254780809

254780809

tRNA modification GTPase TrmE

GeneID:8209815 Locus tag:CLIBASIA_03500
Protein GI in NCBI database:254780809 Protein Accession:YP_003065222.1
Gene range:+ ( 445994 , 447316 ) Protein Length:439aa
NCBI annotation:tRNA modification GTPase TrmE
Subsystem in SEED:Universal GTPases
sequencesequence profileraw resultsgenome browserNCBI geneNCBI protein

Prediction of Local Sequence Properties

scaler
Sequence
Secondary Structure
Disordered region
Transmembrane Helices
Signal Peptide
conservation map
  
--------10--------20--------30--------40--------50--------60--------70--------80--------90-------100-------110-------120-------130-------140-------150-------160-------170-------180-------190-------200-------210-------220-------230-------240-------250-------260-------270-------280-------290-------300-------310-------320-------330-------340-------350-------360-------370-------380-------390-------400-------410-------420-------430-------44
MNHEKETIFAVSTGALPSAISIIRLSGPSCFQVCEFICKKKKPFPRKASLRYFFGLDGRILDKGLLIVFPSPESFTGEDSAEFHVHGGIAVVNGILEELAKMPNLRLANPGEFSRRAFENGKIDLLEAESLADLISSETEMQRRLSMEGMSGELSSLYGQWIDKLTHIRSFIEADLDFSEEEDVQNFSSKEVLNDILFLKNDISSHISQGKLGEIIRNGYKIVILGHSNAGKSSLFNALAKKDVAIVTDIPGTTRDVLTIDLDLEGYLVKISDTAGIRETDDIVEKEGIKRTFLEVENADLILLLKEINSKKEISFPKNIDFIFIGTKSDLYSTYTEEYDHLISSFTGEGLEELINKIKSILSNKFKKLPFSIPSHKRHLYHLSQTVRYLEMASLNEKDCGLDIIAENLRLASVSLGKITGCVDVEQLLDIIFSKFCIG
cccccccEEEEEccccccEEEEEEEccHHHHHHHHHHHcccccccccEEEEEEccccccEEEEEEEEEEccccccccccEEEEEcccHHHHHHHHHHHHHcccccccccccHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHccccHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccEEEEEEcccccHHHHHHHHHccccEEcccccccEEEEEEEEEEEccEEEEEEEcHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHccccEEEEEEcccccHHHHHHcccEEEEEEEHHHHcccccccccEEEEccccccHHHHHHHHHHHHccHHHcccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHHHHHHHHHHcccc
***EKETIFAVSTGALPSAISIIRLSGPSCFQVCEFICKKKKPFPRKASLRYFFGLDGRILDKGLLIVFPSPESFTGEDSAEFHVHGGIAVVNGILEELAKMPNLRLANPGEFSRRAFENGKIDLLEAESLADLISSETEMQRRLSMEGMSGELSSLYGQWIDKLTHIRSFIEADLDFSEEEDVQNFSSKEVLNDILFLKNDISSHISQGKLGEIIRNGYKIVILGHSNAGKSSLFNALAKKDVAIVTDIPGTTRDVLTIDLDLEGYLVKISDTAGIRETDDIVEKEGIKRTFLEVENADLILLLKEINSKKEISFPKNIDFIFIGTKSDLYSTYTEEYDHLISSFTGEGLEELINKIKSILSNKFKKLPFSIPSHKRHLYHLSQTVRYLEMASLNEKDCGLDIIAENLRLASVSLGKITGCVDVEQLLDIIFSKFCIG
mnheketifavstgalpsaisiirlsgpscfqvcefickkkkpfprkaslryffgldgrildkgllivfpspesftgedsaefhvhggiavvngileelakmpnlrlanpgefsrrafengkidlleaesladlissetemqrrlsmegmsgelsslygqwidklthirsfieadldfseeedvqnfsskevlndilflkndisshisqgklgeiirngykivilghsnagksslfnalakkdvaivtdipgttrdvltidldlegylvkisdtagiretddivekegikrtflevenadlilllkeinskkeisfpknidfifigtksdlystyteeydhlissftgegleelinkiksilsnkfkklpfsipshkrhlyhlsqtvrylemaslnekdcgldiiaenlrlasvslgkitgcvdveqlldiifskfcig
mnheketifavstgalpsaisiirlsgpscfqvcefickkkkpfprkaslryffgldgrildkgllivfpspesftgedsaefhvhggiavvngileelakmpnlrlanpgefsrrafengkidlleaesladlissetemqrrlsmegmsgelsslygqwidklthirsfieadldfseeedvqnfsskevlndilflkndisshisqgklgeiirngykivilghsnagksslfnalakkdvaivtdipgttrdvltidldlegylvkisdtagiretddivekegikrtflevenadlilllkeinskkeisfpknidfifigtksdlystyteeydhlissftgegleelinkiksilsnkfkklpfsipshkrhlyhlsqtvrylemaslnekdcgldiiaenlrlasvslgkitgcvdveqlldiifskfcig
MNHEKETIFAVSTGALPSAISIIRLSGPSCFQVCEFICKKKKPFPRKASLRYFFGLDGRILDKGLLIVFPSPESFTGEDSAEFHVHGGIAVVNGILEELAKMPNLRLANPGEFSRRAFENGKIDLLEAESLADLISSETEMQRRLSMEGMSGELSSLYGQWIDKLTHIRSFIEADLDFSEEEDVQNFSSKEVLNDILFLKNDISSHISQGKLGEIIRNGYKIVILGHSNAGKSSLFNALAKKDVAIVTDIPGTTRDVLTIDLDLEGYLVKISDTAGIRETDDIVEKEGIKRTFLEVENADLILLLKEINSKKEISFPKNIDFIFIGTKSDLYSTYTEEYDHLISSFTGEGLEELINKIKSILSNKFKKLPFSIPSHKRHLYHLSQTVRYLEMASLNEKDCGLDIIAENLRLASVSLGKITGCVDVEQLLDIIFSKFCIG

Domain archietecture



Structure model(s) of the protein

model for region: 4-440
HTML Comment Box is loading comments...