255764469

255764469

ABC-type exporter for lipopolysaccharide, transmembrane component

GeneID:8209379 Locus tag:CLIBASIA_01395
Protein GI in NCBI database:255764469 Protein Accession:YP_003064807.2
Gene range:+ ( 293686 , 294771 ) Protein Length:360aa
NCBI annotation:putative permease protein
Pathway in KEGG:ABC transporters [PATH:las02010]
sequencesequence profileraw resultsgenome browserNCBI geneNCBI protein

Prediction of Local Sequence Properties

scaler
Sequence
Secondary Structure
Disordered region
Transmembrane Helices
Signal Peptide
conservation map
  
--------10--------20--------30--------40--------50--------60--------70--------80--------90-------100-------110-------120-------130-------140-------150-------160-------170-------180-------190-------200-------210-------220-------230-------240-------250-------260-------270-------280-------290-------300-------310-------320-------330-------340-------350-------360
MPGILWRYFFKYYLKTTLYFLLGAMILVFVIDLNEIQNQMGELPNYSISRGAVLAATRVPLIIQQIIPFITLVVNIVVFFNLNRTSELVISRAIGISIWQLLNPFVVGSILLGIFTVLVINPIATSGEKIGIDLIQQWKDNGDKQKSDIIPWMQISNPQQDIFIGAKKILPENHIWEDFTSITIDKKNKIIHRKDADLAIIYNDKVKLKKVVEYQYGRIPIDKNSTTLNIPIKMDGFQKFSEQFASRSFYEIIKKMSFSNKSNIFHNYRAETQFYFLIVIPLMLVAMTLIAASVSLEFSRSNQPRIIVAYGIFSGFMLYTIITIMKSFGKSGILLPVAAALIPVILTISLSILILLQKED
ccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccEEEEEcccccEEEEEEEEEcccccEEccEEEEEEcccccEEEEEEEEEEEEEccEEEEEEEEEEEccccccccccEEEEccccHHHHHHHccccccccHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccc
MPGILWRYFFKYYLKTTLYFLLGAMILVFVIDLNEIQNQMGELPNYSISRGAVLAATRVPLIIQQIIPFITLVVNIVVFFNLNRTSELVISRAIGISIWQLLNPFVVGSILLGIFTVLVINPIATSGEKIGIDLIQQWKDNGDKQKSDIIPWMQISNPQQDIFIGAKKILPENHIWEDFTSITIDKKNKIIHRKDADLAIIYNDKVKLKKVVEYQYGRIPIDKNSTTLNIPIKMDGFQKFSEQFASRSFYEIIKKMSFSNKSNIFHNYRAETQFYFLIVIPLMLVAMTLIAASVSLEFSRSNQPRIIVAYGIFSGFMLYTIITIMKSFGKSGILLPVAAALIPVILTISLSILILLQKE*
mpgilwryffHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHidlneiqnqmgelpnysisrgavlaatrvHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHnrtselvisraigisiHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHnpiatsgekigidliqqwkdngdkqksdiipwmqisnpqqdifigakkilpenhiwedftsitidkknkiihrkdadlaiiyndkvklkkvveyqygripidknsttlnipikmdgfqkfseqfasrsfyeiikkmsfsnksnifhnyraetqfHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHefsrsnqprHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHsfgksgiHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHqked
mpgilwryffkyylkttlyfllgamilvfvidlneiqnqmgelpnysisrgavlaatrvpliiqqiipfitlvvnivvffnlnrtselvisraigisiwqllnpfvvgsillgiftvlvinpiatsgekigidliqqwkdngdkqksdiipwmqisnpqqdifigakkilpenhiwedftsitidkknkiihrkdadlaiiyndkvklkkvveyqygripidknsttlnipikmdgfqkfseqfasrsfyeiikkmsfsnksnifhnyraetqfyfliviplmlvamtliaasvslefsrsnqpriivaygifsgfmlytiitimksfgksgillpvaaalipviltislsilillqked
MPGILWRYFFKYYLKTTLYFLLGAMILVFVIDLNEIQNQMGELPNYSISRGAVLAATRVPLIIQQIIPFITLVVNIVVFFNLNRTSELVISRAIGISIWQLLNPFVVGSILLGIFTVLVINPIATSGEKIGIDLIQQWKDNGDKQKSDIIPWMQISNPQQDIFIGAKKILPENHIWEDFTSITIDKKNKIIHRKDADLAIIYNDKVKLKKVVEYQYGRIPIDKNSTTLNIPIKMDGFQKFSEQFASRSFYEIIKKMSFSNKSNIFHNYRAETQFYFLIVIPLMLVAMTLIAASVSLEFSRSNQPRIIVAYGIFSGFMLYTIITIMKSFGKSGILLPVAAALIPVILTISLSILILLQKED

Domain archietecture



Structure model(s) of the protein

Cannot get confident structure prediction for this protein.

HTML Comment Box is loading comments...