254780127

254780127

prophage DNA polymerase I (EC 2.7.7.7)

GeneID:8209102 Locus tag:CLIBASIA_00030
Protein GI in NCBI database:254780127 Protein Accession:YP_003064540.1
Gene range:+ ( 3745 , 5772 ) Protein Length:674aa
NCBI annotation:putative DNA polymerase from bacteriophage origin
Subsystem in SEED:DNA Repair Base Excision;
DNA-replication
sequencesequence profileraw resultsgenome browserNCBI geneNCBI protein

Prediction of Local Sequence Properties

scaler
Sequence
Secondary Structure
Disordered region
Transmembrane Helices
Signal Peptide
conservation map
  
--------10--------20--------30--------40--------50--------60--------70--------80--------90-------100-------110-------120-------130-------140-------150-------160-------170-------180-------190-------200-------210-------220-------230-------240-------250-------260-------270-------280-------290-------300-------310-------320-------330-------340-------350-------360-------370-------380-------390-------400-------410-------420-------430-------440-------450-------460-------470-------480-------490-------500-------510-------520-------530-------540-------550-------560-------570-------580-------590-------600-------610-------620-------630-------640-------650-------660-------670----
MSKLFIDIETRSPQPLPKVGVWAYAEQAVITLCAYAWDDEPVKLWDRTEQSAMPSDLLQYLRDETVMCVAHNSLFERILFKKTLGIDIPSKRWICTSVLARTNGLPSSLKNACLALNFSEHLTKMEEGKALIARFCKGSIDSPPYDCTRANHVQAWQLFGEYCKRDVEATRELFKRLIPLSDGERDLWLLDQTINDRGYRIDLDLVLKLQELIAQERKKLDEDIVKLTDGIIRSSRQTYALRMYLFLITGIDLVDMSEGTLKSILSHSNITQLAKDLILNRLASSGSAILKLNTLSEAVSSDGRLRGTLQFYGASRTGRWSGCVFQPQNLPRQERSEEILTQTIQALNRGETIADPLGLASDCVRSCIIASNGKKLVVADLAGIEARVLAWIAGEDWKIKAFANGEDIYVTTYAKAFNTPIDKVSKEQRAIGKVMELALGYQGGAKVFKTMASHCGLDLQQFSQNVKSTSTFEDWEQAESHHLWMQDQYPEFAVKDKLIGTACELVKKAWRAKHQGVLQLWKDLTEGFACVVQEGGSISARRVANVPRLVMRRHKRDVHIVLPSSRRLVYSDVKGDCSYLNTATSQLMRERTYGGKLTENIVQAISRDILCEGMKNATKNGYDIVLTVHDEIVSETPDTPYFSVGTLCSLMTKNPSWAKGLPLKAEGYEAKRYR
ccEEEEEEcccccccccccccccccccccEEEEEEEcccccccEEcccccccccHHHHHHHHcccccEEEEcHHHHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHcccccccccHHHHHHHccccccccccccHHHHHHHccccccHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccEEEcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccHHHHHHHHHHHcccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccEEEEEEEccccccccccccccccccccccHHHHcccccccccccccccccHHHHHHHHHHHccccccEEEEEccHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHcccHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHccccEEEEEccccEEEEccccccHHHcccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccEEEEEEccEEEEEccccHHHHHHHHHHHHccccccccccccccccccHHccc
MSKLFIDIETRSPQPLPKVGVWAYAEQAVITLCAYAWDDEPVKLWDRTEQSAMPSDLLQYLRDETVMCVAHNSLFERILFKKTLGIDIPSKRWICTSVLARTNGLPSSLKNACLALNFSEHLTKMEEGKALIARFCKGSIDSPPYDCTRANHVQAWQLFGEYCKRDVEATRELFKRLIPLSDGERDLWLLDQTINDRGYRIDLDLVLKLQELIAQERKKLDEDIVKLTDGIIRSSRQTYALRMYLFLITGIDLVDMS*GTLKSILSHSNITQLAKDLILNRLASSGSAILKLNTLSEAVSSDGRLRGTLQFYGASRTGRWSGCVFQPQNLPRQERSEEILTQTIQALNRGETIADPLGLASDCVRSCIIASNGKKLVVADLAGIEARVLAWIAGEDWKIKAFANGEDIYVTTYAKAFNTPIDKVSKEQRAIGKVMELALGYQGGAKVFKTMASHCGLDLQQFSQNVKSTSTFEDWEQAESHHLWMQDQYPEFAVKDKLIGTACELVKKAWRAKHQGVLQLWKDLTEGFACVVQEGGSISARRVANVPRLVMRRHKRDVHIVLPSSRRLVYSDVKGDCSYLNTATSQLMRERTYGGKLTENIVQAISRDILCEGMKNATKNGYDIVLTVHDEIVSETPDTPYFSVGTLCSLMTKNPSWAKGLPLKAEGYEAKRYR
msklfidietrspqplpkvgvwayaeqavitlcayawddepvklwdrteqsampsdllqylrdetvmcvahnslferilfkktlgidipskrwictsvlartnglpsslknaclalnfsehltkmeegkaliarfckgsidsppydctranhvqawqlfgeyckrdveatrelfkrliplsdgerdlwlldqtindrgyridldlvlklqeliaqerkkldedivkltdgiirssrqtyalrmylflitgidlvdmsegtlksilshsnitqlakdlilnrlassgsailklntlseavssdgrlrgtlqfygasrtgrwsgcvfqpqnlprqerseeiltqtiqalnrgetiadplglasdcvrsciiasngkklvvadlagiearvlawiagedwkikafangediyvttyakafntpidkvskeqraigkvmelalgyqggakvfktmashcgldlqqfsqnvkststfedweqaeshhlwmqdqypefavkdkligtacelvkkawrakhqgvlqlwkdltegfacvvqeggsisarrvanvprlvmrrhkrdvhivlpssrrlvysdvkgdcsylntatsqlmrertyggkltenivqaisrdilcegmknatkngydivltvhdeivsetpdtpyfsvgtlcslmtknpswakglplkaegyeakryr
msklfidietrspqplpkvgvwayaeqavitlcayawddepvklwdrteqsampsdllqylrdetvmcvahnslferilfkktlgidipskrwictsvlartnglpsslknaclalnfsehltkmeegkaliarfckgsidsppydctranhvqawqlfgeyckrdveatrelfkrliplsdgerdlwlldqtindrgyridldlvlklqeliaqerkkldedivkltdgiirssrqtyalrmylflitgidlvdmsegtlksilshsnitqlakdlilnrlassgsailklntlseavssdgrlrgtlqfygasrtgrwsgcvfqpqnlprqerseeiltqtiqalnrgetiadplglasdcvrsciiasngkklvvadlagiearvlawiagedwkikafangediyvttyakafntpidkvskeqraigkvmelalgyqggakvfktmashcgldlqqfsqnvkststfedweqaeshhlwmqdqypefavkdkligtacelvkkawrakhqgvlqlwkdltegfacvvqeggsisarrvanvprlvmrrhkrdvhivlpssrrlvysdvkgdcsylntatsqlmrertyggkltenivqaisrdilcegmknatkngydivltvhdeivsetpdtpyfsvgtlcslmtknpswakglplkaegyeakryr
MSKLFIDIETRSPQPLPKVGVWAYAEQAVITLCAYAWDDEPVKLWDRTEQSAMPSDLLQYLRDETVMCVAHNSLFERILFKKTLGIDIPSKRWICTSVLARTNGLPSSLKNACLALNFSEHLTKMEEGKALIARFCKGSIDSPPYDCTRANHVQAWQLFGEYCKRDVEATRELFKRLIPLSDGERDLWLLDQTINDRGYRIDLDLVLKLQELIAQERKKLDEDIVKLTDGIIRSSRQTYALRMYLFLITGIDLVDMSEGTLKSILSHSNITQLAKDLILNRLASSGSAILKLNTLSEAVSSDGRLRGTLQFYGASRTGRWSGCVFQPQNLPRQERSEEILTQTIQALNRGETIADPLGLASDCVRSCIIASNGKKLVVADLAGIEARVLAWIAGEDWKIKAFANGEDIYVTTYAKAFNTPIDKVSKEQRAIGKVMELALGYQGGAKVFKTMASHCGLDLQQFSQNVKSTSTFEDWEQAESHHLWMQDQYPEFAVKDKLIGTACELVKKAWRAKHQGVLQLWKDLTEGFACVVQEGGSISARRVANVPRLVMRRHKRDVHIVLPSSRRLVYSDVKGDCSYLNTATSQLMRERTYGGKLTENIVQAISRDILCEGMKNATKNGYDIVLTVHDEIVSETPDTPYFSVGTLCSLMTKNPSWAKGLPLKAEGYEAKRYR

Domain archietecture



Structure model(s) of the protein

model for region: 2-131,147-335,360-454,496-535,559-674
HTML Comment Box is loading comments...