254780223

254780223

permease

GeneID:8209204 Locus tag:CLIBASIA_00540
Protein GI in NCBI database:254780223 Protein Accession:YP_003064636.1
Gene range:+ ( 110290 , 111372 ) Protein Length:359aa
NCBI annotation:ABC transporter permease
sequencesequence profileraw resultsgenome browserNCBI geneNCBI protein

Prediction of Local Sequence Properties

scaler
Sequence
Secondary Structure
Disordered region
Transmembrane Helices
Signal Peptide
conservation map
  
--------10--------20--------30--------40--------50--------60--------70--------80--------90-------100-------110-------120-------130-------140-------150-------160-------170-------180-------190-------200-------210-------220-------230-------240-------250-------260-------270-------280-------290-------300-------310-------320-------330-------340-------350-------36
MRETMLNPQGIMRWMIMFIILVSLYFLKGFFAPVLSALIIGFTSWPIYSSFISKKEESSTFLAVIATVSVMCLFIVPLLFLFYYGMLEMKELVSKVVLANQHGIPVPRWLSDIPGGMWASELWTKHLSHPQSLKILSETFLKTNGIDFIPRFASRFGMIFLDYCLSIIFMIIALFFFYRDGFSISQQLDSLGEHLFPAYWKKISRIVPKVIRSTFLGMTIIAIGEGLVLGSAYWLAGVPSHVALGVITAIMAMIPGGAPISFTAVSIYLLIKGNIFNATCLFLWGAIELFIVDKTLRPFLVGGPIKLPFLPTFFGLVGGVRTMGLLGLFIGPVLMALIAVIWKESIMAIKENKEKISSN
ccHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccccHHHHHccccHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccEEEccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcc
*******PQGIMRWMIMFIILVSLYFLKGFFAPVLSALIIGFTSWPIYSSFISKKEESSTFLAVIATVSVMCLFIVPLLFLFYYGMLEMKELVSKVVLANQHGIPVPRWLSDIPGGMWASELWTKHLSHPQSLKILSETFLKTNGIDFIPRFASRFGMIFLDYCLSIIFMIIALFFFYRDGFSISQQLDSLGEHLFPAYWKKISRIVPKVIRSTFLGMTIIAIGEGLVLGSAYWLAGVPSHVALGVITAIMAMIPGGAPISFTAVSIYLLIKGNIFNATCLFLWGAIELFIVDKTLRPFLVGGPIKLPFLPTFFGLVGGVRTMGLLGLFIGPVLMALIAVIWKESIMAIK*********
mretmlnpqgimrwmimHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHyssfiskkeesstfHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHmlemkelvskvvlanqhgipvprwlsdipggmwaselwtkhlshpqslkilsetflktngidfiprfasrfHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHrdgfsisqqldslgehlfpaywkkisrivpkvirHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHgvpshvaHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHllikgnifHHHHHHHHHHHHHHHHdktlrpflvggpiklpflptffglvgHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHkesimaikenkekissn
mretmlnpqgimrwmimfiilvslyflkgffapvlsaliigftswpiyssfiskkeesstflaviatvsvmclfivpllflfyygmlemkelvskvvlanqhgipvprwlsdipggmwaselwtkhlshpqslkilsetflktngidfiprfasrfgmifldyclsiifmiialfffyrdgfsisqqldslgehlfpaywkkisrivpkvirstflgmtiiaigeglvlgsaywlagvpshvalgvitaimamipggapisftavsiyllikgnifnatclflwgaielfivdktlrpflvggpiklpflptffglvggvrtmgllglfigpvlmaliaviwkesimaikenkekissn
MRETMLNPQGIMRWMIMFIILVSLYFLKGFFAPVLSALIIGFTSWPIYSSFISKKEESSTFLAVIATVSVMCLFIVPLLFLFYYGMLEMKELVSKVVLANQHGIPVPRWLSDIPGGMWASELWTKHLSHPQSLKILSETFLKTNGIDFIPRFASRFGMIFLDYCLSIIFMIIALFFFYRDGFSISQQLDSLGEHLFPAYWKKISRIVPKVIRSTFLGMTIIAIGEGLVLGSAYWLAGVPSHVALGVITAIMAMIPGGAPISFTAVSIYLLIKGNIFNATCLFLWGAIELFIVDKTLRPFLVGGPIKLPFLPTFFGLVGGVRTMGLLGLFIGPVLMALIAVIWKESIMAIKENKEKISSN

Domain archietecture



Structure model(s) of the protein

Cannot get confident structure prediction for this protein.

HTML Comment Box is loading comments...