CASP9

Targets
515 516 517 518
519 520 521 522
523 524 525 526
527 528 529 530
531 532 533 534
535 536 537 538
539 540 541 542
543 544 545 546
547 548 549 550
551 552 553 554
555 556 557 558
559 560 561 562
563 564 565 566
567 568 569 570
571 572 573 574
575 576 577 578
579 580 581 582
583 584 585 586
587 588 589 590
591 592 593 594
595 596 597 598
599 600 601 602
603 604 605 606
607 608 609 610
611 612 613 614
615 616 617 618
619 620 621 622
623 624 625 626
627 628 629 630
631 632 633 634
635 636 637 638
639 640 641 642
643      

Domain definition

For those wanting it quick: flat file with manual domain parse is here.

Proteins are composed of domains. Domains are usually defined as globular units in protein structures. Domains are somewhat separate from each other spatially and can recombine with each other in evolution to form various proteins. Each domain frequently carries out its own function, or the functional site may be formed at the domain interface. Analysis of domains is essential for understanding of proteins. However, while everyone agrees on the domain importance, opinions differ greatly about the criteria for domain definition, and existing software tools are inconsistent with each other in domain parse. Researchers think about domains from the position of structural compactness, sequence similarity and continuity, evolutionary origin, folding or function. Different criteria lead to different domain definitions. Nevertheless, our experience with protein sequence-structural analysis indicates that it might be possible to bring these criteria together for a biologically reasonable domain parse. We applied our conceptual view on protein domains to CASP9 targets. Domains defined here correspond to structurally compact evolutionary modules.

To define domains in a target we looked for similarity to other protein sequences and structures and self-similarity (internal duplications), structural compactness (globularity), presence of a hydrophobic core, and took into account sequence continuity. To define precise boundaries between domains, we inspected side-chain orientations and their interactions with domains. In some targets (e.g. T0530), certain regions protruded away from the PDB chain. These regions were frequently involved in a domain swap. In such cases, we defined globular domains with a swap. The following targets were affected by this:

In other cases, protruding regions did not participate in swaps, but were interacting with other chains in the crystals, e.g. in T0516. We removed such regions in domain definition to check whether the shorter domain is predicted more accurately. Text file with domain boundaries for all targets can be downloaded from here.

We did not take into account server predictions in defining domains, only sequence, structural and evolutionary considerations about targets were used. It might not be necessary to use these evolutionary domains for evaluation of all targets. See the discussion of whole chain vs. domain evaluation. In summary, comparison of domain-based predictions with whole chain predictions reveals that the following targets require domain-based evaluation: T0521, T0528, T0529, T0533, T0534, T0542, T0543, T0544, T0547, T0548, T0550, T0553, T0555, T0571, T0575, T0579, T0582, T0586, T0589, T0596, T0600, T0604, T0608, T0611, T0628, T0629, T0632, as for these targets server predictions for whole chains are much inferior to individual domain predictions. Only these targets are evaluated as domains in our combined domain evaluation tables. Furthermore, among those domains, we merged T0533_1 and T0533_3 as one evaluation unit, similar cases are T0542_2 and T0542_3, T0543_3 and T0543_4, T0589_1 and T0589_2. Predictions for other targets follow the general trend, are of a more similar quality for 'domain' and 'whole chain' and thus domain-based evaluation may not be necessary for them. Thus other targets are evaluated as whole chains in combined domain evaluation tables. These targets are considered to be single-domain proteins for evaluation. Although some of these targets are multi-domain proteins evolutionarily, domains do not move relatively to each other, are of the same prediction difficulty. Nevertheless, we compute evaluation scores on all domains shown in the table below, and these scores are available from individual target pages,e.g. T0515 page shows evaluation of whole chain (T0515), which is the evaluation unit we finally used, N-terminal Tim-barrel domain (T0515_1) and C-terminal Eukaryotic ODC-like domain (T0515_2).

In the table below, domains are marked by "_" followed by a domain number and preceded by a target name; "s" after the domain number denotes a swapped domain. Whole chains (no "_" in name) are given to show the residue range and mapping between target and PDB. Links to PyMOL scripts with domain definitions by various workers and programs are provided as well.

CASP9 targets and domainstext file
Target PyMOL
to see various
domain parses
Type Method Category Range in target
(PDB modified to match
the target sequence)
PyMOL
to see
domain
PDB chain Range in PDB
T0515 PyMOL Human/Server X-RAY TBM 2-365 PyMol 3mt1 A 2-365
               1-365 PyMol    B 1-365
T0515_1            2-10,239-365 PyMol    A 2-10,239-365
               1-10,239-365 PyMol    B 1-10,239-365
T0515_2            11-238 PyMol    A 11-238
               11-238 PyMol    B 11-238
T0516 PyMOL Server only X-RAY TBM 1-227 PyMol 3no6 A -7-227
               1-226 PyMol    B 1-226
               1-226 PyMol    C 1-226
               1-227 PyMol    D 1-227
T0516_1            1-221 PyMol    A -7-221
               1-221 PyMol    B 1-221
               1-221 PyMol    C 1-221
               1-221 PyMol    D 1-221
T0517 PyMOL Human/Server X-RAY TBM 1-159 PyMol N/A A 0-159
               3-159 PyMol    B 3-159
               3-159 PyMol    C 3-159
               1-159 PyMol    D 0-159
               3-159 PyMol    E 3-159
               3-159 PyMol    F 3-159
T0518 PyMOL Server only X-RAY TBM 33-288 PyMol 3nmb A 33-288
T0519    Server only X-RAY Canceled                
T0520 PyMOL Human/Server X-RAY TBM 2-174 PyMol 3mr7 A -1-171
               2-173 PyMol    B -1-170
               3-174 PyMol    C 0-171
T0521 PyMOL Server only X-RAY   1-179 PyMol 3mse B 1-179
T0521_1s          TBM 1-33,34-104 PyMol    B,D D:1-33,B:34-104
T0521_2          TBM 107-179 PyMol    B 107-179
T0522 PyMOL Server only X-RAY TBM 1-134 PyMol 3nrd A 0-134
               1-134 PyMol    B 1-134
               1-134 PyMol    C 1-134
               1-134 PyMol    D 0-134
T0523 PyMOL Human/Server X-RAY TBM 3-115 PyMol 3mqo A 4-116
               3-120 PyMol    B 4-121
T0523_1            3-115 PyMol    A 4-116
               3-115 PyMol    B 4-116
T0524 PyMOL Server only X-RAY TBM 2-323 PyMol 3mwx A 2-323
               2-323 PyMol    B 2-323
T0525 PyMOL Server only X-RAY TBM 9-213 PyMol 3mqz A 6-210
T0526 PyMOL Human/Server X-RAY TBM 1-290 PyMol 3nre A 0-290
               1-290 PyMol    B 0-290
               1-290 PyMol    C 0-290
               1-290 PyMol    D 0-290
T0527 PyMOL Server only X-RAY TBM 9-142 PyMol 3mr0 A 6-139
               9-142 PyMol    B 6-139
T0527_1            9-124 PyMol    A 6-121
               9-124 PyMol    B 6-121
T0528 PyMOL Server only X-RAY   18-388 PyMol 3n0x A 18-388
T0528_1          TBM 18-138,269-351 PyMol    A 18-138,269-351
T0528_2          TBM 139-268,352-388 PyMol    A 139-268,352-388
T0529 PyMOL Human/Server X-RAY   7-561 PyMol N/A A 7-561
               8-561 PyMol    B 8-561
               8-561 PyMol    C 8-561
T0529_1          FM 7-339 PyMol    A 7-339
               8-338 PyMol    B 8-339
               8-338 PyMol    C 8-339
T0529_2          TBM 364-561 PyMol    A 364-561
               364-561 PyMol    B 364-561
               364-561 PyMol    C 364-561
T0530 PyMOL Server only X-RAY TBM 30-115 PyMol 3npp A 0-115
               30-115 PyMol    B 0-115
T0530_1s            30-34,35-115 PyMol    A,B B:0-33,A:34-115
T0531 PyMOL Human/Server NMR FM 4-65 PyMol 2kjx A 1-65
T0532 PyMOL Server only X-RAY TBM 35-506 PyMol 3mx3 A 35-506
               35-506 PyMol    B 35-506
T0532_1            35-242,336-506 PyMol    A 35-242,336-506
               35-242,336-506 PyMol    B 35-242,336-506
T0532_2            245-335 PyMol    A 245-335
               245-335 PyMol    B 245-335
T0533 PyMOL Server only X-RAY   7-312 PyMol 3mwb A 4-309
               7-312 PyMol    B 4-312
T0533_1          TBM 7-90,179-191 PyMol    A 4-87,176-188
               7-90,179-191 PyMol    B 4-87,176-188
T0533_2          TBM 91-178 PyMol    A 88-175
               91-178 PyMol    B 88-175
T0533_3          TBM 192-291 PyMol    A 189-288
               192-291 PyMol    B 189-288
T0534 PyMOL Human/Server X-RAY   33-384 PyMol 3n8u A 33-384
               31-384 PyMol    B 31-384
T0534_1          FM 33-80,257-384 PyMol    A 33-80,257-384
               31-80,257-384 PyMol    B 31-80,257-384
T0534_2          FM 81-256 PyMol    A 81-256
               81-256 PyMol    B 81-256
T0535 PyMOL Server only X-RAY Canceled 1-294 PyMol 3mpx A 890-1205
T0535_1            1-198 PyMol    A 890-1100
T0535_2            199-294 PyMol    A 1101-1205
T0536 PyMOL Server only X-RAY TBM 12-147 PyMol 3mxq A -4-131
               8-145 PyMol    B -8-129
               12-146 PyMol    C -4-130
               10-144 PyMol    D -6-128
T0536_1s            8-28,29-147 PyMol    A,B B:-8-12,A:13-131
               10-28,29-146 PyMol    C,D D:-6-12,C:13-130
T0537 PyMOL Human/Server X-RAY FM 29-381 PyMol 3n6z A 29-381
T0537_1            65-350 PyMol    A 65-350
T0537_2            351-381 PyMol    A 351-381
T0538 PyMOL Server only NMR TBM 1-54 PyMol 2l09 A 1-62
T0539 PyMOL Server only NMR TBM 3-81 PyMol 2l0b A 1-91
T0540 PyMOL Human/Server X-RAY TBM 1-90 PyMol N/A A 1-90
T0541 PyMOL Server only NMR TBM 1-106 PyMol 2l0d A 1-114
T0542 PyMOL Server only X-RAY   2-585 PyMol 3n05 A 0-583
               2-585 PyMol    B 0-583
T0542_1          TBM 2-303 PyMol    A 0-301
               2-303 PyMol    B 0-301
T0542_2          TBM 304-492 PyMol    A 302-490
               304-492 PyMol    B 302-490
T0542_3          TBM 509-585 PyMol    A 507-583
               509-585 PyMol    B 507-583
T0543 PyMOL Human/Server X-RAY   56-884 PyMol N/A A 56-859
T0543_1          TBM 56-95 PyMol    A 56-95
T0543_2          TBM 96-140 PyMol    A 96-140
T0543_3          TBM 141-366,468-540 PyMol    A 141-366,468-540
T0543_4          TBM 367-457 PyMol    A 367-457
T0543_5          TBM 541-884 PyMol    A 541-859
T0544 PyMOL Human/Server NMR   1-135 PyMol N/A A 1-143
T0544_1          FM 1-61 PyMol    A 1-61
T0544_2          FM 62-135 PyMol    A 62-143
T0545 PyMOL Server only NMR TBM 1-158 PyMol 2l3f A 1-161
T0546    Server only NMR Canceled               
T0547 PyMOL Human/Server X-RAY   1-609 PyMol 3nzp A 1-609
               1-611 PyMol    B 1-619
T0547_1          TBM 1-51,330-342,435-553 PyMol    A 1-51,330-342,435-553
               1-51,330-342,436-553 PyMol    B 1-51,330-342,436-553
T0547_2          TBM 52-329 PyMol    A 52-329
               52-329 PyMol    B 52-329
T0547_3          FM 343-421 PyMol    A 343-421
               343-421 PyMol    B 343-421
T0547_4          FM 554-609 PyMol    A 554-609
               554-611 PyMol    B 554-619
T0548 PyMOL Server only X-RAY   12-106 PyMol 3nnq A 12-106
               12-106 PyMol    B 12-106
T0548_1          TBM 12-46 PyMol    A 12-46
               12-46 PyMol    B 12-46
T0548_2          TBM 47-106 PyMol    A 47-106
               47-106 PyMol    B 47-106
T0549 PyMOL Server only NMR Canceled 6-82 PyMol 2kzv A 1-92
T0550 PyMOL Human/Server X-RAY   31-339 PyMol 3nqk A 31-339
T0550_1          FM 31-179 PyMol    A 31-179
T0550_2          FM 180-339 PyMol    A 180-339
T0551 PyMOL Server only X-RAY TBM 7-72 PyMol 3obh A 12-77
               5-71 PyMol    B 10-76
T0552 PyMOL Server only NMR TBM 12-115 PyMol 2l3b A 1-130
T0553 PyMOL Human/Server NMR   2-140 PyMol 2ky4 A 1-149
T0553_1          FM 2-65 PyMol    A 1-65
T0553_2          FM 66-140 PyMol    A 66-149
T0554    Server only NMR Canceled               
T0555 PyMOL Server only NMR   13-146 PyMol 2l06 A 1-155
T0555_1          FM 13-74 PyMol    A 1-73
T0555_2          FM 75-146 PyMol    A 74-155
T0556 PyMOL Human/Server NMR Canceled 1-68 PyMol     1-83
T0557 PyMOL Server only NMR TBM 1-126 PyMol 2kyy A 1-153
T0558 PyMOL Human/Server X-RAY TBM 21-294 PyMol 3no2 A 21-294
T0559 PyMOL Server only NMR TBM 1-69 PyMol 2l01 A 1-77
T0560 PyMOL Server only NMR TBM 1-69 PyMol 2l02 A 1-82
T0561 PyMOL Human/Server X-RAY FM 1-161 PyMol N/A A 399-561
T0562 PyMOL Human/Server NMR TBM 1-123 PyMol 2kzx A 1-131
T0563 PyMOL Server only X-RAY TBM 3-279 PyMol 3on7 A 3-279
               1-279 PyMol    B 1-279
               1-279 PyMol    C 1-279
               1-279 PyMol    D 1-279
T0564 PyMOL Human/Server NMR TBM 3-85 PyMol 2l0c A 1-97
T0565 PyMOL Server only X-RAY TBM 22-326 PyMol 3npf A 22-326
               30-326 PyMol    B 30-326
T0565_1            22-103 PyMol    A 22-103
               30-103 PyMol    B 30-103
T0565_2            104-172 PyMol    A 104-172
               104-172 PyMol    B 104-172
T0565_3            173-326 PyMol    A 173-326
               173-326 PyMol    B 173-326
T0566 PyMOL Human/Server X-RAY TBM 1-155 PyMol 3n72 A 8-163
               5-156 PyMol    B 13-164
T0567 PyMOL Server only X-RAY TBM 4-145 PyMol 3n70 A 146-287
               12-143 PyMol    B 154-285
               8-141 PyMol    C 150-283
               16-138 PyMol    D 158-280
               6-144 PyMol    E 148-286
               7-143 PyMol    F 149-285
               12-141 PyMol    G 154-283
               12-133 PyMol    H 154-275
T0568 PyMOL Human/Server X-RAY TBM 23-158 PyMol 3n6y A 0-158
               23-158 PyMol    B 0-158
T0569 PyMOL Human/Server NMR TBM 1-79 PyMol 2kyw A 1-87
T0570 PyMOL Server only X-RAY TBM 22-258 PyMol 3no3 A 0-258
T0570_1            22-63,106-258 PyMol    A 0-62,105-258
T0570_2            64-105 PyMol    A 63-104
T0571 PyMOL Human/Server X-RAY   30-344 PyMol 3n91 A 30-344
T0571_1          FM 30-198 PyMol    A 30-198
T0571_2          FM 199-331 PyMol    A 199-331
T0572 PyMOL Server only NMR TBM 5-93 PyMol 2kxy A 1-100
T0573 PyMOL Server only X-RAY TBM 3-309 PyMol 3oox A 3-309
               3-308 PyMol    B 3-308
T0574 PyMOL Human/Server X-RAY TBM 25-126 PyMol 3nrf A 25-126
               23-125 PyMol    B 23-125
T0575 PyMOL Server only X-RAY   1-216 PyMol 3nrq A 0-216
               1-216 PyMol    B 0-216
               1-216 PyMol    C 0-216
               1-216 PyMol    D 0-216
               1-216 PyMol    E 0-216
T0575_1          TBM 1-63 PyMol    A 0-63
               1-63 PyMol    B 0-63
               1-63 PyMol    C 0-63
               1-63 PyMol    D 0-63
               1-63 PyMol    E 0-63
T0575_2          TBM 64-216 PyMol    A 64-216
               64-216 PyMol    B 64-216
               64-216 PyMol    C 64-216
               64-216 PyMol    D 64-216
               64-216 PyMol    E 64-216
T0576 PyMOL Human/Server X-RAY TBM 25-162 PyMol 3na2 A 3-140
               25-160 PyMol    B 3-138
               26-159 PyMol    C 4-137
               25-161 PyMol    D 3-139
T0577    Server only NMR Canceled               
T0578 PyMOL Human/Server X-RAY FM 1-163 PyMol 3nat A -2-160
               1-162 PyMol    B -2-159
T0579 PyMOL Human/Server NMR   1-124 PyMol 2ky9 A 1-132
T0579_1          TBM 1-29,94-124 PyMol    A 1-29,94-132
T0579_2          TBM 30-93 PyMol    A 30-93
T0580 PyMOL Human/Server X-RAY TBM 2-105 PyMol 3nbm A 454-557
T0581 PyMOL Human/Server X-RAY FM 20-131 PyMol 3npd A 0-131
T0582 PyMOL Human/Server X-RAY   1-221 PyMol 3o14 A 0-221
               1-221 PyMol    B 0-221
T0582_1          TBM 1-123 PyMol    A 0-123
               1-123 PyMol    B 0-123
T0582_2          TBM 124-221 PyMol    A 124-221
               124-221 PyMol    B 124-221
T0583    Server only NMR Canceled                
T0584 PyMOL Human/Server X-RAY TBM 4-341 PyMol 3nf2 A 38-375
T0584_1            4-227,302-341 PyMol    A 38-261,336-375
T0584_2            228-301 PyMol    A 262-335
T0585 PyMOL Server only X-RAY TBM 3-234 PyMol 3ne8 A 178-409
T0586 PyMOL Human/Server X-RAY   5-123 PyMol 3neu A 2-120
T0586_1          TBM 5-87 PyMol    A 2-84
T0586_2          TBM 88-123 PyMol    A 85-120
T0587    Server only X-RAY Canceled                
T0588 PyMOL Human/Server X-RAY TBM 20-400 PyMol 3nfv A 0-400
T0589 PyMOL Server only X-RAY   9-464 PyMol 3net A 6-461
               11-465 PyMol    B 8-462
T0589_1          TBM 9-188,272-367 PyMol    A 6-185,269-364
               11-188,272-367 PyMol    B 8-185,269-364
T0589_2          TBM 189-271 PyMol    A 186-268
               189-271 PyMol    B 186-268
T0589_3          TBM 368-464 PyMol    A 365-461
               368-465 PyMol    B 365-462
T0590 PyMOL Human/Server NMR TBM 57-137 PyMol 2kzw A 1-145
T0591 PyMOL Server only X-RAY TBM 2-406 PyMol 3nra A 2-406
               2-406 PyMol    B 2-406
T0591_1            45-300 PyMol    A 45-300
               45-300 PyMol    B 45-300
T0591_2            301-406 PyMol    A 301-406
               301-406 PyMol    B 301-406
T0592 PyMOL Human/Server X-RAY TBM 2-135 PyMol 3nhv A 17-150
               2-138 PyMol    B 17-153
               1-135 PyMol    C 16-150
               1-134 PyMol    D 16-149
               2-134 PyMol    E 17-149
T0593 PyMOL Server only X-RAY TBM 1-195 PyMol 3ngw A 1-195
T0594 PyMOL Human/Server X-RAY TBM 1-140 PyMol 3ni8 A 18-157
T0595    Server only NMR Canceled               
T0596 PyMOL Human/Server X-RAY   6-188 PyMol 3ni7 A 6-188
               6-188 PyMol    B 6-188
T0596_1          TBM 6-58 PyMol    A 6-58
               6-58 PyMol    B 6-58
T0596_2          TBM 59-188 PyMol    A 59-188
               59-188 PyMol    B 59-188
T0597 PyMOL Server only X-RAY TBM 14-423 PyMol 3nie A 14-423
               19-429 PyMol    B 19-429
T0597_1            14-113 PyMol    A 14-113
               19-113 PyMol    B 19-113
T0597_2            114-423 PyMol    A 114-423
               114-429 PyMol    B 114-429
T0598 PyMOL Human/Server X-RAY TBM 6-150 PyMol 3njc A -7-145
               6-148 PyMol    B -2-143
T0599 PyMOL Server only X-RAY TBM 9-392 PyMol 3os6 A 9-392
               10-392 PyMol    B 10-392
               10-392 PyMol    C 10-392
               9-392 PyMol    D 9-392
T0599_1            9-195,347-392 PyMol    A 9-195,347-392
               10-195,347-392 PyMol    B 10-195,347-392
               10-195,347-392 PyMol    C 10-195,347-392
               9-195,347-392 PyMol    D 9-195,347-392
T0599_2            196-346 PyMol    A 196-346
               196-346 PyMol    B 196-346
               196-346 PyMol    C 196-346
               196-346 PyMol    D 196-346
T0600 PyMOL Server only X-RAY   17-122 PyMol 3nja A 14-119
               15-122 PyMol    B 12-119
               16-123 PyMol    C 13-120
               18-122 PyMol    D 15-119
T0600_1s          TBM 17-77,78-122 PyMol    A,B A:14-74,B:75-119
               16-77,78-122 PyMol    C,D C:13-74,D:75-119
T0601 PyMOL Server only X-RAY TBM 9-449 PyMol N/A A 9-449
               7-448 PyMol    B 7-448
               7-448 PyMol    C 7-448
               7-448 PyMol    D 7-448
T0601_1            9-110 PyMol    A 9-110
               7-110 PyMol    B 7-110
               7-110 PyMol    C 7-110
               7-110 PyMol    D 7-110
T0601_2            111-234 PyMol    A 111-234
               111-234 PyMol    B 111-234
               111-234 PyMol    C 111-234
               111-234 PyMol    D 111-234
T0601_3            235-248,359-449 PyMol    A 235-248,359-449
               235-248,359-448 PyMol    B 235-248,359-448
               235-248,359-448 PyMol    C 235-248,359-448
               235-248,359-448 PyMol    D 235-248,359-448
T0601_4            249-358 PyMol    A 249-358
               249-358 PyMol    B 249-358
               249-358 PyMol    C 249-358
               249-358 PyMol    D 249-358
T0602 PyMOL Human/Server X-RAY TBM 1-97 PyMol 3nkz A -2-94
               1-97 PyMol    B -2-94
               1-95 PyMol    C -2-92
               1-96 PyMol    D -2-93
T0603 PyMOL Server only X-RAY TBM 13-280 PyMol 3nkd A 13-280
               9-280 PyMol    B 9-280
T0603_1            13-91 PyMol    A 13-91
               9-91 PyMol    B 9-91
T0603_2            92-280 PyMol    A 92-280
               92-280 PyMol    B 92-280
T0604 PyMOL Human/Server X-RAY   11-548 PyMol 3nlc A 1-538
T0604_1          FM 11-94 PyMol    A 1-84
T0604_2          TBM 95-291,497-548 PyMol    A 85-281,487-538
T0604_3          FM 292-496 PyMol    A 282-486
T0605 PyMOL Human/Server X-RAY TBM 19-71 PyMol 3nmd A 2-54
               21-67 PyMol    B 4-50
               18-70 PyMol    C 1-53
               19-68 PyMol    D 2-51
               20-70 PyMol    E 3-53
T0606 PyMOL Human/Server X-RAY TBM 46-168 PyMol 3noh A 46-168
T0607 PyMOL Server only X-RAY TBM 1-470 PyMol 3pfe A 0-470
T0607_1            1-205,380-470 PyMol    A 0-205,380-470
T0607_2            206-379 PyMol    A 206-379
T0608 PyMOL Human/Server X-RAY   29-278 PyMol 3nyy A 0-278
T0608_1          FM 29-117 PyMol    A 0-116
T0608_2          TBM 118-278 PyMol    A 117-278
T0609 PyMOL Server only X-RAY TBM 3-340 PyMol 3os7 A 3-340
               3-340 PyMol    B 3-340
               3-340 PyMol    C 3-340
               3-340 PyMol    D 3-340
T0610 PyMOL Human/Server X-RAY TBM 8-186 PyMol 3ot2 A 8-186
               8-186 PyMol    B 8-186
T0611 PyMOL Server only X-RAY   3-214 PyMol 3nnr A 3-214
T0611_1          TBM 3-55 PyMol    A 3-55
T0611_2          TBM 56-214 PyMol    A 56-214
T0612 PyMOL Server only X-RAY TBM 20-128 PyMol 3o0l A 20-128
               22-129 PyMol    B 22-129
T0613 PyMOL Server only X-RAY TBM 3-287 PyMol 3obi A 3-287
               3-287 PyMol    B 3-287
               3-286 PyMol    C 3-286
               3-286 PyMol    D 3-286
T0613_1            3-87 PyMol    A 3-87
               3-87 PyMol    B 3-87
               3-87 PyMol    C 3-87
               3-87 PyMol    D 3-87
T0613_2            88-287 PyMol    A 88-287
               88-287 PyMol    B 88-287
               88-286 PyMol    C 88-286
               88-286 PyMol    D 88-286
T0614 PyMOL Human/Server X-RAY TBM 2-122 PyMol N/A B 1-121
T0615 PyMOL Server only X-RAY TBM 2-179 PyMol 3ngw A 2-179
               2-179 PyMol    B 2-179
T0615_1            2-95 PyMol    A 2-95
               2-95 PyMol    B 2-95
T0615_2            96-179 PyMol    A 96-179
               96-179 PyMol    B 96-179
T0616 PyMOL Human/Server X-RAY FM 10-102 PyMol 3nrt A 7-99
               10-103 PyMol    B 7-100
               5-103 PyMol    C 2-100
               10-102 PyMol    D 7-99
               6-103 PyMol    E 3-100
               10-103 PyMol    F 7-100
T0617 PyMOL Server only X-RAY TBM 6-148 PyMol 3nrv A 2-145
               6-148 PyMol    B 2-145
               7-148 PyMol    C 4-145
               7-148 PyMol    D 4-145
T0617_1            6-37,111-148 PyMol    A 2-34,108-145
               6-37,111-148 PyMol    B 2-34,108-145
               7-37,111-148 PyMol    C 4-34,108-145
               7-37,111-148 PyMol    D 4-34,108-145
T0617_2            38-110 PyMol    A 35-107
               38-110 PyMol    B 35-107
               38-110 PyMol    C 35-107
               38-110 PyMol    D 35-107
T0618 PyMOL Human/Server X-RAY FM 6-175 PyMol 3nrh A 6-175
               6-170 PyMol    B 6-170
T0619 PyMOL Human/Server X-RAY TBM 1-101 PyMol 3nrw A 4-107
T0620 PyMOL Server only X-RAY TBM 3-312 PyMol 3nr8 A 422-731
               1-312 PyMol    B 420-731
T0621 PyMOL Human/Server X-RAY FM 2-170 PyMol 3nkg A 0-169
               2-170 PyMol    B 0-169
T0622 PyMOL Human/Server X-RAY TBM 1-121 PyMol 3nkl A 0-121
               1-122 PyMol    B 0-122
T0623 PyMOL Server only X-RAY TBM 1-220 PyMol 3nkh A -3-220
               1-220 PyMol    B -4-220
T0623_1            1-209 PyMol    A -3-209
               1-209 PyMol    B -4-209
T0624 PyMOL Human/Server X-RAY FM 5-73 PyMol 3nrl A 5-73
               5-73 PyMol    B 5-73
T0625 PyMOL Human/Server X-RAY TBM 2-232 PyMol 3oru A 2-232
T0626 PyMOL Server only X-RAY TBM 1-283 PyMol 3o1l A -14-283
               1-283 PyMol    B -1-283
T0626_1            1-84 PyMol    A -14-84
               1-84 PyMol    B -1-84
T0626_2            85-283 PyMol    A 85-283
               85-283 PyMol    B 85-283
T0627 PyMOL Human/Server X-RAY TBM 3-246 PyMol 3oql A 3-246
               3-246 PyMol    B 3-246
               3-246 PyMol    C 3-246
               3-246 PyMol    D 3-246
T0628 PyMOL Human/Server X-RAY   1-295 PyMol 3nuw A -2-292
               4-295 PyMol    B 1-292
               4-295 PyMol    C 1-292
               4-295 PyMol    D 1-292
T0628_1          TBM 1-124,282-295 PyMol    A -2-121,279-292
               4-124,282-295 PyMol    B 1-121,279-292
               4-124,282-295 PyMol    C 1-121,279-292
               4-124,282-295 PyMol    D 1-121,279-292
T0628_2          TBM 125-281 PyMol    A 122-278
               125-281 PyMol    B 122-278
               125-281 PyMol    C 122-278
               125-281 PyMol    D 122-278
T0629 PyMOL Human/Server X-RAY   1-216 PyMol 2xqf A 811-1026
               1-216 PyMol    B 811-1026
               1-216 PyMol    C 811-1026
T0629_1          TBM 1-49,209-216 PyMol    A 811-859,1019-1026
               1-49,209-216 PyMol    B 811-859,1019-1026
               1-49,209-216 PyMol    C 811-859,1019-1026
T0629_2          FM 50-208 PyMol    A 860-1018
               50-208 PyMol    B 860-1018
               50-208 PyMol    C 860-1018
T0630 PyMOL Human/Server X-RAY TBM 7-123 PyMol 2kyt A 7-123
T0631    Human/Server X-RAY Canceled                
T0632 PyMOL Server only X-RAY   10-164 PyMol 3nwz A 10-164
               12-167 PyMol    B 12-167
               10-164 PyMol    C 10-164
               13-164 PyMol    D 13-164
T0632_1          TBM 10-43 PyMol    A 10-43
               12-43 PyMol    B 12-43
               10-43 PyMol    C 10-43
               13-43 PyMol    D 13-43
T0632_2          TBM 44-164 PyMol    A 44-164
               44-167 PyMol    B 44-167
               44-164 PyMol    C 44-164
               44-164 PyMol    D 44-164
T0633    Human/Server X-RAY Canceled                
T0634 PyMOL Server only X-RAY TBM 3-129 PyMol 3n53 A 1-127
               3-124 PyMol    B 1-122
T0635 PyMOL Server only X-RAY TBM 2-183 PyMol 3n1u A 2-183
T0636 PyMOL Server only X-RAY TBM 14-334 PyMol 3p1t A 14-334
               17-334 PyMol    B 17-334
               15-334 PyMol    C 15-334
               17-334 PyMol    D 17-334
T0636_1            29-242 PyMol    A 29-242
               29-242 PyMol    B 29-242
               29-242 PyMol    C 29-242
               29-242 PyMol    D 29-242
T0636_2            243-334 PyMol    A 243-334
               243-334 PyMol    B 243-334
               243-334 PyMol    C 243-334
               243-334 PyMol    D 243-334
T0637 PyMOL Server only X-RAY FM 1-135 PyMol 2x3o A 36-170
               1-135 PyMol    B 36-170
T0637_1s            1-89,90-135 PyMol    A,B A:36-124,B:125-170
T0638 PyMOL Server only X-RAY TBM 1-260 PyMol 3nxh A 72-331
T0639 PyMOL Server only X-RAY FM 3-126 PyMol 3nym A 0-123
               5-127 PyMol    B 2-124
T0640 PyMOL Server only X-RAY TBM 5-243 PyMol 3nyi A 3-241
               6-242 PyMol    B 4-240
               6-243 PyMol    C 4-241
               6-242 PyMol    D 4-240
T0641 PyMOL Server only X-RAY TBM 4-296 PyMol 3nyi A 1-293
               2-296 PyMol    B -1-293
T0641_1            4-29,68-153 PyMol    A 1-26,65-150
               2-29,68-153 PyMol    B -1-26,65-150
T0641_2            30-67 PyMol    A 27-64
               30-67 PyMol    B 27-64
T0641_3            154-296 PyMol    A 151-293
               154-296 PyMol    B 151-293
T0642    Server only X-RAY Canceled                 
T0643 PyMOL Human/Server X-RAY TBM 7-79 PyMol 3nzl A 7-79