Diaphorina citri psyllid: psy3270

Local Sequence Feature Prediction

Prediction and MethodResult
Residue Number Marker
Protein Sequence ?
Secondary Structure (Consensus) ?
Disordered Region (Consensus) ?
Transmembrane Helix (Consensus) ?
Signal Peptide (Consensus) ?
Coiled Coil (COILS) ?
 
--------10--------20--------30--------40--------50--------60--------70--------80--------90-------100-------110-------120-------130-------140-------150-------160-------170-------180-------190-------200-------210-------220-------230-------240-------250-------260-------270-------280-------290-------300-------310-------320-------330-------340-------350-------360-------370-------380-------390-------400-------410-------420-------430-------440-------450-------460-------470-------480-------490-------500-------510-------520-------530-------540-------550-------560-------570-------580-------590-------600-------610-------620-------630-------640-------650-----
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*PISLDLSVAMNPKNTVFDAKRLIGRKFEDQKIQEDIKHWPFTVVSDGGKPKIQVEYKGEIKKFAPEEISSMVLTKMREIAEVYLGGKVSEAVITVPAYFNDSQRQATKDAGSIAGLNVLRIINEPTAAALAYGLDKNLKGEKNVLIFDLGGGTFDVSMREIAEVYLGGKVSEAVITVPAYFNDSQRQATKDAGSIAGLNVLRIINEPTAAALAYGLDKNLKGEKNVLIFDLGGGTFDVSVLAIDEGSLFQVKSTAGDTHLGGEDFDNRLVTFFADEFKRKHKKDILANTRAVRRLRTACERAKRTLSSSTEASLEIDALHEGIDFYSKITRARFEELCMDLFRQTLAPVERALNDAKLDKGSIHDVVLVGGSIRIPKIQKMLQDFFNGKSLNLSINPDEAVAYGAAVQAAILSGDTSSAIQDVLLVDVAPLSLGIETAGGVMTKIVERNSRIPCKQQQTFTTYSDNQNAVTIQVFEGERAMTKDNNLLGTFNLTGIPPAPRGVPKIEVTFDLDANGILNVSAKDSSTGKAERITIQNDKGRLSKDDIDRMLAEAEKYKAE********AAKNKLESYAFAV*****************SVSQACSATLTWLEGNSLAEKEEFEDRLKTLQQTCT********************
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Function Prediction

Annotation transfered from Closely Related SWISS-PROT Entries ?

Annotation ?Function Description ?Confidence Level ?Reference Protein ?
Heat shock 70 kDa protein 1A/1B In cooperation with other chaperones, Hsp70s stabilize preexistent proteins against aggregation and mediate the folding of newly translated polypeptides in the cytosol as well as within organelles. These chaperones participate in all these processes through their ability to recognize nonnative conformations of other proteins. They bind extended peptide segments with a net hydrophobic character exposed by polypeptides during translation and membrane translocation, or following stress-induced damage. In case of rotavirus A infection, serves as a post-attachment receptor for the virus to facilitate entry into the cell.very confidentP08107
Heat shock cognate 71 kDa protein Chaperone. May play a role in regulating apoptosis during embryonic development.very confidentO73885
Heat shock 70 kDa protein 1A In cooperation with other chaperones, Hsp70s stabilize preexistent proteins against aggregation and mediate the folding of newly translated polypeptides in the cytosol as well as within organelles. These chaperones participate in all these processes through their ability to recognize nonnative conformations of other proteins. They bind extended peptide segments with a net hydrophobic character exposed by polypeptides during translation and membrane translocation, or following stress-induced damage.very confidentQ27975

Prediction of Gene Ontology Terms ?

GO Term ?Description ?Confidence Level ?Parent GO Terms ?
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GO:0007286 [BP]spermatid developmentprobableGO:0048610, GO:0022412, GO:0048468, GO:0019953, GO:0032501, GO:0007276, GO:0000003, GO:0048869, GO:0048515, GO:0030855, GO:0002064, GO:0032502, GO:0030154, GO:0048609, GO:0032504, GO:0060429, GO:0009888, GO:0044767, GO:0022414, GO:0007283, GO:0044763, GO:0048232, GO:0007281, GO:0044699, GO:0044702, GO:0003006, GO:0048856, GO:0008150, GO:0009987
GO:0019915 [BP]lipid storageprobableGO:0008150, GO:0033036, GO:0010876, GO:0051179
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Prediction of Enzyme Commission Number ?

No EC number assigned to the protein, probably not an enzyme!

Spatial Structural Prediction

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