Diaphorina citri psyllid: psy16498

Local Sequence Feature Prediction

Prediction and MethodResult
Residue Number Marker
Protein Sequence ?
Secondary Structure (Consensus) ?
Disordered Region (Consensus) ?
Transmembrane Helix (Consensus) ?
Signal Peptide (Consensus) ?
Coiled Coil (COILS) ?
 
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Function Prediction

Annotation transfered from Closely Related SWISS-PROT Entries ?

Annotation ?Function Description ?Confidence Level ?Reference Protein ?
Sonic hedgehog protein Binds to the patched (PTC) receptor, which functions in association with smoothened (SMO), to activate the transcription of target genes. In the absence of SHH, PTC represses the constitutive signaling activity of SMO. Also regulates another target, the gli oncogene. Intercellular signal essential for a variety of patterning events during development: signal produced by the notochord that induces ventral cell fate in the neural tube and somites, and the polarizing signal for patterning of the anterior-posterior axis of the developing limb bud. Displays both floor plate- and motor neuron-inducing activity. The threshold concentration of N-product required for motor neuron induction is 5-fold lower than that required for floor plate induction.confidentQ15465
Desert hedgehog protein Intercellular signal essential for a variety of patterning events during development. May function as a spermatocyte survival factor in the testes. Essential for testes development.confidentQ61488
Protein hedgehog The hedgehog protein C-product, which mediates the autocatalytic activity, has no signaling activity.confidentQ02936

Prediction of Gene Ontology Terms ?

GO Term ?Description ?Confidence Level ?Parent GO Terms ?
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GO:0060135 [BP]maternal process involved in female pregnancyprobableGO:0044703, GO:0044702, GO:0048609, GO:0032504, GO:0044706, GO:0007565, GO:0022414, GO:0032501, GO:0008150, GO:0051704, GO:0044699, GO:0000003
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Prediction of Enzyme Commission Number ?

No EC number assigned to the protein, probably not an enzyme!

Spatial Structural Prediction

Structural Models Based on Templates

Template: 3N1G, chain B
Confidence level:very confident
Coverage over the Query: 2-75
View the alignment between query and template
View the model in PyMOL