Diaphorina citri psyllid: psy12430

Local Sequence Feature Prediction

Prediction and MethodResult
Residue Number Marker
Protein Sequence ?
Secondary Structure (Consensus) ?
Disordered Region (Consensus) ?
Transmembrane Helix (Consensus) ?
Signal Peptide (Consensus) ?
Coiled Coil (COILS) ?
 
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Function Prediction

Annotation transfered from Closely Related SWISS-PROT Entries ?

Annotation ?Function Description ?Confidence Level ?Reference Protein ?
Transcription factor SOX-5 Binds specifically to the DNA sequence 5'-AACAAT-3'. Activates transcription of COL2A1 and AGC1 in vitro.confidentP35711
Transcription factor SOX-5 Binds specifically to the DNA sequence 5'-AACAAT-3'. Activates transcription of COL2A1 and AGC1 in vitro.confidentP35710
Transcription factor Sox-6 Transcriptional activator. Binds specifically to the DNA sequence 5'-AACAAT-3'. Plays a key role in several developmental processes, including neurogenesis and skeleton formation.confidentB1H349

Prediction of Gene Ontology Terms ?

GO Term ?Description ?Confidence Level ?Parent GO Terms ?
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GO:0040007 [BP]growthprobableGO:0008150
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Prediction of Enzyme Commission Number ?

No EC number assigned to the protein, probably not an enzyme!

Spatial Structural Prediction

Structural Models Based on Templates

Template: 2GZK, chain A
Confidence level:very confident
Coverage over the Query: 1-100
View the alignment between query and template
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