254780933

254780933

valyl-tRNA synthetase (EC 6.1.1.9)

GeneID:8209955 Locus tag:CLIBASIA_04160
Protein GI in NCBI database:254780933 Protein Accession:YP_003065346.1
Gene range:+ ( 921065 , 923908 ) Protein Length:946aa
NCBI annotation:valyl-tRNA synthetase
Pathway in KEGG:Valine, leucine and isoleucine biosynthesis [PATH:las00290]
Aminoacyl-tRNA biosynthesis [PATH:las00970]
Subsystem in SEED:tRNA aminoacylation, Val
sequencesequence profileraw resultsgenome browserNCBI geneNCBI protein

Prediction of Local Sequence Properties

scaler
Sequence
Secondary Structure
Disordered region
Transmembrane Helices
Signal Peptide
conservation map
  
--------10--------20--------30--------40--------50--------60--------70--------80--------90-------100-------110-------120-------130-------140-------150-------160-------170-------180-------190-------200-------210-------220-------230-------240-------250-------260-------270-------280-------290-------300-------310-------320-------330-------340-------350-------360-------370-------380-------390-------400-------410-------420-------430-------440-------450-------460-------470-------480-------490-------500-------510-------520-------530-------540-------550-------560-------570-------580-------590-------600-------610-------620-------630-------640-------650-------660-------670-------680-------690-------700-------710-------720-------730-------740-------750-------760-------770-------780-------790-------800-------810-------820-------830-------840-------850-------860-------870-------880-------890-------900-------910-------920-------930-------940------
MMIDKTYDFAFIEQKSVEKWNSVDAFRIDVAPKLGSGVFCIAMPPPNVTGSLHMGHAFNTTIQDIMIRFERMRGKNVLWQPGTDHAGIATQITVESRLFAQSSLTREDIGRDAFIEKVWEWKKESGGSILSQLKRLGASCDWSRERFTMDEGMSNAVRNAFVVLYKDGLIYRDKRIVNWDPSLKTSVSDLEVIQKEVDGNLWYVRYPLVEGVTYRHPIKFDDDAKPIDWEVRDYIIVSTTRPETMFGDVAIAVHPDDYRYKELIGKYATLPIVGRLIPIVSDVYPDPEFGDGAVKVTPAHDFNDFEIAKRHGLGFINILTPEAKIFLSENESFLENIVLSDEARNIFSEFEGLDCFAARSKIVSLLEKSNLLDKTDSYRHIVPHCERSGVTIEPCITEQWYLDAKVLAESAIRSAKNGCLSFIPQSWDKSYYEWLENIQPWCISRQIWWGHQIPVWYSPDGKLFVENTEDAALRSAIDYYLSQDNDMTVKVRKMIKDGNISDLLKRDEDVLDTWFSSALWPFASLGWPEQTAELKTYYPTSVLVTGFDILFFWVARMMMMGLYFMKDAEGKGIEPFHIVYMHALVRDKNGQKMSKSKGNVVDPIDVIDQYGADALRFYFSIMAVQGRDINLDLERIAGYRNFITKFWNAIRFSKMKNARHSVSFVPQDVKWIVNKWIIKRLATVINDVTVGMENHRFNDVSAVLYRFVWDELCDWYVEFIKSILNQKDSELVSETLSCFSYVLYNVCKLLHPIIPFVTEDLYSHVSPQDDMDKQGLLCHAQWPSLIIDDSESIEEVNWIIDLISKVRSIRTEMNVPLKAVVPLVFANIDAHVRKRLECHKCIIDRLSSGNIIFADCPPDRSIQIILDGMVLFLAIGDFVDFVKERSRLKKSLEKVLDELSSIKKKLENNQFVEKAPPSILQAEKERFSKVEKKRISLENSLERIRM
ccccccccHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccccEEEEEEccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccccEEEcccccHHHHHHHHHHHHHccccccccHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHcccEEcccEEEEccccccccccHHHHHHcccccccEEEEEEEEcccccccccccccccccccccccccEEEcccccHHHcccEEEEEcccHHHHHHHcccEEEEEcccccccEEEcccccccccccEEEEcccccHHHHHHHHHHcccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccccHHHccHHHHHHHHHcccEEccccccccccccccccccEEEEEcccEEEEcHHHHHHHHHHHHccccEEEcHHHHHHHHHHHccccccEEEEEccccEEEEEEEcccccEEEcccHHHHHHHHHHccccccccccccHHHccccccccccccccccccccEEcccccHHEEEccccccHHHHHHccccEEEEEccccccHHHHHHHHHHHccccccccccccHHHHEEcccEEccccccHHcccccEEcHHHHHHHccHHHHHHHHHHcccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcHHHHccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHccHHHHHHHHHHHcccccccccccccccccccccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccccccHHHHHHHcccHHHHHHHHHHHHHHHHHccccEEEEccccccEEEEEEcccEEEEEccccccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHcccHHHHHHccHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHc
MMIDKTYDFAFIEQKSVEKWNSVDAFRIDVAPKLGSGVFCIAMPPPNVTGSLHMGHAFNTTIQDIMIRFERMRGKNVLWQPGTDHAGIATQITVESRLFAQSSLTREDIGRDAFIEKVWEWKKESGGSILSQLKRLGASCDWSRERFTMDEGMSNAVRNAFVVLYKDGLIYRDKRIVNWDPSLKTSVSDLEVIQKEVDGNLWYVRYPLVEGVTYRHPIKFDDDAKPIDWEVRDYIIVSTTRPETMFGDVAIAVHPDDYRYKELIGKYATLPIVGRLIPIVSDVYPDPEFGDGAVKVTPAHDFNDFEIAKRHGLGFINILTPEAKIFLSENESFLENIVLSDEARNIFSEFEGLDCFAARSKIVSLLEKSNLLDKTDSYRHIVPHCERSGVTIEPCITEQWYLDAKVLAESAIRSAKNGCLSFIPQSWDKSYYEWLENIQPWCISRQIWWGHQIPVWYSPDGKLFVENTEDAALRSAIDYYLSQDNDMTVKVRKMIKDGNISDLLKRDEDVLDTWFSSALWPFASLGWPEQTAELKTYYPTSVLVTGFDILFFWVARMMMMGLYFMKDAEGKGIEPFHIVYMHALVRDKNGQKMSKSKGNVVDPIDVIDQYGADALRFYFSIMAVQGRDINLDLERIAGYRNFITKFWNAIRFSKMKNARHSVSFVPQDVKWIVNKWIIKRLATVINDVTVGMENHRFNDVSAVLYRFVWDELCDWYVEFIKSILNQKDSELVSETLSCFSYVLYNVCKLLHPIIPFVTEDLYSHVSPQDDMDKQGLLCHAQWPSLIIDDSESIEEVNWIIDLISKVRSIRTEMNVPLKAVVPLVFANIDAHVRKRLECHKCIIDRLSSGNIIFADCPPDRSIQIILDGMVLFLAIGDFVDFVKERSRLKKSLEKVLDELSSIKKKLENNQFVEKAPPSILQAEKERFSKVEKKRISLENSLERIRM
mmidktydfafieqksvekwnsvdafridvapklgsgvfciampppnvtgslhmghafnttiqdimirfermrgknvlwqpgtdhagiatqitvesrlfaqssltredigrdafiekvwewkkesggsilsqlkrlgascdwsrerftmdegmsnavrnafvvlykdgliyrdkrivnwdpslktsvsdleviqkevdgnlwyvryplvegvtyrhpikfdddakpidwevrdyiivsttrpetmfgdvaiavhpddyrykeligkyatlpivgrlipivsdvypdpefgdgavkvtpahdfndfeiakrhglgfiniltpeakiflsenesflenivlsdearnifsefegldcfaarskivslleksnlldktdsyrhivphcersgvtiepciteqwyldakvlaesairsakngclsfipqswdksyyewleniqpwcisrqiwwghqipvwyspdgklfventedaalrsaidyylsqdndmtvkvrkmikdgnisdllkrdedvldtwfssalwpfaslgwpeqtaelktyyptsvlvtgfdilffwvarmmmmglyfmkdaegkgiepfhivymhalvrdkngqkmskskgnvvdpidvidqygadalrfyfsimavqgrdinldleriagyrnfitkfwnairfskmknarhsvsfvpqdvkwivnkwiikrlatvindvtvgmenhrfndvsavlyrfvwdelcdwyvefiksilnqkdselvsetlscfsyvlynvckllhpiipfvtedlyshvspqddmdkqgllchaqwpsliiddsesieevnwiidliskvrsirtemnvplkavvplvfanidahvrkrlechkciidrlssgniifadcppdrsiqiildgmvlflaigdfvdfvkersrlkkslekvldelssikkklennqfvekappsilqaekerfskvekkrislenslerirm
mmidktydfafieqksvekwnsvdafridvapklgsgvfciampppnvtgslhmghafnttiqdimirfermrgknvlwqpgtdhagiatqitvesrlfaqssltredigrdafiekvwewkkesggsilsqlkrlgascdwsrerftmdegmsnavrnafvvlykdgliyrdkrivnwdpslktsvsdleviqkevdgnlwyvryplvegvtyrhpikfdddakpidwevrdyiivsttrpetmfgdvaiavhpddyrykeligkyatlpivgrlipivsdvypdpefgdgavkvtpahdfndfeiakrhglgfiniltpeakiflsenesflenivlsdearnifsefegldcfaarskivslleksnlldktdsyrhivphcersgvtiepciteqwyldakvlaesairsakngclsfipqswdksyyewleniqpwcisrqiwwghqipvwyspdgklfventedaalrsaidyylsqdndmtvkvrkmikdgnisdllkrdedvldtwfssalwpfaslgwpeqtaelktyyptsvlvtgfdilffwvarmmmmglyfmkdaegkgiepfhivymhalvrdkngqkmskskgnvvdpidvidqygadalrfyfsimavqgrdinldleriagyrnfitkfwnairfskmknarhsvsfvpqdvkwivnkwiikrlatvindvtvgmenhrfndvsavlyrfvwdelcdwyvefiksilnqkdselvsetlscfsyvlynvckllhpiipfvtedlyshvspqddmdkqgllchaqwpsliiddsesieevnwiidliskvrsirtemnvplkavvplvfanidahvrkrlechkciidrlssgniifadcppdrsiqiildgmvlflaigdfvdfvkersrlkkslekvldelssikkklennqfvekappsilqaekerfskvekkrislenslerirm
MMIDKTYDFAFIEQKSVEKWNSVDAFRIDVAPKLGSGVFCIAMPPPNVTGSLHMGHAFNTTIQDIMIRFERMRGKNVLWQPGTDHAGIATQITVESRLFAQSSLTREDIGRDAFIEKVWEWKKESGGSILSQLKRLGASCDWSRERFTMDEGMSNAVRNAFVVLYKDGLIYRDKRIVNWDPSLKTSVSDLEVIQKEVDGNLWYVRYPLVEGVTYRHPIKFDDDAKPIDWEVRDYIIVSTTRPETMFGDVAIAVHPDDYRYKELIGKYATLPIVGRLIPIVSDVYPDPEFGDGAVKVTPAHDFNDFEIAKRHGLGFINILTPEAKIFLSENESFLENIVLSDEARNIFSEFEGLDCFAARSKIVSLLEKSNLLDKTDSYRHIVPHCERSGVTIEPCITEQWYLDAKVLAESAIRSAKNGCLSFIPQSWDKSYYEWLENIQPWCISRQIWWGHQIPVWYSPDGKLFVENTEDAALRSAIDYYLSQDNDMTVKVRKMIKDGNISDLLKRDEDVLDTWFSSALWPFASLGWPEQTAELKTYYPTSVLVTGFDILFFWVARMMMMGLYFMKDAEGKGIEPFHIVYMHALVRDKNGQKMSKSKGNVVDPIDVIDQYGADALRFYFSIMAVQGRDINLDLERIAGYRNFITKFWNAIRFSKMKNARHSVSFVPQDVKWIVNKWIIKRLATVINDVTVGMENHRFNDVSAVLYRFVWDELCDWYVEFIKSILNQKDSELVSETLSCFSYVLYNVCKLLHPIIPFVTEDLYSHVSPQDDMDKQGLLCHAQWPSLIIDDSESIEEVNWIIDLISKVRSIRTEMNVPLKAVVPLVFANIDAHVRKRLECHKCIIDRLSSGNIIFADCPPDRSIQIILDGMVLFLAIGDFVDFVKERSRLKKSLEKVLDELSSIKKKLENNQFVEKAPPSILQAEKERFSKVEKKRISLENSLERIRM

Domain archietecture



Structure model(s) of the protein

model for region: 1-210,232-328,345-475,493-944
HTML Comment Box is loading comments...