Diaphorina citri psyllid: psy15151

Local Sequence Feature Prediction

Prediction and MethodResult
Residue Number Marker
Protein Sequence ?
Secondary Structure (Consensus) ?
Disordered Region (Consensus) ?
Transmembrane Helix (Consensus) ?
Signal Peptide (Consensus) ?
Coiled Coil (COILS) ?
 
--------10--------20--------30--------40--------50--------60--------70--------80--------90-------100-------110-------120-------130-------140-------150-------160-------170-------180-------190-------200-------210-------220-------230-------240-------250-------260-------270-------280-------290-------300-------310-------320-------330-------340-------350-------360-------370-------380-------390-------400-------410-------420-------430-
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ccccccccccccccccccccccHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHcccccccccccccHHHHHcccccEEEEEcccccEEEEEccccccccccccccEEEEEcccEEEEEccccccccccccEEEccccccccccccccHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHcccccccEEEEEcccccHHHHHHHHHHHHcccEEEEEEHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHccccEEEEEcccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHcccccccccEEEEEEccccccccccccccccccCEEccccccHHHHHHHHHHHcccccccccccHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHcccccccccc
*******************************DINSRTRLLDNEIKIMKSEVMR*****************KIKVNKNLPYLVSNVIELLDVDPQDTEEDGAVVDLDAQRKGKCAVIKTSTRQTYFLPVIGLVDAEKLKPGDLVGVNKDSYLILETLPAEYDARVKAMEVDERPTEQYSDIGGLDKQIQELIEAVVLPMTHKEKFVNLGIQPPKGVLLYGPPGTGKTLLARACAAQTKSTFLKLAGPQLVQMFIGDGAKLVRDAFALAKEKAPAIIFIDELDAIGTKRF*********VQRTMLELLNQLDGFSSTADIKVIAATNRVDILDPALLRSGRLDRKIEFPHPNEEARARIMQIHSRKMNVSPDVNYEELSRSTDDFNGAQCKAVCVEAGMIALRRGAAIVTHEDFMDAIMEVQ********YY*
xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx
xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx
MSGPATATLEDSSIWEGEESLGDDILRMSTDDINSRTRLLDNEIKIMKSEVMRISHELQAQNEKIRENTEKIKVNKNLPYLVSNVIELLDVDPQDTEEDGAVVDLDAQRKGKCAVIKTSTRQTYFLPVIGLVDAEKLKPGDLVGVNKDSYLILETLPAEYDARVKAMEVDERPTEQYSDIGGLDKQIQELIEAVVLPMTHKEKFVNLGIQPPKGVLLYGPPGTGKTLLARACAAQTKSTFLKLAGPQLVQMFIGDGAKLVRDAFALAKEKAPAIIFIDELDAIGTKRFDSEKAGDREVQRTMLELLNQLDGFSSTADIKVIAATNRVDILDPALLRSGRLDRKIEFPHPNEEARARIMQIHSRKMNVSPDVNYEELSRSTDDFNGAQCKAVCVEAGMIALRRGAAIVTHEDFMDAIMEVQAKKKANLNYYA

Function Prediction

Annotation transfered from Closely Related SWISS-PROT Entries ?

Annotation ?Function Description ?Confidence Level ?Reference Protein ?
26S protease regulatory subunit 6A homolog The 26S protease is involved in the ATP-dependent degradation of ubiquitinated proteins. The regulatory (or ATPase) complex confers ATP dependency and substrate specificity to the 26S complex.very confidentP46465
26S protease regulatory subunit 6A The 26S protease is involved in the ATP-dependent degradation of ubiquitinated proteins. The regulatory (or ATPase) complex confers ATP dependency and substrate specificity to the 26S complex (By similarity). In case of HIV-1 infection, suppresses Tat-mediated transactivation.very confidentP17980
26S protease regulatory subunit 6A The 26S protease is involved in the ATP-dependent degradation of ubiquitinated proteins. The regulatory (or ATPase) complex confers ATP dependency and substrate specificity to the 26S complex.very confidentO14126

Prediction of Gene Ontology Terms ?

GO Term ?Description ?Confidence Level ?Parent GO Terms ?
GO:0044444 [CC]cytoplasmic partvery confidentGO:0005737, GO:0044464, GO:0005623, GO:0005622, GO:0005575, GO:0044424
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GO:0048471 [CC]perinuclear region of cytoplasmconfidentGO:0005737, GO:0044464, GO:0005623, GO:0005622, GO:0005575, GO:0044444, GO:0044424
GO:0008540 [CC]proteasome regulatory particle, base subcomplexconfidentGO:0043234, GO:0005838, GO:0022624, GO:0044464, GO:0005623, GO:0005622, GO:0005575, GO:0000502, GO:0044424, GO:0032991
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GO:0006977 [BP]DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in cell cycle arrestconfidentGO:0051726, GO:0044699, GO:0010948, GO:0044773, GO:0044774, GO:0007165, GO:0035556, GO:0072331, GO:0050789, GO:0072401, GO:0090068, GO:0051716, GO:2000134, GO:0031570, GO:0031571, GO:0072395, GO:0010564, GO:0071158, GO:0065007, GO:1901988, GO:0048518, GO:0048519, GO:0071156, GO:1901990, GO:0030330, GO:0008150, GO:0009987, GO:0007346, GO:0050794, GO:0006974, GO:1901987, GO:0006950, GO:0044763, GO:0023052, GO:0007154, GO:0072413, GO:0042770, GO:0044700, GO:0007049, GO:0000077, GO:2000045, GO:0000075, GO:0072431, GO:0022402, GO:0072422, GO:0033554, GO:1901991, GO:0044783, GO:0007093, GO:0050896, GO:0048523, GO:0048522
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GO:0002479 [BP]antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-dependentconfidentGO:0002474, GO:0019882, GO:0019884, GO:0002478, GO:0002376, GO:0042590, GO:0008150, GO:0048002
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GO:0051437 [BP]positive regulation of ubiquitin-protein ligase activity involved in mitotic cell cycleconfidentGO:0009893, GO:0019222, GO:0031325, GO:0031323, GO:0051439, GO:0051438, GO:0050789, GO:0007049, GO:0080090, GO:0051340, GO:0010604, GO:0051246, GO:0051247, GO:0032270, GO:0044699, GO:0031398, GO:0031399, GO:0031396, GO:0065007, GO:0065009, GO:0043085, GO:0009987, GO:0000278, GO:0060255, GO:0050790, GO:0050794, GO:0048518, GO:0044763, GO:0032268, GO:0051443, GO:0022402, GO:0031401, GO:0051351, GO:0008150, GO:0044093, GO:0048522
GO:0045899 [BP]positive regulation of RNA polymerase II transcriptional preinitiation complex assemblyconfidentGO:0060260, GO:0009893, GO:0019222, GO:0031328, GO:0031326, GO:0031325, GO:0051173, GO:0031323, GO:0051128, GO:0010628, GO:0050789, GO:0080090, GO:0010604, GO:0044087, GO:0051171, GO:0009891, GO:2000112, GO:0019219, GO:2000142, GO:0065007, GO:0048518, GO:0010468, GO:0051130, GO:0045935, GO:0010556, GO:0060255, GO:0009889, GO:0050794, GO:0008150, GO:0045893, GO:2001141, GO:0043254, GO:0045898, GO:0051252, GO:0051254, GO:0006355, GO:0010557, GO:0006357, GO:0045944, GO:0048522
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Prediction of Enzyme Commission Number ?

No EC number assigned to the protein, probably not an enzyme!

Spatial Structural Prediction

Structural Models Based on Templates

Template: 4B4T, chain M
Confidence level:very confident
Coverage over the Query: 44-88,110-431
View the alignment between query and template
View the model in PyMOL