Results

Matches to full PDB Dali: mol1A,

Query: mol1A

Select neighbours (check boxes) for viewing as multiple structural alignment or 3D superimposition. The list of neighbours is sorted by Z-score. Similarities with a Z-score lower than 2 are spurious. Each neighbour has links to pairwise structural alignment with the query structure, to pre-computed structural neighbours in the Dali Database, and to the PDB format coordinate file where the neighbour is superimposed onto the query structure.

Expand gaps

Summary

    No:  Chain   Z    rmsd lali nres  %id PDB  Description
   1:  1ic8-B  3.9  3.1   65   173   20 PDB  MOLECULE: HEPATOCYTE NUCLEAR FACTOR 1-ALPHA;                         
   2:  2ppx-A  3.7  2.5   50    62    4 PDB  MOLECULE: UNCHARACTERIZED PROTEIN ATU1735;                           
   3:  3d1n-I  3.6  2.9   60   149   13 PDB  MOLECULE: 5'-                                                        
   4:  1au7-A  3.5  2.7   56   130   14 PDB  MOLECULE: PROTEIN PIT-1;                                             
   5:  2o38-B  3.5  3.9   55    90   13 PDB  MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN;                                      
   6:  2a6c-A  3.4  2.6   55    76   11 PDB  MOLECULE: HELIX-TURN-HELIX MOTIF;                                    
   7:  2w48-B  3.2  7.0   44   313   18 PDB  MOLECULE: SORBITOL OPERON REGULATOR;                                 
   8:  3g5g-B  3.0  2.6   52    78   19 PDB  MOLECULE: REGULATORY PROTEIN;                                        
   9:  1ojl-D  3.0  6.8   47   297    9 PDB  MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATORY PROTEIN ZRAR;                   
  10:  3dnv-B  2.9  3.1   51    71   29 PDB  MOLECULE: PROTEIN HIPA;                                              
  11:  1y9q-A  2.8  3.7   58   178   17 PDB  MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, HTH_3 FAMILY;                   
  12:  2d5v-A  2.8  3.2   58   135   19 PDB  MOLECULE: HEPATOCYTE NUCLEAR FACTOR 6;                               
  13:  2bwj-A  2.8  4.2   60   196    5 PDB  MOLECULE: ADENYLATE KINASE 5;                                        
  14:  3f51-A  2.6  2.4   45    94   16 PDB  MOLECULE: CLP GENE REGULATOR (CLGR);                                 
  15:  1vz0-B  2.6  4.8   51   192   16 PDB  MOLECULE: CHROMOSOME PARTITIONING PROTEIN PARB;                      
  16:  2bnm-A  2.6  2.6   48   194   17 PDB  MOLECULE: EPOXIDASE;                                                 
  17:  2eby-A  2.5  2.7   50   102   24 PDB  MOLECULE: PUTATIVE HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR YBAQ;          
  18:  2auw-B  2.5  5.2   62   155    8 PDB  MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN NE0471;                               
  19:  3cec-A  2.5  2.7   51    91   18 PDB  MOLECULE: PUTATIVE ANTIDOTE PROTEIN OF PLASMID MAINTENANCE           
  20:  1r71-B  2.5  3.3   47   116   17 PDB  MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REPRESSOR PROTEIN KORB;                    
  21:  2ntz-A  2.5  2.9   46   183   15 PDB  MOLECULE: 5'-                                                        
  22:  2k9n-A  2.5  2.5   41   107   10 PDB  MOLECULE: MYB24;                                                     
  23:  1wty-A  2.4  3.5   65   116    8 PDB  MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN TTHA0048;                             
  24:  2ofy-A  2.4  2.9   47    82   13 PDB  MOLECULE: PUTATIVE XRE-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;             
  25:  2ox6-C  2.4  3.5   54   163    6 PDB  MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN SO3848;                               
  26:  2b5a-A  2.4  3.0   50    77   18 PDB  MOLECULE: C.BCLI;                                                    
  27:  1cp9-B  2.3  5.2   67   553    6 PDB  MOLECULE: PENICILLIN AMIDOHYDROLASE;                                 
  28:  2euc-A  2.3  3.4   61   108    7 PDB  MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN YFMB;                                 
  29:  1g2h-A  2.3  2.2   43    61   14 PDB  MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATORY PROTEIN TYRR HOMOLOG;           
  30:  2r0q-C  2.3  4.2   43   193   14 PDB  MOLECULE: PUTATIVE TRANSPOSON TN552 DNA-INVERTASE BIN3;              
  31:  2ef8-A  2.2  2.9   50    84   26 PDB  MOLECULE: PUTATIVE TRANSCRIPTION FACTOR;                             
  32:  3ivp-A  2.2  2.6   46   115    4 PDB  MOLECULE: PUTATIVE TRANSPOSON-RELATED DNA-BINDING PROTEIN;           
  33:  1utx-A  2.2  2.7   47    66   19 PDB  MOLECULE: CYLR2;                                                     
  34:  3g7d-A  2.2  2.4   42   418   10 PDB  MOLECULE: PHPD;                                                      
  35:  1umq-A  2.2  7.3   51    60    8 PDB  MOLECULE: PHOTOSYNTHETIC APPARATUS REGULATORY PROTEIN;               
  36:  2jn6-A  2.1  3.7   48    97    6 PDB  MOLECULE: PROTEIN CGL2762;                                           
  37:  3bd1-A  2.1  2.5   42    65   24 PDB  MOLECULE: CRO PROTEIN;                                               
  38:  1fse-B  2.1  4.4   46    70   15 PDB  MOLECULE: GERE;                                                      
  39:  1l3l-A  2.0  4.4   48   233    2 PDB  MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL ACTIVATOR PROTEIN TRAR;                    
  40:  2ibd-A  2.0  5.3   43   192    9 PDB  MOLECULE: POSSIBLE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;

Pairwise Structural Alignments

Notation: three-state secondary structure definitions by DSSP (reduced to H=helix, E=sheet, L=coil) are shown above the amino acid sequence. Structurally equivalent residues are in uppercase, structurally non-equivalent residues (e.g. in loops) are in lowercase. Amino acid identities are marked by vertical bars.

No 1: Query=mol1A Sbjct=1ic8B Z-score=3.9

back to top 
DSSP  ------lllllllllllLLLLLL---LHHHHHHHHHHHHL--LLLHHHHHHHLLLLHHHH
Query ------mghhhhhhshmLPPEQW---SHTTVRNALKDLLK--DMNQSSLAKECPLSQSMI   49
ident                     |         |    |  |      |        | ||  
Sbjct ilkelenlspeeaahqkAVVETLlqeDPWRVAKMVKSYLQqhNIPQREVVDTTGLNQSHL   60
DSSP  lllllllllhhhhhhhhHHHHHHlllLHHHHHHHHHHHHHhlLLLHHHHHHHHLLLHHHH


DSSP  HHHHLLllLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHL-------------------------------
Query SSIVNStyYANVSAAKCQEFGRWYKHFKK-------------------------------   78
ident |   |          |      ||                                    
Sbjct SQHLNK--GTPMKTQKRAALYTWYVRKQRevaqqfthrnrfkwgpasqqilfqayerqkn  118
DSSP  HHHHHL--LLLLLHHHHHHHHHHHHHHLLlllllllllllllllhhhhhhhhhhhhllll


DSSP  --------------------------------------------------lllll
Query --------------------------------------------------tkdmm   83
ident                                                        
Sbjct pskeeretlveecnraeciqrgvspsqaqglgsnlvtevrvynwfanrrkeeafr  173
DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllhhhlllhhhhhhhhhhhhhlllll

No 2: Query=mol1A Sbjct=2ppxA Z-score=3.7

back to top 
DSSP  llllllllllllllllllhhhhhHHHHHHHL--LLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHHLLlll
Query mghhhhhhshmlppeqwshttvrNALKDLLK--DMNQSSLAKECPLSQSMISSIVNStyy   58
ident                           |         |                       
Sbjct ----------------------xPRIKIIRRalKLTQEEFSARYHIPLGTLRDWEQG--r   36
DSSP  ----------------------lLHHHHHHHhlLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHLL--l


DSSP  llLLLHHHHHHHHHHHHHHL-lllll
Query anVSAAKCQEFGRWYKHFKK-tkdmm   83
ident                           
Sbjct sePDQPARAYLKIIAVDPEGtaaalr   62
DSSP  llLLHHHHHHHHHHHHLHHHhhhhhl

No 3: Query=mol1A Sbjct=3d1nI Z-score=3.6

back to top 
DSSP  lllllllllllllllllLHHHHHHHHHHHHL--LLLHHHHHHHLL------LLHHHHHHH
Query mghhhhhhshmlppeqwSHTTVRNALKDLLK--DMNQSSLAKECP------LSQSMISSI   52
ident                           |         |               ||| ||  
Sbjct --------------nxeEIREFAKNFKIRRLslGLTQTQVGQAXTategpaYSQSAISRF   46
DSSP  --------------lhhHHHHHHHHHHHHHHllLLLHHHHHHHHLllllllLLHHHHHHH


DSSP  HLLllLLLL--LLHHHHHHHHHHHHHHLL-------------------------------
Query VNStyYANV--SAAKCQEFGRWYKHFKKT-------------------------------   79
ident                      |                                      
Sbjct EKL--DITPksAQKLKPVLEKWLNEAELRnqegqqnlxefvggepskkrkrrtsftpqai  104
DSSP  HLL--LLLHhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhllllhhhhhlllllllllllllllhhhh


DSSP  -----------------------------------------llll
Query -----------------------------------------kdmm   83
ident                                              
Sbjct ealnayfeknplptgqeitexakelnydrevvrvwfsnrrqtlkn  149
DSSP  hhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhll

No 4: Query=mol1A Sbjct=1au7A Z-score=3.5

back to top 
DSSP  lllllllllllllllllLHHHHHHHHHHHHL--LLLHHHHHHHL------llLHHHHHHH
Query mghhhhhhshmlppeqwSHTTVRNALKDLLK--DMNQSSLAKEC------plSQSMISSI   52
ident                        |  |         |               ||  |   
Sbjct --------------gmrALEQFANEFKVRRIklGYTQTNVGEALaavhgsefSQTTICRF   46
DSSP  --------------lhhHHHHHHHHHHHHHHhhLLLHHHHHHHHhhllllllLHHHHHHH


DSSP  HLLllLLLL--LLHHHHHHHHHHHHHH---------------------------------
Query VNStyYANV--SAAKCQEFGRWYKHFK---------------------------------   77
ident  |                   |                                      
Sbjct ENL--QLSFknACKLKAILSKWLEEAEqkrrttisiaakdalerhfgehskpssqeimrm  104
DSSP  HLL--LLLHhhHHHHHHHHHHHHHHLLllllllllhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhh


DSSP  --------------------llllll
Query --------------------ktkdmm   83
ident                           
Sbjct aeelnlekevvrvwfcnrrqrekrvk  130
DSSP  hhhhlllhhhhhhhhhhhhhhlllll

No 5: Query=mol1A Sbjct=2o38B Z-score=3.5

back to top 
DSSP  lllllllllllllllllLHHHHHHHHHHHHL--LLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHHLLlll
Query mghhhhhhshmlppeqwSHTTVRNALKDLLK--DMNQSSLAKECPLSQSMISSIVNStyy   58
ident                         ||          |   |      |   |   |    
Sbjct ---------xpdaeerqTKLRLAYALNAVIDraRLSQAAAAARLGINQPKVSALRNY--k   49
DSSP  ---------llhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHhhLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHLL--l


DSSP  lLLLL-HHHHHHHHHhhhhhLLLL---------------ll
Query aNVSA-AKCQEFGRWykhfkKTKD---------------mm   83
ident                                          
Sbjct lEGFSvERLXTLLNAldqdvEIVIrkkprsraaarisvvaa   90
DSSP  lLLLLhHHHHHHHHHlleeeEEEEeellllllllleeeeel

No 6: Query=mol1A Sbjct=2a6cA Z-score=3.4

back to top 
DSSP  lllllllllllllllllLHHHHHHH-HHHHHL-LLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHHLLlll
Query mghhhhhhshmlppeqwSHTTVRNA-LKDLLK-DMNQSSLAKECPLSQSMISSIVNStyy   58
ident                              |      |   |      |   |        
Sbjct --------ihhhhhhxkXRSQLLIVlQEHLRNsGLTQFKAAELLGVTQPRVSDLXRG-ki   51
DSSP  --------lllllllhhHHHHHHHHhHHHHHLlLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHLL-lh


DSSP  LLLLLHHHHHHHHHHHHhhllllll
Query ANVSAAKCQEFGRWYKHfkktkdmm   83
ident    |                     
Sbjct DLFSLESLIDXITSIGLkveinikd   76
DSSP  HHLLHHHHHHHHHHLLLllllllll

No 7: Query=mol1A Sbjct=2w48B Z-score=3.2

back to top 
DSSP  lllllllllllllllLLLHHHHHHHHHHHHL--LLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHHLL---
Query mghhhhhhshmlppeQWSHTTVRNALKDLLK--DMNQSSLAKECPLSQSMISSIVNS---   55
ident                             |    || |   | |       ||        
Sbjct ---------------NSDDIRLIVKIAQLYYeqDMTQAQIARELGIYRTTISRLLKRgre   45
DSSP  ---------------LLLHHHHHHHHHHHHHhlLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHHHHhhh


DSSP  ---------------------------------------------------------lll
Query ---------------------------------------------------------tyy   58
ident                                                             
Sbjct qgivtiainydynenlwleqqlkqkfglkeavvassdglleeeqlsamgqhgallvdrll  105
DSSP  hlleeelllllhhhhhhhhhhhhhhhllleeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhl


DSSP  lllllhhhhhhhhhhhhhhllLLLL-----------------------------------
Query anvsaakcqefgrwykhfkktKDMM-----------------------------------   83
ident                                                             
Sbjct epgdiigfswgravrslvenlPQRSqsrqvicvpiiggpsgklesryhvntltygaaarl  165
DSSP  lllleeeelllhhhhhhhhllLLLLllllleeeellllllllllhhhlhhhhhhhhhhhh


DSSP  ------------------------------------------------------------
Query ------------------------------------------------------------   83
ident                                                             
Sbjct kaeshladfpalldnplirngimqsqhfktissywdsldvalvgigspairdganwhafy  225
DSSP  lleelllllllllllhhhhhhhhllhhhhhhhhhhlllleeeeelllllllllllhhhhl


DSSP  ------------------------------------------------------------
Query ------------------------------------------------------------   83
ident                                                             
Sbjct gseesddlnarhvagdicsrfydingglvdtnmsektlsiemaklrqarysigiamgeek  285
DSSP  lhhhhhhhhhhleeeeelleeeelllleellhhhhllllllhhhhhllleeeeellllll


DSSP  ----------------------------
Query ----------------------------   83
ident                             
Sbjct ysgilgalhgryinclvtnretaelllk  313
DSSP  hhhhhhhhhllllleeeeehhhhhhhll

No 8: Query=mol1A Sbjct=3g5gB Z-score=3.0

back to top 
DSSP  lllllllllllllllllLHHHHHHHHHHHHL--LLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHHLLlll
Query mghhhhhhshmlppeqwSHTTVRNALKDLLK--DMNQSSLAKECPLSQSMISSIVNStyy   58
ident                      |    |       | |  ||    |    || |      
Sbjct --------------esfLLSKVSFVIKKIRLekGMTQEDLAYKSNLDRTYISGIERN---   43
DSSP  --------------llhHHHHHHHHHHHHHHhlLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHLL---


DSSP  llLLLHhhHHHHHH---hhhHHLL----------llll
Query anVSAAkcQEFGRW---ykhFKKT----------kdmm   83
ident                                       
Sbjct -sRNLT--IKSLELimkgleVSDVvffemlikeilkhd   78
DSSP  -lLLLL--HHHHHHhhhhhlLLHHhhhhhhhhhhhlll

No 9: Query=mol1A Sbjct=1ojlD Z-score=3.0

back to top 
DSSP  ------------------------------------------------------------
Query ------------------------------------------------------------    0
ident                                                             
Sbjct hmigsspamqhllneiamvapsdatvlihgdsgtgkelvaralhacsarsdrplvtlnca   60
DSSP  llllllhhhhhhhhhhhhhlllllleeeellllllhhhhhhhhhhhllllllleeeeell


DSSP  ------------------------------------------------------------
Query ------------------------------------------------------------    0
ident                                                             
Sbjct alneslleselfghekgaftgadkrregrfveadggtlfldeigdisplmqvrllraiqe  120
DSSP  lllhhhhhhhhlllllllllllllllllllhhhllleeeeellllllhhhhhhhhhhhhl


DSSP  ------------------------------------------------------------
Query ------------------------------------------------------------    0
ident                                                             
Sbjct revqrvgsnqtisvdvrliaathrdlaeevsagrfrqdlyyrlnvvaiempslrqrredi  180
DSSP  leelllllllleellleeeeeelllhhhhhhlllllhhhhhhhlleeeelllhhhhlllh


DSSP  ------------------------------------------------------------
Query ------------------------------------------------------------    0
ident                                                             
Sbjct plladhflrrfaernrkvvkgftpqamdllihydwpgnirelenaieravvlltgeyise  240
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhlllllllllhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhlllllllh


DSSP  ------lLLLLLLlllllllLLLLHHHHHHHHHHHHLLL--LHHHHHHHLLLLHHHHHHH
Query ------mGHHHHHhshmlppEQWSHTTVRNALKDLLKDM--NQSSLAKECPLSQSMISSI   52
ident                      |             |     |    |             
Sbjct relplaiAATPIK------eIQPLVDVEKEVILAALEKTggNKTEAARQLGITRKTLLAK  294
DSSP  hhllhhhLLLLLL------lLLLHHHHHHHHHHHHHHLLllLHHHHHHHHLLLHHHHHHH


DSSP  HLLllllllllhhhhhhhhhhhhhhllllll
Query VNStyyanvsaakcqefgrwykhfkktkdmm   83
ident                                
Sbjct LSR----------------------------  297
DSSP  LLL----------------------------

No 10: Query=mol1A Sbjct=3dnvB Z-score=2.9

back to top 
DSSP  lllllllLLLLllllllLHHHHHHHHHHHHL--LLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHHLLlll
Query mghhhhhHSHMlppeqwSHTTVRNALKDLLK--DMNQSSLAKECPLSQSMISSIVNStyy   58
ident                  | |   || |         || |||     |  ||   |    
Sbjct -------FQKI-----ySPTQLANAMKLVRQqnGWTQSELAKKIGIKQATISNFENN--p   46
DSSP  -------LLLL-----lLHHHHHHHHHHHHHhlLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHL--h


DSSP  LLLLLHHHHhhhhhhhhhhllllll
Query ANVSAAKCQefgrwykhfkktkdmm   83
ident  |                       
Sbjct DNTTLTTFFkilqslelsmtlcdak   71
DSSP  HHLLHHHHHhhhhhlllllllllll

No 11: Query=mol1A Sbjct=1y9qA Z-score=2.8

back to top 
DSSP  lllllllllllllllllLHHHHHHHHHHHHL--LLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHHLLlll
Query mghhhhhhshmlppeqwSHTTVRNALKDLLK--DMNQSSLAKECPLSQSMISSIVNStyy   58
ident                        | || | |         |     |      |      
Sbjct -------------tdvxFKSQIANQLKNLRKsrGLSLDATAQLTGVSKAXLGQIERG--e   45
DSSP  -------------lhhhHHHHHHHHHHHHHHhlLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHLL--l


DSSP  llLLLHHHHHHHH-----------------------------------------------
Query anVSAAKCQEFGR-----------------------------------------------   71
ident      |                                                      
Sbjct ssPTIATLWKIASgleasfsaffandpqllssersfpddlnxkihtlfpyaadtgleife  105
DSSP  llLLHHHHHHHHHhhllllhhhhllllhhhhhllllllllleeeeeeeeeelllleeeee


DSSP  ----------hhhHHHLL------------------------------------------
Query ----------wykHFKKT------------------------------------------   79
ident              |                                              
Sbjct itlldhhqqxsspHALGVieyihvlegixkvffdeqwhelqqgehirffsdqphgyaavt  165
DSSP  eeelllleeeellLLLLLeeeeeeeelleeeeelleeeeelllleeeeelllleeeeell


DSSP  --------LLLL-
Query --------KDMM-   83
ident              
Sbjct ekavfqniVAYPr  178
DSSP  lleeeeeeEELLl

No 12: Query=mol1A Sbjct=2d5vA Z-score=2.8

back to top 
DSSP  lllllllllllllLLLLLHHHHHHHHHHHHL--LLLHHHHHHHLL-lLHHHHHHHHLLll
Query mghhhhhhshmlpPEQWSHTTVRNALKDLLK--DMNQSSLAKECP-lSQSMISSIVNSty   57
ident               |      |       ||     |   |      ||   |       
Sbjct -------------MEEINTKEVAQRITTELKrySIPQAIFAQRVLcrSQGTLSDLLRNpk   47
DSSP  -------------LLLLLHHHHHHHHHHHHHhlLLLHHHHHHHHLllLHHHHHHHHHLll


DSSP  llllLLHHhHHHHHHHHHHHLL--------------------------------------
Query yanvSAAKcQEFGRWYKHFKKT--------------------------------------   79
ident           |  |                                              
Sbjct pwskLKSG-RETFRRMWKWLQEpefqrmsalrlprlvftdvqrrtlhaifkenkrpskel  106
DSSP  lhhhLLLL-HHHHHHHHHHHHLlhhhhhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhlllllhhh


DSSP  -------------------------llll
Query -------------------------kdmm   83
ident                              
Sbjct qitisqqlglelstvsnffmnarrrsldk  135
DSSP  hhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhlllll

No 13: Query=mol1A Sbjct=2bwjA Z-score=2.8

back to top 
DSSP  ---------------llLLLL--LLLL-----llllLLLLhHHHHHHHHHHHllllhhhh
Query ---------------mgHHHH--HHSH-----mlppEQWShTTVRNALKDLLkdmnqssl   38
ident                                                             
Sbjct gfmedlrkckiifiiggPGSGkgTQCEklvekygftHLST-GELLREELASE--------   51
DSSP  lhhhhhhhlleeeeeelLLLLhhHHHHhhhhhhlleEEEH-HHHHHHHHHHL--------


DSSP  hhhllllHHHHHHHHL-LLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHL-LLLL--------------
Query akecplsQSMISSIVN-STYYANVSAAKCQEFGRWYKHFKK-TKDM--------------   82
ident              |         |      |                             
Sbjct -------SERSKLIRDiMERGDLVPSGIVLELLKEAMVASLgDTRGflidgyprevkqge  104
DSSP  -------LHHHHHHHHhHHLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHLlLLLLeeeelllllhhhhh


DSSP  ------------------------------------------------------------
Query ------------------------------------------------------------   82
ident                                                             
Sbjct efgrrigdpqlvicmdcsadtmtnrllqmsrsslpvddttktiakrleayyrasipviay  164
DSSP  hhhhhllllleeeeeellhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  -------------------------------l
Query -------------------------------m   83
ident                                 
Sbjct yetktqlhkinaegtpedvflqlctaidsifl  196
DSSP  hhhhleeeeeellllhhhhhhhhhhhhhhhll

No 14: Query=mol1A Sbjct=3f51A Z-score=2.6

back to top 
DSSP  lllllllllllllllllLHHHHHHHHHHHHL--LLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHHLllll
Query mghhhhhhshmlppeqwSHTTVRNALKDLLK--DMNQSSLAKECPLSQSMISSIVNstyy   58
ident                         ||             ||     |    |        
Sbjct -------------peplLREALGAALRSFRAdkGVTLRELAEASRVSPGYLSELER----   43
DSSP  -------------llllHHHHHHHHHHHHHHhhLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHL----


DSSP  lllllhHHHHHHHH----------------------------hhhhhllllll
Query anvsaaKCQEFGRW----------------------------ykhfkktkdmm   83
ident          |                                           
Sbjct --grkeVSSELLASvchalgasvadvlieaagsmalqaaqedlarvlewshpq   94
DSSP  --llllLLHHHHHHhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll

No 15: Query=mol1A Sbjct=1vz0B Z-score=2.6

back to top 
DSSP  -----------lLLLLL-------------------------------------------
Query -----------mGHHHH-------------------------------------------    6
ident                                                             
Sbjct vvrlplasirpnPRQPRkrfaeeslkeladsirekgllqpllvrpqgdgyelvagerryr   60
DSSP  leeeehhheellLLLHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeelleeeeeelhhhhh


DSSP  -------------------------lllllllLLLLLHHHHHHHHHHHHL-LLLHHHHHH
Query -------------------------hhshmlpPEQWSHTTVRNALKDLLK-DMNQSSLAK   40
ident                                  |  |          ||     |   | 
Sbjct aalmaglqevpavvkdltdrealelalvenlqREDLSPVEEARGYQALLEmGLTQEEVAR  120
DSSP  hhhhhlllleeeeellllhhhhhhhhhhhhllLLLLLHHHHHHHHHHHHHlLLLHHHHHH


DSSP  HLLLLHHHHHHHHLL-----------------lLLLL------------lllhhhhhhhh
Query ECPLSQSMISSIVNS-----------------tYYAN------------vsaakcqefgr   71
ident       |                            |                        
Sbjct RVGKARSTVANALRLlqlppealealergeitaGHARallmlepedrlwglkeilekgls  180
DSSP  HHLLLHHHHHHHHHHhhllhhhhhhhhhllllhHHHHhhhlllhhhhhhhhhhhhhllll


DSSP  hhhhhhllllll
Query wykhfkktkdmm   83
ident             
Sbjct vrqaealrerla  192
DSSP  hhhhhlllhhhl

No 16: Query=mol1A Sbjct=2bnmA Z-score=2.6

back to top 
DSSP  lllllllllllllllllLHHHHHHHHHHHHL--LLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHHLllll
Query mghhhhhhshmlppeqwSHTTVRNALKDLLK--DMNQSSLAKECPLSQSMISSIVNstyy   58
ident                    |     |||      |    ||              |    
Sbjct ---------------ktASTGFAELLKDRREqvKMDHAALASLLGETPETVAAWEN---g   42
DSSP  ---------------lhHHHHHHHHHHHHHHhlLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHL---l


DSSP  llLLLHhhHHHHHHH---------------------------------------------
Query anVSAAkcQEFGRWY---------------------------------------------   73
ident                                                             
Sbjct egGELT--LTQLGRIahvlgtsigaltppagndlddgviiqmpderpilkgvrdnvdyyv  100
DSSP  llLLLL--HHHHHHHhhhlllllhhhllllllllllllllllhhhlleelllllllllee


DSSP  ------------------------------------------------------------
Query ------------------------------------------------------------   73
ident                                                             
Sbjct ynclvrtkrapslvplvvdvltdnpddakfnsghagneflfvlegeihmkwgdkenpkea  160
DSSP  eeelllllllllleeeeeeellllhhhlllllllllleeeeeeelleeeeelllllleee


DSSP  ------------------------hhhhllllll
Query ------------------------khfkktkdmm   83
ident                                   
Sbjct llptgasmfveehvphaftaakgtgsakliavnf  194
DSSP  eelllleeeellllleeeeelllllleeeeeeel

No 17: Query=mol1A Sbjct=2ebyA Z-score=2.5

back to top 
DSSP  llllllllllllllllllhHHHHHHHH-HHHL--LLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHHLLll
Query mghhhhhhshmlppeqwshTTVRNALK-DLLK--DMNQSSLAKECPLSQSMISSIVNSty   57
ident                    ||    |    |   |     ||          |   |   
Sbjct -----------------kpTTPGDILLyEYLEplDLKINELAELLHVHRNSVSALINN--   41
DSSP  -----------------llLLHHHHHHhHLLLllLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHLL--


DSSP  llllllhhHHHHHHHHHH-HHLL-------------------------------------
Query yanvsaakCQEFGRWYKH-FKKT-------------------------------------   79
ident           |        |  |                                     
Sbjct ----nrklTTEMAFRLAKvFDTTvdfwlnlqaavdlwevennmrtqeelgrietvaeyla   97
DSSP  ----llllLHHHHHHHHHhHLLLhhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhlllhhhhhh


DSSP  -llll
Query -kdmm   83
ident      
Sbjct rreer  102
DSSP  hhhhl

No 18: Query=mol1A Sbjct=2auwB Z-score=2.5

back to top 
DSSP  ------------------------------------------------------------
Query ------------------------------------------------------------    0
ident                                                             
Sbjct xneyffpkltavealapyrlrttwstgevlevdvgdilrkipdlapildpeafarvhiae   60
DSSP  lllllllleeeeeelllleeeeeelllleeeeelhhhhhhlhhhhhhhlhhhhllleell


DSSP  -------lLLLLLL----lllllllLLLLHHHHHHHHHHHHllLLHHHHHHHLLLLHHHH
Query -------mGHHHHH----hshmlppEQWSHTTVRNALKDLLkdMNQSSLAKECPLSQSMI   49
ident                             ||                   |     |    
Sbjct wegsvewfDTEFGRdnvyawakeqaGEVSHEXFGDWXHRNN--LSLTTAAEALGISRRXV  118
DSSP  lllleellLLLLLHhhhhhhhhhhlLLLLHHHHHHHHHHLL--LLHHHHHHHHLLLHHHH


DSSP  HHhhllllllLLLLHhhHHHHHH-HHHHHL--------lLLLL
Query SSivnstyyaNVSAAkcQEFGRW-YKHFKK--------tKDMM   83
ident |                                          
Sbjct SY----yrtaHKIIP--RTIWLAcLGWEATrpetktlprTLPA  155
DSSP  HH----hhllLLLLL--HHHHHHhHHHHHHlllllllllLLLL

No 19: Query=mol1A Sbjct=3cecA Z-score=2.5

back to top 
DSSP  llllllllllllllllllhHHHHHHHHHHHL--LLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHHLLlll
Query mghhhhhhshmlppeqwshTTVRNALKDLLK--DMNQSSLAKECPLSQSMISSIVNStyy   58
ident                            | |   | |    |     |   |    |    
Sbjct ----------------vrpIHPGEVIADILDdlDINTANFAEILGVSNQTIQEVING--q   42
DSSP  ----------------lllLLHHHHHHHHHHhhLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHLL--l


DSSP  llLLLHHHHHHHHHHHH------------------------hhllllll
Query anVSAAKCQEFGRWYKH------------------------fkktkdmm   83
ident            |                                     
Sbjct rsITVDIAIRLGKALGNgprlwlnlqqkvdlwyalqshkeeyeqvxtlv   91
DSSP  llLLHHHHHHHHHHHLLlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll

No 20: Query=mol1A Sbjct=1r71B Z-score=2.5

back to top 
DSSP  lllllllllllllLLLLLHHHHHHHHHHHHL-LLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHHL-----
Query mghhhhhhshmlpPEQWSHTTVRNALKDLLK-DMNQSSLAKECPLSQSMISSIVN-----   54
ident                              |         |||   |   |   |      
Sbjct -yneadqvienlqRNELTPREIADFIGRELAkGKKKGDIAKEIGKSPAFITQHVTlldlp   59
DSSP  -llhhhhhhhhhhLLLLLHHHHHHHHHHHHHlLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHHHhhlll


DSSP  --------------LLLLLL--------------lllhhhhhhhhhhhhhhllllll
Query --------------STYYAN--------------vsaakcqefgrwykhfkktkdmm   83
ident                |                                         
Sbjct ekiadafntgrvrdVTVVNElvtafkkrpeeveawldddtqeitrgtvkllreflde  116
DSSP  hhhhhhhhllllllHHHHHHhhhhhhhlhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhll

No 21: Query=mol1A Sbjct=2ntzA Z-score=2.5

back to top 
DSSP  llllllllllllllLLLLHH--HHHHHHHHHHL-LLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHHLL--
Query mghhhhhhshmlppEQWSHT--TVRNALKDLLK-DMNQSSLAKECPLSQSMISSIVNS--   55
ident                   |        |         |   |    |||           
Sbjct -------------qTALQHSirEIGLRLXRXKNdGXSQKDIAAKEGLSQAKVTRALQAas   47
DSSP  -------------lLLLLLLhhHHHHHHHHHHHlLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHHHHhl


DSSP  ----------------LLLLL---------------------------------------
Query ----------------TYYAN---------------------------------------   60
ident                                                             
Sbjct apeelvalfpvqseltFSDYKtlcavgdexgnlefdqliqnispeindilsieexaedev  107
DSSP  llhhhhhllllhhhllHHHHHhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllll


DSSP  -----------------------------------------------------lllhhhh
Query -----------------------------------------------------vsaakcq   67
ident                                                             
Sbjct knkilrlitkeaslltdkksvvtelwkfedkdrfarkrvkgrafsyefnrlskelqeeld  167
DSSP  hhhhhhhhlhhhhhhhllllleeellllllllleeeeelllllleeeeelllhhhhhhhh


DSSP  hhhhhhhhhhllllll
Query efgrwykhfkktkdmm   83
ident                 
Sbjct rxighilrksldkkpk  183
DSSP  hhhhhhhhhlllllll

No 22: Query=mol1A Sbjct=2k9nA Z-score=2.5

back to top 
DSSP  llllllllllllllllllHHHHHHHHHHHHLLL---LHHHHHHHL-LLLHHHHHHHHLL-
Query mghhhhhhshmlppeqwsHTTVRNALKDLLKDM---NQSSLAKEC-PLSQSMISSIVNS-   55
ident                          |  |                            |  
Sbjct --------------kvkfTEEEDLKLQQLVMRYgakDWIRISQLMiTRNPRQCRERWNNy   46
DSSP  --------------llllLHHHHHHHHHHHHHHlllLHHHHHHHLlLLLHHHHHHHHHHh


DSSP  -------------------------------------lLLLLlllhhhhhhhhhhhhhhl
Query -------------------------------------tYYANvsaakcqefgrwykhfkk   78
ident                                          |                  
Sbjct inpalrtdpwspeedmlldqkyaeygpkwnkiskflknRSDN----nirnrwmmiarhra  102
DSSP  lllllllllllhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhllLLHH----hhhhhhhhhhhhhh


DSSP  lllll
Query tkdmm   83
ident      
Sbjct khqks  107
DSSP  lllll

No 23: Query=mol1A Sbjct=1wtyA Z-score=2.4

back to top 
DSSP  lllllllllllllLLLL---------------LHHHHHHHHHHHHLLL------------
Query mghhhhhhshmlpPEQW---------------SHTTVRNALKDLLKDM------------   33
ident               |                              |              
Sbjct -------aslaraVERLkaalerpkdefirdsAIQRFEFTFELAWKTLktflelqglear   53
DSSP  -------llhhhhHHHHhhhhlllllhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhlllll


DSSP  LHHHHHH-----------hLLLL-HHHHHHHHLLLL--LLLLLLHHHHHHHHHHHHHHLL
Query NQSSLAK-----------eCPLS-QSMISSIVNSTY--YANVSAAKCQEFGRWYKHFKKT   79
ident                      |                 |    |               
Sbjct SPRAAIRgafqvgllpedpFWLExLELRNLTNHTYDeaLAERIYAELPKALERFQELLRR  113
DSSP  LHHHHHHhhhhhllllllhHHHHhHHHHHHHHHLLLhhHHHHHHLLHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  llll
Query kdmm   83
ident     
Sbjct -lee  116
DSSP  -hll

No 24: Query=mol1A Sbjct=2ofyA Z-score=2.4

back to top 
DSSP  lllllllllllllllllLHHHHHHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHHLLllLLL
Query mghhhhhhshmlppeqwSHTTVRNALKDLLKDMNQSSLAKECPLSQSMISSIVNStyYAN   60
ident                          |     |      |     |      |      | 
Sbjct -------rvpltaeeleRGQRLGELLRSARGDXSXVTVAFDAGISVETLRKIETG-rIAT   52
DSSP  -------lllllhhhhhHHHHHHHHHHHHHLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHLL-lLLL


DSSP  LLLHHH-------hhhhhhhhhhhllllll
Query VSAAKC-------qefgrwykhfkktkdmm   83
ident                               
Sbjct PAFFTIaavarvldlslddvaavvtfgpvs   82
DSSP  LLHHHHhhhhhhllllhhhhhlllllllll

No 25: Query=mol1A Sbjct=2ox6C Z-score=2.4

back to top 
DSSP  llllllllllllllLLLLhhhHHHHHHHHHL--LLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHHLLlll
Query mghhhhhhshmlppEQWShttVRNALKDLLK--DMNQSSLAKECPLSQSMISSIVNStyy   58
ident                             |                 |        |    
Sbjct --------------NIGL---NAIEMSYLRQslSLSAAQVGQLTNHSEAEVLAWENA---   40
DSSP  --------------LLLL---LHHHHHHHHHhlLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHLL---


DSSP  lllllhHHHHHHhHHHHHHLLLL-------------------------------------
Query anvsaaKCQEFGrWYKHFKKTKD-------------------------------------   81
ident                                                             
Sbjct --etqaPELAQKkLLDIDDIIEMqvlnttdgiealfkkepkrhlafvvyptqaiytqynp   98
DSSP  --llllLHHHHHhHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeeeelllhhhhhhhlh


DSSP  ------------------------------------------------------------
Query ------------------------------------------------------------   81
ident                                                             
Sbjct eflsslpltelyntaawrikkecklvlevdvslinlnveaykayreqnglsesresrakw  158
DSSP  hhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlleeeeeellhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhh


DSSP  ---ll
Query ---mm   83
ident      
Sbjct aatql  163
DSSP  hhlll

No 26: Query=mol1A Sbjct=2b5aA Z-score=2.4

back to top 
DSSP  lllllllllllllllllLHHHHHHHHHHHHL--LLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHHlllll
Query mghhhhhhshmlppeqwSHTTVRNALKDLLK--DMNQSSLAKECPLSQSMISSIVnstyy   58
ident                          ||         |  ||    |    ||        
Sbjct -----------mineieIKRKFGRTLKKIRTqkGVSQEELADLAGLHRTYISEVE----r   45
DSSP  -----------lllhhhHHHHHHHHHHHHHHhlLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHH----l


DSSP  llLLLHhhHHHHHH----hhhHHLL-----llll
Query anVSAAkcQEFGRW----ykhFKKT-----kdmm   83
ident                         |         
Sbjct gdRNIS--LINIHKicaaldiPASTffrkmeeen   77
DSSP  llLLLL--HHHHHHhhhhlllLHHHhhhhhhhll

No 27: Query=mol1A Sbjct=1cp9B Z-score=2.3

back to top 
DSSP  ------------------------------------------------------------
Query ------------------------------------------------------------    0
ident                                                             
Sbjct snvwlvgktkasgakaillngpqfgwfnpaytygiglhgagfnivgntpfaypailfghn   60
DSSP  leeeeellllllllleeeeeelllllllllleeeeeeeelleeeeeeeellllllleeel


DSSP  ------------------------------------------------------------
Query ------------------------------------------------------------    0
ident                                                             
Sbjct ghvswgstagfgdgvdifaeqvspedpnsylhqgqwkkmlsrqetlnvkgeqpitfeiyr  120
DSSP  lleeeeeeellllleeeeeeeeelleeeeeeelleeeeleeeeeeellllllleeeeeee


DSSP  ------------------------------------------------------------
Query ------------------------------------------------------------    0
ident                                                             
Sbjct tvhgnvvkrdktthtayskarawdgkeltslmawvkqgqaqnwqqwldqaqnqaltinwy  180
DSSP  lllleeeeeelllleeeeeeelllllhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhlllllleeee


DSSP  ------------------------------------------------------lLLLLL
Query ------------------------------------------------------mGHHHH    6
ident                                                             
Sbjct yadkdgnigyvhtghypdrqinhdprlpvsgtgewdwkgiqpfannpkvynpksgYIANW  240
DSSP  eeelllleeeeeellleelllllllllleelllllllleellhhhlleeelllllEEEEL


DSSP  ----------------lLLLL---------------------------llllllLHHHHH
Query ----------------hHSHM---------------------------lppeqwSHTTVR   23
ident                                                        |    
Sbjct nnspaknypasdlfaflWGSAdrvkeidnrieaydkltaddmwailqqtsrvdlNHRLFT  300
DSSP  lllllllllllllllllLLLLlllhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhlllLHHHHH


DSSP  HHHHHHHLLLLHHHHHhhllllHHHHHHHHLLllLLLL------------LLHHHHHHHH
Query NALKDLLKDMNQSSLAkecplsQSMISSIVNStyYANV------------SAAKCQEFGR   71
ident   |                       |                         |       
Sbjct PFLTQATQGLPSNDNS------VKLVSMLQQW--DGINqlssdgkhyihpGSAILDIWLK  352
DSSP  HHHHHHLLLLLLLLHH------HHHHHHHHLL--LLLLllllllllllllHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHHHLL-------LLLL-----------------------------------------
Query WYKHFKKT-------KDMM-----------------------------------------   83
ident                                                             
Sbjct EMLKATLGqtvpapfDKWYlasgyettqegptgslnistgakllyeslledkspisqsid  412
DSSP  HHHHHLHHhhllllhHHHLlllllllllllllllllllhhhhhhhhhhlhhhllllllll


DSSP  ------------------------------------------------------------
Query ------------------------------------------------------------   83
ident                                                             
Sbjct lfsgqpqndvirktlnttyqkmiekygdnpanwqtpataltfrennffgipqalpqenfh  472
DSSP  llllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhllllllleeellllllllllllllllee


DSSP  ------------------------------------------------------------
Query ------------------------------------------------------------   83
ident                                                             
Sbjct qneyhnrgtendlivfteegvsawdvvapgqsgfispqgkpsphyqdqlslyqqfgkkpl  532
DSSP  ellllllllleeeeeelllleeeeeellllllllllllllllllllllhhhhhlllleee


DSSP  ---------------------
Query ---------------------   83
ident                      
Sbjct wlnsedvapyiestetliier  553
DSSP  lllhhhhhhhlleeeeeeeel

No 28: Query=mol1A Sbjct=2eucA Z-score=2.3

back to top 
DSSP  lllllllllllllllllLHHHHHHHHHH-----------hhLLLL--HHHHHHHLLLLHH
Query mghhhhhhshmlppeqwSHTTVRNALKD-----------llKDMN--QSSLAKECPLSQS   47
ident                            |                                
Sbjct -----------xqyfspEQQYNAWIVSDlvkqifhkragcsPGIHelAVFAEEHFHIDID   49
DSSP  -----------lllllhHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhllllLLHHhhHHHHHHLLLLLHH


DSSP  HHHHHHLLLLLLLL-----LLHHHHHHHHHHHHHHLLL------------------lll
Query MISSIVNSTYYANV-----SAAKCQEFGRWYKHFKKTK------------------dmm   83
ident    ||                 |                                    
Sbjct FVFSIIXNIGDIEFaltdeIEKKLSGYLSTLLPYVTADxfetskanahaflsaayhlfv  108
DSSP  HHHHHHHLLLLLLLllllhHHHHHHHHHHHHHHHLLHHhhhhhhhhhhhhlllllllll

No 29: Query=mol1A Sbjct=1g2hA Z-score=2.3

back to top 
DSSP  lllllllllLLLL---------lllLLHHHHHHHHHHHHLL-LLHHHHHHHLLLLHHHHH
Query mghhhhhhsHMLP---------peqWSHTTVRNALKDLLKD-MNQSSLAKECPLSQSMIS   50
ident                                   ||           ||     |   | 
Sbjct ---------SAVIsldefenktldeIIGFYEAQVLKLFYAEyPSTRKLAQRLGVSHTAIA   51
DSSP  ---------LLLLllllllllllllLLLHHHHHHHHHHHHHlLLHHHHHHHLLLLLHHHH


DSSP  HHHLLllllllllhhhhhhhhhhhhhhllllll
Query SIVNStyyanvsaakcqefgrwykhfkktkdmm   83
ident                                  
Sbjct NKLKQ-----------------------ygigk   61
DSSP  HHHHL-----------------------lllll

No 30: Query=mol1A Sbjct=2r0qC Z-score=2.3

back to top 
DSSP  ------------------------------------------------------------
Query ------------------------------------------------------------    0
ident                                                             
Sbjct miigyarvssldqnlerqlenlktfgaekifteknrpilqkalnfvrmgdrfivesidrl   60
DSSP  leeeeelllllllllhhhhhhhhllllleeeellllhhhhhhhhhllllleeeellhhhh


DSSP  ------------------------------------------------------------
Query ------------------------------------------------------------    0
ident                                                             
Sbjct grnynevihtvnylkdkevqlmitslpmmnevignplldkfmkdliiqilamvseqerne  120
DSSP  lllhhhhhhhhhhhhhhlleeeelllllhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllh


DSSP  ---------------llllllllllllLLLLLLHHHHHHHHHHHHL-LLLHHHHHHHLLL
Query ---------------mghhhhhhshmlPPEQWSHTTVRNALKDLLK-DMNQSSLAKECPL   44
ident                                             |      |  |||   
Sbjct skrrqaqgiqvakekgvykgrpllyspNAKDPQKRVIYHRVVEMLEeGQAISKIAKEVNI  180
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllLLLLHHHHHHHHHHHHHHHlLLLHHHHHHHHLL


DSSP  LHHHHHHHHLLllllllllhhhhhhhhhhhhhhllllll
Query SQSMISSIVNStyyanvsaakcqefgrwykhfkktkdmm   83
ident        |                               
Sbjct TRQTVYRIKHD--------------------------ng  193
DSSP  LHHHHHHHHLL--------------------------ll

No 31: Query=mol1A Sbjct=2ef8A Z-score=2.2

back to top 
DSSP  lllllllllllllllllLHHHHHHHHHHHHL-LLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHHLLllll
Query mghhhhhhshmlppeqwSHTTVRNALKDLLK-DMNQSSLAKECPLSQSMISSIVNStyya   59
ident                      |    |        || ||    |||| || |       
Sbjct ----------ptihdhrYRXLVQLLTKLRKEaSLSQSELAIFLGLSQSDISKIESF----   46
DSSP  ----------lllllhhHHHHHHHHHHHHHHlLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHLL----


DSSP  llllhHHHHHHHH-------hhhhHLLL---------lll
Query nvsaaKCQEFGRW-------ykhfKKTK---------dmm   83
ident                                         
Sbjct --errLDALELFEllevvasrlglPMDIllkdtyesisks   84
DSSP  --lllLLHHHHHHhhhhhhhhhllLHHHhhhhhhhhllll

No 32: Query=mol1A Sbjct=3ivpA Z-score=2.2

back to top 
DSSP  lllllllllllllllllLHHHHHHHHHHHH-LLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHHLLllll
Query mghhhhhhshmlppeqwSHTTVRNALKDLL-KDMNQSSLAKECPLSQSMISSIVNStyya   59
ident                                                     | |     
Sbjct ----------kkedkydFRALGLAIKEARKkQGLTREQVGAXIEIDPRYLTNIENK----   46
DSSP  ----------lllllllLHHHHHHHHHHHHhLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHL----


DSSP  llllhHHHHHHHH-----------------------------------------------
Query nvsaaKCQEFGRW-----------------------------------------------   72
ident                                                             
Sbjct --gqhPSLQVLYDlvsllnvsvdefflpassqvkstkrrqlenkidnftdadlvixesva  104
DSSP  --lllLLHHHHHHhhhhhllllhhhhlllllllllhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhh


DSSP  hhhhhllllll
Query ykhfkktkdmm   83
ident            
Sbjct dgivkskevge  115
DSSP  hhhhhhhhhhl

No 33: Query=mol1A Sbjct=1utxA Z-score=2.2

back to top 
DSSP  llllllllllllllllllhHHHHhhHHHHHL--LLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHHLLlll
Query mghhhhhhshmlppeqwshTTVRnaLKDLLK--DMNQSSLAKECPLSQSMISSIVNStyy   58
ident                          ||         || ||     |   |  |      
Sbjct ------------------mIINN--LKLIREkkKISQSELAALLEVSRQTINGIEKN---   37
DSSP  ------------------lEEEL--HHHHHHhlLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHLL---


DSSP  lllllhHHHHHHHH-HHHHH------llllll
Query anvsaaKCQEFGRW-YKHFK------ktkdmm   83
ident                                 
Sbjct ---kynPSLQLALKiAYYLNtpledifqwqpe   66
DSSP  ---lllLLHHHHHHhHHHLLllhhhheeelll

No 34: Query=mol1A Sbjct=3g7dA Z-score=2.2

back to top 
DSSP  llllllllllllllllLLHHhhHHHHHHHHL--LLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHHlllll
Query mghhhhhhshmlppeqWSHTtvRNALKDLLK--DMNQSSLAKECPLSQSMISSIVnstyy   58
ident                          |              |    |              
Sbjct ----------------XRID--PFKLAHWXNarKYTAAQTADLAGLPLDDLRRLL-----   37
DSSP  ----------------LLLL--HHHHHHHHHhhLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHL-----


DSSP  llllLHHHHHH-------------------------------------------------
Query anvsAAKCQEF-------------------------------------------------   69
ident      |                                                      
Sbjct ----PAAATALaealsvepsqlaadahrnltvvhksaeexhasrrpiqrdgihfynyytl   93
DSSP  ----LHHHHHHhhhllllhhhlllllllllleeeelhhhhhhlleeeeelleeeeeeeel


DSSP  ------------------------------------------------------------
Query ------------------------------------------------------------   69
ident                                                             
Sbjct aapegrvapvvldilcpsdrlpalnnghlepaitvnlgpgdingrwgeeitpqtwrvlha  153
DSSP  llllllllleeeeellllllllllllllllleeeeeeeelleeeellllllllleeeell


DSSP  ------------------------------------------------------------
Query ------------------------------------------------------------   69
ident                                                             
Sbjct nhggdrwitgdsyvepsycphsyslagdaparivsytaqsnisplxteannwstgafeea  213
DSSP  llllllllllleeeelllllleeeellllleeeeeeelllllhhhhhhhllllhhhhhhh


DSSP  ------------------------------------------------------------
Query ------------------------------------------------------------   69
ident                                                             
Sbjct lkalsgkvsagsvldlflarrahtrtsaaeaagvppadleaalrspasetgltvlrtlgr  273
DSSP  hhhhlllllhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhlllhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhh


DSSP  ------------------------------------------------------------
Query ------------------------------------------------------------   69
ident                                                             
Sbjct algfdyrvllpaddqgvgktwttiedsrrsrrtfgtyeaasxasaahlpdlvgsflrvdd  333
DSSP  hhlllhhhhllllllllllllllhhhhhhlleeelleeeeelllllllllleeeeeeell


DSSP  ------------------------------------------------------------
Query ------------------------------------------------------------   69
ident                                                             
Sbjct lidhaenhyvvtegrltlewdgpdgpasvelepdgsawtgpfvrhrwhgtgtvlkfgsga  393
DSSP  llllleeeeeeeelleeeeeeelleeeeeeelllleeeellllleeeelleeeeeeeell


DSSP  -----------hhhhhhhhllllll
Query -----------grwykhfkktkdmm   83
ident                          
Sbjct hlgyqdwleltntfepaatlrrgrr  418
DSSP  lllhhhhhhhhllllhhhhhhhhhl

No 35: Query=mol1A Sbjct=1umqA Z-score=2.2

back to top 
DSSP  --lllLLLLLLLllllLLLLHHHHHHHHHHHHLLL--LHHHHHHHLLLLHHHHHHHH-LL
Query --mghHHHHHSHmlppEQWSHTTVRNALKDLLKDM--NQSSLAKECPLSQSMISSIV-NS   55
ident                                      | |  |            |    
Sbjct lakgeSLPPPPE---nPMSADRVRWEHIQRIYEMCdrNVSETARRLNMHRRTLQRILaKR   57
DSSP  lllllLLLLLLL---lLLLHHHHHHHHHHHHHHHLllLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHhLL


DSSP  LLLlllllhhhhhhhhhhhhhhllllll
Query TYYanvsaakcqefgrwykhfkktkdmm   83
ident                             
Sbjct SPR-------------------------   60
DSSP  LLL-------------------------

No 36: Query=mol1A Sbjct=2jn6A Z-score=2.1

back to top 
DSSP  lllllllllllllllLLLHhHHHHHHHHHHLL---LLHHHHHHHLLLLHHHHHHHHLL--
Query mghhhhhhshmlppeQWSHtTVRNALKDLLKD---MNQSSLAKECPLSQSMISSIVNS--   55
ident                  |          |            |                  
Sbjct -----------mptkTYSE-EFKRDAVALYENsdgASLQQIANDLGINRVTLKNWIIKyg   48
DSSP  -----------llllLLLH-HHHHHHHHHHLLhhhLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHhl


DSSP  -----------LLLLL----------lllhhhhhhhhhHHHHhllllll
Query -----------TYYAN----------vsaakcqefgrwYKHFkktkdmm   83
ident                                                  
Sbjct snhnvqgttpsAAVSEaeqirqlkkenalqrartrhpaESCLehhhhhh   97
DSSP  lllllllllllHHHHLhhhhhhhhhlhhhhhhllllllHHHHlllllll

No 37: Query=mol1A Sbjct=3bd1A Z-score=2.1

back to top 
DSSP  llllllllllllllllllhhhhhHHHHHHHLL-LLHHHHHHHLLLLHHHHHHHHLLllll
Query mghhhhhhshmlppeqwshttvrNALKDLLKD-MNQSSLAKECPLSQSMISSIVNStyya   59
ident                        ||           | ||      || ||         
Sbjct ----------------------mNAIDIAINKlGSVSALAASLGVRQSAISNWRAR----   34
DSSP  ----------------------lLHHHHHHHHhLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHH----


DSSP  llllhhHHHHHHHHHH----------hhllllll
Query nvsaakCQEFGRWYKH----------fkktkdmm   83
ident         |                         
Sbjct ---grvPAERCIDIERvtngavicrelrpdvfga   65
DSSP  ---lllLHHHHHHHHHhllllllhhhhlllllll

No 38: Query=mol1A Sbjct=1fseB Z-score=2.1

back to top 
DSSP  llLLLLLlllllllllllHHHHHHHHHHHHL-LLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHHLL-LLL
Query mgHHHHHhshmlppeqwsHTTVRNALKDLLK-DMNQSSLAKECPLSQSMISSIVNS-TYY   58
ident                    |        ||  |      | |   |              
Sbjct --EFQSK---------plLTKREREVFELLVqDKTTKEIASELFISEKTVRNHISNaMQK   49
DSSP  --LLLLL---------llLLHHHHHHHHHHLlLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHhHHH


DSSP  Lllllhhhhhhhhhhhhhhllllll
Query Anvsaakcqefgrwykhfkktkdmm   83
ident                          
Sbjct L----gvkgrsqavvellrmgelel   70
DSSP  H----llllhhhhhhhhhhhlllll

No 39: Query=mol1A Sbjct=1l3lA Z-score=2.0

back to top 
DSSP  ------------------------------------------------------------
Query ------------------------------------------------------------    0
ident                                                             
Sbjct qhwldkltdlaaiegdecilktgladiadhfgftgyaylhiqhrhitavtnyhrqwqsty   60
DSSP  llhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhlllleeeeeeeelleeeeeelllhhhhhhh


DSSP  ------------------------------------------------------------
Query ------------------------------------------------------------    0
ident                                                             
Sbjct fdkkfealdpvvkrarsrkhiftwsgeherptlskderafydhasdfgirsgitipikta  120
DSSP  hhllhhhllhhhhhhhhlllleeeehhhhlllllhhhhhhhhhhhllllleeeeeeeelh


DSSP  -------------------------------------------LLLLLLLllllllllll
Query -------------------------------------------MGHHHHHhshmlppeqw   17
ident                                                             
Sbjct ngfxsxftxasdkpvidldreidavaaaatigqiharisflrtTPTAEDA---------a  171
DSSP  hhleeeeeeeellllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlllLLLEELL---------l


DSSP  lHHHHHHHHHHHHL-LLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHHLL-LLLLllllhhhhhhhhhhhh
Query sHTTVRNALKDLLK-DMNQSSLAKECPLSQSMISSIVNS-TYYAnvsaakcqefgrwykh   75
ident                       |                                     
Sbjct wLDPKEATYLRWIAvGKTXEEIADVEGVKYNSVRVKLREaXKRF------dvrskahlta  225
DSSP  lLLHHHHHHHHHHLlLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHhHHHH------llllhhhhhh


DSSP  hhllllll
Query fkktkdmm   83
ident         
Sbjct lairrkli  233
DSSP  hhhhllll

No 40: Query=mol1A Sbjct=2ibdA Z-score=2.0

back to top 
DSSP  lllllllllllllllllLHHHHHHHHHHHHLLL---------LHHHHHHHLLLLHHHHHH
Query mghhhhhhshmlppeqwSHTTVRNALKDLLKDM---------NQSSLAKECPLSQSMISS   51
ident                       |  | |                   |            
Sbjct -----------------GKSGRRTELLDIAATLfaerglratTVRDIADAAGILSGSLYH   43
DSSP  -----------------LHHHHHHHHHHHHHHHhhhhlllllLHHHHHHHLLLLHHHHHH


DSSP  HHL---------------------------------------------------------
Query IVN---------------------------------------------------------   54
ident                                                             
Sbjct HFDskesxvdeilrgflddlfgkyreivasgldsratlealvttsyeaidashsavaiyq  103
DSSP  HLLlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhh


DSSP  ---------------------------------------lllllllllhhhhhhhhhhhh
Query ---------------------------------------styyanvsaakcqefgrwykh   75
ident                                                             
Sbjct devkhlvanerftylselntefrelwxgvleagvkdgsfrsdidvelafrflrdtawvav  163
DSSP  hllhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllhhhhhhhhhhhllhhh


DSSP  hhLLLLLL---------------------
Query fkKTKDMM---------------------   83
ident                              
Sbjct rwYRPGGSvtvdtvakqylsivldglasp  192
DSSP  hlLLLLLLllhhhhhhhhhhhhhhlllll