Psyllid ID: psy688


Local Sequence Feature Prediction

Prediction and (Method)Result
Residue Number Marker
Protein Sequence ?
Secondary Structure (PSIPRED) ?
Secondary Structure Prediction (SSPRO) ?
Coil and Loop (DISEMBL) ?
Flexible Loop (DISEMBL) ?
Low Complexity Region (SEG) ?
Disordered region (IsUnstruct) ?
Disordered Region (DISOPRED) ?
Disordered Region (DISEMBL) ?
Disordered Region (DISPRO) ?
Transmembrane Helix (TMHMM) ?
Transmembrane Helix (HMMTOP) ?
Transmembrane Helix (MEMSAT) ?
TM Helix, Signal Peptide (MEMSAT_SVM) ?
TM Helix, Signal Peptide (Phobius) ?
Signal Peptide (SignalP HMM Mode) ?
Signal Peptide (SignalP NN Mode) ?
Coiled Coils (COILS) ?
Positional Conservation ?
 
--------10--------20--------30--------40--------50--------60--------70--------80--------90-------100-------110-------120-------130-------140-------150-------160-------170-------180-------190-------200-------210-------220-------230-------240-------250-------260-------
MAARNLSIINTLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIINTLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIINTLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKRVRKM
cccccccccccccccccccccccccccHHHHHccccccccccccccccHHHcccccccccccccccccccccccccccccccccccccccHHHHccccccccccHHccccccccccccccccccccHHcccccccccccHHHHccccHHHcccHHHHHccccccccccccccccHHHHcccHHHHcccHHHHHHcHHHHcccHHHHcccHHHHccccccccccccccccccccccHHHHHHHccHHHHccccccccccccccccccc
ccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccc
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MAARNLSIINTLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIINTLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIINTLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIkslpyiiksLPYIIKRVRKM
MAARNLSIINTLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIINTLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIINTLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKRVRKM
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no confident homologs detected

Close Homologs for Annotation Transfer

Close Homologs in SWISS-PROT Database Detected by BLAST ?

No hits with e-value below 0.001 by BLAST

Close Homologs in the Non-Redundant Database Detected by BLAST ?

GI ?Alignment Graph ?Length ? Definition ? Q cover ? H cover ? Identity ? E-value ?
Query267
428162087217 hypothetical protein GUITHDRAFT_83234, p 0.767 0.944 0.419 5e-49
123404527 976 hypothetical protein [Trichomonas vagina 0.951 0.260 0.529 2e-47
123193288364 hypothetical protein [Trichomonas vagina 0.951 0.697 0.547 3e-47
123202800 378 hypothetical protein [Trichomonas vagina 0.962 0.679 0.536 1e-46
156390308269 predicted protein [Nematostella vectensi 0.962 0.955 0.237 3e-46
123425988 941 SLEI family protein [Trichomonas vaginal 0.947 0.268 0.539 7e-46
123193412357 hypothetical protein [Trichomonas vagina 0.955 0.714 0.533 7e-46
123239209331 hypothetical protein [Trichomonas vagina 0.958 0.773 0.535 4e-45
123258295 388 hypothetical protein [Trichomonas vagina 0.958 0.659 0.507 2e-44
123412971 397 hypothetical protein [Trichomonas vagina 0.955 0.642 0.509 8e-43
>gi|428162087|gb|EKX31284.1| hypothetical protein GUITHDRAFT_83234, partial [Guillardia theta CCMP2712] Back     alignment and taxonomy information
 Score =  200 bits (509), Expect = 5e-49,   Method: Compositional matrix adjust.
 Identities = 86/205 (41%), Positives = 142/205 (69%)

Query: 59  KSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLP 118
           ++LPY  ++LPY  ++LPY  ++LPY  ++LPY  ++LPY  ++LPY  ++LPY  ++LP
Sbjct: 1   QALPYTSRALPYASQALPYTSQALPYTSQALPYTSQALPYASRALPYTSQALPYTSQALP 60

Query: 119 YIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIINTLPYIIKSLPYIIK 178
           Y  ++LPY  ++LPY  ++LPY  ++LPY  ++LPY  ++LPY    LPY  ++LPY  +
Sbjct: 61  YASQALPYTSQALPYTSRALPYASQALPYTSQALPYTSQALPYTSQALPYASRALPYTSQ 120

Query: 179 SLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPY 238
           +LPY  ++LPY  ++LPY  ++LPY  ++LPY  ++LPY  ++LPY  ++LPY  ++LPY
Sbjct: 121 ALPYTSQALPYASQALPYTSQALPYTSQALPYTSQALPYTSQALPYTSQALPYTSQALPY 180

Query: 239 IIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKR 263
             ++LPY  ++LPY  ++L     R
Sbjct: 181 TSQALPYTSQALPYASQALLCCFTR 205




Source: Guillardia theta CCMP2712

Species: Guillardia theta

Genus: Guillardia

Family: Geminigeraceae

Order: Pyrenomonadales

Class: Cryptophyta

Phylum:

Superkingdom: Eukaryota

>gi|123404527|ref|XP_001302454.1| hypothetical protein [Trichomonas vaginalis G3] gi|121883743|gb|EAX89524.1| hypothetical protein TVAG_372360 [Trichomonas vaginalis G3] Back     alignment and taxonomy information
>gi|123193288|ref|XP_001282792.1| hypothetical protein [Trichomonas vaginalis G3] gi|121840818|gb|EAX69862.1| conserved hypothetical protein [Trichomonas vaginalis G3] Back     alignment and taxonomy information
>gi|123202800|ref|XP_001284171.1| hypothetical protein [Trichomonas vaginalis G3] gi|121845122|gb|EAX71241.1| conserved hypothetical protein [Trichomonas vaginalis G3] Back     alignment and taxonomy information
>gi|156390308|ref|XP_001635213.1| predicted protein [Nematostella vectensis] gi|156222304|gb|EDO43150.1| predicted protein [Nematostella vectensis] Back     alignment and taxonomy information
>gi|123425988|ref|XP_001306934.1| SLEI family protein [Trichomonas vaginalis G3] gi|121888535|gb|EAX94004.1| SLEI family protein [Trichomonas vaginalis G3] Back     alignment and taxonomy information
>gi|123193412|ref|XP_001282818.1| hypothetical protein [Trichomonas vaginalis G3] gi|121840916|gb|EAX69888.1| conserved hypothetical protein [Trichomonas vaginalis G3] Back     alignment and taxonomy information
>gi|123239209|ref|XP_001287557.1| hypothetical protein [Trichomonas vaginalis G3] gi|121855205|gb|EAX74627.1| conserved hypothetical protein [Trichomonas vaginalis G3] Back     alignment and taxonomy information
>gi|123258295|ref|XP_001289220.1| hypothetical protein [Trichomonas vaginalis G3] gi|121859852|gb|EAX76290.1| conserved hypothetical protein [Trichomonas vaginalis G3] Back     alignment and taxonomy information
>gi|123412971|ref|XP_001304188.1| hypothetical protein [Trichomonas vaginalis G3] gi|121885623|gb|EAX91258.1| conserved hypothetical protein [Trichomonas vaginalis G3] Back     alignment and taxonomy information

Prediction of Gene Ontology (GO) Terms

Close Homologs with Gene Ontology terms Detected by BLAST ?

ID ? Alignment graph ? Length ? Definition ? Q cover ? H cover ? Identity ? E-value ?
Query267
WB|WBGene00010924 279 M153.1 [Caenorhabditis elegans 0.498 0.476 0.488 4.9e-30
FB|FBgn0038516 273 CG5840 [Drosophila melanogaste 0.546 0.534 0.443 3.9e-28
ZFIN|ZDB-GENE-050522-26 362 zgc:110655 "zgc:110655" [Danio 0.494 0.364 0.451 1.7e-27
ZFIN|ZDB-GENE-040426-1675 320 pycr1 "pyrroline-5-carboxylate 0.494 0.412 0.459 4.5e-27
UNIPROTKB|B4DMU0 346 PYCR1 "Pyrroline-5-carboxylate 0.494 0.381 0.451 1.2e-26
UNIPROTKB|J3KQ22253 PYCR1 "Pyrroline-5-carboxylate 0.494 0.521 0.451 1.2e-26
UNIPROTKB|J3QKT4 242 PYCR1 "Pyrroline-5-carboxylate 0.494 0.545 0.451 1.2e-26
UNIPROTKB|J3QL24225 PYCR1 "Pyrroline-5-carboxylate 0.494 0.586 0.451 1.2e-26
UNIPROTKB|J3QL32217 PYCR1 "Pyrroline-5-carboxylate 0.494 0.608 0.451 1.2e-26
UNIPROTKB|P32322 319 PYCR1 "Pyrroline-5-carboxylate 0.494 0.413 0.451 1.2e-26
WB|WBGene00010924 M153.1 [Caenorhabditis elegans (taxid:6239)] Back     alignment and assigned GO terms
 Score = 332 (121.9 bits), Expect = 4.9e-30, P = 4.9e-30
 Identities = 66/135 (48%), Positives = 92/135 (68%)

Query:   162 MGAKITFDNKEVTLNSEVIILAVKP-HIVPVALNDIKPVFNESNLLISVAGGVPIKNMEQ 220
             +G   T DN EV   S+V+ LAVKP H+  VA ++I P  ++ +L++S+A G+ I+N+E 
Sbjct:    48 LGLNTTHDNAEVVQKSDVVFLAVKPVHVSKVA-SEIAPALSKEHLVVSIALGITIRNIES 106

Query:   221 ALPKNSRIIRAMPNTPALVRQGASVFVRGSSASDQDAQTVINLFKSVGTCEEVPEYLLDG 280
              LP  SR++R MPNTP++VR GAS F  GS+  D DA+TV  L  +VG   EVPE  +D 
Sbjct:   107 LLPTKSRVVRVMPNTPSVVRAGASAFAMGSACRDGDAETVEKLLSTVGFAVEVPEIHIDP 166

Query:   281 ITGLSGSGPAYRYEV 295
             +TGLSGSGP+Y + V
Sbjct:   167 VTGLSGSGPSYMFAV 181




GO:0004735 "pyrroline-5-carboxylate reductase activity" evidence=IEA
GO:0006561 "proline biosynthetic process" evidence=IEA
GO:0055114 "oxidation-reduction process" evidence=IEA
GO:0016491 "oxidoreductase activity" evidence=IEA
GO:0004616 "phosphogluconate dehydrogenase (decarboxylating) activity" evidence=IEA
GO:0006098 "pentose-phosphate shunt" evidence=IEA
GO:0005737 "cytoplasm" evidence=IEA
GO:0016616 "oxidoreductase activity, acting on the CH-OH group of donors, NAD or NADP as acceptor" evidence=IEA
GO:0046168 "glycerol-3-phosphate catabolic process" evidence=IEA
GO:0051287 "NAD binding" evidence=IEA
GO:0004455 "ketol-acid reductoisomerase activity" evidence=IEA
GO:0008652 "cellular amino acid biosynthetic process" evidence=IEA
FB|FBgn0038516 CG5840 [Drosophila melanogaster (taxid:7227)] Back     alignment and assigned GO terms
ZFIN|ZDB-GENE-050522-26 zgc:110655 "zgc:110655" [Danio rerio (taxid:7955)] Back     alignment and assigned GO terms
ZFIN|ZDB-GENE-040426-1675 pycr1 "pyrroline-5-carboxylate reductase 1" [Danio rerio (taxid:7955)] Back     alignment and assigned GO terms
UNIPROTKB|B4DMU0 PYCR1 "Pyrroline-5-carboxylate reductase" [Homo sapiens (taxid:9606)] Back     alignment and assigned GO terms
UNIPROTKB|J3KQ22 PYCR1 "Pyrroline-5-carboxylate reductase" [Homo sapiens (taxid:9606)] Back     alignment and assigned GO terms
UNIPROTKB|J3QKT4 PYCR1 "Pyrroline-5-carboxylate reductase" [Homo sapiens (taxid:9606)] Back     alignment and assigned GO terms
UNIPROTKB|J3QL24 PYCR1 "Pyrroline-5-carboxylate reductase 1, mitochondrial" [Homo sapiens (taxid:9606)] Back     alignment and assigned GO terms
UNIPROTKB|J3QL32 PYCR1 "Pyrroline-5-carboxylate reductase 1, isoform CRA_a" [Homo sapiens (taxid:9606)] Back     alignment and assigned GO terms
UNIPROTKB|P32322 PYCR1 "Pyrroline-5-carboxylate reductase 1, mitochondrial" [Homo sapiens (taxid:9606)] Back     alignment and assigned GO terms

Prediction of Enzyme Commission (EC) Number

EC Number Prediction by Annotation Transfer from SWISS-PROT Entries ?

No confident hit for EC number transfering in SWISSPROT detected by BLAST

EC Number Prediction by EFICAz Software ?

No EC number assignment, probably not an enzyme!


Prediction of Functionally Associated Proteins


Conserved Domains and Related Protein Families

Conserved Domains Detected by RPS-BLAST ?

ID ?Alignment Graph ?Length ? Definition ? E-value ?
Query267
PRK15370 754 PRK15370, PRK15370, E3 ubiquitin-protein ligase Sl 1e-04
PRK15370 754 PRK15370, PRK15370, E3 ubiquitin-protein ligase Sl 4e-04
PRK15370 754 PRK15370, PRK15370, E3 ubiquitin-protein ligase Sl 7e-04
PRK15370 754 PRK15370, PRK15370, E3 ubiquitin-protein ligase Sl 8e-04
PRK15370 754 PRK15370, PRK15370, E3 ubiquitin-protein ligase Sl 0.001
PRK15370 754 PRK15370, PRK15370, E3 ubiquitin-protein ligase Sl 0.003
>gnl|CDD|185268 PRK15370, PRK15370, E3 ubiquitin-protein ligase SlrP; Provisional Back     alignment and domain information
 Score = 42.8 bits (100), Expect = 1e-04
 Identities = 53/226 (23%), Positives = 99/226 (43%)

Query: 19  LPYIIKSLPYIIKSLPYIINTLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYI 78
           L  I   +P  I +L    N L  + ++L   IK+L      L  I  +LP  I+ +   
Sbjct: 190 LTTIPACIPEQITTLILDNNELKSLPENLQGNIKTLYANSNQLTSIPATLPDTIQEMELS 249

Query: 79  IKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSL 138
           I  +  + + LP  ++SL      +  + ++LP  ++ L     S+  +   LP  I  L
Sbjct: 250 INRITELPERLPSALQSLDLFHNKISCLPENLPEELRYLSVYDNSIRTLPAHLPSGITHL 309

Query: 139 PYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIINTLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYII 198
                SL  + ++LP  +K+L    N L  +  SLP  ++ L      +  + ++LP  I
Sbjct: 310 NVQSNSLTALPETLPPGLKTLEAGENALTSLPASLPPELQVLDVSKNQITVLPETLPPTI 369

Query: 199 KSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLPYIIKSLP 244
            +L     +L  + ++LP  ++ +     +L  + +SLP+     P
Sbjct: 370 TTLDVSRNALTNLPENLPAALQIMQASRNNLVRLPESLPHFRGEGP 415


Length = 754

>gnl|CDD|185268 PRK15370, PRK15370, E3 ubiquitin-protein ligase SlrP; Provisional Back     alignment and domain information
>gnl|CDD|185268 PRK15370, PRK15370, E3 ubiquitin-protein ligase SlrP; Provisional Back     alignment and domain information
>gnl|CDD|185268 PRK15370, PRK15370, E3 ubiquitin-protein ligase SlrP; Provisional Back     alignment and domain information
>gnl|CDD|185268 PRK15370, PRK15370, E3 ubiquitin-protein ligase SlrP; Provisional Back     alignment and domain information
>gnl|CDD|185268 PRK15370, PRK15370, E3 ubiquitin-protein ligase SlrP; Provisional Back     alignment and domain information

Conserved Domains Detected by HHsearch ?

No hit with probability above 80.00


Homologous Structure Templates

Structure Templates Detected by BLAST ?

No homologous structure with e-value below 0.005

Structure Templates Detected by RPS-BLAST ?

No hit with e-value below 0.005

Structure Templates Detected by HHsearch ?

No hit with probability above 80.00


Homologous Structure Domains

Structure Domains Detected by RPS-BLAST ?

No hit with e-value below 0.005

Homologous Domains Detected by HHsearch ?

No hit with probability above 80.00