254780925

254780925

Preprotein translocase subunit SecD/SecF

GeneID:8209945 Locus tag:CLIBASIA_04120
Protein GI in NCBI database:254780925 Protein Accession:YP_003065338.1
Gene range:+ ( 908699 , 911200 ) Protein Length:832aa
NCBI annotation:bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF
Pathway in KEGG:Protein export [PATH:las03060]
Bacterial secretion system [PATH:las03070]

Prediction of Local Sequence Properties

scaler
Sequence
Secondary Structure
Disordered region
Transmembrane Helices
Signal Peptide
conservation map
  
--------10--------20--------30--------40--------50--------60--------70--------80--------90-------100-------110-------120-------130-------140-------150-------160-------170-------180-------190-------200-------210-------220-------230-------240-------250-------260-------270-------280-------290-------300-------310-------320-------330-------340-------350-------360-------370-------380-------390-------400-------410-------420-------430-------440-------450-------460-------470-------480-------490-------500-------510-------520-------530-------540-------550-------560-------570-------580-------590-------600-------610-------620-------630-------640-------650-------660-------670-------680-------690-------700-------710-------720-------730-------740-------750-------760-------770-------780-------790-------800-------810-------820-------830--
MRNNPWLVILYSMICCIGLLIALPNFLPQSMLDRFPSAMPKNRISLGLDLRGGSHLVLEVDEDDFVNGFLQMYSDELRSFLKKEGIGVFSMRQIQNKITLSFADSRFKENIADKVTLFLQGVNSKLNVDPKKNLLVTTTEKEISIVLSQNNIDQVISHAIEQSMEIIRQRIDQIGISESTIQRLGSHRILIQLPGEQDPSRLRQLLGTTAKMSFHKVLPNNSKKGFMFGVRFLRDSDGNQYLVEDKVEISGIHLNGATANFDPKTHKPVVDISFDEMGARRFFEVTRDNIGKPLAVVLDGRVLTAPVINQAIPSGKAQISGNFTIETAGILAAMLRAGSLPIKLNIVEERNVGADLGSDSIYKGTCAIVAGLVLIVLFMIVLYGKWGLVADFSIFLNVILTLALLSLLGATLTLPSIAGIVLGIGLAVDSNILVNERIREENRKNQSVFCSLDMGFSRAYSTIFDSNITALIATVVLFFFGGGAVRGFAITMGLSILISMFTAISIVRAMMIFIIRYKKMKSIDINPLSRFFLIPDCIAIQFMRARFWGVGISILFSICSICLLFTHGLNYGIDFKGGIQLGVLANRPVDLSVVRSNLESLQIGDISFQNFDGEKNFLVRLQYQPGDSVAQTRVLEMVKKKITEIVPLSTIQNTEIVGPKISRELIRKGIVGVIISAIAMLIYIWIRFKWYFALGAITTLILDITKTLGFFALFGIEFNLTAVAAVLTLIGYSVNDKVVVYDRMRKNMKLYTTSISFRDLIDKSINETLGRSVYTSMAAFISVLPMAVWGGSVIGSFAIPMAFGIVVAASSSIFIAAPILLFIYDWRAKNAR
ccccHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccccEEEEEEccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccEEccccEEEEEEcccccHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccEEEccccEEEEEEcHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccccEEEEEEcccccHHHHHHHHccccEEEEEEcccccccccccccccccccccccEEEEccccEEEccEEEEcccccccccccEEEEEEEcHHHHHHHHHHHHHHHcccEEEEEccccccccEEEEEcccccEEEEccccHHHHHHHHHHHHcccccccEEEEEEEEEcHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHccEEEEEHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccccccccEEEEEEEcccccHHHHHHHHHHccccccEEEEEccccEEEEEEEccccccHHHHHHHHHHHHHHcccccccEEEEEEEEcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccEEcHHHHHHHHHHHHHHHcccEEEEHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccc
MRNNPWLVILYSMICCIGLLIALPNFLPQSMLDRFPSAMPKNRISLGLDLRGGSHLVLEVDEDDFVNGFLQMYSDELRSFLKKEGIGVFSMRQIQNKITLSFADSRFKENIADKVTLFLQGVNSKLNVDPKKNLLVTTTEKEISIVLSQNNIDQVISHAIEQSMEIIRQRIDQIGISESTIQRLGSHRILIQLPGEQDPSRLRQLLGTTAKMSFHKVLPNNSKKGFMFGVRFLRDSDGNQYLVEDKVEISGIHLNGATANFDPKTHKPVVDISFDEMGARRFFEVTRDNIGKPLAVVLDGRVLTAPVINQAIPSGKAQISGNFTIETAGILAAMLRAGSLPIKLNIVEERNVGADLGSDSIYKGTCAIVAGLVLIVLFMIVLYGKWGLVADFSIFLNVILTLALLSLLGATLTLPSIAGIVLGIGLAVDSNILVNERIREENRKNQSVFCSLDMGFSRAYSTIFDSNITALIATVVLFFFGGGAVRGFAITMGLSILISMFTAISIVRAMMIFIIRYKKMKSIDINPLSRFFLIPDCIAIQFMRARFWGVGISILFSICSICLLFTHGLNYGIDFKGGIQLGVLANRPVDLSVVRSNLESLQIGDISFQNFDGEKNFLVRLQYQPGDSVAQTRVLEMVKKKITEIVPLSTIQNTEIVGPKISRELIRKGIVGVIISAIAMLIYIWIRFKWYFALGAITTLILDITKTLGFFALFGIEFNLTAVAAVLTLIGYSVNDKVVVYDRMRKNMKLYTTSISFRDLIDKSINETLGRSVYTSMAAFISVLPMAVWGGSVIGSFAIPMAFGIVVAASSSIFIAAPILLFIYDWRAKNA*
mrnnHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHlpqsmldrfpsampknrislgldlrggshlvlevdeddfvngflqmysdelrsflkkegigvfsmrqiqnkitlsfadsrfkeniadkvtlflqgvnsklnvdpkknllvtttekeisivlsqnnidqvishaieqsmeiirqridqigisestiqrlgshriliqlpgeqdpsrlrqllgttakmsfhkvlpnnskkgfmfgvrflrdsdgnqylvedkveisgihlngatanfdpkthkpvvdisfdemgarrffevtrdnigkplavvldgrvltapvinqaipsgkaqisgnftietagilaamlragslpiklniveernvgadlgsdsiHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHgkwglHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHatltlHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHnerireenrknqsvfcsldmgfsraystiHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHgfaiHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHirykkmksidinplsrfflipdciaiqfmrarfHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHnygidfkggiqlgvlanrpvdlsvvrsnleslqigdisfqnfdgeknflvrlqyqpgdsvaqtrvlemvkkkiteivplstiqnteivgpkisreliHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHfkwHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHfgiefHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHvydrmrknmklyttsisfrdlidksinetlgrHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHsvigsfHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHfiydwraknar
mrnnpwlvilysmiccigllialpnflpqsmldrfpsampknrislgldlrggshlvlevdeddfvngflqmysdelrsflkkegigvfsmrqiqnkitlsfadsrfkeniadkvtlflqgvnsklnvdpkknllvtttekeisivlsqnnidqvishaieqsmeiirqridqigisestiqrlgshriliqlpgeqdpsrlrqllgttakmsfhkvlpnnskkgfmfgvrflrdsdgnqylvedkveisgihlngatanfdpkthkpvvdisfdemgarrffevtrdnigkplavvldgrvltapvinqaipsgkaqisgnftietagilaamlragslpiklniveernvgadlgsdsiykgtcaivaglvlivlfmivlygkwglvadfsiflnviltlallsllgatltlpsiagivlgiglavdsnilvnerireenrknqsvfcsldmgfsraystifdsnitaliatvvlfffgggavrgfaitmglsilismftaisivrammifiirykkmksidinplsrfflipdciaiqfmrarfwgvgisilfsicsicllfthglnygidfkggiqlgvlanrpvdlsvvrsnleslqigdisfqnfdgeknflvrlqyqpgdsvaqtrvlemvkkkiteivplstiqnteivgpkisrelirkgivgviisaiamliyiwirfkwyfalgaittlilditktlgffalfgiefnltavaavltligysvndkvvvydrmrknmklyttsisfrdlidksinetlgrsvytsmaafisvlpmavwggsvigsfaipmafgivvaasssifiaapillfiydwraknar
MRNNPWLVILYSMICCIGLLIALPNFLPQSMLDRFPSAMPKNRISLGLDLRGGSHLVLEVDEDDFVNGFLQMYSDELRSFLKKEGIGVFSMRQIQNKITLSFADSRFKENIADKVTLFLQGVNSKLNVDPKKNLLVTTTEKEISIVLSQNNIDQVISHAIEQSMEIIRQRIDQIGISESTIQRLGSHRILIQLPGEQDPSRLRQLLGTTAKMSFHKVLPNNSKKGFMFGVRFLRDSDGNQYLVEDKVEISGIHLNGATANFDPKTHKPVVDISFDEMGARRFFEVTRDNIGKPLAVVLDGRVLTAPVINQAIPSGKAQISGNFTIETAGILAAMLRAGSLPIKLNIVEERNVGADLGSDSIYKGTCAIVAGLVLIVLFMIVLYGKWGLVADFSIFLNVILTLALLSLLGATLTLPSIAGIVLGIGLAVDSNILVNERIREENRKNQSVFCSLDMGFSRAYSTIFDSNITALIATVVLFFFGGGAVRGFAITMGLSILISMFTAISIVRAMMIFIIRYKKMKSIDINPLSRFFLIPDCIAIQFMRARFWGVGISILFSICSICLLFTHGLNYGIDFKGGIQLGVLANRPVDLSVVRSNLESLQIGDISFQNFDGEKNFLVRLQYQPGDSVAQTRVLEMVKKKITEIVPLSTIQNTEIVGPKISRELIRKGIVGVIISAIAMLIYIWIRFKWYFALGAITTLILDITKTLGFFALFGIEFNLTAVAAVLTLIGYSVNDKVVVYDRMRKNMKLYTTSISFRDLIDKSINETLGRSVYTSMAAFISVLPMAVWGGSVIGSFAIPMAFGIVVAASSSIFIAAPILLFIYDWRAKNAR

Domain archietecture




Structure model(s) of the protein

model for region: 1-42,56-832

HTML Comment Box is loading comments...