-69,151-157,209-227
1zmb d1zmbc1 C:55-69,151-157,209-227
1zmb d1zmbb1 B:55-69,151-157,209-227
1esc d1esca_ A:40-53,97-103,285-305
2apj d2apja1 A:93-107,150-159,240-260
2apj d2apjc1 C:93-107,150-159,240-260
2apj d2apjb1 B:93-107,150-159,240-260
3bzw d3bzwb1 B:67-77,76-85,263-282
3dc7 d3dc7a1 A:41-51,84-90,205-225
1zmb d1zmbe1 E:55-69,109-118,209-227
1zmb d1zmbf1 F:55-69,109-118,209-227
1zmb d1zmbb1 B:55-69,109-118,209-227
1zmb d1zmbd1 D:55-69,109-118,209-227
1zmb d1zmba1 A:55-69,109-118,209-227
1zmb d1zmbc1 C:55-69,109-118,209-227
3dc7 d3dc7b1 B:41-51,84-89,205-225
3dc7 d3dc7c1 C:41-51,84-89,205-225
3bzw d3bzwc1 C:67-77,76-86,263-282
3bzw d3bzwe1 E:67-77,76-86,263-282
1zmb d1zmba1 A:55-69,151-158,209-227
1zmb d1zmbe1 E:55-69,151-158,209-227
3bzw d3bzwf1 F:67-77,76-86,263-282
3bzw d3bzwd1 D:67-77,76-86,263-282
3bzw d3bzwa1 A:67-77,76-86,263-282
1flc d1flca2 A:73-81,108-114,357-370
1flc d1flcc2 C:73-81,108-114,357-370
1k7c d1k7ca_ A:22-31,63-70,197-216
1flc d1flce2 E:73-81,108-114,357-370
1pp4 d1pp4b_ B:22-31,63-70,197-216
1deo d1deoa_ A:22-31,63-70,197-216
1dex d1dexa_ A:22-31,63-70,197-216
1pp4 d1pp4a_ A:22-31,63-70,197-216
1jrl d1jrla_ A:22-31,64-69,159-175
1ivn d1ivna_ A:22-31,64-69,159-175
1v2g d1v2ga_ A:22-31,64-69,159-175
2o14 d2o14a2 A:186-195,269-277,344-363
155. c.51.2 TolB, N-terminal domain
Anticodon-binding domain-like 3 layers: a/b/a; mixed beta-sheet of five strands, order 21345; strand 4 is antiparallel to the rest
2ivz d2ivzb2 B:54-67,68-72,138-159
2hqs d2hqsd2 D:54-67,68-72,138-159
1c5k d1c5ka2 A:54-67,68-72,138-159
2hqs d2hqsf2 F:54-67,68-72,138-159
2ivz d2ivzc2 C:54-67,68-72,138-159
2ivz d2ivzd2 D:54-67,68-72,138-159
2hqs d2hqsb2 B:54-67,68-72,138-159
2ivz d2ivza2 A:54-67,68-72,138-159
2hqs d2hqsa2 A:54-67,68-72,138-159
1crz d1crza2 A:32-45,46-50,116-137
2hqs d2hqsf2 F:54-67,98-109,138-159
1crz d1crza2 A:32-45,76-87,116-137
2hqs d2hqsd2 D:54-67,98-109,138-159
2ivz d2ivzd2 D:54-67,98-109,138-159
2ivz d2ivzb2 B:54-67,98-109,138-159
2hqs d2hqsa2 A:54-67,98-109,138-159
2hqs d2hqsb2 B:54-67,98-109,138-159
1c5k d1c5ka2 A:54-67,98-109,138-159
2ivz d2ivzc2 C:54-67,98-109,138-159
2ivz d2ivza2 A:54-67,98-109,138-159
156. g.41.3 Zinc beta-ribbon
Rubredoxin-like metal(zinc or iron)-bound fold; sequence contains two CX(n)C motifs, in most cases n = 2
1d0q d1d0qb_ B:18-28,48-55,69-79
1d0q d1d0qa_ A:18-28,48-55,69-79
1d0q d1d0qa_ A:18-28,64-69,69-79
1d0q d1d0qb_ B:18-28,64-69,69-79
157. d.104.1 Class II aaRS and biotin synthetases
Class II aaRS and biotin synthetases contains large mixed beta-sheet
1bib d1biba3 A:68-77,103-111,234-257
1bia d1biaa3 A:68-77,103-111,234-257
2ewn d2ewna3 A:68-77,103-111,234-257
1nnh d1nnha_ A:125-149,212-222,265-274
1hxd d1hxda3 A:68-77,103-111,234-257
1bib d1biba3 A:68-77,80-86,234-257
1hxd d1hxdb3 B:68-77,103-111,234-257
2ewn d2ewnb3 B:68-77,103-111,234-257
1bia d1biaa3 A:68-77,80-86,234-257
1bbu d1bbua2 A:285-306,419-428,478-487
1bbw d1bbwa2 A:285-306,419-428,478-487
1hxd d1hxda3 A:68-77,80-86,234-257
1hxd d1hxdb3 B:68-77,80-86,234-257
1efw d1efwb3 B:246-267,474-483,529-538
1il2 d1il2b3 B:1240-1261,1480-1489,1535-1544
1il2 d1il2a3 A:240-261,480-489,535-544
1b8a d1b8ab2 B:1239-1263,1324-1330,1410-1419
1b8a d1b8aa2 A:239-263,324-330,410-419
1c0a d1c0aa3 A:240-261,480-489,535-544
2ewn d2ewna3 A:68-77,80-86,234-257
1eqr d1eqrb3 B:240-261,480-489,535-544
1efw d1efwa3 A:246-267,474-483,529-538
1asz d1asza2 A:350-374,441-447,529-538
1eqr d1eqrc3 C:240-261,480-489,535-544
1eqr d1eqra3 A:240-261,480-489,535-544
1yfr d1yfrb2 B:101-119,188-199,221-231
1e1t d1e1ta2 A:285-306,314-319,478-487
2aly d2alya1 A:229-246,274-287,318-328
1b8a d1b8aa2 A:239-263,359-368,410-419
1e1o d1e1oa2 A:285-306,314-319,478-487
2ewn d2ewnb3 B:68-77,80-86,234-257
1e24 d1e24a2 A:285-306,314-319,478-487
1b8a d1b8ab2 B:1239-1263,1359-1368,1410-1419
1efw d1efwb3 B:246-267,419-425,529-538
2iy5 d2iy5a2 A:229-246,274-287,318-328
1e22 d1e22a2 A:285-306,314-319,478-487
1asz d1aszb2 B:350-374,441-447,529-538
1asy d1asyb2 B:350-374,441-447,529-538
1g51 d1g51a3 A:246-267,419-425,529-538
1qe0 d1qe0b2 B:136-155,279-290,309-321
1lyl d1lyla2 A:285-306,314-319,478-487
1efw d1efwa3 A:246-267,419-425,529-538
1qe0 d1qe0a2 A:136-155,279-290,309-321
1g51 d1g51b3 B:1246-1267,1419-1425,1529-1538
1lyl d1lylb2 B:285-306,314-319,478-487
1lyl d1lylc2 C:285-306,314-319,478-487
1jjc d1jjca_ A:229-246,274-287,318-328
2amc d2amca1 A:229-246,275-287,318-328
2akw d2akwa1 A:229-246,275-287,318-328
1eiy d1eiya2 A:229-246,275-287,318-328
1bbu d1bbua2 A:285-306,314-319,478-487
1asy d1asya2 A:350-374,441-447,528-538
1b7y d1b7ya_ A:229-246,274-287,318-328
1b70 d1b70a_ A:229-246,274-287,318-328
1nj8 d1nj8d3 D:159-182,212-224,253-265
1nj8 d1nj8b3 B:159-182,212-224,253-265
1pys d1pysa_ A:229-246,274-287,318-328
1nj8 d1nj8a3 A:159-182,212-224,253-265
1bbw d1bbwa2 A:285-306,314-319,478-487
1nj8 d1nj8c3 C:159-182,212-224,253-265
1nj6 d1nj6a3 A:175-198,228-240,269-281
1nj1 d1nj1a3 A:175-198,228-240,269-281
1g5i d1g5ib2 B:218-241,269-281,316-328
1g5h d1g5hc2 C:218-241,269-281,316-328
1hc7 d1hc7a2 A:167-191,221-233,262-274
1h4t d1h4td2 D:167-191,221-234,262-274
1n9w d1n9wa2 A:226-250,310-316,394-403
1n9w d1n9wb2 B:226-250,310-316,394-403
1nj5 d1nj5a3 A:175-198,228-240,269-281
1hc7 d1hc7c2 C:167-191,221-233,262-274
1hc7 d1hc7d2 D:167-191,221-233,262-274
1h4s d1h4sb2 B:167-191,221-233,262-274
1h4s d1h4sa2 A:167-191,221-233,262-274
1g5i d1g5ic2 C:218-241,269-281,316-328
1g5h d1g5ha2 A:218-241,269-281,316-328
1g5i d1g5ia2 A:218-241,269-281,316-328
1h4t d1h4ta2 A:167-191,221-233,262-274
1h4q d1h4qa2 A:167-191,221-233,262-274
1h4q d1h4qb2 B:167-191,221-233,262-274
1nj2 d1nj2a3 A:175-198,228-241,269-281
1wu7 d1wu7b2 B:134-153,284-294,313-325
1b76 d1b76a2 A:248-268,273-279,363-377
1b76 d1b76b2 B:248-268,273-279,363-377
1j5w d1j5wa_ A:87-100,133-146,161-170
1eov d1eova2 A:350-374,441-447,528-538
1j5w d1j5wb_ B:87-100,133-146,161-170
1h4v d1h4vb2 B:136-155,280-289,308-320
1evk d1evkb2 B:389-412,475-487,517-530
1nyq d1nyqa4 A:391-414,481-493,523-536
1ggm d1ggmb2 B:245-268,273-279,363-377
1asy d1asya2 A:350-374,477-485,528-538
1nyr d1nyra4 A:391-414,481-493,523-536
1evk d1evka2 A:389-412,475-487,517-530
1eov d1eova2 A:350-374,477-485,528-538
1yfs d1yfsa2 A:101-119,190-204,221-231
1ggm d1ggma2 A:245-268,273-279,364-377
1ygb d1ygba2 A:101-119,190-203,221-231
1yfs d1yfsb2 B:101-119,190-204,221-231
1yft d1yfta2 A:101-119,190-204,221-231
1riq d1riqa2 A:101-119,190-204,221-231
1ser d1sera2 A:287-310,340-353,383-396
1ser d1serb2 B:787-810,840-854,883-896
1ati d1atib2 B:248-268,273-279,364-377
1ati d1atia2 A:248-268,273-279,364-377
1ggm d1ggma2 A:245-268,300-312,364-377
1ati d1atib2 B:248-268,300-312,364-377
1ati d1atia2 A:248-268,300-312,364-377
158. e.67.1 PH0156-like
PH0156-like 2 (sub)domains; d1: [alpha/beta with central mixed beta-sheet, order: 23415876, similarity to the G protein but no P-loop]; d2: [all-alpha, 5 helices, provides dimerization interface]
2p62 d2p62a1 A:10-26,89-97,231-241
2p62 d2p62b1 B:10-26,90-98,231-241
2p62 d2p62a1 A:10-26,57-65,231-241
2p62 d2p62b1 B:10-26,57-65,231-241
159. c.125.1 Creatininase
Creatininase 3 layers, a/b/a; core: parallel beta-sheet of 4 strands, order 2134
1j2t d1j2te_ E:43-61,112-119,234-258
1j2u d1j2ud_ D:43-61,112-120,234-258
1j2u d1j2uf_ F:43-61,112-119,234-258
1j2t d1j2td_ D:43-61,112-120,234-258
1j2t d1j2tf_ F:43-61,112-119,234-258
1v7z d1v7zc_ C:43-61,112-119,234-258
1v7z d1v7za_ A:43-61,112-119,234-258
1j2t d1j2tc_ C:43-61,112-119,234-258
1j2u d1j2ub_ B:43-61,112-120,234-258
1v7z d1v7zf_ F:43-61,112-119,234-258
1j2u d1j2uc_ C:43-61,112-119,234-258
1v7z d1v7zd_ D:43-61,112-119,234-258
1v7z d1v7zb_ B:43-61,112-120,234-258
1v7z d1v7ze_ E:43-61,112-120,234-258
1j2t d1j2tb_ B:43-61,112-120,234-258
1q3k d1q3kb_ B:43-61,112-119,234-258
1j2t d1j2ta_ A:43-61,112-120,234-258
1q3k d1q3kf_ F:41-61,112-119,234-258
1q3k d1q3ke_ E:42-61,112-119,234-258
1q3k d1q3kc_ C:42-61,112-120,234-258
1q3k d1q3kd_ D:41-61,112-119,234-258
1j2u d1j2ue_ E:42-61,112-120,234-258
1q3k d1q3ka_ A:42-61,112-120,234-258
1j2u d1j2ua_ A:42-61,112-120,234-258
1v7z d1v7zb_ B:43-61,146-152,234-258
1j2t d1j2te_ E:43-61,146-152,234-258
1j2t d1j2tb_ B:43-61,146-152,234-258
1j2t d1j2td_ D:43-61,146-152,234-258
1v7z d1v7za_ A:43-61,146-152,234-258
1j2u d1j2ub_ B:43-61,146-152,234-258
1q3k d1q3kb_ B:43-61,146-152,234-258
1v7z d1v7zd_ D:43-61,146-152,234-258
1v7z d1v7ze_ E:43-61,146-152,234-258
1j2t d1j2ta_ A:43-61,146-152,234-258
1j2u d1j2ud_ D:43-61,146-152,234-258
1v7z d1v7zc_ C:43-61,146-152,234-258
1v7z d1v7zf_ F:43-61,146-152,234-258
1j2t d1j2tf_ F:43-61,146-152,234-258
1j2t d1j2tc_ C:43-61,146-152,234-258
1j2u d1j2uf_ F:43-61,146-152,234-258
1j2u d1j2uc_ C:43-61,146-152,234-258
1q3k d1q3ke_ E:42-61,146-152,234-258
1q3k d1q3kc_ C:42-61,146-152,234-258
1q3k d1q3kd_ D:41-61,146-152,234-258
1q3k d1q3kf_ F:41-61,146-152,234-258
1q3k d1q3ka_ A:42-61,146-152,234-258
1j2u d1j2ua_ A:42-61,146-152,234-258
1j2u d1j2ue_ E:42-61,146-152,234-258
160. d.198.5 YgaC/TfoX-N like overall similar to the Type III secretory system chaperone subunits; different shape of the beta-sheet
Secretion chaperone-like alpha-beta(3)-alpha-beta(2)-alpha; 2 layers: alpha/beta
2od0 d2od0b1 B:4-17,34-42,88-104
2g7j d2g7ja1 A:4-16,33-40,98-112
2od0 d2od0a1 A:4-17,34-42,88-105
161. c.126.1 DNA polymerase III psi subunit
DNA polymerase III psi subunit 3 layers, a/b/a; parallel beta-sheet of 4 strands, order 2134
1em8 d1em8b_ B:51-62,98-106,114-129
1em8 d1em8d_ D:51-62,98-106,114-129
1em8 d1em8b_ B:51-62,83-91,114-129
1em8 d1em8d_ D:51-62,83-91,114-129
162. a.260.1 Rhabdovirus nucleoprotein-like
Rhabdovirus nucleoprotein-like multihelical, consist of two helical domains; each domain contains a buried helix
2gic d2gica1 A:65-78,108-112,188-206
2gic d2gice1 E:65-78,108-112,188-206
2gic d2gicc1 C:65-78,108-112,188-206
2gic d2gicd1 D:65-79,108-112,188-206
2gic d2gicb1 B:65-79,108-112,188-206
163. c.1.8 (Trans)glycosidases
TIM beta/alpha-barrel contains parallel beta-sheet barrel, closed; n=8, S=8; strand order 12345678 ! the first seven superfamilies have similar phosphate-binding sites
1hl9 d1hl9b2 B:106-118,319-327,334-352
1w3k d1w3ka_ A:45-57,258-266,290-303
2v38 d2v38a1 A:45-57,258-266,290-304
1h5v d1h5va_ A:45-57,258-266,290-304
1hf6 d1hf6a_ A:45-57,258-266,290-303
1hl8 d1hl8b2 B:106-118,319-327,334-352
1ocq d1ocqa_ A:45-57,258-266,290-303
1qhz d1qhza_ A:45-57,258-266,290-304
1l8n d1l8na1 A:177-191,193-199,455-472
1mqq d1mqqa1 A:177-191,193-199,455-472
2c8n d2c8nf2 F:52-62,344-355,372-386
1w3l d1w3la_ A:45-57,257-266,290-303
1gql d1gqla1 A:187-201,203-209,456-473
1gqj d1gqjb1 B:187-201,203-209,456-473
1gqk d1gqka1 A:187-201,203-209,456-473
1gql d1gqlb1 B:187-201,203-209,456-473
1gqk d1gqkb1 B:187-201,203-209,456-473
1hl8 d1hl8a2 A:106-118,318-327,334-352
1hl9 d1hl9a2 A:106-118,318-327,334-352
1mqr d1mqra1 A:177-191,193-198,455-472
1gqi d1gqib1 B:187-201,203-209,456-473
2c8n d2c8nd2 D:52-62,346-355,372-386
7a3h d7a3ha_ A:45-57,257-266,290-303
2c8n d2c8ne2 E:52-62,344-355,372-386
1gqi d1gqia1 A:187-201,203-209,456-473
1h41 d1h41a1 A:187-201,203-209,456-473
1fcu d1fcua_ A:29-37,296-302,309-333
1it0 d1it0a2 A:4-13,259-266,290-303
1odu d1odua2 A:106-118,319-327,334-358
2c7f d2c7fb2 B:52-62,347-355,372-386
2c7f d2c7fc2 C:52-62,347-355,372-386
2c7f d2c7fa2 A:52-62,347-355,372-386
2c7f d2c7fd2 D:52-62,347-355,372-386
1h41 d1h41b1 B:187-201,203-208,456-473
1odu d1odub2 B:106-118,319-327,334-358
1gqj d1gqja1 A:187-201,203-208,456-473
2vvs d2vvsa2 A:142-157,159-166,376-394
2jiw d2jiwb2 B:142-157,159-166,376-394
2j47 d2j47a2 A:142-157,159-166,376-394
2j4g d2j4ga2 A:142-157,159-166,376-394
2jiw d2jiwa2 A:142-157,159-166,376-394
2vvn d2vvnb2 B:142-157,159-166,376-394
2cho d2chob2 B:142-157,159-166,376-394
2j4g d2j4gb2 B:142-157,159-166,376-394
2cho d2choa2 A:142-157,159-166,376-394
2vvn d2vvna2 A:142-157,159-166,376-394
1xyf d1xyfa2 A:4-13,259-266,290-303
1v6w d1v6wb2 B:504-513,759-766,790-802
1isv d1isva2 A:4-13,259-266,290-302
1isx d1isxa2 A:4-13,259-266,290-302
1isy d1isya2 A:4-13,259-266,290-302
1isv d1isvb2 B:504-513,759-766,790-802
2chn d2chnb2 B:142-157,159-166,376-394
1isw d1iswa2 A:4-13,259-266,290-302
1v6u d1v6ua2 A:4-13,259-266,290-302
1v6w d1v6wa2 A:4-13,259-266,290-302
1v6v d1v6va2 A:4-13,259-266,290-302
1v6v d1v6vb2 B:504-513,759-766,790-802
1isy d1isyb2 B:504-513,759-766,790-802
1e0x d1e0xb_ B:4-13,259-266,290-302
1v6x d1v6xb2 B:504-513,759-766,790-802
1xyf d1xyfb2 B:504-513,759-766,790-802
2chn d2chna2 A:142-157,159-166,376-394
1v6x d1v6xa2 A:4-13,259-266,290-302
1v6u d1v6ub2 B:504-513,759-766,790-802
1isz d1isza2 A:4-13,259-266,290-302
1isw d1iswb2 B:504-513,759-766,790-802
1isx d1isxb2 B:504-513,759-766,790-802
1gjw d1gjwa2 A:125-133,494-501,549-567
1isz d1iszb2 B:504-513,759-766,790-802
1it0 d1it0b2 B:504-513,759-766,790-802
1e0x d1e0xa_ A:4-13,259-266,290-302
1gju d1gjua2 A:125-133,494-501,549-567
1yht d1yhta1 A:31-46,323-330,346-359
2d0g d2d0ga3 A:196-205,499-505,532-549
2j62 d2j62b2 B:194-209,211-218,433-451
1ji1 d1ji1b3 B:196-205,499-505,532-549
2d0f d2d0fa3 A:196-205,499-505,532-549
1ji1 d1ji1a3 A:196-205,499-505,532-549
1izj d1izja3 A:196-205,499-505,532-549
1k9e d1k9ea1 A:176-191,193-199,455-472
1uh4 d1uh4a3 A:196-205,499-505,532-549
1uh3 d1uh3a3 A:196-205,499-505,532-549
1uh2 d1uh2a3 A:196-205,499-505,532-549
1k9d d1k9da1 A:176-191,193-199,455-472
1k9f d1k9fa1 A:176-191,193-199,455-472
1izk d1izka3 A:196-205,499-505,532-549
1bvz d1bvzb3 B:178-186,448-454,480-498
2d0h d2d0ha3 A:196-205,499-505,532-549
1g1y d1g1ya3 A:178-186,448-454,480-498
1lwj d1lwja2 A:28-36,306-312,371-387
1xyz d1xyzb_ B:517-526,790-795,824-835
1m01 d1m01a1 A:166-181,436-442,456-469
1jak d1jaka1 A:166-181,436-442,456-469
1xyz d1xyza_ A:517-526,790-795,824-835
1lwj d1lwjb2 B:469-477,747-753,812-828
1mqp d1mqpa1 A:176-191,193-198,455-472
1m03 d1m03a1 A:166-181,436-442,456-469
2je8 d2je8a5 A:373-388,639-649,666-677
1eh9 d1eh9a3 A:124-132,409-415,470-488
1vfm d1vfmb3 B:178-186,448-454,480-498
1xyz d1xyzb_ B:517-526,527-533,824-835
1vfm d1vfma3 A:178-186,448-454,480-498
2vqu d2vqua5 A:373-388,639-649,666-677
1h1n d1h1na_ A:33-44,266-276,291-302
2d2o d2d2ob3 B:178-186,448-454,480-498
2je8 d2je8b5 B:373-388,639-649,666-677
1jl8 d1jl8b3 B:178-186,448-454,480-498
1xyz d1xyza_ A:517-526,527-533,824-835
1jf6 d1jf6b3 B:178-186,448-454,480-498
1vfu d1vfub3 B:178-186,448-454,480-498
1lwh d1lwha2 A:28-36,306-312,371-387
1wzm d1wzmb3 B:178-186,448-454,480-498
1lwh d1lwhb2 B:469-477,747-753,812-828
2vl4 d2vl4b5 B:373-388,639-649,666-677
1g1y d1g1yb3 B:178-186,448-454,480-498
1wzm d1wzma3 A:178-186,448-454,480-498
2vqu d2vqub5 B:373-388,639-649,666-677
1h1n d1h1nb_ B:33-44,266-276,291-302
2vl4 d2vl4a5 A:373-388,639-649,666-677
2vr4 d2vr4b5 B:373-388,639-649,666-677
1jf6 d1jf6a3 A:178-186,448-454,480-498
2vqt d2vqtb5 B:373-388,639-649,666-677
2vr4 d2vr4a5 A:373-388,639-649,666-677
1jf5 d1jf5b3 B:178-186,448-454,480-498
1j0k d1j0ka3 A:181-189,451-457,483-501
2vmf d2vmfb5 B:373-388,639-649,666-677
2vot d2vota5 A:373-388,639-649,666-677
1wzk d1wzka3 A:178-186,448-454,480-498
2vjx d2vjxb5 B:373-388,639-649,666-677
1uok d1uoka2 A:36-44,360-366,459-475
2vmf d2vmfa5 A:373-388,639-649,666-677
2vo5 d2vo5a5 A:373-388,639-649,666-677
2d2o d2d2oa3 A:178-186,448-454,480-498
1j0i d1j0ia3 A:181-189,451-457,483-501
1wzl d1wzla3 A:178-186,448-454,480-498
1jf5 d1jf5a3 A:178-186,448-454,480-498
1gzj d1gzja_ A:33-44,266-276,291-302
1ji2 d1ji2a3 A:178-186,448-454,480-498
2vot d2votb5 B:373-388,639-649,666-677
1bvz d1bvza3 A:178-186,448-454,480-498
1vb9 d1vb9a3 A:178-186,448-454,480-498
1j0k d1j0kb3 B:181-189,451-457,483-501
2vqt d2vqta5 A:373-388,640-649,666-677
1ta3 d1ta3b_ B:2-11,13-19,243-258
2vo5 d2vo5b5 B:373-388,639-649,666-677
1bqc d1bqca_ A:34-45,250-256,278-287
2vjx d2vjxa5 A:373-388,639-649,666-677
1wzk d1wzkb3 B:178-186,448-454,480-498
2taa d2taac2 C:48-56,323-329,356-377
2taa d2taab2 B:48-56,323-329,356-377
2taa d2taaa2 A:48-56,323-329,356-377
1m53 d1m53a2 A:78-86,401-407,500-516
1jib d1jibb3 B:178-186,448-454,480-498
1gzj d1gzjb_ B:33-44,266-276,291-302
1j0j d1j0jb3 B:181-189,451-457,483-501
1vfu d1vfua3 A:178-186,448-454,480-498
1vfo d1vfoa3 A:178-186,448-454,480-498
1vb9 d1vb9b3 B:178-186,448-454,480-498
1jl8 d1jl8a3 A:178-186,448-454,480-498
1ji2 d1ji2b3 B:178-186,448-454,480-498
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1wzl d1wzlb3 B:178-186,448-454,480-498
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1jg9 d1jg9a2 A:111-126,480-486,529-549
1mw1 d1mw1a2 A:111-126,480-486,529-549
2vrj d2vrja1 A:60-72,416-422,429-442
2cbu d2cbua1 A:60-72,416-422,429-442
1mvy d1mvya2 A:111-126,480-486,529-549
1g5a d1g5aa2 A:111-126,480-486,529-549
1qvb d1qvba_ A:61-73,417-425,455-468
1qvb d1qvbb_ B:61-73,417-425,455-468
1zs2 d1zs2a2 A:111-126,480-486,529-549
2c7f d2c7ff2 F:52-62,359-365,372-386
1uyq d1uyqa1 A:60-72,391-399,429-442
1jgi d1jgia2 A:111-126,480-486,529-549
2c7f d2c7fe2 E:52-62,359-365,372-386
1fcq d1fcqa_ A:29-37,296-302,309-324
2cbu d2cbub1 B:60-72,416-422,429-442
1mw0 d1mw0a2 A:111-126,480-486,529-549
1s46 d1s46a2 A:111-126,480-486,529-549
1np2 d1np2b_ B:58-70,378-386,417-430
1yq2 d1yq2e5 E:346-361,545-554,598-609
1yq2 d1yq2f5 F:346-361,545-554,598-609
1yq2 d1yq2d5 D:346-361,545-554,598-609
1yq2 d1yq2b5 B:346-361,545-554,598-609
1yq2 d1yq2c5 C:346-361,545-554,598-609
1yq2 d1yq2a5 A:346-361,545-554,598-609
1us3 d1us3a2 A:278-289,545-552,587-599
164. d.82.2 Frataxin/Nqo15-like
N domain of copper amine oxidase-like alpha-beta(5)-alpha; 2 layers: alpha/beta; meander antiparallel sheet
2fug d2fugh1 H:3-28,64-73,111-127
2fug d2fug71 7:3-28,64-73,111-127
2fug d2fugq1 Q:3-28,64-73,111-127
2fug d2fugz1 Z:3-28,64-73,111-127
1soy d1soya_ A:1-25,46-54,86-100
2p1x d2p1xa1 A:1-24,46-56,86-100
2eff d2effa1 A:1-24,46-56,86-100
1ew4 d1ew4a_ A:2-24,46-56,86-100
2fql d2fqla1 A:75-96,116-124,157-172
1ekg d1ekga_ A:91-116,139-150,181-195
2ga5 d2ga5a1 A:18-45,65-72,106-123
1ew4 d1ew4a_ A:2-24,29-36,86-100
2eff d2effa1 A:1-24,29-36,86-100
2p1x d2p1xa1 A:1-24,29-36,86-100
1ly7 d1ly7a_ A:90-117,141-150,181-195
2fug d2fugz1 Z:3-28,29-35,111-127
2fug d2fugh1 H:3-28,29-35,111-127
2fug d2fugq1 Q:3-28,29-35,111-127
2fug d2fug71 7:3-28,29-35,111-127
2fug d2fugh1 H:3-28,91-98,111-127
2fug d2fugq1 Q:3-28,91-98,111-127
2fug d2fugz1 Z:3-28,91-98,111-127
2fug d2fug71 7:3-28,91-98,111-127
165. c.143.1 CofD-like
CofD-like 3 layers: a/b/a, parallel beta-sheet of 7 strands, order 3214567; topological similarity to the CobT-like fold (scop_cf 52732)
2hzb d2hzbd1 D:12-26,179-186,302-312
2hzb d2hzbb1 B:12-26,179-186,302-312
2hzb d2hzba1 A:11-23,179-186,302-312
2hzb d2hzbd1 D:12-26,210-216,302-312
2hzb d2hzbc1 C:11-21,179-186,302-312
2hzb d2hzbb1 B:12-26,210-216,302-312
2hzb d2hzbd1 D:12-26,26-34,302-312
2hzb d2hzba1 A:11-23,210-216,302-312
2hzb d2hzbb1 B:12-26,26-34,302-312
2hzb d2hzbc1 C:11-21,210-216,302-312
2hzb d2hzba1 A:11-23,26-34,302-312
2hzb d2hzba1 A:11-23,26-34,187-198
2hzb d2hzbc1 C:11-21,26-34,187-198
2hzb d2hzbd1 D:12-26,291-296,302-312
2hzb d2hzbc1 C:11-21,291-296,302-312
166. d.148.1 Hect, E3 ligase catalytic domain
Hect, E3 ligase catalytic domain consists of two alpha+beta domains; the N-terminal domain is array of helices and beta-hairpins; the C-terminal domain is an a/b sandwich with one left-handed beta-alpha(n)-beta unit; conformational flexibility of domain orientation
1nd7 d1nd7a_ A:839-852,891-899,901-917
1nd7 d1nd7a_ A:825-838,891-899,901-917
1d5f d1d5fb_ B:761-774,821-827,831-846
1c4z d1c4zb_ B:761-774,821-829,831-846
1d5f d1d5fa_ A:761-774,821-828,831-846
1d5f d1d5fc_ C:761-774,821-829,831-846
1c4z d1c4zc_ C:761-774,821-829,831-846
1c4z d1c4za_ A:761-774,821-829,831-846
1c4z d1c4za_ A:775-788,821-829,831-846
1d5f d1d5fb_ B:775-788,821-827,831-846
1d5f d1d5fa_ A:775-788,821-828,831-846
1c4z d1c4zc_ C:775-788,821-829,831-846
1c4z d1c4zb_ B:775-788,821-829,831-846
1d5f d1d5fc_ C:775-788,821-829,831-846
167. c.1.9 Metallo-dependent hydrolases the beta-sheet barrel is similarly distorted and capped by a C-terminal helix ! has transition metal ions bound inside the barrel !
TIM beta/alpha-barrel contains parallel beta-sheet barrel, closed; n=8, S=8; strand order 12345678 ! the first seven superfamilies have similar phosphate-binding sites
1qw7 d1qw7a_ A:75-94,301-305,312-322
2d2h d2d2ha1 A:75-94,301-305,312-322
1ez2 d1ez2b_ B:75-94,301-305,312-322
1ez2 d1ez2a_ A:75-94,301-305,312-322
2d2g d2d2ga1 A:75-94,301-305,312-322
1psc d1psca_ A:75-94,301-305,312-322
1i0b d1i0bb_ B:75-94,301-305,312-322
1jgm d1jgmb_ B:75-94,301-305,312-322
1p6c d1p6cb_ B:75-94,301-305,312-322
1psc d1pscb_ B:75-94,301-305,312-322
1dpm d1dpma_ A:75-94,301-305,312-322
1i0d d1i0db_ B:75-94,301-305,312-322
1jgm d1jgma_ A:75-94,301-305,312-322
1i0b d1i0ba_ A:75-94,301-305,312-322
1eyw d1eywa_ A:75-94,301-305,312-322
1qw7 d1qw7b_ B:75-94,301-305,312-322
1dpm d1dpmb_ B:75-94,301-305,312-322
2d2j d2d2ja1 A:75-94,301-305,312-322
1hzy d1hzya_ A:75-94,301-305,312-322
1p6b d1p6bb_ B:75-94,301-305,312-322
1p6c d1p6ca_ A:75-94,301-305,312-322
1hzy d1hzyb_ B:75-94,301-305,312-322
1p6b d1p6ba_ A:75-94,301-305,312-322
1i0d d1i0da_ A:75-94,301-305,312-322
1onw d1onwb2 B:88-96,279-287,306-322
1yix d1yixb1 B:21-33,33-40,220-236
3be7 d3be7f2 F:79-98,312-317,320-335
3dug d3dugf2 F:79-98,312-317,320-335
3be7 d3be7g2 G:79-98,312-317,320-335
3be7 d3be7e2 E:79-98,312-317,320-335
3dug d3dugh2 H:79-98,312-317,320-335
3dug d3dugb2 B:79-98,312-317,320-335
3be7 d3be7b2 B:79-98,312-317,320-335
3dug d3dugg2 G:79-98,312-317,320-335
3dug d3dugd2 D:79-98,312-317,320-335
3dug d3duga2 A:79-98,312-317,320-335
3dug d3duge2 E:79-98,312-317,320-335
3dug d3dugc2 C:79-98,312-317,320-335
3be7 d3be7d2 D:79-98,312-317,320-335
3be7 d3be7c2 C:79-98,312-317,320-335
1yix d1yixa1 A:21-33,35-41,220-236
3be7 d3be7a2 A:79-98,312-317,320-335
2pnk d2pnkj1 J:123-136,136-145,358-388
2pnk d2pnkh1 H:123-136,136-145,358-388
1xwy d1xwya1 A:16-28,30-37,222-238
2pnk d2pnki1 I:123-136,136-145,358-388
2pnk d2pnkl1 L:123-136,136-145,358-388
1zzm d1zzma1 A:20-32,32-40,222-238
2qee d2qeee1 E:123-136,138-145,358-388
2qee d2qeec1 C:123-136,138-145,358-388
2pnk d2pnkc1 C:123-136,138-145,358-388
2pnk d2pnkk1 K:123-136,138-145,358-388
2qee d2qeel1 L:123-136,138-145,358-388
2pnk d2pnka1 A:123-136,138-145,358-388
2pnk d2pnkg1 G:123-136,138-145,358-388
2pnk d2pnke1 E:123-136,138-145,358-388
2pnk d2pnkb1 B:123-136,138-145,358-388
1j5s d1j5sb_ B:135-144,144-153,400-426
2f6k d2f6ka1 A:36-48,260-265,271-285
1j5s d1j5sa_ A:135-144,144-153,400-426
3be7 d3be7f2 F:79-98,100-105,320-335
3dug d3dugh2 H:79-98,100-105,320-335
3dug d3dugf2 F:79-98,100-105,320-335
3dug d3dugd2 D:79-98,100-105,320-335
3dug d3duga2 A:79-98,100-105,320-335
3dug d3duge2 E:79-98,100-105,320-335
3dug d3dugb2 B:79-98,100-105,320-335
3be7 d3be7e2 E:79-98,100-105,320-335
3be7 d3be7d2 D:79-98,100-105,320-335
3be7 d3be7b2 B:79-98,100-105,320-335
3be7 d3be7a2 A:79-98,100-105,320-335
1j5s d1j5sc_ C:135-144,144-154,400-426
1j6o d1j6oa_ A:15-27,27-36,216-232
2paj d2paja2 A:111-130,330-335,345-361
1i0d d1i0db_ B:75-94,96-101,323-340
1qw7 d1qw7a_ A:75-94,96-101,323-340
1jgm d1jgmb_ B:75-94,96-101,323-340
1hzy d1hzyb_ B:75-94,96-101,323-340
1i0b d1i0bb_ B:75-94,96-101,323-340
1kcx d1kcxa2 A:228-247,273-279,475-490
1jgm d1jgma_ A:75-94,96-101,323-340
1kcx d1kcxb2 B:228-247,273-279,475-490
1hzy d1hzya_ A:75-94,96-101,323-340
1i0d d1i0da_ A:75-94,96-101,323-340
1qw7 d1qw7b_ B:75-94,96-101,323-340
1i0b d1i0ba_ A:75-94,96-101,323-340
168. c.1.2 Ribulose-phoshate binding barrel
TIM beta/alpha-barrel contains parallel beta-sheet barrel, closed; n=8, S=8; strand order 12345678 ! the first seven superfamilies have similar phosphate-binding sites
1a5b d1a5ba_ A:29-44,46-52,247-267
2clo d2cloa1 A:29-44,46-52,247-267
1kfe d1kfea_ A:29-44,46-52,247-267
2cli d2clia1 A:29-44,46-52,247-267
2clh d2clha1 A:29-44,46-52,247-267
1k8x d1k8xa_ A:29-44,46-52,247-267
1kfc d1kfca_ A:29-44,46-52,247-267
2rhg d2rhga1 A:29-44,46-52,247-267
1k3u d1k3ua_ A:29-44,46-52,247-267
2cll d2clla1 A:29-44,46-52,247-267
2clf d2clfa1 A:29-44,46-52,247-267
2j9z d2j9za1 A:29-44,46-52,247-267
2clm d2clma1 A:29-44,46-52,247-267
2cle d2clea1 A:29-44,46-52,247-267
1xc4 d1xc4a_ A:29-44,46-52,247-267
1kfk d1kfka_ A:29-44,46-52,247-267
1xc4 d1xc4b_ B:29-44,46-52,247-267
1c29 d1c29a_ A:29-44,46-52,247-267
1k7e d1k7ea_ A:29-44,46-52,247-267
1kfb d1kfba_ A:29-44,46-52,247-267
1cx9 d1cx9a_ A:29-44,46-52,247-267
2j9y d2j9ya1 A:29-44,46-52,247-267
1k8y d1k8ya_ A:29-44,46-52,247-267
2rh9 d2rh9a1 A:29-44,46-52,247-267
1tjp d1tjpa1 A:29-44,46-52,247-267
2j9x d2j9xa1 A:29-44,46-52,247-267
1qoq d1qoqa_ A:29-44,46-52,247-267
1a5s d1a5sa_ A:29-44,46-52,247-267
1qop d1qopa_ A:29-44,46-52,247-267
3cep d3cepa1 A:29-44,46-52,247-267
1wbj d1wbja1 A:29-44,46-52,247-267
2clk d2clka1 A:29-44,46-52,247-267
1cw2 d1cw2a_ A:29-44,46-52,247-267
1kfj d1kfja_ A:29-44,46-52,247-267
1fuy d1fuya_ A:29-44,46-52,247-267
1k7x d1k7xa_ A:29-44,46-52,247-267
1beu d1beua_ A:29-44,46-52,247-268
1a50 d1a50a_ A:29-44,46-52,247-267
1bks d1bksa_ A:29-44,46-52,247-267
1c8v d1c8va_ A:29-44,46-52,247-267
1c9d d1c9da_ A:29-44,46-52,247-267
1k7f d1k7fa_ A:29-44,46-52,247-267
1pii d1piia1 A:244-255,422-427,438-452
1k8z d1k8za_ A:29-44,46-52,247-268
1a5a d1a5aa_ A:29-44,46-52,247-268
1wq5 d1wq5b1 B:1029-1044,1046-1052,1247-1268
1wq5 d1wq5a1 A:29-44,46-52,247-268
1ttp d1ttpa_ A:29-44,46-52,247-268
2trs d2trsa_ A:29-44,46-52,247-268
1pii d1piia1 A:244-255,256-261,438-452
1pii d1piia1 A:264-275,422-427,438-452
1v5x d1v5xb_ B:10-21,169-174,185-200
1znn d1znnf1 F:27-38,230-235,243-258
1znn d1znnb1 B:27-38,230-235,243-258
2wsy d2wsya_ A:29-44,46-52,251-268
1v5x d1v5xa_ A:10-21,169-174,185-200
1znn d1znnc1 C:27-38,230-235,243-258
1znn d1znne1 E:27-38,230-235,243-258
1znn d1znna1 A:27-38,230-235,243-258
1znn d1znnd1 D:27-38,230-235,243-258
1gpw d1gpwa_ A:31-43,45-53,223-230
2j9y d2j9ya1 A:2-15,229-234,247-267
1vc4 d1vc4b_ B:66-78,231-236,244-254
1a5s d1a5sa_ A:2-15,229-233,247-267
1vc4 d1vc4a_ A:66-78,231-236,244-254
1lbf d1lbfa_ A:65-77,228-233,239-248
1igs d1igsa_ A:65-77,228-233,239-248
1a53 d1a53a_ A:65-77,228-233,239-248
1lbl d1lbla_ A:65-77,228-233,239-248
1i4n d1i4na_ A:63-75,226-231,239-252
1i4n d1i4nb_ B:63-75,226-231,239-252
1jul d1jula_ A:65-77,228-233,239-248
1juk d1juka_ A:65-77,228-233,239-248
1jcm d1jcmp_ P:69-81,231-236,244-255
1pii d1piia2 A:69-81,231-236,244-255
1dbt d1dbtb_ B:14-26,30-35,222-236
1dbt d1dbtc_ C:14-26,30-35,222-236
1dbt d1dbta_ A:14-26,30-35,222-236
1eix d1eixa_ A:25-37,41-46,229-242
1jjk d1jjkg_ G:25-37,41-46,229-242
1jjk d1jjkd_ D:25-37,41-46,229-242
1jjk d1jjkb_ B:25-37,41-46,229-242
1jjk d1jjkh_ H:25-37,41-46,229-242
1jjk d1jjki_ I:25-37,41-46,229-242
1jjk d1jjkj_ J:25-37,41-46,229-242
1jjk d1jjko_ O:25-37,41-46,229-242
1jjk d1jjkf_ F:25-37,41-46,229-242
1jjk d1jjka_ A:25-37,41-46,229-242
1jjk d1jjkc_ C:25-37,41-46,229-242
1jjk d1jjke_ E:25-37,41-46,229-242
1jjk d1jjkl_ L:25-37,41-46,229-242
1jjk d1jjkp_ P:25-37,41-46,229-242
1jjk d1jjkm_ M:25-37,41-46,229-242
1jjk d1jjkn_ N:25-37,41-46,229-242
1jjk d1jjkk_ K:25-37,41-46,229-242
1eix d1eixc_ C:25-37,41-46,229-243
1eix d1eixd_ D:25-37,41-47,229-242
2za2 d2za2b1 B:74-98,287-293,301-316
2za1 d2za1b1 B:75-98,287-293,301-316
2za3 d2za3b1 B:75-98,287-293,301-317
2za3 d2za3a1 A:74-98,287-293,301-318
2za1 d2za1a1 A:74-98,287-293,301-318
2za2 d2za2a1 A:75-98,287-293,301-318
2aqw d2aqwa1 A:77-101,290-296,304-322
2ffc d2ffca1 A:105-129,318-324,332-351
3bar d3bara1 A:74-98,287-293,301-321
2q8z d2q8zb1 B:74-98,287-293,301-321
2guu d2guua1 A:105-129,318-324,332-352
3bar d3barb1 B:74-98,287-293,301-321
2qaf d2qafb1 B:74-98,287-293,301-321
2qaf d2qafa1 A:74-98,287-293,301-322
2zcg d2zcgb1 B:75-98,287-293,301-322
2fds d2fdsb1 B:76-100,289-295,303-324
2q8l d2q8la1 A:74-98,287-293,301-322
2q8z d2q8za1 A:74-98,287-293,301-323
2fds d2fdsa1 A:76-100,289-295,303-324
2f84 d2f84a1 A:74-98,287-293,301-323
169. c.113.1 HemD-like
HemD-like duplication: consists of two similar 'swapped' domain with 3 layers (a/b/a) each; parallel beta-sheet of 5 strands, order 21345
1wd7 d1wd7a_ A:18-30,185-190,244-261
1wd7 d1wd7b_ B:18-30,185-190,244-260
1jr2 d1jr2a_ A:17-27,191-196,247-260
1jr2 d1jr2b_ B:17-27,28-34,247-260
1jr2 d1jr2a_ A:17-27,28-35,247-260
1wd7 d1wd7a_ A:18-30,31-37,244-261
1wd7 d1wd7b_ B:18-30,31-37,244-260
170. c.18.1 Uracil-DNA glycosylase-like
Uracil-DNA glycosylase-like 3 layers, a/b/a; core: parallel beta-sheet of 4 strands, order 2134
1ui0 d1ui0a_ A:56-70,115-121,169-188
1ui1 d1ui1a_ A:56-70,115-121,169-188
1l9g d1l9ga_ A:61-75,119-125,170-189
1vk2 d1vk2a_ A:61-75,119-125,170-189
1mug d1muga_ A:35-45,102-108,148-164
1mwi d1mwia_ A:35-45,102-108,148-164
1mwj d1mwja_ A:35-45,102-108,148-164
1oe5 d1oe5a_ A:146-161,219-225,261-274
1oe4 d1oe4a_ A:146-161,219-225,261-274
1oe5 d1oe5b_ B:146-161,219-225,261-274
1oe6 d1oe6b_ B:146-161,219-225,261-274
1oe4 d1oe4b_ B:146-161,219-225,261-274
1oe6 d1oe6a_ A:146-161,219-225,261-274
2q07 d2q07a2 A:275-286,343-349,378-390
171. a.269.1 FtsH protease domain-like contains zincin-like (
FtsH protease domain-like array of 6 helices and a 2-stranded beta-ribbon
2cea d2ceac1 C:413-435,441-445,452-459
172. d.50.1 dsRNA-binding domain-like
dsRBD-like alpha-beta(3)-alpha; 2 layers: alpha/beta
1t4o d1t4ob_ B:367-379,409-417,419-435
1t4o d1t4oa_ A:367-379,409-417,419-435
1o0w d1o0wb2 B:168-182,209-218,219-237
1o0w d1o0wa2 A:168-182,209-218,219-236
1qu6 d1qu6a2 A:105-118,120-128,154-174
1uhz d1uhza_ A:7-20,48-56,57-74
1h2i d1h2ij_ J:67-80,83-100,134-159
1h2i d1h2ih_ H:67-80,83-100,134-159
1h2i d1h2is_ S:67-80,83-100,134-159
1h2i d1h2iu_ U:67-80,83-100,134-159
1h2i d1h2ii_ I:67-80,83-100,134-159
1h2i d1h2iv_ V:67-80,83-100,134-159
1h2i d1h2io_ O:67-80,83-100,134-159
1h2i d1h2im_ M:67-80,83-100,134-159
1h2i d1h2it_ T:67-80,83-100,134-159
1h2i d1h2ia_ A:67-80,83-100,134-159
1h2i d1h2ik_ K:67-80,83-100,134-159
1h2i d1h2ic_ C:67-80,83-100,134-159
1h2i d1h2ib_ B:67-80,83-100,134-159
1h2i d1h2ir_ R:67-80,83-100,134-159
1h2i d1h2ig_ G:67-80,83-100,134-159
1h2i d1h2ip_ P:67-80,83-100,134-159
1h2i d1h2il_ L:67-80,83-100,134-159
1h2i d1h2id_ D:67-80,83-100,134-159
1h2i d1h2ie_ E:67-80,83-100,134-159
1h2i d1h2if_ F:67-80,83-100,134-159
1t4o d1t4ob_ B:367-379,384-395,419-435
1h2i d1h2iq_ Q:67-80,83-100,134-159
1h2i d1h2in_ N:67-80,83-100,134-159
1kn0 d1kn0k_ K:67-80,83-100,134-159
1kn0 d1kn0d_ D:67-80,83-100,134-159
1t4o d1t4oa_ A:367-379,409-417,434-443
1kn0 d1kn0i_ I:67-80,83-100,134-159
1kn0 d1kn0c_ C:67-80,83-100,134-159
1kn0 d1kn0e_ E:67-80,83-100,134-159
1kn0 d1kn0j_ J:67-80,83-100,134-159
1kn0 d1kn0a_ A:67-80,83-100,134-159
1kn0 d1kn0g_ G:67-80,83-100,134-159
1kn0 d1kn0f_ F:67-80,83-100,134-159
1kn0 d1kn0h_ H:67-80,83-100,134-159
1kn0 d1kn0b_ B:67-80,83-100,134-159
1t4o d1t4oa_ A:367-379,384-395,419-435
2nuf d2nufa2 A:151-165,168-179,201-220
2ez6 d2ez6b2 B:151-165,168-179,201-220
2nug d2nuga2 A:151-165,168-179,201-218
2nuf d2nufb2 B:151-165,168-179,201-220
2nug d2nugb2 B:151-165,168-179,201-220
1yz9 d1yz9b2 B:151-165,168-179,201-220
2ez6 d2ez6a2 A:151-165,168-179,201-220
1yyo d1yyob2 B:151-165,168-179,201-220
1uhz d1uhza_ A:7-20,24-35,57-74
1yyk d1yyka2 A:151-165,168-179,201-221
1rc7 d1rc7a2 A:151-165,168-179,201-220
2nue d2nuea2 A:151-165,168-179,201-220
1t4o d1t4ob_ B:367-379,409-417,434-447
1yyw d1yywa2 A:151-165,168-179,201-220
1yyw d1yywb2 B:151-165,168-178,201-220
1o0w d1o0wa2 A:168-182,185-196,219-236
1yyw d1yywd2 D:151-165,168-178,201-220
1yyw d1yywc2 C:151-165,168-178,201-219
2nue d2nueb2 B:151-165,168-179,201-220
1di2 d1di2a_ A:112-125,129-140,162-180
1yyo d1yyoa2 A:151-165,168-178,201-220
1yz9 d1yz9a2 A:151-165,168-178,201-220
1o0w d1o0wb2 B:168-182,185-196,219-237
1whn d1whna_ A:369-382,386-395,418-435
1yyk d1yykb2 B:151-165,168-178,201-221
1whq d1whqa_ A:3-16,19-29,53-73
173. c.42.1 Arginase/deacetylase
Arginase/deacetylase 3 layers: a/b/a, parallel beta-sheet of 8 strands, order 21387456
3c0y d3c0yc1 C:544-559,834-840,844-861
3c0z d3c0zc1 C:544-559,834-840,844-861
1t69 d1t69a_ A:36-49,297-305,307-324
3c0y d3c0yb1 B:544-559,834-840,844-861
3c10 d3c10c1 C:544-559,834-840,844-861
1t67 d1t67a_ A:36-49,297-304,307-324
3c0y d3c0ya1 A:544-559,834-840,844-861
3c0z d3c0zb1 B:544-559,834-840,844-861
3c10 d3c10a1 A:544-559,834-840,844-861
1w22 d1w22a_ A:36-49,297-304,307-324
3c0z d3c0za1 A:544-559,834-840,844-861
3c10 d3c10b1 B:544-559,834-840,844-861
1vkg d1vkga_ A:36-49,297-304,307-324
1cev d1cevf_ F:31-40,90-98,280-295
2cev d2ceve_ E:31-40,90-97,280-295
1cev d1ceva_ A:31-40,90-98,280-295
2cev d2cevc_ C:31-40,90-97,280-295
1cev d1cevc_ C:31-40,90-98,280-295
1cev d1cevb_ B:31-40,90-97,280-295
2cev d2cevd_ D:31-40,90-97,280-295
1cev d1cevd_ D:31-40,90-98,280-295
2cev d2ceva_ A:31-40,90-98,280-295
2cev d2cevb_ B:31-40,90-97,280-295
1cev d1ceve_ E:31-40,90-98,280-295
2cev d2cevf_ F:31-40,90-97,280-295
5cev d5ceva_ A:31-40,90-98,280-295
5cev d5ceve_ E:31-40,90-98,280-295
3cev d3cevf_ F:31-40,90-97,280-295
5cev d5cevc_ C:31-40,90-98,280-295
5cev d5cevf_ F:31-40,90-98,280-295
3cev d3cevc_ C:31-40,90-97,280-295
5cev d5cevd_ D:31-40,90-98,280-295
3cev d3ceve_ E:31-40,90-97,280-295
4cev d4ceva_ A:31-40,90-97,280-295
4cev d4cevd_ D:31-40,90-97,280-295
3cev d3ceva_ A:31-40,90-97,280-295
4cev d4ceve_ E:31-40,90-97,280-295
4cev d4cevc_ C:31-40,90-97,280-295
3cev d3cevd_ D:31-40,90-98,280-295
1t64 d1t64b_ B:36-49,297-304,307-324
1t64 d1t64a_ A:36-49,297-304,307-324
5cev d5cevb_ B:31-40,90-98,280-295
4cev d4cevf_ F:31-40,90-97,280-295
3cev d3cevb_ B:31-40,90-97,280-295
4cev d4cevb_ B:31-40,90-97,280-295
2pha d2phab1 B:21-35,271-277,285-305
1wva d1wvaa1 A:21-35,271-277,285-305
1wvb d1wvba1 A:21-35,271-277,285-305
3dj8 d3dj8b1 B:21-35,271-277,285-305
3c0y d3c0yb1 B:544-559,658-663,844-861
2zav d2zavb1 B:21-35,271-277,285-305
2pha d2phaa1 A:21-35,271-277,285-305
1hqf d1hqfc_ C:21-35,271-277,285-305
1hqf d1hqfa_ A:21-35,271-277,285-305
1hqf d1hqfb_ B:21-35,271-277,285-305
2aeb d2aeba1 A:21-35,271-277,285-305
3dj8 d3dj8a1 A:21-35,271-277,285-305
2pll d2pllb1 B:21-35,271-277,285-305
2pho d2phob1 B:21-35,271-277,285-305
3c0y d3c0yc1 C:544-559,658-663,844-861
3c0z d3c0zb1 B:544-559,658-663,844-861
3c10 d3c10c1 C:544-559,658-663,844-861
1c3s d1c3sa_ A:26-39,121-126,298-315
1c3p d1c3pa_ A:26-39,121-126,298-315
3c0z d3c0zc1 C:544-559,658-663,844-861
2pll d2plla1 A:21-35,271-277,285-305
1pq3 d1pq3e_ E:53-62,111-119,304-324
1pq3 d1pq3b_ B:53-62,111-119,304-324
1wvb d1wvbb1 B:21-35,271-277,285-305
1cev d1cevd_ D:19-31,265-271,280-295
1cev d1cevf_ F:19-31,265-271,280-295
3c10 d3c10b1 B:544-559,658-663,844-861
1pq3 d1pq3d_ D:53-62,111-119,304-324
1pq3 d1pq3a_ A:53-62,111-119,304-324
1ta1 d1ta1b1 B:22-35,271-277,285-305
1cev d1cevb_ B:19-31,265-271,280-295
1wva d1wvab1 B:21-35,271-277,285-305
1cev d1ceve_ E:19-31,265-271,280-295
1cev d1ceva_ A:19-31,265-271,280-295
1cev d1cevc_ C:19-31,265-271,280-295
2pho d2phoa1 A:21-35,271-277,285-305
5rla d5rlab_ B:22-35,271-277,285-305
5rla d5rlaa_ A:22-35,271-277,285-305
1ta1 d1ta1c1 C:22-35,271-277,285-305
4rla d4rlac_ C:22-35,271-277,285-305
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1wog d1wogf_ F:46-63,265-274,283-304
1woh d1woha_ A:46-63,265-274,283-304
1woi d1woic_ C:46-63,265-274,283-304
1wog d1wogc_ C:46-63,265-274,283-304
1woi d1woid_ D:46-63,265-274,283-304
1wog d1wogb_ B:46-63,265-274,283-304
1woh d1wohf_ F:46-60,265-274,283-304
1woi d1woib_ B:46-60,265-274,283-304
1woh d1wohd_ D:46-60,265-274,283-304
1xfk d1xfka_ A:63-79,292-300,309-333
1wog d1wogd_ D:46-60,265-274,283-304
1woh d1wohc_ C:46-60,265-274,283-304
1woh d1wohb_ B:46-60,265-274,283-304
1woi d1woia_ A:46-63,264-274,283-304
1wog d1woga_ A:46-63,264-274,283-304
1woh d1wohe_ E:46-60,264-274,283-304
1wog d1woge_ E:46-63,264-274,283-304
1woi d1woie_ E:46-63,264-274,283-304
1gq6 d1gq6c_ C:47-60,271-279,288-309
1gq6 d1gq6a_ A:47-60,271-279,288-309
1gq6 d1gq6b_ B:47-60,271-279,288-309
1gq7 d1gq7e_ E:47-60,271-279,288-309
1gq7 d1gq7b_ B:47-60,271-279,288-309
1gq7 d1gq7a_ A:47-60,271-279,288-309
174. c.145.1 NadA-like
NadA-like duplication; consists of three similar domains related by pseudo threefold symmetry; 3 layers, a/b/a; parallel beta sheet, order: 2134
1wzu d1wzua1 A:25-32,51-57,263-274
1wzu d1wzua1 A:58-70,104-110,113-120
1wzu d1wzua1 A:146-158,191-196,200-207
175. c.99.1 Dipeptide transport protein
Dipeptide transport protein 3 layers: a/b/a; parallel beta-sheet of 6 strands, order 321456; also contains a C-terminal alpha+beta subdomain
1hi9 d1hi9e_ E:25-50,96-102,186-205
1hi9 d1hi9b_ B:25-50,96-102,186-205
1hi9 d1hi9a_ A:25-50,96-102,186-205
1hi9 d1hi9c_ C:25-50,96-102,186-205
1hi9 d1hi9d_ D:25-50,96-102,186-205
1hi9 d1hi9b_ B:25-50,147-153,186-205
1hi9 d1hi9a_ A:25-50,147-153,186-205
1hi9 d1hi9e_ E:25-50,147-153,186-205
1hi9 d1hi9c_ C:25-50,147-153,186-205
1hi9 d1hi9d_ D:25-50,147-153,186-205
176. f.1.3 delta-Endotoxin (insectocide), N-terminal domain
Toxins' membrane translocation domains multi-helical domains of various folds which is thought to unfold in the membrane
1ji6 d1ji6a3 A:259-277,303-310,321-329
1ciy d1ciya3 A:222-240,266-270,282-292
1dlc d1dlca3 A:258-288,302-309,320-328
177. c.149.1 AtpF-like
AtpF-like 3 layers, a/b/a; core: parallel beta-sheet of 4 strands, order 2134
2d00 d2d00e1 E:11-22,24-28,30-45
2d00 d2d00f1 F:11-22,24-28,30-45
2d00 d2d00d1 D:11-22,24-28,30-45
178. c.1.20 tRNA-guanine transglycosylase
TIM beta/alpha-barrel contains parallel beta-sheet barrel, closed; n=8, S=8; strand order 12345678 ! the first seven superfamilies have similar phosphate-binding sites
1pud d1puda_ A:71-79,129-136,136-148
1wkd d1wkda_ A:71-79,129-136,136-148
1wke d1wkea_ A:71-79,129-136,136-148
1wkf d1wkfa_ A:71-79,129-136,136-148
1q66 d1q66a_ A:70-79,131-136,136-148
2z7k d2z7ka1 A:71-79,132-136,136-148
2bbf d2bbfa1 A:71-79,131-136,136-148
1s38 d1s38a_ A:71-79,132-136,136-148
1ozq d1ozqa_ A:71-79,131-136,136-148
1ozm d1ozma_ A:71-79,131-136,136-148
1pxg d1pxga_ A:71-79,131-136,136-148
1q2r d1q2rd_ D:71-79,131-136,136-148
1q2r d1q2rb_ B:71-79,131-136,136-148
1s39 d1s39a_ A:71-79,131-136,136-148
1y5x d1y5xd1 D:1070-1079,1132-1136,1136-1148
1q2r d1q2ra_ A:71-79,129-136,136-148
1q2r d1q2rc_ C:71-79,129-136,136-148
1q65 d1q65a_ A:70-79,129-136,136-148
179. d.58.16 PAP/Archaeal CCA-adding enzyme, C-terminal domain
Ferredoxin-like alpha+beta sandwich with antiparallel beta-sheet; (beta-alpha-beta)x2
2drb d2drba3 A:263-275,276-285,423-434
1tfy d1tfyc3 C:263-275,276-285,423-434
2zha d2zhaa3 A:263-275,276-285,423-434
1tfy d1tfyd3 D:263-275,276-285,423-434
2zh6 d2zh6a3 A:263-275,276-285,423-434
2zh8 d2zh8a3 A:263-275,276-285,423-434
1tfw d1tfwc3 C:263-275,276-285,423-434
1r8a d1r8aa3 A:263-275,276-285,423-434
2zh7 d2zh7a3 A:263-275,276-285,423-434
2dra d2draa3 A:263-275,276-285,423-434
2zh4 d2zh4a3 A:263-275,276-285,423-434
2zhb d2zhba3 A:263-275,276-285,423-434
1r89 d1r89a3 A:263-275,276-285,423-434
1r8b d1r8ba3 A:263-275,276-285,423-434
1uet d1ueta3 A:263-275,276-285,423-434
2dr8 d2dr8a3 A:263-275,276-285,423-434
2dr9 d2dr9a3 A:263-275,276-285,423-434
2zh3 d2zh3a3 A:263-275,276-285,423-434
2zh5 d2zh5a3 A:263-275,276-285,423-434
2zh9 d2zh9a3 A:263-275,276-285,423-434
1uev d1ueva3 A:263-275,276-285,423-434
1ueu d1ueua3 A:263-275,276-285,423-434
2dr7 d2dr7a3 A:263-275,276-285,423-434
1tfy d1tfya3 A:263-275,276-285,423-434
1tfw d1tfwb3 B:263-275,276-285,423-434
2dr5 d2dr5a3 A:263-275,276-285,423-434
1r8c d1r8ca3 A:263-275,276-285,423-434
2dvi d2dvia3 A:263-275,276-285,423-434
1tfw d1tfwd3 D:263-275,276-285,423-434
1tfw d1tfwa3 A:263-275,276-285,423-434
1sz1 d1sz1b3 B:263-275,276-285,423-434
1sz1 d1sz1a3 A:263-275,276-285,423-434
1tfy d1tfyb3 B:263-275,276-285,425-434
2zh1 d2zh1a3 A:263-275,276-284,423-434
2zh2 d2zh2a3 A:263-275,276-284,423-434
180. e.51.1 Urocanase
Urocanase 3 domains; d1: alpha+beta [alpha(2)-beta(3); mixed sheet: 213]; d2: alpha/beta of the NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily (scop_sf 51735, most similar to scop_fa 51883 and scop_fa 51736); d3: alpha+beta of the glutamine synthetase/guanido kinase fold (scop_cf 55930); d1 and d3 form a single beta-sheet
1w1u d1w1ub_ B:140-162,318-322,344-351
181. c.30.1 PreATP-grasp domain precedes the ATP-grasp domain common to all superfamily members, can contain a substrate-binding function !
PreATP-grasp domain 3 layers: a/b/a; parallel or mixed beta-sheet of 4 to 6 strands ! possible rudiment form of Rossmann-fold domain
1glv d1glva1 A:19-32,81-87,300-316
1w96 d1w96a2 A:67-87,144-148,398-409
1w96 d1w96c2 C:67-87,144-148,398-409
1uc8 d1uc8a1 A:10-24,50-56,266-279
1jdb d1jdbk4 K:574-592,635-639,859-870
1kj9 d1kj9a2 A:21-35,77-82,298-309
1kjj d1kjjb2 B:21-35,77-82,298-309
1ez1 d1ez1b2 B:21-35,77-82,298-309
1ce8 d1ce8c4 C:575-593,636-640,860-871
1cs0 d1cs0g4 G:575-593,636-640,860-871
1eyz d1eyza2 A:21-35,77-82,298-309
1gsa d1gsaa1 A:19-32,81-87,300-314
1c30 d1c30g4 G:575-593,636-640,860-871
2glt d2glta1 A:19-32,81-87,300-316
1uc8 d1uc8b1 B:10-24,50-56,266-279
1cs0 d1cs0c4 C:575-593,636-640,860-871
1kj9 d1kj9b2 B:21-35,77-82,298-309
1c30 d1c30c4 C:575-593,636-640,860-871
1ce8 d1ce8a4 A:575-593,636-640,860-871
1cs0 d1cs0a4 A:575-593,636-640,860-871
1t36 d1t36a4 A:575-593,636-640,860-871
1kj8 d1kj8b2 B:21-35,77-82,298-309
1eyz d1eyzb2 B:21-35,77-82,298-309
1kji d1kjib2 B:21-35,77-82,298-309
1t36 d1t36g4 G:575-593,636-640,860-871
1t36 d1t36e4 E:575-593,636-640,860-871
1c3o d1c3og4 G:575-593,636-640,860-871
1uc9 d1uc9a1 A:10-24,50-56,266-279
1c3o d1c3oc4 C:575-593,636-640,860-871
1gsh d1gsha1 A:19-32,81-87,300-316
1a9x d1a9xg4 G:6575-6593,6636-6640,6860-6871
1ez1 d1ez1a2 A:21-35,77-82,298-309
1jdb d1jdbe4 E:574-592,635-639,859-870
1jdb d1jdbh4 H:574-592,635-639,859-870
1a9x d1a9xa4 A:575-593,636-640,860-871
1m6v d1m6va4 A:575-593,636-640,860-871
1t36 d1t36c4 C:575-593,636-640,860-871
1kji d1kjia2 A:21-35,77-82,298-309
1kjq d1kjqb2 B:21-35,77-82,298-309
1kee d1keeg4 G:575-593,636-640,860-871
2gpw d2gpwb2 B:10-25,76-81,307-318
1kj8 d1kj8a2 A:21-35,77-82,298-309
1kee d1keec4 C:575-593,636-640,860-871
1m6v d1m6vg4 G:575-593,636-640,860-871
1uc9 d1uc9b1 B:10-24,50-56,266-279
1c3o d1c3oa4 A:575-593,636-640,860-871
1a9x d1a9xc4 C:2575-2593,2636-2640,2860-2871
1ce8 d1ce8e4 E:575-593,636-640,860-871
1kjj d1kjja2 A:21-35,77-82,298-309
1m6v d1m6vc4 C:575-593,636-640,860-871
1jdb d1jdbb4 B:574-592,635-639,859-870
1c30 d1c30e4 E:575-593,636-640,860-871
1c3o d1c3oe4 E:575-593,636-640,860-871
2j9g d2j9gb2 B:10-25,76-81,307-318
1a9x d1a9xe4 E:4575-4593,4636-4640,4860-4871
1kee d1keea4 A:575-593,636-640,860-871
1m6v d1m6ve4 E:575-593,636-640,860-871
1c30 d1c30a4 A:575-593,636-640,860-871
1cs0 d1cs0e4 E:575-593,636-640,860-871
2gpw d2gpwd2 D:10-25,76-81,307-318
1kjq d1kjqa2 A:21-35,77-82,298-309
1bxr d1bxrc4 C:575-593,636-640,860-871
1kee d1keee4 E:575-593,636-640,860-871
2vr1 d2vr1a2 A:10-25,76-81,307-318
1c3o d1c3oa3 A:23-41,84-88,318-329
1ce8 d1ce8c3 C:23-41,84-88,318-329
2j9g d2j9ga2 A:10-25,76-81,307-318
1c30 d1c30a3 A:23-41,84-88,318-329
1ce8 d1ce8a3 A:23-41,84-88,318-329
1kee d1keec3 C:23-41,84-88,318-329
1ce8 d1ce8g4 G:575-593,636-640,860-871
1bxr d1bxre4 E:575-593,636-640,860-871
1c3o d1c3oe3 E:23-41,84-88,318-329
1bxr d1bxrc3 C:23-41,84-88,318-329
1cs0 d1cs0c3 C:23-41,84-88,318-329
1bxr d1bxrg4 G:575-593,636-640,860-871
1bnc d1bncb2 B:10-25,76-81,307-318
1kee d1keea3 A:23-41,84-88,318-329
1c30 d1c30c3 C:23-41,84-88,318-329
1kee d1keee3 E:23-41,84-88,318-329
2gps d2gpsb2 B:10-25,76-80,307-318
1ce8 d1ce8e3 E:23-41,84-88,318-329
1t36 d1t36a3 A:23-41,84-88,318-329
1cs0 d1cs0a3 A:22-41,84-88,318-329
1dv1 d1dv1b2 B:10-25,76-81,307-318
1a9x d1a9xc3 C:2023-2041,2084-2088,2318-2329
1dv2 d1dv2b2 B:10-25,76-81,307-318
1ce8 d1ce8g3 G:23-41,42-49,318-329
1m6v d1m6vc3 C:22-41,84-88,318-329
1cs0 d1cs0e3 E:23-41,84-88,318-329
1m6v d1m6ve3 E:23-41,84-88,318-329
1ce8 d1ce8a3 A:23-41,42-49,318-329
1m6v d1m6va3 A:22-41,84-88,318-329
1ce8 d1ce8g3 G:23-41,84-88,318-329
1t36 d1t36c3 C:23-41,84-88,318-329
2vr1 d2vr1b2 B:10-25,76-81,307-318
1t36 d1t36e3 E:23-41,84-88,318-329
1ce8 d1ce8e3 E:23-41,42-49,318-329
1c30 d1c30e3 E:23-41,84-88,318-329
1a9x d1a9xg3 G:6023-6041,6084-6088,6318-6329
1c30 d1c30e3 E:23-41,42-49,318-329
1c3o d1c3oc3 C:22-41,84-88,318-329
1cs0 d1cs0e3 E:23-41,42-49,318-329
1jdb d1jdbb3 B:21-40,83-87,317-328
1a9x d1a9xc3 C:2023-2041,2042-2049,2318-2329
1a9x d1a9xa3 A:22-41,84-88,318-329
1c3o d1c3oa3 A:23-41,42-49,318-329
1ulz d1ulza2 A:10-25,75-79,306-317
1t36 d1t36c3 C:23-41,42-49,318-329
1kee d1keee3 E:23-41,42-49,318-329
1jdb d1jdbe3 E:22-40,83-87,317-328
1jdb d1jdbh3 H:22-40,41-48,317-328
1a9x d1a9xe3 E:4023-4041,4042-4049,4318-4329
1bxr d1bxre3 E:23-41,84-88,318-329
1c3o d1c3oe3 E:23-41,42-49,318-329
2gpw d2gpwa2 A:10-25,76-80,307-318
1dv1 d1dv1a2 A:10-25,76-81,307-318
1a9x d1a9xe3 E:4023-4041,4084-4088,4318-4329
1c30 d1c30c3 C:23-41,42-49,318-329
1ce8 d1ce8c3 C:23-41,42-49,318-329
1kee d1keea3 A:23-41,42-49,318-329
1bxr d1bxra3 A:22-41,84-88,318-329
1jdb d1jdbk3 K:22-40,41-48,317-328
1kee d1keeg3 G:23-41,42-49,318-329
1bxr d1bxra4 A:574-593,636-640,860-871
1kee d1keeg3 G:23-41,84-88,318-329
1t36 d1t36e3 E:23-41,42-49,318-329
1c3o d1c3og3 G:23-41,84-88,318-329
1cs0 d1cs0a3 A:22-41,42-49,318-329
1cs0 d1cs0g3 G:23-41,42-49,318-329
1c30 d1c30a3 A:23-41,42-49,318-329
1cs0 d1cs0c3 C:23-41,42-49,318-329
1c3o d1c3og3 G:23-41,42-49,318-329
1t36 d1t36a3 A:23-41,42-49,318-329
1cs0 d1cs0g3 G:23-41,84-88,318-329
1jdb d1jdbk3 K:22-40,83-87,317-328
1kee d1keec3 C:23-41,42-49,318-329
1bnc d1bnca2 A:10-25,76-81,307-318
1m6v d1m6ve3 E:23-41,42-49,318-329
1c30 d1c30g3 G:23-41,42-49,318-329
2gpw d2gpwc2 C:10-25,76-80,307-318
1jdb d1jdbh3 H:22-40,83-87,317-328
1bxr d1bxre3 E:23-41,42-49,318-329
2gps d2gpsa2 A:10-25,76-81,307-318
1uc8 d1uc8a1 A:10-24,26-31,266-279
1a9x d1a9xg3 G:6023-6041,6042-6049,6318-6329
1c30 d1c30g3 G:23-41,84-88,318-329
1b6r d1b6ra2 A:10-24,24-31,257-268
1m6v d1m6vc3 C:22-41,42-49,318-329
1t36 d1t36g3 G:22-41,84-88,318-329
1a9x d1a9xa3 A:22-41,42-49,318-329
3eth d3etha2 A:10-24,24-31,257-268
1c3o d1c3oc3 C:22-41,42-49,318-329
1jdb d1jdbb3 B:21-40,41-48,317-328
1bxr d1bxrc3 C:23-41,42-49,318-329
1dv2 d1dv2a2 A:10-25,76-80,307-318
1m6v d1m6vg3 G:22-41,84-88,318-329
1bxr d1bxrg3 G:22-41,84-88,318-329
1uc8 d1uc8b1 B:10-24,26-31,266-279
1uc9 d1uc9a1 A:10-24,26-31,266-279
1bxr d1bxra3 A:22-41,42-49,318-329
3eth d3ethb2 B:10-24,44-49,257-268
1b6s d1b6sc2 C:10-24,44-49,257-268
1b6s d1b6sa2 A:10-24,44-49,257-268
1bxr d1bxrg3 G:22-41,42-49,318-329
3eth d3etha2 A:10-24,44-49,257-268
1b6s d1b6sb2 B:10-24,44-49,257-268
1uc9 d1uc9b1 B:10-24,26-31,266-279
1b6s d1b6sd2 D:10-24,44-49,257-268
1b6r d1b6ra2 A:10-24,44-49,257-268
3etj d3etjb2 B:10-24,44-49,257-268
3etj d3etja2 A:10-24,44-49,257-268
1b6s d1b6sa2 A:10-24,25-31,257-268
1b6s d1b6sd2 D:10-24,25-31,257-268
2r7n d2r7na1 A:28-40,86-90,338-354
1b6s d1b6sc2 C:10-24,25-31,257-268
1b6s d1b6sb2 B:10-24,25-31,257-268
2r7m d2r7ma1 A:28-40,86-90,338-354
2r7l d2r7la1 A:28-40,86-90,338-354
2r7k d2r7ka1 A:28-40,86-90,338-354
3etj d3etja2 A:10-24,25-31,257-268
3eth d3ethb2 B:10-24,25-31,257-268
3etj d3etjb2 B:10-24,25-31,257-268
2r85 d2r85a1 A:12-24,63-67,311-327
2r87 d2r87e1 E:12-24,63-67,311-327
2r84 d2r84a1 A:12-24,63-67,311-327
2r84 d2r84b1 B:12-24,63-67,311-327
2r85 d2r85b1 B:12-24,63-67,311-327
2r87 d2r87d1 D:12-24,63-67,311-327
2r87 d2r87c1 C:12-24,63-67,311-327
2r87 d2r87f1 F:12-24,63-67,311-327
2r87 d2r87b1 B:12-24,63-67,311-327
2r86 d2r86a1 A:12-24,63-67,311-327
2r87 d2r87a1 A:12-24,63-67,311-327
2r86 d2r86b1 B:12-24,63-67,311-327
1ez1 d1ez1b2 B:21-35,36-43,298-309
1ez1 d1ez1a2 A:21-35,36-43,298-309
1kjq d1kjqb2 B:21-35,36-43,298-309
1kjq d1kjqa2 A:21-35,36-43,298-309
1kj8 d1kj8a2 A:21-35,36-43,298-309
1bxr d1bxra4 A:574-593,594-601,643-651
1ce8 d1ce8e4 E:575-593,594-601,643-651
1ce8 d1ce8g4 G:575-593,594-601,643-651
1c3o d1c3oc4 C:575-593,594-601,643-651
1t36 d1t36e4 E:575-593,594-601,643-651
1ce8 d1ce8c4 C:575-593,594-601,643-651
1cs0 d1cs0e4 E:575-593,594-601,643-651
1cs0 d1cs0g4 G:575-593,594-601,643-651
1t36 d1t36c4 C:575-593,594-601,643-651
1cs0 d1cs0c4 C:575-593,594-601,643-651
1m6v d1m6vc4 C:575-593,594-601,643-651
1kee d1keec4 C:575-593,594-601,643-651
1ce8 d1ce8a4 A:575-593,594-601,643-651
1c3o d1c3oa4 A:575-593,594-601,643-651
1m6v d1m6vg4 G:575-593,594-601,643-651
1c3o d1c3oe4 E:575-593,594-601,643-651
1t36 d1t36a4 A:575-593,594-601,643-651
1kee d1keeg4 G:575-593,594-601,643-651
1cs0 d1cs0a4 A:575-593,594-601,643-651
1jdb d1jdbh4 H:574-592,593-600,642-650
1jdb d1jdbb4 B:574-592,593-600,642-650
1c3o d1c3og4 G:575-593,594-601,643-651
1m6v d1m6ve4 E:575-593,594-601,643-651
1c30 d1c30c4 C:575-593,594-601,643-651
1jdb d1jdbk4 K:574-592,593-600,642-650
1a9x d1a9xc4 C:2575-2593,2594-2601,2643-2651
1jdb d1jdbe4 E:574-592,593-600,642-650
1c30 d1c30g4 G:575-593,594-601,643-651
1a9x d1a9xg4 G:6575-6593,6594-6601,6643-6651
1kee d1keea4 A:575-593,594-601,643-651
1c30 d1c30a4 A:575-593,594-601,643-651
1t36 d1t36g4 G:575-593,594-601,643-651
1c30 d1c30e4 E:575-593,594-601,643-651
1m6v d1m6va4 A:575-593,594-601,643-651
1a9x d1a9xe4 E:4575-4593,4594-4601,4643-4651
1a9x d1a9xa4 A:575-593,594-601,643-651
1kee d1keee4 E:575-593,594-601,643-651
1bxr d1bxre4 E:575-593,594-601,643-651
2r85 d2r85a1 A:12-24,26-31,311-327
2r84 d2r84a1 A:12-24,26-31,311-327
1bxr d1bxrg4 G:575-593,594-601,643-651
2r85 d2r85b1 B:12-24,26-31,311-327
2r86 d2r86a1 A:12-24,26-31,311-327
1bxr d1bxrc4 C:575-593,594-601,643-651
2r87 d2r87e1 E:12-24,26-31,311-327
2r86 d2r86b1 B:12-24,26-31,311-327
2r87 d2r87c1 C:12-24,26-31,311-327
2r87 d2r87a1 A:12-24,26-31,311-327
2r87 d2r87f1 F:12-24,26-31,311-327
2r84 d2r84b1 B:12-24,26-31,311-327
2r87 d2r87d1 D:12-24,26-31,311-327
2r87 d2r87b1 B:12-24,26-31,311-327
2r7l d2r7la1 A:28-40,42-48,338-354
2r7n d2r7na1 A:28-40,42-48,338-354
2r7m d2r7ma1 A:28-40,42-48,338-354
2r7k d2r7ka1 A:28-40,42-48,338-354
2pbz d2pbzc1 C:12-24,26-32,289-305
2pbz d2pbza1 A:12-24,26-32,289-305
2pbz d2pbzb1 B:12-24,26-32,289-305
182. c.64.1 Pyruvate-ferredoxin oxidoreductase, PFOR, domain III
Pyruvate-ferredoxin oxidoreductase, PFOR, domain III 3 layers: a/b/a; mixed beta-sheet of 6 strands, order 231456; strand 3 is antiparallel to the rest
2c3o d2c3ob4 B:429-445,485-490,558-572
2uza d2uzaa4 A:429-445,485-490,558-572
2c3m d2c3ma4 A:429-445,485-490,558-572
2c3y d2c3ya4 A:429-445,485-490,558-572
2uza d2uzab4 B:429-445,485-490,558-572
2c3u d2c3ua4 A:429-445,485-490,558-572
1b0p d1b0pa4 A:429-446,485-490,558-572
1b0p d1b0pb4 B:429-446,485-490,558-572
1kek d1keka4 A:429-446,485-490,558-572
2c3y d2c3yb4 B:429-446,485-490,558-572
2c42 d2c42a4 A:429-446,485-490,558-572
2c3p d2c3pa4 A:429-446,485-490,558-572
2c3u d2c3ub4 B:429-446,485-490,558-572
2pda d2pdaa4 A:429-446,485-490,558-572
2pda d2pdab4 B:429-446,485-490,558-572
2c3p d2c3pb4 B:429-446,485-490,558-572
2c3m d2c3mb4 B:429-446,485-490,558-572
1kek d1kekb4 B:429-446,485-490,558-572
2c42 d2c42b4 B:429-446,485-490,558-572
2c3o d2c3oa4 A:429-446,485-492,558-572
183. c.1.10 Aldolase Common fold covers whole protein structure !
TIM beta/alpha-barrel contains parallel beta-sheet barrel, closed; n=8, S=8; strand order 12345678 ! the first seven superfamilies have similar phosphate-binding sites
1gyn d1gyna_ A:38-53,55-61,329-353
1b57 d1b57b_ B:38-53,55-61,329-353
1b57 d1b57a_ A:38-53,55-61,329-353
1dos d1dosb_ B:38-53,55-61,329-353
1dos d1dosa_ A:38-53,55-61,329-353
2b7o d2b7ob1 B:95-118,406-413,445-462
2b7o d2b7oa1 A:95-118,406-412,445-462
1rv8 d1rv8d_ D:26-41,43-49,276-300
1rv8 d1rv8b_ B:26-41,43-49,276-300
1rvg d1rvgc_ C:26-41,43-49,276-300
1rvg d1rvgd_ D:26-41,43-49,276-300
1rvg d1rvgb_ B:26-41,43-49,276-300
1rvg d1rvga_ A:26-41,43-49,276-300
1rv8 d1rv8a_ A:26-41,43-49,276-300
1rv8 d1rv8c_ C:26-41,43-49,276-300
1zen d1zena_ A:38-53,55-61,329-354
1f05 d1f05a_ A:13-22,21-28,240-248
1f05 d1f05b_ B:13-22,21-28,240-248
1onr d1onrb_ B:3-12,11-18,229-237
1onr d1onra_ A:3-12,11-18,229-237
1i2r d1i2rb_ B:3-12,11-18,229-237
1i2r d1i2ra_ A:3-12,11-18,229-237
2e1d d2e1da1 A:13-22,21-28,240-248
2e1d d2e1db1 B:13-22,21-28,240-248
2cwn d2cwna1 A:13-22,21-28,240-248
1i2n d1i2nb_ B:3-12,11-18,229-237
1i2n d1i2na_ A:3-12,11-18,229-237
1i2o d1i2oa_ A:3-12,11-18,229-237
1i2o d1i2ob_ B:3-12,11-18,229-237
1ucw d1ucwb_ B:3-12,11-18,229-237
1ucw d1ucwa_ A:3-12,11-18,229-237
1i2q d1i2qa_ A:3-12,11-18,229-237
1i2q d1i2qb_ B:3-12,11-18,229-237
1i2p d1i2pb_ B:3-12,11-18,229-237
1i2p d1i2pa_ A:3-12,11-18,229-237
2cwn d2cwnb1 B:13-22,21-28,240-248
1i8j d1i8jb_ B:57-71,73-80,311-320
1l6s d1l6sb_ B:57-71,73-80,311-320
1l6s d1l6sa_ A:57-71,73-80,311-320
1gg1 d1gg1c_ C:65-84,86-93,330-349
1i8j d1i8ja_ A:57-71,73-80,311-320
1rvg d1rvgc_ C:26-41,248-253,276-300
1gg1 d1gg1a_ A:65-84,86-93,330-349
1rvg d1rvgb_ B:26-41,248-253,276-300
1rv8 d1rv8c_ C:26-41,248-253,276-300
1l6y d1l6yb_ B:57-71,73-81,311-320
1rv8 d1rv8a_ A:26-41,248-253,276-300
1qr7 d1qr7b_ B:65-84,86-93,330-350
1gg1 d1gg1b_ B:65-84,86-93,330-350
1l6y d1l6ya_ A:57-71,73-80,311-320
1qr7 d1qr7c_ C:65-84,86-93,330-350
1qr7 d1qr7a_ A:65-84,86-93,330-350
1n8f d1n8fc_ C:65-84,86-93,330-350
1qr7 d1qr7d_ D:65-84,86-93,330-350
1n8f d1n8fb_ B:65-84,86-93,330-350
1kfl d1kflh_ H:65-84,86-93,330-350
1kfl d1kflb_ B:65-84,86-93,330-350
1wx0 d1wx0d1 D:9-20,189-194,194-203
1kfl d1kflg_ G:65-84,86-93,330-350
1kfl d1kfld_ D:65-84,86-93,330-350
1n8f d1n8fa_ A:65-84,86-93,330-350
1kfl d1kflf_ F:65-84,86-94,330-350
1n8f d1n8fd_ D:65-84,86-93,330-350
1gg1 d1gg1d_ D:65-84,86-93,330-350
1wx0 d1wx0g1 G:9-20,189-194,194-203
1wx0 d1wx0b1 B:9-20,189-194,194-203
1wx0 d1wx0h1 H:9-20,189-194,194-203
1wx0 d1wx0j1 J:9-20,189-194,194-203
2a21 d2a21a1 A:1015-1034,1217-1225,1239-1258
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1og0 d1og0f_ F:44-64,101-108,133-152
1og0 d1og0d_ D:44-64,101-108,133-152
1kfl d1kfle_ E:29-49,86-94,118-137
1kfl d1kfld_ D:29-49,86-93,118-137
2a4a d2a4ab1 B:27-40,46-51,246-258
1kfl d1kflh_ H:29-49,86-93,118-137
1kfl d1kflc_ C:29-49,86-94,118-137
1o60 d1o60d_ D:30-49,234-242,256-278
2a4a d2a4aa1 A:27-40,46-51,246-258
1gg1 d1gg1b_ B:29-49,86-93,118-137
1qr7 d1qr7c_ C:29-49,86-93,118-137
1rzm d1rzmb_ B:106-121,293-300,315-334
1rzm d1rzma_ A:106-121,293-300,315-334
1kfl d1kflf_ F:29-49,86-94,118-137
1q3n d1q3na_ A:30-49,234-241,256-277
1e51 d1e51a_ A:58-72,74-82,318-328
2cwn d2cwnb1 B:30-38,249-256,256-267
1n8f d1n8fc_ C:29-49,86-93,118-137
1n8f d1n8fd_ D:29-49,86-93,118-137
2e1d d2e1db1 B:30-38,249-256,256-267
1vr6 d1vr6a1 A:106-121,293-300,315-334
1gg1 d1gg1a_ A:29-49,86-93,118-137
1h7p d1h7pa_ A:68-82,84-92,329-340
1qr7 d1qr7a_ A:29-49,86-93,118-137
1kfl d1kfla_ A:29-49,86-94,118-137
1gg1 d1gg1d_ D:29-49,86-93,118-137
1qr7 d1qr7d_ D:29-49,86-93,118-137
1gg1 d1gg1c_ C:29-49,86-93,118-137
1qr7 d1qr7b_ B:29-49,86-93,118-137
2cwn d2cwna1 A:30-38,249-256,256-267
1n8f d1n8fb_ B:29-49,86-93,118-137
1b4k d1b4kb_ B:64-79,81-88,324-335
1vr6 d1vr6d1 D:106-121,293-300,315-334
1n8f d1n8fa_ A:29-49,86-93,118-137
1vr6 d1vr6c1 C:106-121,293-300,315-334
1phq d1phqa_ A:30-49,234-239,256-277
1e51 d1e51b_ B:58-72,74-82,318-328
1ohl d1ohla_ A:68-82,84-92,329-340
1eb3 d1eb3a_ A:68-82,84-92,329-340
1jcl d1jcla_ A:25-38,44-48,237-249
1vr6 d1vr6b1 B:106-121,293-300,315-334
1fxq d1fxqb_ B:2015-2034,2036-2044,2239-2258
1fwt d1fwtb_ B:2015-2034,2036-2044,2239-2258
1gjp d1gjpa_ A:68-82,84-92,329-340
1aw5 d1aw5a_ A:68-82,84-92,329-340
1jcy d1jcyb_ B:2015-2034,2036-2044,2239-2258
1pl9 d1pl9a_ A:30-49,234-241,256-277
1fww d1fwwb_ B:2015-2034,2036-2044,2239-2258
1jcj d1jcja_ A:25-38,44-48,237-249
1h7n d1h7na_ A:68-82,84-92,329-340
1pcw d1pcwb_ B:2015-2034,2036-2044,2239-2258
1jcj d1jcjb_ B:25-38,44-48,237-249
1fws d1fwsb_ B:2015-2034,2036-2044,2239-2258
1fxq d1fxqa_ A:1015-1034,1036-1044,1239-1258
1pe1 d1pe1b_ B:2015-2034,2036-2044,2239-2258
1jcl d1jclb_ B:25-38,44-48,237-249
1w31 d1w31a1 A:68-82,84-92,329-340
1qnv d1qnva_ A:68-82,84-92,329-340
1fwt d1fwta_ A:1015-1034,1036-1044,1239-1258
1fwn d1fwnb_ B:2015-2034,2036-2044,2239-2258
1p1x d1p1xa_ A:25-38,44-48,237-249
1fwn d1fwna_ A:1015-1034,1036-1044,1239-1258
1jcy d1jcya_ A:1015-1034,1036-1044,1239-1258
1fww d1fwwa_ A:1015-1034,1036-1044,1239-1258
1pck d1pckb_ B:2015-2034,2036-2044,2239-2258
1ktn d1ktna_ A:25-38,44-48,237-249
1lrq d1lrqb_ B:2015-2034,2036-2044,2239-2258
1ktn d1ktnb_ B:25-38,44-48,237-249
1jcx d1jcxb_ B:2015-2034,2036-2044,2239-2258
1lrn d1lrna_ A:1015-1034,1036-1044,1239-1258
2a2i d2a2ia1 A:1015-1034,1036-1044,1239-1258
1lrn d1lrnb_ B:2015-2034,2036-2044,2239-2258
1lro d1lrob_ B:2015-2034,2036-2044,2239-2258
1fx6 d1fx6b_ B:2015-2034,2036-2044,2239-2258
1pv8 d1pv8a_ A:57-72,74-82,318-330
1p1x d1p1xb_ B:1025-1038,1044-1048,1237-1249
1fx6 d1fx6a_ A:1015-1034,1036-1044,1239-1258
1b4k d1b4ka_ A:64-79,82-88,324-335
1gzg d1gzga_ A:64-79,82-88,324-335
2e1d d2e1db1 B:171-182,184-190,301-331
2a21 d2a21b1 B:2015-2034,2035-2044,2239-2258
1l6w d1l6wc_ C:9-17,182-187,187-197
1i2p d1i2pb_ B:160-171,173-179,288-317
1l6w d1l6wg_ G:9-17,182-187,187-197
1l6w d1l6wf_ F:9-17,182-187,187-197
1i2p d1i2pa_ A:160-171,173-179,288-317
1l6w d1l6wb_ B:9-17,182-187,187-197
1l6w d1l6we_ E:9-17,182-187,187-197
1l6w d1l6wa_ A:9-17,182-187,187-197
1l6w d1l6wh_ H:9-17,182-187,187-197
1l6w d1l6wi_ I:9-17,182-187,187-197
1l6w d1l6wj_ J:9-17,182-187,187-197
1fy6 d1fy6b_ B:2015-2034,2035-2044,2239-2258
2a2i d2a2ib1 B:2015-2034,2035-2044,2239-2258
1l6w d1l6wd_ D:9-17,182-187,187-197
1fxp d1fxpb_ B:2015-2034,2035-2044,2239-2258
1fy6 d1fy6a_ A:1015-1034,1035-1044,1239-1258
2a21 d2a21a1 A:1015-1034,1035-1044,1239-1258
1fws d1fwsa_ A:1015-1034,1035-1044,1239-1258
1fxp d1fxpa_ A:1015-1034,1035-1044,1239-1258
1lro d1lroa_ A:1015-1034,1035-1044,1239-1258
1vli d1vlia2 A:30-45,230-238,253-274
1pck d1pcka_ A:1015-1034,1035-1044,1239-1258
1lrq d1lrqa_ A:1015-1034,1035-1044,1239-1258
1jcx d1jcxa_ A:1015-1034,1035-1044,1239-1258
1pcw d1pcwa_ A:1015-1034,1035-1044,1239-1258
1jcl d1jcla_ A:25-38,232-238,237-249
1pe1 d1pe1a_ A:1015-1034,1035-1044,1239-1258
1jcj d1jcja_ A:25-38,232-238,237-249
2a4a d2a4ab1 B:27-40,242-247,246-258
2e1d d2e1da1 A:171-182,184-190,301-332
1to3 d1to3a_ A:41-60,247-252,264-291
1jcl d1jclb_ B:25-38,232-238,237-249
1jcj d1jcjb_ B:25-38,232-238,237-249
1i2o d1i2oa_ A:160-171,173-178,288-317
1i2o d1i2ob_ B:160-171,173-178,288-317
1ok6 d1ok6f_ F:3-14,107-116,119-138
1ok6 d1ok6b_ B:3-14,107-116,119-138
1ok6 d1ok6d_ D:3-14,107-116,119-138
1ok6 d1ok6i_ I:3-14,107-116,119-138
1ok6 d1ok6j_ J:3-14,107-116,119-138
1ok6 d1ok6h_ H:3-14,107-116,119-138
1ok6 d1ok6g_ G:3-14,107-116,119-138
2a4a d2a4aa1 A:27-40,241-247,246-258
1mzh d1mzhb_ B:1118-1133,1135-1140,1305-1321
1h7r d1h7ra_ A:68-82,84-92,329-341
1qml d1qmla_ A:68-82,84-92,329-341
1f2j d1f2ja_ A:21-34,81-88,139-151
184. f.33.1 Calcium ATPase, transmembrane domain M
Calcium ATPase, transmembrane domain M core: multihelical; consists of three transmembrane regions of 2, 2 and 6 helices, separated by cytoplasmic domains
1wpg d1wpgc4 C:308-330,330-334,335-345
1wpg d1wpgb4 B:308-330,330-334,335-345
2zbg d2zbga4 A:308-330,330-334,335-345
1iwo d1iwoa4 A:308-330,330-334,335-345
1iwo d1iwob4 B:308-330,330-334,335-345
1xp5 d1xp5a4 A:308-330,330-334,335-345
3b9r d3b9rb4 B:308-330,330-334,335-345
3b9r d3b9ra4 A:308-330,330-334,335-345
2zbf d2zbfa4 A:308-330,330-334,335-345
1wpg d1wpga4 A:308-330,330-334,335-345
1wpg d1wpgd4 D:308-330,330-334,335-345
3b9b d3b9ba4 A:308-330,330-334,335-345
2zbe d2zbeb4 B:308-330,330-334,335-345
2zbe d2zbea4 A:308-330,330-334,335-345
1t5t d1t5ta4 A:308-330,330-334,335-345
2zbd d2zbda4 A:308-330,330-334,335-345
1t5s d1t5sa4 A:308-330,330-334,335-345
1vfp d1vfpa4 A:308-330,330-334,335-345
1vfp d1vfpb4 B:308-330,330-334,335-345
185. c.59.1 MurD-like peptide ligases, peptide-binding domain
MurD-like peptide ligases, peptide-binding domain 3 layers: a/b/a; mixed beta-sheet of 6 strands, order 126345; strand 1 is antiparallel to the rest
1eeh d1eeha2 A:372-381,383-388,389-401
186. b.77.2 delta-Endotoxin (insectocide), middle domain
beta-Prism I consists of 3 4-stranded sheets; strands are parallel to the 3-fold axis ! duplication: has internal pseudo threefold symmetry
1i5p d1i5pa2 A:237-253,274-278,289-302
1i5p d1i5pa2 A:289-302,421-431,434-441
187. d.261.1 Hypothetical protein PH1602
Hypothetical protein PH1602 complex alpha+beta fold; contains a region of similarity to the ferredoxin-like fold
1uc2 d1uc2a_ A:420-432,433-438,439-447
1uc2 d1uc2b_ B:420-432,433-438,439-447
188. c.26.2 Adenine nucleotide alpha hydrolases-like share similar mode of ligand (Adenosine group) binding ! can be subdivided into two group with closer relationships within each group than between the groups; the first three families form one group whereas the last two families form the other group !
Adenine nucleotide alpha hydrolase-like core: 3 layers, a/b/a ; parallel beta-sheet of 5 strands, order 32145
2gm3 d2gm3c1 C:24-40,126-132,145-154
2gm3 d2gm3b1 B:24-40,126-132,145-154
189. i.18.1 Membrane ion ATPase
Membrane ion ATPase
1mhs d1mhsb_ B:337-357,357-361,362-372
1mhs d1mhsa_ A:337-357,357-361,362-372
1mhs d1mhsb_ B:537-551,552-559,670-713
1mhs d1mhsa_ A:537-551,552-559,670-713
190. d.198.1 Type III secretory system chaperone-like
Secretion chaperone-like alpha-beta(3)-alpha-beta(2)-alpha; 2 layers: alpha/beta
2plg d2plgb1 B:23-36,58-66,127-154
2plg d2plga1 A:23-36,58-66,127-154
1l2w d1l2wc_ C:3-16,33-42,99-118
1l2w d1l2we_ E:3-16,33-42,99-118
1l2w d1l2wb_ B:3-16,33-42,99-118
1n5b d1n5bd_ D:3-16,33-42,99-118
1l2w d1l2wh_ H:3-16,33-42,99-118
1k6z d1k6zb_ B:2003-2016,2033-2042,2099-2117
1n5b d1n5bc_ C:3-16,33-42,99-118
1n5b d1n5ba_ A:3-16,33-42,99-119
1jya d1jyaa_ A:3-16,33-42,99-118
1n5b d1n5bb_ B:3-16,33-42,99-119
1k6z d1k6za_ A:1003-1016,1033-1042,1099-1118
1xkp d1xkpb1 B:2-16,34-43,102-122
1s28 d1s28d_ D:1-19,40-48,107-130
1s28 d1s28b_ B:1-19,40-48,107-130
1s28 d1s28c_ C:1-19,40-48,107-130
1s28 d1s28a_ A:1-19,40-48,107-130
1xkp d1xkpc1 C:2-13,31-40,103-126
1ttw d1ttwa_ A:3-16,35-44,101-120
2fm8 d2fm8a1 A:5-18,41-49,111-134
1k3s d1k3sa_ A:3-13,28-37,90-113
1jya d1jyab_ B:3-16,33-42,99-122
1ry9 d1ry9a_ A:2-18,41-49,111-133
1ry9 d1ry9b_ B:2-18,41-49,111-133
1ry9 d1ry9c_ C:2-18,41-49,111-133
1ry9 d1ry9d_ D:2-18,41-49,111-133
1k3s d1k3sb_ B:3-13,77-87,90-110
1l2w d1l2wg_ G:1-16,33-42,102-118
1l2w d1l2wf_ F:1-16,33-42,102-118
1l2w d1l2wd_ D:0-16,33-42,102-120
2fm8 d2fm8b1 B:5-18,42-49,111-134
1l2w d1l2wa_ A:0-16,33-42,102-120
1s28 d1s28b_ B:1-19,93-103,107-130
1n5b d1n5bc_ C:3-16,84-95,99-118
1s28 d1s28d_ D:1-19,93-103,107-130
1n5b d1n5bd_ D:3-16,85-95,99-118
1s28 d1s28c_ C:1-19,93-103,107-130
1s28 d1s28a_ A:1-19,93-103,107-130
1k6z d1k6zb_ B:2003-2016,2084-2095,2099-2117
1jya d1jyab_ B:3-16,85-95,99-122
191. c.1.4 FMN-linked oxidoreductases
TIM beta/alpha-barrel contains parallel beta-sheet barrel, closed; n=8, S=8; strand order 12345678 ! the first seven superfamilies have similar phosphate-binding sites
1viz d1viza_ A:20-31,33-38,214-227
1viz d1vizb_ B:20-31,33-38,214-226
1k03 d1k03a_ A:49-64,64-72,355-363
1oyb d1oyba_ A:49-64,64-71,355-363
1oyc d1oyca_ A:49-64,64-71,355-363
1oya d1oyaa_ A:49-64,64-71,355-363
1bwk d1bwka_ A:49-64,64-72,355-363
1bwl d1bwla_ A:49-64,64-71,355-363
1k02 d1k02a_ A:49-64,64-76,355-363
2f6x d2f6xa1 A:1019-1030,1210-1215,1222-1230
2f6u d2f6ub1 B:2019-2030,2210-2215,2222-2230
2f6u d2f6ua1 A:1019-1030,1210-1215,1222-1230
3dh7 d3dh7d1 D:74-88,89-94,295-318
2f6x d2f6xb1 B:2019-2030,2210-2215,2222-2230
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192. c.74.1 AraD/HMP-PK domain-like
AraD/HMP-PK domain-like 3 layers: a/b/a; mixed (mostly antiparallel) beta-sheet of 9 strands, order 432159876; left-handed crossover between strands 4 and 5
2pb9 d2pb9a1 A:268-287,298-303,439-451
2pb9 d2pb9b1 B:268-287,298-303,439-451
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193. d.154.1 DmpA/ArgJ-like convergent similarity to the Ntn amidohydrolases !
DmpA/ArgJ-like duplication of beta(3)-alpha-beta-alpha motif; 4 layers: alpha/beta/beta/alpha
1vz7 d1vz7c_ C:193-212,221-230,236-259
1vz8 d1vz8a_ A:193-212,221-230,236-259
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1vz6 d1vz6a_ A:193-212,264-272,275-289
1vz6 d1vz6b_ B:193-212,264-272,275-289
194. c.1.13 Malate synthase G
TIM beta/alpha-barrel contains parallel beta-sheet barrel, closed; n=8, S=8; strand order 12345678 ! the first seven superfamilies have similar phosphate-binding sites
2jqx d2jqxa1 A:588-614,619-623,652-675
1d8c d1d8ca_ A:588-614,619-623,652-672
2jqx d2jqxa1 A:159-179,235-243,537-552
1n8w d1n8wa_ A:590-616,619-625,654-676
2gq3 d2gq3a1 A:590-616,619-625,654-674
2gq3 d2gq3b1 B:590-616,619-625,654-674
1p7t d1p7tb_ B:588-614,617-623,652-672
1n8w d1n8wb_ B:590-616,619-625,654-674
1n8i d1n8ia_ A:590-616,619-625,654-673
1p7t d1p7ta_ A:588-614,617-623,652-672
1n8i d1n8ia_ A:161-181,236-244,544-559
2gq3 d2gq3b1 B:161-181,236-244,544-559
2gq3 d2gq3a1 A:161-181,236-244,544-559
1n8w d1n8wa_ A:161-181,236-244,544-559
1n8w d1n8wb_ B:161-181,236-244,544-559
1p7t d1p7ta_ A:159-179,235-243,537-552
1d8c d1d8ca_ A:159-179,235-243,537-552
1p7t d1p7tb_ B:159-179,235-243,537-552
1y8b d1y8ba_ A:159-179,235-242,537-552
2jqx d2jqxa1 A:123-135,265-270,537-552
1p7t d1p7ta_ A:123-135,531-536,537-552
1p7t d1p7tb_ B:123-135,531-536,537-552
1n8i d1n8ia_ A:123-135,266-273,544-559
2gq3 d2gq3b1 B:123-134,266-273,544-559
1p7t d1p7tb_ B:123-135,265-272,537-552
1d8c d1d8ca_ A:123-135,265-272,537-552
1n8w d1n8wb_ B:123-135,266-273,544-559
1p7t d1p7ta_ A:123-135,265-272,537-552
2gq3 d2gq3a1 A:123-134,266-273,544-559
2jqx d2jqxa1 A:123-135,531-535,537-552
1n8w d1n8wa_ A:123-134,266-273,544-559
1y8b d1y8ba_ A:123-136,265-270,537-552
195. c.49.1 PK C-terminal domain-like
Pyruvate kinase C-terminal domain-like 3 layers: a/b/a; mixed beta-sheet of 5 strands, order 32145, strand 5 is antiparallel to the rest
1vp8 d1vp8a_ A:15-31,33-40,125-142
196. c.22.1 Ribosomal protein L4
Ribosomal protein L4 3 layers, a/b/a; core: parallel beta-sheet of 4 strands, order 1423
2hgq d2hgqf1 F:102-122,153-158,182-190
2j01 d2j01f1 F:102-121,153-158,182-190
2j03 d2j03f1 F:102-121,153-158,182-190
2v47 d2v47f1 F:102-121,153-158,182-190
2v49 d2v49f1 F:102-121,153-158,182-190
2hgu d2hguf1 F:102-122,152-159,182-190
3cf5 d3cf5c1 C:96-116,147-153,176-184
2zjp d2zjpc1 C:96-116,147-153,176-184
2hgj d2hgjf1 F:102-122,152-159,182-190
3dll d3dllc1 C:96-116,115-120,176-184
2hgj d2hgjf1 F:102-122,121-126,182-190
2hgq d2hgqf1 F:102-122,121-126,182-190
2hgu d2hguf1 F:102-122,121-126,182-190
197. d.195.1 YopH tyrosine phosphatase N-terminal domain
YopH tyrosine phosphatase N-terminal domain consists of four alpha-helices and two beta-hairpins
1m0v d1m0va_ A:49-64,97-104,109-126
1huf d1hufa_ A:49-64,96-104,109-125
1k46 d1k46a_ A:49-64,96-104,109-125
198. e.23.1 Acetyl-CoA synthetase-like
Acetyl-CoA synthetase-like 4 domains: (1&2) duplication: share the same alpha/beta fold; (3) beta-barrel; (4) alpha+beta
1lci d1lcia_ A:85-99,147-151,164-172
1ba3 d1ba3a_ A:85-99,147-152,164-172
1ba3 d1ba3a_ A:85-99,124-129,164-172
1lci d1lcia_ A:85-99,124-129,164-172
1lci d1lcia_ A:52-71,147-151,164-172
1pg3 d1pg3a_ A:142-156,215-221,236-245
1lci d1lcia_ A:52-71,124-129,164-172
1ba3 d1ba3a_ A:52-71,124-129,164-172
1pg3 d1pg3b_ B:142-156,181-187,236-244
1pg4 d1pg4a_ A:142-156,181-187,236-244
3cw9 d3cw9a1 A:64-78,197-202,207-222
1pg3 d1pg3b_ B:142-156,215-221,236-244
1pg4 d1pg4b_ B:142-156,181-187,236-244
3cw9 d3cw9b1 B:64-78,197-202,207-222
1t5d d1t5dx_ X:64-78,197-202,207-222
1pg4 d1pg4a_ A:142-156,215-221,236-244
1t5h d1t5hx_ X:64-78,197-202,207-222
1amu d1amub_ B:99-113,224-229,234-248
1amu d1amua_ A:99-113,224-229,234-248
199. b.51.1 ValRS/IleRS/LeuRS editing domain
ValRS/IleRS/LeuRS editing domain core: barrel, closed; n=6, S=8; topology is similar to that of the acid proteases barrel
1ile d1ilea2 A:230-237,353-358,358-374
1ue0 d1ue0a_ A:230-237,354-358,358-374
1udz d1udzb_ B:230-237,354-358,358-374
1ue0 d1ue0b_ B:230-237,354-358,358-374
1gax d1gaxb2 B:216-223,310-314,313-329
1udz d1udza_ A:230-237,354-358,358-374
1ile d1ilea2 A:230-237,300-306,325-336
200. d.159.1 Metallo-dependent phosphatases different families of this superfamily are groupped in a single Pfam family,
Metallo-dependent phosphatases 4 layers: alpha/beta/beta/alpha; mixed beta sheets; contains duplication
3c9f d3c9fa2 A:51-70,294-301,302-311
3c9f d3c9fb2 B:51-70,294-301,302-311
201. c.1.23 FAD-linked oxidoreductase distinct cofactor-binding mode from both FMN- and NAD(P)-linked TIM-barrel oxidoreductases; families are related by a circular permutation !
TIM beta/alpha-barrel contains parallel beta-sheet barrel, closed; n=8, S=8; strand order 12345678 ! the first seven superfamilies have similar phosphate-binding sites
1b5t d1b5tb_ B:34-52,270-275,279-291
1b5t d1b5ta_ A:34-52,270-275,279-291
1v93 d1v93a_ A:24-42,267-272,276-288
1b5t d1b5tc_ C:34-52,270-276,279-291
1tj2 d1tj2a2 A:264-279,279-287,517-524
1tiw d1tiwa2 A:264-279,279-287,517-524
2fzm d2fzma2 A:264-279,279-287,517-524
1tj1 d1tj1a2 A:264-279,279-287,517-524
202. c.86.1 Phosphoglycerate kinase
Phosphoglycerate kinase consists of two non-similar domains, 3 layers (a/b/a) each ! Domain 1 has parallel beta-sheet of 6 strands, order 342156 ! Domain 2 has parallel beta-sheet of 6 strands, order 321456
13pk d13pka_ A:219-231,333-339,397-407
1php d1phpa_ A:197-212,311-317,372-382
13pk d13pkd_ D:219-231,333-339,397-407
16pk d16pka_ A:219-231,333-339,397-407
13pk d13pkb_ B:219-231,333-339,397-407
13pk d13pkc_ C:219-231,333-339,397-407
1vpe d1vpea_ A:197-205,312-318,375-385
1v6s d1v6sa_ A:194-206,308-314,370-380
1vpe d1vpea_ A:204-212,312-318,375-385
1fw8 d1fw8a_ A:142-157,258-264,321-331
1v6s d1v6sb_ B:194-206,308-314,371-380
1qpg d1qpga_ A:213-225,329-335,392-402
3pgk d3pgka_ A:214-227,330-334,392-402
1hdi d1hdia_ A:219-230,331-337,394-404
1vjd d1vjda_ A:219-230,331-337,394-404
1vjc d1vjca_ A:219-230,331-337,394-404
1ltk d1ltkc_ C:219-230,331-337,394-404
1kf0 d1kf0a_ A:219-230,331-337,394-404
1ltk d1ltka_ A:219-230,331-336,394-404
1ltk d1ltkb_ B:219-230,331-336,394-404
203. g.1.1 Insulin-like
Insulin-like nearly all-alpha ! can be classified as disulfide-rich
1tgr d1tgra_ A:1-19,22-26,43-51
204. a.127.1 L-aspartase-like
L-aspartase-like multihelical, consists of three all-alpha domains
1w27 d1w27a_ A:175-189,189-193,233-242
1w27 d1w27b_ B:175-189,189-193,233-242
1w27 d1w27a_ A:152-170,189-193,206-218
1w27 d1w27b_ B:152-170,189-193,206-218
1c3c d1c3cb_ B:215-245,250-254,302-334
1c3c d1c3ca_ A:215-245,250-254,302-334
1c3u d1c3ua_ A:215-245,250-254,302-334
1c3u d1c3ub_ B:215-245,250-254,302-334
205. d.300.1 Kinetochore globular domain swapped heterodimer with the N-terminal helices; Spc24-like subunits have the core fold, whereas Spc25-like subunits have a variant fold !
Kinetochore globular domain-like core: alpha-beta(3)-alpha; variant: alpha-beta(4)-alpha(2)
2fv4 d2fv4b1 B:156-169,169-175,199-213
206. c.46.1 Rhodanese/Cell cycle control phosphatase
Rhodanese/Cell cycle control phosphatase 3 layers: a/b/a; parallel beta-sheet of 5 strands, order 32451
1yt8 d1yt8a4 A:244-263,264-268,331-346
1h4k d1h4kx2 X:92-106,224-230,232-247
1h4m d1h4mx2 X:92-106,224-230,232-247
1e0c d1e0ca2 A:92-106,224-230,232-247
1qxn d1qxna_ A:2-23,84-88,94-106
2gwf d2gwfe1 E:206-214,254-260,300-309
2gwf d2gwfa1 A:206-214,254-260,299-309
2gwf d2gwfc1 C:206-214,254-260,299-309
207. c.138.1 Indigoidine synthase A-like
Indigoidine synthase A-like core: 3 layers, a/b/a; parallel beta-sheet of 7 strands, order 2134756
1vkm d1vkmf_ F:26-45,110-116,258-284
1vkm d1vkmd_ D:26-45,110-116,258-284
1vkm d1vkma_ A:26-45,110-116,258-284
1vkm d1vkmc_ C:26-45,110-118,258-284
1vkm d1vkme_ E:26-45,110-118,258-284
1vkm d1vkmb_ B:26-45,46-55,258-284
1vkm d1vkmf_ F:26-45,46-55,258-284
1vkm d1vkma_ A:26-45,46-55,258-284
1vkm d1vkmc_ C:26-45,46-55,258-284
1vkm d1vkmd_ D:26-45,46-55,258-284
1vkm d1vkme_ E:26-45,46-55,258-284
208. c.68.1 Nucleotide-diphospho-sugar transferases
Nucleotide-diphospho-sugar transferases 3 layers: a/b/a; mixed beta-sheet of 7 strands, order 3214657; strand 6 is antiparallel to the rest
1w77 d1w77a1 A:107-120,173-180,186-201
1mp3 d1mp3b_ B:35-48,222-227,229-248
1vpa d1vpab_ B:30-43,96-103,109-124
1i52 d1i52a_ A:36-49,101-107,113-127
1h5r d1h5ra_ A:35-48,222-227,229-248
2oi6 d2oi6b2 B:34-47,97-104,110-121
1ini d1inia_ A:36-49,101-107,113-127
1fxo d1fxoc_ C:34-47,221-226,228-247
2oi7 d2oi7b2 B:34-47,97-104,110-121
1vh3 d1vh3a_ A:28-41,93-99,105-120
2oi5 d2oi5b2 B:34-47,97-104,110-121
1g1l d1g1lf_ F:34-47,221-226,228-247
1fxo d1fxoh_ H:34-47,221-226,228-247
1fxo d1fxod_ D:34-47,221-226,228-247
1g0r d1g0rf_ F:34-47,221-226,228-247
1mc3 d1mc3b_ B:32-45,219-224,226-245
1mp3 d1mp3a_ A:35-48,222-227,229-248
2dpw d2dpwa1 A:33-46,86-92,98-109
1mc3 d1mc3a_ A:32-45,219-224,226-245
1g0r d1g0rc_ C:34-47,221-226,228-247
1fxo d1fxob_ B:34-47,221-226,228-247
1g1l d1g1ld_ D:34-47,221-226,228-247
1g0r d1g0rg_ G:34-47,221-226,228-247
1g0r d1g0rb_ B:34-47,221-226,228-247
1vpa d1vpaa_ A:30-43,96-103,109-124
1fxo d1fxog_ G:34-47,221-226,228-247
1g1l d1g1lc_ C:34-47,221-226,228-247
1g1l d1g1la_ A:34-47,221-226,228-247
1g3l d1g3lb_ B:34-47,221-226,228-247
1g3l d1g3ld_ D:34-47,221-226,228-247
1fzw d1fzwb_ B:34-47,221-226,228-247
1g1l d1g1lb_ B:34-47,221-226,228-247
1iim d1iimb_ B:35-48,222-227,229-248
1g0r d1g0rd_ D:34-47,221-226,228-247
1fxo d1fxof_ F:34-47,221-226,228-247
1fxo d1fxoe_ E:34-47,221-226,228-247
1g0r d1g0ra_ A:34-47,221-226,228-247
1g0r d1g0re_ E:34-47,221-226,228-247
1vgt d1vgta_ A:36-49,101-106,113-127
1g3l d1g3la_ A:34-47,221-226,228-247
1fxo d1fxoa_ A:34-47,221-226,228-247
1g1l d1g1lg_ G:34-47,221-226,228-247
1g0r d1g0rh_ H:34-47,221-226,228-247
1mp5 d1mp5a_ A:35-48,222-226,229-248
1fzw d1fzwf_ F:34-47,221-226,228-247
1fzw d1fzwd_ D:34-47,221-226,228-247
1mp5 d1mp5b_ B:35-48,222-226,229-248
1fzw d1fzwc_ C:34-47,221-226,228-247
1iim d1iima_ A:35-48,222-227,229-248
1g3l d1g3lc_ C:34-47,221-226,228-247
1g1l d1g1lh_ H:34-47,221-226,228-247
1g2v d1g2vb_ B:34-47,221-226,228-247
1g23 d1g23a_ A:34-47,221-226,228-247
1g1l d1g1le_ E:34-47,221-226,228-247
1g2v d1g2vf_ F:34-47,221-226,228-247
1g2v d1g2vc_ C:34-47,221-226,228-247
1g23 d1g23b_ B:34-47,221-226,228-247
1g2v d1g2va_ A:34-47,221-226,228-247
1fzw d1fzwh_ H:34-47,221-226,228-247
1g23 d1g23e_ E:34-47,221-226,228-247
1g2v d1g2vg_ G:34-47,221-226,228-247
1inj d1inja_ A:36-49,101-106,113-127
1fzw d1fzwa_ A:34-47,221-226,228-247
1g2v d1g2vd_ D:34-47,221-226,228-247
1vgt d1vgtb_ B:36-49,101-106,113-127
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1kws d1kwsb_ B:86-104,105-114,200-210
3cu0 d3cu0a1 A:86-104,105-114,200-210
1kws d1kwsa_ A:86-104,105-114,200-210
1fgg d1fggb_ B:86-104,105-114,200-210
1qgs d1qgsa_ A:13-27,31-40,103-118
1qg8 d1qg8a_ A:13-27,31-40,103-118
1h7q d1h7qa_ A:13-27,31-40,103-118
1qgq d1qgqa_ A:13-27,31-40,103-118
1h7l d1h7la_ A:13-27,31-40,103-118
209. c.92.1 Chelatase interdomain linker is short; swapping of C-terminal helices between the two domains !
Chelatase-like duplication: tandem repeat of two domains; 3 layers (a/b/a); parallel beta-sheet of 4 strands, order 2134
1qgo d1qgoa_ A:20-34,75-82,241-258
1l8x d1l8xa_ A:102-124,155-162,342-360
1lbq d1lbqa_ A:102-124,155-162,342-360
1lbq d1lbqb_ B:102-124,155-162,342-360
1l8x d1l8xb_ B:102-124,155-162,342-360
1hrk d1hrkb_ B:130-152,183-190,374-392
1hrk d1hrka_ A:130-152,183-190,374-392
2hrc d2hrca1 A:130-152,183-190,374-392
1ak1 d1ak1a_ A:52-76,106-113,293-309
2hrc d2hrcb1 B:630-652,683-690,874-892
2q2n d2q2na1 A:52-76,106-113,293-309
1doz d1doza_ A:52-76,106-113,293-309
1n0i d1n0ia_ A:52-76,106-113,293-309
1ld3 d1ld3a_ A:52-76,106-113,293-309
1c1h d1c1ha_ A:52-76,106-113,293-309
1c9e d1c9ea_ A:52-76,106-113,293-309
2hk6 d2hk6a1 A:52-76,106-113,293-309
2q2n d2q2na1 A:52-76,77-88,293-309
1ak1 d1ak1a_ A:52-76,77-88,293-309
1n0i d1n0ia_ A:52-76,77-88,293-309
2hk6 d2hk6a1 A:52-76,77-88,293-309
1doz d1doza_ A:52-76,77-88,293-309
1ld3 d1ld3a_ A:52-76,77-88,293-309
1hrk d1hrkb_ B:130-152,156-164,374-392
1hrk d1hrka_ A:130-152,156-164,374-392
2hrc d2hrca1 A:130-152,156-164,374-392
2hrc d2hrcb1 B:630-652,656-664,874-892
1l8x d1l8xb_ B:102-124,128-136,342-360
210. d.58.29 Nucleotide cyclase common fold is elaborated with additional secondary structures !
Ferredoxin-like alpha+beta sandwich with antiparallel beta-sheet; (beta-alpha-beta)x2
1wc6 d1wc6b_ B:1142-1156,1158-1163,1164-1171
1wc6 d1wc6a_ A:1142-1156,1158-1163,1164-1171
1wc6 d1wc6c_ C:1142-1156,1158-1163,1164-1171
1wc6 d1wc6a_ A:1074-1104,1115-1124,1142-1156
1wc6 d1wc6c_ C:1074-1104,1115-1124,1142-1156
1wc6 d1wc6b_ B:1074-1104,1115-1124,1142-1156
1u0h d1u0ha_ A:454-478,482-491,508-521
1wc1 d1wc1b_ B:1142-1155,1158-1163,1164-1171
1wc4 d1wc4b_ B:1142-1155,1158-1163,1164-1171
1wc4 d1wc4a_ A:1142-1155,1158-1163,1164-1171
1wc5 d1wc5c_ C:1142-1155,1158-1163,1164-1171
1wc5 d1wc5d_ D:1142-1155,1158-1163,1164-1171
1wc0 d1wc0b_ B:1142-1155,1158-1163,1164-1171
1wc3 d1wc3a_ A:1142-1155,1158-1163,1164-1171
1wc0 d1wc0a_ A:1142-1155,1158-1163,1164-1171
1wc3 d1wc3b_ B:1142-1155,1158-1163,1164-1171
211. e.19.1 HydA/Nqo6-like
HydA/Nqo6-like 2 domains: (1) alpa/beta; (2) Fe-S cluster-bound
2fug d2fugx1 X:43-55,103-109,143-160
2fug d2fugf1 F:43-55,103-109,143-160
2fug d2fug61 6:43-55,103-109,143-160
2fug d2fugo1 O:43-55,103-109,143-160
1frf d1frfs_ S:18-27,70-77,150-165
2fug d2fugf1 F:43-55,76-82,143-160
2fug d2fugo1 O:43-55,76-82,143-160
2fug d2fugx1 X:43-55,76-82,143-160
2fug d2fug61 6:43-55,76-82,143-160
1frf d1frfs_ S:18-27,105-112,150-165
212. i.21.1 Transferrin receptor-transferrin complex
Transferrin receptor-transferrin complex
1suv d1suva_ A:415-441,446-455,582-605
1suv d1suvb_ B:415-441,477-485,582-605
1suv d1suva_ A:415-441,477-485,582-605
1suv d1suvb_ B:415-441,445-455,582-605
1suv d1suvf_ F:455-471,575-580,649-663
1suv d1suve_ E:455-471,575-580,649-663
1suv d1suvd_ D:124-136,242-248,316-329
1suv d1suvc_ C:124-136,242-248,316-329
1suv d1suvb_ B:159-177,401-410,415-441
1suv d1suva_ A:159-177,401-410,415-441
1suv d1suvb_ B:415-441,550-559,582-605
1suv d1suva_ A:415-441,550-559,582-605
213. c.7.1 PFL-like glycyl radical enzymes duplication: the N- and C-terminal halves have similar topologies !
PFL-like glycyl radical enzymes contains: barrel, closed; n=10, S=10; accommodates a hairpin loop inside the barrel
1pem d1pema2 A:160-167,415-421,430-449
4r1r d4r1rc2 C:208-215,462-469,474-496
4r1r d4r1ra2 A:208-215,462-469,474-496
4r1r d4r1rb2 B:208-215,462-469,474-496
1r1r d1r1rb2 B:208-215,462-469,474-496
1r1r d1r1ra2 A:208-215,462-469,474-496
1r1r d1r1rc2 C:208-215,462-469,474-496
1l1l d1l1ld_ D:192-202,248-255,273-292
1l1l d1l1lb_ B:192-202,248-255,273-292
1l1l d1l1la_ A:192-202,248-255,273-292
1l1l d1l1lc_ C:192-202,248-255,273-292
214. d.44.1 Fe,Mn superoxide dismutase (SOD), C-terminal domain
Fe,Mn superoxide dismutase (SOD), C-terminal domain alpha-beta(2)-alpha-beta-alpha(2); 3 strands of antiparallel sheet: 213
2p4k d2p4kb2 B:90-102,152-156,185-198
1ap5 d1ap5b2 B:90-102,152-156,185-198
1var d1varb2 B:90-102,152-156,185-198
1szx d1szxa2 A:90-102,152-156,185-198
1zsp d1zspa2 A:90-102,152-156,185-198
1var d1vara2 A:90-102,152-156,185-198
2p4k d2p4kc2 C:90-102,152-156,185-198
1qnm d1qnmb2 B:90-102,152-156,185-198
1szx d1szxb2 B:90-102,152-156,185-198
1gn6 d1gn6b2 B:92-104,153-157,186-199
1gn6 d1gn6a2 A:92-104,153-157,186-199
1gn6 d1gn6c2 C:92-104,153-157,186-199
1gn6 d1gn6d2 D:92-104,153-157,186-199
1gn4 d1gn4d2 D:92-104,153-157,186-199
1n0j d1n0ja2 A:90-102,152-156,185-198
2gds d2gdsc2 C:90-102,152-156,185-198
1pl4 d1pl4d2 D:90-102,152-156,185-197
2p4k d2p4ka2 A:90-102,152-156,185-198
2p4k d2p4kd2 D:90-102,152-156,185-198
1gn4 d1gn4c2 C:92-104,153-157,186-199
1pl4 d1pl4c2 C:90-102,152-156,185-197
3mds d3mdsa2 A:99-111,159-163,192-203
1luv d1luva2 A:90-102,152-156,185-197
1mng d1mnga2 A:99-111,159-163,192-203
1d5n d1d5nd2 D:95-107,160-164,193-204
1en6 d1en6b2 B:95-107,160-164,193-204
1ix9 d1ix9b2 B:95-107,160-164,193-204
1my6 d1my6b2 B:95-107,154-158,188-198
1my6 d1my6a2 A:95-107,154-158,188-198
1xil d1xilb2 B:90-102,152-156,185-195
215. e.45.1 Antivirulence factor
Antivirulence factor contains a helical bundle with a buried helix and an alpha+beta insert domain
2nud d2nudb1 B:131-141,170-182,295-304
2nun d2nuna1 A:127-141,170-182,295-304
2nud d2nuda1 A:127-141,170-182,295-304
1nh1 d1nh1a_ A:128-141,170-182,295-304
216. c.55.1 Actin-like ATPase domain duplication contains two domains of this fold !
Ribonuclease H-like motif 3 layers: a/b/a; mixed beta-sheet of 5 strands, order 32145; strand 2 is antiparallel to the rest
2zhc d2zhca2 A:147-154,274-280,306-319
1dej d1deja2 A:136-146,297-301,334-349
1ba0 d1ba0a2 A:174-184,332-338,364-381
1kaz d1kaza2 A:174-184,332-338,364-381
1hpm d1hpma2 A:174-184,332-338,364-381
1kay d1kaya2 A:174-184,332-338,364-381
1ba1 d1ba1a2 A:174-184,332-338,364-381
2zhc d2zhca2 A:147-154,165-173,306-319
1ats d1atsa2 A:174-184,332-338,364-382
1c0g d1c0ga2 A:136-146,297-302,334-349
2qw9 d2qw9b2 B:174-184,332-338,364-382
2qw9 d2qw9a2 A:174-184,332-338,364-382
2bup d2bupa2 A:174-184,332-339,364-381
1bup d1bupa2 A:174-184,332-339,364-381
1yuw d1yuwa3 A:174-184,332-339,364-382
1ngd d1ngda2 A:174-184,332-339,364-381
3d2e d3d2eb2 B:174-184,332-339,364-382
1qqn d1qqna2 A:174-184,332-339,364-381
1ngi d1ngia2 A:174-184,332-339,364-381
1kax d1kaxa2 A:174-184,332-339,364-381
1ngc d1ngca2 A:174-184,332-339,364-381
1qqm d1qqma2 A:174-184,332-339,364-381
1ngh d1ngha2 A:174-184,332-339,364-381
1hx1 d1hx1a2 A:174-184,332-339,364-381
1ngb d1ngba2 A:174-184,332-339,364-381
1nge d1ngea2 A:174-184,332-339,364-381
3d2f d3d2fb2 B:174-184,332-339,364-382
1dej d1deja2 A:136-146,148-156,334-349
1qqo d1qqoa2 A:174-184,332-339,364-381
1ngg d1ngga2 A:174-184,332-339,364-381
1c0g d1c0ga2 A:136-146,148-157,334-349
3d2e d3d2ed2 D:174-184,332-339,364-382
2e88 d2e88a2 A:174-184,332-339,364-382
3d2f d3d2fd2 D:174-184,332-339,364-382
2qwr d2qwra2 A:174-184,332-339,364-382
2e8a d2e8aa2 A:174-184,332-339,364-382
2qwq d2qwqa2 A:174-184,332-339,364-382
1ngf d1ngfa2 A:174-184,332-339,364-382
2qwm d2qwmb2 B:174-184,332-339,364-382
2qwl d2qwlb2 B:174-184,332-339,364-382
3hsc d3hsca2 A:174-184,332-339,364-382
1ngj d1ngja2 A:174-184,332-339,364-382
2qwn d2qwna2 A:174-184,332-339,364-382
1s3x d1s3xa2 A:174-184,332-339,364-382
2qwo d2qwoa2 A:174-184,332-339,364-382
2qwl d2qwla2 A:174-184,332-339,364-382
1atr d1atra2 A:174-184,332-339,364-382
2qwm d2qwma2 A:174-184,332-339,364-382
2qwp d2qwpa2 A:174-184,332-339,364-382
1mwk d1mwka2 A:147-154,274-281,307-320
1hjo d1hjoa2 A:174-184,332-339,364-382
1hx1 d1hx1a2 A:174-184,191-201,364-381
1gla d1glag1 G:48-68,93-97,164-175
2zgy d2zgya2 A:147-154,274-280,309-320
1kax d1kaxa2 A:174-184,192-202,364-381
1ba0 d1ba0a2 A:174-184,192-202,364-381
1ngi d1ngia2 A:174-184,192-202,364-381
2zgy d2zgyb2 B:147-154,274-280,309-320
2bup d2bupa2 A:174-184,192-202,364-381
2a41 d2a41a2 A:136-146,297-301,337-349
1kaz d1kaza2 A:174-184,192-202,364-381
1bup d1bupa2 A:174-184,192-202,364-381
1ba1 d1ba1a2 A:174-184,192-202,364-381
1kay d1kaya2 A:174-184,192-202,364-381
1qqm d1qqma2 A:174-184,192-202,364-381
1yuw d1yuwa3 A:174-184,192-202,364-382
1qqn d1qqna2 A:174-184,192-202,364-381
1nga d1ngaa2 A:174-184,192-202,364-381
1hpm d1hpma2 A:174-184,192-202,364-381
1ngd d1ngda2 A:174-184,192-202,364-381
1qqo d1qqoa2 A:174-184,192-202,364-381
1ngb d1ngba2 A:174-184,192-202,364-381
1ngc d1ngca2 A:174-184,192-202,364-381
2a40 d2a40a2 A:136-146,297-301,337-349
1ma9 d1ma9b2 B:136-146,297-301,337-349
2p9u d2p9ua2 A:143-155,319-323,375-387
1nge d1ngea2 A:174-184,192-202,364-381
2a40 d2a40d2 D:136-146,297-301,337-349
1ngg d1ngga2 A:174-184,192-202,364-381
1lcu d1lcua2 A:146-156,307-312,347-359
1rfq d1rfqa2 A:136-146,296-301,337-349
1ngh d1ngha2 A:174-184,192-202,364-381
1yxq d1yxqb2 B:136-146,297-301,337-349
2hf4 d2hf4a2 A:136-146,297-301,337-349
2gwk d2gwkb2 B:136-146,297-301,337-349
1yxq d1yxqa2 A:136-146,297-301,337-349
1lot d1lotb2 B:136-146,297-302,337-349
2p9n d2p9na2 A:143-155,319-323,375-387
1wua d1wuaa2 A:136-146,297-301,337-349
2zhc d2zhca2 A:147-154,274-280,280-290
2gwj d2gwja2 A:136-146,297-301,337-349
1zbs d1zbsa1 A:96-107,237-242,269-282
2p9k d2p9ka2 A:143-155,319-323,375-387
2a3z d2a3za2 A:136-146,297-302,337-349
2fxu d2fxua2 A:136-146,297-301,337-349
2d1k d2d1ka2 A:136-146,297-302,337-349
2gwk d2gwka2 A:136-146,297-301,337-349
2a42 d2a42a2 A:136-146,297-301,337-349
2e88 d2e88a2 A:174-184,190-201,364-382
2hf3 d2hf3a2 A:136-146,297-301,337-349
1kxp d1kxpa2 A:136-146,297-302,337-349
1zxo d1zxof2 F:94-105,235-241,267-277
2q1n d2q1nb2 B:136-146,297-301,337-349
3d2e d3d2eb2 B:174-184,190-201,364-382
2oan d2oana2 A:136-146,297-301,337-349
2q31 d2q31a2 A:136-146,297-301,337-349
2q31 d2q31b2 B:136-146,297-301,337-349
1y64 d1y64a2 A:136-146,297-301,337-350
2hmp d2hmpb2 B:136-146,297-301,337-349
1lcu d1lcub2 B:1146-1156,1307-1311,1347-1359
2q36 d2q36a2 A:136-146,297-302,337-349
1glb d1glbg1 G:48-68,93-97,164-175
2qwl d2qwlb2 B:174-184,192-202,364-382
1u2v d1u2va2 A:143-156,319-323,375-388
2hmp d2hmpa2 A:136-146,297-301,337-349
1s22 d1s22a2 A:136-146,297-302,337-349
3c7n d3c7nb3 B:174-184,332-338,367-382
2qwr d2qwra2 A:174-184,192-202,364-382
1rfq d1rfqb2 B:136-146,296-302,337-349
1sz2 d1sz2b1 B:99-111,256-262,303-318
2qwq d2qwqa2 A:174-184,192-202,364-382
2qwl d2qwla2 A:174-184,192-202,364-382
2qw9 d2qw9b2 B:174-184,192-202,364-382
2qwm d2qwmb2 B:174-184,192-202,364-382
2qw9 d2qw9a2 A:174-184,192-202,364-382
2oan d2oanb2 B:136-146,297-301,337-349
1r59 d1r59x2 X:245-255,406-411,438-453
2qwm d2qwma2 A:174-184,192-202,364-382
2q1n d2q1na2 A:136-146,297-302,337-349
2qwn d2qwna2 A:174-184,192-202,364-382
3hsc d3hsca2 A:174-184,192-202,364-382
1ngf d1ngfa2 A:174-184,192-202,364-382
1ngj d1ngja2 A:174-184,192-202,364-382
1sqk d1sqka2 A:136-146,297-301,337-349
2e8a d2e8aa2 A:174-184,192-202,364-382
1ijj d1ijjb2 B:536-546,697-702,737-749
1tyq d1tyqa2 A:143-156,319-324,375-388
1bu6 d1bu6z1 Z:48-68,93-97,164-175
2p9l d2p9la2 A:143-155,319-323,375-388
1s3x d1s3xa2 A:174-184,192-202,364-382
2qwo d2qwoa2 A:174-184,192-202,364-382
1mdu d1mdub2 B:138-148,299-303,339-351
1ijj d1ijja2 A:136-146,297-302,337-349
2oan d2oand2 D:136-146,297-301,337-350
1atr d1atra2 A:174-184,192-202,364-382
1p8z d1p8za2 A:136-146,297-302,337-349
1nlv d1nlva2 A:136-146,297-302,337-349
1rgi d1rgia2 A:136-146,297-302,337-349
2p9p d2p9pa2 A:143-155,319-324,375-388
1k8k d1k8ka2 A:143-155,319-324,375-388
1bg3 d1bg3a4 A:656-670,853-862,896-911
1nwk d1nwka2 A:136-146,297-301,337-350
1atn d1atna2 A:136-146,297-302,337-349
2oan d2oanc2 C:136-146,297-301,337-350
2p9i d2p9ia2 A:143-155,319-323,375-388
2p9s d2p9sa2 A:143-155,319-324,375-388
1t6d d1t6db2 B:115-132,204-210,295-307
1zxo d1zxob2 B:94-105,235-240,267-280
1zxo d1zxoe2 E:94-105,235-240,267-280
1h1v d1h1va2 A:136-146,297-301,337-350
1j6z d1j6za2 A:136-146,297-301,337-350
1v4s d1v4sa2 A:204-218,401-410,443-461
1zbs d1zbsa1 A:96-107,262-268,269-282
1zxo d1zxod2 D:94-105,235-240,267-280
2btf d2btfa2 A:136-146,297-302,337-350
1rfq d1rfqa2 A:136-146,148-156,337-349
1zxo d1zxoc2 C:94-105,235-240,267-280
1zxo d1zxoa2 A:94-105,235-240,267-280
2nrh d2nrhb2 B:72-83,168-173,191-205
1r59 d1r59x2 X:245-255,259-267,438-453
1zxo d1zxob2 B:94-105,262-266,267-280
1zxo d1zxoe2 E:94-105,261-266,267-280
1zxo d1zxod2 D:94-105,261-266,267-280
1rfq d1rfqb2 B:136-146,148-157,337-349
1t6d d1t6da2 A:115-132,204-210,295-310
1zxo d1zxoc2 C:94-105,262-266,267-280
1bg3 d1bg3a4 A:656-670,673-679,896-911
1v4s d1v4sa2 A:204-218,221-227,443-461
2hoe d2hoea2 A:184-198,200-209,347-368
217. c.51.4 ITPase-like formerly Maf/Ham1; elaborated with additional structures inserted in the common fold !
Anticodon-binding domain-like 3 layers: a/b/a; mixed beta-sheet of five strands, order 21345; strand 4 is antiparallel to the rest
1u14 d1u14a_ A:10-26,70-81,149-167
1zwy d1zwyd1 D:19-35,79-90,158-177
1k7k d1k7ka_ A:10-25,63-75,181-197
1zwy d1zwya1 A:19-35,79-90,158-177
1zno d1znob1 B:19-35,79-90,158-177
1zwy d1zwyb1 B:19-35,79-90,158-177
1zno d1znoa1 A:19-35,79-90,158-177
1zwy d1zwyc1 C:19-35,79-90,158-177
1vp2 d1vp2b_ B:12-23,62-74,174-191
1vp2 d1vp2a_ A:12-23,62-74,174-191
1u5w d1u5we1 E:13-29,73-84,152-171
1u5w d1u5wa1 A:13-29,73-84,152-171
1u5w d1u5wg1 G:13-29,73-84,152-171
1u5w d1u5wb1 B:13-29,73-84,152-171
1u5w d1u5wd1 D:13-29,73-84,152-171
1u5w d1u5wc1 C:13-29,73-84,152-171
1u5w d1u5wf1 F:13-29,73-84,152-171
1u5w d1u5wh1 H:13-29,73-84,152-171
2dvn d2dvnb1 B:9-24,60-71,167-184
2dvp d2dvpa1 A:9-24,60-71,167-184
2zti d2ztia1 A:9-24,60-71,167-184
2dvn d2dvna1 A:9-24,60-71,167-184
2dvo d2dvoa1 A:9-24,60-71,167-185
1v7r d1v7ra_ A:9-24,60-71,167-185
1exc d1excb_ B:11-22,64-76,174-185
1ex2 d1ex2b_ B:11-22,64-76,174-185
1exc d1exca_ A:11-22,64-76,174-185
1b78 d1b78a_ A:17-29,68-79,176-192
1ex2 d1ex2a_ A:11-22,64-76,174-185
2mjp d2mjpa_ A:17-29,68-79,176-192
2j4e d2j4eh1 H:16-28,67-78,176-190
1b78 d1b78b_ B:17-29,68-79,176-193
2j4e d2j4ea1 A:16-28,67-78,176-190
2j4e d2j4ee1 E:16-28,66-78,176-189
2j4e d2j4eg1 G:16-28,67-78,176-190
2mjp d2mjpb_ B:17-29,68-79,176-193
2amh d2amha1 A:18-30,83-95,196-207
2j4e d2j4ec1 C:16-28,66-78,176-193
2j4e d2j4eb1 B:16-28,66-78,176-193
2j4e d2j4ef1 F:16-28,66-78,176-193
2j4e d2j4ed1 D:16-28,66-78,176-193
218. c.1.19 Cobalamin (vitamin B12)-dependent enzymes
TIM beta/alpha-barrel contains parallel beta-sheet barrel, closed; n=8, S=8; strand order 12345678 ! the first seven superfamilies have similar phosphate-binding sites
1req d1reqb1 B:117-132,134-140,372-391
4req d4reqb1 B:117-132,134-140,372-391
3req d3reqb1 B:117-132,134-140,372-391
4req d4reqd1 D:117-132,134-140,372-391
1req d1reqd1 D:117-132,134-140,372-391
1e1c d1e1cb1 B:117-132,134-140,372-391
5req d5reqd1 D:117-132,134-140,372-391
7req d7reqb1 B:117-132,134-140,372-391
5req d5reqb1 B:117-132,134-140,372-391
2req d2reqd1 D:117-132,134-140,372-391
1e1c d1e1cd1 D:117-132,134-140,372-391
2req d2reqb1 B:117-132,134-140,372-391
1cb7 d1cb7b_ B:71-87,89-95,336-355
1req d1reqa1 A:94-109,111-116,376-395
1e1c d1e1cc1 C:94-109,111-116,376-395
4req d4reqc1 C:94-109,111-116,376-395
5req d5reqc1 C:94-109,111-116,376-395
1cb7 d1cb7d_ D:71-87,89-96,336-355
1iwp d1iwpa_ A:151-166,359-367,381-396
1uc4 d1uc4a_ A:150-165,358-366,380-395
1mmf d1mmfl_ L:151-166,359-367,381-396
1mmf d1mmfa_ A:151-166,359-367,381-396
219. c.6.2 Glycoside hydrolase/deacetylase in the different families beta-barrels are similarly distorted but may vary in the number of strands !
7-stranded beta/alpha barrel variant of beta/alpha barrel; parallel beta-sheet barrel, closed, n=7, S=8; strand order 1234567; some members may have fewer strands
1ufa d1ufaa2 A:23-50,54-60,361-378
2nly d2nlya1 A:45-54,214-221,221-236
2b5d d2b5dx2 X:24-49,52-58,357-374
1ufa d1ufaa2 A:23-50,136-142,361-378
1k1w d1k1wa3 A:19-42,45-51,233-242
1o7d d1o7d.3 A:96-112,115-119,324-341
3bui d3buia3 A:106-122,125-129,346-368
3bvw d3bvwa3 A:106-122,125-129,346-368
3d4z d3d4za3 A:106-122,125-129,346-368
3bvx d3bvxa3 A:106-122,125-129,346-368
1tqu d1tqua3 A:106-122,125-129,346-368
2f1a d2f1aa3 A:106-122,125-129,346-368
2f7r d2f7ra3 A:106-122,125-129,346-368
2ow7 d2ow7a3 A:106-122,125-129,346-368
3d51 d3d51a3 A:106-122,125-129,346-368
3d52 d3d52a3 A:106-122,125-129,346-368
2f18 d2f18a3 A:106-122,125-129,346-368
3czs d3czsa3 A:106-122,125-129,346-368
1hxk d1hxka3 A:106-122,125-129,346-368
2alw d2alwa3 A:106-122,125-129,346-368
1hty d1htya3 A:106-122,125-129,346-368
2f7q d2f7qa3 A:106-122,125-129,346-368
3bub d3buba3 A:106-122,125-129,346-368
3czn d3czna3 A:106-122,125-129,346-368
1qwu d1qwua3 A:106-122,125-129,346-368
1qx1 d1qx1a3 A:106-122,125-129,346-368
3bvu d3bvua3 A:106-122,125-129,346-368
2ow6 d2ow6a3 A:106-122,125-129,346-368
1tqt d1tqta3 A:106-122,125-129,346-368
1ps3 d1ps3a3 A:106-122,125-129,346-368
1tqv d1tqva3 A:106-122,125-129,346-368
3d4y d3d4ya3 A:106-122,125-129,346-368
3bvt d3bvta3 A:106-122,125-129,346-368
3buq d3buqa3 A:106-122,125-129,346-368
3ddf d3ddfa3 A:106-122,125-129,346-368
2f7p d2f7pa3 A:106-122,125-129,346-368
1qwn d1qwna3 A:106-122,125-129,346-368
1tqw d1tqwa3 A:106-122,125-129,346-368
3d50 d3d50a3 A:106-122,125-129,346-368
3cv5 d3cv5a3 A:106-122,125-129,346-368
3bud d3buda3 A:106-122,125-129,346-368
3bup d3bupa3 A:106-122,125-129,346-368
3ddg d3ddga3 A:106-122,125-129,346-368
3bvv d3bvva3 A:106-122,125-129,346-368
1r33 d1r33a3 A:106-122,125-129,346-368
2fyv d2fyva3 A:106-122,125-129,346-368
1tqs d1tqsa3 A:106-122,125-129,346-368
1r34 d1r34a3 A:106-122,125-129,346-368
2f7o d2f7oa3 A:106-122,125-129,346-368
1hww d1hwwa3 A:106-122,125-129,346-368
3blb d3blba3 A:106-122,125-129,346-368
2f1b d2f1ba3 A:106-122,125-129,346-368
1k1x d1k1xb3 B:19-42,45-51,232-244
1k1y d1k1yb3 B:19-42,45-51,232-244
1k1x d1k1xa3 A:19-42,45-51,232-244
1k1y d1k1ya3 A:19-42,45-51,232-244
2dfa d2dfaa1 A:20-28,218-222,228-244
1xw8 d1xw8a_ A:15-23,213-217,221-235
2cc0 d2cc0b1 B:16-30,32-38,164-176
2cc0 d2cc0a1 A:16-30,32-38,164-176
2i5i d2i5ib1 B:16-31,206-213,227-240
2i5i d2i5ia1 A:16-31,206-213,227-240
220. c.71.1 Dihydrofolate reductase-like
Dihydrofolate reductase-like 3 layers: a/b/a; mixed beta-sheet of 8 strands, order 34251687; strand 8 is antiparallel to the rest
2fzi d2fzia1 A:29-42,139-147,173-182
2fzh d2fzha1 A:29-42,139-147,173-182
1klk d1klka_ A:29-42,139-147,173-182
1ly4 d1ly4a_ A:29-42,139-148,173-182
1vj3 d1vj3a_ A:29-42,139-147,173-182
1e26 d1e26a_ A:29-42,139-147,173-182
1s3y d1s3ya_ A:29-42,139-147,173-182
3cd2 d3cd2a_ A:29-42,139-147,173-182
1daj d1daja_ A:29-42,139-148,173-182
1dyr d1dyra_ A:29-42,139-147,173-182
2cd2 d2cd2a_ A:29-42,139-147,173-182
1ly3 d1ly3a_ A:29-42,139-148,173-182
4cd2 d4cd2a_ A:29-42,139-147,173-182
1cd2 d1cd2a_ A:29-42,139-147,173-182
1ai9 d1ai9b_ B:29-42,128-137,160-169
1ia1 d1ia1b_ B:29-42,128-137,160-169
1aoe d1aoeb_ B:29-42,128-137,160-169
1ia2 d1ia2b_ B:29-42,128-137,160-169
1m78 d1m78b_ B:29-42,128-137,160-169
1ia4 d1ia4b_ B:29-42,128-137,160-169
1ia3 d1ia3b_ B:29-42,128-137,160-169
1m79 d1m79b_ B:29-42,129-137,160-169
1m7a d1m7ab_ B:29-42,129-137,160-169
1ia4 d1ia4b_ B:29-42,106-112,160-169
1ia2 d1ia2b_ B:29-42,106-112,160-169
1m79 d1m79b_ B:29-42,106-112,160-169
1ia3 d1ia3b_ B:29-42,106-112,160-169
3cd2 d3cd2a_ A:29-42,115-123,173-182
1dyr d1dyra_ A:29-42,115-123,173-182
221. c.1.12 Phosphoenolpyruvate/pyruvate domain
TIM beta/alpha-barrel contains parallel beta-sheet barrel, closed; n=8, S=8; strand order 12345678 ! the first seven superfamilies have similar phosphate-binding sites
1jqo d1jqoa_ A:236-251,282-289,673-684
1jqo d1jqob_ B:236-252,282-289,673-684
1u5h d1u5ha_ A:20-29,204-209,210-222
1u5v d1u5va_ A:20-29,204-209,210-222
1qb4 d1qb4a_ A:212-233,242-248,623-645
1fiy d1fiya_ A:212-233,242-248,623-645
1jqn d1jqna_ A:212-233,242-248,623-645
1pky d1pkyc2 C:16-27,29-34,320-339
1jde d1jdea1 A:542-553,850-855,855-874
1u5h d1u5ha_ A:20-29,29-36,210-222
1u5v d1u5va_ A:20-29,29-36,210-222
1jqo d1jqoa_ A:250-271,282-289,683-705
1jqo d1jqob_ B:251-271,282-289,683-705
1e0u d1e0ud2 D:16-27,29-36,320-339
1e0u d1e0uc2 C:16-27,29-36,320-339
1pky d1pkyd2 D:16-27,29-36,320-339
1e0u d1e0ub2 B:16-27,29-36,320-339
1e0u d1e0ua2 A:16-27,29-36,320-339
1sgj d1sgja_ A:18-29,31-38,222-233
1qb4 d1qb4a_ A:197-213,607-615,614-622
1jde d1jdea1 A:542-553,554-561,855-874
1fiy d1fiya_ A:197-213,607-615,614-622
1igw d1igwa_ A:43-59,87-91,113-139
1pky d1pkya2 A:16-27,29-36,320-339
1jqn d1jqna_ A:197-213,607-615,614-622
1igw d1igwb_ B:43-59,87-91,113-139
1a3x d1a3xb2 B:33-44,46-53,340-359
1a3x d1a3xa2 A:33-44,46-53,340-359
1a49 d1a49b2 B:656-667,669-676,969-988
1a5u d1a5ub2 B:656-667,669-676,969-988
1a49 d1a49g2 G:4256-4267,4269-4276,4569-4588
1a5u d1a5uf2 F:3656-3667,3669-3676,3969-3988
1a49 d1a49h2 H:4856-4867,4869-4876,5169-5188
1f3w d1f3wd2 D:56-67,69-76,369-388
1f3w d1f3wf2 F:56-67,69-76,369-388
1f3w d1f3wg2 G:56-67,69-76,369-388
1f3w d1f3wb2 B:56-67,69-76,369-388
1f3w d1f3wa2 A:56-67,69-76,369-388
1f3w d1f3wc2 C:56-67,69-76,369-388
1f3w d1f3wh2 H:56-67,69-76,369-388
1f3w d1f3we2 E:56-67,69-76,369-388
1a49 d1a49f2 F:3656-3667,3669-3676,3969-3988
1a5u d1a5ug2 G:4256-4267,4269-4276,4569-4588
1sgj d1sgja_ A:18-29,216-221,222-233
1a5u d1a5uh2 H:4856-4867,4869-4876,5169-5188
1a5u d1a5ue2 E:3056-3067,3069-3076,3369-3388
1a49 d1a49e2 E:3056-3067,3069-3076,3369-3388
1f3x d1f3xe2 E:56-67,69-76,369-388
1f3x d1f3xa2 A:56-67,69-76,369-388
2g50 d2g50e2 E:56-67,69-76,369-388
2g50 d2g50f2 F:56-67,69-76,369-388
2g50 d2g50a2 A:56-67,69-76,369-388
2g50 d2g50b2 B:56-67,69-76,369-388
1f3x d1f3xg2 G:56-67,69-76,369-388
2g50 d2g50h2 H:56-67,69-76,369-388
1f3x d1f3xc2 C:56-67,69-76,369-388
2g50 d2g50d2 D:56-67,69-76,369-388
1f3x d1f3xh2 H:56-67,69-76,369-388
1f3x d1f3xd2 D:56-67,69-76,369-388
2g50 d2g50c2 C:56-67,69-76,369-388
2g50 d2g50g2 G:56-67,69-76,369-388
222. c.51.5 CinA-like
Anticodon-binding domain-like 3 layers: a/b/a; mixed beta-sheet of five strands, order 21345; strand 4 is antiparallel to the rest
2a9s d2a9sb1 B:35-45,99-107,144-165
2a9s d2a9sa1 A:35-45,99-107,144-167
223. d.34.1 DNA-binding domain of Mlu1-box binding protein MBP1 has some topological similarity to the "winged helix" DNA-binding domain, to B1 and B5 domains of PheRS-beta (1PYS CH B) and to methyl-CpG-binding domain !
DNA-binding domain of Mlu1-box binding protein MBP1 beta(4)-alpha(2)-beta(2)-alpha; antiparallel sheet: order 123465
1bm8 d1bm8a_ A:36-44,74-79,79-91
1mb1 d1mb1a_ A:36-44,74-79,79-91
224. c.1.7 NAD(P)-linked oxidoreductase
TIM beta/alpha-barrel contains parallel beta-sheet barrel, closed; n=8, S=8; strand order 12345678 ! the first seven superfamilies have similar phosphate-binding sites
1lqa d1lqaa_ A:28-43,303-308,311-325
1gve d1gveb_ B:20-35,278-284,287-300
1gve d1gvea_ A:20-35,278-284,287-300
3eau d3eaua1 A:65-80,318-323,326-344
1qrq d1qrqc_ C:65-80,318-323,326-344
1qrq d1qrqd_ D:65-80,318-323,326-344
1qrq d1qrqa_ A:65-80,318-323,326-344
1qrq d1qrqb_ B:65-80,318-323,326-344
2a79 d2a79a1 A:65-80,318-323,326-344
1exb d1exba_ A:65-80,318-323,326-344
1ral d1rala_ A:33-45,265-270,273-287
2r9r d2r9rg1 G:65-80,318-323,326-344
1pz1 d1pz1b_ B:32-47,275-280,283-296
1xf0 d1xf0a_ A:32-45,265-270,273-287
1dla d1dlab_ B:22-37,39-44,264-277
1hqt d1hqta_ A:25-40,258-263,266-276
1abn d1abna_ A:23-38,40-45,265-279
1c9w d1c9wa_ A:23-38,40-45,265-278
1iei d1ieia_ A:23-38,257-262,265-275
1mzr d1mzrb_ B:27-42,44-49,235-249
2fzb d2fzba1 A:23-38,257-262,265-279
1ah4 d1ah4a_ A:23-38,257-262,265-278
2alr d2alra_ A:24-39,41-46,265-279
1us0 d1us0a_ A:23-38,40-45,265-278
1ah0 d1ah0a_ A:23-38,257-262,265-279
1z8a d1z8aa1 A:23-38,40-45,265-278
2i16 d2i16a1 A:24-39,41-46,266-279
1ah3 d1ah3a_ A:23-38,257-262,265-278
2i17 d2i17a1 A:24-39,41-46,266-279
2j8t d2j8ta1 A:23-38,40-45,265-278
1dla d1dlad_ D:22-37,39-44,264-277
2qxw d2qxwa1 A:23-38,40-45,265-278
2j8t d2j8ta1 A:23-38,257-262,265-278
2fzb d2fzba1 A:23-38,40-45,265-279
2fzd d2fzda1 A:23-38,257-262,265-279
1x98 d1x98a_ A:23-38,40-45,265-278
1z8a d1z8aa1 A:23-38,257-262,265-278
1cwn d1cwna_ A:25-40,42-47,266-280
2fzd d2fzda1 A:23-38,40-45,265-279
1pwm d1pwma_ A:23-38,40-45,265-278
1ah4 d1ah4a_ A:23-38,40-45,265-278
1us0 d1us0a_ A:23-38,257-262,265-278
1x98 d1x98a_ A:23-38,257-262,265-278
3bcj d3bcja1 A:23-38,40-45,265-279
1t41 d1t41a_ A:23-38,40-45,265-279
1pwm d1pwma_ A:23-38,257-262,265-278
1pz1 d1pz1a_ A:32-47,275-280,283-290
1az2 d1az2a_ A:23-38,257-262,265-278
2acq d2acqa_ A:23-38,257-262,265-278
1ah0 d1ah0a_ A:23-38,40-45,265-279
1abn d1abna_ A:23-38,257-262,265-279
3bcj d3bcja1 A:23-38,257-262,265-279
1pwl d1pwla_ A:23-38,40-45,265-279
2inz d2inza1 A:23-38,257-262,265-278
2pev d2peva1 A:23-38,40-45,265-279
1mzr d1mzra_ A:27-42,44-49,235-249
2ikg d2ikga1 A:23-38,40-45,265-279
1x97 d1x97a_ A:23-38,257-262,265-279
2iki d2ikia1 A:23-38,40-45,265-279
2hv5 d2hv5a1 A:23-38,40-45,265-279
2pf8 d2pf8a1 A:23-38,40-45,265-279
2dv0 d2dv0a1 A:23-38,40-45,265-279
2fz9 d2fz9a1 A:23-38,40-45,265-279
2pdg d2pdga1 A:23-38,40-45,265-279
2pzn d2pzna1 A:23-38,40-45,265-279
2duz d2duza1 A:23-38,40-45,265-279
2pzn d2pzna1 A:23-38,257-262,265-279
2iki d2ikia1 A:23-38,257-262,265-279
2pdg d2pdga1 A:23-38,257-262,265-279
2dux d2duxa1 A:23-38,40-45,265-279
2f2k d2f2ka1 A:23-38,40-45,265-279
2hvn d2hvna1 A:23-38,40-45,265-279
2pev d2peva1 A:23-38,257-262,265-279
2nvd d2nvda1 A:23-38,40-45,265-279
2pfh d2pfha1 A:23-38,40-45,265-279
2pf8 d2pf8a1 A:23-38,257-262,265-279
2dux d2duxa1 A:23-38,257-262,265-279
2f2k d2f2ka1 A:23-38,257-262,265-279
2fz9 d2fz9a1 A:23-38,257-262,265-279
2ikj d2ikja1 A:23-38,40-45,265-279
2ikh d2ikha1 A:23-38,257-262,265-279
2hvo d2hvoa1 A:23-38,40-45,265-279
2ikg d2ikga1 A:23-38,257-262,265-279
2fz8 d2fz8a1 A:23-38,40-45,265-279
1z89 d1z89a1 A:23-38,257-262,265-279
1z89 d1z89a1 A:23-38,40-45,265-279
1x97 d1x97a_ A:23-38,40-45,265-279
2ikj d2ikja1 A:23-38,257-262,265-279
2iq0 d2iq0a1 A:23-38,257-262,265-279
2nvc d2nvca1 A:23-38,40-45,265-279
1x96 d1x96a_ A:23-38,257-262,265-279
2acu d2acua_ A:23-38,257-262,265-279
2nvc d2nvca1 A:23-38,257-262,265-279
1ads d1adsa_ A:23-38,257-262,265-279
2ikh d2ikha1 A:23-38,40-45,265-279
2hv5 d2hv5a1 A:23-38,257-262,265-279
2ine d2inea1 A:23-38,257-262,265-279
2acs d2acsa_ A:23-38,257-262,265-279
2nvd d2nvda1 A:23-38,257-262,265-279
2ipw d2ipwa1 A:23-38,257-262,265-279
2acr d2acra_ A:23-38,257-262,265-279
1x96 d1x96a_ A:23-38,40-45,265-279
2acq d2acqa_ A:23-38,40-45,265-278
1el3 d1el3a_ A:23-38,257-262,265-279
2iqd d2iqda1 A:23-38,257-262,265-279
1az1 d1az1a_ A:23-38,257-262,265-279
1mar d1mara_ A:23-38,40-45,265-279
1t40 d1t40a_ A:23-38,40-45,265-279
1z3n d1z3na1 A:23-38,257-262,265-279
1t40 d1t40a_ A:23-38,257-262,265-279
2pfh d2pfha1 A:23-38,257-262,265-279
2isf d2isfa1 A:23-38,257-262,265-279
1frb d1frba_ A:23-38,40-45,265-279
1el3 d1el3a_ A:23-38,40-45,265-279
1j96 d1j96b_ B:30-45,265-270,273-287
1og6 d1og6a_ A:30-45,256-262,265-278
2hdj d2hdja1 A:30-45,265-270,273-287
1ihi d1ihib_ B:30-45,265-270,273-287
1j96 d1j96a_ A:30-45,265-270,273-287
2acu d2acua_ A:23-38,40-45,265-279
1ihi d1ihia_ A:30-45,265-270,273-287
1mar d1mara_ A:23-38,257-262,265-279
1z3n d1z3na1 A:23-38,40-45,265-279
1a80 d1a80a_ A:25-40,227-232,235-245
1ads d1adsa_ A:23-38,40-45,265-279
2ine d2inea1 A:23-38,40-45,265-279
2acr d2acra_ A:23-38,40-45,265-279
1k8c d1k8ca_ A:27-42,269-274,277-287
2acs d2acsa_ A:23-38,40-45,265-279
1az1 d1az1a_ A:23-38,40-45,265-279
3c3u d3c3ua1 A:30-45,265-270,273-287
1xjb d1xjba1 A:30-45,265-270,273-287
1ry8 d1ry8b_ B:30-45,265-270,273-287
2f38 d2f38a1 A:30-45,265-270,273-287
2hdj d2hdjb1 B:30-45,265-270,273-287
1xjb d1xjbb1 B:30-45,265-270,273-287
1q13 d1q13b_ B:30-45,265-270,273-287
1s2c d1s2ca_ A:30-45,265-270,273-287
1q13 d1q13a_ A:30-45,265-270,273-287
1q5m d1q5mb_ B:30-45,265-270,273-287
1ry0 d1ry0b_ B:30-45,265-270,273-287
1ur3 d1ur3m_ M:30-45,256-262,265-278
1s1r d1s1ra_ A:30-45,265-270,273-287
1s2a d1s2aa_ A:30-45,265-270,273-287
1og6 d1og6b_ B:30-45,256-262,265-279
1ry0 d1ry0a_ A:30-45,265-270,273-287
1og6 d1og6c_ C:30-45,256-262,265-279
1zq5 d1zq5a1 A:30-45,265-270,273-287
1ry8 d1ry8a_ A:30-45,265-270,273-287
1q5m d1q5ma_ A:30-45,265-270,273-287
1mrq d1mrqa_ A:30-45,265-270,273-287
2fgb d2fgba1 A:30-45,265-270,273-287
1s1p d1s1pa_ A:30-45,265-270,273-287
1r38 d1r38a_ A:27-42,269-274,277-291
1ihi d1ihib_ B:30-45,47-52,273-287
1ihi d1ihia_ A:30-45,47-52,273-287
1r38 d1r38b_ B:27-42,269-274,277-291
1j96 d1j96b_ B:30-45,47-52,273-287
3c3u d3c3ua1 A:30-45,47-52,273-287
1k8c d1k8cc_ C:27-42,269-274,277-291
1k8c d1k8cb_ B:27-42,269-274,277-291
1r38 d1r38d_ D:27-42,269-274,277-291
1lwi d1lwib_ B:30-45,265-270,273-287
1lwi d1lwia_ A:30-45,265-270,273-287
1vp5 d1vp5a_ A:25-40,228-233,236-250
1afs d1afsa_ A:30-45,265-270,273-287
1afs d1afsb_ B:30-45,265-270,273-287
1k8c d1k8cd_ D:27-42,269-274,277-291
2hdj d2hdja1 A:30-45,47-52,273-287
1j96 d1j96a_ A:30-45,47-52,273-287
1vp5 d1vp5b_ B:25-40,228-233,236-250
1xjb d1xjba1 A:30-45,47-52,273-287
1mi3 d1mi3a_ A:27-42,269-274,277-291
1r38 d1r38c_ C:27-42,269-274,277-291
2hdj d2hdjb1 B:30-45,47-52,273-287
1xjb d1xjbb1 B:30-45,47-52,273-287
1sm9 d1sm9c_ C:27-42,269-274,277-291
1lqa d1lqab_ B:28-43,301-308,311-324
1mi3 d1mi3c_ C:27-42,269-274,277-291
2r9r d2r9ra1 A:65-80,316-323,326-344
225. c.1.28 Radical SAM enzymes common Fe-S cluster and SAM binding sites are embedded into complete or incomplete beta/alpha-barrel !
TIM beta/alpha-barrel contains parallel beta-sheet barrel, closed; n=8, S=8; strand order 12345678 ! the first seven superfamilies have similar phosphate-binding sites
1tv7 d1tv7b_ B:51-66,265-271,297-312
2fb3 d2fb3a1 A:51-66,265-271,297-312
1tv7 d1tv7a_ A:51-66,265-271,297-312
1tv8 d1tv8a_ A:51-66,265-271,297-312
2fb3 d2fb3b1 B:51-66,265-271,297-312
1tv8 d1tv8b_ B:51-66,265-271,297-312
1olt d1olta_ A:78-97,334-340,342-354
1olt d1olta_ A:78-97,319-325,342-354
226. h.4.2 Clostridium neurotoxins, "coiled-coil" domain
Antiparallel coiled-coil this is not a true fold; contains at least two very long antiparallel helices
2np0 d2np0a4 A:535-545,552-556,557-565
1s0d d1s0da4 A:535-545,552-556,557-565
1s0e d1s0ea4 A:535-545,552-556,557-565
1g9b d1g9ba4 A:535-545,552-556,557-565
1g9a d1g9aa4 A:535-545,552-556,557-565
1i1e d1i1ea4 A:535-545,552-556,557-565
1s0b d1s0ba4 A:535-545,552-556,557-565
1epw d1epwa4 A:535-545,552-556,557-565
1s0c d1s0ca4 A:535-545,552-556,557-565
1s0f d1s0fa4 A:535-545,552-556,557-565
1s0g d1s0ga4 A:535-545,552-556,557-565
1g9d d1g9da4 A:535-545,552-556,557-565
1g9c d1g9ca4 A:535-545,552-556,557-565
1f31 d1f31a4 A:535-545,552-556,557-565
227. c.19.1 FabD/lysophospholipase-like
FabD/lysophospholipase-like core: 3 layers, a/b/a; mixed beta-sheet of 6 strands, order 432156; strand 4 is antiparallel to the rest
1mla d1mlaa1 A:58-81,270-276,299-307
1cjy d1cjyb2 B:1197-1216,1569-1576,1686-1705
1cjy d1cjya2 A:197-216,569-576,686-705
1nm2 d1nm2a1 A:55-76,292-298,299-314
1cjy d1cjyb2 B:1197-1216,1569-1576,1704-1717
1nm2 d1nm2a1 A:55-76,270-276,299-314
1mla d1mlaa1 A:58-81,292-297,299-307
1cjy d1cjya2 A:151-162,222-227,311-322
1cjy d1cjyb2 B:1197-1216,1635-1642,1686-1705
1cjy d1cjya2 A:197-216,635-642,686-705
1oxw d1oxwa_ A:77-88,148-157,223-240
1oxw d1oxwb_ B:1077-1088,1148-1157,1223-1240
1oxw d1oxwc_ C:2077-2088,2148-2157,2223-2240
1cjy d1cjyb2 B:1151-1162,1222-1228,1311-1322
1oxw d1oxwc_ C:2037-2060,2315-2323,2335-2353
1cjy d1cjya2 A:197-216,569-576,704-721
1oxw d1oxwb_ B:1037-1060,1315-1323,1361-1382
1oxw d1oxwa_ A:37-60,315-323,335-352
1oxw d1oxwc_ C:2037-2060,2315-2323,2361-2383
1oxw d1oxwb_ B:1037-1060,1315-1323,1335-1352
1oxw d1oxwb_ B:1037-1060,1252-1263,1335-1352
1oxw d1oxwa_ A:37-60,252-263,335-352
1oxw d1oxwa_ A:37-60,315-323,361-384
1oxw d1oxwc_ C:2037-2060,2252-2263,2335-2353
1oxw d1oxwb_ B:1037-1060,1252-1263,1361-1382
1oxw d1oxwc_ C:2037-2060,2252-2263,2361-2383
1oxw d1oxwa_ A:37-60,252-263,361-384
228. d.41.2 Nicotinate/Quinolinate PRTase N-terminal domain-like
alpha/beta-Hammerhead core: beta-BETA-alpha-beta-BETA-beta-alpha; contains a beta-hammerhead motif similar to that in barrel-sandwich hybrids
1vlp d1vlpb1 B:13-28,30-39,231-243
229. d.15.1 Ubiquitin-like
beta-Grasp (ubiquitin-like) core: beta(2)-alpha-beta(2); mixed beta-sheet 2143
2rgf d2rgfa_ A:37-50,69-75,77-87
1l7y d1l7ya_ A:38-51,64-68,72-81
1e8w d1e8wa3 A:208-216,236-240,290-300
230. d.352.1 FlaG-like
FlaG-like alpha(2)-beta(3)-alpha; 2 layers: a/b; antiparallel beta-sheet, order: 123; partial similatity to the dsRBD-like fold(sop_cf 54767)
2hc5 d2hc5a1 A:36-55,78-87,86-106
2hc5 d2hc5a1 A:36-55,57-66,86-106
231. d.194.1 CNF1/YfiH-like putative cysteine hydrolases
CNF1/YfiH-like putative cysteine hydrolases 4 layers: alpha/beta/beta/alpha; mixed beta sheets
1t8h d1t8ha_ A:187-199,205-209,217-230
1xfj d1xfja_ A:175-187,192-196,205-218
1u05 d1u05a_ A:165-177,182-187,193-206
1rw0 d1rw0b_ B:165-177,182-187,193-206
1rw0 d1rw0a_ A:165-177,182-187,193-206
1u05 d1u05b_ B:165-177,182-187,193-206
1xaf d1xafa_ A:165-177,182-187,193-206
1xaf d1xafb_ B:165-177,182-187,193-206
232. d.128.1 Glutamine synthetase/guanido kinase
Glutamine synthetase/guanido kinase duplication: common core consists of two beta-alpha-beta2-alpha repeats
1f52 d1f52g2 G:103-119,122-131,366-385
1f52 d1f52l2 L:103-119,122-131,366-385
1f52 d1f52c2 C:103-119,122-131,366-385
1f52 d1f52e2 E:103-119,122-131,366-385
1f52 d1f52d2 D:103-119,122-131,366-385
1f52 d1f52k2 K:103-119,122-131,366-385
1f52 d1f52a2 A:103-119,122-131,366-385
1f52 d1f52f2 F:103-119,122-131,366-385
1f52 d1f52i2 I:103-119,122-131,366-385
1f52 d1f52b2 B:103-119,122-131,366-385
1f52 d1f52h2 H:103-119,122-131,366-385
1f52 d1f52j2 J:103-119,122-131,366-385
1fpy d1fpyh2 H:103-119,122-131,366-385
1fpy d1fpyb2 B:103-119,122-131,366-385
1fpy d1fpyi2 I:103-119,122-131,366-385
1fpy d1fpyg2 G:103-119,122-131,366-385
1fpy d1fpyj2 J:103-119,122-131,366-385
1fpy d1fpye2 E:103-119,122-131,366-385
1fpy d1fpyd2 D:103-119,122-131,366-385
1fpy d1fpyf2 F:103-119,122-131,366-385
1fpy d1fpya2 A:103-119,122-131,366-385
1fpy d1fpyk2 K:103-119,122-131,366-385
1fpy d1fpyc2 C:103-119,122-131,366-385
1fpy d1fpyl2 L:103-119,122-131,366-385
1htq d1htqb2 B:103-119,122-131,366-385
1htq d1htqs2 S:103-119,122-131,366-385
1htq d1htqw2 W:103-119,122-131,366-385
1htq d1htql2 L:103-119,122-131,366-385
1htq d1htqr2 R:103-119,122-131,366-385
1htq d1htqc2 C:103-119,122-131,366-385
1htq d1htqk2 K:103-119,122-131,366-385
1htq d1htqh2 H:103-119,122-131,366-385
1htq d1htqu2 U:103-119,122-131,366-385
1htq d1htqo2 O:103-119,122-131,366-385
1htq d1htqp2 P:103-119,122-131,366-385
1htq d1htqi2 I:103-119,122-131,366-385
1htq d1htqm2 M:103-119,122-131,366-385
1htq d1htqf2 F:103-119,122-131,366-385
1htq d1htqd2 D:103-119,122-131,366-385
1htq d1htqt2 T:103-119,122-131,366-385
1htq d1htqg2 G:103-119,122-131,366-385
1htq d1htqj2 J:103-119,122-131,366-385
1htq d1htqq2 Q:103-119,122-131,366-385
1htq d1htqn2 N:103-119,122-131,366-385
1htq d1htqa2 A:103-119,122-131,366-385
1htq d1htqe2 E:103-119,122-131,366-385
1htq d1htqv2 V:103-119,122-131,366-385
1htq d1htqx2 X:103-119,122-131,366-385
2bvc d2bvce2 E:107-123,126-135,375-394
1f1h d1f1hk2 K:103-119,122-131,366-385
1f1h d1f1hg2 G:103-119,122-131,366-385
1f1h d1f1hh2 H:103-119,122-131,366-385
1f1h d1f1he2 E:103-119,122-131,366-385
1f1h d1f1hi2 I:103-119,122-131,366-385
1f1h d1f1ha2 A:103-119,122-131,366-385
1f1h d1f1hc2 C:103-119,122-131,366-385
1f1h d1f1hf2 F:103-119,122-131,366-385
1f1h d1f1hd2 D:103-119,122-131,366-385
1f1h d1f1hl2 L:103-119,122-131,366-385
1f1h d1f1hb2 B:103-119,122-131,366-385
1f1h d1f1hj2 J:103-119,122-131,366-385
2bvc d2bvcd2 D:107-123,126-135,375-394
2bvc d2bvcf2 F:107-123,126-135,375-394
2bvc d2bvcc2 C:107-123,126-135,375-394
1hto d1htol2 L:103-119,122-131,366-385
1hto d1htob2 B:103-119,122-131,366-385
1hto d1htox2 X:103-119,122-131,366-385
1hto d1htok2 K:103-119,122-131,366-385
1hto d1htos2 S:103-119,122-131,366-385
1hto d1htoe2 E:103-119,122-131,366-385
1hto d1htou2 U:103-119,122-131,366-385
1hto d1htoh2 H:103-119,122-131,366-385
1hto d1htoa2 A:103-119,122-131,366-385
1hto d1htoc2 C:103-119,122-131,366-385
1hto d1htog2 G:103-119,122-131,366-385
1hto d1htoo2 O:103-119,122-131,366-385
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1hto d1htoj2 J:103-119,122-131,366-385
1hto d1hton2 N:103-119,122-131,366-385
1hto d1htow2 W:103-119,122-131,366-385
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1hto d1htof2 F:103-119,122-131,366-385
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1hto d1htov2 V:103-119,122-131,366-385
2lgs d2lgsc2 C:103-119,122-131,366-385
2lgs d2lgse2 E:103-119,122-131,366-385
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2lgs d2lgsl2 L:103-119,122-131,366-385
2lgs d2lgsh2 H:103-119,122-131,366-385
2lgs d2lgsa2 A:103-119,122-131,366-385
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2lgs d2lgsb2 B:103-119,122-131,366-385
2lgs d2lgsg2 G:103-119,122-131,366-385
2lgs d2lgsd2 D:103-119,122-131,366-385
2lgs d2lgsi2 I:103-119,122-131,366-385
1lgr d1lgrg2 G:103-119,122-131,366-385
1lgr d1lgrj2 J:103-119,122-131,366-385
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1lgr d1lgrb2 B:103-119,122-131,366-385
1lgr d1lgrf2 F:103-119,122-131,366-385
1hto d1htop2 P:103-119,122-131,366-385
1lgr d1lgrl2 L:103-119,122-131,366-385
1lgr d1lgre2 E:103-119,122-131,366-385
1lgr d1lgrk2 K:103-119,122-131,366-385
1lgr d1lgra2 A:103-119,122-131,366-385
1lgr d1lgrd2 D:103-119,122-131,366-385
1lgr d1lgrh2 H:103-119,122-131,366-385
1lgr d1lgri2 I:103-119,122-131,366-385
2bvc d2bvca2 A:107-123,126-135,375-394
2gls d2glsc2 C:103-119,122-131,366-385
2gls d2glsl2 L:103-119,122-131,366-385
2gls d2glsh2 H:103-119,122-131,366-385
2gls d2glsi2 I:103-119,122-131,366-385
2gls d2glsf2 F:103-119,122-131,366-385
2gls d2glsb2 B:103-119,122-131,366-385
2gls d2glsg2 G:103-119,122-131,366-385
2gls d2glsk2 K:103-119,122-131,366-385
2gls d2glsj2 J:103-119,122-131,366-385
2gls d2glse2 E:103-119,122-131,366-385
2gls d2glsa2 A:103-119,122-131,366-385
2gls d2glsd2 D:103-119,122-131,366-385
233. d.144.1 Protein kinase-like (PK-like) shares functional and structural similarities with the ATP-grasp fold and PIPK !
Protein kinase-like (PK-like) consists of two alpha+beta domains, C-terminal domain is mostly alpha helical
2zm3 d2zm3d1 D:982-989,1026-1037,1040-1058
2zm3 d2zm3a1 A:982-989,1026-1037,1040-1058
2zm3 d2zm3b1 B:982-989,1026-1037,1040-1058
234. b.81.1 Trimeric LpxA-like enzymes superhelical turns are made of three short strands; duplication: the sequence hexapeptide repeats correspond to individual strands !
Single-stranded left-handed beta-helix superhelix turns are made of parallel beta-strands and (short) turns
2q4j d2q4jb1 B:361-371,392-397,402-411
2icx d2icxa1 A:361-371,392-397,402-411
1z90 d1z90b1 B:361-371,392-397,402-411
2icx d2icxb1 B:361-370,392-397,402-411
2icy d2icya1 A:361-371,392-397,402-411
2icy d2icyb1 B:361-371,392-397,402-411
1z90 d1z90a1 A:361-371,392-397,402-411
2q4j d2q4ja1 A:361-371,392-397,402-411
235. b.118.1 FAS1 domain
FAS1 domain core: barrel, closed; n=7, S=12; meander
1nyo d1nyoa_ A:56-64,65-72,90-103
1o70 d1o70a1 A:344-355,356-363,378-389
236. d.212.1 TolA/TonB C-terminal domain
TolA/TonB C-terminal domain beta(2)-alpha-beta; 2 layers, alpha/beta; left-handed beta-alpha-beta unit in non-swapped monomer
1lr0 d1lr0a_ A:77-92,110-117,117-127
237. d.129.3 Bet v1-like contains a single copy of this fold with a alpha-beta2 insertion after the first helix; there is a cavity between the beta-sheet and the long C-terminal helix !
TBP-like beta-alpha-beta(4)-alpha
2b1x d2b1xa2 A:170-183,239-246,281-291
2b1x d2b1xc2 C:170-183,239-246,281-291
2b1x d2b1xe2 E:170-183,239-246,281-291
2b24 d2b24c2 C:170-182,239-246,281-291
2b24 d2b24e2 E:170-182,239-246,281-291
2b24 d2b24a2 A:170-182,239-246,281-291
238. d.15.2 CAD & PB1 domains contain extra helix; similar heterodimerization modes; possibly related to the ubiquitin-like superfamily !
beta-Grasp (ubiquitin-like) core: beta(2)-alpha-beta(2); mixed beta-sheet 2143
1wj6 d1wj6a_ A:37-50,63-68,70-85
1wi0 d1wi0a_ A:40-53,67-73,74-96
2npt d2nptc1 C:40-53,67-73,74-96
239. e.11.1 Type II DNA topoisomerase
Type II DNA topoisomerase 4 domains: (1) toprim alpha/beta; (2) "winged helix"-like; (3) alpha+beta; (4) all-alpha
1bjt d1bjta_ A:450-465,519-525,605-631
1bgw d1bgwa_ A:451-466,468-476,609-632
1bgw d1bgwa_ A:451-466,520-526,609-632
1bgw d1bgwa_ A:451-466,556-560,609-632
240. c.1.15 Xylose isomerase-like different families share similar but non-identical metal-binding sites !
TIM beta/alpha-barrel contains parallel beta-sheet barrel, closed; n=8, S=8; strand order 12345678 ! the first seven superfamilies have similar phosphate-binding sites
2g0w d2g0wb1 B:25-37,39-44,258-279
1tz9 d1tz9a_ A:16-24,27-32,332-353
1de5 d1de5d_ D:79-95,97-104,341-363
1de6 d1de6a_ A:79-95,97-104,341-363
1de6 d1de6d_ D:79-95,97-104,341-363
1d8w d1d8wa_ A:79-95,97-104,341-363
1de5 d1de5b_ B:79-95,97-104,341-363
1de5 d1de5c_ C:79-95,97-104,341-363
1de6 d1de6b_ B:79-95,97-104,341-363
1de6 d1de6c_ C:79-95,97-104,341-363
1d8w d1d8wc_ C:79-95,97-104,341-363
1d8w d1d8wb_ B:79-95,97-104,341-363
1d8w d1d8wd_ D:79-95,97-104,341-363
1de5 d1de5a_ A:79-95,97-104,341-363
241. e.47.1 39 kda initiator binding protein, IBP39, C-terminal domains
39 kda initiator binding protein, IBP39, C-terminal domains 2 closely associated domains: (1) all-alpha, EF-hand like; (2) alpha+beta, Frataxin-like
1q89 d1q89a_ A:236-252,290-298,318-327
242. d.93.1 SH2 domain
SH2-like 3 layers: a/b/a; antiparallel beta-sheet of 5 strands is flaked by two helices
2izv d2izva2 A:277-285,305-313,356-367
1a81 d1a81g2 G:152-166,230-235,236-248
1a81 d1a81k2 K:152-166,230-235,236-248
1uus d1uusa3 A:576-586,607-614,650-659
1uur d1uura3 A:576-586,607-614,650-659
2oq1 d2oq1a2 A:151-163,227-232,233-245
2c9w d2c9wa2 A:32-47,68-75,121-134
3bum d3bumb3 B:253-265,289-296,323-335
2cbl d2cbla3 A:253-265,289-296,323-335
1b47 d1b47a3 A:253-265,289-296,323-335
1yvh d1yvha3 A:253-265,288-296,323-335
1fbv d1fbva3 A:253-265,288-296,323-335
3bux d3buxd3 D:253-265,288-296,323-335
3bun d3bunb3 B:253-265,289-296,323-335
3buo d3buod3 D:253-265,288-296,323-335
3buo d3buob3 B:253-265,288-296,323-335
3buw d3buwb3 B:253-265,288-296,323-335
3bux d3buxb3 B:253-265,288-296,323-335
3buw d3buwd3 D:253-265,288-296,323-335
1a81 d1a81e2 E:152-166,230-235,236-248
1b47 d1b47b3 B:253-265,289-295,323-335
2oq1 d2oq1a2 A:151-163,186-194,233-245
1b47 d1b47c3 C:253-265,289-295,323-335
243. d.210.1 Argininosuccinate synthetase, C-terminal domain
Argininosuccinate synthetase, C-terminal domain unusual fold
1k92 d1k92a2 A:71-87,243-249,294-311
1j1z d1j1zc2 C:60-77,223-229,273-290
1kp3 d1kp3a2 A:71-87,243-249,294-311
1k97 d1k97a2 A:71-87,243-249,294-311
1kp2 d1kp2a2 A:71-87,243-249,294-311
1j1z d1j1zd2 D:60-77,223-229,273-290
1j20 d1j20b2 B:60-77,223-229,273-290
1j20 d1j20c2 C:60-77,223-229,273-290
1j1z d1j1zb2 B:60-77,223-229,273-290
1j1z d1j1za2 A:60-77,223-229,273-290
1kh3 d1kh3c2 C:60-77,223-229,273-290
1kor d1korc2 C:60-77,223-229,273-290
1j20 d1j20d2 D:60-77,223-229,273-290
1j21 d1j21c2 C:60-77,224-229,273-290
1kh1 d1kh1a2 A:60-77,224-229,273-290
1j20 d1j20a2 A:60-77,224-229,273-290
1j21 d1j21a2 A:60-77,224-229,273-290
1kh1 d1kh1c2 C:61-77,225-229,273-290
1kh2 d1kh2b2 B:60-77,225-229,273-290
1kh1 d1kh1b2 B:60-77,225-229,273-290
1kh2 d1kh2a2 A:60-77,225-229,273-290
1kh2 d1kh2c2 C:60-77,225-229,273-290
1kh3 d1kh3b2 B:60-77,225-229,273-290
1kh1 d1kh1d2 D:60-77,225-229,273-290
1j21 d1j21b2 B:60-77,225-229,273-290
1kh2 d1kh2d2 D:60-77,225-229,273-290
1kh3 d1kh3a2 A:60-77,225-229,273-290
1kor d1kora2 A:60-77,225-229,273-290
1j21 d1j21d2 D:60-77,225-229,273-290
1kh3 d1kh3d2 D:60-77,225-229,273-290
1kor d1korb2 B:60-77,225-229,273-290
1kor d1kord2 D:60-77,225-229,273-290
244. c.1.11 Enolase C-terminal domain-like binds metal ion (magnesium or manganese) in conserved site inside barrel ! N-terminal alpha+beta domain is common to this superfamily !
TIM beta/alpha-barrel contains parallel beta-sheet barrel, closed; n=8, S=8; strand order 12345678 ! the first seven superfamilies have similar phosphate-binding sites
2one d2onea1 A:128-138,143-147,381-391
4enl d4enla1 A:128-138,143-147,381-391
2al1 d2al1b1 B:128-138,143-147,381-391
2one d2oneb1 B:128-138,143-147,381-391
1ebh d1ebha1 A:128-138,143-147,381-391
1l8p d1l8pa1 A:128-138,143-147,381-391
1nel d1nela1 A:128-138,143-147,381-391
5enl d5enla1 A:128-138,143-147,381-391
1ebg d1ebgb1 B:128-138,143-147,381-391
6enl d6enla1 A:128-138,143-147,381-391
1ebh d1ebhb1 B:128-138,143-147,381-391
1one d1onea1 A:128-138,143-147,381-391
2al2 d2al2b1 B:128-138,143-147,381-391
1p43 d1p43a1 A:128-138,143-147,381-391
3enl d3enla1 A:128-138,143-147,381-391
1l8p d1l8pc1 C:1128-1138,1143-1147,1381-1391
2al1 d2al1a1 A:128-138,143-147,381-391
2al2 d2al2a1 A:128-138,143-147,381-391
1one d1oneb1 B:128-138,143-147,381-391
1els d1elsa1 A:128-138,143-147,381-391
7enl d7enla1 A:128-138,143-147,381-391
1ebg d1ebga1 A:128-138,143-147,381-391
1l8p d1l8pb1 B:628-638,643-647,881-891
1l8p d1l8pd1 D:1628-1638,1643-1647,1881-1891
1p43 d1p43b1 B:628-638,643-647,881-891
1p48 d1p48a1 A:128-138,143-147,381-391
1p48 d1p48b1 B:628-638,643-647,881-891
1kd0 d1kd0b1 B:176-188,190-196,390-413
1kcz d1kczb1 B:176-188,190-196,390-413
1kcz d1kcza1 A:176-188,190-196,390-413
1kko d1kkoa1 A:176-188,190-196,390-411
1kko d1kkob1 B:176-188,190-196,390-411
1kkr d1kkrb1 B:176-188,190-196,390-411
245. c.20.1 Initiation factor IF2/eIF5b, domain 3
Initiation factor IF2/eIF5b, domain 3 3 layers, a/b/a; core: parallel beta-sheet of 4 strands, order 2134
1g7r d1g7ra3 A:359-374,404-410,433-461
1g7s d1g7sa3 A:359-374,404-410,433-461
1g7t d1g7ta3 A:359-374,404-410,433-461
246. d.48.1 RecA protein, C-terminal domain
Anti-LPS factor/recA domain alpha-beta(3)-alpha(2); 2 layers, alpha/beta
1mo6 d1mo6a2 A:270-283,296-302,313-329
1mo5 d1mo5a2 A:270-283,296-302,313-329
1mo3 d1mo3a2 A:270-283,296-302,313-329
1g19 d1g19a2 A:270-283,296-302,313-329
1mo4 d1mo4a2 A:270-283,296-302,313-329
1ube d1ubea2 A:271-284,297-303,314-330
1ubg d1ubga2 A:271-284,297-303,314-330
1g18 d1g18a2 A:270-283,296-302,313-329
1ubc d1ubca2 A:271-284,297-303,314-330
1u94 d1u94a2 A:269-282,295-300,312-328
1ubf d1ubfa2 A:271-284,297-303,314-330
247. c.1.25 Monomethylamine methyltransferase MtmB
TIM beta/alpha-barrel contains parallel beta-sheet barrel, closed; n=8, S=8; strand order 12345678 ! the first seven superfamilies have similar phosphate-binding sites
1tv3 d1tv3a_ A:139-151,154-158,379-394
1tv3 d1tv3a_ A:139-151,362-370,379-394
1l2q d1l2qa_ A:136-151,154-158,379-394
1tv4 d1tv4a_ A:136-151,154-158,379-394
1nth d1ntha_ A:136-151,154-158,379-394
1tv2 d1tv2a_ A:136-151,154-158,379-394
1l2q d1l2qa_ A:136-151,362-370,379-394
1tv2 d1tv2a_ A:136-151,362-370,379-394
1nth d1ntha_ A:136-151,362-370,379-394
1tv4 d1tv4a_ A:136-151,362-370,379-394
248. c.40.1 Methylesterase CheB, C-terminal domain
Methylesterase CheB, C-terminal domain 3 layers: a/b/a, parallel beta-sheet of 7 strands, order 3421567
1a2o d1a2ob2 B:165-178,274-282,329-343
1a2o d1a2ob2 B:165-178,299-305,329-343
1a2o d1a2oa2 A:166-178,299-305,329-344
1chd d1chda_ A:166-178,274-280,329-343
1a2o d1a2oa2 A:166-178,274-280,329-344
1chd d1chda_ A:166-178,184-190,329-343
249. c.96.1 Fe-only hydrogenase
Fe-only hydrogenase consist of two intertwined domains; contains partial duplication
1hfe d1hfel1 L:126-138,225-232,259-271
1hfe d1hfem1 M:126-138,225-232,259-271
1c4a d1c4aa1 A:249-261,346-353,380-392
1c4c d1c4ca1 A:249-261,346-353,380-392
1feh d1feha1 A:249-261,346-353,380-392
3c8y d3c8ya1 A:249-261,346-353,380-392
1hfe d1hfem1 M:179-191,342-352,352-366
1hfe d1hfel1 L:179-191,342-352,352-366
3c8y d3c8ya1 A:300-312,463-473,473-484
1c4c d1c4ca1 A:300-312,463-473,473-484
1c4a d1c4aa1 A:300-312,463-473,473-484
1feh d1feha1 A:300-312,463-473,473-484
250. d.58.39 Glutamyl tRNA-reductase catalytic, N-terminal domain common fold is elaborated with additional secondary structures !
Ferredoxin-like alpha+beta sandwich with antiparallel beta-sheet; (beta-alpha-beta)x2
1gpj d1gpja3 A:58-70,73-78,77-91
251. c.120.1 PIN domain-like
PIN domain-like 3 layers, a/b/a; core: parallel beta-sheet of 5 strands, order 32145
1v8o d1v8oc_ C:8-19,28-32,122-133
1v8o d1v8og_ G:8-19,28-32,122-133
1v8o d1v8oe_ E:8-19,28-32,122-133
1v8o d1v8ob_ B:8-19,28-32,122-133
1v8o d1v8of_ F:8-19,28-32,122-133
1v8o d1v8oa_ A:8-19,28-32,122-133
1v8p d1v8pc_ C:8-19,28-32,122-133
1v8p d1v8pl_ L:8-19,28-32,122-133
1v8p d1v8pg_ G:8-19,28-32,122-133
1v8p d1v8ph_ H:8-19,28-32,122-133
1v8p d1v8pe_ E:8-19,28-32,122-133
1v8p d1v8pi_ I:8-19,28-32,122-133
1v8p d1v8pj_ J:8-19,28-32,122-133
1v8o d1v8od_ D:8-19,28-32,122-133
1v8p d1v8pf_ F:8-19,28-32,122-133
1v8o d1v8oh_ H:8-19,28-32,122-133
1v8p d1v8pb_ B:8-19,28-32,122-133
1v8p d1v8pa_ A:8-19,28-32,122-133
1v8p d1v8pk_ K:8-19,28-32,122-133
1v8p d1v8pd_ D:8-19,28-32,122-133
1ye5 d1ye5a1 A:10-19,33-38,95-109
1v96 d1v96a1 A:10-19,33-38,95-109
1ye5 d1ye5b1 B:10-19,33-38,95-109
1y82 d1y82c1 C:10-19,33-38,95-109
1y82 d1y82a1 A:10-19,33-38,95-109
252. c.1.17 Nicotinate/Quinolinate PRTase C-terminal domain-like incomplete beta/alpha barrel with parallel beta-sheet of 7 strands !
TIM beta/alpha-barrel contains parallel beta-sheet barrel, closed; n=8, S=8; strand order 12345678 ! the first seven superfamilies have similar phosphate-binding sites
1o4u d1o4ub1 B:90-116,118-122,238-247
1vlp d1vlpc2 C:155-171,173-178,331-346
1vlp d1vlpa2 A:155-171,173-178,331-346
1o4u d1o4ua1 A:90-116,118-122,238-247
1vlp d1vlpd2 D:155-171,173-178,331-346
2i14 d2i14f1 F:2501-2527,2530-2535,2672-2680
2i14 d2i14e1 E:2101-2127,2130-2135,2272-2280
2i14 d2i14c1 C:1101-1127,1130-1135,1272-1280
2i14 d2i14a1 A:101-127,130-135,272-280
2i14 d2i14d1 D:1501-1527,1530-1535,1672-1680
2i14 d2i14b1 B:501-527,530-535,672-680
1vlp d1vlpb2 B:155-171,173-178,331-346
1ybe d1ybea1 A:168-194,197-201,348-360
1ytd d1ytda1 A:105-131,133-139,274-285
1qpq d1qpqe1 E:2103-2129,2133-2138,2252-2263
1ybe d1ybeb1 B:168-194,197-202,348-360
1qpo d1qpoe1 E:2103-2129,2133-2138,2252-2263
1qpr d1qprb1 B:103-129,133-138,252-263
1qpq d1qpqd1 D:1603-1629,1633-1638,1752-1763
1qpr d1qpre1 E:103-129,133-138,252-263
1qpq d1qpqb1 B:603-629,633-638,752-763
1qpo d1qpod1 D:1603-1629,1633-1638,1752-1763
1qpr d1qprd1 D:103-129,133-138,252-263
1qpr d1qprf1 F:103-129,133-138,252-263
1qpr d1qprc1 C:103-129,133-138,252-263
1qpq d1qpqc1 C:1103-1129,1133-1138,1252-1263
1qpn d1qpnd1 D:1603-1629,1633-1638,1752-1763
1qpo d1qpof1 F:2603-2629,2633-2638,2752-2763
1qpq d1qpqf1 F:2603-2629,2633-2638,2752-2763
1qpq d1qpqa1 A:103-129,133-138,252-263
1qpn d1qpne1 E:2103-2129,2133-2138,2252-2263
1qpr d1qpra1 A:103-129,133-138,252-263
1qpn d1qpnb1 B:603-629,633-638,752-763
1qpo d1qpoa1 A:103-129,133-138,252-263
1qpn d1qpna1 A:103-129,133-138,252-263
1qpo d1qpob1 B:603-629,633-638,752-763
1qpn d1qpnf1 F:2603-2629,2633-2638,2752-2763
1qpo d1qpoc1 C:1103-1129,1133-1138,1252-1263
1qpn d1qpnc1 C:1103-1129,1133-1138,1252-1263
1qap d1qapb1 B:116-142,146-151,262-273
2f7f d2f7fa1 A:127-153,155-160,296-307
253. e.28.1 Reovirus inner layer core protein p3
Reovirus inner layer core protein p3 large protein without apparent domain division; has a number of all-alpha regions and one all beta domain near the C-end
2btv d2btva_ A:229-247,247-251,886-893
254. d.81.1 Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase-like, C-terminal domain N-terminal domain is the classic Rossmann-fold !
FwdE/GAPDH domain-like core: alpha-beta-alpha-beta(3); mixed sheet: 2134, strand 2 is parallel to strand 1
1b7g d1b7gq2 Q:138-156,290-299,299-317
1b7g d1b7go2 O:138-156,290-299,299-317
1r0k d1r0kb3 B:150-160,255-262,265-276
1r0k d1r0kc3 C:150-160,255-262,265-276
1r0k d1r0kd3 D:150-160,255-262,265-276
1r0k d1r0ka3 A:150-160,255-262,265-276
1r0l d1r0ld3 D:150-160,255-262,265-276
1r0l d1r0lc3 C:150-160,255-262,265-276
2egh d2eghb3 B:149-159,264-271,274-285
1t1s d1t1sa4 A:149-160,264-271,274-285
1r0l d1r0lb3 B:150-160,255-262,265-276
1jvs d1jvsb3 B:149-160,264-271,274-285
1ono d1onoa3 A:150-161,265-272,275-286
1r0l d1r0la3 A:150-160,255-262,265-276
1cf2 d1cf2p2 P:139-148,290-299,299-317
1t1r d1t1ra4 A:149-160,264-271,274-285
1jvs d1jvsa3 A:149-160,264-271,274-285
1ono d1onob3 B:150-160,265-272,275-286
1t1s d1t1sb4 B:149-160,264-271,274-285
1cf2 d1cf2q2 Q:139-148,290-299,299-317
1onn d1onnb3 B:150-160,265-272,275-286
2egh d2egha3 A:149-159,264-271,274-285
1cf2 d1cf2r2 R:139-148,290-299,299-317
1k5h d1k5ha3 A:150-160,265-272,275-286
1k5h d1k5hc3 C:150-161,265-272,275-286
1q0l d1q0la3 A:150-161,265-272,275-286
1t1r d1t1rb4 B:149-160,264-271,274-285
1onp d1onpb3 B:150-160,265-272,275-286
1onn d1onna3 A:150-161,265-272,275-286
1k5h d1k5hb3 B:150-160,265-272,275-286
1onp d1onpa3 A:150-161,265-272,275-286
1q0h d1q0ha3 A:150-161,265-272,275-286
1q0q d1q0qa3 A:150-161,265-272,275-286
1q0q d1q0qb3 B:150-161,265-272,275-286
1nvm d1nvmh2 H:219-239,240-244,288-310
1nvm d1nvmb2 B:219-239,240-244,288-312
1nvm d1nvmd2 D:219-239,240-244,288-310
1nvm d1nvmf2 F:219-239,240-244,288-311
255. d.82.4 GAS2 domain-like this superfamily may include the most C-terminal domain of IBP39 (
N domain of copper amine oxidase-like alpha-beta(5)-alpha; 2 layers: alpha/beta; meander antiparallel sheet
1v5r d1v5ra1 A:8-22,30-35,66-76
256. d.110.9 GlcG-like alpha-beta(2)-alpha(3)-beta(2)-alpha; similar to the Roadblock/LC7 domain !
Profilin-like core: 2 alpha-helices and 5-stranded antiparallel sheet: order 21543; 3 layers: alpha/beta/alpha
2a2l d2a2la1 A:57-75,115-125,127-145
2a2l d2a2ld1 D:57-75,115-125,127-146
2a2l d2a2lb1 B:57-75,115-125,127-146
2a2l d2a2lc1 C:57-75,115-125,127-146
257. c.85.1 FucI/AraA N-terminal and middle domains
FucI/AraA N-terminal and middle domains consists of two domains of similar topology, 3 layers (a/b/a) each ! Domain 1 (1-173) has parallel beta-sheet of 5 strands, order 21345 ! Domain 2 (174-355) has parallel beta-sheet of 4 strands, order 2134
2hxg d2hxgc2 C:194-203,204-209,308-323
2hxg d2hxgb2 B:194-203,204-209,308-323
2ajt d2ajtb2 B:194-203,204-209,308-323
2ajt d2ajtc2 C:194-203,204-209,308-323
2hxg d2hxga2 A:194-203,204-209,308-323
2ajt d2ajta2 A:194-203,204-210,308-323
2hxg d2hxgb2 B:20-43,99-106,153-176
1fui d1fuid2 D:18-45,81-88,152-175
2ajt d2ajtc2 C:20-43,99-106,153-176
2ajt d2ajtb2 B:20-43,99-106,153-176
1fui d1fuid2 D:18-45,103-110,152-175
1fui d1fuie2 E:20-45,81-88,152-175
1fui d1fuib2 B:20-45,81-88,152-175
1fui d1fuia2 A:20-45,81-88,152-175
1fui d1fuif2 F:20-45,81-88,152-175
1fui d1fuic2 C:20-45,81-88,152-175
1fui d1fuie2 E:20-45,103-110,152-175
1fui d1fuib2 B:20-45,103-110,152-175
1fui d1fuif2 F:20-45,103-110,152-175
1fui d1fuia2 A:20-45,103-110,152-175
1fui d1fuic2 C:20-45,103-110,152-175
1fui d1fuid2 D:18-45,54-58,152-175
1fui d1fuia2 A:20-45,54-58,152-175
1fui d1fuic2 C:20-45,54-58,152-175
258. c.148.1 ComB-like
ComB-like contains of two similar intertwined domains related by pseudo dyad; duplication; core: 3 layers: a/b/a; parallel beta-sheet of 4 strands, order 1423
1vr0 d1vr0a1 A:50-62,96-103,102-113
1vr0 d1vr0b1 B:50-62,96-103,102-113
1vr0 d1vr0c1 C:50-62,96-103,102-113
1vr0 d1vr0c1 C:50-62,64-71,102-113
259. c.100.1 Thiamin pyrophosphokinase, catalytic domain
Thiamin pyrophosphokinase, catalytic domain 3 layers: a/b/a; parallel beta-sheet of 6 strands, order 432156
1ig0 d1ig0a2 A:51-63,215-223,311-319
1ig0 d1ig0b2 B:51-63,215-223,311-319
260. e.10.1 Prokaryotic type I DNA topoisomerase duplication: the protein chain passing through the domains 2-4 makes two structural repeats ! The active site is formed by the toprim and "winged helix" domains (domains 1 and 4); these two domains are also found in the type II topoisomerase (DNA gyrase A) and in the alpha subunit of topoisomerase IV !
Prokaryotic type I DNA topoisomerase 4 domains: (1) Toprim alpha/beta; (2&4) "winged helix"-like; (3) barrel: n=6, S=8
1i7d d1i7da_ A:8-20,96-102,138-149
1d6m d1d6ma_ A:8-20,96-102,138-149
1cy2 d1cy2a_ A:10-22,103-110,143-154
1cy8 d1cy8a_ A:10-22,103-110,143-154
1mw9 d1mw9x_ X:10-22,105-109,143-154
1mw8 d1mw8x_ X:10-22,105-109,143-154
1cy1 d1cy1a_ A:10-22,103-109,143-154
1ecl d1ecla_ A:10-22,103-109,143-154
1cy4 d1cy4a_ A:10-21,103-109,143-154
1cy7 d1cy7a_ A:10-21,103-109,143-154
261. d.74.1 PCD-like has additional alpha helix at the N-terminus !
DCoH-like beta(2)-alpha-beta(2)-alpha; 2 layers, alpha/beta
1dcp d1dcpg_ G:9-18,25-29,86-104
1dch d1dchg_ G:9-18,25-29,86-104
1dco d1dcog_ G:9-18,25-29,86-104
262. d.58.36 Nitrite/Sulfite reductase N-terminal domain-like duplication: contains two subdomains of this fold !
Ferredoxin-like alpha+beta sandwich with antiparallel beta-sheet; (beta-alpha-beta)x2
1zj9 d1zj9a2 A:60-67,67-71,139-154
263. d.90.1 FMN-dependent nitroreductase-like
FMN-dependent nitroreductase-like core: (alpha-beta-alpha-beta)2; 3 layers a/b/a; antiparallel beta-sheet: 1243
1vkw d1vkwa_ A:61-83,159-165,167-187
264. g.52.1 Inhibitor of apoptosis (IAP) repeat
Inhibitor of apoptosis (IAP) repeat metal(zinc)-bound alpha+beta fold
1sdz d1sdza_ A:60-68,83-89,95-105
1se0 d1se0a_ A:60-68,83-89,95-105
2vsl d2vsla1 A:280-288,303-309,315-325
1g73 d1g73d_ D:280-288,303-309,315-325
2opz d2opzb1 B:280-288,303-309,315-325
1q4q d1q4qj_ J:243-251,266-272,278-288
2opz d2opzd1 D:280-288,303-309,315-325
1xb1 d1xb1a_ A:280-288,303-309,315-325
1e31 d1e31b_ B:34-42,61-66,72-82
1f9x d1f9xa_ A:279-288,303-309,315-325
1se0 d1se0a_ A:60-68,68-72,95-105
1sdz d1sdza_ A:60-68,68-72,95-105
2vsl d2vsla1 A:280-288,288-292,315-325
1q4q d1q4qj_ J:243-251,251-255,278-288
265. b.50.1 Acid proteases
Acid proteases barrel, closed; n=6, S=10, complex topology
1fmu d1fmua_ A:47-54,98-108,109-116
1pfz d1pfza_ A:49-56,95-109,111-119
2igy d2igya1 A:49-56,99-109,111-119
2igy d2igyb1 B:49-56,99-109,111-119
1fq5 d1fq5a_ A:47-54,98-107,109-116
1bil d1bila_ A:47-54,97-107,108-116
1fq7 d1fq7a_ A:47-54,98-107,109-116
1fq8 d1fq8a_ A:47-54,98-107,109-116
1fq6 d1fq6a_ A:47-54,98-107,109-116
2jxr d2jxra_ A:47-54,98-107,109-116
1hrn d1hrnb_ B:47-54,97-107,108-115
1bbs d1bbsa_ A:47-54,97-107,108-115
1bbs d1bbsb_ B:47-54,97-107,108-115
1smr d1smre_ E:47B-54,97-107,108-115
1smr d1smra_ A:47B-54,97-107,108-115
1smr d1smrc_ C:47B-54,97-107,108-115
1smr d1smrg_ G:47B-54,97-107,108-115
266. d.198.4 YdhG-like some similarity to YjbR-like (scop_sf 136320)
Secretion chaperone-like alpha-beta(3)-alpha-beta(2)-alpha; 2 layers: alpha/beta
2oc6 d2oc6b1 B:13-32,49-59,99-115
2oc6 d2oc6a1 A:13-32,49-59,99-117
267. b.38.1 Sm-like ribonucleoproteins
Sm-like fold core: barrel, open; n*=4, S*=8; meander; SH3-like topology
2vv5 d2vv5a1 A:111-128,144-150,166-174
2vv5 d2vv5d1 D:111-128,144-150,166-174
2vv5 d2vv5f1 F:111-128,144-150,166-174
2vv5 d2vv5e1 E:111-128,144-150,166-174
2vv5 d2vv5g1 G:111-128,144-150,166-174
2vv5 d2vv5b1 B:111-128,144-150,166-174
2vv5 d2vv5c1 C:111-128,144-150,166-174
2oau d2oaug1 G:111-128,144-150,166-173
2oau d2oauf1 F:111-128,144-150,166-173
2oau d2oauc1 C:111-128,144-150,166-173
2oau d2oaub1 B:111-128,144-150,166-173
2oau d2oaue1 E:111-128,144-150,166-173
2oau d2oaud1 D:111-128,144-150,166-173
2oau d2oaua1 A:111-128,144-150,166-173
268. d.15.6 Superantigen toxins, C-terminal domain
beta-Grasp (ubiquitin-like) core: beta(2)-alpha-beta(2); mixed beta-sheet 2143
2g9h d2g9hd2 D:4-17,175-181,187-198
1eu3 d1eu3a2 A:1-15,169-175,181-192
1et6 d1et6a2 A:1-15,169-175,181-192
1eu3 d1eu3b2 B:4-15,169-175,181-192
1l0y d1l0yb2 B:17-28,181-186,193-204
1l0y d1l0yd2 D:17-28,181-186,193-204
1et6 d1et6b2 B:4-15,169-175,181-192
1fnu d1fnua2 A:17-28,181-186,193-204
1b1z d1b1zb2 B:17-28,181-186,193-204
1b1z d1b1zd2 D:17-28,181-186,193-204
1fnu d1fnud2 D:917-928,1081-1086,1093-1104
1lo5 d1lo5d2 D:19-33,193-199,205-216
1ty2 d1ty2b2 B:4-20,169-175,182-193
1ha5 d1ha5c2 C:3017-3028,3180-3186,3193-3204
1uup d1uupd2 D:4017-4028,4180-4186,4193-4204
1fnu d1fnuc2 C:617-628,780-786,793-804
1uup d1uupb2 B:2017-2028,2180-2186,2193-2204
1ha5 d1ha5a2 A:1017-1028,1180-1186,1193-1204
1ha5 d1ha5b2 B:2017-2028,2180-2186,2193-2204
1uup d1uupa2 A:1017-1028,1180-1186,1193-1204
1fnu d1fnub2 B:317-328,480-486,493-504
1l0x d1l0xb2 B:17-28,180-186,193-204
1l0x d1l0xd2 D:17-28,180-186,193-204
1uup d1uupc2 C:3017-3028,3180-3186,3193-3204
1b1z d1b1zc2 C:17-28,180-186,193-204
1b1z d1b1za2 A:17-28,180-186,193-204
1fnw d1fnwg2 G:1817-1828,1980-1986,1993-2004
1fnw d1fnwb2 B:317-328,480-486,493-504
1eu4 d1eu4a2 A:4-18,164-172,178-189
1fnw d1fnwh2 H:2117-2128,2280-2286,2293-2304
1jck d1jckb2 B:20-29,193-201,209-220
1jck d1jckd2 D:20-29,193-201,209-220
1goz d1gozb2 B:2020-2029,2193-2201,2209-2220
1ty0 d1ty0b2 B:4-20,168-175,182-193
1ty2 d1ty2c2 C:6-20,168-175,182-193
1ty0 d1ty0c2 C:6-20,168-175,182-193
1ktk d1ktkc2 C:5-19,165-173,180-191
1hqr d1hqrd2 D:505-519,665-673,680-691
1ktk d1ktka2 A:5-19,165-173,180-191
1ktk d1ktkd2 D:5-19,165-173,180-191
1ty0 d1ty0a2 A:2-20,167-175,182-193
1an8 d1an8a2 A:5-19,165-173,180-191
1ty2 d1ty2a2 A:2-20,167-175,182-193
1ktk d1ktkb2 B:5-19,165-173,180-191
269. c.1.18 PLC-like phosphodiesterases
TIM beta/alpha-barrel contains parallel beta-sheet barrel, closed; n=8, S=8; strand order 12345678 ! the first seven superfamilies have similar phosphate-binding sites
2fju d2fjub4 B:341-352,622-627,632-646
2zkm d2zkmx4 X:341-352,622-627,632-646
1t8q d1t8qd_ D:47-58,341-346,347-356
1t8q d1t8qc_ C:47-58,341-346,347-356
1ydy d1ydya1 A:47-58,341-346,347-356
1qat d1qatb3 B:325-336,573-578,583-597
1ydy d1ydyb1 B:47-58,341-346,347-356
1qas d1qasb3 B:325-336,573-578,583-597
1qas d1qasa3 A:325-336,573-578,583-597
1t8q d1t8qa_ A:47-58,341-346,347-356
1djy d1djya3 A:325-336,573-578,583-597
1djy d1djyb3 B:325-336,573-578,583-597
1djx d1djxb3 B:325-336,573-578,583-597
1zcc d1zcca1 A:18-29,218-223,224-240
1zcc d1zcce1 E:18-29,218-223,224-233
1v8e d1v8ea1 A:24-35,209-214,215-222
1vd6 d1vd6a1 A:24-35,209-214,215-224
1zcc d1zccf1 F:18-29,218-223,224-235
1aod d1aoda_ A:69-77,78-87,281-293
270. d.310.1 VC0467-like
VC0467-like complex fold; contains bifurcated beta-sheet structure folded into pseudo barrel
2gs5 d2gs5a1 A:64-71,112-117,121-129
2hrx d2hrxa1 A:64-71,112-117,121-129
271. c.52.3 Eukaryotic RPB5 N-terminal domain
Restriction endonuclease-like core: 3 layers, a/b/a; mixed beta-sheet of 5 strands, order 12345; strands 2 &, in some families, 5 are antiparallel to the rest
1dzf d1dzfa1 A:5-27,106-112,136-143
2nvy d2nvye1 E:2-27,106-112,136-143
1twh d1twhe1 E:2-27,106-112,136-143
2yu9 d2yu9e1 E:3-27,106-112,136-143
1i3q d1i3qe1 E:3-27,106-112,136-143
1twa d1twae1 E:2-27,106-112,136-143
1twg d1twge1 E:2-27,106-112,136-143
1twc d1twce1 E:2-27,106-112,136-143
2ja8 d2ja8e1 E:2-27,106-112,136-143
2ja5 d2ja5e1 E:2-27,106-112,136-143
2nvq d2nvqe1 E:3-27,106-112,136-143
2ja7 d2ja7e1 E:2-27,106-112,136-143
1twf d1twfe1 E:2-27,106-112,136-143
2ja6 d2ja6e1 E:2-27,106-112,136-143
2ja7 d2ja7q1 Q:2-27,106-112,136-143
2b63 d2b63e1 E:3-27,106-112,136-143
1i6h d1i6he1 E:3-27,106-112,136-143
1dzf d1dzfa1 A:5-27,77-83,136-143
1i50 d1i50e1 E:2-27,106-112,136-143
2nvt d2nvte1 E:3-27,106-112,136-143
2e2j d2e2je1 E:3-27,106-112,136-143
1k83 d1k83e1 E:3-27,106-112,136-143
2b8k d2b8ke1 E:3-27,106-112,136-143
2e2i d2e2ie1 E:3-27,106-112,136-143
2nvx d2nvxe1 E:3-27,106-112,136-143
2nvy d2nvye1 E:2-27,77-83,136-143
1twh d1twhe1 E:2-27,77-83,136-143
272. c.1.26 Homocysteine S-methyltransferase
TIM beta/alpha-barrel contains parallel beta-sheet barrel, closed; n=8, S=8; strand order 12345678 ! the first seven superfamilies have similar phosphate-binding sites
1q8j d1q8jb2 B:42-57,267-274,276-288
1q8a d1q8ab2 B:42-57,267-274,276-288
3bof d3bofb2 B:42-57,267-274,276-288
3bol d3bolb2 B:42-57,267-274,276-288
3bof d3bofa2 A:42-57,267-274,276-288
1q8a d1q8aa2 A:42-57,267-274,276-288
1q8j d1q8ja2 A:42-57,267-274,276-288
3bol d3bola2 A:42-57,267-274,276-288
1q7q d1q7qa2 A:42-57,267-274,276-288
1lt8 d1lt8a_ A:52-67,294-301,303-315
1lt7 d1lt7a_ A:52-67,294-301,303-315
1q85 d1q85a2 A:42-57,267-274,276-288
1q85 d1q85b2 B:42-57,267-274,276-288
1q7q d1q7qb2 B:42-57,267-274,276-288
1q7z d1q7zb2 B:42-57,267-274,276-288
1q7z d1q7za2 A:42-57,267-274,276-288
1lt8 d1lt8a_ A:52-67,69-73,303-315
1lt8 d1lt8b_ B:52-67,69-73,303-315
1q7m d1q7mb2 B:42-57,267-274,276-288
1q7m d1q7ma2 A:42-57,267-274,276-288
1lt8 d1lt8b_ B:52-67,294-299,303-315
1umy d1umyb_ B:52-67,294-301,303-319
1umy d1umya_ A:52-67,294-301,303-319
1umy d1umyc_ C:52-67,294-301,303-319
1umy d1umyd_ D:52-67,294-301,303-319
1q85 d1q85b2 B:42-57,59-67,276-288
1lt7 d1lt7b_ B:52-67,294-299,303-315
1q7q d1q7qb2 B:42-57,59-67,276-288
1q8j d1q8jb2 B:42-57,59-67,276-288
1q7z d1q7za2 A:42-57,59-67,276-288
1q85 d1q85a2 A:42-57,59-67,276-288
1q7m d1q7ma2 A:42-57,59-67,276-288
1q8a d1q8ab2 B:42-57,59-67,276-288
3bol d3bolb2 B:42-57,59-67,276-288
3bof d3bofb2 B:42-57,59-67,276-288
3bol d3bola2 A:42-57,59-67,276-288
1q8j d1q8ja2 A:42-57,59-67,276-288
1q7z d1q7zb2 B:42-57,59-67,276-288
1q7q d1q7qa2 A:42-57,59-67,276-288
1q8a d1q8aa2 A:42-57,59-67,276-288
3bof d3bofa2 A:42-57,59-67,276-288
1q7m d1q7mb2 B:42-57,59-67,276-288
1lt7 d1lt7b_ B:52-67,69-74,303-315
1lt7 d1lt7a_ A:52-67,69-74,303-315
1umy d1umyc_ C:52-67,69-73,303-319
1umy d1umyb_ B:52-67,69-73,303-319
1umy d1umya_ A:52-67,69-73,303-319
1umy d1umyd_ D:52-67,69-73,303-319
273. d.248.1 Coproporphyrinogen III oxidase
Coproporphyrinogen III oxidase alpha-beta(6)-alpha(2)-beta-alpha(n); 3 layers alpha/beta/alpha; antiparallel sheet: order 1234567
1tk1 d1tk1a_ A:11-36,128-140,220-249
3dwr d3dwrb1 B:1-28,104-116,195-224
3dwr d3dwra1 A:1-28,104-117,195-224
3dws d3dwsa1 A:1-28,104-117,195-224
1vju d1vjua_ A:9-36,112-125,203-232
2qt8 d2qt8a1 A:1-28,104-117,195-224
1tlb d1tlbu_ U:9-36,128-142,220-249
1tkl d1tkla_ A:11-36,128-142,220-249
3dws d3dwsb1 B:-2-28,104-117,195-224
1txn d1txna_ A:11-36,128-142,220-249
1txn d1txnb_ B:11-36,128-142,220-249
1tkl d1tklb_ B:11-36,128-142,220-249
1vju d1vjub_ B:6-36,112-125,203-232
2qt8 d2qt8b1 B:-2-28,104-117,195-224
1tlb d1tlbq_ Q:6-36,128-142,220-249
1tlb d1tlbd_ D:6-36,128-142,220-249
1tlb d1tlbw_ W:6-36,128-142,220-249
1tlb d1tlbs_ S:6-36,128-142,220-249
1tlb d1tlba_ A:6-36,128-142,220-249
274. d.125.1 Ornithine decarboxylase C-terminal domain
Ornithine decarboxylase C-terminal domain complex alpha+beta motif
1c4k d1c4ka3 A:627-638,639-645,718-726
275. d.282.1 SSo0622-like the dimer, formed in the crystals, is a probable biological unit !
SSo0622-like alpha(2)-beta(2)-alpha-beta-alpha-beta(2)-alpha; 2 layers: a/b; antiparallel beta-sheet: order 21354; strands 1,3 and 5 and the C-terminal helix are longer than other secondary structures
1tlj d1tljb_ B:27-42,43-52,162-192
1tlj d1tlja_ A:27-42,43-52,162-192
276. c.142.1 Nqo1 FMN-binding domain-like
Nqo1 FMN-binding domain-like 3 layers, a/b/a; parallel beta-sheet of 4 strands, order 3214
2fug d2fugj2 J:110-126,128-136,220-234
2fug d2fug12 1:110-126,128-136,220-234
2fug d2fugs2 S:110-126,128-136,220-234
2fug d2fuga2 A:110-126,128-136,220-234
2fug d2fugj2 J:101-111,128-136,220-234
2fug d2fugs2 S:101-111,128-136,220-234
2fug d2fug12 1:101-111,128-136,220-234
2fug d2fuga2 A:101-111,128-136,220-234
277. d.126.1 Pentein
Pentein, beta/alpha-propeller duplication: composed of 5 alpha-beta(2)-alpha-beta units arranged around pseudo fivefold axis
2q3u d2q3ub1 B:285-293,303-307,353-361
1vkp d1vkpa_ A:285-293,303-307,353-361
1vkp d1vkpb_ B:285-293,303-307,353-361
278. e.60.1 Thermophilic metalloprotease-like
Thermophilic metalloprotease-like consists of two domains; d1: alpha/beta (3 layers, a/b/a; parralel beta-sheet, order 2134); d2: pseudo beta-barrel capped by helices
1zjc d1zjca1 A:3-21,143-149,163-180
2ayi d2ayic1 C:3-21,141-147,161-177
2ayi d2ayia1 A:3-21,141-147,161-177
2ayi d2ayib1 B:3-21,141-147,161-177
2ayi d2ayid1 D:3-21,141-147,161-177
2ayi d2ayie1 E:3-21,141-147,161-177
279. c.1.3 Thiamin phosphate synthase
TIM beta/alpha-barrel contains parallel beta-sheet barrel, closed; n=8, S=8; strand order 12345678 ! the first seven superfamilies have similar phosphate-binding sites
1xi3 d1xi3b_ B:19-31,177-182,190-207
1xi3 d1xi3a_ A:19-31,177-182,190-207
1xi3 d1xi3a_ A:19-31,33-38,190-207
1xi3 d1xi3b_ B:19-31,33-38,190-207
1g4p d1g4pa_ A:40-52,203-208,216-234
1g6c d1g6cb_ B:1040-1052,1203-1208,1216-1234
1g4e d1g4eb_ B:1040-1052,1203-1208,1216-1234
1g4p d1g4pb_ B:1040-1052,1203-1208,1216-1234
2tps d2tpsb_ B:40-52,203-208,216-234
1g4t d1g4tb_ B:1040-1052,1203-1208,1216-1235
1g4e d1g4ea_ A:40-52,203-208,216-235
1g67 d1g67b_ B:1040-1052,1203-1208,1216-1235
1g4s d1g4sb_ B:1040-1052,1203-1208,1216-1235
1g6c d1g6ca_ A:40-52,203-208,216-235
1g4s d1g4sa_ A:40-52,203-208,216-235
1g4t d1g4ta_ A:40-52,203-208,216-235
1g69 d1g69b_ B:1040-1052,1203-1208,1216-1235
1g69 d1g69a_ A:40-52,203-208,216-235
1g67 d1g67a_ A:40-52,203-208,216-235
2tps d2tpsa_ A:40-52,203-208,216-235
1g4p d1g4pb_ B:1040-1052,1054-1060,1216-1234
1g4e d1g4eb_ B:1040-1052,1054-1060,1216-1234
1g4p d1g4pa_ A:40-52,54-60,216-234
1g6c d1g6cb_ B:1040-1052,1054-1060,1216-1234
1g4t d1g4tb_ B:1040-1052,1054-1060,1216-1235
2tps d2tpsb_ B:40-52,54-60,216-234
1g4s d1g4sb_ B:1040-1052,1054-1060,1216-1235
1g67 d1g67b_ B:1040-1052,1054-1060,1216-1235
1g4s d1g4sa_ A:40-52,54-60,216-235
1g69 d1g69a_ A:40-52,54-60,216-235
1g69 d1g69b_ B:1040-1052,1054-1060,1216-1235
1g4e d1g4ea_ A:40-52,54-60,216-235
1g6c d1g6ca_ A:40-52,54-60,216-235
1g67 d1g67a_ A:40-52,54-60,216-235
1g4t d1g4ta_ A:40-52,54-60,216-235
2tps d2tpsa_ A:40-52,54-60,216-235
280. e.55.1 Rap/Ran-GAP
Rap/Ran-GAP consists of two domains; d1: alpha+beta (78-190; alpha-beta(4)-alpha-beta-alpha; 3 layers; antiparallel beta-sheet of 5 strands; order 51234); d2: alpha/beta similar to the G-domain fold (191-381; scop_fa 52592)
1srq d1srqa_ A:217-228,292-299,358-379
1srq d1srqb_ B:217-228,315-322,357-379
1srq d1srqa_ A:217-228,315-324,358-379
281. e.38.1 Release factor
Release factor 4 domains: (1) 3-helical bundle; (2) alpha+beta of ferredoxin-like fold (3 and 4) alpha+beta of dsRDB-like fold
1rq0 d1rq0a_ A:97-120,283-289,304-311
1gqe d1gqea_ A:137-160,323-329,344-351
1rq0 d1rq0c_ C:897-920,1083-1089,1104-1111
2fvo d2fvoa1 A:97-120,283-289,304-311
1rq0 d1rq0b_ B:497-520,683-689,704-711
282. e.13.1 DNA primase core
DNA primase core 2 domains: (1) alpha+beta; (2) toprim alpha/beta
1eqn d1eqne_ E:266-277,302-309,345-354
1eqn d1eqne_ E:266-277,280-284,345-354
1eqn d1eqnd_ D:266-277,302-309,345-354
1eqn d1eqnb_ B:266-277,302-309,345-354
1eqn d1eqnc_ C:266-277,280-284,345-354
1eqn d1eqnd_ D:266-277,280-284,345-354
1eqn d1eqna_ A:266-277,302-309,345-354
1eqn d1eqna_ A:266-277,280-284,345-354
1eqn d1eqnc_ C:266-277,302-309,345-354
1dde d1ddea_ A:266-277,280-284,345-354
1dde d1ddea_ A:266-277,302-310,345-354
1eqn d1eqnb_ B:266-277,280-285,345-354
1dd9 d1dd9a_ A:266-277,280-284,345-354
283. d.20.1 UBC-like
UBC-like alpha-beta(4)-alpha(3); core: meander beta-sheet plus one helix 2
1i7k d1i7ka_ A:30-46,49-55,127-142
2f0r d2f0ra1 A:17-33,71-76,123-139
1i7k d1i7kb_ B:30-46,49-55,127-142
1kpp d1kppa_ A:17-33,65-76,123-139
1y6l d1y6lb_ B:0-17,20-26,98-113
1y6l d1y6la_ A:0-17,20-26,98-113
1y6l d1y6lc_ C:0-17,20-26,98-113
1yrv d1yrva1 A:3-20,23-29,104-119
1fzy d1fzya_ A:2-18,21-27,101-116
1zdn d1zdnb1 B:10-27,30-35,108-123
2aak d2aaka_ A:3-20,23-29,101-116
2c4o d2c4ob1 B:-2-17,20-26,98-113
1zdn d1zdna1 A:9-27,30-35,108-123
2eso d2esoa1 A:-1-17,20-26,98-113
2c4o d2c4od1 D:-2-17,20-26,98-113
2esq d2esqa1 A:-1-17,20-26,98-113
2clw d2clwa1 A:-1-17,20-26,98-113
2clw d2clwb1 B:-1-17,20-26,98-113
2c4o d2c4oc1 C:-1-17,20-26,98-113
2px9 d2px9b1 B:1-20,23-29,108-123
1x23 d1x23a1 A:-4-17,20-26,98-113
1jbb d1jbba_ A:5-19,22-28,100-115
1jbb d1jbbb_ B:5-19,22-28,100-115
1q34 d1q34a_ A:3-20,23-29,101-116
1jat d1jata_ A:5-19,22-28,100-115
1q34 d1q34b_ B:3-20,23-29,101-116
2ayv d2ayva1 A:-1-17,20-26,98-113
2clw d2clwc1 C:-2-17,20-26,98-113
1q34 d1q34c_ C:3-20,23-29,101-116
2clw d2clwd1 D:-2-17,20-26,98-113
2esk d2eska1 A:-1-17,20-26,98-113
2esp d2espa1 A:-1-17,20-26,98-113
1kps d1kpsa_ A:1-20,24-29,108-123
1a3s d1a3sa_ A:1-20,24-29,108-123
2c4o d2c4oa1 A:-1-17,21-26,98-113
2c2v d2c2ve1 E:9-23,26-32,104-119
2ucz d2ucza_ A:2-20,23-28,115-130
2c2v d2c2vk1 K:9-23,26-32,104-119
1u9a d1u9aa_ A:0-20,24-29,108-123
1u9b d1u9ba_ A:0-20,24-29,108-123
1ur6 d1ur6a_ A:1-17,20-27,98-113
2c2v d2c2vh1 H:9-23,26-32,104-119
2c2v d2c2vb1 B:9-23,26-32,104-119
1x23 d1x23d1 D:-4-17,20-26,98-113
1x23 d1x23b1 B:-4-17,20-26,98-113
1j7d d1j7db_ B:5-19,22-28,100-115
1fxt d1fxta_ A:2-18,21-27,101-116
2gmi d2gmia1 A:5-19,22-28,100-115
2awf d2awfa1 A:4-21,24-30,116-131
1yh2 d1yh2a1 A:0-18,21-27,103-118
1fzy d1fzyb_ B:2-18,22-27,101-116
2grn d2grna1 A:2-20,24-29,108-123
2bf8 d2bf8a1 A:2-19,26-32,105-120
1kps d1kpsc_ C:3-20,24-29,108-123
1x23 d1x23c1 C:-4-17,20-26,98-113
2o25 d2o25b2 B:3-19,26-32,105-120
2o25 d2o25a2 A:2-19,26-32,105-120
2o25 d2o25d1 D:2-20,24-29,108-123
2pe6 d2pe6a1 A:2-20,24-29,108-123
2bep d2bepa1 A:2-19,26-32,105-120
2c2v d2c2vc1 C:39-55,59-65,143-157
2vrr d2vrra1 A:2-20,24-29,108-123
1yla d1ylab2 B:2-19,26-33,105-120
1yla d1ylaa2 A:2-19,26-33,105-120
2o25 d2o25c1 C:2-20,24-29,108-123
2uyz d2uyza1 A:3-20,24-29,108-123
3e46 d3e46a2 A:2-19,26-33,105-120
1j7d d1j7db_ B:5-19,50-58,100-115
1zuo d1zuoa1 A:202-219,226-232,318-334
284. a.3.1 Cytochrome c covalently-bound heme completes the core !
Cytochrome c core: 3 helices; folded leaf, opened
1h31 d1h31e1 E:21-29,29-33,176-185
1h31 d1h31g1 G:21-29,29-33,176-185
1h31 d1h31a1 A:21-29,29-33,176-185
1h31 d1h31c1 C:21-29,29-33,176-185
1h32 d1h32a1 A:21-29,29-33,176-185
2oz1 d2oz1e1 E:21-29,29-33,176-185
1h33 d1h33a1 A:21-29,29-33,176-185
2oz1 d2oz1c1 C:21-29,29-33,176-185
2oz1 d2oz1a1 A:21-28,29-33,176-185
285. d.110.2 GAF domain-like alpha(2)-beta(3)-alpha-beta(3)-alpha; antiparallel beta-sheet: order 321654 !
Profilin-like core: 2 alpha-helices and 5-stranded antiparallel sheet: order 21543; 3 layers: alpha/beta/alpha
1tf1 d1tf1b_ B:103-118,119-124,158-183
1tf1 d1tf1c_ C:103-118,119-124,158-183
2o9a d2o9ab1 B:99-114,115-120,154-179
2o99 d2o99b1 B:99-114,115-120,154-179
1td5 d1td5c_ C:99-114,115-120,154-179
1td5 d1td5d_ D:99-114,115-120,154-179
2o99 d2o99d1 D:99-114,115-120,154-180
2o9a d2o9ad1 D:99-114,115-120,154-180
1tf1 d1tf1d_ D:103-118,119-124,158-182
1tf1 d1tf1a_ A:103-118,119-124,158-183
2o9a d2o9aa1 A:99-114,115-120,154-180
2o99 d2o99a1 A:99-114,115-120,154-180
1td5 d1td5b_ B:99-114,115-120,154-179
2o99 d2o99c1 C:99-114,115-120,154-182
2o9a d2o9ac1 C:99-114,115-120,154-182
1td5 d1td5a_ A:99-114,115-120,154-179
1mkm d1mkmb2 B:167-182,183-188,222-245
1mkm d1mkma2 A:167-182,183-188,222-245
1stz d1stza2 A:80-99,271-276,313-336
1stz d1stzc2 C:80-95,271-275,313-336
1stz d1stzb2 B:80-95,271-275,313-336
286. d.50.2 Porphobilinogen deaminase (hydroxymethylbilane synthase), C-terminal domain
dsRBD-like alpha-beta(3)-alpha; 2 layers: alpha/beta
1gtk d1gtka2 A:221-239,245-254,282-298
1ah5 d1ah5a2 A:221-239,245-254,282-298
1pda d1pdaa2 A:221-239,245-254,282-298
2ypn d2ypna2 A:221-239,245-254,282-298
1ypn d1ypna2 A:221-239,245-254,282-298
1gtk d1gtka2 A:221-239,270-279,282-298
1ah5 d1ah5a2 A:221-239,270-279,282-298
2ypn d2ypna2 A:221-239,270-279,282-298
1pda d1pdaa2 A:221-239,270-279,282-298
1ypn d1ypna2 A:221-239,270-279,282-298
287. c.136.1 Toprim domain this domain is also present in several multidomain proteins that are not split in scop yet:
Toprim domain 3 layers, a/b/a; parallel beta-sheet of 4 strands, order 2134
2i5r d2i5rc1 C:12-23,51-57,93-105
2fcj d2fcjc1 C:12-23,51-57,93-105
2i5r d2i5ra1 A:12-23,51-56,93-105
2i5r d2i5rb1 B:12-23,51-56,93-105
2fcj d2fcja1 A:12-23,51-56,93-105
2fcj d2fcjb1 B:12-23,51-56,93-105
288. d.130.1 S-adenosylmethionine synthetase
S-adenosylmethionine synthetase duplication: consists of 3 similar intertwined domains ! structural repeat: beta-alpha-beta(2)-alpha-beta; two layers, alpha/beta
1xrc d1xrca3 A:269-289,292-303,336-345
289. c.1.30 CutC-like
TIM beta/alpha-barrel contains parallel beta-sheet barrel, closed; n=8, S=8; strand order 12345678 ! the first seven superfamilies have similar phosphate-binding sites
1twd d1twda_ A:10-21,193-198,231-248
1x7i d1x7ia1 A:10-21,193-198,231-248
1x8c d1x8ca1 A:10-21,193-198,231-248
1twd d1twdb_ B:10-21,23-28,231-249
1twd d1twda_ A:10-21,23-28,231-248
1twd d1twdb_ B:10-21,193-198,231-249
1x8c d1x8ca1 A:10-21,23-28,231-248
1x7i d1x7ia1 A:10-21,23-28,231-248
1x8c d1x8cb1 B:10-21,23-28,231-250
1x8c d1x8cb1 B:10-21,193-198,231-250
1x7i d1x7ib1 B:10-21,23-28,231-250
1x7i d1x7ib1 B:10-21,193-198,231-250
1twd d1twda_ A:10-21,199-204,231-248
1x8c d1x8ca1 A:10-21,199-205,231-248
1x7i d1x7ia1 A:10-21,199-205,231-248
1twd d1twdb_ B:10-21,199-205,231-249
1x8c d1x8cb1 B:10-21,199-205,231-250
1x7i d1x7ib1 B:10-21,199-205,231-250
290. e.42.1 L-A virus major coat protein
L-A virus major coat protein large protein without apparent domain division
1m1c d1m1ca_ A:285-302,317-324,401-415
291. c.39.1 Nicotinate mononucleotide:5,6-dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase (CobT)
Nicotinate mononucleotide:5,6-dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase (CobT) 3 layers: a/b/a, parallel beta-sheet of 7 strands, order 3214567
1jhp d1jhpa_ A:97-107,168-176,318-338
1jhu d1jhua_ A:97-107,168-176,318-338
1jhm d1jhma_ A:97-107,168-176,318-338
1l5f d1l5fa_ A:97-107,168-176,318-338
1d0s d1d0sa_ A:97-107,168-176,318-338
1l5n d1l5na_ A:97-107,168-176,318-338
1l4b d1l4ba_ A:97-107,168-176,318-338
1l4k d1l4ka_ A:97-107,168-176,318-338
1l5o d1l5oa_ A:97-107,168-176,318-338
1jha d1jhaa_ A:97-107,168-176,318-338
1l4f d1l4fa_ A:97-107,168-176,318-338
1l4g d1l4ga_ A:97-107,168-176,318-338
1jhv d1jhva_ A:97-107,168-176,318-338
1jh8 d1jh8a_ A:97-107,168-176,318-338
1jhx d1jhxa_ A:97-107,168-176,318-338
1l4m d1l4ma_ A:97-107,168-176,318-338
1jhr d1jhra_ A:97-107,168-176,318-338
1jhy d1jhya_ A:97-107,168-176,318-338
1l4e d1l4ea_ A:97-107,168-176,318-338
1l4l d1l4la_ A:97-107,168-176,318-338
1l4n d1l4na_ A:97-107,168-176,318-338
1l5k d1l5ka_ A:97-107,168-176,318-338
1l4h d1l4ha_ A:97-107,168-176,318-338
1jhq d1jhqa_ A:97-107,168-176,318-338
1l5m d1l5ma_ A:97-107,168-176,318-338
1d0v d1d0va_ A:97-107,168-176,318-338
1l5l d1l5la_ A:97-107,168-176,318-338
1jho d1jhoa_ A:97-107,168-176,318-338
1j33 d1j33a_ A:83-93,156-164,305-325
1jhp d1jhpa_ A:97-107,108-117,318-338
1jhu d1jhua_ A:97-107,108-117,318-338
1l4g d1l4ga_ A:97-107,108-117,318-338
1l5o d1l5oa_ A:97-107,108-117,318-338
1jhv d1jhva_ A:97-107,108-117,318-338
1jh8 d1jh8a_ A:97-107,108-117,318-338
1l5n d1l5na_ A:97-107,108-117,318-338
1l4f d1l4fa_ A:97-107,108-117,318-338
1jha d1jhaa_ A:97-107,108-117,318-338
1jhm d1jhma_ A:97-107,108-117,318-338
1d0v d1d0va_ A:97-107,108-117,318-338
1d0s d1d0sa_ A:97-107,108-117,318-338
1l4m d1l4ma_ A:97-107,108-117,318-338
1l4h d1l4ha_ A:97-107,108-117,318-338
1jhx d1jhxa_ A:97-107,108-117,318-338
1l4k d1l4ka_ A:97-107,108-117,318-338
1jhy d1jhya_ A:97-107,108-117,318-338
1l5m d1l5ma_ A:97-107,108-117,318-338
1l4b d1l4ba_ A:97-107,108-117,318-338
1l5f d1l5fa_ A:97-107,108-117,318-338
1l5k d1l5ka_ A:97-107,108-117,318-338
1l4l d1l4la_ A:97-107,108-117,318-338
1l4n d1l4na_ A:97-107,108-117,318-338
1jhq d1jhqa_ A:97-107,108-117,318-338
1l4e d1l4ea_ A:97-107,108-117,318-338
1jhr d1jhra_ A:97-107,108-117,318-338
1l5l d1l5la_ A:97-107,108-117,318-338
1jho d1jhoa_ A:97-107,108-117,318-338
1j33 d1j33a_ A:83-93,93-102,305-325
292. d.258.1 Chorismate synthase, AroC
Chorismate synthase, AroC duplication: consists of two DCoH-like beta(2)-alpha-beta(2)-alpha structural repeats; 3 layers, beta/alpha/beta
1q1l d1q1la_ A:135-157,158-168,351-377
1q1l d1q1ld_ D:135-157,158-168,351-377
1q1l d1q1lb_ B:135-157,158-168,351-377
1qxo d1qxob_ B:132-154,155-165,342-367
1qxo d1qxoa_ A:132-154,155-165,342-367
1qxo d1qxod_ D:132-154,155-165,342-367
1qxo d1qxoc_ C:132-154,155-165,342-367
1um0 d1um0b_ B:122-147,147-158,326-355
1um0 d1um0a_ A:122-147,147-158,326-355
1umf d1umfc_ C:123-147,147-158,326-355
1umf d1umfa_ A:123-147,147-158,326-355
1umf d1umfb_ B:122-147,147-158,326-355
1um0 d1um0c_ C:123-147,147-158,326-355
1umf d1umfd_ D:124-147,147-158,326-355
1q1l d1q1lc_ C:135-157,158-168,353-377
1um0 d1um0d_ D:124-147,147-158,326-355
1r52 d1r52b_ B:128-148,149-159,341-369
1r52 d1r52d_ D:128-148,149-159,341-369
1r52 d1r52a_ A:128-148,149-159,341-369
1r52 d1r52c_ C:128-148,149-159,341-369
1r53 d1r53a_ A:128-148,149-159,341-371
1sq1 d1sq1a_ A:126-146,147-157,323-352
293. c.1.24 Pyridoxine 5'-phosphate synthase
TIM beta/alpha-barrel contains parallel beta-sheet barrel, closed; n=8, S=8; strand order 12345678 ! the first seven superfamilies have similar phosphate-binding sites
1ixq d1ixqb_ B:26-38,210-215,226-243
1m5w d1m5wc_ C:26-38,209-215,226-243
1ho4 d1ho4a_ A:26-38,210-215,226-243
1ixo d1ixod_ D:26-38,209-215,226-243
1m5w d1m5we_ E:26-38,209-215,226-243
1m5w d1m5wf_ F:26-38,210-215,226-243
1m5w d1m5wa_ A:26-38,210-215,226-243
1m5w d1m5wh_ H:26-38,209-215,226-243
1ixp d1ixpb_ B:26-38,210-215,226-243
1m5w d1m5wg_ G:26-38,209-215,226-243
1ho1 d1ho1d_ D:26-38,210-215,226-243
1ixp d1ixpd_ D:26-38,210-215,226-243
1m5w d1m5wb_ B:26-38,40-46,226-243
1m5w d1m5we_ E:26-38,40-46,226-243
1m5w d1m5wd_ D:26-38,40-46,226-243
1ixp d1ixpb_ B:26-38,40-46,226-243
1m5w d1m5wc_ C:26-38,40-46,226-243
1ixn d1ixnb_ B:26-38,40-46,226-243
1m5w d1m5wh_ H:26-38,40-46,226-243
1ixo d1ixod_ D:26-38,40-46,226-243
1ho4 d1ho4b_ B:26-38,40-46,226-243
1m5w d1m5wg_ G:26-38,40-46,226-243
1ho1 d1ho1d_ D:26-38,40-46,226-243
1m5w d1m5wf_ F:26-38,40-46,226-243
1ho4 d1ho4a_ A:26-38,40-46,226-243
1ixn d1ixnc_ C:26-38,40-46,226-243
1ho4 d1ho4d_ D:26-38,40-46,226-243
1ixo d1ixoa_ A:26-38,40-46,226-243
1ho1 d1ho1c_ C:26-38,40-46,226-243
1m5w d1m5wa_ A:26-38,40-46,226-243
1ixo d1ixob_ B:26-38,40-46,226-243
1ixn d1ixnd_ D:26-38,40-46,226-243
1ixp d1ixpc_ C:26-38,40-46,226-243
1ixq d1ixqa_ A:26-38,40-46,226-243
1ho1 d1ho1b_ B:26-38,40-46,226-243
1ixq d1ixqb_ B:26-38,40-46,226-243
1ho4 d1ho4c_ C:26-38,40-46,226-243
1ixp d1ixpd_ D:26-38,40-46,226-243
1ixn d1ixna_ A:26-38,40-46,226-243
1ixp d1ixpa_ A:26-38,40-46,226-243
1ixq d1ixqd_ D:26-38,40-46,226-243
1ho1 d1ho1a_ A:26-38,40-46,226-243
1ixo d1ixoc_ C:26-38,40-46,226-243
1ixq d1ixqc_ C:26-38,40-46,226-243
294. i.15.1 Muscle protein complexes
Muscle protein complexes
1o1b d1o1b9_ 9:136-146,297-302,337-349
1o1b d1o1b0_ 0:136-146,297-302,337-349
1o1b d1o1bw_ W:136-146,297-302,337-349
1o1e d1o1ex_ X:136-146,297-302,337-349
1o1b d1o1bx_ X:136-146,297-302,337-349
1o1b d1o1by_ Y:136-146,297-302,337-349
1o1b d1o1bz_ Z:136-146,297-302,337-349
1o1b d1o1bv_ V:136-146,297-302,337-349
1o1e d1o1e7_ 7:136-146,297-302,337-349
1o1b d1o1b4_ 4:136-146,297-302,337-349
1o1b d1o1b7_ 7:136-146,297-302,337-349
1o1b d1o1b1_ 1:136-146,297-302,337-349
1o1b d1o1b2_ 2:136-146,297-302,337-349
1o1e d1o1ey_ Y:136-146,297-302,337-349
1o1b d1o1b3_ 3:136-146,297-302,337-349
1o1e d1o1ew_ W:136-146,297-302,337-349
1o1e d1o1e8_ 8:136-146,297-302,337-349
1o1c d1o1c0_ 0:136-146,297-302,337-349
1mvw d1mvw3_ 3:136-146,297-302,337-349
1o1e d1o1e1_ 1:136-146,297-302,337-349
1o1c d1o1cv_ V:136-146,297-302,337-349
1o1e d1o1e6_ 6:136-146,297-302,337-349
1o1d d1o1d9_ 9:136-146,297-302,337-349
1mvw d1mvw2_ 2:136-146,297-302,337-349
1o1e d1o1ev_ V:136-146,297-302,337-349
1o1e d1o1e5_ 5:136-146,297-302,337-349
1o1b d1o1b5_ 5:136-146,297-302,337-349
1o1c d1o1c3_ 3:136-146,297-302,337-349
1o1e d1o1e3_ 3:136-146,297-302,337-349
1o1e d1o1ez_ Z:136-146,297-302,337-349
1o1e d1o1e4_ 4:136-146,297-302,337-349
1o1e d1o1e9_ 9:136-146,297-302,337-349
1mvw d1mvww_ W:136-146,297-302,337-349
1o1e d1o1e2_ 2:136-146,297-302,337-349
1o1b d1o1b8_ 8:136-146,297-302,337-349
1mvw d1mvwy_ Y:136-146,297-302,337-349
1o1c d1o1cy_ Y:136-146,297-302,337-349
1mvw d1mvw1_ 1:136-146,297-302,337-349
1o1c d1o1c4_ 4:136-146,297-302,337-349
1o1f d1o1f3_ 3:136-146,297-302,337-349
1o19 d1o191_ 1:136-146,297-302,337-349
1o1f d1o1f5_ 5:136-146,297-302,337-349
1mvw d1mvwz_ Z:136-146,297-302,337-349
1mvw d1mvw8_ 8:136-146,297-302,337-349
1mvw d1mvw7_ 7:136-146,297-302,337-349
1o1c d1o1c7_ 7:136-146,297-302,337-349
1o1d d1o1d8_ 8:136-146,297-302,337-349
1o1f d1o1fz_ Z:136-146,297-302,337-349
1mvw d1mvwx_ X:136-146,297-302,337-349
1mvw d1mvwv_ V:136-146,297-302,337-349
1o1c d1o1c9_ 9:136-146,297-302,337-349
1o1d d1o1dv_ V:136-146,297-302,337-349
1o1f d1o1f6_ 6:136-146,297-302,337-349
1o1d d1o1d5_ 5:136-146,297-302,337-349
1o19 d1o19w_ W:136-146,297-302,337-349
1o1f d1o1f1_ 1:136-146,297-302,337-349
1mvw d1mvw5_ 5:136-146,297-302,337-349
1o1c d1o1cx_ X:136-146,297-302,337-349
1o1d d1o1d1_ 1:136-146,297-302,337-349
1o1c d1o1c1_ 1:136-146,297-302,337-349
1o1d d1o1dx_ X:136-146,297-302,337-349
1o1d d1o1d4_ 4:136-146,297-302,337-349
1o1f d1o1f8_ 8:136-146,297-302,337-349
1o1c d1o1c5_ 5:136-146,297-302,337-349
1o1d d1o1d7_ 7:136-146,297-302,337-349
1o19 d1o192_ 2:136-146,297-302,337-349
1mvw d1mvw9_ 9:136-146,297-302,337-349
1o19 d1o19v_ V:136-146,297-302,337-349
1o1f d1o1f0_ 0:136-146,297-302,337-349
1o1d d1o1d3_ 3:136-146,297-302,337-349
1o1g d1o1gx_ X:136-146,297-302,337-349
1mvw d1mvw4_ 4:136-146,297-302,337-349
1m8q d1m8qx_ X:136-146,297-302,337-349
1o1d d1o1d0_ 0:136-146,297-302,337-349
1o1d d1o1dy_ Y:136-146,297-302,337-349
1o1d d1o1dw_ W:136-146,297-302,337-349
1mvw d1mvw6_ 6:136-146,297-302,337-349
1o1c d1o1cz_ Z:136-146,297-302,337-349
1o1c d1o1cw_ W:136-146,297-302,337-349
1o1c d1o1c2_ 2:136-146,297-302,337-349
1o1c d1o1c8_ 8:136-146,297-302,337-349
1o19 d1o19z_ Z:136-146,297-302,337-349
1o1f d1o1fy_ Y:136-146,297-302,337-349
1m8q d1m8q9_ 9:136-146,297-302,337-349
1o1d d1o1d2_ 2:136-146,297-302,337-349
1m8q d1m8qz_ Z:136-146,297-302,337-349
1o1f d1o1fx_ X:136-146,297-302,337-349
1o1a d1o1a4_ 4:136-146,297-302,337-349
1o19 d1o196_ 6:136-146,297-302,337-349
1o19 d1o19y_ Y:136-146,297-302,337-349
1o1f d1o1fw_ W:136-146,297-302,337-349
1o1d d1o1dz_ Z:136-146,297-302,337-349
1o1g d1o1g8_ 8:136-146,297-302,337-349
1o1a d1o1a2_ 2:136-146,297-302,337-349
1m8q d1m8q7_ 7:136-146,297-302,337-349
1o1g d1o1g4_ 4:136-146,297-302,337-349
1m8q d1m8qv_ V:136-146,297-302,337-349
1m8q d1m8q0_ 0:136-146,297-302,337-349
1o1f d1o1fv_ V:136-146,297-302,337-349
1o1f d1o1f7_ 7:136-146,297-302,337-349
1o19 d1o198_ 8:136-146,297-302,337-349
1o19 d1o199_ 9:136-146,297-302,337-349
1o1g d1o1gz_ Z:136-146,297-302,337-349
1o1g d1o1g2_ 2:136-146,297-302,337-349
1o19 d1o197_ 7:136-146,297-302,337-349
1o1g d1o1g1_ 1:136-146,297-302,337-349
1m8q d1m8q2_ 2:136-146,297-302,337-349
1o1g d1o1gw_ W:136-146,297-302,337-349
1o18 d1o186_ 6:136-146,297-302,337-349
1o19 d1o19x_ X:136-146,297-302,337-349
1m8q d1m8q8_ 8:136-146,297-302,337-349
1o1a d1o1a9_ 9:136-146,297-302,337-349
1o18 d1o18y_ Y:136-146,297-302,337-349
1o1f d1o1f2_ 2:136-146,297-302,337-349
1o18 d1o183_ 3:136-146,297-302,337-349
1m8q d1m8q5_ 5:136-146,297-302,337-349
1o18 d1o18v_ V:136-146,297-302,337-349
1o1g d1o1g3_ 3:136-146,297-302,337-349
1o18 d1o185_ 5:136-146,297-302,337-349
1o19 d1o194_ 4:136-146,297-302,337-349
1o18 d1o189_ 9:136-146,297-302,337-349
1o1g d1o1gy_ Y:136-146,297-302,337-349
1o18 d1o181_ 1:136-146,297-302,337-349
1o1f d1o1f4_ 4:136-146,297-302,337-349
1m8q d1m8q3_ 3:136-146,297-302,337-349
1o1g d1o1g5_ 5:136-146,297-302,337-349
1m8q d1m8qy_ Y:136-146,297-302,337-349
1o1g d1o1gv_ V:136-146,297-302,337-349
1o1a d1o1a6_ 6:136-146,297-302,337-349
1m8q d1m8q4_ 4:136-146,297-302,337-349
1o1a d1o1az_ Z:136-146,297-302,337-349
1m8q d1m8qw_ W:136-146,297-302,337-349
1o1g d1o1g9_ 9:136-146,297-302,337-349
1o18 d1o18w_ W:136-146,297-302,337-349
1o19 d1o193_ 3:136-146,297-302,337-349
1o1a d1o1av_ V:136-146,297-302,337-349
1m8q d1m8q1_ 1:136-146,297-302,337-349
1o1g d1o1g7_ 7:136-146,297-302,337-349
1o18 d1o182_ 2:136-146,297-302,337-349
1o18 d1o184_ 4:136-146,297-302,337-349
1o1a d1o1aw_ W:136-146,297-302,337-349
1o1a d1o1a1_ 1:136-146,297-302,337-349
1o1a d1o1ay_ Y:136-146,297-302,337-349
1o1a d1o1a7_ 7:136-146,297-302,337-349
1o18 d1o18z_ Z:136-146,297-302,337-349
1o1g d1o1g6_ 6:136-146,297-302,337-349
1o1a d1o1a8_ 8:136-146,297-302,337-349
1o18 d1o18x_ X:136-146,297-302,337-349
1o1a d1o1ax_ X:136-146,297-302,337-349
1o1a d1o1a5_ 5:136-146,297-302,337-349
1o18 d1o187_ 7:136-146,297-302,337-349
1o18 d1o188_ 8:136-146,297-302,337-349
1o19 d1o195_ 5:136-146,297-302,337-349
1o1a d1o1a3_ 3:136-146,297-302,337-349
295. d.58.1 4Fe-4S ferredoxins
Ferredoxin-like alpha+beta sandwich with antiparallel beta-sheet; (beta-alpha-beta)x2
2v4j d2v4jd1 D:247-257,294-299,307-314
2v4j d2v4ja1 A:247-257,294-299,307-314
296. a.118.8 TPR-like
alpha-alpha superhelix multihelical; 2 (curved) layers: alpha/alpha; right-handed superhelix
3ckb d3ckba1 A:78-92,93-97,492-503
3cgh d3cgha1 A:59-76,77-81,462-474
3ck8 d3ck8b1 B:78-91,93-97,492-503
3ck9 d3ck9b1 B:78-91,93-97,492-503
3ck7 d3ck7a1 A:78-91,93-97,492-503
3ck7 d3ck7b1 B:78-91,93-97,492-503
3ck7 d3ck7d1 D:78-91,93-97,492-503
3ck7 d3ck7c1 C:78-91,93-97,492-503
3ck9 d3ck9a1 A:78-91,93-97,492-503
3ckb d3ckbb1 B:78-91,93-97,492-503
3ckc d3ckcb1 B:78-91,93-97,492-503
3ckc d3ckca1 A:78-91,93-97,492-503
3ck8 d3ck8a1 A:78-91,93-97,494-503
297. d.364.1 PA1123-like
PA1123-like irregular array of short helices and two three-stranded beta-sheets
2hg6 d2hg6a1 A:5-16,53-57,65-76
298. c.1.31 ThiG-like shares the common phosphate-binding site with other superfamilies !
TIM beta/alpha-barrel contains parallel beta-sheet barrel, closed; n=8, S=8; strand order 12345678 ! the first seven superfamilies have similar phosphate-binding sites
1wv2 d1wv2b_ B:2031-2043,2211-2216,2224-2246
1wv2 d1wv2a_ A:1031-1043,1211-1216,1224-1246
1xm3 d1xm3c_ C:24-36,202-207,215-237
1xm3 d1xm3a_ A:24-36,202-207,215-237
1xm3 d1xm3d_ D:24-36,202-207,215-237
1xm3 d1xm3b_ B:24-36,202-207,215-237
1tyg d1tyga_ A:124-136,302-307,315-337
1tyg d1tygc_ C:124-136,302-307,315-337
299. c.47.2 RNA 3'-terminal phosphate cyclase, RPTC, insert domain
Thioredoxin fold core: 3 layers, a/b/a; mixed beta-sheet of 4 strands, order 4312; strand 3 is antiparallel to the rest
1qmi d1qmid1 D:202-218,245-254,259-278
1qmi d1qmia1 A:202-218,245-254,259-278
1qmi d1qmib1 B:202-218,245-254,259-278
1qmh d1qmha1 A:202-218,245-254,259-278
1qmi d1qmic1 C:202-218,245-254,259-278
1qmh d1qmhb1 B:202-218,245-254,259-278
300. d.206.1 YggU-like
YggU-like beta(2)-loop-alpha-beta(2)-alpha; 2 layers: a/b; antiparallel sheet 1243; some similarity to the Homing endonuclease-like fold
1jrm d1jrma_ A:55-65,66-72,87-100
301. d.322.1 PHP14-like
PHP14-like beta(3)-alpha-beta(2)-alpha-beta; 3 layers, a/b/a; mixed beta-sheet, half-barrel, order: 132456; strands 2 and 5 are antiparallel to the rest
2o8r d2o8rb2 B:103-112,112-116,300-308
2o8r d2o8rb2 B:103-112,201-206,300-308
302. d.224.1 SufE/NifU iron-sulfur cluster assembly proteins !
SufE/NifU alpha(2)-beta(3)-alpha(3); 2 layers alpha/beta, 3-stranded antiparallel beta-sheet; order 123
1ni7 d1ni7a_ A:29-45,75-84,85-100
1mzg d1mzgb_ B:19-35,65-74,75-90
1mzg d1mzga_ A:19-34,66-74,75-90
303. c.51.6 XCC0632-like short crossover loop between strands 2 and 3; the antiparallel part of the beta-sheet (strands 3, 4 and 5) and the C-terminal helix are quite long
Anticodon-binding domain-like 3 layers: a/b/a; mixed beta-sheet of five strands, order 21345; strand 4 is antiparallel to the rest
2iqi d2iqih1 H:90-107,122-136,176-209
2iqi d2iqid1 D:90-107,122-136,176-209
2iqi d2iqif1 F:90-107,122-136,176-209
2iqi d2iqia1 A:90-107,122-136,176-209
2iqi d2iqic1 C:90-107,122-136,176-209
2iqi d2iqig1 G:90-107,122-136,176-209
2iqi d2iqie1 E:90-107,122-136,176-209
2iqi d2iqib1 B:90-107,122-136,176-209
2i9i d2i9ia1 A:97-117,138-152,221-253
304. e.25.1 Sec1/munc18-like (SM) proteins
Sec1/munc18-like (SM) proteins 3 domains: (1 and 2) alpha+beta; (3) mostly alpha, inserted in domain 2
1mqs d1mqsa_ A:279-289,288-292,387-415
1mqs d1mqsa_ A:13-28,152-160,188-211
305. a.4.5 "Winged helix" DNA-binding domain contains a small beta-sheet (wing) !
DNA/RNA-binding 3-helical bundle core: 3-helices; bundle, closed or partly opened, right-handed twist; up-and down
1t6s d1t6sb2 B:124-133,134-142,153-161
1t6s d1t6sa2 A:124-133,134-142,153-161
1ku9 d1ku9a_ A:54-69,70-75,88-119
1sfx d1sfxb_ B:46-61,62-70,81-105
1ku9 d1ku9b_ B:1054-1069,1070-1075,1088-1119
1sfx d1sfxa_ A:46-61,62-70,81-105
306. d.139.1 PurM C-terminal domain-like
PurM C-terminal domain-like 3 layers: alpha/beta/alpha; partial topological similarity to the ferredoxin-like fold
1t3t d1t3ta7 A:707-727,823-832,859-877
307. d.283.1 Putative modulator of DNA gyrase, PmbA/TldD
Putative modulator of DNA gyrase, PmbA/TldD consists of two different alpha+beta domains; d1: [duplication of alpha-beta(3)-alpha motif; 2 layers: a/b; antiparallel beta-sheet, order: 321456; strands 1, 2, 4 and 5 are twice longer than other secondary structures]; d2 [ complex fold; contains beta-barrel (n=5, S=10)]
1vl4 d1vl4b_ B:115-134,180-191,197-213
1vl4 d1vl4a_ A:115-134,180-191,197-213
1vpb d1vpba_ A:125-141,191-203,210-227
1vl4 d1vl4a_ A:115-134,135-156,197-213
1vl4 d1vl4b_ B:115-134,135-156,197-213
1vl4 d1vl4b_ B:2-18,19-37,71-86
1vl4 d1vl4a_ A:2-18,19-37,71-86
1vpb d1vpba_ A:125-141,146-166,210-227
1vpb d1vpba_ A:3-21,22-41,74-93
308. d.147.1 Methenyltetrahydromethanopterin cyclohydrolase
Methenyltetrahydromethanopterin cyclohydrolase consists of two alpha+beta subdomains
1qlm d1qlma_ A:173-184,202-212,218-233
309. d.38.1 Thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase
Thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase core: beta-alpha-beta(4); 2 layers: alpha/beta
1t82 d1t82c_ C:51-75,77-90,107-114
1sh8 d1sh8a_ A:51-71,76-88,102-117
1sh8 d1sh8b_ B:51-71,76-88,102-117
310. c.1.5 Inosine monophosphate dehydrogenase (IMPDH) The phosphate moiety of substrate binds in the 'common' phosphate-binding site !
TIM beta/alpha-barrel contains parallel beta-sheet barrel, closed; n=8, S=8; strand order 12345678 ! the first seven superfamilies have similar phosphate-binding sites
1zfj d1zfja1 A:58-69,361-365,432-452
1nfb d1nfba1 A:75-86,87-92,452-472
1nfb d1nfbb1 B:75-86,87-92,452-472
1jcn d1jcnb1 B:75-86,87-92,452-472
1jcn d1jcna1 A:75-86,87-92,452-472
1vrd d1vrda1 A:50-61,62-67,420-440
2cu0 d2cu0a1 A:60-71,72-77,423-443
1jr1 d1jr1b1 B:75-86,87-92,452-472
1b3o d1b3ob1 B:75-86,87-92,452-472
1b3o d1b3oa1 A:75-86,87-92,452-472
1jr1 d1jr1a1 A:75-86,87-92,452-472
1nf7 d1nf7a1 A:75-86,87-92,452-472
1nf7 d1nf7b1 B:75-86,87-92,452-472
1zfj d1zfja1 A:58-69,70-76,432-452
311. c.1.14 RuBisCo, C-terminal domain
TIM beta/alpha-barrel contains parallel beta-sheet barrel, closed; n=8, S=8; strand order 12345678 ! the first seven superfamilies have similar phosphate-binding sites
2cxe d2cxed1 D:166-181,183-187,381-399
2cxe d2cxec1 C:166-181,183-187,381-399
2cxe d2cxeb1 B:166-181,183-187,381-399
2cxe d2cxea1 A:166-181,183-187,381-399
2d69 d2d69b1 B:166-181,183-187,381-399
2cwx d2cwxa1 A:166-181,183-187,381-399
2d69 d2d69d1 D:166-181,183-187,381-399
1geh d1gehe1 E:169-184,186-190,400-418
1geh d1gehd1 D:169-184,186-190,400-418
1geh d1geha1 A:169-184,186-190,400-418
1geh d1gehb1 B:169-184,186-190,400-418
2d69 d2d69e1 E:166-181,183-187,381-399
1geh d1gehc1 C:169-184,186-190,400-418
2cwx d2cwxe1 E:166-181,183-187,381-399
2d69 d2d69a1 A:166-181,183-187,381-399
1iwa d1iwac1 C:181-196,198-202,412-434
1ir2 d1ir2z1 Z:181-196,198-202,412-434
1ir2 d1ir2g1 G:181-196,198-202,412-434
1uzh d1uzhr1 R:181-196,198-202,412-434
1iwa d1iwam1 M:181-196,198-202,412-434
1ir2 d1ir2s1 S:181-196,198-202,412-434
1gk8 d1gk8a1 A:181-196,198-202,412-434
1ir2 d1ir2t1 T:181-196,198-202,412-434
2v68 d2v68h1 H:181-196,198-202,412-434
1iwa d1iwao1 O:181-196,198-202,412-434
2v68 d2v68e1 E:181-196,198-202,412-434
2v68 d2v68d1 D:181-196,198-202,412-434
1gk8 d1gk8g1 G:181-196,198-202,412-434
1rcx d1rcxr1 R:181-196,198-202,412-434
1rcx d1rcxb1 B:181-196,198-202,412-434
1rcx d1rcxh1 H:181-196,198-202,412-434
1rcx d1rcxl1 L:181-196,198-202,412-434
1rcx d1rcxv1 V:181-196,198-202,412-434
1rcx d1rcxk1 K:181-196,198-202,412-434
1rcx d1rcxo1 O:181-196,198-202,412-434
1rcx d1rcxe1 E:181-196,198-202,412-434
1ir2 d1ir2f1 F:181-196,198-202,412-434
1ir2 d1ir2x1 X:181-196,198-202,412-434
2v68 d2v68c1 C:181-196,198-202,412-434
2v68 d2v68a1 A:181-196,198-202,412-434
1bxn d1bxne1 E:184-199,201-205,414-436
1gk8 d1gk8e1 E:181-196,198-202,412-434
1uzh d1uzhk1 K:181-196,198-202,412-434
4rub d4rubb1 B:181-196,198-202,412-434
1ir2 d1ir2c1 C:181-196,198-202,412-434
2v68 d2v68g1 G:181-196,198-202,412-434
1uzh d1uzhb1 B:181-196,198-202,412-434
2v68 d2v68f1 F:181-196,198-202,412-434
1uzh d1uzho1 O:181-196,198-202,412-434
1bxn d1bxnc1 C:184-199,201-205,414-436
1uw9 d1uw9r1 R:181-196,198-202,412-434
1ir2 d1ir2u1 U:181-196,198-202,412-434
1uzh d1uzhv1 V:181-196,198-202,412-434
1uw9 d1uw9k1 K:181-196,198-202,412-434
1bxn d1bxna1 A:184-199,201-205,414-436
1iwa d1iwai1 I:181-196,198-202,412-434
1ir2 d1ir2y1 Y:181-196,198-202,412-434
1ir2 d1ir2a1 A:181-196,198-202,412-434
1ir2 d1ir2e1 E:181-196,198-202,412-434
1gk8 d1gk8c1 C:181-196,198-202,412-434
1bxn d1bxng1 G:184-199,201-205,414-436
1uw9 d1uw9e1 E:181-196,198-202,412-434
1uw9 d1uw9v1 V:181-196,198-202,412-434
1tel d1telb1 B:2178-2193,2195-2199,2391-2409
1tel d1tela1 A:1178-1193,1195-1199,1391-1409
1wdd d1wdda1 A:181-196,198-202,412-434
1ir2 d1ir2d1 D:181-196,198-202,412-434
1uw9 d1uw9b1 B:181-196,198-202,412-434
1ir2 d1ir2w1 W:181-196,198-202,412-434
1uw9 d1uw9a1 A:181-196,198-202,412-434
1uzh d1uzhh1 H:181-196,198-202,412-434
1uzh d1uzha1 A:181-196,198-202,412-434
2v63 d2v63h1 H:181-196,198-202,412-434
1uw9 d1uw9h1 H:181-196,198-202,412-434
1uwa d1uwar1 R:181-196,198-202,412-434
1uw9 d1uw9o1 O:181-196,198-202,412-434
1ir2 d1ir2h1 H:181-196,198-202,412-434
1uzh d1uzhe1 E:181-196,198-202,412-434
2v67 d2v67e1 E:181-196,198-202,412-434
2v6a d2v6ac1 C:181-196,198-202,412-434
1iwa d1iwag1 G:181-196,198-202,412-434
1ir2 d1ir2v1 V:181-196,198-202,412-434
1uzd d1uzda1 A:181-196,198-202,412-434
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2v68 d2v68b1 B:181-196,198-202,412-434
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1rbo d1rbob1 B:181-196,396-403,412-434
1rbo d1rboh1 H:181-196,396-403,412-434
1rbo d1rbol1 L:181-196,396-403,412-434
1rbo d1rboe1 E:181-196,396-403,412-434
1ir1 d1ir1b1 B:181-196,396-403,412-434
1rbl d1rblb1 B:181-196,396-403,412-434
1rbl d1rble1 E:181-196,396-403,412-434
1rbl d1rblc1 C:181-196,396-403,412-434
1rbl d1rblh1 H:181-196,396-403,412-434
1rbl d1rblf1 F:181-196,396-403,412-434
1rbl d1rblg1 G:181-196,396-403,412-434
1rbl d1rbla1 A:181-196,396-403,412-434
1rbl d1rbld1 D:181-196,396-403,412-434
1rxo d1rxoh1 H:181-196,396-403,412-434
1rxo d1rxob1 B:181-196,396-403,412-434
1rxo d1rxoe1 E:181-196,396-403,412-434
1rxo d1rxol1 L:181-196,396-403,412-434
1rco d1rcoo1 O:181-196,396-403,412-434
1rco d1rcok1 K:181-196,396-403,412-434
1rco d1rcoh1 H:181-196,396-403,412-434
1rco d1rcoe1 E:181-196,396-403,412-434
1rco d1rcov1 V:181-196,396-403,412-434
1rco d1rcor1 R:181-196,396-403,412-434
1rco d1rcol1 L:181-196,396-403,412-434
1rco d1rcob1 B:181-196,396-403,412-434
1rsc d1rscg1 G:181-196,396-403,411-434
1ej7 d1ej7l1 L:181-196,396-403,412-434
1rsc d1rscd1 D:181-196,396-403,411-434
1rsc d1rscc1 C:181-196,396-403,411-434
1rsc d1rscb1 B:181-196,396-403,411-434
1rsc d1rsca1 A:181-196,396-403,411-434
1rsc d1rsch1 H:181-196,396-403,411-434
1rsc d1rscf1 F:181-196,396-403,411-434
1rsc d1rsce1 E:181-196,396-403,411-434
1iwa d1iwak1 K:181-196,396-403,412-434
1rld d1rlda1 A:181-196,396-403,411-434
1rld d1rldb1 B:181-196,396-403,411-434
1svd d1svda1 A:174-189,389-396,405-427
1aus d1auso1 O:181-196,396-403,412-434
1aus d1ausn1 N:181-196,396-403,412-434
1aus d1ausl1 L:181-196,396-403,412-434
1aus d1ausm1 M:181-196,396-403,412-434
312. d.58.31 Methyl-coenzyme M reductase subunits each of the three different subunits, alpha, beta and gamma, contains this fold decorated with additional secondary structures !
Ferredoxin-like alpha+beta sandwich with antiparallel beta-sheet; (beta-alpha-beta)x2
1hbu d1hbud2 D:109-121,203-211,219-240
1mro d1mroa2 A:109-121,203-211,219-240
1hbu d1hbub2 B:50-60,110-117,126-147
1mro d1mrob2 B:50-60,110-117,126-147
1hbu d1hbue2 E:50-60,110-117,126-147
1hbn d1hbnb2 B:50-60,110-117,126-147
1mro d1mroe2 E:50-60,110-117,126-147
1hbm d1hbmb2 B:50-60,110-117,126-147
1hbn d1hbne2 E:50-60,110-117,126-147
1hbm d1hbme2 E:50-60,110-117,126-147
313. d.79.3 L30e-like
Bacillus chorismate mutase-like core: beta-alpha-beta-alpha-beta(2); mixed beta-sheet: order: 1423, strand 4 is antiparallel to the rest
1dt9 d1dt9a2 A:304-315,343-348,373-382
314. d.223.1 Polo-box domain Serine/threonine protein kinase-associated motif embedded in two distinct folds !
Polo-box domain beta(6)-alpha; antiparallel beta-sheet, meander
1umw d1umwa1 A:373-388,558-563,564-571
315. b.52.1 Barwin-like endoglucanases
Double psi beta-barrel barrel, closed; n=6, S=10; complex topology with crossover (psi) loops
2pi8 d2pi8a1 A:152-163,164-169,314-324
2pi8 d2pi8b1 B:152-163,164-169,314-324
2pi8 d2pi8c1 C:152-163,164-169,314-324
2g5d d2g5da1 A:252-263,263-270,411-422
2pi8 d2pi8d1 D:152-163,164-169,314-324
316. d.17.4 NTF2-like has a beta-alpha(2)-beta insertion after the main helix !
Cystatin-like Core: alpha-beta(4); helix packs against coiled antiparallel beta-sheet
1tuh d1tuha_ A:67-83,113-128,140-149
317. d.87.2 CO dehydrogenase flavoprotein C-terminal domain-like
CO dehydrogenase flavoprotein C-domain-like core: beta(3,4)-alpha(3); alpha+beta sandwich
1n62 d1n62f1 F:123-133,207-218,226-236
1n5x d1n5xa4 A:504-529,1168-1181,1301-1310
1n5x d1n5xb4 B:504-529,1168-1181,1301-1310
1vdv d1vdvb4 B:504-528,1168-1181,1301-1310
1v97 d1v97b4 B:504-528,1168-1181,1301-1310
318. c.1.27 (2r)-phospho-3-sulfolactate synthase ComA
TIM beta/alpha-barrel contains parallel beta-sheet barrel, closed; n=8, S=8; strand order 12345678 ! the first seven superfamilies have similar phosphate-binding sites
1u83 d1u83a_ A:29-41,45-50,231-244
319. a.223.1 Triger factor/SurA peptide-binding domain-like there are sequence and functional similarities between the families, but their structural similarity is obscured by conformational flexibility (in the TF family) !
Triger factor/SurA peptide-binding domain-like multihelical; irregular array of long and short helices
1w26 d1w26b1 B:262-299,415-422,423-430
320. c.1.21 Dihydropteroate synthetase-like
TIM beta/alpha-barrel contains parallel beta-sheet barrel, closed; n=8, S=8; strand order 12345678 ! the first seven superfamilies have similar phosphate-binding sites
1eye d1eyea_ A:27-42,250-255,256-273
1ad4 d1ad4b_ B:25-40,236-241,242-265
1ad4 d1ad4b_ B:25-40,42-48,242-265
321. d.287.1 DNA methylase specificity domain
DNA methylase specificity domain comprises the N-terminal, double beta-helix like structure and C-terminal alpha-hairpin
1yf2 d1yf2a1 A:126-138,162-166,167-210
1yf2 d1yf2b1 B:126-138,162-166,167-210
1ydx d1ydxa2 A:288-300,323-328,330-371
1yf2 d1yf2b2 B:336-348,371-376,377-419
1yf2 d1yf2a2 A:336-348,371-376,377-419
322. d.17.2 Amine oxidase N-terminal region
Cystatin-like Core: alpha-beta(4); helix packs against coiled antiparallel beta-sheet
1n9e d1n9ed3 D:192-204,249-256,277-288
1n9e d1n9ec3 C:192-204,249-256,277-288
1n9e d1n9eb3 B:192-204,249-256,277-288
1n9e d1n9ea3 A:192-204,249-256,277-288
1w7c d1w7ca3 A:192-204,249-256,277-288
1rky d1rkya3 A:192-204,249-256,277-288
323. e.6.1 Acyl-CoA dehydrogenase NM domain-like flavoprotein: binds FAD; constituent families differ in the numbers of C-terminal domains (four-helical bundles) !
Acyl-CoA dehydrogenase NM domain-like 2 domains: (1) all-alpha: 5 helices; (2) contains an open beta-sheet barrel: n*=5, S*=8; complex topology
1ege d1egec2 C:91-112,165-169,360-375
2c12 d2c12a2 A:87-107,168-172,386-404
2c12 d2c12b2 B:87-107,168-172,386-404
2reh d2rehd2 D:87-107,168-172,386-404
1ivh d1ivhc2 C:90-112,165-169,359-376
2a1t d2a1tb2 B:91-112,165-169,360-375
3mdd d3mdda2 A:91-112,165-169,360-375
2c12 d2c12f2 F:87-107,168-172,386-404
2c12 d2c12d2 D:87-107,168-172,386-404
2reh d2rehb2 B:87-107,168-172,386-403
1t9g d1t9ga2 A:91-112,165-169,360-375
1ege d1egeb2 B:91-112,165-169,360-375
1ukw d1ukwb2 B:111-132,185-189,377-392
2a1t d2a1tc2 C:91-112,165-169,360-375
2a1t d2a1td2 D:91-112,165-169,360-375
1egc d1egcc2 C:91-112,165-169,360-375
1egd d1egdc2 C:91-112,165-169,360-375
1ege d1eged2 D:91-112,165-169,360-375
3mdd d3mddb2 B:91-112,165-169,360-375
1t9g d1t9gc2 C:91-112,165-169,360-375
3mde d3mdeb2 B:91-112,165-169,360-375
2a1t d2a1ta2 A:91-112,165-169,360-375
1t9g d1t9gd2 D:91-112,165-169,360-375
3mde d3mdea2 A:91-112,165-169,360-375
1egd d1egdb2 B:91-112,165-169,360-375
1egd d1egda2 A:91-112,165-169,360-375
1t9g d1t9gb2 B:91-112,165-169,360-375
1egc d1egcd2 D:91-112,165-169,360-375
324. d.295.1 TFB5-like
TFB5-like beta-alpha-beta(2)-alpha; 2 layers, a/b; antiparallel sheet, order: 132; dimerises in solution (PDB 2jnj) via extended N-terminal strand
1ydl d1ydla1 A:13-27,33-39,48-62
325. d.16.1 FAD-linked reductases, C-terminal domain N-terminal domain is beta/beta/alpha common fold !
FAD-linked reductases, C-terminal domain alpha+beta sandwich
1o5w d1o5wa2 A:167-183,345-355,354-365
1o5w d1o5wc2 C:2167-2183,2345-2355,2354-2365
1o5w d1o5wb2 B:1167-1183,1345-1355,1354-1365
1o5w d1o5wd2 D:3167-3183,3345-3355,3354-3365
326. d.2.1 Lysozyme-like
Lysozyme-like common alpha+beta motif for the active site region
1bvk d1bvkf_ F:24-37,50-55,101-109
327. b.2.8 beta-sandwich domain of Sec23/24
Common fold of diphtheria toxin/transcription factors/cytochrome f sandwich; 9 strands in 2 sheet; greek-key; subclass of immunoglobin-like fold
1m2o d1m2oa2 A:22-30,498-513,516-523
328. a.172.1 Helical scaffold and wing domains of SecA
Helical scaffold and wing domains of SecA multihelical; consists of 2 all-alpha subdomains
1tf2 d1tf2a2 A:176-190,350-356,571-621
329. d.89.1 Origin of replication-binding domain, RBD-like
Origin of replication-binding domain, RBD-like alpha-beta-alpha-beta(2)-alpha-beta-alpha-beta; 3 layers: a/b/a; antiparallel sheet 41325
1p4d d1p4da_ A:192-212,214-218,287-305
1p4d d1p4db_ B:192-212,214-218,287-305
330. a.102.1 Six-hairpin glycosidases
alpha/alpha toroid multihelical; up to seven alpha-hairpins are arranged in closed circular array; there may be sequence similarities between different superfamilies
1ut9 d1ut9a1 A:306-323,325-329,434-452
1rq5 d1rq5a1 A:306-323,325-329,434-452
331. d.142.1 Glutathione synthetase ATP-binding domain-like
ATP-grasp Consists of two subdomains with different alpha+beta folds ! shares functional and structural similarities with the PIPK and protein kinase superfamilies
1m6v d1m6ve6 E:575-593,823-834,847-858
1jdb d1jdbh6 H:574-592,822-833,846-857
1ce8 d1ce8a6 A:575-593,823-834,847-858
1ce8 d1ce8e6 E:575-593,823-834,847-858
1cs0 d1cs0e6 E:575-593,823-834,847-858
1m6v d1m6vc6 C:575-593,823-834,847-858
1m6v d1m6vg6 G:575-593,823-834,847-858
1ce8 d1ce8g6 G:575-593,823-834,847-858
1t36 d1t36e6 E:575-593,823-834,847-858
1c3o d1c3oe6 E:575-593,823-834,847-858
1c3o d1c3oa6 A:575-593,823-834,847-858
1t36 d1t36g6 G:575-593,823-834,847-858
1m6v d1m6va6 A:575-593,823-834,847-858
1a9x d1a9xc6 C:2575-2593,2823-2834,2847-2858
1jdb d1jdbb6 B:574-592,822-833,846-857
1kee d1keea6 A:575-593,823-834,847-858
1c30 d1c30a6 A:575-593,823-834,847-858
1kee d1keeg6 G:575-593,823-834,847-858
1c3o d1c3og6 G:575-593,823-834,847-858
1c30 d1c30e6 E:575-593,823-834,847-858
1cs0 d1cs0a6 A:575-593,823-834,847-858
1ce8 d1ce8c6 C:575-593,823-834,847-858
1cs0 d1cs0g6 G:575-593,823-834,847-858
1c3o d1c3oc6 C:575-593,823-834,847-858
1a9x d1a9xg6 G:6575-6593,6823-6834,6847-6858
1a9x d1a9xe6 E:4575-4593,4823-4834,4847-4858
1kee d1keee6 E:575-593,823-834,847-858
1c30 d1c30c6 C:575-593,823-834,847-858
1t36 d1t36a6 A:575-593,823-834,847-858
1kee d1keec6 C:575-593,823-834,847-858
1jdb d1jdbk6 K:574-592,822-833,846-857
1jdb d1jdbe6 E:574-592,822-833,846-857
1cs0 d1cs0c6 C:575-593,823-834,847-858
1a9x d1a9xa6 A:575-593,823-834,847-858
1t36 d1t36c6 C:575-593,823-834,847-858
1c30 d1c30g6 G:575-593,823-834,847-858
1bxr d1bxre6 E:575-593,823-834,847-858
1bxr d1bxrg6 G:575-593,823-834,847-858
1bxr d1bxrc6 C:575-593,823-834,847-858
1bxr d1bxra6 A:574-593,823-834,847-858
1m6v d1m6vc6 C:575-593,823-834,860-871
1m6v d1m6ve6 E:575-593,823-834,860-871
1m6v d1m6vg6 G:575-593,823-834,860-871
1ce8 d1ce8e6 E:575-593,823-834,860-871
1a9x d1a9xg6 G:6575-6593,6823-6834,6860-6871
1jdb d1jdbh6 H:574-592,822-833,859-870
1ce8 d1ce8a6 A:575-593,823-834,860-871
1cs0 d1cs0g6 G:575-593,823-834,860-871
1jdb d1jdbb6 B:574-592,822-833,859-870
1c3o d1c3og6 G:575-593,823-834,860-871
1c3o d1c3oe6 E:575-593,823-834,860-871
1t36 d1t36g6 G:575-593,823-834,860-871
1cs0 d1cs0e6 E:575-593,823-834,860-871
1c3o d1c3oa6 A:575-593,823-834,860-871
1a9x d1a9xc6 C:2575-2593,2823-2834,2860-2871
1c30 d1c30a6 A:575-593,823-834,860-871
1c30 d1c30c6 C:575-593,823-834,860-871
1kee d1keea6 A:575-593,823-834,860-871
1m6v d1m6va6 A:575-593,823-834,860-871
1c3o d1c3oc6 C:575-593,823-834,860-871
1t36 d1t36e6 E:575-593,823-834,860-871
1kee d1keeg6 G:575-593,823-834,860-871
1a9x d1a9xe6 E:4575-4593,4823-4834,4860-4871
1ce8 d1ce8c6 C:575-593,823-834,860-871
1t36 d1t36c6 C:575-593,823-834,860-871
1c30 d1c30e6 E:575-593,823-834,860-871
1t36 d1t36a6 A:575-593,823-834,860-871
1kee d1keee6 E:575-593,823-834,860-871
1kee d1keec6 C:575-593,823-834,860-871
1cs0 d1cs0c6 C:575-593,823-834,860-871
1jdb d1jdbe6 E:574-592,822-833,859-870
1cs0 d1cs0a6 A:575-593,823-834,860-871
1jdb d1jdbk6 K:574-592,822-833,859-870
1ce8 d1ce8g6 G:575-593,823-834,860-871
1a9x d1a9xa6 A:575-593,823-834,860-871
1c30 d1c30g6 G:575-593,823-834,860-871
1bxr d1bxre6 E:575-593,823-834,860-871
1bxr d1bxrc6 C:575-593,823-834,860-871
1bxr d1bxrg6 G:575-593,823-834,860-871
1bxr d1bxra6 A:574-593,823-834,860-871
332. e.43.1 Subunits of heterodimeric actin filament capping protein Capz
Subunits of heterodimeric actin filament capping protein Capz 3 domains: (1) protozoan pheromone-like alpha-helical bundle; (2) rubredoxin-like domain lacking metal-binding site; (3) alpha+beta heterodimerisation domain: alpha-beta(5)-alpha
1izn d1izna_ A:115-137,168-182,220-260
1izn d1iznc_ C:115-137,168-182,220-260
1izn d1iznb_ B:90-113,144-159,208-245
1izn d1iznd_ D:90-113,144-159,208-245
333. d.32.1 Glyoxalase/Bleomycin resistance protein/Dihydroxybiphenyl dioxygenase
Glyoxalase/Bleomycin resistance protein/Dihydroxybiphenyl dioxygenase beta-alpha-beta(3); 2 layers: alpha/beta
1t47 d1t47a2 A:217-227,227-235,360-377
1t47 d1t47b2 B:218-227,227-235,360-377
334. a.119.1 Lipoxigenase
Lipoxigenase multihelical ! large nearly all-alpha domain
2p0m d2p0ma1 A:225-236,299-308,337-381
1rrl d1rrla1 A:360-371,448-458,491-538
1rov d1rova1 A:360-371,448-458,491-538
1lnh d1lnha1 A:360-371,448-458,491-538
1rrl d1rrlb1 B:360-371,448-458,491-538
1ik3 d1ik3a1 A:360-371,448-458,491-538
1rrh d1rrha1 A:360-371,448-458,491-538
1no3 d1no3a1 A:360-371,448-458,491-538
3bnb d3bnba1 A:342-353,429-439,472-519
1fgq d1fgqa1 A:342-353,429-439,473-519
1n8q d1n8qa1 A:360-371,448-458,492-538
1hu9 d1hu9a1 A:360-371,448-458,492-538
1jnq d1jnqa1 A:360-371,448-458,492-538
1fgm d1fgma1 A:342-353,429-439,473-519
1y4k d1y4ka1 A:342-353,429-439,473-519
3bnc d3bnca1 A:342-353,429-439,473-519
3bnd d3bnda1 A:342-353,429-439,473-519
1fgt d1fgta1 A:342-353,429-439,473-519
1fgr d1fgra1 A:342-353,429-439,473-519
2sbl d2sbla1 A:342-353,429-439,473-519
2sbl d2sblb1 B:342-353,429-439,473-519
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1yge d1ygea1 A:342-353,429-439,473-519
1f8n d1f8na1 A:342-353,429-439,473-519
335. d.305.1 NAP-like
NAP-like core: central meander 4-stranded beta-sheet (order: 1234) transversed by a C-terminal helix
2z2r d2z2ra1 A:89-141,213-222,327-356
2z2r d2z2rb1 B:89-141,213-223,328-356
List of motif hits that are not present in SCOP but are found in PDB for pattern ID: 18 (enumeration index: query8) of S3
2ux8 H:38-51,125-131,141-154
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