Diaphorina citri psyllid: psy15714

Local Sequence Feature Prediction

Prediction and MethodResult
Residue Number Marker
Protein Sequence ?
Secondary Structure (Consensus) ?
Disordered Region (Consensus) ?
Transmembrane Helix (Consensus) ?
Signal Peptide (Consensus) ?
Coiled Coil (COILS) ?
 
--------10--------20--------30--------40--------50--------60--------70--------80--------90-------100-------110-------120-------130-------140-------150-------160-------170-------180-------190-------200-----
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Function Prediction

Annotation transfered from Closely Related SWISS-PROT Entries ?

Annotation ?Function Description ?Confidence Level ?Reference Protein ?
Ras-related C3 botulinum toxin substrate 1 Plasma membrane-associated small GTPase which cycles between active GTP-bound and inactive GDP-bound states. In its active state, binds to a variety of effector proteins to regulate cellular responses such as secretory processes, phagocytosis of apoptotic cells, epithelial cell polarization and growth-factor induced formation of membrane ruffles. Rac1 p21/rho GDI heterodimer is the active component of the cytosolic factor sigma 1, which is involved in stimulation of the NADPH oxidase activity in macrophages. Essential for the SPATA13-mediated regulation of cell migration and adhesion assembly and disassembly (By similarity). Stimulates PKN2 kinase activity (By similarity). In concert with RAB7A, plays a role in regulating the formation of RBs (ruffled borders) in osteoclasts.very confidentQ6RUV5
Rho-related protein racB very confidentP34148
Ras-related C3 botulinum toxin substrate 1 Isoform B has an accelerated GEF-independent GDP/GTP exchange and an impaired GTP hydrolysis, which is restored partially by GTPase-activating proteins. It is able to bind to the GTPase-binding domain of PAK but not full-length PAK in a GTP-dependent manner, suggesting that the insertion does not completely abolish effector interaction.very confidentP63000

Prediction of Gene Ontology Terms ?

GO Term ?Description ?Confidence Level ?Parent GO Terms ?
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GO:0030866 [BP]cortical actin cytoskeleton organizationconfidentGO:0006996, GO:0007010, GO:0030029, GO:0071840, GO:0009987, GO:0030865, GO:0044763, GO:0030036, GO:0008150, GO:0044699, GO:0016043
GO:0071777 []positive regulation of cell cycle cytokinesisconfident
GO:0050807 [BP]regulation of synapse organizationconfidentGO:0044700, GO:0019226, GO:0032501, GO:0044707, GO:0035637, GO:0050803, GO:0050877, GO:0009987, GO:0044763, GO:0050794, GO:0051128, GO:0065007, GO:0008150, GO:0023052, GO:0007268, GO:0007267, GO:0007154, GO:0065008, GO:0050789, GO:0044699, GO:0003008
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GO:0048846 [BP]axon extension involved in axon guidanceconfidentGO:0048675, GO:0048666, GO:0044707, GO:0048589, GO:0048588, GO:0030030, GO:0030154, GO:0048468, GO:0031175, GO:0007411, GO:0009653, GO:0007275, GO:0044699, GO:0000902, GO:0000904, GO:0016049, GO:0040007, GO:0042330, GO:0048869, GO:0016043, GO:0032989, GO:0071840, GO:0060560, GO:0032502, GO:0048667, GO:0032501, GO:0006935, GO:0030182, GO:0009987, GO:0044767, GO:0044763, GO:0007409, GO:0048731, GO:0042221, GO:0022008, GO:0032990, GO:0040011, GO:0048699, GO:0048858, GO:0009605, GO:0050896, GO:0048856, GO:0007399, GO:0048812, GO:0008150
GO:0036089 [BP]cleavage furrow formationconfidentGO:0000910, GO:0044699, GO:0032506, GO:0009987, GO:0008150, GO:0022402, GO:0051301, GO:0044763, GO:0007049
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GO:0014057 [BP]positive regulation of acetylcholine secretionprobableGO:0060341, GO:0051047, GO:0051049, GO:0050804, GO:0014056, GO:0023051, GO:0051588, GO:0010646, GO:0050789, GO:0043269, GO:0051046, GO:0044057, GO:0065007, GO:0048518, GO:0051954, GO:0051050, GO:0050794, GO:0043270, GO:0051952, GO:0051590, GO:0046928, GO:0008150, GO:0051239, GO:0032879, GO:0031644, GO:0001956, GO:0051969, GO:0048522
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GO:0010119 [BP]regulation of stomatal movementprobableGO:0008150, GO:0065007, GO:0050789, GO:0050794
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GO:0050773 [BP]regulation of dendrite developmentprobableGO:0010975, GO:0030154, GO:0051128, GO:0050789, GO:0044699, GO:0050767, GO:0048869, GO:0060284, GO:0031344, GO:0045664, GO:0065007, GO:0032502, GO:0032501, GO:0050793, GO:0009987, GO:0050794, GO:0045595, GO:0008150, GO:0051239, GO:0022008, GO:0048699, GO:0044707, GO:0007399, GO:0048856, GO:0044763, GO:0051960, GO:2000026, GO:0007275, GO:0048731
GO:0050772 [BP]positive regulation of axonogenesisprobableGO:0022604, GO:0032502, GO:0044707, GO:0051239, GO:0022603, GO:0030154, GO:0051128, GO:0031344, GO:0044699, GO:0031346, GO:0050767, GO:0048869, GO:0060284, GO:0050769, GO:0045664, GO:0010769, GO:0065007, GO:0010720, GO:0048518, GO:0051130, GO:0032501, GO:0050793, GO:0009987, GO:0050794, GO:0045597, GO:0045595, GO:0008150, GO:0010975, GO:0022008, GO:0048699, GO:0050770, GO:0007399, GO:0051094, GO:0048856, GO:0044763, GO:0050789, GO:0051960, GO:2000026, GO:0007275, GO:0048731, GO:0048522
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GO:0005522 [MF]profilin bindingprobableGO:0003674, GO:0005488, GO:0005515
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GO:0071963 [BP]establishment or maintenance of cell polarity regulating cell shapeprobableGO:0022604, GO:0008360, GO:0022603, GO:0050793, GO:0009987, GO:0051128, GO:0008150, GO:0007163, GO:0044763, GO:0050794, GO:0065007, GO:0065008, GO:0050789, GO:0044699
GO:0032467 [BP]positive regulation of cytokinesisprobableGO:0090068, GO:0051726, GO:0010564, GO:0050794, GO:0050789, GO:0048518, GO:0051781, GO:0065007, GO:0032465, GO:0008150, GO:0051302, GO:0048522
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GO:0046326 [BP]positive regulation of glucose importprobableGO:0051050, GO:0051049, GO:0050789, GO:0010827, GO:0065007, GO:0046324, GO:0048518, GO:0008150, GO:0032879, GO:0010828
GO:0090037 [BP]positive regulation of protein kinase C signaling cascadeprobableGO:0090036, GO:0023051, GO:0009966, GO:0010740, GO:0048584, GO:0048583, GO:0050794, GO:0023056, GO:0065007, GO:0009967, GO:0048518, GO:0008150, GO:0010647, GO:0010646, GO:0010627, GO:0050789, GO:0048522
GO:0009086 [BP]methionine biosynthetic processprobableGO:0019752, GO:0044249, GO:0006807, GO:0009067, GO:0009066, GO:0044283, GO:1901576, GO:0044710, GO:0044711, GO:0006520, GO:0071704, GO:1901605, GO:1901607, GO:0009987, GO:0044238, GO:0000097, GO:0000096, GO:0009058, GO:0008150, GO:0008152, GO:0043436, GO:0008652, GO:1901564, GO:0006082, GO:1901566, GO:0044272, GO:0046394, GO:0006555, GO:0016053, GO:0044237, GO:0006790, GO:0044281
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GO:0060237 [BP]regulation of fungal-type cell wall organizationprobableGO:0008150, GO:0050794, GO:0065007, GO:0050789, GO:0051128
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GO:0010817 [BP]regulation of hormone levelsprobableGO:0008150, GO:0065008, GO:0065007
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Prediction of Enzyme Commission Number ?

No EC number assigned to the protein, probably not an enzyme!

Spatial Structural Prediction

Structural Models Based on Templates

Template: 2ATX, chain A
Confidence level:very confident
Coverage over the Query: 14-198
View the alignment between query and template
View the model in PyMOL