Citrus Sinensis ID: 002684


Local Sequence Feature Prediction

Prediction and (Method)Result
Residue Number Marker
Protein Sequence ?
Secondary Structure (PSIPRED) ?
Secondary Structure Prediction (SSPRO) ?
Coil and Loop (DISEMBL) ?
Flexible Loop (DISEMBL) ?
Low Complexity Region (SEG) ?
Disordered region (IsUnstruct) ?
Disordered Region (DISOPRED) ?
Disordered Region (DISEMBL) ?
Disordered Region (DISPRO) ?
Transmembrane Helix (TMHMM) ?
Transmembrane Helix (HMMTOP) ?
Transmembrane Helix (MEMSAT) ?
TM Helix, Signal Peptide (MEMSAT_SVM) ?
TM Helix, Signal Peptide (Phobius) ?
Signal Peptide (SignalP HMM Mode) ?
Signal Peptide (SignalP NN Mode) ?
Coiled Coils (COILS) ?
Positional Conservation ?
 
--------10--------20--------30--------40--------50--------60--------70--------80--------90-------100-------110-------120-------130-------140-------150-------160-------170-------180-------190-------200-------210-------220-------230-------240-------250-------260-------270-------280-------290-------300-------310-------320-------330-------340-------350-------360-------370-------380-------390-------400-------410-------420-------430-------440-------450-------460-------470-------480-------490-------500-------510-------520-------530-------540-------550-------560-------570-------580-------590-------600-------610-------620-------630-------640-------650-------660-------670-------680-------690-------700-------710-------720-------730-------740-------750-------760-------770-------780-------790-------800-------810-------820-------830-------840-------850-------860-------870-------880-------890---
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no confident homologs detected

Close Homologs for Annotation Transfer

Close Homologs in SWISS-PROT Database Detected by BLAST ?

No hits with e-value below 0.001 by BLAST

Close Homologs in the Non-Redundant Database Detected by BLAST ?

GI ?Alignment Graph ?Length ? Definition ? Q cover ? H cover ? Identity ? E-value ?
Query893
255573801985 conserved hypothetical protein [Ricinus 0.968 0.878 0.837 0.0
359483090980 PREDICTED: uncharacterized protein LOC10 0.967 0.881 0.830 0.0
224087367949 predicted protein [Populus trichocarpa] 0.983 0.925 0.795 0.0
297793327945 hypothetical protein ARALYDRAFT_918999 [ 0.988 0.934 0.761 0.0
42568619945 uncharacterized protein [Arabidopsis tha 0.985 0.931 0.763 0.0
449442649957 PREDICTED: uncharacterized protein LOC10 0.961 0.897 0.785 0.0
9759536932 unnamed protein product [Arabidopsis tha 0.959 0.919 0.735 0.0
356495039948 PREDICTED: uncharacterized protein LOC10 0.978 0.921 0.758 0.0
356527439956 PREDICTED: uncharacterized protein LOC10 0.973 0.908 0.752 0.0
357148985946 PREDICTED: uncharacterized protein LOC10 0.961 0.908 0.626 0.0
>gi|255573801|ref|XP_002527820.1| conserved hypothetical protein [Ricinus communis] gi|223532794|gb|EEF34572.1| conserved hypothetical protein [Ricinus communis] Back     alignment and taxonomy information
 Score = 1534 bits (3971), Expect = 0.0,   Method: Compositional matrix adjust.
 Identities = 730/872 (83%), Positives = 805/872 (92%), Gaps = 7/872 (0%)

Query: 27  SYGSPSRKSGR-SSVFSLFNLRERSRFWSESVIRGDFDDLQSSSPGRVGVLNYTRAGNIA 85
           S  + SRK+GR SSVFSLFNL+E+SRFW+E+VIRGDFDDL+S SPG+ G +NYT+AGNIA
Sbjct: 70  SGSNGSRKTGRLSSVFSLFNLKEKSRFWNEAVIRGDFDDLKSLSPGKAGAINYTKAGNIA 129

Query: 86  NYLKLMEVDSMYLPVPVNFIFIGFEGNGNQDFQLHPDELERWFLKIDHIFEHTRVPPIGE 145
           NYL L EVDS+YLPVPVNFIFIGFEG GNQ+F+LHP+ELERWF KIDH+FEHTR+P IGE
Sbjct: 130 NYLMLQEVDSLYLPVPVNFIFIGFEGKGNQEFKLHPEELERWFTKIDHVFEHTRIPQIGE 189

Query: 146 VLAPFYRTSVDKVQRHHLPTISHINYNFSVHAIQMGEKVTSVFEHAIKVLARKDDVSTNR 205
           VL PFY+ S+DK QRHHLP ISHINYNFSVHAIQMGEKVTS+FEHAI +LARKDDVS N 
Sbjct: 190 VLTPFYKISIDKEQRHHLPIISHINYNFSVHAIQMGEKVTSIFEHAINILARKDDVSGNS 249

Query: 206 DDVDALWQVDVSMMDVLFTSLVDYLQLENAYNIFILNPKHE-KRARYGYRRGLSDSEITF 264
           +D D LWQVDV MMD+LFTSLVDYLQLENAYNIFILNPKH+ KRA+YGYRRGLS+SEI F
Sbjct: 250 NDEDVLWQVDVDMMDILFTSLVDYLQLENAYNIFILNPKHDLKRAKYGYRRGLSESEINF 309

Query: 265 LKENKDLQTKILQSGNIPESILALDKIRRPLYEKHPMMKFSWTIAEDTDTAEWYNICLDP 324
           LKENK LQTKIL+S  IPESIL L+KI+RPLYEKHPM KF+WTI EDTDT EWYNICL+ 
Sbjct: 310 LKENKSLQTKILKSETIPESILELEKIKRPLYEKHPMTKFAWTITEDTDTVEWYNICLNA 369

Query: 325 LNNVEKFYRGKETADIIQSKVLQLLKGKNEDLKFLLEKELKSGDLSNLHAECLTDSWIGN 384
           LNNVEK Y+GK+T+DIIQ+KV QLLKGKNED+K LLEK LKSGD  + H ECLTD+WIG 
Sbjct: 370 LNNVEKLYQGKDTSDIIQNKVHQLLKGKNEDMK-LLEKYLKSGDFGDFHTECLTDTWIGR 428

Query: 385 NRWAFIDLTAGPFSWGPAVGGEGVRTELSLPNVGKTIGAVEEISEDEAEDRLQDAIQEKF 444
           +RWAFIDLTAGPFSWGPAVGGEGVRTELSLPNV KTIGAV EISEDEAEDRLQ+AIQEKF
Sbjct: 429 DRWAFIDLTAGPFSWGPAVGGEGVRTELSLPNVTKTIGAVAEISEDEAEDRLQEAIQEKF 488

Query: 445 AVFGDKDHQAIDILLAEIDIYELFAFKHCKGRKVKLALCEELDERMQDLKNELQSFEGEE 504
           AVFG+KDHQAIDILLAEIDIYELFAFKHCKGRKVKLALCEELDERMQDLKNELQSFEGEE
Sbjct: 489 AVFGNKDHQAIDILLAEIDIYELFAFKHCKGRKVKLALCEELDERMQDLKNELQSFEGEE 548

Query: 505 YDENHKRKAIEALRRMENWNLFSDTHEEFQNYTVARDTFLAHLGATLWGSMRHVISPSIA 564
           YDE+HK+KAIEAL+RMENWNLFSDT+EEFQNYTVARDTFLAHLGATLWGSMRH+ISPSIA
Sbjct: 549 YDESHKKKAIEALKRMENWNLFSDTYEEFQNYTVARDTFLAHLGATLWGSMRHIISPSIA 608

Query: 565 DGAFHYYETISFQLFFITQEKVRQVKQLPVNLKSLMDGLSSLLLPSQKPVFSQRMLTLSE 624
           DGAFHYYE ISFQLFFITQEKVR VKQLPV+LK+LMDGLSSLLLPSQK +FSQ +L+LSE
Sbjct: 609 DGAFHYYEKISFQLFFITQEKVRNVKQLPVDLKALMDGLSSLLLPSQKAMFSQNLLSLSE 668

Query: 625 DPALAMAFSVARRAAAVPMLLVNGTYRKTVRSYVDSAILQYQLQRMNDRDSLKGAHAHSR 684
           D ALAMAFSVARRAAAVP+LLVNGTYRKT+RSY+DS+I+QYQLQR+ND  SL+GAHAHSR
Sbjct: 669 DSALAMAFSVARRAAAVPLLLVNGTYRKTIRSYLDSSIIQYQLQRLNDHVSLRGAHAHSR 728

Query: 685 STLEVPIFWFIHGDPLLVDKHYQAKALSDMVIVVQSEEPSWESHLQCNGQSLLWDLRSPI 744
           STLEVPIFWFI+G+PLLVDKHYQAKAL DMVI+VQSE  SWESHLQCNGQSLLWDLR PI
Sbjct: 729 STLEVPIFWFIYGEPLLVDKHYQAKALMDMVIIVQSEPSSWESHLQCNGQSLLWDLRRPI 788

Query: 745 KAALASVSEHLAGLLPLHLVYSQAHETAIEDWIWSVGCNPFSITSQGWHISQFQSDTIAR 804
           KAA+A+VSEHLAGLLPLHLVYS AHETAIEDWIWSVGCN FSITS+GWHISQFQSDTIAR
Sbjct: 789 KAAMAAVSEHLAGLLPLHLVYSHAHETAIEDWIWSVGCNLFSITSRGWHISQFQSDTIAR 848

Query: 805 SYIISTLEESIQTVNSAIHLLLMERTTEKTFKLFQSQERELVNKYNYVVSLWRRISTVTG 864
           SYII+TLEESIQ +NSAI  LLMERT+EKTF+LFQS+E+ELVNKYNYVVSLWRRIS++TG
Sbjct: 849 SYIITTLEESIQLINSAIRRLLMERTSEKTFRLFQSKEQELVNKYNYVVSLWRRISSITG 908

Query: 865 DLRYADAMRQLYTLEDASKGYGD----TVALL 892
           +L Y DAMR LYTLEDA+KG+ D    T+ALL
Sbjct: 909 ELHYVDAMRLLYTLEDAAKGFSDQVNATIALL 940




Source: Ricinus communis

Species: Ricinus communis

Genus: Ricinus

Family: Euphorbiaceae

Order: Malpighiales

Class:

Phylum: Streptophyta

Superkingdom: Eukaryota

>gi|359483090|ref|XP_002274115.2| PREDICTED: uncharacterized protein LOC100255062 [Vitis vinifera] Back     alignment and taxonomy information
>gi|224087367|ref|XP_002308138.1| predicted protein [Populus trichocarpa] gi|222854114|gb|EEE91661.1| predicted protein [Populus trichocarpa] Back     alignment and taxonomy information
>gi|297793327|ref|XP_002864548.1| hypothetical protein ARALYDRAFT_918999 [Arabidopsis lyrata subsp. lyrata] gi|297310383|gb|EFH40807.1| hypothetical protein ARALYDRAFT_918999 [Arabidopsis lyrata subsp. lyrata] Back     alignment and taxonomy information
>gi|42568619|ref|NP_200618.3| uncharacterized protein [Arabidopsis thaliana] gi|332009614|gb|AED96997.1| uncharacterized protein [Arabidopsis thaliana] Back     alignment and taxonomy information
>gi|449442649|ref|XP_004139093.1| PREDICTED: uncharacterized protein LOC101207480 [Cucumis sativus] Back     alignment and taxonomy information
>gi|9759536|dbj|BAB11002.1| unnamed protein product [Arabidopsis thaliana] Back     alignment and taxonomy information
>gi|356495039|ref|XP_003516388.1| PREDICTED: uncharacterized protein LOC100779643 [Glycine max] Back     alignment and taxonomy information
>gi|356527439|ref|XP_003532318.1| PREDICTED: uncharacterized protein LOC100800000 [Glycine max] Back     alignment and taxonomy information
>gi|357148985|ref|XP_003574960.1| PREDICTED: uncharacterized protein LOC100835558 [Brachypodium distachyon] Back     alignment and taxonomy information

Prediction of Gene Ontology (GO) Terms

Close Homologs with Gene Ontology terms Detected by BLAST ?

ID ? Alignment graph ? Length ? Definition ? Q cover ? H cover ? Identity ? E-value ?
Query893
TAIR|locus:2155846945 AT5G58100 [Arabidopsis thalian 0.985 0.931 0.723 0.0
DICTYBASE|DDB_G02850831020 DDB_G0285083 [Dictyostelium di 0.220 0.193 0.339 6e-60
TAIR|locus:2098423687 AT3G28720 "AT3G28720" [Arabido 0.309 0.401 0.247 3.4e-12
DICTYBASE|DDB_G0273745 808 DDB_G0273745 "transmembrane pr 0.170 0.188 0.239 1.5e-08
DICTYBASE|DDB_G0273189 808 DDB_G0273189 "transmembrane pr 0.170 0.188 0.239 1.5e-08
DICTYBASE|DDB_G0279945641 DDB_G0279945 [Dictyostelium di 0.372 0.519 0.219 2e-08
TAIR|locus:2155846 AT5G58100 [Arabidopsis thaliana (taxid:3702)] Back     alignment and assigned GO terms
 Score = 3418 (1208.3 bits), Expect = 0., P = 0.
 Identities = 639/883 (72%), Positives = 741/883 (83%)

Query:     6 SHTISTFSFFICLLLLF--QAXXXXXXXXXXXXXXXXXXLFNLRERSRFWSESVIRGDFD 63
             + ++S     IC+ +LF                      LFNLR++SRFWSESV R DFD
Sbjct:     8 NRSVSKLVLTICVAILFIPSLSYGASQGNRKTAKSSVFSLFNLRDKSRFWSESVFRTDFD 67

Query:    64 DLQSSSPGRVGVLNYTRAGNIANYLKLMEVDSMYLPVPVNFIFIGFEGNGNQDFQLHPDE 123
             DL+SS     GVLNYT++GNIA+YL+LMEVDS+YLPVPVNFIFIGFEG GNQDF+L P+E
Sbjct:    68 DLESSVHSNSGVLNYTKSGNIASYLELMEVDSVYLPVPVNFIFIGFEGKGNQDFKLRPEE 127

Query:   124 LERWFLKIDHIFEHTRVPPIGEVLAPFYRTSVDKVQRHHLPTISHINYNFSVHAIQMGEK 183
             LERWF K+DH+FEHTRVP I EVL PFY+ +++K  +HHLP IS +NYNFSVHAIQMGEK
Sbjct:   128 LERWFNKLDHMFEHTRVPQIKEVLNPFYKINIEKEVQHHLPIISRVNYNFSVHAIQMGEK 187

Query:   184 VTSVFEHAIKVLARKDDVSTNRDDVDALWQVDVSMMDVLFTSLVDYLQLENAYNIFILNP 243
             VTSV EHAIKVLARKDDV+TN+D+  AL QVD  MM+ +FTSLV+Y  LE+AYN+FILNP
Sbjct:   188 VTSVIEHAIKVLARKDDVATNKDEESALLQVDAEMMEFIFTSLVEYFHLEDAYNLFILNP 247

Query:   244 KHE-KRARYGYRRGLSDSEITFLKENKDLQTKILQSGNIPESILALDKIRRPLYEKHPMM 302
             KH+ K+A+YGYRRG S+SEI++LKENK++   +LQSG   E+ILA D +R+PLY++HPM+
Sbjct:   248 KHDNKKAKYGYRRGFSESEISYLKENKEILKNLLQSGKPSENILAFDMVRKPLYDRHPML 307

Query:   303 KFSWTIAEDTDTAEWYNICLDPLNNVEKFYRGKETADIIQSKVLQLLKGXXXXXXXXXXX 362
             KFSWT AE+TDTAEW+N C D LN +E+   GK+ A++IQSKVLQLL+G           
Sbjct:   308 KFSWTNAEETDTAEWFNACQDALNKLEQLSLGKDAAELIQSKVLQLLRGKNEDMKVFLEK 367

Query:   363 XXXSGDLSNLHAECLTDSWIGNNRWAFIDLTAGPFSWGPAVGGEGVRTELSLPNVGKTIG 422
                +GD SNL+AECLTD WIG  RWAFIDLTAGPFSWGP+VGGEGVRTELSLPNVG TIG
Sbjct:   368 DLRAGDFSNLNAECLTDIWIGKGRWAFIDLTAGPFSWGPSVGGEGVRTELSLPNVGTTIG 427

Query:   423 AVEEISEDEAEDRLQDAIQEKFAVFGDKDHQAIDILLAEIDIYELFAFKHCKGRKVKLAL 482
             AV EISEDEAED+LQ AIQ+KF+VFG+ DHQA+DILLAEID+YELFAFKHCKGRKVKLAL
Sbjct:   428 AVAEISEDEAEDKLQTAIQDKFSVFGENDHQAVDILLAEIDVYELFAFKHCKGRKVKLAL 487

Query:   483 CEELDERMQDLKNELQSFEGEEYDENHKRKAIEALRRMENWNLFSDTHEEFQNYTVARDT 542
             CEELDERM+DLK ELQSF+GEEYDE HKRKA++ALRRME+WNLFSD  EEFQNYTVARDT
Sbjct:   488 CEELDERMRDLKTELQSFDGEEYDETHKRKAMDALRRMESWNLFSDEREEFQNYTVARDT 547

Query:   543 FLAHLGATLWGSMRHVISPSIADGAFHYYETISFQLFFITQEKVRQVKQLPVNLKSLMDG 602
             FLAHLGATLWGSMRH+ISPS+ADGAFH+YE ISFQL FITQEKVRQ+KQLPV+LK+LMDG
Sbjct:   548 FLAHLGATLWGSMRHIISPSVADGAFHHYEKISFQLVFITQEKVRQIKQLPVDLKALMDG 607

Query:   603 LSSLLLPSQKPVFSQRMLTLSEDPXXXXXXXXXXXXXXXPMLLVNGTYRKTVRSYVDSAI 662
             LSSLLLPSQKP+FSQ MLTLSEDP               P+LLVNGTYRKTVRSY+DS+I
Sbjct:   608 LSSLLLPSQKPLFSQHMLTLSEDPALAMAFSVARRAAAVPLLLVNGTYRKTVRSYLDSSI 667

Query:   663 LQYQLQRMNDRDSLKGAHAHSRSTLEVPIFWFIHGDPLLVDKHYQAKALSDMVIVVQSEE 722
             LQYQLQR+ND  SLKG HAHSRSTLE+PIFW I GDPLL+DKHYQAKALS+MV+VVQSE 
Sbjct:   668 LQYQLQRVNDHTSLKGGHAHSRSTLEIPIFWLISGDPLLIDKHYQAKALSNMVVVVQSEA 727

Query:   723 PSWESHLQCNGQSLLWDLRSPIKAALASVSEHLAGLLPLHLVYSQAHETAIEDWIWSVGC 782
              SWESHLQCNG+SLLWDLRSP+KAA+ASV+EHLAGLLPLHLVYS AHE+AIEDW WSVGC
Sbjct:   728 SSWESHLQCNGRSLLWDLRSPVKAAMASVAEHLAGLLPLHLVYSVAHESAIEDWTWSVGC 787

Query:   783 NPFSITSQGWHISQFQSDTIARSYIISTLEESIQTVNSAIHLLLMERTTEKTFKLFQSQE 842
             NPFS+TSQGW +SQFQSDTIARSY+I+ LEESIQ VNS IHLL +ERT +KTFKLFQS+E
Sbjct:   788 NPFSVTSQGWLLSQFQSDTIARSYMITALEESIQAVNSGIHLLRLERTNKKTFKLFQSRE 847

Query:   843 RELVNKYNYVVSLWRRISTVTGDLRYADAMRQLYTLEDASKGY 885
             REL+NKY YVVSLWRR+S V G+ RY DAMR L+TLE+A+  +
Sbjct:   848 RELMNKYKYVVSLWRRLSNVAGETRYGDAMRFLHTLEEATSSF 890




GO:0005739 "mitochondrion" evidence=ISM
GO:0010584 "pollen exine formation" evidence=IMP
GO:0005794 "Golgi apparatus" evidence=IDA
GO:0005783 "endoplasmic reticulum" evidence=IDA
DICTYBASE|DDB_G0285083 DDB_G0285083 [Dictyostelium discoideum (taxid:44689)] Back     alignment and assigned GO terms
TAIR|locus:2098423 AT3G28720 "AT3G28720" [Arabidopsis thaliana (taxid:3702)] Back     alignment and assigned GO terms
DICTYBASE|DDB_G0273745 DDB_G0273745 "transmembrane protein" [Dictyostelium discoideum (taxid:44689)] Back     alignment and assigned GO terms
DICTYBASE|DDB_G0273189 DDB_G0273189 "transmembrane protein" [Dictyostelium discoideum (taxid:44689)] Back     alignment and assigned GO terms
DICTYBASE|DDB_G0279945 DDB_G0279945 [Dictyostelium discoideum (taxid:44689)] Back     alignment and assigned GO terms

Prediction of Enzyme Commission (EC) Number

EC Number Prediction by Annotation Transfer from SWISS-PROT Entries ?

No confident hit for EC number transfering in SWISSPROT detected by BLAST

EC Number Prediction by Ezypred Server ?

Fail to connect to Ezypred Server

EC Number Prediction by EFICAz Software ?

No EC number assignment, probably not an enzyme!


Prediction of Functionally Associated Proteins

Functionally Associated Proteins Detected by STRING ?

Fail to connect to STRING server


Conserved Domains and Related Protein Families

Conserved Domains Detected by RPS-BLAST ?

Conserved Domains Detected by HHsearch ?

No hit with probability above 80.00


Homologous Structure Templates

Structure Templates Detected by BLAST ?

No homologous structure with e-value below 0.005

Structure Templates Detected by RPS-BLAST ?

ID ?Alignment Graph ?Length ? Definition ? E-value ?
Query893
1vt4_I 1221 APAF-1 related killer DARK; drosophila apoptosome, 8e-15
1vt4_I 1221 APAF-1 related killer DARK; drosophila apoptosome, 6e-06
>1vt4_I APAF-1 related killer DARK; drosophila apoptosome, apoptosis, programmed cell death; HET: DTP; 6.90A {Drosophila melanogaster} PDB: 3iz8_A* Length = 1221 Back     alignment and structure
 Score = 78.0 bits (191), Expect = 8e-15
 Identities = 83/653 (12%), Positives = 189/653 (28%), Gaps = 159/653 (24%)

Query: 75  VLNYTRAGNIANYLKLMEVDSMY-LPVPVN---FIFIGFEGNGNQDFQLHPDELER---- 126
           V +  +     + L   E+D +      V+    +F        +  Q   +E+ R    
Sbjct: 38  VQDMPK-----SILSKEEIDHIIMSKDAVSGTLRLFWTLLSKQEEMVQKFVEEVLRINYK 92

Query: 127 WFL-------------KIDHIFEHTRVPPIGEVLAPFYRTSVDKVQ--RHHLPTISHINY 171
           + +                +I +  R+    +V A +  + +      R  L  +     
Sbjct: 93  FLMSPIKTEQRQPSMMTRMYIEQRDRLYNDNQVFAKYNVSRLQPYLKLRQALLELRPAKN 152

Query: 172 NFSVHAIQMGE--KVTSVFEHAIKVLARKDDVSTNRDDVDALWQVDV----SMMDVLFTS 225
              +    +    K  +    A+ V      V    D     W +++    S   VL   
Sbjct: 153 -VLIDG--VLGSGK--TWV--ALDVC-LSYKVQCKMDF-KIFW-LNLKNCNSPETVL--- 199

Query: 226 LVDYLQLENAYNIFILNPKHEKRARYGYRRGLSDSEITFLKENKDLQTKILQSGNIPESI 285
                 L+     + ++P    R+ +      S +    +   +    ++L+S      +
Sbjct: 200 ----EMLQKLL--YQIDPNWTSRSDH------SSNIKLRIHSIQAELRRLLKSKPYENCL 247

Query: 286 LALDKIRRPLYEKHPMMKFSWTI------AEDTDTAEWYNICLDPLNNVEKFYRGKETAD 339
           L L  ++            S  I       + TD           L++        E   
Sbjct: 248 LVLLNVQNAKAWNA--FNLSCKILLTTRFKQVTDFLSAATTTHISLDHHSMTLTPDEVKS 305

Query: 340 IIQSKVLQLLKGKNEDLKFLLEKELKSGD--LSNLHAECLTDSWIGNNRWAFIDLTAGPF 397
           ++  K L     + +DL     +E+ + +    ++ AE + D   G   W          
Sbjct: 306 LL-LKYLDC---RPQDLP----REVLTTNPRRLSIIAESIRD---GLATWDN-------- 346

Query: 398 SWGPAVGGEGVRTELSLPNVGKTIGA-VEEISEDEAEDRLQDAIQEKFAVFGDKD----H 452
            W            ++   +   I + +  +   E             +VF         
Sbjct: 347 -W----------KHVNCDKLTTIIESSLNVLEPAEYRKMFDR-----LSVF-PPSAHIPT 389

Query: 453 QAIDILLAEIDIYELFAF-KHCKGRKVKLALCEELDERMQ----DLKNELQSFEGEEYDE 507
             + ++  ++   ++            K +L E+  +        +  EL+  + E    
Sbjct: 390 ILLSLIWFDVIKSDVMVVVNKL----HKYSLVEKQPKESTISIPSIYLELKV-KLENEYA 444

Query: 508 NHKRKAIEALRRMENWNLFSDTHEEFQNYTVARDTFLAHLGATLWGSMRHVISPSIADGA 567
            H R  ++     + ++           Y      F +H+G        H+ +    +  
Sbjct: 445 LH-RSIVDHYNIPKTFDSDDLIPPYLDQY------FYSHIG-------HHLKNIEHPE-R 489

Query: 568 FHYYETISFQLFFITQEKVRQVKQLPVNLKSLMDGLSSL-----LLPSQKPVFSQRMLTL 622
              +  +     F+ ++K+R          S+++ L  L      +    P + + +  +
Sbjct: 490 MTLFRMVFLDFRFL-EQKIRHDSTAWNASGSILNTLQQLKFYKPYICDNDPKYERLVNAI 548

Query: 623 SEDPALAMAFSVARRAAAVPMLLVNGTYRKTVR---SYVDSAILQ---YQLQR 669
                  + F    +       L+   Y   +R      D AI +    Q+QR
Sbjct: 549 -------LDFL--PKIEEN---LICSKYTDLLRIALMAEDEAIFEEAHKQVQR 589


>1vt4_I APAF-1 related killer DARK; drosophila apoptosome, apoptosis, programmed cell death; HET: DTP; 6.90A {Drosophila melanogaster} PDB: 3iz8_A* Length = 1221 Back     alignment and structure

Structure Templates Detected by HHsearch ?

No hit with probability above 80.00


Homologous Structure Domains

Structure Domains Detected by RPS-BLAST ?

No hit with e-value below 0.005

Homologous Domains Detected by HHsearch ?

No hit with probability above 80.00