Diaphorina citri psyllid: psy2518

Local Sequence Feature Prediction

Prediction and MethodResult
Residue Number Marker
Protein Sequence ?
Secondary Structure (Consensus) ?
Disordered Region (Consensus) ?
Transmembrane Helix (Consensus) ?
Signal Peptide (Consensus) ?
Coiled Coil (COILS) ?
 
--------10--------20--------30--------40--------50--------60--------70--------80--------90-------100-------110-------120-------130-------140-------150-------160-------170-------180-------190-------200-------21
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ccCEECccEEEEEEEEcccccccccEEEEEEEEcccEEEEEEEcccccccccccccEEEEEEEEEEEEEccEEEEEEEEcccccccccccHHHHHccccEEEEEEEcccHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccEEEEEEcccccccccccHHHHHHHHHHHcccEEEccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccccccc
*INRICEGEEVRLMLWDTAGQEEFDAITKAYYRGAQACVITFSTIDRDSFEAAHSWKMKVSIKRTIKECEGEEVRLMLWDTAGQEEFDAITKAYYRGAQACVITFSTIDRDSFEAAHSWKMKVENECGEIPTVLVQNKIDLLDQSVVAPEEADLLSRALGCRLMRTSVKEDINVNSIFRYLTTKCLSEL*******************
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MINRICEGEEVRLMLWDTAGQEEFDAITKAYYRGAQACVITFSTIDRDSFEAAHSWKMKVSIKRTIKECEGEEVRLMLWDTAGQEEFDAITKAYYRGAQACVITFSTIDRDSFEAAHSWKMKVENECGEIPTVLVQNKIDLLDQSVVAPEEADLLSRALGCRLMRTSVKEDINVNSIFRYLTTKCLSELRQQEEEYSINGNGLPPYTI

Function Prediction

Annotation transfered from Closely Related SWISS-PROT Entries ?

Annotation ?Function Description ?Confidence Level ?Reference Protein ?
GTP-binding protein ypt2 Protein transport. Probably involved in vesicular traffic.confidentP17609
Ras-related protein Rab-23 confidentP35288
Ras-related protein SEC4 Involved in exocytosis. Maybe by regulating the binding and fusion of secretory vesicles with the cell surface. The GTP-bound form of SEC4 may interact with an effector, thereby stimulating its activity and leading to exocytotic fusion. SEC4 may be an upstream activator of the 19.5S SEC8/SEC15 particle. SEC4 probably interacts directly with SEC8; it could serve as the attachment site for the SEC8/SEC15 particle.confidentP07560

Prediction of Gene Ontology Terms ?

GO Term ?Description ?Confidence Level ?Parent GO Terms ?
GO:0043231 [CC]intracellular membrane-bounded organelleconfidentGO:0044464, GO:0005623, GO:0005622, GO:0005575, GO:0043229, GO:0044424, GO:0043227, GO:0043226
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GO:0051117 [MF]ATPase bindingprobableGO:0003674, GO:0005515, GO:0019899, GO:0005488
GO:0044703 [BP]multi-organism reproductive processprobableGO:0022414, GO:0008150, GO:0000003
GO:0042992 [BP]negative regulation of transcription factor import into nucleusprobableGO:0033157, GO:0060341, GO:0051049, GO:0032386, GO:0032387, GO:0051223, GO:0051224, GO:0050789, GO:0032880, GO:0065007, GO:0048519, GO:0070201, GO:0051051, GO:0090317, GO:0050794, GO:0008150, GO:0042308, GO:0042306, GO:0032879, GO:0042990, GO:1900180, GO:0046822, GO:0046823
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GO:0051020 [MF]GTPase bindingprobableGO:0003674, GO:0005515, GO:0019899, GO:0005488
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GO:0006904 [BP]vesicle docking involved in exocytosisprobableGO:0046903, GO:0006810, GO:0016192, GO:0006887, GO:0044765, GO:0022406, GO:0048278, GO:0032940, GO:0044763, GO:0051649, GO:0008150, GO:0009987, GO:0051234, GO:0051179, GO:0044699, GO:0051641
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Prediction of Enzyme Commission Number ?

No EC number assigned to the protein, probably not an enzyme!

Spatial Structural Prediction

Structural Models Based on Templates

Template: 3TKL, chain A
Confidence level:very confident
Coverage over the Query: 22-189
View the alignment between query and template
View the model in PyMOL