Diaphorina citri psyllid: psy2159

Local Sequence Feature Prediction

Prediction and MethodResult
Residue Number Marker
Protein Sequence ?
Secondary Structure (Consensus) ?
Disordered Region (Consensus) ?
Transmembrane Helix (Consensus) ?
Signal Peptide (Consensus) ?
Coiled Coil (COILS) ?
 
--------10--------20--------30--------40--------50--------60--------70--------80--------90-------100-------110-------120-------130-------140-------150-------160-------170-------180-------190----
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cHHHHHHHHHHHHHHcccccEEEEEEEEcccccHHHHHHHHcccccccccccccccEEEEEEccEEEEEEEccccccccccHHcccccccEEEEEEEccccccHHHHHHHHHHHHcccccccccEEEEEccccccccccHHHHHHHHcccccccccccccccccccccEEEEEEcccccccHHHHHHHHHHccc
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Function Prediction

Annotation transfered from Closely Related SWISS-PROT Entries ?

Annotation ?Function Description ?Confidence Level ?Reference Protein ?
GTP-binding protein SAR1a Involved in transport from the endoplasmic reticulum to the Golgi apparatus. Required to maintain SEC16A localization at discrete locations on the ER membrane perhaps by preventing its dissociation. SAR1A-GTP-dependent assembly of SEC16A on the ER membrane forms an organized scaffold defining endoplasmic reticulum exit sites (ERES).very confidentQ3T0D7
Small COPII coat GTPase SAR1 Small GTPase component of the coat protein complex II (COPII) which promotes the formation of transport vesicles from the endoplasmic reticulum (ER). The coat has two main functions, the physical deformation of the endoplasmic reticulum membrane into vesicles and the selection of cargo molecules. SAR1 controls the coat assembly in a stepwise manner. Activated SAR1-GTP binds to membranes first and recruits the SEC23/24 complex. These SEC23/24-SAR1 prebudding intermediates are then collected by the SEC13/31 complex as subunits polymerize to form coated transport vesicles. Conversion to SAR1-GDP triggers coat release and recycles COPII subunits.very confidentQ6BVA7
GTP-binding protein SAR1a Involved in transport from the endoplasmic reticulum to the Golgi apparatus (By similarity). Required to maintain SEC16A localization at discrete locations on the ER membrane perhaps by preventing its dissociation. SAR1A-GTP-dependent assembly of SEC16A on the ER membrane forms an organized scaffold defining endoplasmic reticulum exit sites (ERES).very confidentQ9NR31

Prediction of Gene Ontology Terms ?

GO Term ?Description ?Confidence Level ?Parent GO Terms ?
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GO:0005912 [CC]adherens junctionprobableGO:0005575, GO:0070161, GO:0030054

Prediction of Enzyme Commission Number ?

No EC number assigned to the protein, probably not an enzyme!

Spatial Structural Prediction

Structural Models Based on Templates

Template: 1F6B, chain A
Confidence level:very confident
Coverage over the Query: 9-194
View the alignment between query and template
View the model in PyMOL