Diaphorina citri psyllid: psy3400

Local Sequence Feature Prediction

Prediction and MethodResult
Residue Number Marker
Protein Sequence ?
Secondary Structure (Consensus) ?
Disordered Region (Consensus) ?
Transmembrane Helix (Consensus) ?
Signal Peptide (Consensus) ?
Coiled Coil (COILS) ?
 
--------10--------20--------30--------40--------50--------60--------70--------80--------90-------100-------110-------120-------130-------140-------150-------160-------170-------180-------190-------200-------210-------220-------230-------240-------250-------260-------270-------280-------290-------300-------310-------320-------330-------340-------350-------360-------370-------380-------390-------400-------410-------
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cccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHcHHHcccccHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHccccHHHHHHcHHHHHHHHHHHcccccccccHHHHHHcccccccccHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHccccccEEEEEccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccc
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MATTTYLPASSVVASDLDGMNIVNTSIGYPSPRSVPDSGELKYQHHHHHHHHHQVPSSPSPNGHPVSLSAAHNPWVSLQPGAGADPWSSSMPGIHNHHHPHHHQQSPVDIKPPPDMHRTSHQHGGMGSPHSWHTPVVSSHYIPSGNSGAASPLQHHSAYHVNVMNGMLHHHQPSPQLHHSLRDIQAHSPSYSQSQHPDAPSGSEEDAPTSDDLEAFAKQFKQRRIKLGFTQADVGLALGTLYGNVFSQTTICRFEALQLSFKNMCKLKPLLQKWLEEADSTTGSPTSIDKIAAQGRKRKKRTSIEVTVKGALETHFHKQPKPSAQEITTLADSLQLEKEVVRVWFCNRRQKEKRMTPPNTLGGPQDGMMEGQLGMHGYHHPDLHGSPMGPHSHSHSHSPPMLSPSHQSMQSHQLTAH

Function Prediction

Annotation transfered from Closely Related SWISS-PROT Entries ?

Annotation ?Function Description ?Confidence Level ?Reference Protein ?
POU domain, class 3, transcription factor 1 May play a role in neuronal differentiation.confidentQ4QQQ7
Homeobox protein ceh-6 Vital for embryonic development and essential for the proper function of the excretory cell.confidentP20268
Silk gland factor 3 Involved in the transcriptional regulation of sericin-1 gene.confidentQ17237

Prediction of Gene Ontology Terms ?

GO Term ?Description ?Confidence Level ?Parent GO Terms ?
GO:0006355 [BP]regulation of transcription, DNA-dependentconfidentGO:0009889, GO:0080090, GO:0019222, GO:0060255, GO:0031326, GO:0031323, GO:0051252, GO:2000112, GO:0050794, GO:0050789, GO:0019219, GO:0010556, GO:0065007, GO:0051171, GO:2001141, GO:0008150, GO:0010468
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GO:0001077 [MF]RNA polymerase II core promoter proximal region sequence-specific DNA binding transcription factor activity involved in positive regulation of transcriptionconfidentGO:0003700, GO:0001228, GO:0003674, GO:0001071, GO:0000982, GO:0000981
GO:0000980 [MF]RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific DNA bindingconfidentGO:0005488, GO:0044212, GO:0043565, GO:0001067, GO:0003677, GO:0001012, GO:0001158, GO:0000976, GO:0000977, GO:0003676, GO:0000975, GO:0003674, GO:0097159, GO:1901363, GO:0035326
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GO:0050770 [BP]regulation of axonogenesisprobableGO:0022604, GO:0010975, GO:0022603, GO:0030154, GO:0051128, GO:0050789, GO:0044699, GO:0050767, GO:0048869, GO:0060284, GO:0031344, GO:0045664, GO:0010769, GO:0065007, GO:0032502, GO:0032501, GO:0050793, GO:0009987, GO:0050794, GO:0045595, GO:0008150, GO:0051239, GO:0022008, GO:0048699, GO:0044707, GO:0007399, GO:0048856, GO:0044763, GO:0051960, GO:2000026, GO:0007275, GO:0048731
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GO:0010171 [BP]body morphogenesisprobableGO:0032502, GO:0048856, GO:0044767, GO:0008150, GO:0009653, GO:0044699
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GO:0001714 [BP]endodermal cell fate specificationprobableGO:0048598, GO:0007492, GO:0030154, GO:0009790, GO:0009653, GO:0007275, GO:0044699, GO:0001706, GO:0001704, GO:0048869, GO:0001708, GO:0007369, GO:0048646, GO:0032502, GO:0032501, GO:0009987, GO:0009888, GO:0044767, GO:0044763, GO:0035987, GO:0001711, GO:0045165, GO:0044707, GO:0048856, GO:0060795, GO:0008150
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Prediction of Enzyme Commission Number ?

No EC number assigned to the protein, probably not an enzyme!

Spatial Structural Prediction

Structural Models Based on Templates

Template: 2XSD, chain C
Confidence level:very confident
Coverage over the Query: 207-279,303-357
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