Home/Protein

P03354

Gag-Pol polyprotein [Cleaved into: Matrix protein p19; p2A; p2B; p10; Capsid protein p27, alternate cleaved 1; Capsid protein p27, alternate cleaved 2; Spacer peptide (SP) (p3); Nucleocapsid protein p12 (NCp12); Protease p15 (EC 3.4.23.-); Reverse transcriptase beta-subunit (RT-beta); Reverse transcriptase alpha-subunit (RT-alpha) (EC 2.7.7.49) (EC 2.7.7.7) (EC 3.1.26.4); Integrase (IN) (EC 2.7.7.-) (EC 3.1.-.-) (pp32); p4]

UniProt

Domain Architecture(104 domains)

1234567891011121314151617181920212223242526272829303132333435363738394041424344454647484950515253545556575859606162636465666768697071727374757677787980818283848586878889909192939495969798991001011021031041269
e5kzaA1(A:-1-92)e5kzbA1(A:-1-102)e3tirA1(A:1-147)e5ejkA3(A:1-44)e5kz9A1(A:1-102)e5ejkB4(B:1-44)e5ejkC4(C:1-44)e5ejkD4(D:1-44)e5ejkE3(E:1-44)e5ejkF4(F:1-44)e5ejkG3(G:1-44)e5ejkH3(H:1-44)e6ccjA1(A:1-87)e6ce5A1(A:1-87)e6cusA1(A:1-87)e6cv8A1(A:1-87)e6cw4A1(A:1-87)e7jn3A2(A:1-44)e7jn3E1(E:1-44)e7ku7A2(A:1-44)e7ku7E1(E:1-44)e7kuiA1(A:1-44)e7kuiE2(E:1-44)e5ejkA2(A:45-215)e5ejkB3(B:45-215)e5ejkC3(C:45-215)e5ejkD3(D:45-215)e5ejkE2(E:45-215)e5ejkF3(F:45-215)e5ejkG2(G:45-215)e5ejkH2(H:45-215)e7jn3A3(A:45-215)e7jn3E3(E:45-215)e7ku7A1(A:45-215)e7ku7E3(E:45-215)e7kuiA2(A:45-215)e7kuiE3(E:45-215)e1c0mA2(A:52-198)e1c1aA2(A:52-198)e1c0mC2(C:52-198)e4fw2A2(A:52-215)e4fw1A1(A:52-215)e7jn3D1(D:52-215)e7jn3G2(G:52-215)e7jn3H1(H:52-215)e7ku7D1(D:52-215)e7ku7G2(G:52-215)e7ku7H1(H:52-215)e1c0mD2(D:54-198)e1c0mB2(B:54-198)e4fw1B2(B:54-212)e4fw2B2(B:54-212)e7jn3C1(C:54-215)e7ku7C1(C:54-215)e1c1aB2(B:55-198)e7jn3F2(F:56-215)e7ku7F2(F:56-215)e7kuiF1(F:56-215)e7jn3B1(B:57-215)e7ku7B2(B:57-215)e7kuiB2(B:57-215)e3tirA2(A:151-226)e4fw1B1(B:213-269)e4fw2B1(B:213-268)e5ejkB2(B:213-269)e5ejkC2(C:213-269)e5ejkD2(D:213-269)e5ejkE1(E:213-269)e5ejkF2(F:213-269)e5ejkG1(G:213-269)e5ejkH1(H:213-269)e7jn3A1(A:213-269)e7jn3E2(E:213-269)e7ku7A3(A:213-269)e7ku7E2(E:213-269)e7kuiA3(A:213-269)e7kuiE1(E:213-269)e4fw2A1(A:216-269)e4fw1A4(A:216-269)e5ejkA1(A:216-269)e7jn3B2(B:216-269)e7jn3C2(C:216-269)e7jn3D2(D:216-269)e7jn3F1(F:216-269)e7jn3G1(G:216-269)e7jn3H2(H:216-269)e7ku7B1(B:216-269)e7ku7C2(C:216-269)e7ku7D2(D:216-269)e7ku7F1(F:216-269)e7ku7G1(G:216-269)e7ku7H2(H:216-269)e7kuiB1(B:216-269)e7kuiF2(F:216-269)e1c0mA1(A:217-269)e1c1aA1(A:217-269)e1c0mD1(D:217-269)e1c1aB1(B:217-268)e1c0mB1(B:217-269)e1c0mC1(C:217-269)e7kuiC1(C:221-269)e7kuiD1(D:221-269)e7kuiG1(G:221-269)e7kuiH1(H:221-269)

3D Structure

Loading viewer...

Domain Details

#Domain IDRangeX-groupH-groupT-groupFamily
1e5kzaA1A:-1-92612612.1612.1.1
612.1.1.5(Retro_M)
2e5kzbA1A:-1-102612612.1612.1.1
612.1.1.5(Retro_M)
3e3tirA1A:1-147170170.2170.2.1
170.2.1.1(Gag_p24)
4e5ejkA3A:1-44101101.1101.1.1
101.1.1.14(Integrase_Zn)
5e5kz9A1A:1-102612612.1612.1.1
612.1.1.5(Retro_M)
6e5ejkB4B:1-44101101.1101.1.1
101.1.1.14(Integrase_Zn)
7e5ejkC4C:1-44101101.1101.1.1
101.1.1.14(Integrase_Zn)
8e5ejkD4D:1-44101101.1101.1.1
101.1.1.14(Integrase_Zn)
9e5ejkE3E:1-44101101.1101.1.1
101.1.1.14(Integrase_Zn)
10e5ejkF4F:1-44101101.1101.1.1
101.1.1.14(Integrase_Zn)
11e5ejkG3G:1-44101101.1101.1.1
101.1.1.14(Integrase_Zn)
12e5ejkH3H:1-44101101.1101.1.1
101.1.1.14(Integrase_Zn)
13e6ccjA1A:1-87612612.1612.1.1
612.1.1.5(Retro_M)
14e6ce5A1A:1-87612612.1612.1.1
612.1.1.5(Retro_M)
15e6cusA1A:1-87612612.1612.1.1
612.1.1.5(Retro_M)
16e6cv8A1A:1-87612612.1612.1.1
612.1.1.5(Retro_M)
17e6cw4A1A:1-87612612.1612.1.1
612.1.1.5(Retro_M)
18e7jn3A2A:1-44101101.1101.1.1
101.1.1.14(Integrase_Zn)
19e7jn3E1E:1-44101101.1101.1.1
101.1.1.14(Integrase_Zn)
20e7ku7A2A:1-44101101.1101.1.1
101.1.1.14(Integrase_Zn)
21e7ku7E1E:1-44101101.1101.1.1
101.1.1.14(Integrase_Zn)
22e7kuiA1A:1-44101101.1101.1.1
101.1.1.14(Integrase_Zn)
23e7kuiE2E:1-44101101.1101.1.1
101.1.1.14(Integrase_Zn)
24e5ejkA2A:45-21524842484.12484.1.1
25e5ejkB3B:45-21524842484.12484.1.1
26e5ejkC3C:45-21524842484.12484.1.1
27e5ejkD3D:45-21524842484.12484.1.1
28e5ejkE2E:45-21524842484.12484.1.1
29e5ejkF3F:45-21524842484.12484.1.1
30e5ejkG2G:45-21524842484.12484.1.1
31e5ejkH2H:45-21524842484.12484.1.1
32e7jn3A3A:45-21524842484.12484.1.1
33e7jn3E3E:45-21524842484.12484.1.1
34e7ku7A1A:45-21524842484.12484.1.1
35e7ku7E3E:45-21524842484.12484.1.1
36e7kuiA2A:45-21524842484.12484.1.1
37e7kuiE3E:45-21524842484.12484.1.1
38e1c0mA2A:52-19824842484.12484.1.1
39e1c1aA2A:52-19824842484.12484.1.1
40e1c0mC2C:52-19824842484.12484.1.1
41e4fw2A2A:52-21524842484.12484.1.1
42e4fw1A1A:52-21524842484.12484.1.1
43e7jn3D1D:52-21524842484.12484.1.1
44e7jn3G2G:52-21524842484.12484.1.1
45e7jn3H1H:52-21524842484.12484.1.1
46e7ku7D1D:52-21524842484.12484.1.1
47e7ku7G2G:52-21524842484.12484.1.1
48e7ku7H1H:52-21524842484.12484.1.1
49e1c0mD2D:54-19824842484.12484.1.1
50e1c0mB2B:54-19824842484.12484.1.1
51e4fw1B2B:54-21224842484.12484.1.1
52e4fw2B2B:54-21224842484.12484.1.1
53e7jn3C1C:54-21524842484.12484.1.1
54e7ku7C1C:54-21524842484.12484.1.1
55e1c1aB2B:55-19824842484.12484.1.1
56e7jn3F2F:56-21524842484.12484.1.1
57e7ku7F2F:56-21524842484.12484.1.1
58e7kuiF1F:56-21524842484.12484.1.1
59e7jn3B1B:57-21524842484.12484.1.1
60e7ku7B2B:57-21524842484.12484.1.1
61e7kuiB2B:57-21524842484.12484.1.1
62e3tirA2A:151-226170170.1170.1.1
63e4fw1B1B:213-26944.14.1.1
4.1.1.8(IN_DBD_C)
64e4fw2B1B:213-26844.14.1.1
4.1.1.8(IN_DBD_C)
65e5ejkB2B:213-26944.14.1.1
4.1.1.8(IN_DBD_C)
66e5ejkC2C:213-26944.14.1.1
4.1.1.8(IN_DBD_C)
67e5ejkD2D:213-26944.14.1.1
4.1.1.8(IN_DBD_C)
68e5ejkE1E:213-26944.14.1.1
4.1.1.8(IN_DBD_C)
69e5ejkF2F:213-26944.14.1.1
4.1.1.8(IN_DBD_C)
70e5ejkG1G:213-26944.14.1.1
4.1.1.8(IN_DBD_C)
71e5ejkH1H:213-26944.14.1.1
4.1.1.8(IN_DBD_C)
72e7jn3A1A:213-26944.14.1.1
4.1.1.8(IN_DBD_C)
73e7jn3E2E:213-26944.14.1.1
4.1.1.8(IN_DBD_C)
74e7ku7A3A:213-26944.14.1.1
4.1.1.8(IN_DBD_C)
75e7ku7E2E:213-26944.14.1.1
4.1.1.8(IN_DBD_C)
76e7kuiA3A:213-26944.14.1.1
4.1.1.8(IN_DBD_C)
77e7kuiE1E:213-26944.14.1.1
4.1.1.8(IN_DBD_C)
78e4fw2A1A:216-26944.14.1.1
4.1.1.8(IN_DBD_C)
79e4fw1A4A:216-26944.14.1.1
4.1.1.8(IN_DBD_C)
80e5ejkA1A:216-26944.14.1.1
4.1.1.8(IN_DBD_C)
81e7jn3B2B:216-26944.14.1.1
4.1.1.8(IN_DBD_C)
82e7jn3C2C:216-26944.14.1.1
4.1.1.8(IN_DBD_C)
83e7jn3D2D:216-26944.14.1.1
4.1.1.8(IN_DBD_C)
84e7jn3F1F:216-26944.14.1.1
4.1.1.8(IN_DBD_C)
85e7jn3G1G:216-26944.14.1.1
4.1.1.8(IN_DBD_C)
86e7jn3H2H:216-26944.14.1.1
4.1.1.8(IN_DBD_C)
87e7ku7B1B:216-26944.14.1.1
4.1.1.8(IN_DBD_C)
88e7ku7C2C:216-26944.14.1.1
4.1.1.8(IN_DBD_C)
89e7ku7D2D:216-26944.14.1.1
4.1.1.8(IN_DBD_C)
90e7ku7F1F:216-26944.14.1.1
4.1.1.8(IN_DBD_C)
91e7ku7G1G:216-26944.14.1.1
4.1.1.8(IN_DBD_C)
92e7ku7H2H:216-26944.14.1.1
4.1.1.8(IN_DBD_C)
93e7kuiB1B:216-26944.14.1.1
4.1.1.8(IN_DBD_C)
94e7kuiF2F:216-26944.14.1.1
4.1.1.8(IN_DBD_C)
95e1c0mA1A:217-26944.14.1.1
4.1.1.8(IN_DBD_C)
96e1c1aA1A:217-26944.14.1.1
4.1.1.8(IN_DBD_C)
97e1c0mD1D:217-26944.14.1.1
4.1.1.8(IN_DBD_C)
98e1c1aB1B:217-26844.14.1.1
4.1.1.8(IN_DBD_C)
99e1c0mB1B:217-26944.14.1.1
4.1.1.8(IN_DBD_C)
100e1c0mC1C:217-26944.14.1.1
4.1.1.8(IN_DBD_C)
101e7kuiC1C:221-26944.14.1.1
4.1.1.8(IN_DBD_C)
102e7kuiD1D:221-26944.14.1.1
4.1.1.8(IN_DBD_C)
103e7kuiG1G:221-26944.14.1.1
4.1.1.8(IN_DBD_C)
104e7kuiH1H:221-26944.14.1.1
4.1.1.8(IN_DBD_C)