254780413

254780413

Signal transduction histidine kinase

GeneID:8209399 Locus tag:CLIBASIA_01490
Protein GI in NCBI database:254780413 Protein Accession:YP_003064826.1
Gene range:+ ( 314434 , 316896 ) Protein Length:819aa
NCBI annotation:PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase

Prediction of Local Sequence Properties

scaler
Sequence
Secondary Structure
Disordered region
Transmembrane Helices
Signal Peptide
conservation map
  
--------10--------20--------30--------40--------50--------60--------70--------80--------90-------100-------110-------120-------130-------140-------150-------160-------170-------180-------190-------200-------210-------220-------230-------240-------250-------260-------270-------280-------290-------300-------310-------320-------330-------340-------350-------360-------370-------380-------390-------400-------410-------420-------430-------440-------450-------460-------470-------480-------490-------500-------510-------520-------530-------540-------550-------560-------570-------580-------590-------600-------610-------620-------630-------640-------650-------660-------670-------680-------690-------700-------710-------720-------730-------740-------750-------760-------770-------780-------790-------800-------810-------82
MSTDSIISNPEDILTSNCKGNTQDLSKKKIDNGFETEKSKKENPCHDSFEQSNFTDQNQESVSNTNYLDSENTFVFDPIPRTVRFTWNIDAHGYLKEISEELPKTIGNYAFKMIGMRLCDVSDILHIDPNNHIGDLLKRQNTWYGKTTLWPIEGTNLYVPIDLAALPIYSRNREFSGFRGFGIVHVNRVDNDPRALGKRLDKKFSHLHEIKKGHSSVEKEKYDIFSQQSPPPHLRMKNKVSSLTEYYAHKDDVLKTEKYPLLTSEESSLPEQEDFHTINLNQYTKKQYFGTLQNNSKESFEYLSHRNHPSLSAYFDEGENLTPETVDKCPIPFFVYSHGNLFYANPSFLLLTKYKSVDDIEIAGGLSTLLDAPKLSDNNAIKPVMLYRSDRTCIAASARLHTIQWNRENSLAMTFIPFEKANQFPENMPQNGIEPEDVDTRINKRKMEIEVMQLCSILEATSDGIAIINREGIILSTNRAVSKLFGYPVEDILRKPFTVFLEQNTPSVMNHYLTEILSLDLRQTLEKITLGSTKEEKLLSLRIIIKKLPFSSCYSLTMHDISEWKQEKNKLSHAKKIAEKESSHKSDFLARVSHEIRTPLTAIIGFSEVIKNQRFGPLGNPRYIEYANYIDRSGNLVLDIVNDLLDISKIESGKMNLHFEPVSLDEAVSEAISLVQLYANEKRILIRTSFANNIPRILADLRSVKQIALNILSNAIHFTPSGGQIIISTTHTSNEEVILRVRDTGVGMTNYELEKAMKPFGQIPNSQQIRGEGTGLGLPLAKAMVDANMGKFYIFSTPAKGTLIEIIFPLYDTSHPHDC
cccccccccHHHHHcccccccHHHHHHHHHHcccccccccccccccHHHHHccccccccHHcccccccccccEEEcccccccEEEEEEEcccccEEEEEcHHHHHHcccHHHHccccHHHHHHHccccHHHHHHHHHHccccccccEEEcccccccEEEEEEEcccccccccccccccccEEEEEcccccccHHHHHHHHcccccHHHHcccccccccHHHccccccccccHHHHHHHHHHHcccccccccccccccccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccEEEEccccEEEEccHHHHHHHccccHHHHHHccccccEEccccccccccHHHHHHHHHHcccccccEEEEEEEEcccccEEEEEEEEccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccEEEEccccEEEEEcHHHHHHHcccHHHHccccHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHccccccEEEEEEccccEEEEEEEEEccccccccEEEcccccccccccccccccccccccccccccccccHHHHHHHHcccccHHccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccHHcccccccHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHccccEEEEEEEEccccccccccccHHHHHHHHHHccccEEcccccEEEEEEEEccccEEEEEEEEccccccHHHHHHHccccEEccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHccEEEEEEEccccEEEEEEEEcccccccccc
*********************************************************************************TVRFTWNIDAHGYLKEISEELPKTIGNYAFKMIGMRLCDVSDILHIDPNNHIGDLLKRQNTWYGKTTLWPIEGTNLYVPIDLAALPIYSRNREFSGFRGFGIVHVNRVDNDPRALGKRLDKK**********************************************************************DFHTINLNQYTKKQYFGTLQN*****************************ETVDKCPIPFFVYSHGNLFYANPSFLLLTKYKSVDDIEIAGGLSTLLDAPKLSDNNAIKPVMLYRSDRTCIAASARLHTIQWNRENSLAMTFIPFEKANQFPENMPQNGIEPEDVDTRINKRKMEIEVMQLCSILEATSDGIAIINREGIILSTNRAVSKLFGYPVEDILRKPFTVFLEQNTPSVMNHYLTEILSLDLRQTLEKITLGSTKEEKLLSLRIIIKKLPFSSCYSLTMHDISEWKQEKNKLSHAKKIAEKESSHKSDFLARVSHEIRTPLTAIIGFSEVIKNQRFGPLGNPRYIEYANYIDRSGNLVLDIVNDLLDISKIESGK*NLHFEPVSLDEAVSEAISLVQLYANEKRILIRTSFANNIPRILADLRSVKQIALNILSNAIHFTPSGGQIIISTTHTSNEEVILRVRDTGVGMTNYELEKAMKPFGQI*NSQQIR*****LGLPLAKAMVDANMGKFYIFSTPAKGTLIEIIFPLYDTS*****
mstdsiisnpediltsnckgntqdlskkkidngfetekskkenpchdsfeqsnftdqnqesvsntnyldsentfvfdpiprtvrftwnidahgylkeiseelpktignyafkmigmrlcdvsdilhidpnnhigdllkrqntwygkttlwpiegtnlyvpidlaalpiysrnrefsgfrgfgivhvnrvdndpralgkrldkkfshlheikkghssvekekydifsqqsppphlrmknkvsslteyyahkddvlktekyplltseesslpeqedfhtinlnqytkkqyfgtlqnnskesfeylshrnhpslsayfdegenltpetvdkcpipffvyshgnlfyanpsfllltkyksvddieiagglstlldapklsdnnaikpvmlyrsdrtciaasarlhtiqwnrenslamtfipfekanqfpenmpqngiepedvdtrinkrkmeievmqlcsileatsdgiaiinregiilstnravsklfgypvedilrkpftvfleqntpsvmnhylteilsldlrqtlekitlgstkeekllslriiikklpfsscysltmhdisewkqeknklshakkiaekesshksdflarvsheirtpltaiigfseviknqrfgplgnpryieyanyidrsgnlvldivndlldiskiesgkmnlhfepvsldeavseaislvqlyanekrilirtsfannipriladlrsvkqialnilsnaihftpsggqiiistthtsneevilrvrdtgvgmtnyelekamkpfgqipnsqqirgegtglglplakamvdanmgkfyifstpakgtlieiifplydtshphdc
mstdsiisnpediltsnckgntqdlskkkidngfetekskkenpchdsfeqsnftdqnqesvsntnyldsentfvfdpiprtvrftwnidahgylkeiseelpktignyafkmigmrlcdvsdilhidpnnhigdllkrqntwygkttlwpiegtnlyvpidlaalpiysrnrefsgfrgfgivhvnrvdndpralgkrldkkfshlheikkghssvekekydifsqqsppphlrmknkvsslteyyahkddvlktekyplltseesslpeqedfhtinlnqytkkqyfgtlqnnskesfeylshrnhpslsayfdegenltpetvdkcpipffvyshgnlfyanpsfllltkyksvddieiagglstlldapklsdnnaikpvmlyrsdrtciaasarlhtiqwnrenslamtfipfekanqfpenmpqngiepedvdtrinkrkmeievmqlcsileatsdgiaiinregiilstnravsklfgypvedilrkpftvfleqntpsvmnhylteilsldlrqtlekitlgstkeekllslriiikklpfsscysltmhdisewkqeknklshakkiaekesshksdflarvsheirtpltaiigfseviknqrfgplgnpryieyanyidrsgnlvldivndlldiskiesgkmnlhfepvsldeavseaislvqlyanekrilirtsfannipriladlrsvkqialnilsnaihftpsggqiiistthtsneevilrvrdtgvgmtnyelekamkpfgqipnsqqirgegtglglplakamvdanmgkfyifstpakgtlieiifplydtshphdc
MSTDSIISNPEDILTSNCKGNTQDLSKKKIDNGFETEKSKKENPCHDSFEQSNFTDQNQESVSNTNYLDSENTFVFDPIPRTVRFTWNIDAHGYLKEISEELPKTIGNYAFKMIGMRLCDVSDILHIDPNNHIGDLLKRQNTWYGKTTLWPIEGTNLYVPIDLAALPIYSRNREFSGFRGFGIVHVNRVDNDPRALGKRLDKKFSHLHEIKKGHSSVEKEKYDIFSQQSPPPHLRMKNKVSSLTEYYAHKDDVLKTEKYPLLTSEESSLPEQEDFHTINLNQYTKKQYFGTLQNNSKESFEYLSHRNHPSLSAYFDEGENLTPETVDKCPIPFFVYSHGNLFYANPSFLLLTKYKSVDDIEIAGGLSTLLDAPKLSDNNAIKPVMLYRSDRTCIAASARLHTIQWNRENSLAMTFIPFEKANQFPENMPQNGIEPEDVDTRINKRKMEIEVMQLCSILEATSDGIAIINREGIILSTNRAVSKLFGYPVEDILRKPFTVFLEQNTPSVMNHYLTEILSLDLRQTLEKITLGSTKEEKLLSLRIIIKKLPFSSCYSLTMHDISEWKQEKNKLSHAKKIAEKESSHKSDFLARVSHEIRTPLTAIIGFSEVIKNQRFGPLGNPRYIEYANYIDRSGNLVLDIVNDLLDISKIESGKMNLHFEPVSLDEAVSEAISLVQLYANEKRILIRTSFANNIPRILADLRSVKQIALNILSNAIHFTPSGGQIIISTTHTSNEEVILRVRDTGVGMTNYELEKAMKPFGQIPNSQQIRGEGTGLGLPLAKAMVDANMGKFYIFSTPAKGTLIEIIFPLYDTSHPHDC

Domain archietecture




Structure model(s) of the protein

model for region: 86-206
model for region: 333-560
model for region: 561-813

HTML Comment Box is loading comments...