Diaphorina citri psyllid: psy11240


Local Sequence Feature Prediction

Prediction and MethodResult
Residue Number Marker
Protein Sequence ?
Secondary Structure (Consensus) ?
Disordered Region (Consensus) ?
Transmembrane Helix (Consensus) ?
Signal Peptide (Consensus) ?
Coiled Coil (COILS) ?
 
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MNTIHDVMIAGLGTSTSKEAKEYFSNMERHRILFKYSGDNDDAHIRMAFSKKLVDERKTWLTTWMEECRRRKEMGIGEDYLYTKTTKAITYTEFVNKELILFSNMDNERSIPSLCDGLKPGSRKVLFTCLKRNDRREVKVAQLAGSVAEHSAYHHGEQSLMSTIINLAQNFVGSNNINLLQPIGQFGTFLFIFESTNLSGAVVNALDFGSGGWRFESNDYKEYHTDTTVKFVVTMSPDKLHKAEMDGLHKVFKLQTTLAISSMCAFDRYGVLTKFDTTNQILKEFYAVRLEYYAKRKDYLEGVLGAEALKLTNQARFIVEKCDGDLRIENRKKKEMIAELIKRKYDSDPVKSWKMKQNKENAL

Function Prediction

Annotation transfered from Closely Related SWISS-PROT Entries ?

Annotation ?Function Description ?Confidence Level ?Reference Protein ?
DNA topoisomerase 2-beta Control of topological states of DNA by transient breakage and subsequent rejoining of DNA strands. Topoisomerase II makes double-strand breaks. Indirectly ivolved in vitamin D-coupled transcription regulation via its association with the WINAC complex, a chromatin-remodeling complex recruited by vitamin D receptor (VDR).confidentO42131
DNA topoisomerase 2-alpha Control of topological states of DNA by transient breakage and subsequent rejoining of DNA strands. Topoisomerase II makes double-strand breaks.confidentO46374
DNA topoisomerase 2-alpha Control of topological states of DNA by transient breakage and subsequent rejoining of DNA strands. Topoisomerase II makes double-strand breaks.confidentP41515

Prediction of Gene Ontology Terms ?

GO Term ?Description ?Confidence Level ?Parent GO Terms ?
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Prediction of Enzyme Commission Number ?

No confident prediction of EC number!


Spatial Structural Prediction

Structural Models Based on Templates

Template: 3QX3, chain A
Confidence level:very confident
Coverage over the Query: 18-76,87-358
View the alignment between query and template
View the model in PyMOL