Select neighbours (check boxes) for viewing as multiple structural alignment or 3D superimposition.
The list of neighbours is sorted by Z-score. Similarities with a Z-score lower than 2 are spurious.
Each neighbour has links to pairwise structural alignment with the query structure, to pre-computed structural neighbours in the Dali Database,
and to the PDB format coordinate file where the neighbour
is superimposed onto the query structure.
Expand gaps
Summary
No: Chain Z rmsd lali nres %id PDB Description
1: 1ic8-B 3.9 3.1 65 173 20 PDB MOLECULE: HEPATOCYTE NUCLEAR FACTOR 1-ALPHA;
2: 2ppx-A 3.7 2.5 50 62 4 PDB MOLECULE: UNCHARACTERIZED PROTEIN ATU1735;
3: 3d1n-I 3.6 2.9 60 149 13 PDB MOLECULE: 5'-
4: 1au7-A 3.5 2.7 56 130 14 PDB MOLECULE: PROTEIN PIT-1;
5: 2o38-B 3.5 3.9 55 90 13 PDB MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN;
6: 2a6c-A 3.4 2.6 55 76 11 PDB MOLECULE: HELIX-TURN-HELIX MOTIF;
7: 2w48-B 3.2 7.0 44 313 18 PDB MOLECULE: SORBITOL OPERON REGULATOR;
8: 3g5g-B 3.0 2.6 52 78 19 PDB MOLECULE: REGULATORY PROTEIN;
9: 1ojl-D 3.0 6.8 47 297 9 PDB MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATORY PROTEIN ZRAR;
10: 3dnv-B 2.9 3.1 51 71 29 PDB MOLECULE: PROTEIN HIPA;
11: 1y9q-A 2.8 3.7 58 178 17 PDB MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, HTH_3 FAMILY;
12: 2d5v-A 2.8 3.2 58 135 19 PDB MOLECULE: HEPATOCYTE NUCLEAR FACTOR 6;
13: 2bwj-A 2.8 4.2 60 196 5 PDB MOLECULE: ADENYLATE KINASE 5;
14: 3f51-A 2.6 2.4 45 94 16 PDB MOLECULE: CLP GENE REGULATOR (CLGR);
15: 1vz0-B 2.6 4.8 51 192 16 PDB MOLECULE: CHROMOSOME PARTITIONING PROTEIN PARB;
16: 2bnm-A 2.6 2.6 48 194 17 PDB MOLECULE: EPOXIDASE;
17: 2eby-A 2.5 2.7 50 102 24 PDB MOLECULE: PUTATIVE HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR YBAQ;
18: 2auw-B 2.5 5.2 62 155 8 PDB MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN NE0471;
19: 3cec-A 2.5 2.7 51 91 18 PDB MOLECULE: PUTATIVE ANTIDOTE PROTEIN OF PLASMID MAINTENANCE
20: 1r71-B 2.5 3.3 47 116 17 PDB MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REPRESSOR PROTEIN KORB;
21: 2ntz-A 2.5 2.9 46 183 15 PDB MOLECULE: 5'-
22: 2k9n-A 2.5 2.5 41 107 10 PDB MOLECULE: MYB24;
23: 1wty-A 2.4 3.5 65 116 8 PDB MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN TTHA0048;
24: 2ofy-A 2.4 2.9 47 82 13 PDB MOLECULE: PUTATIVE XRE-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
25: 2ox6-C 2.4 3.5 54 163 6 PDB MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN SO3848;
26: 2b5a-A 2.4 3.0 50 77 18 PDB MOLECULE: C.BCLI;
27: 1cp9-B 2.3 5.2 67 553 6 PDB MOLECULE: PENICILLIN AMIDOHYDROLASE;
28: 2euc-A 2.3 3.4 61 108 7 PDB MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN YFMB;
29: 1g2h-A 2.3 2.2 43 61 14 PDB MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATORY PROTEIN TYRR HOMOLOG;
30: 2r0q-C 2.3 4.2 43 193 14 PDB MOLECULE: PUTATIVE TRANSPOSON TN552 DNA-INVERTASE BIN3;
31: 2ef8-A 2.2 2.9 50 84 26 PDB MOLECULE: PUTATIVE TRANSCRIPTION FACTOR;
32: 3ivp-A 2.2 2.6 46 115 4 PDB MOLECULE: PUTATIVE TRANSPOSON-RELATED DNA-BINDING PROTEIN;
33: 1utx-A 2.2 2.7 47 66 19 PDB MOLECULE: CYLR2;
34: 3g7d-A 2.2 2.4 42 418 10 PDB MOLECULE: PHPD;
35: 1umq-A 2.2 7.3 51 60 8 PDB MOLECULE: PHOTOSYNTHETIC APPARATUS REGULATORY PROTEIN;
36: 2jn6-A 2.1 3.7 48 97 6 PDB MOLECULE: PROTEIN CGL2762;
37: 3bd1-A 2.1 2.5 42 65 24 PDB MOLECULE: CRO PROTEIN;
38: 1fse-B 2.1 4.4 46 70 15 PDB MOLECULE: GERE;
39: 1l3l-A 2.0 4.4 48 233 2 PDB MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL ACTIVATOR PROTEIN TRAR;
40: 2ibd-A 2.0 5.3 43 192 9 PDB MOLECULE: POSSIBLE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
Pairwise Structural Alignments
Notation: three-state secondary structure definitions by DSSP (reduced to H=helix, E=sheet, L=coil) are shown above the amino acid sequence. Structurally equivalent residues are in uppercase, structurally non-equivalent residues (e.g. in loops) are in lowercase. Amino acid identities are marked by vertical bars.
No 1: Query=mol1A Sbjct=1ic8B Z-score=3.9
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DSSP ------lllllllllllLLLLLL---LHHHHHHHHHHHHL--LLLHHHHHHHLLLLHHHH Query ------mghhhhhhshmLPPEQW---SHTTVRNALKDLLK--DMNQSSLAKECPLSQSMI 49 ident | | | | | | || Sbjct ilkelenlspeeaahqkAVVETLlqeDPWRVAKMVKSYLQqhNIPQREVVDTTGLNQSHL 60 DSSP lllllllllhhhhhhhhHHHHHHlllLHHHHHHHHHHHHHhlLLLHHHHHHHHLLLHHHH DSSP HHHHLLllLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHL------------------------------- Query SSIVNStyYANVSAAKCQEFGRWYKHFKK------------------------------- 78 ident | | | || Sbjct SQHLNK--GTPMKTQKRAALYTWYVRKQRevaqqfthrnrfkwgpasqqilfqayerqkn 118 DSSP HHHHHL--LLLLLHHHHHHHHHHHHHHLLlllllllllllllllhhhhhhhhhhhhllll DSSP --------------------------------------------------lllll Query --------------------------------------------------tkdmm 83 ident Sbjct pskeeretlveecnraeciqrgvspsqaqglgsnlvtevrvynwfanrrkeeafr 173 DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllhhhlllhhhhhhhhhhhhhlllll
DSSP llllllllllllllllllhhhhhHHHHHHHL--LLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHHLLlll Query mghhhhhhshmlppeqwshttvrNALKDLLK--DMNQSSLAKECPLSQSMISSIVNStyy 58 ident | | Sbjct ----------------------xPRIKIIRRalKLTQEEFSARYHIPLGTLRDWEQG--r 36 DSSP ----------------------lLHHHHHHHhlLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHLL--l DSSP llLLLHHHHHHHHHHHHHHL-lllll Query anVSAAKCQEFGRWYKHFKK-tkdmm 83 ident Sbjct sePDQPARAYLKIIAVDPEGtaaalr 62 DSSP llLLHHHHHHHHHHHHLHHHhhhhhl
DSSP lllllllllllllllllLHHHHHHHHHHHHL--LLLHHHHHHHLL------LLHHHHHHH Query mghhhhhhshmlppeqwSHTTVRNALKDLLK--DMNQSSLAKECP------LSQSMISSI 52 ident | | ||| || Sbjct --------------nxeEIREFAKNFKIRRLslGLTQTQVGQAXTategpaYSQSAISRF 46 DSSP --------------lhhHHHHHHHHHHHHHHllLLLHHHHHHHHLllllllLLHHHHHHH DSSP HLLllLLLL--LLHHHHHHHHHHHHHHLL------------------------------- Query VNStyYANV--SAAKCQEFGRWYKHFKKT------------------------------- 79 ident | Sbjct EKL--DITPksAQKLKPVLEKWLNEAELRnqegqqnlxefvggepskkrkrrtsftpqai 104 DSSP HLL--LLLHhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhllllhhhhhlllllllllllllllhhhh DSSP -----------------------------------------llll Query -----------------------------------------kdmm 83 ident Sbjct ealnayfeknplptgqeitexakelnydrevvrvwfsnrrqtlkn 149 DSSP hhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhll
DSSP lllllllllllllllllLHHHHHHHHHHHHL--LLLHHHHHHHL------llLHHHHHHH Query mghhhhhhshmlppeqwSHTTVRNALKDLLK--DMNQSSLAKEC------plSQSMISSI 52 ident | | | || | Sbjct --------------gmrALEQFANEFKVRRIklGYTQTNVGEALaavhgsefSQTTICRF 46 DSSP --------------lhhHHHHHHHHHHHHHHhhLLLHHHHHHHHhhllllllLHHHHHHH DSSP HLLllLLLL--LLHHHHHHHHHHHHHH--------------------------------- Query VNStyYANV--SAAKCQEFGRWYKHFK--------------------------------- 77 ident | | Sbjct ENL--QLSFknACKLKAILSKWLEEAEqkrrttisiaakdalerhfgehskpssqeimrm 104 DSSP HLL--LLLHhhHHHHHHHHHHHHHHLLllllllllhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhh DSSP --------------------llllll Query --------------------ktkdmm 83 ident Sbjct aeelnlekevvrvwfcnrrqrekrvk 130 DSSP hhhhlllhhhhhhhhhhhhhhlllll
DSSP lllllllllllllllllLHHHHHHHHHHHHL--LLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHHLLlll Query mghhhhhhshmlppeqwSHTTVRNALKDLLK--DMNQSSLAKECPLSQSMISSIVNStyy 58 ident || | | | | | Sbjct ---------xpdaeerqTKLRLAYALNAVIDraRLSQAAAAARLGINQPKVSALRNY--k 49 DSSP ---------llhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHhhLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHLL--l DSSP lLLLL-HHHHHHHHHhhhhhLLLL---------------ll Query aNVSA-AKCQEFGRWykhfkKTKD---------------mm 83 ident Sbjct lEGFSvERLXTLLNAldqdvEIVIrkkprsraaarisvvaa 90 DSSP lLLLLhHHHHHHHHHlleeeEEEEeellllllllleeeeel
DSSP lllllllllllllllllLHHHHHHH-HHHHHL-LLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHHLLlll Query mghhhhhhshmlppeqwSHTTVRNA-LKDLLK-DMNQSSLAKECPLSQSMISSIVNStyy 58 ident | | | | | Sbjct --------ihhhhhhxkXRSQLLIVlQEHLRNsGLTQFKAAELLGVTQPRVSDLXRG-ki 51 DSSP --------lllllllhhHHHHHHHHhHHHHHLlLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHLL-lh DSSP LLLLLHHHHHHHHHHHHhhllllll Query ANVSAAKCQEFGRWYKHfkktkdmm 83 ident | Sbjct DLFSLESLIDXITSIGLkveinikd 76 DSSP HHLLHHHHHHHHHHLLLllllllll
DSSP lllllllllllllllLLLHHHHHHHHHHHHL--LLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHHLL--- Query mghhhhhhshmlppeQWSHTTVRNALKDLLK--DMNQSSLAKECPLSQSMISSIVNS--- 55 ident | || | | | || Sbjct ---------------NSDDIRLIVKIAQLYYeqDMTQAQIARELGIYRTTISRLLKRgre 45 DSSP ---------------LLLHHHHHHHHHHHHHhlLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHHHHhhh DSSP ---------------------------------------------------------lll Query ---------------------------------------------------------tyy 58 ident Sbjct qgivtiainydynenlwleqqlkqkfglkeavvassdglleeeqlsamgqhgallvdrll 105 DSSP hlleeelllllhhhhhhhhhhhhhhhllleeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhl DSSP lllllhhhhhhhhhhhhhhllLLLL----------------------------------- Query anvsaakcqefgrwykhfkktKDMM----------------------------------- 83 ident Sbjct epgdiigfswgravrslvenlPQRSqsrqvicvpiiggpsgklesryhvntltygaaarl 165 DSSP lllleeeelllhhhhhhhhllLLLLllllleeeellllllllllhhhlhhhhhhhhhhhh DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 83 ident Sbjct kaeshladfpalldnplirngimqsqhfktissywdsldvalvgigspairdganwhafy 225 DSSP lleelllllllllllhhhhhhhhllhhhhhhhhhhlllleeeeelllllllllllhhhhl DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 83 ident Sbjct gseesddlnarhvagdicsrfydingglvdtnmsektlsiemaklrqarysigiamgeek 285 DSSP lhhhhhhhhhhleeeeelleeeelllleellhhhhllllllhhhhhllleeeeellllll DSSP ---------------------------- Query ---------------------------- 83 ident Sbjct ysgilgalhgryinclvtnretaelllk 313 DSSP hhhhhhhhhllllleeeeehhhhhhhll
DSSP lllllllllllllllllLHHHHHHHHHHHHL--LLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHHLLlll Query mghhhhhhshmlppeqwSHTTVRNALKDLLK--DMNQSSLAKECPLSQSMISSIVNStyy 58 ident | | | | || | || | Sbjct --------------esfLLSKVSFVIKKIRLekGMTQEDLAYKSNLDRTYISGIERN--- 43 DSSP --------------llhHHHHHHHHHHHHHHhlLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHLL--- DSSP llLLLHhhHHHHHH---hhhHHLL----------llll Query anVSAAkcQEFGRW---ykhFKKT----------kdmm 83 ident Sbjct -sRNLT--IKSLELimkgleVSDVvffemlikeilkhd 78 DSSP -lLLLL--HHHHHHhhhhhlLLHHhhhhhhhhhhhlll
DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct hmigsspamqhllneiamvapsdatvlihgdsgtgkelvaralhacsarsdrplvtlnca 60 DSSP llllllhhhhhhhhhhhhhlllllleeeellllllhhhhhhhhhhhllllllleeeeell DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct alneslleselfghekgaftgadkrregrfveadggtlfldeigdisplmqvrllraiqe 120 DSSP lllhhhhhhhhlllllllllllllllllllhhhllleeeeellllllhhhhhhhhhhhhl DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct revqrvgsnqtisvdvrliaathrdlaeevsagrfrqdlyyrlnvvaiempslrqrredi 180 DSSP leelllllllleellleeeeeelllhhhhhhlllllhhhhhhhlleeeelllhhhhlllh DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct plladhflrrfaernrkvvkgftpqamdllihydwpgnirelenaieravvlltgeyise 240 DSSP hhhhhhhhhhhhhhlllllllllhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhlllllllh DSSP ------lLLLLLLlllllllLLLLHHHHHHHHHHHHLLL--LHHHHHHHLLLLHHHHHHH Query ------mGHHHHHhshmlppEQWSHTTVRNALKDLLKDM--NQSSLAKECPLSQSMISSI 52 ident | | | | Sbjct relplaiAATPIK------eIQPLVDVEKEVILAALEKTggNKTEAARQLGITRKTLLAK 294 DSSP hhllhhhLLLLLL------lLLLHHHHHHHHHHHHHHLLllLHHHHHHHHLLLHHHHHHH DSSP HLLllllllllhhhhhhhhhhhhhhllllll Query VNStyyanvsaakcqefgrwykhfkktkdmm 83 ident Sbjct LSR---------------------------- 297 DSSP LLL----------------------------
DSSP lllllllLLLLllllllLHHHHHHHHHHHHL--LLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHHLLlll Query mghhhhhHSHMlppeqwSHTTVRNALKDLLK--DMNQSSLAKECPLSQSMISSIVNStyy 58 ident | | || | || ||| | || | Sbjct -------FQKI-----ySPTQLANAMKLVRQqnGWTQSELAKKIGIKQATISNFENN--p 46 DSSP -------LLLL-----lLHHHHHHHHHHHHHhlLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHL--h DSSP LLLLLHHHHhhhhhhhhhhllllll Query ANVSAAKCQefgrwykhfkktkdmm 83 ident | Sbjct DNTTLTTFFkilqslelsmtlcdak 71 DSSP HHLLHHHHHhhhhhlllllllllll
DSSP lllllllllllllllllLHHHHHHHHHHHHL--LLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHHLLlll Query mghhhhhhshmlppeqwSHTTVRNALKDLLK--DMNQSSLAKECPLSQSMISSIVNStyy 58 ident | || | | | | | Sbjct -------------tdvxFKSQIANQLKNLRKsrGLSLDATAQLTGVSKAXLGQIERG--e 45 DSSP -------------lhhhHHHHHHHHHHHHHHhlLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHLL--l DSSP llLLLHHHHHHHH----------------------------------------------- Query anVSAAKCQEFGR----------------------------------------------- 71 ident | Sbjct ssPTIATLWKIASgleasfsaffandpqllssersfpddlnxkihtlfpyaadtgleife 105 DSSP llLLHHHHHHHHHhhllllhhhhllllhhhhhllllllllleeeeeeeeeelllleeeee DSSP ----------hhhHHHLL------------------------------------------ Query ----------wykHFKKT------------------------------------------ 79 ident | Sbjct itlldhhqqxsspHALGVieyihvlegixkvffdeqwhelqqgehirffsdqphgyaavt 165 DSSP eeelllleeeellLLLLLeeeeeeeelleeeeelleeeeelllleeeeelllleeeeell DSSP --------LLLL- Query --------KDMM- 83 ident Sbjct ekavfqniVAYPr 178 DSSP lleeeeeeEELLl
DSSP lllllllllllllLLLLLHHHHHHHHHHHHL--LLLHHHHHHHLL-lLHHHHHHHHLLll Query mghhhhhhshmlpPEQWSHTTVRNALKDLLK--DMNQSSLAKECP-lSQSMISSIVNSty 57 ident | | || | | || | Sbjct -------------MEEINTKEVAQRITTELKrySIPQAIFAQRVLcrSQGTLSDLLRNpk 47 DSSP -------------LLLLLHHHHHHHHHHHHHhlLLLHHHHHHHHLllLHHHHHHHHHLll DSSP llllLLHHhHHHHHHHHHHHLL-------------------------------------- Query yanvSAAKcQEFGRWYKHFKKT-------------------------------------- 79 ident | | Sbjct pwskLKSG-RETFRRMWKWLQEpefqrmsalrlprlvftdvqrrtlhaifkenkrpskel 106 DSSP lhhhLLLL-HHHHHHHHHHHHLlhhhhhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhlllllhhh DSSP -------------------------llll Query -------------------------kdmm 83 ident Sbjct qitisqqlglelstvsnffmnarrrsldk 135 DSSP hhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhlllll
DSSP ---------------llLLLL--LLLL-----llllLLLLhHHHHHHHHHHHllllhhhh Query ---------------mgHHHH--HHSH-----mlppEQWShTTVRNALKDLLkdmnqssl 38 ident Sbjct gfmedlrkckiifiiggPGSGkgTQCEklvekygftHLST-GELLREELASE-------- 51 DSSP lhhhhhhhlleeeeeelLLLLhhHHHHhhhhhhlleEEEH-HHHHHHHHHHL-------- DSSP hhhllllHHHHHHHHL-LLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHL-LLLL-------------- Query akecplsQSMISSIVN-STYYANVSAAKCQEFGRWYKHFKK-TKDM-------------- 82 ident | | | Sbjct -------SERSKLIRDiMERGDLVPSGIVLELLKEAMVASLgDTRGflidgyprevkqge 104 DSSP -------LHHHHHHHHhHHLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHLlLLLLeeeelllllhhhhh DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 82 ident Sbjct efgrrigdpqlvicmdcsadtmtnrllqmsrsslpvddttktiakrleayyrasipviay 164 DSSP hhhhhllllleeeeeellhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh DSSP -------------------------------l Query -------------------------------m 83 ident Sbjct yetktqlhkinaegtpedvflqlctaidsifl 196 DSSP hhhhleeeeeellllhhhhhhhhhhhhhhhll
DSSP lllllllllllllllllLHHHHHHHHHHHHL--LLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHHLllll Query mghhhhhhshmlppeqwSHTTVRNALKDLLK--DMNQSSLAKECPLSQSMISSIVNstyy 58 ident || || | | Sbjct -------------peplLREALGAALRSFRAdkGVTLRELAEASRVSPGYLSELER---- 43 DSSP -------------llllHHHHHHHHHHHHHHhhLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHL---- DSSP lllllhHHHHHHHH----------------------------hhhhhllllll Query anvsaaKCQEFGRW----------------------------ykhfkktkdmm 83 ident | Sbjct --grkeVSSELLASvchalgasvadvlieaagsmalqaaqedlarvlewshpq 94 DSSP --llllLLHHHHHHhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
DSSP -----------lLLLLL------------------------------------------- Query -----------mGHHHH------------------------------------------- 6 ident Sbjct vvrlplasirpnPRQPRkrfaeeslkeladsirekgllqpllvrpqgdgyelvagerryr 60 DSSP leeeehhheellLLLHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeelleeeeeelhhhhh DSSP -------------------------lllllllLLLLLHHHHHHHHHHHHL-LLLHHHHHH Query -------------------------hhshmlpPEQWSHTTVRNALKDLLK-DMNQSSLAK 40 ident | | || | | Sbjct aalmaglqevpavvkdltdrealelalvenlqREDLSPVEEARGYQALLEmGLTQEEVAR 120 DSSP hhhhhlllleeeeellllhhhhhhhhhhhhllLLLLLHHHHHHHHHHHHHlLLLHHHHHH DSSP HLLLLHHHHHHHHLL-----------------lLLLL------------lllhhhhhhhh Query ECPLSQSMISSIVNS-----------------tYYAN------------vsaakcqefgr 71 ident | | Sbjct RVGKARSTVANALRLlqlppealealergeitaGHARallmlepedrlwglkeilekgls 180 DSSP HHLLLHHHHHHHHHHhhllhhhhhhhhhllllhHHHHhhhlllhhhhhhhhhhhhhllll DSSP hhhhhhllllll Query wykhfkktkdmm 83 ident Sbjct vrqaealrerla 192 DSSP hhhhhlllhhhl
DSSP lllllllllllllllllLHHHHHHHHHHHHL--LLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHHLllll Query mghhhhhhshmlppeqwSHTTVRNALKDLLK--DMNQSSLAKECPLSQSMISSIVNstyy 58 ident | ||| | || | Sbjct ---------------ktASTGFAELLKDRREqvKMDHAALASLLGETPETVAAWEN---g 42 DSSP ---------------lhHHHHHHHHHHHHHHhlLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHL---l DSSP llLLLHhhHHHHHHH--------------------------------------------- Query anVSAAkcQEFGRWY--------------------------------------------- 73 ident Sbjct egGELT--LTQLGRIahvlgtsigaltppagndlddgviiqmpderpilkgvrdnvdyyv 100 DSSP llLLLL--HHHHHHHhhhlllllhhhllllllllllllllllhhhlleelllllllllee DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 73 ident Sbjct ynclvrtkrapslvplvvdvltdnpddakfnsghagneflfvlegeihmkwgdkenpkea 160 DSSP eeelllllllllleeeeeeellllhhhlllllllllleeeeeeelleeeeelllllleee DSSP ------------------------hhhhllllll Query ------------------------khfkktkdmm 83 ident Sbjct llptgasmfveehvphaftaakgtgsakliavnf 194 DSSP eelllleeeellllleeeeelllllleeeeeeel
DSSP llllllllllllllllllhHHHHHHHH-HHHL--LLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHHLLll Query mghhhhhhshmlppeqwshTTVRNALK-DLLK--DMNQSSLAKECPLSQSMISSIVNSty 57 ident || | | | || | | Sbjct -----------------kpTTPGDILLyEYLEplDLKINELAELLHVHRNSVSALINN-- 41 DSSP -----------------llLLHHHHHHhHLLLllLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHLL-- DSSP llllllhhHHHHHHHHHH-HHLL------------------------------------- Query yanvsaakCQEFGRWYKH-FKKT------------------------------------- 79 ident | | | Sbjct ----nrklTTEMAFRLAKvFDTTvdfwlnlqaavdlwevennmrtqeelgrietvaeyla 97 DSSP ----llllLHHHHHHHHHhHLLLhhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhlllhhhhhh DSSP -llll Query -kdmm 83 ident Sbjct rreer 102 DSSP hhhhl
DSSP ------------------------------------------------------------ Query ------------------------------------------------------------ 0 ident Sbjct xneyffpkltavealapyrlrttwstgevlevdvgdilrkipdlapildpeafarvhiae 60 DSSP lllllllleeeeeelllleeeeeelllleeeeelhhhhhhlhhhhhhhlhhhhllleell DSSP -------lLLLLLL----lllllllLLLLHHHHHHHHHHHHllLLHHHHHHHLLLLHHHH Query -------mGHHHHH----hshmlppEQWSHTTVRNALKDLLkdMNQSSLAKECPLSQSMI 49 ident || | | Sbjct wegsvewfDTEFGRdnvyawakeqaGEVSHEXFGDWXHRNN--LSLTTAAEALGISRRXV 118 DSSP lllleellLLLLLHhhhhhhhhhhlLLLLHHHHHHHHHHLL--LLHHHHHHHHLLLHHHH DSSP HHhhllllllLLLLHhhHHHHHH-HHHHHL--------lLLLL Query SSivnstyyaNVSAAkcQEFGRW-YKHFKK--------tKDMM 83 ident | Sbjct SY----yrtaHKIIP--RTIWLAcLGWEATrpetktlprTLPA 155 DSSP HH----hhllLLLLL--HHHHHHhHHHHHHlllllllllLLLL
DSSP llllllllllllllllllhHHHHHHHHHHHL--LLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHHLLlll Query mghhhhhhshmlppeqwshTTVRNALKDLLK--DMNQSSLAKECPLSQSMISSIVNStyy 58 ident | | | | | | | | Sbjct ----------------vrpIHPGEVIADILDdlDINTANFAEILGVSNQTIQEVING--q 42 DSSP ----------------lllLLHHHHHHHHHHhhLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHLL--l DSSP llLLLHHHHHHHHHHHH------------------------hhllllll Query anVSAAKCQEFGRWYKH------------------------fkktkdmm 83 ident | Sbjct rsITVDIAIRLGKALGNgprlwlnlqqkvdlwyalqshkeeyeqvxtlv 91 DSSP llLLHHHHHHHHHHHLLlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
DSSP lllllllllllllLLLLLHHHHHHHHHHHHL-LLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHHL----- Query mghhhhhhshmlpPEQWSHTTVRNALKDLLK-DMNQSSLAKECPLSQSMISSIVN----- 54 ident | ||| | | | Sbjct -yneadqvienlqRNELTPREIADFIGRELAkGKKKGDIAKEIGKSPAFITQHVTlldlp 59 DSSP -llhhhhhhhhhhLLLLLHHHHHHHHHHHHHlLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHHHhhlll DSSP --------------LLLLLL--------------lllhhhhhhhhhhhhhhllllll Query --------------STYYAN--------------vsaakcqefgrwykhfkktkdmm 83 ident | Sbjct ekiadafntgrvrdVTVVNElvtafkkrpeeveawldddtqeitrgtvkllreflde 116 DSSP hhhhhhhhllllllHHHHHHhhhhhhhlhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhll
DSSP llllllllllllllLLLLHH--HHHHHHHHHHL-LLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHHLL-- Query mghhhhhhshmlppEQWSHT--TVRNALKDLLK-DMNQSSLAKECPLSQSMISSIVNS-- 55 ident | | | | ||| Sbjct -------------qTALQHSirEIGLRLXRXKNdGXSQKDIAAKEGLSQAKVTRALQAas 47 DSSP -------------lLLLLLLhhHHHHHHHHHHHlLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHHHHhl DSSP ----------------LLLLL--------------------------------------- Query ----------------TYYAN--------------------------------------- 60 ident Sbjct apeelvalfpvqseltFSDYKtlcavgdexgnlefdqliqnispeindilsieexaedev 107 DSSP llhhhhhllllhhhllHHHHHhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllll DSSP -----------------------------------------------------lllhhhh Query -----------------------------------------------------vsaakcq 67 ident Sbjct knkilrlitkeaslltdkksvvtelwkfedkdrfarkrvkgrafsyefnrlskelqeeld 167 DSSP hhhhhhhhlhhhhhhhllllleeellllllllleeeeelllllleeeeelllhhhhhhhh DSSP hhhhhhhhhhllllll Query efgrwykhfkktkdmm 83 ident Sbjct rxighilrksldkkpk 183 DSSP hhhhhhhhhlllllll
DSSP llllllllllllllllllHHHHHHHHHHHHLLL---LHHHHHHHL-LLLHHHHHHHHLL- Query mghhhhhhshmlppeqwsHTTVRNALKDLLKDM---NQSSLAKEC-PLSQSMISSIVNS- 55 ident | | | Sbjct --------------kvkfTEEEDLKLQQLVMRYgakDWIRISQLMiTRNPRQCRERWNNy 46 DSSP --------------llllLHHHHHHHHHHHHHHlllLHHHHHHHLlLLLHHHHHHHHHHh DSSP -------------------------------------lLLLLlllhhhhhhhhhhhhhhl Query -------------------------------------tYYANvsaakcqefgrwykhfkk 78 ident | Sbjct inpalrtdpwspeedmlldqkyaeygpkwnkiskflknRSDN----nirnrwmmiarhra 102 DSSP lllllllllllhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhllLLHH----hhhhhhhhhhhhhh DSSP lllll Query tkdmm 83 ident Sbjct khqks 107 DSSP lllll
DSSP lllllllllllllLLLL---------------LHHHHHHHHHHHHLLL------------ Query mghhhhhhshmlpPEQW---------------SHTTVRNALKDLLKDM------------ 33 ident | | Sbjct -------aslaraVERLkaalerpkdefirdsAIQRFEFTFELAWKTLktflelqglear 53 DSSP -------llhhhhHHHHhhhhlllllhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhlllll DSSP LHHHHHH-----------hLLLL-HHHHHHHHLLLL--LLLLLLHHHHHHHHHHHHHHLL Query NQSSLAK-----------eCPLS-QSMISSIVNSTY--YANVSAAKCQEFGRWYKHFKKT 79 ident | | | Sbjct SPRAAIRgafqvgllpedpFWLExLELRNLTNHTYDeaLAERIYAELPKALERFQELLRR 113 DSSP LHHHHHHhhhhhllllllhHHHHhHHHHHHHHHLLLhhHHHHHHLLHHHHHHHHHHHHHH DSSP llll Query kdmm 83 ident Sbjct -lee 116 DSSP -hll
DSSP lllllllllllllllllLHHHHHHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHHLLllLLL Query mghhhhhhshmlppeqwSHTTVRNALKDLLKDMNQSSLAKECPLSQSMISSIVNStyYAN 60 ident | | | | | | Sbjct -------rvpltaeeleRGQRLGELLRSARGDXSXVTVAFDAGISVETLRKIETG-rIAT 52 DSSP -------lllllhhhhhHHHHHHHHHHHHHLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHLL-lLLL DSSP LLLHHH-------hhhhhhhhhhhllllll Query VSAAKC-------qefgrwykhfkktkdmm 83 ident Sbjct PAFFTIaavarvldlslddvaavvtfgpvs 82 DSSP LLHHHHhhhhhhllllhhhhhlllllllll
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