Diaphorina citri psyllid: psy2717

Local Sequence Feature Prediction

Prediction and MethodResult
Residue Number Marker
Protein Sequence ?
Secondary Structure (Consensus) ?
Disordered Region (Consensus) ?
Transmembrane Helix (Consensus) ?
Signal Peptide (Consensus) ?
Coiled Coil (COILS) ?
 
--------10--------20--------30--------40--------50--------60--------70--------80--------90-------100-------110-------120-------130-------140-------150-------160-------170-------180-------190-------200-------210-------220-------23
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ccccccEEEEEcccccccccccccccccHHccccccHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHccccccccEEEcccccEEEEcccccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHccEEEcccccccccHHHHHHHHHHHcccccccCEEEcccccccccccHHHHHccccccccccccHHHHccccccccccccc
*****LSTVSLHNKYSNPYGNGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAAA***LEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETVYNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTIKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPGIVHRKCF
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MATRKLSTVSLHNKYSNPYGNGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAAASTSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETVYNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTIKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPGIVHRKCF

Function Prediction

Annotation transfered from Closely Related SWISS-PROT Entries ?

Annotation ?Function Description ?Confidence Level ?Reference Protein ?
Actin, cytoplasmic 1 Actins are highly conserved proteins that are involved in various types of cell motility and are ubiquitously expressed in all eukaryotic cells.very confidentQ6NVA9
Actin-5C Actins are highly conserved proteins that are involved in various types of cell motility and are ubiquitously expressed in all eukaryotic cells. Multiple isoforms are involved in various cellular functions such as cytoskeleton structure, cell mobility, chromosome movement and muscle contraction.very confidentP84185
Actin, cytoplasmic 1 Actins are highly conserved proteins that are involved in various types of cell motility and are ubiquitously expressed in all eukaryotic cells.very confidentQ5R1X3

Prediction of Gene Ontology Terms ?

GO Term ?Description ?Confidence Level ?Parent GO Terms ?
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Prediction of Enzyme Commission Number ?

No EC number assigned to the protein, probably not an enzyme!

Spatial Structural Prediction

Structural Models Based on Templates

Template: 2FXU, chain A
Confidence level:very confident
Coverage over the Query: 2-225
View the alignment between query and template
View the model in PyMOL