Diaphorina citri psyllid: psy2182

Local Sequence Feature Prediction

Prediction and MethodResult
Residue Number Marker
Protein Sequence ?
Secondary Structure (Consensus) ?
Disordered Region (Consensus) ?
Transmembrane Helix (Consensus) ?
Signal Peptide (Consensus) ?
Coiled Coil (COILS) ?
 
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cccccccccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHcccccccccccc
*****G*****************RVATNGVVTKIADYKRECPSIFAWEIRDRLLAEGVCNNDNIP**
xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx
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Function Prediction

Annotation transfered from Closely Related SWISS-PROT Entries ?

Annotation ?Function Description ?Confidence Level ?Reference Protein ?
Paired box protein Pax-8 Thought to encode a transcription factor. It may have a role in kidney cell differentiation. May play a regulatory role in mammalian development.confidentP47240
Paired box protein Pax-6 Transcription factor with important functions in the development of the eye, nose, central nervous system and pancreas. Required for the differentiation of pancreatic islet alpha cells. Competes with PAX4 in binding to a common element in the glucagon, insulin and somatostatin promoters (By similarity). Regulates specification of the ventral neuron subtypes by establishing the correct progenitor domains.confidentP63016
Paired box protein Pax-6 Transcription factor with important functions in the development of the eye, nose, central nervous system and pancreas. Required for the differentiation of pancreatic islet alpha cells (By similarity). Competes with PAX4 in binding to a common element in the glucagon, insulin and somatostatin promoters. Regulates specification of the ventral neuron subtypes by establishing the correct progenitor domains (By similarity). Isoform 5a appears to function as a molecular switch that specifies target genes.confidentP26367

Prediction of Gene Ontology Terms ?

GO Term ?Description ?Confidence Level ?Parent GO Terms ?
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Prediction of Enzyme Commission Number ?

No EC number assigned to the protein, probably not an enzyme!

Spatial Structural Prediction

Structural Models Based on Templates

Template: 2K27, chain A
Confidence level:very confident
Coverage over the Query: 2-62
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